2HZEA

Crystal structures of a poxviral glutaredoxin in the oxidized and reduced states show redox-correlated structural changes
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
110
structure length
110
Chain Sequence
HHQMAEEFVQQRLANNKVTIFVKYTCPFCRNALDILNKFSFKRGAYEIVDIKEFKPENELRDYFEQITGGKTVPRIFFGKTSIGGYSDLLEIDNMDALGDILSSIGVLRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of a Poxviral Glutaredoxin in the Oxidized and Reduced States Show Redox-correlated Structural Changes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutaredoxin-1
source organism Ectromelia virus
molecule tags Electron transport, oxidoreductase
total genus 32
structure length 110
sequence length 110
ec nomenclature ec 1.8.5.1: Glutathione dehydrogenase (ascorbate).
pdb deposition date 2006-08-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2hzeA00
4XHMA 1R4WA 1PGTA 3GTUA 1ERVA 2HSYA 3PINA 3TJKA 4MABA 2EIRA 2RM5A 3WGXA 1ILOA 1THOA 3EU4A 4RI7A 4D73B 3QAGA 2ZNMA 4N30A 4L5OA 1EGOA 3IPZA 1A8YA 3D4TA 3WD6A 1PN9A 3QAWA 5G2ZA 4HZ2A 3LXZA 1KBNA 3GYKA 2L5LA 1A2LA 2C4JA 5IO2A 3KTLA 4EVMA 4GTUA 1V2AA 4LMWA 3FR6A 1WE0A 1VF4A 4ZB6A 3RPNA 2XPEA 1GULA 4GRFA 4HJ2A 5ECSA 5EL8A 1SL2B 3PGTA 5D9TA 1AUCA 1KNGA 5ELGA 2PVQA 2OE3A 1AQXA 3LQ7A 5J41A 2PU9C 4HDEA 1GLPA 3LXTA 2MBSA 1BG5A 5J9CA 5ECRB 6GSWA 5INYA 2YV7A 2OE0A 4ISDA 1LU4A 1O73A 1XOBA 5ECLB 4POBA 4MF6A 4AJ8A 1TK8B 1RW1A 2LQQA 4TRXA 1AAZA 1O8WA 4MPGA 4QQ7A 1UN2A 5AGYA 5E4WA 4EDYA 2L57A 1AQWA 4NXIA 4BL7A 4FYUA 1TRUA 2RUFA 4IW9A 2P5QA 2MMNA 4V2MA 3F4SA 2WZ9A 2WGRA 5IMAA 1U87A 2DBCA 2DJ3A 1VF3A 3GSSA 3OR5A 4KDYA 5LCZA 2I4AA 3EVIA 1I9DA 1ZYEA 1A24A 3VLNA 1HQOA 5GZZB 4FYCA 3FY7A 1OC9A 2VCXA 2H01A 1SJIA 5DCHA 