2HS6A

Crystal structure of the e291k mutant of 12-oxophytodienoate reductase 3 (opr3) from tomato
Total Genus 137
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
137
sequence length
376
structure length
362
Chain Sequence
NPLFSPYKMGKFNLSHRVVLAPMTRCRALNNIPQAALGEYYEQRATAGGFLITEGTMISPTSAGFPHVPGIFTKEQVREWKKIVDVVHAKGAVIFCQLWHVGRASHEVYQPAGAAPISSTEKPISNRWRILMPDGTHGIYPKPRAIGTYEISQVVEDYRRSALNAIEAGFDGIEIHGAHGYLIDQFLKDGINDRTDEYGGSLANRCKFITQVVQAVVSAIGADRVGVRVSPAIDHLDAMDSNPLSLGLAVVERLNKIQLHSGSKLAYLHVTQPREEEEARLMRTLRNAYQGTFICSGGYTRELGIEAVAQGDADLVSYGRLFISNPDLVMRIKLNAPLNKYNRKTFYTQDPVVGYTDYPFLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of 12-oxophytodienoate reductase 3 from tomato: Self-inhibition by dimerization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 12-oxophytodienoate reductase 3
molecule tags Oxidoreductase
source organism Solanum lycopersicum
total genus 137
structure length 362
sequence length 376
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.1.42: 12-oxophytodienoate reductase.
pdb deposition date 2006-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2hs6A00
1G67A 5AN7A 1A50A 2VEPA 1GG1A 3AO0A 3S5OA 3BG5A 3NM1A 5I3JA 1A5BA 1TPFA 4ZQNA 3DHDA 1GQNA 3EX6A 2CU0A 2W79A 4IPIA 1F7BA 1FCVA 3CPRA 4OWGA 4YLWA 5BMWA 3Q2DA 1SO5A 4H3DA 1J4EA 3TH6A 3S5NA 2WSYA 1FXPA 2RDTA 4PCFA 5AHIA 2CLMA 2DZUA 5HMSA 3PSWA 4UCGA 3CM4A 1LBMA 1SW3A 1PHWA 2H3BA 2HMCA 3W73A 3G1SA 3NPWA 5AYXA 1LOLA 4M7SA 3UWWA 4A2SA 1FDYA 4JY9A 3C52A 1AW5A 4Z0JA 4LT9A 4UFMA 1Z48A 4L4MA 3G18A 2PE4A 4JTEA 1LM1A 3M16A 3MP3A 2D73A 4OBTA 4K7YA 5D03A 2VFFA 2VELA 1NAL1 3TXVA 3O15A 3TK7A 3TE9A 1UBSA 3LCXA 2XFWA 1T96A 3CLMA 3C2EA 2GVGA 3A9IA 3G0XA 2X30A 5FEWA 3DFTA 4LVDA 3OVPA 5EY5A 4U4MA 3UWVA 2Y88A 2PRLA 4MIMA 2Z2UA 5HQEA 1ZAJA 2X1SA 2V30A 4TX9A 2E6AA 1KLZA 1X1OA 2WKJA 2FPVA 5E1QA 3CEUA 2ISVA 3Q94A 3N9SA 4MZ8A 2QCLA 2WJZA 1R47A 1N7KA 4UR8A 3P60A 1KM6A 2B4GA 1SSDA 3TSDA 1GEQA 3GLCA 1BKSA 3CTLA 3MP4A 3O05A 5A5WA 1TTIA 5D2WA 1H1YA 1TV8A 1SUXA 2R94A 3GNNA 2BTMA 2CWNA 2CZ5A 2Y63A 2TYSA 2Y6ZA 4JYDA 3NQEA 4AF0B 1JCNA 1WBHA 3BARA 2ZRZA 1GVRA 