The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
21
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
b'SALHWRAAGAATVLLVIVLLAGSYLAVLAERGAPGAQLITYPRALWWACETATTVGY'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural and Functional Consequences of an Amide-to-Ester Substitution in the Selectivity Filter of a Potassium Channel.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
FAB HEAVY CHAIN
|
| molecule tags |
Membrane protein
|
| total genus |
21
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| structure length |
57
|
| sequence length |
57
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-06-26 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Helix Hairpins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4GX5 A; 2WLK A; 3F7V C; 2HG5 C; 3LDC A; 4MW8 A; 3F7Y C; 3ABL C; 3STL C; 4PA7 A; 3FB7 C; 3SYC A; 3SYO A; 2WLM A; 1OCC C; 4LBE C; 1G4Y B; 2H8P C; 4PA6 A; 4QE9 A; 1OCR C; 4ZBM A; 5B1B C; 2DWD C; 1M56 C; 3JYC A; 3F5W C; 4DXW A; 4MSW C; 5KUM A; 4GX1 A; 4PA9 A; 4MTG A; 2A9H A; 4TWK A; 3SYP A; 4F4L A; 5EC1 C; 4QE7 A; 2IH1 C; 4MVZ A; 4UUJ C; 5CBF A; 4X88 A; 4MS2 A; 1K4C C; 3RBZ A; 3E83 A; 4BW5 A; 4H37 A; 4MW3 A; 3T2M A; 2EIM C; 2HVJ C; 4J9Y B; 3ASO C; 1S5H C; 3RW0 A; 2EIN C; 3ZRS A; 1M57 C; 3UM7 A; 2AHY A; 4PDV A; 4WFF A; 3SPH A; 4R7C A; 3IGA C; 3SPJ A; 2AHZ A; 4P9O A; 3IFX A; 3OR7 C; 3OR6 C; 3VOU A; 3OUF A; 4PA4 A; 5E1A C; 4XDJ A; 2ITC C; 1P7B A; 2HVK C; 3PJS K; 5EC2 C; 3RVZ A; 2WLI A; 3RVY A; 2IH3 C; 3E8H A; 4XDL A; 5EK0 A; 3TET A; 4R50 A; 2BOB C; 2X6C A; 2ZXW C; 2BOC C; 2Q67 A; 1K4D C; 2WLH A; 3FB6 C; 4MVS A; 1QLE C; 2R9R B; 4RAI A; 5B3S C; 5IY5 C; 4P30 A; 3ZJZ A; 2Q69 A; 4R6Z A; 3E86 A; 3WG7 C; 4J9Z B; 4LCU C; 4RUE A; 5EBM C; 4HYO A; 4R8C A; 3SPG A; 2A79 B; 4PDL A; 1ZWI C; 3KG2 A; 2EIK C; 3SPC A; 3SYA A; 5KUK A; 4QNH B; 3E8G A; 4GX0 A; 2EIL C; 4OXS A; 2WLI B; 1J95 A; 4G27 B; 3E8B A; 4JTC B; 4CBC A; 3OGC C; 3GB7 C; 1R3L C; 3E89 A; 2DWE C; 3SJQ C; 2A0L A; 3T4Z A; 3K04 A; 2X6A A; 1V55 C; 2WLL A; 