2HLSA

The crystal structure of a protein disulfide oxidoreductase from aeropyrum pernix k1
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
232
structure length
232
Chain Sequence
ARYYVLDLSEDFRRELRETLAEMVNPVEVHVFLSKSGCETCEDTLRLMKLFEEESPTRNGGKLLKLNVYYRESDSDKFSEFKVERVPTVAFLGGEVRWTGIPAGEEIRALVEVIMRLSEDESGLEDATKEALKSLKGRVHIETIITPSCPYCPYAVLLAHMFAYEAWKQGNPVILSEAVEAYENPDIADKYGVMSVPSIAINGYLVFVGVPYEEDFLDYVKSAAEGRLTVKG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords protein disulfide oxidoreductase
publication title A Novel Member of the Protein Disulfide Oxidoreductase Family from Aeropyrum pernix K1: Structure, Function and Electrostatics.
pubmed doi rcsb
source organism Aeropyrum pernix
molecule tags Oxidoreductase
total genus 80
structure length 232
sequence length 232
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-07-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13192 Thioredoxin_3 Thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2hlsA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2hlsA02
4GLTA 2KP1A 2GSTA 3QOUA 5D9WA 2XPDA 5B7CA 2B7JA 4ISDA 4CW9A 2R5GA 4EL1A 1ABAA 1UA5A 2OBKA 2L4QA 2VL2A 4MDCA 1K0CA 3F0IA 4MABA 3UOMA 1PSQA 1O7UA 3EC3A 4GCIA 1SKWB 1GSSA 4MA9A 3E9JB 4POKA 3QFBC 1FB0A 4F0CA 1PKWA 3TJJA 2EC4A 3GKXA 5DAKA 2B1KA 2H1AA 2B5XA 1BX9A 3FHKA 2YNXA 4X0XA 3WYWA 2ON5A 2NDOA 4G10A 1SJZA 2O85A 2O89A 3PR8A 2GVPA 4HEA2 5DAKB 2E2MA 2GSQA 1EZKA 1H75A 3EVIA 11GSA 1J08A 4KX4A 3F3QA 3GKKA 3QAWA 1U6TA 3SWLA 3EWLA 3GN3A 5AN1A 4EO3A 2VCZA 1XCCA 2BJXA 3TUEA 1ERUA 5ELGA 1AW9A 4BWSA 3TKSE 1GLPA 1Z7RA 2NBSA 1Z5YE 1PD21 1HNBA 3TCOA 2JACA 2CZ3A 1OC9A 5J41A 3QMXA 3W8JA 4YQUA 2DJ3A 4IS0A 5IIZA 5DJMA 1R4WA 2LUSA 4L0UA 2DMMA 1TKDB 3L0HA 