4NJIA 3OA3A 4K38A 3LM7A 1GVQA 4PTNA 2DP3A 3DGRA 8TIMA 2F84A 3HOJA 3LOTA 3HG3A 4UNLA 1B4EA 3G24A 4RZ5A 3G1DA 3GXNA 1M6JA 3B03A 4YMZA 1ADOA 2A7NA 3BW4A 3O06A 3LRMA 3PR2A 1YDOA 3W83A 3EXSA 1YDVA 4BF9A 3LCLA 3LTSA 2YYTA 1G4EA 2CLIA 2CLKA 3E9AA 1MSSA 4GUGA 1KA9F 4CQ9A 4LVFA 1Z41A 2Y62A 3C4UA 2Q3RA 3NL5A 3M5ZA 2G96A 4C1LA 1EP2A 3IIZA 1TPWA 3DU0A 3LERA 1ICSA 2C18A 3LB0A 1EEPA 3P80A 5AFDA 1W5OA 3BLIA 1VQTA 1CW2A 3MYOA 3IRDA 2X16A 4LS2A 1UJPA 3NQ2A 3QMSA 4AH7A 2E5CA 5BW6A 2LLEA 4MZ1A 5I3GA 3STEA 1I2NA 2E5DA 2WOQA 3QH2A 4PL1A 2NV1A 2Q8LA 3SECA 2VFHA 3NPUA 1W54A 4O1BA 3RU6A 5D33A 4FF7A 3CB8A 3KVKA 2X1UA 1H7WA 2CW6A 4K8EA 4LC6A 4O14A 1K03A 1XBXA 2DZXA 1OFEA 1EWDA 3UPWA 2TPSA 3NQMA 2W0UA 4LS1A 1D3GA 3GYEA 1DV7A 1W5MA 3QPYA 2FB2A 3IV3A 4HPXA 1XM3A 1VZWA 1F5ZA 4WUIA 4UTHA 2ZZ7A 1EWEA 4PODA 4N6EA 4RCXA 3O63A 1J2WA 1U5JA 1W5NA 3FYPA 1TREA 3QQ0A 3FOKA 4XWUA 4HNVA 3ATZA 4PL2A 3PBUA 4PA8A 5L9FA 1DHPA 1HFBA 2ZRXA 4OGZA 1KM3A 1XL9A 3LHWA 1JUEA 3LXAA 2JBMA 5LHEA 2P0OA 3E96A 2ZDRA 4FXSA 3NA8A 1VLIA 4IWWA 2OT0A 3L0KA 4AMAA 1HUVA 3OIXA 3T78A 5K3VA 4LY8A 1I8JA 4DQWA 3NQAA 4GJ1A 2FTPA 3T40A 2TMDA 1MEIA 3TJLA 4WX2A 3GAKA 4M19A 1AW2A 1DBTA 3MJYA 4UUIA 3R12A 4JN6A 4MZYA 1TRDA 1E51A 3LCIA 4A2RA 3W88A 5FESA 5EBUA 3W7OA 3W9ZA 5LNWA 4Q33A 3P8IA 3CWOX 1SZGA 1QFEA 3JR2A 4AAJA 3HMJG 2VOMA 5CZJA 1TTQA 3PULA 1QPOA 3QRHA 5D30A 5HJLA 5DLCA 3UNDA 3G1YA 3G8RA 4O4VA 3PAJA 5BMXA 1YPFA 1VYRA 3KX6A 5D05A 3RNDA 5FF0A 2BWGA 1OFDA 2QAPA 5AHLA 2VKZG 4FNUA 1VH7A 1TB3A 1GTHA 1F2JA 4OU1A 3QW3A 4X22A 4DF0A 5AB3A 2Z6JA 5U7SA 3QSTA 2G97A 3W7QA 2R14A 3W7LA 4LWWA 3NL3A 1JULA 1YDNA 2J88A 1JRCA 6ALDA 1FCQA 4O1DA 4IUOA 2OT1A 1A5CA 1SFLA 1JCXA 1RQBA 4AHPA 2CLEA 3PSVA 1Q6QA 4NZFA 3LHUA 5CPMA 4JX6A 4ADUA 3U2OA 3WJSA 4EWND 1FCBA 2R8WA 5LNSA 1UB3A 1GG0A 3EWBX 5HWJA 2DZWA 5BOOA 1OG0A 2ZFAA 1P0NA 4PC8A 1H51A 3O6YX 2FJKA 4MY1A 2GUUA 5K9XA 1O95A 3B8DA 3S8HA 3HGSA 3HG4A 3PS7A 1V5XA 5DCEA 1EIXA 3GKAA 2Q3OA 1D9EA 3RLUA 2VFIA 3GXTA 2GJLA 1D3HA 3UWUA 4ADSA 3FLUA 3G22A 4GUHA 3STCA 3NG3A 1OJXA 1OFPA 2NWSA 2QEZA 2E1DA 1JUKA 3UXAA 1FWWA 5J5DA 3UWYA 2VENA 1TTJA 2GVJA 3A21A 3I65A 4M6PA 1X7FA 