2HSAA

Crystal structure of 12-oxophytodienoate reductase 3 (opr3) from tomato
Total Genus 136
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
136
sequence length
376
structure length
376
Chain Sequence
NPLFSPYKMGKFNLSHRVVLAPMTRCRALNNIPQAALGEYYEQRATAGGFLITEGTMISPTSAGFPHVPGIFTKEQVREWKKIVDVVHAKGAVIFCQLWHVGRASHEVYQPAGAAPISSTEKPISNRWRILMPDGTHGIYPKPRAIGTYEISQVVEDYRRSALNAIEAGFDGIEIHGAHGYLIDQFLKDGINDRTDEYGGSLANRCKFITQVVQAVVSAIGADRVGVRVSPAIDHLDAMDSNPLSLGLAVVERLNKIQLHSGSKLAYLHVTQPRYVAYGQTEAGRLGSEEEEARLMRTLRNAYQGTFICSGGYTRELGIEAVAQGDADLVSYGRLFISNPDLVMRIKLNAPLNKYNRKTFYTQDPVVGYTDYPFLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Solanum lycopersicum
publication title Crystal structure of 12-oxophytodienoate reductase 3 from tomato: Self-inhibition by dimerization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 12-oxophytodienoate reductase 3
total genus 136
structure length 376
sequence length 376
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.1.42: 12-oxophytodienoate reductase.
pdb deposition date 2006-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2hsaA00
2Z6IA 3B0VC 4DELA 2UV8G 4HNVA 1QWGA 1G4PA 3M0ZA 1KM2A 6ALDA 4HN4A 2QCLA 1KLYA 3T55A 5AHNA 2ZDRA 4UFJA 4Z0JA 3UXDA 3G8EA 4LW7A 1LRQA 4H4IA 3UWVA 4ONVA 2R8WA 1R30A 2JGYA 1SO4A 1GG1A 4K7YA 4A2RA 4JDBA 1GT8A 3W7GA 1P5BA 3NPXA 3TJLA 3PS7A 1L6WA 3PWAA 3G0XA 1S5TA 1AL7A 3G8RA 3LCIA 3A9IA 3FKRA 2HMCA 3N73A 3L0GA 4JYFA 5L9FA 4XZ9A 4UTTA 4CLMA 1EWDA 1TIMA 4I9AA 3W7JA 1RVGA 3C52A 4HKPA 1Q6QA 2J9ZA 1ZJIA 1N8FA 3F1QA 4XTDA 2A7PA 5D2YA 1DORA 3MBDA 1OFOA 1RPXA 3TNOA 2AGKA 4OQVA 4IMFA 3W7QA 2BX7A 5C6MA 1XKYA 4O19A 3VE9A 1LDCA 4ZQNA 3TE9A 2V2DA 4UTJA 5EPDA 2CFFA 3OIXA 2J6XA 1L6YA 5F2IA 3OVPA 5D2VA 5DXXA 2JBMA 3UWYA 3BK0A 1H60A 5I3FA 4TMBA 4JTGA 3HO8A 4JIQA 1GQNA 1FUYA 3GDMA 3TDFA 4DO5A 1GYNA 5AHLA 3S9YA 1T0OA 2ZA3A 1ZCOA 1DQWA 1OYAA 3LHUA 4E2BA 1S3HA 4QSHA 1H61A 1JCJA 1XDLA 2WV8A 4N6FA 4TU1A 1A5CA 1X1ZA 4FNSA 5KSWA 4R7JA 3TQ0A 1TTJA 3S42A 2C13A 2A4AA 2E6FA 3DFPA 4HT3A 4LUIA 3LRMA 3TUUA 1YTEA 2CLMA 4MVAA 4ZL1A 1IIGA 3I7SA 4JS3A 4ZQMA 3G1YA 4BWLA 4JICA 