5J9CA 1Z7PA 6GSSA 2GGTA 1HNCA 4KCAA 2JU5A 5FHIA 2L5LA 1FHEA 4MP4A 1F3BA 3TOTA 1TK8B 3FW2A 5DJLA 2YANA 3TRXA 3AY8A 4PX1A 4MJCA 4PNFA 1WMJA 4PGTA 1X9MB 4O32A 2HI7A 4F9ZA 5DALA 2VCVA 3MNGA 4HZ2A 2VLTA 3HD5A 2AHEA 3FYGA 3DIEA 3H4KA 1GSEA 2HXKA 4OFTA 5DQYA 2DJKA 2LNTA 1U88A 1XVWA 2F8FA 5CRWA 1WP0A 14GSA 4KGIA 5AISA 5DALB 4CDOA 2CVBA 1JLVA 2L6CA 1A8YA 3UVHA 2AYTA 3D6IA 1K3LA 1V9WA 3UJ1A 2VM1A 5DCHA 1A2JA 3L9UA 3ERGA 1HD2A 17GSA 4YH2A 3P8WA 2TRXA 4IN0A 2WRTA 4NV2A 1FB6A 3ZRDA 2HLSA 3K8NA 2DSAA 1EWXA 2M72A 3HJPA 1SYXA 1ILOA 3TJGA 5D9VA 5IMAA 3EE2A 4AF2A 4IQ1A 1ERVA 2GSRA 1NHYA 2LNSA 1K3OA 1SD8A 5D9XA 1EP8A 5ECPB 4HOJA 4IP1A 1YEXA 3GFKA 2PN8A 4MH2A 2VUPA 1M0UA 1TI3A 1O8XA 4BPYA 1U3AA 1T3BA 3BBYA 1FAAA 4ZILA 1T4ZA 1I5GA 3QAVA 3ZLPA 3J7Yb 5D8IA 5G2ZA 3HZ8A 2TRCP 4ULXA 4NAXA 2JZSA 3HVXA 1KEBA 4KUNA 18GSA 4DVCA 1XOAA 3C71A 4N30A 2A2RA 2L57A 4QL7A 3VWVA 3F9UA 4OCFA 1EOGA 2H72A 1V2AA 2R37A 4KA0A 1K3YA 3H1NA 2PERA 1VF1A 2RLIA 3KMNA 2YV7A 2B7KA 3E0UA 3P7XA 3HA9A 5D73A 4BVYA 1GTAA 3MDKA 2LKUA 4ZB8A 1WWJA 1GTBA 4NHWA 2I9HA 5C04A 3QPMA 2DJJA 1M2AA 4NMUA 5CRDA 4DSSB 4GTUA 3W6GA 1AUCA 5KEJA 4EVMA 2HZFA 2VO4A 5ABRA 2YZUA 2YCDA 1KNGA 2VL3A 1DSBA 1M9BA 1ZL9A 3FR3A 2C3NA 5GAND 1YDKA 1A8LA 3KP8A 1B48A 1F3AA 1VF2A 1SL1B 3F4SA 2WULA 1GSFA 3VLNA 1UVZA 3S9FA 4O7HA 1SD9A 5IPGA 1GLQA 1RW1A 1TOFA 4OFMA 3J7Yk 5CNWA 3UBKA 5JWRB 2A2SA 4DSQA 3HJOA 1DBYA 2QSIA 4Q5NA 1OYJA 1VF3A 7GSSA 2GQLA 1YY7A 1Y6EA 2D2ZA 3F6DA 2X99A 4WETA 4EXJA 1NHOA 2GZPA 1WJKA 3DVXA 1BQ7A 2QKEA 1QQ2A 5IPHA 2VL9A 2R6KA 4XS1A 1AC1A 3D5JA 2GQKA 4X1UA 2H0HA 1UN2A 5ECQB 1JFUA 1SL0B 4ZB6A 4MMMA 2G2QA 4POLA 2YWOA 1AXDA 2H6ZA 3KEBA 1GSQA 5GZZB 2FUG2 5FWGA 4HQSA 3EU4A 3VPQA 2AUVA 4WKWA 3HKRA 3DRNA 1AIUA 1M2BA 5L71A 3TDGA 5H5SA 5JCWA 