1JVM A; 4X8A A; 3HPL C; 4WFH A; 1XL6 A; 3TCU A; 2WLJ A; 1OCO C; 2HJF C; 5EBL C; 3ABM C; 1OCZ C; 2WLN A; 4PDR A; 3K06 A; 3FB5 C; 1V54 C; 4RUF A; 4WFG A; 2QTO A; 1LNQ A; 4PDM A; 2Q68 A; 4PA3 A; 2Q6A A; 1KKD A; 3K03 A; 4KFM A; 3UKM A; 2ITD C; 2P7T C; 2Y69 C; 2NLJ C; 3K0D A; 5CBG A; 3LDE A; 3LUT B; 5CBH A; 3OUS A; 2WLL B; 5B1A C; 3BEH A; 3AG4 C; 4MTF A; 3ABK C; 2EIJ C; 2KB1 A; 3STZ C; 4GX2 A; 3X2Q C; 4EKW A; 2QKS A; 4RO2 A; 2W0F C; 3AG3 C; 5BZB A; 4MVQ A; 5J9P C; 1XL4 A; 2OCC C; 4MVU A; 3K0G A; 1R3K C; 4MVO A; 4P9P A; 4HZ3 A; 3LNM B; 3R65 A; 3T4D A; 1R3I C; 2DYS C; 2JK5 C; 3T1C A; 4JTA B; 4XDK A; 1BL8 A; 1R3J C; 4MVR A; 4MTO A; 3AG2 C; 4WFE A; 3EFF K; 4P2Z A; 4JTD B; 4G28 B; 2ATK C; 1ORQ C; 3SPI A; 3ASN C; 2ZD9 A; 3FB8 C; 3SYQ A; 2HFE C; 4LP8 A; 3E8F A; 4H33 A; 2K1E A; 3AG1 C; 3K08 A; 2DYR C; 3LDD A; 5EBW C; 4X89 A; 2X6B A; 2YEV A; 4I9W A; 4MVM A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1GN3 A; 4I4T B; 1I5X A; 4LF8 B; 5LP6 B; 2ZE7 A; 1OCR C; 2FB5 A; 2Z5U A; 3D8C A; 1Q5O A; 1ZL8 A; 1DK1 A; 2Q9L A; 2JS5 A; 4J7Z A; 4DR3 B; 5CB4 B; 2B9Z A; 2XAJ A; 4QE7 A; 1OHH G; 3W7S A; 2UUA B; 3H1L H; 3ZHU A; 4B3M O; 4LFC B; 3A8T A; 1VQL V; 3L71 H; 2F1M A; 2WWW A; 4WFF A; 4JI5 B; 1XRE A; 3U10 A; 4N21 A; 4U3J A; 3VQX A; 3RVY A; 3E22 A; 4E2L A; 2ZIN A; 2QWQ B; 5CA1 A; 3CEI A; 3SGI A; 4UCU A; 2Q67 A; 3K3W A; 5KMG A; 3U0Z A; 1HNW O; 2UXB B; 4JGS A; 5IJ0 A; 4HBN A; 3D3I A; 5EZY B; 1S0V A; 3GWK C; 2UXD B; 2EJ7 A; 4U7N A; 4WFH A; 5LXT A; 4E4E A; 3BAB A; 2VWJ A; 2DE0 X; 5EBL C; 3JD3 A; 4DV5 B; 3RYC A; 1Y74 A; 4LF8 O; 3LSQ A; 4J42 A; 4ZIB A; 3B40 A; 5B66 Z; 1AJN A; 5B1A C; 1N32 B; 2UUA O; 5BZB A; 3EXA A; 3BA9 A; 1R3K C; 1FPO A; 1RM1 C; 2CGN A; 3T4D A; 3CCJ V; 3DXR A; 2HJD A; 4J7K A; 4DRX B; 3T1Y O; 5EYP A; 4GLX A; 3JAW A; 2UXC O; 4WFE A; 3WB1 A; 5IYZ A; 4JI2 B; 2JGU A; 4B3S O; 1AI5 A; 1RM1 B; 1EM1 A; 2EUL A; 3FX7 A; 3W7U A; 3F7V C; 2RMK B; 2LP7 A; 3FB7 C; 3J81 N; 4GKJ B; 3RYF A; 5H2F Z; 4Q20 A; 4DYL A; 1R6N A; 4J7J A; 1EN4 A; 3EVK A; 1SA0 B; 5JQG