4ZBAA 1GSDA 3O3TA 1EP8A 3CTGA 2MBTA 5B6NA 1G0TA 3G7JA 1N2AA 1NSWA 5JWRB 2KHPA 4KH7A 1A0FA 4O5RA 1X9WB 14GSA 3M8NA 2YWIA 1BX9A 1FVKA 3O6TA 3TJJA 1F9MA 3HDCA 2VUPA 1YY7A 4HEA2 1PKWA 2LS5A 4NAXA 3LJRA 5CREA 1J08A 4TW5A 2PWJA 1GNWA 1Y25A 4IHUA 5HFIA 5DQSA 2JADA 3GL3A 2VIMA 3VURA 4DSSB 1T7PB 5G5EA 2V32A 5LD0A 4DSSA 4WF4A 1K3LA 3GRXA 2K18A 3WGEA 1FW1A 2PPTA 1B8XA 2O89A 3C7MA 2FA8A 2LKUA 3DMLA 3ZFLA 4KX4A 3ZRDA 2AB6A 2ZCTA 4EDZA 4X1UA 2GVPA 1T8EB 3KTBA 1Z7RA 2EIQA 3A2VA 3CTFA 3EWLA 4V2NA 4IJ3A 3KGKA 1DBYA 2LJRA 1EV9A 1IYIA 2H1DA 4OD7A 4OFNA 2E2MA 1EWXA 3C73A 4GSNA 2O85A 2MMAA 3CRUA 4POLA 2J9HA 4ECCA 4GCIA 4PXOA 3VK9A 2XBIA 2M46A 4ACSA 3TKSC 6GSXA 5CRGA 3GSTA 1O8XA 5D96A 1X9SB 4TXOA 4WXTA 2FWHA 3LORA 2N5BA 2CZ2A 2H72A 3VWXA 3VPQA 5IOXA 1ZCPA 3W6GA 3BCIA 4KSMA 3H79A 4K7IA 3GX8A 3CXGA 2H66A 2JZSA 2OBIA 4Q5NA 1ERTA 4LMVA 2JSZA 2LQOA 1LJRA 5E59A 1U3AA 1URMA 4F0BA 4PURA 2CX4A 4GXZA 1PSQA 5J4UA 1XFLA 9GSSA 2E0QA 3RPPA 2WCIA 2BJXA 4MH3A 1S3AA 1V98A 2V6OA 5D8IA 2V2GA 2X8GA 4V2LA 2H30A 4QL9A 5B8AA 2IL3A 4XS4B 5IMDA 4XS1A 2DSAA 1UC7A 4O92A 3UAPA 3TDGA 3DWVA 3P8WA 3QR6A 2YN1A 2EIOA 2B6MA 1GTIA 20GSA 2A2SA 3IK9A 4GSSA 4IS0A 1SENA 2MYGA 4MLYA 2ON7A 1WMJA 3QPMA 2V41A 3L78A 5EVOA 4NV5A 2GZYA 4GQFA 3KP9A 2AUVA 2HYXA 3DKSA 5ECIB 3LGCA 3KH9A 4WEYA 2HXKA 2TRCP 2DC5A 3TKQA 3I43A 1BQ7A 2I3YA 1JZRA 1NHOA 1JZDA 3F6FA 4KA0A 2ALBA 2IFQA 3C8EA 3US3A 2JU5A 3HHVA 4MCUA 5FHIA 5CP1A 3IAM2 4JBBA 1B4QA 5ECKB 5ECPB 2LJKA 2H71A 3KJYA 4IJIA 5H5RA 3VI7A 2P31A 2YZHA 4G9HA 4F2IA 5GAND 4KUNA 4PUFC 1M0UA 1XBSA 2E2GA 4HU9A 5J3RA 3FR3A 1VRSD 1CQGA 3VI5A 2KP1A 2QGVA 4K9ZA 3CYNA 1ON4A 5KN2A 2CAIA 1BEDA 1KEBA 3DYRA 4K2DA 4N11A 5ID2B 3W8JA 2X99A 2JACA 3RDWA 2I1UA 4JR4A 4J57E 3U5RE 