2HU1A

Crystal structure analysis of hen egg white lyszoyme
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
publication title Elucidation of the mechanism and end products of glutaraldehyde crosslinking reaction by X-ray structure analysis
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
total genus 49
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2006-07-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2hu1A00
1LKRA 4ETAA 1UA6Y 1YAOA 4NSIA 1B7PA 1DI3A 1WQMA 3TMWA 2BQNA 1F6SA 4NHSA 2Z2EA 4KXIA 1UIBA 5F9UA 1XGUC 1FN5A 1IC5Y 1BGIA 4G9SA 1NMMA 1LSBA 1LZDA 5LAGA 3A3QA 4MR1A 3ZVQB 1EQEA 2C8OA 2HEAA 4WM3A 2ZNXY 1IOTA 1OUEA 2DBTA 3CB7A 2DQIY 4OWCA 1HMKA 1LHMA 4X3BA 2XBRA 3CT1A 1GFTA 1QIOA 1CJ7A 4L41A 1JHLA 5J7CA 1FKVA 133LA 1GB5A 1CKDA 2BAAA 1B9OA 1NQIA 3WUAA 1LMTA 4XENA 5I5QA 2EPEA 4CGEA 2F30A 2DKVA 4H94A 4H90A 3N9EA 1BB4A 5L3HA 1C45A 2BQIA 4PHIA 1P2CC 1IC7Y 3G3AB 4QDNA 194LA 4ETBA 1GEZA 3CT0A 1HELA 1A2YC 2BQMA 4NGKA 4OOTA 1JEFA 1FLWA 4RW2A 4H9AA 1LSGA 1LZAA 208LA 3TXIA 1TEWA 1IWTA 2XTHA 1GF5A 1V7TA 2HEBA 1IY4A 1HERA 4XJIA 4RDSA 4EOFA 3W6CA 1UIGA 1YAQA 3OK0A 1QTEA 1REXA 4TUNA 4NGVA 1LOZA 1WQRA 4YOPA 1BVKC 2BQFA 3T36A 1XFPL 2X0AA 3A90A 1C7PA 4GCDA 1RI8B 1YANA 1H87A 4YEOA 1LJHA 1DXJA 1JKDA 1HEOA 2LYOA 3LYTA 3EO5A 5B1GA 3T6UA 1NDMC 2FBBA 4H93A 5EBHA 3HBEX 1BB7A 1LYYA 3IJUA 1LMNA 2BQBA 1B0DA 1LJGA 1LMQA 2Y8PA 4NSJA 1XGTC 3AGHA 1QDRA 3AJNA 1CKCA 1LHLA 1OUBA 1LSAA 4YM8A 1CKHA 4GCEA 3CSZA 2IHLA 1GDWA 1LSNA 2FYDA 4QGZA 1B7NA 1WVVA 5KXZA 2DQGY 1LZ6A 1YAPA 1IP6A 3TXEA 2I26L 4KT3A 4NWHA 1LZ8A 2D4KA 2EIZC 1BB6A 4QEQA 4TSCA 3WXTA 1LSDA 4H92A 1GFKA 1NDGC 3LZTA 4A7DA 5K7OA 135LA 1LMOA 3A94A 4XYYA 1UIFA 4GLVA 1GB7A 1IWWA 2H9JA 4WMGA 1YROA 2CDSA 2H9KA 3IWRA 4DD7A 1UC0A 2WARA 1BWIA 2ZIKA 4AXTA 5F9XA 5B07A 1HFYA 4HJZA 3LYMA 3WPKA 5KXTA 4LFXA 1LZCA 1CKFA 1OUCA 1IO5A 3EBAB 1QSWA 2BQKA 1LSCA 5KXOA 4NG1A 3QY4A 1CJ9A 1IP7A 4YENA 4PRUA 4NHQA 3P4ZA 4OWHA 5FELA 1F0WA 1JJ3A 3TXFA 3WU7A 4RW1A 1GF4A 1HFZA 1VFBC 3AGGG 4WL6A 3WPJA 4HP0A 5LA8A 1IC4Y 2LYZA 3N9AA 2BQOA 4IATA 