A; 3H01 A; 3K57 A; 3L70 H; 5ITZ B; 4I50 B; 3F5T A; 3B77 A; 3ZBH A; 1PNK A; 5BXZ A; 2IJH A; 4O4I B; 3PJS K; 3HKC B; 1VQ8 V; 1H38 A; 3TJT A; 1HNX B; 4K8X A; 1SKV A; 4UFZ A; 1BQZ A; 1K4D C; 4LF6 O; 3AEI A; 3HB3 B; 4DR6 B; 3M7M X; 2Y0P A; 1SER A; 4J9Z B; 3FD9 A; 3MHH C; 4H0L B; 2XAG A; 4B3R B; 2GBO A; 1IDS A; 3B8N A; 1JCH A; 1IX9 A; 2DWE C; 2A0L A; 1ZUQ A; 3T4Z A; 2X6A A; 4RWU A; 4W4L A; 1AR1 B; 4ZI7 B; 3TXQ A; 1Z5V A; 5KHJ A; 2EZP A; 2O57 A; 3ZN1 A; 4JI6 B; 2WLN A; 4JYY A; 5JH7 A; 4TQD A; 2Q6A A; 1PL4 A; 2LFS A; 2QM7 A; 5CBG A; 5JJN B; 4MTX A; 2JRI A; 4FLX A; 2RQ6 A; 3OEE G; 3K5L A; 2CE4 A; 3RWR D; 3QTC A; 2LW1 A; 4NXM B; 1BCC H; 1BL8 A; 3S3W A; 3QO8 A; 1YJW V; 1H2G A; 4O4H A; 1HNX O; 2E75 B; 4IYI A; 3M99 B; 3LDD A; 1XNR B; 3FAV B; 2YEV A; 3OMA B; 1SQG A; 5LHI A; 2YI8 A; 3LDC A; 1SQQ H; 1YTF D; 3G6E V; 4IIJ B; 2ZE8 A; 2JJ2 G; 5B5E Z; 2Q5Z A; 1K73 W; 1HNZ B; 2F4V B; 4B3R O; 3OTO B; 2HLD G; 4PV1 B; 2DWD C; 4UCS A; 1XEQ A; 3WB0 A; 5LGN A; 1Z2G A; 1GO3 F; 1YZB A; 1ZLZ A; 2B1I A; 4DV7 B; 1K97 A; 1H2S B; 1KP3 A; 1WA8 B; 4WFA V; 2K9P A; 1NKD A; 5JWP A; 2VWK A; 1W0J G; 4X1I B; 3M8A A; 4DK0 A; 1P7B A; 3CRA A; 1TAE A; 4BAY A; 2FTK A; 2X6C A; 2AXT Z; 1AI4 A; 1MSW D; 1S5J A; 3CWB H; 3L9D A; 1SZT A; 4ZHQ A; 2QWR B; 3PN1 A; 3JD2 A; 4NXM O; 1Y76 B; 1ZWI C; 1THZ A; 2EIK C; 1XUQ A; 4OXS A; 4BR6 A; 4FLY A; 1R3L C; 2BTQ B; 3OM3 B; 1XNR O; 1NBM G; 2NN4 A; 5A9G A; 2L6L A; 4TV8 B; 2YDE A; 4RUF A; 1KUQ A; 3W7X A; 4PDM A; 2HEP A; 4PA3 A; 4KXR A; 5CN0 A; 5IWA B; 3ZS8 C; 2WLL B; 2Y0I A; 1F7Y A; 4YJ3 B; 2PTM A; 1COW G; 1I0H A; 2ZXW B; 5BR8 O; 4DV7 O; 3LSU A; 1Y67 A; 2P90 A; 1Q43 A; 4TUY A; 4DW1 A; 1E1Q G; 5JVD A; 2GHY A; 4X9Q A; 1EFR G; 1LUV A; 3EFF K; 2OIG A; 4G28 B; 3ZN0 A; 4AIL C; 1UFI A; 4DV2 B; 3ML0 A; 5BMV A; 1U97 A; 2YI9 A; 2G38 A; 2YXL A; 1EN5 A; 1OCO B; 3ABL C; 2WLM A; 4L8J A; 1YXB A; 5LOV A; 3L73 H; 5J2U B; 2OCH A; 1JX9 A; 2OWO A; 5H5N A; 3JD0 A; 1NTK H; 3LSS A; 1PNL A; 4UUJ C; 1XNQ O; 3RBZ A; 1OZ0 A; 3BPZ A; 3ASO C; 3G80 A; 1OJH A; 4F6R A; 2AHY A; 