3D0ZA 1GUHA 2VM2A 1TDIA 4L8EA 2ON5A 3CSJA 4Z7XA 3ISOA 1O7UA 5CO3A 4CW9A 1U3IA 3MDKA 3P2AA 1GUKA 1DE2A 5ECMB 3APSA 4DVCA 5J9BA 4MZCA 5HFKA 1FB6A 2WULA 3CBUA 2HLSA 4HZ4A 3M0FA 4IN0A 1ERUA 4JRRA 2GLRA 4HJMA 5CRWA 1YEPA 1SK1A 5CNWA 1SD9A 2LEGA 4ZIJA 5JWOB 3ZFBA 3M9KA 4I6XA 3D21A 2TIRA 2H1AA 1F3BA 3H93A 4FH8A 1DSBA 4N0ZA 3H4KA 4N10A 1PKZA 4I8BA 4L0WA 3VPTA 1TTZA 1Q4JA 5LNKe 2YPMA 1V40A 1Z5YE 4Q5QA 2YP6A 1HNCA 3GKXA 4MDCA 2NBSA 3ME7A 3ZREA 3D6IA 4AJ7A 2P5RA 2VAFA 2H8LA 2LUSA 1SKWB 5EY6A 4FIWA 5CAXA 3ZVJA 11GSA 2GZPA 3FZAA 4PQHA 1GTUA 1N8JA 5DDLA 4N0VA 2RM6A 4PNGA 1FO5A 1VGLA 2CX3A 3GN3A 2O7KA 2C1YA 1E2YA 3ZMLA 1TW9A 1PRXA 2B5EA 2I9HA 2WJUA 1FHEA 2C3TA 3GFKA 4TOPA 2LJAA 3C1RA 3P7XA 18GSA 2WS2A 3HD5A 3H1NA 5IIZA 1SYRA 1VF2A 3QAVA 4XS6A 12GSA 3DD3A 6GSUA 5G30A 4LLRA 3FEUA 3A2XA 4POKA 2OBKA 1G6WA 4MK3A 4YAPA 4D73A 4K6XA 1YDKA 3MAKA 5IPHA 1ZGNA 1JLWA 4ZXGA 4ILFA 3VWWA 3IRAA 2IMFA 2NTOA 2HZFA 1GH2A 1K0BA 16GSA 2DJ2A 4KNDA 1JHBA 2VL9A 2HRNA 1YF1A 3GH9A 2GS3A 2PMTA 4HQZA 4LL4B 2FY6A 2OA7A 2B5YA 1QMVA 2HSHA 3KXOA 4G2EA 1OKDA 1WOUA 2XBQA 1GLQA 4WBJA 3WT1A 3U6VA 4BWSA 2YWNA 3TJFA 3FKFA 3TOUA 4WKWA 3LEFA 3HCZA 5D9XA 2LRTA 5IMCA 1X5CA 2K6VA 3W8SA 1MDKA 1M9AA 1JLVA 3JCML 2H74A 3F6DA 1XW9A 4HOJA 4BA7A 2VCWA 1EEJA 1JZWA 1XWBA 5B7CA 4GWRA 2KLXA 1GNEA 1TOFA 4MZWA 3G7IA 4IGJA 3TJBA 3TUEA 1ML6A 3D22A 3EURA 1ZOFA 4XTSA 4G10A 4YQUA 1DE1A 2X8HA 1PD21 1AQVA 5FT3A 2MZCA 2ES7A 2H70A 3PH9A 2VOCA 3GNJA 1MD3A 3ZZXA 4RQXA 4K8MA 4K7OA 1MEKA 4NMUA 5DQYA 4QL7A 4K0GA 2M72A 1SD8A 5A4WA 3N9JA 5DBQA 4MJEA 4ZL8A 3DRNA 4XRAA 4ID0A 3F8UA 3C1SA 1R26A 2Z9SA 5JCUA 2IN3A 3VWUA 4ECJA 4IBPA 1GTBA 4ECIA 1QUWA 2IMDA 3IC4A 5C00A 5ENUA 3IR4A 1OC8A 5G31A 2OJLA 2DLXA 4FYBA 3J7Yk 