1CJ6A 4LYZA 3TXDA 1IEEA 1LPIA 1EL1A 5APCA 3TXHA 3WL2A 1VEDA 3A92A 4DD2A 4UWNA 6LYZA 1IR7A 1JSEA 2BQJA 1LZEA 4H9EA 1GF0A 4N1EI 2YBLA 1CKGA 5KJ9A 4LYTA 1G7JC 207LA 5DN4A 1HENA 3AGIA 1YILA 1IVMA 2G4PA 5LA5A 4ZFPA 1JUGA 3EMSA 4DDAA 1GFVA 2YBJA 3AB6A 1LSEA 1GFGA 4H8YA 4OWBA 5DN5A 2MEEA 5KXXA 1LJKA 4WG7A 3WU9A 1EQ4A 4CFOA 1LJEA 5LAFA 1G7LC 4MCKA 4AGAA 1GB0A 1GEVA 3VWOA 1GB8A 1GBOA 4XJDA 4Z41A 1YKZX 1IX0A 1LSPA 2MEFA 4NGIA 2Z37A 1D6QA 1XEIA 132LA 4NGOA 1CJ8A 3ATOA 4GCCA 1LYSA 1IY3A 3KAMA 4XJBA 1LZRA 1B5YA 4BAFA 2YSSC 4H91A 3TXGA 2Z18A 4R6CA 5KY1A 4XN6A 1MLCE 1C10A 4ETDA 1SLYA 1VAUA 3CQLA 1LZ4A 1XGQC 3CT5A 4G4BA 3W6AA 2ZWBA 3RT5X 3W6EA 4UWVA 1JITA 3ZVQA 1YQVY 2ZYCA 1AT6A 4ET8A 3RZ4A 1GBYA 5KXKA 4XJFA 1HEWA 2W1LA 3GXRA 1LZGA 1YL0X 1JIYA 1GF7A 1LHJA 1VDQA 2MEGA 3G3BB 5M1YA 5FSTA 1DKJA 4DC4A 3TXBA 4UWUA 1LTMA 4J1AA 1QDTA 3WU8A 4N0JA 4GN4A 1WQQA 4E3UA 4HPIA 1GE3A 1LHIA 3P65A 1GB3A 3AZ7A 2XJWA 3J4GA 4HPEA 1CNSA 2HU3A 4DWXA 2Z2FA 4ML7A 4NG8A 1DQJC 1LYZA 4NHPA 4WM2A 4WM5A 5E4PA 5APDA 3BKHA 4I8SA 6LYTA 5HMVA 1FDLY 4DD1A 1GBWA 1GF3A 1NWGA 1WTNA 1LSMA 2YBNA 4FDYA 4HTKA 4NFVA 5FEKA 4B4EA 4XJGA 3WW6A 1XEJA 2DQFC 2EKSC 5KXLA 2F2NA 2F4GA 5JENB 1DI4A 1GXXA 4HJYA 3RU5A 4WG1A 3ZEKA 3D9AC 2CGIA 4B4IA 1BHZA 4PPOA 4CFPA 1IIZA 4DD0A 4B4JA 1AKIA 2W1YA 3CSRA 4NEBA 1GAZA 1UUZC 1MELL 4ET9A 5LVIA 1HEPA 1HSXA 2HUBA 3B72A 1PS5A 5T3FA 4B1AA 1AZFA 1FLUA 1TCYA 3LYOA 2MEIA 3A67Y 3WULA 4M4OA 1UACY 3M18B 1LMAA 1HSWA 1WQOA 7LYZA 4Z3MA 4RLMA 1D0LA 2MECA 5KKIA 1LZ1A 1LSZA 1UIEA 1IP2A 1LMCA 2HEFA 1QUTA 2ZQ4A 3CSQA 4LZTA 1KIQC 1GF8A 1INUA 2Q0MX 4LYCA 8LYZA 1GFUA 4LT2A 5FCPA 1HMLA 1J1XY 4WLTA 1N4FA 1W6ZA 3B0KA 1GFHA 3A3RX 1ALCA 2LZTA 3WXUA 2YVBA 3AYQA 1JTTL 5A3ZA 5KXPA 2A7FA 3LHMA 4RLNA 4TWSA 1OP9B 5LIOA 5I4XA 3N9CA 1GBZA 5L3IA 1Z55A 1W08A 2C8PA 1LYOA 3A34A 4WL7A 134LA 1XSFA 4W94A 1JKCA 5DLAA 3QE8A 1DPXA 1VDPA 3HBHA 4BAPA 5LVJA 2GV0A 153LA 1GPQC 4NSGA 1J1PY 1GFJA 1B7SA 2YBIA 1DPWA 5D5CA 5C6IA 3TMUA 1LJIA 1KIRC 4WO9A 1HFXA 1LJNA 1BWJA 4HJVA 1OUJA 1TBYA 2BQDA 2EQLA 1BVXA 2YDGA 4KL7A 1LJ3A 3BKVA 5B05A 4H8XA 