4KSOA 2H6YA 5GAPD 8GSSA 3JCML 2C1YA 3KCMA 5HR1A 2LEGA 2C0DA 4TR4A 4J56E 5B6MA 1H4OA 1PN9A 1X5EA 4MLYA 1WE0A 4KSMA 4ECJA 4YQVA 1MDJA 3KM6A 2B5YA 3RPPA 1THOA 4BWQA 3VWXA 3KP9A 2MMOA 1BAYA 2BTOT 4DSRA 1G6YA 2NPBA 1EV9A 4AGSA 2REMA 1XPVA 4O5RA 4YAPA 1QXHA 2M46A 2F3MA 4K1FA 4GRFA 2H01A 3LWAA 2IN3A 4QL9A 3ZITA 1GH2A 4KE3A 1HNAA 2OJLA 5HFKA 1GRXA 4K0GA 3APSA 19GSA 5KN2A 2IMDA 2P0GA 3UEMA 4V2NA 2IFQB 4WR5A 3FZ9A 1A24A 2PGTA 3CRTA 2WFCA 4I5QA 3TRQA 3M9KA 4ZL9A 2GS3A 2C0GA 3IHQA 2FD3A 1LJRA 1G7EA 1TJDA 2VD0A 4Q5FA 1T1VA 2R2JA 3V1WA 2YZHA 5AGYA 2MYGA 2K8SA 2RUFA 2PVOC 3GKMA 2AV4A 5JWOB 2XBIA 4MF7A 4N0ZA 5G5EA 4V1Ag 1TRVA 3DYRA 2AB6A 4WEYA 3TKQA 1XW5A 4NXIA 4CHSA 2V2GA 4ZBBA 3KIJA 3C8EA 4RQRA 2B6MA 1YZXA 1SKRB 5ELAA 4ID0A 3ZMKA 1K0BA 2WDUA 4FYUA 4I2UA 3WGEA 3HVVA 5A5KA 4I97A 4TXOA 5ECLB 5HR0A 4QQ7A 1QFNA 3TRPA 3TJFA 3QDNA 5E4WA 1EGRA 3QD9A 1XW9A 4L5LA 2DLXA 4ZBAA 1OVNA 4TR0A 1PGTA 3APQA 4TXOB 4K7IA 4JE1A 1JHBA 1O8WA 3IC4A 4MCUA 3EINA 1OAZA 2P5RA 2LJRA 1GTIA 1J9BA 3TOUA 4FYBA 1M99A 3DD3A 2B5EA 4IQAA 3I69A 1ERWA 1SK1A 2IMEA 2RM6A 4HS1A 2NVLA 2XHFA 1GUKA 3NZNA 1MEKA 2N5AA 3SBCA 1B9XC 4V2MA 1FVJA 4PQ1A 3G7YA 3NOFA 4BA7A 1OC3A 2CVKA 3PH9A 4MH3A 1U87A 3IV4A 4EC0A 4V2LA 2FGXA 2XPEA 2QGVA 4WXTA 2PVQA 2YPMA 3HXSA 2H30A 2J23A 4L8EA 4XTSA 2I1UA 2H19A 4EDZA 4PUFC 2K6VA 6GSTA 1XVQA 2FWHA 2V6KA 3DEXA 2YJHA 1A0FA 1MD4A 3H79A 2X8CA 4RQXA 1SJIA 4FYCA 3TB2A 3HYPA 2EIQA 1XXUA 1Z6NA 5CRHA 4AJ6A 1DUGA 3R2QA 4MPGA 2VM2A 3PINA 2JL4A 1FW1A 4LL1B 2CV4A 5CREA 1BEDA 4KDUA 5DVBA 1YF1A 3E3EA 4PNGA 1Y25A 2HSYA 3ERWA 2MMZA 1A2LA 3KH7A 4ZXGA 2JZRA 4MZBA 3ZMLA 3CTFA 5J5NA 4LMWA 3TGZA 5ECNB 3TKSC 3RHCA 1ZYEA 5E59A 2B3SA 2YJ7A 1UC7A 3UBLA 3GA4A 1T4YA 4H86A 3FY7A 5D93A 4OO4A 1TRSA 4J2FA 2C3QA 3H93A 4IJIA 