4H86A 1TI3A 2AYTA 3IV4A 2C3QA 4TR0A 2MMOA 1M2DA 2JSYA 3PR8A 3UOMA 4OWYA 1XPVA 3K8NA 10GSA 3TKSE 3HKRA 2FWFA 4MP4A 2RUEA 4X0XA 4HI7A 3GV1A 3ME8A 2I81A 5A5KA 4E8EA 3G9BA 1U88A 4HQSA 22GSA 5KN0A 3UMAA 2YWOA 2A4VA 3QFBC 1EV4A 4I97A 3HJPA 3SWLA 1GRXA 1HD2A 1Z6NA 3KEBA 3DGQA 4ZL9A 2QKEA 4NV2A 1QGVA 3E0UA 4YH2A 2RIIA 3RHBA 1T3BA 3GUSA 4HUAA 2VLUA 3G7YA 4KDXA 4OFMA 5H5QA 2CQ9A 2M80A 2P0GA 2VLTA 3KD0A 2GT5A 1XVQA 2FGXA 2H0GA 4JE1A 5J5NA 2C80A 1J9BA 5HQPA 1GSUA 1A0RP 1I5GA 2MMZA 3QD9A 2L6DA 2L4CA 2JZTA 1UA5A 2PVOC 5AIXA 3A2WA 1GTAA 1BAYA 3CSIA 3TRXA 4F0CA 2IMEA 3F9UA 3TKRA 3LYKA 2IPAA 1JFUA 2AHEA 4AGSA 4ML6A 3ZL5A 4I2TA 4WR5A 3LWAA 3LSZA 2WRTA 5L71A 4XS4A 3I6AA 3TB2A 3MWHA 1O81A 4IVFA 3EMPA 4ZB8A 2DJ0A 2V6KA 2AV4A 2JL4A 1YJ6A 2O8VB 5A4VA 4YQMA 1EOGA 2G2QA 1Q98A 2NPBA 2LRCA 1OAZA 3BJ5A 3GX0A 3E9JB 2J23A 4KSOA 3E3EA 4ECBA 3GL5A 2WFCA 3F63A 3MSZA 3D5JA 5CRHA 2YCDA 3A3TA 3GMFA 2DJ1A 1WRYA 5ECHB 4PX1A 2XC2A 1FOVA 2PBJA 1ZZYA 5C04A 1OKTA 3NIVA 5JCGA 5IM9A 3GKNA 2YWMA 4Q5RA 1M2AA 2H19A 4GQCA 2C0GA 1ACVA 3V1WA 3BOAA 5G1LA 3UBLA 4MPFA 2R2JA 2GSRA 3HVXA 1G7EA 3TKSA 1TU8A 3Q74A 2F8FA 4ZB9A 2AJQB 2FHEA 2QSIA 4HU7A 3KP8A 4ZBBA 6GSVA 3R2QA 13GSA 3ERFA 2DJJA 4EKZA 2VL2C 1XZOA 1JZOA 3GKKA 3Q19A 3A5WA 2YOIA 3AY8A 5ECOB 5F0GA 1XW5A 2LNSA 4F82A 4BPYA 2H0IA 5CRDA 3L4NA 2REMA 1EZKA 1LBKA 3F4TA 3ZYWA 4YAVA 5ID2A 1A8LA 4MJAA 1TP9A 4WR4A 4NHZA 1USBA 4MA9A 19GSA 1S3DA 3QFAC 3EE2A 4ZL7A 3KIJA 4KW6A 5D93A 4NWYA 1TU7A 4TVEA 1FAAA 1Y6EA 1OE8A 2DMLA 2IIYA 3IK7A 4JU5A 5DALB 2HT9A 2L4QA 1K0MA 3ZTLA 5HR2A 3DIEA 2OKAA 3LFLA 5HR0A 4PNFA 4WETA 1GWCA 3APOA 5DJLA 1SL0B 2FNOA 3IE3A 1F3AA 3EYTA 4KE3A 2VL3A 1PL1A 1R5PA 3UVTA 4JEDA 3HXSA 4TR1B 2C3NA 1X5DA 3I69A 2H6ZA 1UVZA 1GUMA 