1B2KA 193LA 2DQJY 4LYMA 4LYOA 1F10A 4YEMA 1OUGA 5I4YA 1RE2A 3P64A 1LZYA 2ZQ3A 4M6DA 4P2EA 5A3EA 1GFAA 4II8A 1ZVYB 1TAYA 2N5ZA 4ETCA 5F81A 5DL9A 1H6MA 1I56A 1JKBA 4WM6A 2BLYA 3TXKA 3WMKA 1OUIA 1IOQA 4DT3A 2HTXA 1D6PA 1IR8A 4QY9A 1GDXA 1GFEA 5APFA 2Z38A 1DKKA 1JJ0A 1LCNA 4WM1A 2DQCY 3SP3A 1G7MC 2BQGA 1FLQA 4WM4A 5II3A 1WQNA 2H5ZA 1RFPA 3EXDA 1GE4A 1IWXA 4H9FA 1E8LA 1HHLA 4ANRA 3ULRA 1I1ZA 5LVKA 5LINA 3A91A 3E3DA 4G4CA 1B5XA 4BS7A 2D4JA 4TX7A 1BWHA 1OUHA 1EQ5A 3ATNA 1GB6A 2FBDA 1GFRA 2MEAA 1PZYA 1REMA 1LJFA 4OW1A 1LZNA 1IOSA 5F14A 1QQYA 1GAYA 3F6ZA 1LHKA 3WVYA 2BQEA 1GE2A 3A6BY 4H9CA 4LFPA 1V7SA 1UIDA 2ZILA 4HV1A 4DDBA 1G7IC 5I54A 4GN5C 1B7MA 1IOCA 1LZ5A 1GF6A 4J1BA 2HEEA 5HQ1A 1WTMA 1JJ1A 2HECA 1B5ZA 2DQDY 1LZSA 2Z39A 2NWDX 3A96A 3MGWA 4N9RA 2DQAA 4LT0A 5KXWA 5IELA 1IWUA 4GCBA 5FHWA 1B5VA 2VB1A 2BQLA 5KXMA 4N8ZA 5C6JA 5ILCA 4MSTA 1WQPA 1GB9A 3B0IA 3D3DA 4R0FA 4ZEEA 4PGJB 1GE1A 5LYMA 1QSAA 154LA 1IORA 5HLLA 5B06A 4HTQA 1GXV2 5IDDA 1YL1X 4H9IA 2IFFY 2ZNWY 3J6KA 2D4IA 1LMPA 1OUDA 4IASA 3WH1A 2AUBA 5D5FA 5LXWA 2DQHY 5L9JA 1B5WA 1OUFA 4J0LA 1I20A 1YAMA 3AW7A 3M3UA 2G4QA 2Z12A 4Z46A 4WLDA 2RSCA 4C5FA 1LZ9A 4B49A 1B7RA 1BQLY 1LSYA 1IWYA 1SQ2L 5ILFA 1NF5A 4H9HA 4NGJA 1GWDA 4B0DA 4O34A 3RNXA 1HC0A 1IP1A 1ZMYL 5KXNA 4NGYA 2LYMA 5I53A 3A93A 3TMVA 5FDJA 1LJJA 3B6LA 2PC2A 3AW6A 4LT1A 1HEQA 4WLXA 1JTPL 1JKAA 1C08C 4G4HA 4TTDA 1LHHA 1HF4A 2HEDA 5LYTA 3LYZA 3W6FA 3FI7A 1GF9A 1KXXA 2W1MA 5DM9A 5APEA 1B7OA 1WVUA 4XADA 1UIAA 1LKSA 2BQAA 1IP3A 1C43A 2MEBA 4NY5A 5LVHA 1NBYC 5LVGA 1IWVA 4EMNA 1D0KA 4NGLA 5LYZA 3AZ6A 4YF2A 1LZTA 4GLAA 5B1FA 1NBZC 1BB5A 1HEMA 3WW5A 3WUMA 1GD6A 1JSFA 1KIPC 4WLYA 5F16A 4ETEA 1UBZA 2B5ZA 1KXWA 3AZ4A 5KXSA 4D9ZA 1B5UA 1B7LA 2HU1A 2D6BA 1FBIX 5B59A 1JPOA 4NGWA 1G7HC 2XBSA 2D91A 1XGRC 4LGKA 4OOOA 4CJ2A 1REYA 1GBXA 1TDYA 9LYZA 2YBMA 1RJCB 1D9UA 1YKXX 2G4NA 3WVXA 1ZVHL 3IJVA 5HMJA 1KXYA 4GN3A 1F6RA 3P68A 4OWAA 1VDSA 1DZBX 4FJRA 4U3XB 1T6VL 2F4AA 1IP4A 3W3EA 5E9RA 1T3PA 5KXYA 1NKHA 3WUNA 1UCOA 1LAAA 3A8ZA 3WYHA 2MEHA 1BB3A 4TSBA 1GE0A 2DQEY 1A4VA 4PRQA 2LZ2A 