4O92A 1ZCPA 2GLRA 5ECRB 4TOPA 2LSTA 4XRDA 5DBQA 5HQPA 3L9SA 2VCWA 5CRGA 4AJ7A 3KTBA 1SK0A 2OKAA 4GSNA 5IOXA 4G19A 4F03A 1X5CA 1V57A 1F9MA 3LYKA 3QFAC 3ME8A 1PQNA 1GNEA 1SL2B 4WF4A 3D4TA 1ST9A 2EIRA 2E7PA 4JZQA 1IYHA 3TKPA 3U5RE 1PX6A 4OO5A 5A4VA 1EEMA 3EMPA 2ZCTA 3WT1A 2VAFA 9GSSA 2RUEA 3BCIA 3FEUA 2E0QA 1YKCA 3GSTA 5G1LA 3CYNA 3IE3A 1GWCA 2CT6A 2JSZA 3LXZA 1AQXA 1T8EB 1VGLA 1LBKA 4DSSA 2N5FA 1WPIA 2GDRA 1CQHA 1AAZA 2IMIA 2HSHA 3ERFA 3RBTA 3GTUA 1XFLA 4E8HA 1FG4A 4LMVA 2KP2A 5J3RA 1IYIA 3NIVA 2OE0A 1SU9A 2LJAA 2XC2A 3FR9A 5B8BA 3GTUB 1GUMA 1XWCA 3UMAA 3F8UA 4TVEA 1NSWA 1I9DA 2YWIA 4G9HA 4POMA 2VD1A 1ERTA 1B8XA 1YQ1A 1QGVA 2YN1A 1E2YA 5D9TA 4MK3A 1XWAA 3LQ7A 2MBSA 3RAZA 3M1GA 3LEFA 1PA3A 5ECOB 2H71A 4JRRA 4XS6A 5G31A 2DBCA 3IK9A 1OE8A 3F63A 3KJYA 3C73A 4EE0A 4PQHA 2GZYA 2LRCA 2OACA 2ALBA 1TU7A 3FZ5A 3C7MA 2CVDA 4HJMA 1FO5A 4IP6A 5ID2A 4TXVA 2O8VB 1A0RP 2WZ9A 3N5OA 1A2MA 4ML1A 1V58A 1V98A 12GSA 1X5DA 4XRAA 1GULA 2ON7A 3F4TA 3ZTLA 3IK7A 3CMIA 5J9BA 5H5QA 5ID2B 4ZL7A 1JZWA 3M0FA 2F8AA 4LA1A 2IPAA 1HQOA 5INYA 2FA8A 2V1MA 2RM5A 3KTLA 1G0TA 3A2VA 4BVXA 5GSTA 5ECHB 1WRYA 5EVOA 2GT6A 4PUAA 1SK2A 1K0MA 5IO0A 1G6WA 5ENUA 1RQMA 2DIYA 1Z3EA 1AQVA 2WS2A 3DKSA 3LFLA 3D0ZA 1K0OA 2C8UA 2A4VA 4JR4A 3BCKA 4GSTA 4POBA 1M2DA 2DC5A 1AQWA 3TKRA 4FIWA 4BL7A 3GMFA 1PMTA 3ZREA 5CO3A 4DEJA 3P90A 5A4WA 4GF0A 5LCZA 4GXZA 3GIXA 1B4PA 5HFIA 4MZCA 2DMLA 1C72A 4MPFA 4K6XA 4IGJA 5HR3A 6GSWA 5COHA 3O6TA 2C80A 3FZ4A 1PRXA 5IO2A 2CZ2A 3ZYWA 4JBBA 5F06A 4MF5A 4E8EA 2CAQA 4F0BA 2CX4A 1HYUA 5GSSA 1R5PA 2IFQA 4D73A 4ECCA 5LD0A 5G30A 1YF0A 4KB3A 1VRSD 1BG5A 3VK9A 4X43A 1PKZA 2P5QA 1YEPA 1X9WB 2H8LA 4ECBA 3A2WA 3GHAA 4TR3A 4EDYA 5DDLA 4KNDA 4D73B 2LTKA 5JWQB 1EP7A 5F07A 5IMFA 2FWFA 3G9BA 2LRTA 3TJBA 