4EF9A 2VEIA 3CIXA 2NZLA 1OF6A 3S1WA 5I3FA 4RZ6A 3HB9A 1LBFA 1EPXA 1OYBA 4HKPA 3W2LA 2TRSA 3STFA 1OK6A 3CEPA 3C2VA 4ICNA 2V5LA 4BI5A 3EX2A 1CI1A 4NJJA 3BG3A 3HJZA 4JTKA 3KRZA 3KVMA 4HT3A 4NX5A 4HSOA 4K39A 5LGXA 2BXVA 1IXOA 1G4SA 2X1RA 4O0KA 1FWTA 1HO4A 2YW3A 4Z08A 1TQXA 1RZMA 3R13A 1V7YA 3D0CA 1KV8A 4NZJA 2VEMA 4QJ1A 3W2KA 2VC6A 2YW4A 3MHGA 3TMLA 4P61A 4TU1A 3S1UA 1FX6A 3CQ0A 1QMLA 3GR8A 3QMRA 4UMCA 3V1PA 3F4NA 2WNZA 3NYZA 4TMBA 1ZJIA 1C8VA 4RX0A 3W2NA 5C5YA 2V2DA 2Y7FA 3HG2A 2E5BA 3O8AA 3STGA 3TV8A 3R5EA 3IVTA 1K8XA 3LRLA 1VYPX 3S6DA 5CPLA 1VS1A 1BTMA 3M0ZA 4UTUA 1G7UA 4JTHA 3RFAA 3LBCA 1DL3A 4U28A 4LS0A 1TV5A 1MEWA 3G1FA 1U83A 3GDLA 2CZEA 3LV6A 4EIVA 3FJLA 4FB7A 3DFQA 1B4KA 3H55A 5H91A 1N55A 4CNPA 1B57A 1TPVA 2FIQA 3A22A 5I3KA 5AHMA 2H3DA 3GNDA 3HGJA 5D38A 1DJQA 2J6XA 3T4CA 3TAOA 1WV2A 4QQ3A 4HPJA 5TQLA 1OFRA 3NPXA 3LXBA 3MMTA 4E38A 1M7OA 3BGGA 4UC5A 4X2RA 2H8ZA 1LLZA 5D32A 3UZJA 4FX8A 1SO4A 5D2VA 1WOAA 1KTNA 3L0GA 4IOTA 1QOPA 1PE1A 4FNRA 3EXRA 3W1XA 4DO5A 3LXCA 1WQ5A 3QPZA 4IXHA 2H90A 2RFGA 2WSRA 4UTTA 1KFJA 4D2JA 5LNRA 4JNMA 3M5VA 1OX4B 1ZAHA 2Y7GA 1T99A 1BWKA 2V2CA 4FX7A 2CLLA 4TMCA 2BSLA 2VXNA 1MEHA 4OHQA 2EGZA 4ML9A 3DFOA 3W1PA 2QCDA 1QO5A 3W7NA 5KTLA 3WJYA 3B06A 5GVJA 5EL1A 5K4XA 1TIMA 3PF3A 4RXGA 4XBKA 2PC4A 3DHFA 1H5YA 2Q8ZA 4O18A 2A6LA 3GDKA 5DCDA 3DI0A 1KM4A 2J9ZA 1TPB1 7TIMA 4L4LA 3KRUA 4AWSA 1Q45A 4QSHA 3GK0A 4N4PA 3TA6A 1LTDA 4GBUA 3TSMA 4RV8A 2WO5A 3MHUA 3ABOA 2DZTA 1GYLA 3QM3A 3TMQA 1FQ0A 3UQNA 3PM6A 2RH9A 1W1ZA 4GUFA 1B9BA 5LNVA 3FJ6A 3P67A 3LRKA 4O1CA 4JYFA 3WFAA 5KZMA 2PRHA 1GPWA 4LNYA 4WOQA 3BLEA 4GC4A 5G2WA 3JRKA 4Z1DA 2E6FA 5HUOA 1SU5A 3ZWTA 3TFXA 4WY0F 1QDSA 3I68A 4IMDA 3IEBA 1TRIA 1VLWA 4Z1BA 4RJEA 5D04C 3P62A 3TIMA 2Y7DA 1M7PA 4JTSA 2CLFA 2VFEA 1VCFA 5F1UA 2YZRA 4BFAA 3THAA 4N6FA 4NQ1A 1TO3A 1ME7A 3EB2A 3H53A 1YPIA 4HNTA 3W23A 4LW7A 1KTCA 4WXYA 1VGAA 4LTSA 4MLRA 3G3MA 1W3NA 4OV9A 1Q3NA 4BI6A 1SSGA 2C15A 5MHBA 3MBFA 3N9RA 2E6DA 2YYUA 3C61A 5HINA 4ZQPA 3FS2A 5F4WA 4UTKA 5HULA 4RXFA 2ZTKA 4JTIA 4ORIA 1A5SA 4GRSA 5HUPA 1GYNA 3FKRA 4IMCA 1DQWA 1JQXA 5DBTA 1QO2A 4IQLA 1I2RA 2V9DA 1EP1A 4O4WA 