3LTPA 3M1ZA 2FIQA 2QCGA 3HBLA 5DCDA 4AHOA 4O15A 4N9EA 4LVBA 3G1AA 4O17A 2GQ8A 4DBEA 1KFLA 4UTKA 5HUPA 3LTSA 4Z08A 1SSGA 4GBUA 1P4CA 3B06A 1GEQA 3LERA 4FXRA 3GX9A 3I7RA 2G95A 3TV8A 4LUJA 1ME7A 3NPWA 4O1AA 1ME9A 1K03A 5T26A 1ICPA 3W1NA 3A5FA 3SW6A 1ALDA 3DHFA 3RU6A 4HNNA 3BLFA 4FX8A 1YXDA 2FPTA 2P1FA 3GNDA 3W71A 2O7QA 2WQPA 4GUHA 5F1VA 4K7VA 3OBKA 1IIHA 1N7KA 1X8FA 5AYYA 1OFPA 1KFCA 3CIXA 2A21A 3N19B 2NLIA 2B7PA 3NA8A 3W1AA 5K3VA 1DHPA 2GQ9A 4ZQPA 1PV8A 3PSVA 3SGZA 4ADUA 5CGQA 3N2XA 2Y7EA 2RHGA 2A1YA 2QJHA 3L2IA 1ZHAA 3P5ZA 3G1SA 3LHZA 3LLFA 3QC3A 2J88A 2V9DA 2Q8LA 1VLWA 3TSBA 5HULA 4LOCA 1I8JA 4JTIA 3STCA 3RF9A 4U28A 4KFPA 3NPUA 2ZRYA 4LTSA 1YXCA 1OX6A 1SFLA 4PODA 2CLEA 3LM7A 4AMAA 1OG0A 4LV9A 3W9ZA 1LCOA 1J4EA 1WQ5A 2V2HA 3FIGA 1OFDA 2FFCA 4BI6A 1GVOA 1OF8A 2J9XA 3LTYA 5CG7A 2AQWA 1QAPA 3LHYA 4DF1A 1M7OA 5I3HA 4OWGA 1WYIA 3S0CA 1PCKA 2FJKA 2F7FA 1LROA 3QFEA 1EP2A 2GUUA 3HF3A 4JY9A 5I3KA 1YADA 3BG3A 2YW3A 3TX9A 4Q4KA 4LVGA 2TPSA 2YCEA 1IGSA 3L65A 2OJPA 3GYEA 3G0SA 2ABAA 3TU9A 5AB3A 3DGRA 3SJ3A 2ZBTA 2PCQA 3C61A 2RH9A 1EWEA 2C14A 1THFD 2Q3RA 2ALDA 3RNDA 3S5OA 3SIZA 3W88A 1JCXA 4LV4A 3QMSA 1OK4A 5D03A 1UCWA 5KZDA 3O07A 3MUXA 1B4KA 1A5BA 2WSQA 3W83A 5LNRA 4O57A 1NEYA 2HSAA 5AC6A 4RK8A 3UPBA 5EMUA 1BTMA 4JTTA 2RDWA 5BNKA 2J9YA 3KVKA 1LRTA 3C4UA 2ZRWA 2ISWA 1H62A 1W31A 3A23A 4LVFA 1W3IA 3W1TA 1I2NA 3L67A 4LT9A 2C18A 2F84A 3HJZA 1I2PA 1H7OA 3ZWTA 4AH7A 5AYXA 1B57A 1W5MA 1FWSA 4IMEA 1UJPA 1G7VA 2HS8A 4O1DA 3S1UA 3M6YA 4K37A 3PUDA 1WBHA 5LGXA 3O16A 1KA9F 4Y6GA 1OYCA 1KM3A 2A2IA 1QMLA 3O05A 5D2WA 3W7IA 3ZWSA 1SU5A 1XL9A 2NX1A 1U83A 3C2OA 1TJPA 1K3UA 4DF2A 4LS1A 3EXRA 3GAKA 2R14A 1H7WA 1WBJA 5G1YA 3W7PA 1E51A 1O5KA 3B04A 1QPNA 4EOUA 5LHFA 2G97A 3EWZA 1EB3A 5EA9A 3BLIA 1TPH1 4UTWA 3SFKA 3W7LA 2Y70A 1GVSA 3FYPA 2VFHA 3QPZA 2NV2A 2V81A 4RR4A 1Q3NA 1PIIA 3KAOA 2ZA2A 3PM6A 4A21A 1JCMP 3VCRA 2WSRA 2QF7A 4AEOA 1YPIA 1JUBA 1R46A 4DPPA 4FNRA 5I3IA 3TJXA 3C3NA 3I68A 4WQ6A 4JTFA 4GXMA 4LS2A 5C2XA 5E93A 1O5XA 2DZSA 2NUWA 2H3DA 1PE1A 4YL2A 5FEPA 3G3DA 5K9CA 4I7UA 3QMRA 2NUXA 4H3DA 3KXQA 3GR7A 3W74A 5D09A 1J5TA 4Y9AA 5KZEA 2Y62A 1W0MA 