1FLYA 1HNLA 4KPMA 1RCMA 3LZ2A 4H9BA 1D0MA 5IHGA 3FE0A 4NGZA 1OUAA 1NHEA 4DD9A 3AZ5A 4HTNA 5KXRA 1IP5A 1LJ4A 1YIKA 3A6CY 4Z98A 1C46A 2CWIA 1JWRA 4H8ZA 1XGPC 3P66A 2CJLA 1AT5A 4N5RA 5KKJA 2A7DA 3WPLA 3RW8A 4DD3A 1FKQA 3HFMY 3W6BA 1JTOL 4CHXA 1GB2A 4HSFA 4H1PA 4DDCA 1OQMA 4J7VA 5C6LA 2I6ZA 4ZIXA 1IWZA 2W1XA 1DI5A 5HNCA 4NHIA 4OWEA 1GHLA 1QTKA 4G49A 2ZYPA 4C3WA 4NHTA 1UIHA 1O23A 1VATA 4PJ2C 4W96A 4GCFA 1REZA 2Z19A 1AM7A 4NWEA 1XEKA 3A95A 3HBDA 1GBSA 1ZV5L 1IR9A 3GXKA 4N1CC 2BLXA 3QNGA 5HNLA 1YKYX 4LYBA 3B0OA 4I0CA 4WOAA 2BPUA 3OJPA 3TMXA 1JISA 1UICA 4WO6A 3LN2A 4LT3A 5AMYA 1LZBA 2ZIJA 1LSFA 1B7QA 4NIJA 1J1OY 2BQHA 4IJ4A 4BADA 5I4WA 4HV2A 2I25L 4DYGA 1QUSA 3K3TA 2LHMA 2YBHA 4XJHA 2FYCA 3TXJA 2BQCA 1VDTA 3W6DA 4NSHA 2MEDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1YAOA 1B7PA 1WQMA 2ANXA 4KXIA 1K28A 5F9UA 150LA 4G9SA 1NMMA 1LSBA 1LZDA 1EQEA 4WM3A 3CB7A 2DBTA 1HMKA 1LHMA 4X3BA 2IGCA 4I7OA 4W56A 1GB5A 3WUAA 4DQ7A 3N9EA 1T6HA 2OEAX 4PHIA 3CDOA 4ETBA 2BQMA 1JEFA 1PQDA 208LA 1TEWA 1GF5A 4XJIA 4RDSA 1UIGA 1QTEA 257LA 1L56A 1LOZA 1L11A 1QTBA 1BVKC 1XFPL 4EKQA 209LA 3A90A 4YEOA 1LJHA 1DXJA 1JKDA 3SB6A 3EO5A 3HBEX 1LYYA 3IJUA 2BQBA 1L39A 1LMQA 216LA 3CDVA 4YM8A 4ARQA 3CSZA 3SB8A 1L08A 1L76A 1QT8A 1LZ6A 1BB6A 3C7WA 3DNAA 1GFKA 3LZTA 1LMOA 4XYYA 1C61A 1IWWA 162LA 2H9KA 3V2YA 1CU6A 2ZIKA 1L30A 1IO5A 2B74A 4I7KA 4YENA 4PRUA 3AGGG 1LYDA 1IC4Y 3FA0A 229LA 1CJ6A 1XJTA 1C6NA 3WL2A 1P6YA 1JSEA 1G0KA 2YBLA 4LYTA 141LA 3GUJA 3GUMA 4ZFPA 3C80A 1SWZA 4EJ4A 1GFGA 5DN5A 5KXXA 1XJUA 1LJKA 4WG7A 5LAFA 2B75A 3VWOA 4XJDA 230LA 1L89A 1D6QA 1L88A 1L75A 4NGOA 1T8FA 1CJ8A 3ATOA 4GCCA 4EKPA 5KY1A 4XN6A 1VAUA 1OVHA 2ZWBA 1L20A 4ET8A 1HEWA 1SWYA 2W1LA 1L41A 1JIYA 2F32A 1LYGA 4I7LA 1C66A 1PQMA 1L84A 1GB3A 3C81A 192LA 4HPEA 3OE9A 1L33A 2RB1X 2Z2FA 4WM2A 1DQJC 211LA 3GUOA 4WM5A 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1LZTA 1BB5A 127LA 1D3MA 1GD6A 1JSFA 1UBZA 1ZWNA 4D9ZA 1B7LA 1L24A 5B59A 1G7HC 2D91A 4OOOA 4CJ2A 1GBXA 1TDYA 2YBMA 1F6RA 1CV4A 3SB5A 1LGXA 1DZBX 4FJRA 1T3PA 2LZMA 5KXYA 