1NHYA 2G0FA 3RBTA 2YV9A 4BVYA 1OYJA 1A2MA 2GGTA 1OC3A 1K0OA 4ML1A 3GIXA 2N5AA 2F8AA 4J56E 4MJBA 2GQMA 2KOKA 4XCSA 5F8BA 1H75A 4V1Ap 1THXA 3TRPA 2HNLA 1HNAA 3F3RA 1X9MB 1AXDA 1YF0A 4PQ1A 3F3QA 1BYEA 4NPBA 5DAKB 1ABAA 1TK5B 2F51A 2YJHA 1G6YA 3ZITA 3GURA 4I5QA 3WGDA 3DEXA 3RAZA 2L59A 1FB0A 1GP1A 5JCWA 4I2UA 3LYPA 2C0FA 4PUAA 2HZEB 2BMXA 17GSA 5F06A 2V1MA 1ZL9A 1B4PA 1TXXA 2DIYA 3FRCA 3MNGA 2EC4A 3BD2A 2JZRA 2IJYA 2CZ3A 3BBYA 4F9ZA 1BJXA 4DEJA 3CRTA 4WF5A 2VD1A 3GTUB 1XWKA 2OADA 1J0FA 1A23A 4G19A 3UEMA 1B9YC 5ELAA 3EC3A 3M3MA 1RK4A 2CT6A 1WP0A 4TR3A 5ECQB 4AJ6A 1XWCA 3FR9A 1ERWA 2CV4A 3HZ4A 3GHAA 4L0UA 1TKDB 3QMXA 1RQMA 4ULXA 5HFGA 1Z6MA 3L0HA 3IA1A 2VCQA 4OFTA 4JZQA 4KAEA 2C0EA 4DSRA 2FWEA 2IWTA 3TGZA 2FD3A 1V57A 3TJGA 2BTOT 5D9VA 4K7NA 3I9V2 1MTCA 4EUYA 1XWGA 4L5LA 2H73A 5ECNB 3HVVA 3WT2A 4EF0A 1SJZA 4HS1A 4GSTA 3DVXA 3APQA 2QC7A 5B8BA 2HE3A 3QCPA 1TJDA 2K9FA 1EOHA 4KCAA 2R3XA 3UL3A 3UBKA 4RQRA 2DJKA 2E7PA 4J2FA 4MF5A 4GLTA 4IQAA 2CAQA 1W4VA 5H5SA 3FW2A 1R7HA 5DJMA 2VCZA 1B9XC 5COHA 7GSSA 2R5GA 2A2RA 1XVWA 1HYUA 3VWVA 3NZNA 4IKHA 2X64A 1XOAA 1GSQA 2B1KA 4MMMA 4FO5A 1CQHA 2F9SA 2CVDA 1VF1A 1V58A 1SJ6A 3DVWA 1K0NA 2D2ZA 1S3CA 3F0IA 1F6MC 1QQ2A 5AISA 1M7TA 5IPGA 3L9UA 1OC9B 2GDRA 4IP6A 2FUG2 1ZYQB 2ZUPA 3O76A 1Z7PA 4RI6A 3N5OA 4TR4A 1X0RA 4KB3A 5G5FA 3DXBA 3M1GA 1K3YA 4YQVA 2H6YA 3RHCA 3L9VA 3FZ9A 3IDVA 4MH2A 4OO4A 2LSTA 1EEMA 6GSYA 5ABRA 1R5AA 3FYGA 3ZMKA 1PL2A 4TKYA 1IYHA 4K1FA 4O32A 5HR3A 2O87A 2GT6A 4BWQA 5IMVA 4K0NA 1B48A 2VCVA 3ERGA 3ZLPA 3EMXA 5B6MA 5IO0A 4POMA 5IOWA 4O7HA 1FVJA 1OVNA 1SK0A 4MZBA 2VD0A 2RLIA 3KMNA 4EL1A 3GA4A 1M9BA 5DVBA 2CVBA 2LTKA 1DUGA 3ERWA 3HA9A 2HI7A 1MDIA 3EINA 3HVSA 1O6JA 2PERA 4EC0A 1T00A 1ST9A 