2HULA

Crystal structure of t4 lysozyme s44c synthetic dimer
Total Genus 62
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
62
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKCELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title An approach to crystallizing proteins by synthetic symmetrization.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 62
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2006-07-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2hulA00
1C67A 1L08A 1T8GA 1L18A 1L45A 1KS3A 1C62A 201LA 1L23A 1LYEA 218LA 258LA 1L36A 1SX2A 1SX7A 213LA 1L46A 3D4SA 1L26A 215LA 235LA 3HUKA 4OO9A 5I14A 219LA 3HUQA 4I7QA 1G0LA 243LA 180LA 2RBPA 1C6AA 3LZMA 217LA 2B6XA 1L17A 1G0QA 2LZMA 233LA 3HDEA 1DYFA 1L03A 1L68A 1L80A 3HUAA 1L09A 4W52A 123LA 157LA 225LA 1LYIA 1C69A 192LA 2B6ZA 155LA 110LA 1OWZA 2O7AA 1T8AA 1L81A 4ARMA 1C6EA 1CV3A 2ANVA 1CX7A 2NTGA 4ARLA 1C6LA 227LA 120LA 1LWGA 4W58A 1L01A 1L48A 4ARMB 1XJTA 104LA 174LA 1L67A 1L37A 244LA 1L07A 3FADA 3G3VA 1LI6A 3SB9A 3V2YA 1P2LA 1QS9A 3C83A 4DAJA 3DMXA 4I7RA 1L43A 1QSQA 146LA 1CU3A 1L05A 1CV6A 1L64A 1C6BA 3C8SA 142LA 1CU6A 3ODUA 1P36A 138LA 1D3MA 3RUNA 245LA 1L72A 250LA 234LA 237LA 3C8RA 4W57A 232LA 4LDLA 3HH4A 1T8FA 1CUPA 2OE7X 2B7XA 3L2XA 1C6IA 3SB8A 3NY9A 1L0JA 1DYGA 3DMVA 2IGCA 1L31A 1LYJA 3GUIA 1C6HA 1L91A 1C6QA 3CDOA 1L12A 256LA 1NHBA 127LA 1OVJA 3CDVA 3SBBC 1C6MA 1I6SA 1P46A 3G3WA 1C6PA 1P7SA 1XJUA 1KW7A 1L38A 1L94A 1L95A 131LA 1L61A 1L11A 3CDTA 2B74A 4ARJA 1L87A 1L33A 4W59A 3DN1A 128LA 3GUPA 1KNIA 1L90A 251LA 151LA 1LGXA 1CV0A 1QS5A 178LA 1LPYA 3HT8A 3C8QA 1CV4A 1LWKA 2B75A 1B6IA 1L20A 3DKEX 1L82A 183LA 1G0KA 119LA 3OE0A 3HTDA 4IAPA 3G3XA 224LA 3L64A 1L98A 1SWZA 1LW9A 1L35A 4W51A 1JTMA 1T97A 1C6CA 4LZMA 1LYFA 143LA 249LA 199LA 107LA 3HTGA 3FA0A 3HH3A 2F47A 1QUDA 4EKSA 191LA 4DKLA 3CDRA 1C66A 1QUGA 1L32A 1CV5A 2RAYX 1T6HA 3CDQA 1L65A 3FI5A 3HU8A 1L60A 1L04A 1C6TA 3HWLA 125LA 3V2WA 3UONA 169LA 3HTBA 3C81A 113LA 1L0KA 1L74A 228LA 1P56A 1WTHA 5LZMA 175LA 168LA 1L57A 3HU9A 4GRVA 4EJ4A 4LDEA 4ZPUA 3OE8A 3C7YA 1KY1A 1L89A 2B70A 3GUJA 1L92A 2QB0B 1L53A 1C6DA 4I7PA 1QT8A 1SWYA 3VW7A 2B6WA 