2HZEB

Crystal structures of a poxviral glutaredoxin in the oxidized and reduced states show redox-correlated structural changes
Total Genus 35
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
109
structure length
108
Chain Sequence
HQMAEEFVQQRLANNKVTIFVKYTPFCRNALDILNKFSFKRGAYEIVDIKEFKPENELRDYFEQITGGKTVPRIFFGKTSIGGYSDLLEIDNMDALGDILSSIGVLRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of a Poxviral Glutaredoxin in the Oxidized and Reduced States Show Redox-correlated Structural Changes.
pubmed doi rcsb
molecule tags Electron transport, oxidoreductase
source organism Ectromelia virus
molecule keywords Glutaredoxin-1
total genus 35
structure length 108
sequence length 109
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2hzeB00
5G30A 4KDXA 3HYPA 3IR4A 4BWSA 4IHUA 5CREA 2GZZA 4MK3A 3HJOA 5AN1A 14GSA 3UMAA 4L0UA 2ZUPA 4BVYA 2P5RA 1BQ7A 2YN1A 5IMDA 4IQ1A 2DJ2A 2YJHA 2H19A 2H72A 1ST9A 3VWXA 1TRVA 4K7OA 1T7PB 2K8VA 2RIIA 1JZOA 3TKSE 1A8LA 2LNTA 2I9HA 3TUEA 4OO4A 4MH2A 1GUMA 4GTUA 2GZPA 3FW2A 5F07A 4KCEA 4K7IA 2CV4A 3GMFA 3GTUB 3P2AA 2IMKA 1U3AA 4RQXA 4XHMA 5LCZA 1VF3A 2DIZA 2LS5A 1T8EB 3VFIA 4HQSA 3KP8A 2YJ7A 3V1WA 2OE1A 4PUFC 5DALB 4ILFA 1VRSD 2NVLA 1S3CA 3GSSA 5J41A 1J0FA 1H4OA 1MD4A 4DSQA 2OKAA 4XCSA 3GX8A 4EDZA 2M80A 3KIJA 3ZTLA 4MF6A 3LYPA 1YEXA 5LNKe 4KNDA 2VL2A 1V40A 1FHEA 2ZNMA 3F0IA 3FY7A 2K8SA 4E8HA 4O5RA 1TK8B 1S3DA 1SL2B 4XS1A 4GCIA 4YQVA 1PD21 2V1MA 1I9DA 1GH2A 4HUAA 4L8EA 1OKDA 1PX7A 4K8MA 2XPDA 1MDKA 4ID0A 2PU9C 2OA7A 1X5EA 3GH9A 1SKRB 4N0VA 5ECNB 1M7TA 2GQMA 2IIYA 1ZL9A 5KN3A 1WOUA 4LMVA 3MNGA 4ECBA 3DVXA 3F9UA 2H8LA 2HNLA 2VCTA 4PX1A 2VD1A 1RQMA 1GULA 1EOHA 4TXVA 3EVIA 2XC2A 5AIXA 3UVHA 5KN0A 3L4NA 6GSUA 4N10A 2PUKC 1KTEA 4EVMA 4XRDA 5E59A 2TRCP 2GZYA 3QOUA 5G1KA 1GNWA 2L6CA 3ZMLA 1V58A 4J2FA 1JLWA 