1XXXA 5EPDA 3GXPA 2YPIA 5C2XA 4IX2A 3C3NA 1F73A 1LROA 3GIYA 5AHFA 1RV8A 2XN1A 5FF2A 1NF0A 1A5AA 4XKYA 3BG9A 1F74A 5F2IA 1EUAA 1H61A 3IGUA 2P10A 3ATYA 3P82A 5CKSA 4QM1A 4DELA 2ZRUA 4NNAA 3W1NA 1QR7A 2YCEA 2WSQA 3SGUA 2Y85A 1IIHA 2A5HA 1MZHA 2EAWA 3W71A 1HL2A 5DXXA 4UMBA 1H50A 1XFBA 2C14A 1OK4A 1C29A 1KFKA 5T26A 4IPJA 1KFLA 4MKNA 2OMAA 3QSRA 3TC7A 2C19A 3NO5A 1JRBA 4X3ZA 3MI3A 4AB4A 1ICQA 3NQ6A 1YXCA 4RZ4A 1VHNA 3MHFA 4FNQA 1I2OA 1P5BA 4H4IA 1X6UA 3W87A 2ZYFA 1K8ZA 3G0SA 4M7TA 4Y90A 3LX9A 2NUWA 1KFCA 4UFJA 1K8YA 5HR6A 3W1TA 4A3UA 1SO3A 2FPTA 1SZFA 5AC6A 1AL8A 3W1RA 4I7UA 1LZOA 3L5AA 3OBKA 3NL2A 3G1XA 1FCUA 2ZZ6A 3OG3A 3BV4A 4K6AA 3P5YA 5DCBA 1I2QA 4CQAA 3P7YA 1H7PA 3YPIA 2QDGA 1KV5A 1JCLA 1VPXA 4DF1A 1XI3A 4ZQRA 3I6RA 3NR0A 3EKZA 3TQKA 1F6PA 3NZRA 3C0JA 4EVZA 3LCFA 1YLVA 2VFGA 3DFNA 1O5XA 3HGOA 4WJEA 2A7PA 1IGSA 4JIQA 4RLIA 1ME9A 4R7JA 4UFKA 2B7OA 3SGZA 3ZFHA 1G69A 2V0TA 3M41A 3W7HA 6TIMA 2FFCA 4XBSA 3MUXA 1JJKA 1SZEA 5DY3A 2CZDA 2GQ9A 2NUYA 3O1NA 3GDRA 3UWZA 3S5YA 3A5FA 4ADTA 4B5NA 4JTFA 3VNDA 3LI0A 1SZNA 2ALDA 4I7VA 3KRSA 2FB3A 2JKAA 2NX1A 4WY0A 3GDMA 1KBIA 5AC7A 4UTWC 3O16A 5AYZA 1HG3A 4GFSA 3S9YA 2Z0IA 2QAFA 1DKWA 2NXHA 3W1AA 3C2FA 3B05A 1OFQA 2O7QA 1CX9A 1VJIA 1X8FA 5KITA 5D2XA 3ABSA 1L9WA 1G7VA 4JX5A 3HQ1A 4GUIA 1JCYA 1LBLA 2VEKA 1OABA 1QAPA 1ICPA 3TUUA 1L6WA 4ZQCA 1GVFA 4NNBA 3GVGA 1H1ZA 3N2MA 5EKYA 3L9CA 4FNPA 1NVMA 2ZA1A 4UTMA 2YGYA 1J5TA 2F7FA 3B0UX 5D02A 1PV8A 2ZBTA 3NAVA 1M5WA 2Y89A 5EMUA 3PG8A 4N9EA 4N02A 1OFBA 1SW7A 5K2ZA 3F4WA 4FIQA 5FI8A 4BR1A 1GVOA 4K36A 3P84A 4ONVA 5FEXA 1Q6RA 4R34A 3M1ZA 3HO8A 3TX9A 1XCFA 4JICA 3SFKA 4KFOA 3AJXA 1UUMA 4CCDA 3MBDA 3OVRA 3VKJA 3S42A 4TO8A 3G3DA 1TPC1 3W85A 3F1QA 2V5BA 2OJPA 5AC8A 1H63A 1KM2A 1NF7A 2B7NA 4UNKA 2BLEA 1K7EA 2PRMA 2V2HA 3TW6A 5EA9A 3LCHA 4UTJA 3OVQA 1S5VA 1RD5A 1L6YA 3NQCA 4YWIA 3P81A 3HGRA 5G2HA 2VFDA 3M9YA 3EWUA 2Z1BA 1QPNA 4GWEA 4MYAA 1XDLA 4N2YA 3ABQA 3PC0A 3IVSA 3CHVA 3TFCA 2OX1A 3QMTA 3PB2A 3BW2A 3WK0A 3DFSA 3UY7A 1PS9A 4QAIA 2A6NA 1VYSX 3L68A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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