188LA 1DYDA 3DMZA 1L13A 4I7TA 246LA 1L40A 4EKRA 200LA 159LA 1L34A 4W53A 2Q9DA 102LA 4YXAC 1C65A 238LA 129LA 4EPFA 252LA 1XEPA 2OU8A 196LA 1CU0A 2B6YA 2ANXA 231LA 3DN3A 1L56A 3DN2A 140LA 1KY0A 2Z6BA 3QAKA 3HTFA 118LA 4YX7C 1L54A 185LA 1L41A 221LA 1C6FA 1C6GA 197LA 3C7ZA 3K2RA 160LA 2RAZX 4GBRB 1L49A 1L52A 182LA 186LA 236LA 1LYGA 1L50A 3EMLA 3GUMA 1L88A 2RBOA 1L51A 1L47A 1L55A 1OV5A 1P5CA 248LA 184LA 4EKPA 254LA 3DN6A 1PQMA 2OU0X 150LA 1G0PA 1DYEA 2OE9X 229LA 1CUQA 1LI3A 3GUKA 1L25A 3GUOA 1L44A 4W54A 172LA 1C60A 1SSYA 3PBLA 1DYCA 1L84A 4I7NA 2F32A 253LA 1K28A 148LE 1OVHA 1ZWNA 2OTYX 1LYDA 1G1VA 190LA 1L16A 1G06A 1G0GA 3HDFA 1L10A 241LA 1LI2A 3GULA 156LA 1D9WA 1QT3A 261LA 205LA 1L59A 262LA 1L27A 1P37A 4YXCA 1L21A 1L42A 1QTVA 161LA 2F2QA 1QUHA 149LA 1QTBA 1QT5A 4EPIA 1QTCA 4ARQA 257LA 1OWYA 4DJHA 1CU2A 1C64A 165LA 177LA 1DYBA 230LA 1CV1A 210LA 4ARQB 1L75A 239LA 2OE4X 3F9LA 3JR6A 2RB2X 111LA 173LA 2RH1A 1L06A 1L30A 4I7JA 115LA 1PQKA 3SB7A 1D2YA 1G0MA 1CU5A 3DNAA 1C6JA 2LC9A 259LA 170LA 166LA 162LA 2RB1X 4LDOA 222LA 1L96A 1QSBA 1L77A 2NTHA 164LA 1KW5A 114LA 1TLAA 145LA 1L62A 3OE6A 212LA 2RBSA 1P3NA 1L83A 223LA 2LCBA 255LA 3SB5A 1L58A 1L66A 187LA 7LZMA 3SN6R 3RZEA 1L29A 1L24A 1L02A 3OE9A 109LA 2L78A 2HUKA 1QUOA 1L00A 1CTWA 1SSWA 1OV7A 147LA 108LA 2OTZX 1L14A 167LA 1QTDA 4PJZA 4K5YA 112LA 2RBNA 1L19A 1P64A 4W55A 3HT6A 260LA 4W56A 214LA 2Q9EA 2OU9A 247LA 1PQJA 1P6YA 1CX6A 6LZMA 1L76A 1L15A 171LA 1OYUA 2A4TA 130LA 1LLHA 176LA 1C68A 4S0WA 2B6TA 1L99A 1PQDA 1L86A 1C6NA 209LA 1JTNA 1JQUA 1L28A 198LA 1LGUA 2CUUA 137LA 1L69A 181LA 1C61A 1L85A 1P2RA 2B72A 3HH6A 1D2WA 1L97A 1QTHA 1CVKA 1G07A 2B73A 1PQIA 2HULA 1EPYA 163LA 122LA 1C63A 1L73A 1QTZA 3C7WA 1ZURA 1D3FA 4I7MA 1QT6A 3C82A 1LYHA 3HH5A 144LA 1L93A 189LA 3DN8A 158LA 4E97A 4EKQA 240LA 1ZYTA 2RB0X 3DN0A 211LA 1L63A 1QT7A 1C6KA 1D3NA 1G1WA 1QT4A 3NYAA 1D3JA 3HT7A 206LA 242LA 4I7LA 1LGWA 3SBAA 3DN4A 1L22A 195LA 3SB6A 4I7OA 1L79A 4AQNA 1L39A 3F8VA 220LA 152LA 1DYAA 1G0JA 3HT9A 2QARC 2O79A 2HUMA 4EXMA 3NY8A 2OEAX 1PQOA 2RBQA 226LA 103LA 141LA 1L71A 3GUNA 4ARPA 3PDSA 139LA 126LA 2O4WA 1L70A 1OVKA 4I7SA 216LA 4PK0A 3C80A 2RBRA 