2PN8A 1M9BA 4I5QA 1HD2A 4N0ZA 1A2LA 3LORA 1XZOA 4XS4A 1RK4A 1XOBA 1GLPA 3RPNA 2JU5A 2MMAA 1K3OA 1ZYEA 4IJ3A 4F82A 3ZYWA 4YQMA 4KSOA 5GAND 1F9MA 4PNGA 2H1BA 4JEDA 3F8UA 4GSSA 1EV9A 2IJYA 3UBLA 1AIUA 4I2TA 4ML1A 6GSTA 1M9AA 3UVTA 4K1FA 2E2MA 1Z7PA 2RM5A 1VGLA 1XVQA 2EIOA 3GTUA 3G9BA 3VK9A 5DVBA 3E3EA 4ECJA 3TB2A 2CZ3A 4TR0A 3KH9A 3D4TA 1A2JA 1QUWA 5ABRA 5KEJA 1OKTA 2RUEA 1LBKA 5DALA 3CSHA 3ZZXA 4ZL8A 4D73B 4F9ZA 1YF0A 1PKZA 5B6MA 5HFKA 3D21A 5ECRB 3DEXA 3GX0A 3FZ9A 2H6ZA 3D22A 4JE1A 1YZXA 3J7Yk 2CAIA 1CQGA 5CRGA 1A2MA 2X8CA 4CDOA 1B8XA 1QQ2A 3GA4A 2P31A 4HZ4A 3CTGA 4FYBA 2K9FA 4ZB9A 1SKSB 5ENUA 2I3YA 2YP6A 3QPMA 1JLVA 5HR0A 2LNSA 2F8AA 3UAPA 1EV4A 1MTCA 3DGQA 3D4MA 4L5LA 1TI3A 2C0GA 1YY7A 1GP1A 3W8SA 2H70A 3ZFLA 2WJUA 3VI7A 3APQA 5F8BA 5IOWA 2MZCA 2B3SA 4HU7A 2B5EA 5D73A 2I1UA 3KM6A 2YNXA 1EOGA 5G5EA 1XFLA 3G7IA 3KXOA 3IC4A 5C00A 3M9KA 3FK8A 1X9WB 4DVCA 1O81A 1F3AA 3D6IA 3H79A 5H5QA 5J3RA 2KOKA 4PQHA 4Q5FA 3GN3A 1NHOA 4TR1B 3FEUA 5B8BA 4V2LA 4PURA 1GUHA 1KNGA 4K0NA 2VAFA 4BVXA 2LSTA 1WMJA 3HVVA 3KCMA 2GSRA 3KP9A 4YAPA 2V6KA 4V2MA 2YWIA 4WETA 4TKYA 3NOFA 1B4PA 5LD0A 1M2BA 2H71A 1WJKA 1PX6A 3D5JA 4HS1A 2REMA 4MZBA 13GSA 22GSA 2WB9A 3US3A 2VL9A 2WFCA 4MMMA 3A5WA 1SK1A 1I5GA 5AGYA 1O6JA 4X43A 4KW6A 2AV4A 2B1KA 2GDRA 4CW9A 1M2AA 3LXZA 4POMA 4F0CA 2NPBA 2GSQA 3HVSA 2PWJA 3WGXA 1JZWA 1JZRA 4G19A 3KMNA 5ECOB 2CVDA 1FW1A 2KP2A 2WRTA 1GLQA 2AYTA 4TR4A 1Z3EA 3HZ4A 1S3AA 5D8IA 1JZDA 2C1YA 10GSA 3BCKA 4D73A 1ML6A 2DJ3A 3P90A 3LGCA 1JHBA 4TVEA 4RI7A 1M0UA 5IM9A 3IRAA 1O85A 4JR6A 3I43A 1YKCA 3CRTA 5J9BA 2DSAA 2GGTA 1GSUA 5EVOA 5DJLA 2VCXA 2O85A 3HHVA 4PNFA 3SWLA 3TRPA 1UN2A 4WEYA 3GL5A 1YQ1A 2LJAA 5G1LA 4K2DA 3L9SA 2VM1A 4KGIA 4GF0A 3Q19A 2FD3A 1R7HA 5IPHA 4KDUA 2LUSA 1TU7A 2V41A 3GNJA 5CRDA 4V1Ag 5B8AA 1WIKA 4ML6A 1WP0A 1XWAA 3ED3A 