1BB3A 4KPMA 1HNLA 5IHGA 3HTDA 1L32A 1OUAA 1NHEA 3C7ZA 1IP5A 1YIKA 4Z98A 5KXRA 2CWIA 115LA 4H8ZA 3P66A 3HTFA 3GUIA 1FKQA 4J7VA 1G07A 3RUNA 4NHIA 200LA 1C6AA 2ZYPA 1UIHA 1O23A 187LA 2Z19A 1AM7A 2OU8A 2BLXA 1CV1A 2RBPA 4I0CA 4WOAA 1KS3A 3TMXA 1UICA 167LA 4WO6A 1LSFA 4IJ4A 4BADA 5I4WA 2FYCA 4NSHA 1L74A 1G0MA 2MEDA 1LKRA 4ETAA 156LA 1UA6Y 4NSIA 2Z2EA 1XGUC 1IC5Y 1L07A 1NHBA 3A3QA 1C68A 2C8OA 3F8VA 120LA 1L82A 180LA 3CT1A 1GFTA 4ARLA 1CJ7A 3SB7A 1DYDA 1LMTA 1QTVA 4CGEA 2F30A 4H90A 5L3HA 3HU8A 3G3AB 4QDNA 1HELA 1A2YC 1KW5A 2RBNA 4RW2A 1FLWA 1IY4A 1HERA 1YAQA 1REXA 4NGVA 1WQRA 3HT9A 7LZMA 2BQFA 184LA 239LA 4GCDA 1YANA 1H87A 2LYOA 1HEOA 5B1GA 2FBBA 5EBHA 1LMNA 1P36A 1XGTC 3AJNA 1CKCA 4LDEA 1L00A 1LSAA 1L77A 1JTMA 3G3WA 5KXZA 2DQGY 1L03A 1YAPA 4KT3A 1LZ8A 2D4KA 4QEQA 1NDGC 4A7DA 4I7NA 235LA 4GLVA 1GB7A 2H9JA 4WMGA 2CDSA 4ARMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1LKR A;  4ETA A;  1UA6 Y;  1YAO A;  4NSI A;  1B7P A;  1DI3 A;  1WQM A;  3TMW A;  2BQN A;  1F6S A;  4NHS A;  2Z2E A;  4KXI A;  1UIB A;  5F9U A;  1XGU C;  1FN5 A;  1IC5 Y;  1BGI A;  4G9S A;  1NMM A;  1LSB A;  1LZD A;  5LAG A;  3A3Q A;  4MR1 A;  3ZVQ B;  1EQE A;  2C8O A;  2HEA A;  4WM3 A;  2ZNX Y;  1IOT A;  1OUE A;  2DBT A;  3CB7 A;  2DQI Y;  4OWC A;  1HMK A;  1LHM A;  4X3B A;  2XBR A;  3CT1 A;  1GFT A;  1QIO A;  1CJ7 A;  4L41 A;  1JHL A;  5J7C A;  1FKV A;  133L A;  1GB5 A;  1CKD A;  2BAA A;  1B9O A;  1NQI A;  3WUA A;  1LMT A;  4XEN A;  5I5Q A;  2EPE A;  4CGE A;  2F30 A;  2DKV A;  4H94 A;  4H90 A;  3N9E A;  1BB4 A;  5L3H A;  1C45 A;  2BQI A;  4PHI A;  1P2C C;  1IC7 Y;  3G3A B;  4QDN A;  194L A;  4ETB A;  1GEZ A;  3CT0 A;  1HEL A;  1A2Y C;  2BQM A;  4NGK A;  4OOT A;  1JEF A;  1FLW A;  4RW2 A;  4H9A A;  1LSG A;  1LZA A;  208L A;  3TXI A;  1TEW A;  1IWT A;  2XTH A;  1GF5 A;  1V7T A;  2HEB A;  1IY4 A;  1HER A;  4XJI A;  4RDS A;  4EOF A;  3W6C A;  1UIG A;  1YAQ A;  3OK0 A;  1QTE A;  1REX A;  4TUN A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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