3PGTA 1DE2A 3CRUA 1QK8A 1SJ6A 3IAS2 2EIOA 2WB9A 2GT5A 1KTEA 3TKSA 4TW5A 5CYYA 1TK0B 5EY6A 2AAWA 3KH9A 5IMCA 2LJKA 2CA8A 1PX7A 4ZIJA 5HR2A 1TRUA 6GSYA 2HE3A 3DGQA 1TI1A 4OCEA 3BD2A 3CSHA 4WBJA 1F37A 3EYTA 4K8MA 4ACSA 3A2XA 1T7PB 4IELA 3BOAA 3LG6A 5F8BA 1W89A 3RHBA 2FA4A 5IOWA 1OE7A 2VOCA 4IKHA 2OADA 1A23A 2ES7A 2H75A 2H0GA 3IBHA 1S3CA 3UAPA 5DCGA 2R3XA 1K0DA 5IM9A 2KUCA 2PU9C 1XW6A 5CAXA 2PUKC 3LGCA 3WGXA 1ML6A 1W4VA 3IOSA 2H70A 2V32A 3GRXA 2KLXA 3CSIA 3GL5A 2X64A 1X9SB 2IMKA 3ZVJA 4OMVA 3HVSA 2DJ2A 3APOA 3M9JA 5IMZA 4HJ2A 2YWMA 3BJ5A 2NTOA 4KCEA 2B1LA 2V41A 3D4MA 2OA7A 1GL8A 6GSUA 1XWBA 4IBPA 3IDVA 1G7OA 4KH7A 5LNKe 2FHEA 3WT2A 3HHVA 1WIKA 4ZB9A 4Q5QA 4LLRA 2YP6A 2C0FA 4FH8A 1M9AA 4L0WA 1F6MC 3F6FA 1PL1A 4XS4A 1TK5B 2OBIA 1THXA 2MMNA 2PMTA 1QMVA 3EMXA 1MDKA 5F05A 1S3DA 4F2IA 1TW9A 5J4UA 4XS4B 2P31A 3O3TA 2IIYA 5JCGA 4HU9A 4NWYA 2K8VA 1ZMAA 4P3YB 2H0IA 1GSYA 3GX8A 2O7KA 2G0FA 2RIIA 4ILFA 4PXOA 4G2EA 3QAGA 2DJ1A 4PQIA 4HZ4A 4XIHA 1NM3A 2GQMA 1XIYA 3ZL5A 3QCPA 1OC9B 4F82A 5IMVA 2GTUA 3WD6A 4KDXA 1EGOA 4TRXA 3UARA 4AJ8A 3VFIA 1EOHA 3GH9A 4WR4A 3Q6OA 2X8GA 1X0RA 2IMFA 4JEDA 1JZOA 2K18A 3EURA 3GYKA 1O81A 2QC7A 3GL3A 2I81A 3N9JA 4I6XA 1GNWA 3G7IA 4GQCA 3MAKA 1TRWA 4V1Ap 2K9FA 1USBA 3VURA 5B8AA 4JU5A 1ZZYA 5KN1A 2L5OA 3P2AA 5IMDA 4ECIA 3ME7A 3ZVJD 4L5OA 1BYEA 3GSSA 4NV5A 1SYRA 2KOKA 2LS5A 1FVKA 4MJBA 4MJEA 5CP1A 2M80A 1ON4A 1U3IA 2AJQB 2H76A 13GSA 3I6AA 2H1BA 3I43A 3GV1A 2IL3A 2H1GA 2F9SA 2FWGA 2HNLA 1XWGA 5HFGA 1Z6MA 1K0AA 2C4JA 3VWUA 2HFDA 2OE3A 4OWYA 1TXXA 1OKTA 2VCTA 4ML6A 2H6XA 1FOVA 1R26A 2YWNA 4NHZA 2FWEA 3FKFA 4Z7XA 1V40A 2VLUA 4YAVA 3LYPA 10GSA 2WCIA 5H5RA 3CXGA 3GUSA 5G1KA 3GKNA 1TDIA 4TR1A 2VL2C 22GSA 1OKDA 2X8HA 1O6JA 4EF0A 2GSSA 4FO5A 2FCHA 3CBUA 4MZWA 