4I7KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CSZA 1L18A 2X0AA 4ZEEA 1C62A 5ILFA 2YBHA 201LA 1QSAA 3IJVA 1OUFA 1L36A 4NHQA 4FDYA 3TMVA 5K7OA 4J0LA 3HUQA 1ZVYB 1G0LA 243LA 1IWVA 4RW1A 2RBPA 3TXJA 3LZMA 217LA 2B6XA 4ETEA 1G0QA 3G3BB 3B6LA 1KXYA 1L68A 1DI5A 3AGHA 1LOZA 157LA 4OWHA 1EQ5A 1C69A 2B6ZA 155LA 1OWZA 5II3A 1YAPA 3E3DA 4ARLA 1C6LA 1KXXA 5I4YA 120LA 1GE0A 5KXPA 4W58A 4GN4A 1DQJC 4GCCA 3D9AC 3RNXA 5J7CA 1WQOA 1P2LA 5AMYA 5L3HA 4WG1A 1JKDA 1VEDA 2BPUA 4H8YA 142LA 1IX0A 138LA 1D3MA 1UIHA 1FN5A 1LHMA 1IR8A 3C8RA 1TCYA 1GFHA 1HMKA 2PC2A 5HNLA 1HENA 1HEQA 3L2XA 2G4PA 3SB8A 5FCPA 1C43A 194LA 3NY9A 2A7DA 4QDNA 4HV1A 1LZRA 2YBMA 1L31A 4YM8A 256LA 1G7IC 1MELL 1NHBA 3A93A 6LYZA 1BB4A 3G3WA 5KY1A 1YKYX 1I1ZA 1L94A 2BQFA 2AUBA 5HMJA 1L95A 1LJEA 3QY4A 1L33A 1RJCB 3GUPA 1OUGA 1L90A 251LA 1FLUA 4OOTA 1FDLY 4XJGA 3HT8A 4NHPA 1J1OY 1XEKA 4QEQA 4GCBA 3DKEX 1L82A 3ATOA 3OE0A 3L64A 1GFAA 1LW9A 1L35A 4W51A 5HNCA 1JTMA 143LA 4WO9A 1B5ZA 191LA 1CKFA 4H8ZA 1C66A 5I4XA 3RT5X 3CDQA 1EL1A 1IWZA 3HU8A 3IJUA 1IOSA 1L04A 3HWLA 1IY4A 3V2WA 1J1XY 3UONA 3HTBA 4G49A 5KKIA 113LA 1LMNA 1L0KA 4YEMA 5LVKA 228LA 1F6SA 2YVBA 4LDEA 2Z2EA 1HEWA 2G4NA 4ZPUA 4NY5A 2MECA 1GAYA 2YBJA 153LA 4I8SA 4I7PA 5ILCA 4RDSA 4D9ZA 2DQJY 1L13A 4I7TA 5LVIA 1GFKA 1L40A 3WW5A 1JPOA 102LA 4YXAC 1LZ8A 3EO5A 129LA 1GPQC 1HC0A 2B6YA 2ANXA 4N9RA 5T3FA 4RLNA 5HQ1A 3QAKA 140LA 1KY0A 1NWGA 3A67Y 1L54A 4XADA 2HU3A 4PRUA 2D4JA 1LCNA 160LA 5B1GA 135LA 186LA 236LA 1JSFA 1L50A 1L88A 2RBOA 1JJ0A 1L51A 248LA 254LA 4AXTA 150LA 4J7VA 1G0PA 1DYEA 134LA 5A3EA 1SLYA 1L25A 5L9JA 172LA 1C60A 3AZ6A 1JKBA 1JEFA 2F32A 5LYMA 5L3IA 2D4KA 2CDSA 148LE 4N0JA 3EMSA 1L16A 1L10A 3A3RX 1IWTA 1IORA 1B5YA 4Z98A 1LHIA 3WPKA 4II8A 2C8OA 1P37A 4C3WA 1L21A 161LA 1LJIA 1QT5A 2H9JA 8LYZA 4WLYA 1OWYA 1D0LA 1C64A 177LA 4LFPA 1DYBA 230LA 2RSCA 1LMPA 1LTMA 1UIAA 3GXKA 1B7NA 3F9LA 1DKJA 1L30A 3BKHA 1G0MA 4NG1A 1CU5A 1LHJA 5KXZA 4KL7A 166LA 1HHLA 2BQGA 2NTHA 4GCDA 5DN5A 1ZMYL 1OUDA 3OE6A 223LA 2LCBA 255LA 1DPXA 2BQIA 2ZILA 2HUKA 3WULA 1L00A 3CSQA 1LZGA 2FYDA 1HELA 1UUZC 4PJZA 4CJ2A 3HT6A 214LA 2Q9EA 4WG7A 4IATA 5HLLA 1L15A 4KXIA 171LA 5JENB 3AJNA 3TXDA 1LJFA 