2PVQA 2EC4A 1SU9A 4OCEA 1QMVA 1R4WA 3Q6OA 3CYNA 1F3BA 1XW6A 5ELAA 3FR9A 1DBYA 3EMPA 4IGJA 1J9BA 4K7NA 3RDWA 3GHAA 3BOAA 4MLYA 4X0XA 3BD2A 1U3IA 2I4AA 4NV5A 3HXSA 5ECPB 4LMWA 3HVXA 3FRCA 3ZMKA 1ERTA 2H30A 3KTLA 1R5PA 4MP4A 4KUNA 1TP9A 4KB3A 4IKHA 3DD3A 5G31A 2H1DA 4K0GA 4ZBAA 1XWKA 5HFIA 3AY8A 1GTIA 1OE7A 5GSSA 1SD9A 1TOFA 2LEGA 1MDJA 4BA7A 4KCAA 4XS4B 4LL1B 4NHWA 2YWMA 2WS2A 2YPMA 3R2QA 2MYGA 1T4YA 5F05A 3C8EA 5IQYA 2MBSA 5DAKB 2A4VA 2G2QA 1ZCPA 2GT5A 1GSSA 2OADA 4O32A 1Y6EA 3FKFA 2VM2A 1SK0A 1A24A 1N8JA 4X1UA 4WXTA 3UIWA 2JZRA 3PINA 4FYCA 3H4KA 1F37A 5IMVA 3L0HA 4P3YB 1XBSA 4JZQA 5AISA 4XRAA 1V2AA 3I6AA 1AC1A 4H86A 3F6FA 1EEMA 2F9SA 3TOTA 5HFGA 4ECCA 1IYIA 4ZL9A 4NMUA 2H74A 4Z7XA 1Z7RA 1TW9A 5G5FA 5ECSA 4GWRA 3FZAA 3UOMA 4WBJA 1M2DA 1K0AA 4ZBDA 3HZ8A 3IOSA 2L59A 2GT6A 4GSTA 5HR1A 3EU4A 2O8VB 3P7XA 4EUYA 3CXGA 4AJ7A 3IDVA 3F63A 3TKSC 4NAXA 3RHBA 3CSJA 2VD0A 3A2WA 5CNWA 2H6YA 1Z6MA 2VIMA 3TDGA 2B5XA 2J23A 2HZEA 1X0RA 2B1LA 2GQLA 2PERA 2C3NA 3GURA 3W8JA 1W4VA 2YV7A 1ZZYA 3N9JA 3ERGA 3LJRA 5FWGA 3HDCA 1ZGNA 1TK5B 2OACA 4PXOA 4EE0A 2FWEA 4EKZA 3FHKA 5IPGA 2C0EA 2NBSA 2B7KA 2N5AA 4WF5A 3TOUA 4DEJA 2LQOA 4HZ2A 5HQPA 5A5KA 1DE2A 4TR3A 2PPTA 1A0FA 3D0ZA 4MH3A 4RQRA 2HYXA 1Z6NA 16GSA 4ZILA 2PMTA 1XW9A 1YKAA 1SENA 2MBTA 5JCWA 3TJKA 2V6OA 4YH2A 5IMZA 3GFKA 3OR5A 3GIXA 1EZKA 2L5LA 3QDNA 3VWWA 5DAKA 11GSA 2R4VA 1XOAA 2WCIA 1Y25A 1T3BA 4J56E 2E0QA 2R5GA 1XWGA 2GQKA 2IFQA 1F2EA 2A2SA 2Z9SA 2PGTA 1G7OA 1TJDA 3EE2A 3M3MA 2L5OA 4MJCA 2OE0A 2FNOA 1PGTA 4K6XA 2YWNA 1X9MB 3FZ5A 1PQNA 1A23A 3TJFA 12GSA 1SD8A 4ZB8A 2ZCTA 4QQ7A 2L4QA 1ABAA 2AAWA 2IMFA 3WD6A 3H93A 3DRNA 4MF7A 1AW9A 1XW5A 5IIZA 1W89A 5HR3A 2HRFA 4KH7A 1QK8A 7GSSA 3GYKA 3TKPA 3VURA 3ZITA 3EWLA 4XIHA 2FLSA 3DYRA 5CP1A 2PBJA 3Q74A 3IK9A 1ZOFA 1Q4JA 5JCUA 2RM6A 4HEA2 2AB6A 3IA1A 4IBPA 