4TT3 G; 1ZL8 B; 1VAR A; 2IJI A; 1MOF A; 1NT2 B; 1NTM H; 2KSD A; 1BE3 H; 5EC2 C; 5IWA O; 3NXS A; 4DV3 O; 3ZRW A; 2IH3 C; 4I50 A; 2D3O W; 3FB6 C; 3CCV V; 3JAR A; 1KD1 W; 3KZI Z; 3IC7 A; 3OMN B; 4LF4 O; 1MG1 A; 5JCO C; 2XAQ A; 4U3J B; 4QNH B; 2N04 A; 3E22 B; 3ZMV A; 5CA1 B; 1K5Q A; 3UO2 A; 5F2V O; 1JFF A; 5KMG B; 3K04 A; 1BT8 A; 5IJ0 B; 4B08 A; 4X8A A; 5BY1 A; 3QO5 A; 2ZKO A; 4DUZ B; 4PDR A; 2BE3 A; 2QJ1 A; 3UKM A; 3ZCC A; 1J5E B; 1K5S A; 3AG4 C; 1H8H G; 3ABK C; 5LXT B; 1GM9 A; 2VS0 A; 3STZ C; 4RO2 A; 1MMM A; 4ICG A; 1NS1 A; 3RYC B; 1Y74 B; 2P4V A; 1AB3 A; 4YY3 B; 3CXH F; 4F6E A; 5CA3 A; 1FYJ A; 1UPG A; 1CP9 A; 2X0L A; 4MVR A; 4MTO A; 3TXS A; 5FNV A; 1Y4M A; 3NR7 A; 4XBF A; 4JI3 B; 3SPI A; 2ZNJ A; 2HFE C; 1VF7 A; 3K5O A; 3DXR B; 5KAF Z; 3IAY A; 1SET A; 5EYP B; 1VP7 A; 4EEQ A; 1DLB A; 4MW8 A; 3JAW B; 1GKF A; 5IYZ B; 1FXH A; 4BW9 A; 5IJ9 A; 2QGN A; 2HHH O; 4DR4 O; 1GAX A; 5JJJ B; 3HKD A; 3FAV A; 3CPW U; 1M9N A; 3SYP A; 1K4C C; 4UB6 Z; 4LF5 B; 3RYF B; 1DGS A; 3CCS V; 2ZQM A; 3SJC C; 2GTS A; 3TGU H; 3J80 N; 2XOK G; 3ABT A; 1WA8 A; 1HDJ A; 5EIB C; 3FYI B; 5KHG A; 5FPR A; 3TET A; 2UUB B; 4R50 A; 3CCE V; 2WA3 A; 4ZOL B; 5B3S C; 4FFK A; 4YY3 O; 4R8C A; 3SPC A; 1T5E A; 4GYC B; 4GX0 A; 3E8B A; 3WU2 Z; 1QR8 A; 2WA4 A; 4JI3 O; 3OGC C; 1PNM A; 1V55 C; 2ZR2 A; 1LUW A; 5KHH A; 4BIU A; 1SZX A; 5LGU A; 4LH6 A; 3MAQ A; 2UUC B; 3LUT B; 3C3T A; 1EBO A; 5FLX N; 4UB8 Z; 2Y4T A; 4GX2 A; 3X2Q C; 1AI7 A; 1F51 A; 4UVA A; 4MVO A; 5JH7 B; 5K1P A; 1QLE B; 4WFB V; 2DYS C; 3MDS A; 4X65 B; 1TUB A; 1YI2 V; 4XDK A; 1NVP D; 2RDC A; 1M1K W; 3DGE A; 1P4R A; 1L0L H; 3B4S A; 1VQ7 V; 1VIB A; 3P3N A; 4DV4 O; 2UUB O; 2YID A; 4NTX A; 2HG5 C; 3VQV A; 4D6T H; 2FML A; 1Y66 A; 4O4H B; 1ZSP A; 4ZBM A; 1G4Y B; 2CTP A; 2FL4 A; 2P6J A; 2RNB A; 5B1B C; 2Y48 A; 4KHP O; 1SQP H; 2VQE B; 2YEV B; 1GN4 A; 5LA6 A; 2AZ0 A; 4K0K B; 3T2M A; 1VQP V; 2DMX A; 4HAM A; 4YIP A; 2NNU A; 2DJV A; 1NTZ H; 3ZED A; 2X7R B; 1H2N A; 3RVZ A; 4CH6 A; 5EK0 A; 3CCL V; 1D2D A; 4FM0 A; 5DN6 G; 5IY5 C; 3ZJZ A; 