1NW2A 1SL1B 1SYXA 3HY2A 4TN8A 2B1LA 3FZ5A 3IBHA 3Q18A 4RUVA 4TXVA 3P90A 1SK2A 4TXOB 5F07A 1ZMAA 2VM1A 2OE1A 3F4RA 4XRDA 2WB9A 3TKPA 1XWAA 4LL1B 1K0AA 2GSTA 1TI1A 3NOFA 3TOTA 2B7KA 2K8SA 3GH6A 3FHKA 5GAPD 1NM3A 2LV3A 3HYPA 1W89A 3HJMA 3EU3A 3KCMA 1K0CA 1XXUA 1QK8A 5G1KA 1AW9A 4MJCA 1WWJA 1MDJA 2B3SA 3UJ1A 1YZXA 2C0DA 1PMTA 3C71A 4EE0A 2FWGA 1WIKA 5EPFA 3Q6OA 1YEXA 2L6CA 3WYWA 4IP1A 1WPIA 2GSQA 2DIZA 2NDOA 1H4OA 3M9JA 4DSQA 2KP2A 1HNBA 5KN3A 5AN1A 2GZZA 1E6BA 3GKMA 3KZQA 1WJKA 3IXRA 5KN1A 3VFIA 2YANA 3QOUA 2R37A 2HRFA 5GSSA 2X8CA 3J7Yb 2H75A 1G7OA 5IMZA 3TRQA 1T4YA 4WBRD 1YKAA 2KUCA 4MF7A 1U6TA 4IELA 6GSSA 4CHSA 4V1Ag 1T1VA 1X5EA 1AIUA 1AC1A 3IOSA 3QDNA 1GSFA 4Q5FA 3KH7A 2LRNA 1K0DA 1FG4A 1Z9HA 1GSYA 1MD4A 1QFNA 4GF0A 1PX7A 2IFQB 1M2BA 2IMKA 4EXJA 2PGTA 2DMMA 4CDOA 5JWQB 3FK8A 2OACA 2YJ7A 2YNXA 4LA1A 3TCOA 2GTUA 5CYYA 1T4ZA 4P3YB 4OCFA 2NVLA 2XPDA 5DCGA 1O85A 1TK0B 4KGIA 1V9WA 3S9FA 2YZUA 1SKRB 4OCEA 1SU9A 2XHFA 4KCEA 3BCKA 2N5FA 2H76A 1GL8A 4NHWA 3D4MA 5AIVA 1XCCA 3UVHA 1C72A 5DALA 5D73A 1A2JA 2B7JA 2GQLA 2IMIA 3KMOA 1GSSA 3UARA 2B5XA 4OO5A 4X43A 2VO4A 1TRVA 3LG6A 4JR6A 5IQYA 3HZ8A 4IQ1A 1YKCA 4XIHA 4KDUA 2F3MA 3KM6A 3FZ4A 3IHQA 8GSSA 4TR1A 2C8UA 1M99A 2H6XA 2VLVA 5D9WA 1GSEA 3SBCA 1QXHA 2R6KA 3ED3A 1XIYA 4ZILA 2PUKC 5A4UA 3ZIJA 2FA4A 2H1GA 2H1BA 2CVKA 1F2EA 1OE7A 1TRSA 4EO3A 4BVXA 2HFDA 2PN8A 2FCHA 2WDUA 1K3OA 1SKSB 2CA8A 3ZIVA 3CSHA 1YQ1A 2TRXA 5HR1A 1PA3A 5F05A 3UIWA 1TRWA 4AF2A 4ZBDA 2GSSA 5DAKA 3L9SA 3HJOA 1XW6A 1KTEA 2VL2A 2H0HA 2LNTA 1EP7A 1PQNA 2VCTA 5KEJA 5GSTA 4PQIA 5FWGA 3ZVJD 2GQKA 2R4VA 1EGRA 4OMVA 2AAWA 3IAS2 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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