2OJLA 4FYUA 2HXKA 3H1NA 1GNEA 1SJZA 2TIRA 5D9TA 3WT2A 5JWOB 1PL2A 5AIVA 3VPTA 1AAZA 1GSFA 3KGKA 1AXDA 4ACSA 2R37A 5IMAA 4WR5A 3MDKA 3QFAC 5ECIB 5ECMB 2IN3A 2HI7A 2JSZA 3HKRA 3M0FA 2DJJA 17GSA 2BMXA 2ON7A 3QAVA 3RPPA 5ECQB 2VLVA 2YANA 3ME8A 3A2VA 1FVKA 3IPZA 2H1AA 4GSNA 2F51A 1B9XC 4GQFA 20GSA 2R3XA 3S9FA 3FR6A 2VCVA 4G2EA 4YAVA 3GKXA 1UA5A 1PMTA 2YCDA 1GSDA 5EPFA 3IE3A 2HRNA 4PQIA 3GH6A 2LRCA 3ZL5A 4IELA 2HE3A 1TXXA 2IMDA 1EP7A 1HNAA 4GLTA 2FWHA 1YF1A 2AUVA 2CZ2A 3TKQA 3I69A 4ZXGA 3BBYA 3LWAA 2GVPA 2FY6A 2NDOA 5DBQA 3SBCA 5J9CA 1T1VA 4MABA 4HU9A 2V32A 5JCGA 1MDIA 5B7CA 5FHIA 2L57A 1GTAA 1SYXA 4ULXA 3O6TA 3F3RA 4RI6A 2LKUA 4OFTA 3HCZA 3CBUA 4HJ2A 1DE1A 1G6YA 3GRXA 2VO4A 4AJ6A 3IK7A 4JBBA 3LYKA 4ZB6A 2JACA 2CVBA 5DJMA 2WDUA 2GLRA 1PRXA 3HY2A 1XXUA 1NHYA 2DC5A 1NM3A 5EL8A 3UL3A 1HNBA 3DXBA 3C7MA 4WKWA 5H5SA 3IV4A 4IW9A 2KHPA 2ES7A 4QL9A 4TW5A 4F2IA 1WWJA 2FA4A 2ON5A 2C8UA 4MDCA 1YEPA 5CRWA 1TRWA 4BL7A 1ERUA 5GAPD 3UBKA 3C71A 5KN1A 2C0DA 3G7JA 2ALBA 1GTBA 4DSRA 4LA1A 1PA3A 1VF4A 5A4UA 4NWYA 2DIYA 5D9WA 2H75A 1T4ZA 1ILOA 2DMLA 5ELGA 3ZREA 4GQCA 2C4JA 2B6MA 3EMXA 2VOCA 4TXOB 3MWHA 3RHCA 4KA0A 2H66A 2HSHA 2I81A 1PKWA 3BJ5A 2DJKA 1VF2A 1V57A 3TKRA 1NW2A 2C0FA 3U6VA 1GSEA 1BX9A 4EL1A 4OD7A 3E0UA 2M46A 4ZIJA 2JADA 1OAZA 3JCML 4OO5A 2HZEB 4L5OA 1G6WA 4OWYA 2HSYA 1K3YA 3WGDA 4KAEA 6GSWA 2R2JA 2YZHA 2AJQB 4Q5RA 4LL4B 1WE0A 3IBHA 1V9WA 4MJBA 4F03A 2GSTA 2HZFA 5JWRB 3C73A 1K0MA 2LQQA 2QSIA 1YJ6A 1YDKA 1PSQA 1PL1A 4HJMA 1R5AA 2L4CA 2OE3A 2KP1A 2QGVA 2VCZA 4F0BA 2V2GA 5A4WA 4GXZA 1MD3A 2VCWA 1LJRA 1TDIA 1E2YA 2CQ9A 2N5BA 5INYA 3CRUA 1ZYQB 2VCQA 2O87A 4MZWA 4IP1A 3W6GA 1GRXA 4HI7A 4EO3A 3MAKA 3DKSA 5IOXA 1O73A 3LSZA 2C3QA 3TRQA 3C1SA 4WR4A 4Q5NA 1XPVA 3KD0A 2J9HA 3VPQA 1A8YA 4MCUA 1U6TA 2DJ1A 2FA8A 2N5FA 2X64A 1MEKA 2IFQB 2LJRA 2MMNA 