5LVHA 3WU8A 1C68A 4XJDA 4H93A 1VDSA 4S0WA 2B5ZA 1PQDA 1UCOA 3P65A 1LPIA 1JQUA 1YROA 4HV2A 1EQEA 5B06A 2W1LA 4NHSA 4LYCA 2B72A 3HH6A 5B59A 1WVVA 1CKDA 1TAYA 2MEDA 5F9UA 122LA 1C7PA 144LA 1HSXA 189LA 1C45A 4EKQA 1KXWA 211LA 4DD1A 1G1WA 1QT4A 3NYAA 4TSBA 1LGWA 2GV0A 1L22A 3ZEKA 4I7OA 4PJ2C 1LZCA 3F8VA 5EBHA 152LA 1G0JA 3WUMA 2H5ZA 5APFA 1JTPL 1PQOA 1N4FA 4HTNA 4WOAA 1L71A 1GF8A 4N1CC 2BQHA 1B7PA 5F9XA 3C80A 1T8GA 1GE1A 1L45A 4GLVA 5KXNA 4YF2A 3A96A 4WL7A 3CB7A 4DD2A 4NWEA 4DT3A 4KT3A 215LA 235LA 4OO9A 2EQLA 1BWHA 1REMA 2MEFA 3ZVQA 1LKSA 1NHEA 4LT1A 4I0CA 1L03A 3ZVQB 1CJ9A 1UICA 5F14A 4W52A 123LA 3VWOA 1G7LC 1YILA 1YQVY 192LA 2Z38A 110LA 4J1AA 2O7AA 3WL2A 1T8AA 3WVXA 1JSEA 3HBDA 2DQAA 3A6CY 3RW8A 1L48A 1WTMA 1LSGA 3LHMA 244LA 1YKXX 1QS9A 3DMXA 146LA 3CT0A 1L05A 1RCMA 4TTDA 3C8SA 1YAOA 4UWNA 3ODUA 4N8ZA 1DKKA 245LA 250LA 3TXBA 4LDLA 1D6PA 1NBZC 1LSMA 4UWUA 1DYGA 1T3PA 1REYA 2IGCA 3GUIA 3RU5A 4MCKA 3ATNA 3CDOA 1W08A 3CDVA 1B5XA 3AGIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3CSZ A;  1L18 A;  2X0A A;  4ZEE A;  1C62 A;  5ILF A;  2YBH A;  201L A;  1QSA A;  3IJV A;  1OUF A;  1L36 A;  4NHQ A;  4FDY A;  3TMV A;  5K7O A;  4J0L A;  3HUQ A;  1ZVY B;  1G0L A;  243L A;  1IWV A;  4RW1 A;  2RBP A;  3TXJ A;  3LZM A;  217L A;  2B6X A;  4ETE A;  1G0Q A;  3G3B B;  3B6L A;  1KXY A;  1L68 A;  1DI5 A;  3AGH A;  1LOZ A;  157L A;  4OWH A;  1EQ5 A;  1C69 A;  2B6Z A;  155L A;  1OWZ A;  5II3 A;  1YAP A;  3E3D A;  4ARL A;  1C6L A;  1KXX A;  5I4Y A;  120L A;  1GE0 A;  5KXP A;  4W58 A;  4GN4 A;  1DQJ C;  4GCC A;  3D9A C;  3RNX A;  5J7C A;  1WQO A;  1P2L A;  5AMY A;  5L3H A;  4WG1 A;  1JKD A;  1VED A;  2BPU A;  4H8Y A;  142L A;  1IX0 A;  138L A;  1D3M A;  1UIH A;  1FN5 A;  1LHM A;  1IR8 A;  3C8R A;  1TCY A;  1GFH A;  1HMK A;  2PC2 A;  5HNL A;  1HEN A;  1HEQ A;  3L2X A;  2G4P A;  3SB8 A;  5FCP A;  1C43 A;  194L A;  3NY9 A;  2A7D A;  4QDN A;  4HV1 A;  1LZR A;  2YBM A;  1L31 A;  4YM8 A;  256L A;  1G7I C;  1MEL L;  1NHB A;  3A93 A;  6LYZ A;  1BB4 A;  3G3W A;  5KY1 A;  1YKY X;  1I1Z A;  1L94 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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