5CPNA 3HGSA 2I9EA 1LZOA 5DCEA 2CLIA 2GVLA 5K7JA 1FCQA 1GJPA 1PL9A 3HPZA 5BOOA 2ZZ5A 2EGZA 3AJXA 3QPYA 3P60A 2H8XA 1T99A 1F6PA 3HB9A 4FX6M 4UFKA 2QCFA 3DAQA 1H7NA 5G2HA 3VNDA 2QCDA 4DEFA 4J9JA 1GWJA 4UIOA 1VGAA 3R5EA 4LRSA 3EXTA 4HNUA 4IXHA 1QFEA 2V30A 3FOKA 2FTPA 2VC6A 1TPFA 1WXJA 2E5CA 3TA6A 1XC4A 3UWZA 3IRDA 3Q37A 1OX4B 1NVMA 4O18A 3M5ZA 1QPRA 3TW7A 4CQAA 1DVJA 4BI7A 3NYZA 3SI9A 3DI1A 2CZEA 1VH7A 4H6KA 4IXXA 3DFSA 3CTLA 1D3GA 3WJYA 4Z0SA 5AHFA 3T4CA 4UTMA 5DELA 4LS0A 5CPMA 1KM0A 4DO4A 3OEXA 3HGRA 3HG2A 3TH6A 4O10A 1QPOA 3UY8A 1H7PA 1ADOA 1XDMA 3EWYA 3ABQA 3N9RA 3GKFA 3S5YA 2C19A 5F1UA 5LKYA 1FWNA 3M47A 3LCXA 5U7SA 2E5DA 3QW3A 1UB3A 2RDUA 3PVFA 3THAA 5HR6A 3MP5A 3P61A 3PAJA 1YPFA 3DU0A 4AWUA 4XBSA 1CW2A 2FPVA 3UXAA 3DFTA 4TR9A 4LRTA 1VYPX 1X1OA 3NQVA 3TW6A 2VFGA 3C6CA 3STGA 1ZAIA 2QCEA 5AHEA 2C0AA 5DCBA 1FCVA 3HIJA 5F4XA 3T78A 3W2NA 2X1RA 3NG3A 3NQGA 3DFQA 2C15A 3NNTA 1RR2A 1ICQA 4LC6A 4O12A 4GWEA 2ZZ1A 1VLIA 4GC4A 2AAMA 3GDRA 3GZ3A 5C5YA 2QJIA 3BO9A 4JD4A 4JYEA 2YYTA 1KW1A 3NEVA 1L9WA 5DXYA 2TRSA 2YFNA 3W85A 4AF0B 1LOQA 2B7QA 1XBYA 5FF4A 5FF2A 1MZHA 2E1DA 3T40A 3NQAA 3G18A 3T7VA 4AVFA 3UWUA 3P67A 3EB2A 3NL6A 4FNUA 1H50A 3ELFA 1KV5A 4K6AA 2PRHA 1SZEA 2ZZ3A 3FEMA 3NL2A 2Z6JA 4MKNA 2PRMA 4NXKA 5K9DA 3ATYA 1TQJA 4ZQRA 3HG3A 2VEIA 1TYGA 2Q8ZA 3NQ6A 4PCFA 1EUAA 3LV5A 2A0NA 3PG8A 4N9DA 3EWUA 3MHGA 3UWQA 1IXNA 4OBTA 2ZYFA 1GYLA 5CZ0A 1AW5A 3EXSA 1TPUA 4NU7A 1QO2A 2A6NA 3O6DA 1WOAA 1B3OA 3LCWA 1OFEA 3UY7A 3W1XA 1K8XA 1LLZA 1K02A 4UTHA 4NJJA 2PC4A 2GVGA 3CM4A 3M5VA 4MY9A 5BMXA 4K38A 1A5SA 4NJIA 5HMSA 2V0TA 3M5XA 1HTIA 4GNJA 1YLVA 3NZRA 1IF2A 4MZ1A 4X22A 1MEHA 3UNDA 5D05A 1DV7A 4JGDA 1T8XA 1OJXA 2CLFA 5D04C 2C16A 1R2RA 6TIMA 4NX5A 3TROA 3TFCA 1DJQA 2V82A 1V7YA 2WKJA 1XXXA 2CLOA 5G4WA 2FPYA 3LGEA 1UUMA 4O13A 1AMKA 2ZTJA 4YCPA 2W79A 5DBUA 3R2GA 3W1RA 1H7XA 3BW4A 1QOPA 1QNVA 3RMJA 5D33A 3SGUA 1VC4A 4D2JA 3BG9A 3NQEA 4O16A 3W2KA 2B0MA 4NX0A 1I4NA 1YDNA 3A24A 4RJEA 1DKWA 1TMHA 1SFJA 1RV8A 1FDJA 3IVUA 3HGJA 3PBYA 1F2JA 2A7NA 3BPWA 4JTKA 4DPQA 3ANYA 2X2GA 3W2UA 3TSMA 1AL8A 4XQ6A 3S5ZA 5KMYA 4AHPA 1OX4A 2CLLA 1TB3A 4S1FA 