2C3TA 3UL3A 3L9VA 3KMOA 4N0VA 4XCSA 2Z9SA 1RK4A 3GX0A 4I2TA 3KGKA 2I3YA 1XOBA 4TR1B 3DMLA 4NPBA 3FK8A 3F4RA 5ECMB 2J9HA 3D22A 3HZ4A 4IVFA 2LQQA 3TJKA 4TN8A 1Q98A 4WF5A 2OE1A 1JZDA 2IJYA 4TKYA 3EU3A 4IHUA 5ECKB 1MTCA 2DJ0A 3MSZA 4HI7A 3OR5A 1K0NA 4RI6A 2PPTA 1GSUA 5EPFA 1QUWA 2H73A 4HQZA 20GSA 1JLWA 2JSYA 5KN0A 1NW2A 2N5BA 4KAEA 3GNJA 1SKSB 2HRNA 3IAM2 2VLVA 5KN3A 2KHPA 2FY6A 3L78A 1N2AA 4HDEA 3VI7A 3W8SA 3M3MA 3IR4A 2I4AA 5IQYA 2JADA 5DQSA 3ISOA 3DWVA 4XHMA 1M7TA 4K2DA 2IWTA 4N11A 1TP9A 2ZNMA 1S3AA 1XWKA 5AIVA 3HY2A 4RUVA 3LORA 2HT9A 3ZFLA 2VCXA 4K0NA 1R5AA 2F51A 3H8QA 1GP1A 4GWRA 3C1SA 3UIWA 5AIXA 1O73A 3DXBA 3HCZA 2L4CA 2HYXA 2VCQA 5A4UA 3IA1A 4N10A 2YV9A 1XZOA 4EKZA 3GURA 5D96A 1BJXA 1WOUA 3LSZA 4KW6A 4YQMA 3IRAA 1B4QA 5C00A 3HJMA 1R7HA 2CX3A 2MZCA 1KBNA 4ZBDA 4OD7A 5ECIB 4KDYA 3CSJA 2O87A 3ED3A 3FZAA 5JCUA 1YJ6A 1LU4A 1Z9HA 3KD0A 1GUHA 1ZGNA 4K7OA 3Q74A 1GSDA 2CQ9A 2WJUA 4WBRD 2H74A 3F3RA 1YKAA 5ECSA 3VPTA 3VI5A 1Q4JA 5FT3A 2PBJA 3ZZXA 1O85A 5G5FA 1DE1A 4K9ZA 2L6DA 3O76A 4HUAA 2E2GA 5EL8A 3KZQA 1MD3A 1PL2A 5B6NA 3LXTA 3VWWA 3KXOA 2C0EA 1N8JA 3GH6A 4MJAA 3C1RA 1B9YC 3ZIJA 5F0GA 4IW9A 3CTGA 4HU7A 3Q19A 2LQOA 3MWHA 1VF4A 4GSSA 3UVTA 1MDIA 2GZZA 2MBTA 1CQGA 16GSA 2ZUPA 3G7JA 3IXRA 3U6VA 2XBQA 2HRFA 3QR6A 1E6BA 2TIRA 2R4VA 1F2EA 2DIZA 2H66A 2BMXA 3A3TA 4Q5RA 4I8BA 1ACVA 2CAIA 4IJ3A 3IPZA 1URMA 1XBSA 1OC8A 4GQFA 3D21A 3HDCA 3RDWA 3FR6A 2VIMA 4OFNA 4LL4B 2FLSA 4MF6A 1TTZA 2PWJA 1EV4A 2HZEA 3WGDA 2LV3A 1TU8A 4ZL8A 4K7NA 2WGRA 1GTUA 4EUYA 2L59A 3A5WA 2MMAA 3DVWA 6GSVA 3LJRA 3RPNA 3Q18A 2YOIA 1SENA 6GSXA 1J0FA 3ZIVA 4PURA 4RI7A 2LRNA 4J57E 2JZTA 3US3A 1JZRA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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