5GTH Z; 3JAM N; 4X65 O; 4JI7 O; 3E86 A; 5J2T A; 4HYO A; 4IHJ B; 4K35 A; 1OCR B; 2XAS A; 2QKC A; 1N34 O; 1M93 A; 4ZHQ B; 2GUZ A; 3HPL C; 4UV8 A; 1YEW A; 4PJ0 Z; 2QWP B; 4FFB A; 2F43 G; 4KFM A; 2CAZ C; 2XND G; 3K0D A; 5LYJ A; 5JCO A; 4A5U B; 1Q81 W; 1PD3 A; 5K1X A; 3BRC A; 4HNA A; 4YJ2 B; 2QKS A; 4MVQ A; 4MVU A; 1VQ9 V; 3D3Q A; 4P9P A; 3DTU B; 3THO A; 3JCU Z; 4LF9 B; 4JYA B; 4JI0 O; 3GWO A; 3APO A; 1MZE A; 1ROP A; 4P2Z A; 2HP8 A; 2B1G A; 1K34 A; 4TUY B; 4DR3 O; 4JYB A; 4I9W A; 1MA1 A; 2F95 B; 5JVD B; 4LFC O; 1CXZ B; 1R6K A; 3P3P A; 3CHX A; 3SJB C; 4D7S A; 3JYC A; 5BMV B; 4JI5 O; 5KHI A; 2JJ1 G; 5B1A B; 4GX1 A; 5A2Q N; 1AJP A; 3IJ4 A; 3H1J H; 1GK9 A; 4BW5 A; 2D2C B; 3OEH G; 1FFT B; 1V9P A; 3FYE B; 1NZ6 A; 1M57 C; 3SPH A; 5LOV B; 4I55 A; 2Y4U A; 4GT1 A; 5E1A C; 2UXB O; 1TUE B; 1GN6 A; 2QWN B; 2H3O A; 1EZJ A; 2UXD O; 4F6R B; 2ADQ B; 5E79 Z; 4UCO A; 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3OR6 C; 4PA4 A; 4DR6 O; 3VQW A; 3WB2 A; 4QJF B; 3B8M A; 2WLI A; 4I0X A; 1FD9 A; 4UVB A; 3RYH A; 1Z5W A; 5FL7 G; 2A3Q A; 2BOB C; 4FM2 A; 4EFE A; 1XMQ B; 1JJ2 U; 3QG5 A; 2R9R B; 3T1H B; 2YIB D; 4R6Z A; 4RUE A; 1AIL A; 5EBM C; 3CCQ V; 1IBK B; 4X64 B; 3HKB A; 1F23 A; 4PDL A; 4ASU G; 1S76 D; 1QQC A; 1CEZ A; 1XQ8 A; 1KYO F; 2CGO A; 4JI6 O; 1BZK A; 2NR5 A; 1HR0 O; 2IW5 A; 4IYH A; 4WBN A; 4PHZ A; 4IHJ A; 1UJW B; 2XT9 A; 4O4L A; 4NVP A; 4LF7 O; 4NB5 A; 3C3S A; 3FB5 C; 4LFB B; 2QDO A; 3APQ A; 2BCC H; 3ZMZ A; 2P7T C; 1S72 V; 3VBB A; 3BHP A; 3A0H Z; 1RSO A; 1WP7 A; 1XI1 A; 3OW2 U; 4H13 B; 3UCS C; 1AP5 A; 3RN4 A; 1L8D A; 3H9V A; 4DR1 B; 4YJ2 A; 2LO1 A; 2EIK B; 3CP1 A; 1ORQ C; 3ASN C; 5H9C A; 1XHZ A; 2QTS A; 2F4V O; 1HNZ O; 2M7W A; 3K08 A; 3OTO O; 1TUB B; 4FMT A; 4GUN A; 1XMQ O; 1JOY A; 2X6B A; 1WP8 A; 1SQF A; 3T1H O; 4MVM A; 2WLK A; 5GTI Z; 1VQM V; 5KLV H; 4X64 O; 3ASN B; 4YXW G; 4DR2 B; 2JGD A; 1P84 F; 1VQO V; 3KCX A; 4PA9 A; 1BHA A; 5CA0 A; 1KMI Z; 1JQ0 A; 1RFY A; 2EIN C; 3ICX A; 3UM7 A; 3K79 A; 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