5HJLA 3NQ8A 5AC7A 5D30A 4WZHA 1FCUA 1ML1A 3LXAA 3M44A 2CLKA 3NGJA 4O1CA 4RZ6A 4YXGA 4JTEA 1Z48A 4W9TA 1Z42A 2XFWA 4QJ1A 2WNQA 2QKFA 2XN0A 2X30A 1DBTA 5E0KA 4PC8A 1QOQA 4BR1A 5F2GA 5KZMA 4AWSA 3KVMA 7TIMA 1B4EA 1T96A 3QMTA 3GVGA 4BF9A 3EX1A 4MY8A 1L6SA 3NQCA 1G69A 3N14A 1SZFA 3C2RA 5HWNA 3PULA 2YFOA 3LDVA 4MYXA 2DJLA 3EX4A 4QNEA 1SW0A 2B4GA 2YX0A 1C9DA 1GVQA 5LNSA 1KFEA 3NO5A 3A22A 3W76A 3S6DA 1W56A 5SWUA 1A50A 2OX1A 2OZ0A 2WJZA 5KINA 4LVAA 3CEUA 1P0KA 3W87A 2NWSA 1JUKA 2WPBA 3PB0A 4YLWA 2HS6A 4Z1BA 3PG9A 2OT1A 3L68A 3TAOA 4POCA 4PH6A 4FX7A 5HUOA 1F6KA 1FXQA 1PVNA 3IV3A 3KFTA 4EWND 2FQIA 1FDYA 4Z1AA 1G4SA 4XUGA 3I6RA 3S1XA 3CWNA 4IQLA 2VELA 2H6RA 4Y96A 3NQ2A 4IMCA 3FS2A 3FA5A 4OGZA 1K7XA 4MJZA 2QCDB 3TQKA 2GPTA 2YDAA 3ABOA 4FB7A 1R47A 3B0PA 3NDOA 3P74A 1K7FA 1G7UA 1RQEA 1W5PA 2VEKA 4M6QA 3TC7A 4RCXA 2QCNA 2P0OA 1OYBA 3TAKA 2ISSA 2NX9A 4AF0A 1GPWA 1EUNA 1X7FA 1OFQA 4N02A 3WJZA 1R2SA 3NL3A 2BWGA 4OT7A 2C3ZA 5HQEA 4WOZA 5LHEA 2X1TA 3NPVA 2Y6ZA 3R13A 2E77A 4XBKA 1H1YA 5HINA 4O28A 5D32A 3OHIA 4AXKA 3QF0A 3TC6A 4JTHA 4O4WA 1FY6A 3M43A 2JKEA 5HNRA 5TIMA 4C1KA 3MP3A 1YDVA 3O8AA 2ABBA 2FB3A 4WUIA 1KM6A 3S1VA 4CNNA 4MFEA 3KX6A 3LBCA 5LNUA 1ZFJA 3GIYA 3RLVA 3L5AA 1KM4A 1C29A 3SR7A 2Y63A 3W72A 5IBXC 1GTHA 3EWBX 3M41A 1RZMA 4IX0A 2VFIA 2DP3A 4LVDA 4UXDA 3SSJA 3TSDA 2E6AA 3W7EA 3A5VA 1LRNA 3SY5A 3C2VA 3MO7A 4JEQA 1KFJA 4P61A 3B0UX 1O4UA 4BK9A 4O0KA 1PCWA 1HO4A 4FIRA 1XBVA 4O54A 5BRBA 3I65A 4FEZA 2C6QA 2Q3OA 4FNTA 4UFHA 2ATMA 1LLWA 1WV2A 1OFBA 4UR7A 1OHLA 1VCVA 4PFMA 3GXNA 1D3HA 4YMZA 3W1PA 3UZJA 5D2TA 2D73A 3HG5A 1TTQA 3BG5A 2RFGA 1GTEA 4TX9A 8TIMA 2CZDA 4IX2A 4NVTA 5KTLA 1ICSA 2TYSA 1UBSA 3TKFA 2NUYA 1N55A 1TPVA 4JX6A 1QDSA 2NXHA 1F76A 4GUGA 1KTNA 4MYAA 1W37A 3E96A 1XM3A 4Q33A 2Y85A 1KTCA 4HPJA 5CPLA 2YR1A 2BLEA 1FWTA 1MO0A 3PR2A 5LNWA 3L5MA 3CB8A 4XKYB 2A6LA 3IGSA 3W7CA 1TPWA 2XN2A 1VR6A 5DLCA 4IGHA 3W2LA 4UTTC 3VI2A 4UNLA 4ZQCA 5GVJA 4NJKA 1I2OA 4DO6A 1ZAHA 2P10A 1MSSA 3F4WA 2DORA 3IEBA 1ONRA 3QYQA 3B03A 1ZAJA 3M16A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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