3BCIA 1ON4A 1EWXA 4MJAA 1TRUA 4OFMA 2JSYA 1BJXA 2H1GA 2QC7A 1GSYA 1G7EA 2L6DA 4TN8A 3CTFA 4I6XA 3LG6A 4I8BA 3TJBA 2VUPA 1HQOA 2FWGA 3ZLPA 3ISOA 2MMZA 1WPIA 3H8QA 2FGXA 2PVOC 4K9ZA 1GSQA 3M8NA 4HDEA 2JZSA 2YV9A 1E6BA 2K6VA 1TRSA 1M99A 4OCFA 1QXHA 5GZZB 3A3TA 1R26A 1KEBA 1GUKA 3GL3A 3PGTA 5DCHA 2P5QA 3IHQA 1HYUA 1OC8A 1O8XA 2A2RA 1RW1A 5DQYA 5ID2A 2XBIA 4XS6A 1URMA 1BEDA 2KUCA 6GSXA 3TKSA 4FH8A 4TXOA 5HR2A 1OC3A 2X8GA 1A0RP 4QL7A 4WF4A 1UVZA 2IMIA 1K0DA 4CHSA 5IMFA 3KZQA 3KH7A 2DJ0A 5DQSA 2H73A 3RBTA 1SJIA 4GRFA 3LQ7A 2WGRA 3I9V2 4IVFA 1AUCA 4KE3A 1ZMAA 2CT6A 4IJIA 1FB0A 4JR4A 1IYHA 1OYJA 2VL2C 2P0GA 3F4SA 4IS0A 4G9HA 1SJ6A 1FO5A 2FHEA 1XWBA 5IO2A 1BG5A 3WT1A 3EURA 3F3QA 3UARA 3IAM2 1EGOA 2VLUA 5FT3A 4BWQA 3PR8A 1SK2A 3L9VA 3KMOA 2CAQA 1O8WA 1XVWA 1C72A 2GS3A 4WBRD 3U5RE 1GL8A 1U87A 3EC3A 1OC9A 2C3TA 2FUG2 4DSSA 1UC7A 4AF2A 4I2UA 1XIYA 2QKEA 1GTUA 1WRYA 3EU3A 5H5RA 3M1GA 3QMXA 4HOJA 1X5CA 3DMLA 2CX3A 2H0IA 2F8FA 1SYRA 1GWCA 3ERWA 3KJYA 3DVWA 4ZBBA 1XWCA 1TU8A 3NZNA 3IXRA 3ZRDA 4PGTA 6GSVA 5D96A 2LV3A 1K3LA 3GUSA 3GV1A 4YQUA 2IWTA 3O76A 1XCCA 1FG4A 2JZTA 2LRNA 1TK0B 3P8WA 4Q5QA 2FWFA 2TRXA 2DLXA 1O7UA 2K18A 3VLNA 3RAZA 3IAS2 3FR3A 1OE8A 4E8EA 1CQHA 2H01A 3QR6A 3F4TA 4MZCA 2GTUA 6GSYA 2HLSA 1G0TA 5DCGA 18GSA 5D9VA 1X5DA 5ECHB 2H6XA 3L78A 4ECIA 8GSSA 4PQ1A 2E7PA 1FAAA 3QCPA 3ZIJA 3O3TA 5KN2A 4ZL7A 4MJEA 5IO0A 2JL4A 2DBCA 3HA9A 3GKNA 1ERVA 3QAGA 3CSIA 1AQXA 1QFNA 2WZ9A 3GKKA 3ZVJD 2AHEA 3HJPA 4MA9A 3VWVA 2XPEA 2YZUA 2E2GA 5L71A 2O7KA 1VF1A 3L9UA 1KBNA 4EDYA 3F4RA 2GSSA 3DIEA 5J4UA 1SKWB 1AQWA 2EIRA 1K0NA 2X8HA 4EXJA 1F6MC 6GSSA 2IL3A 3EYTA 1PN9A 4V1Ap 5CAXA 2YOIA 1J08A 2EIQA 4EF0A 1ACVA 2C80A 5EY6A 3HJMA 2LJKA 4AGSA 4L0WA 2CX4A 4I97A 2R6KA 3GSTA 4LLRA 1LU4A 1DUGA 1JFUA 4AJ8A 5GSTA 2OBKA 3KEBA 4O7HA 3LFLA 4RUVA 3UJ1A 2IPAA 1B4QA 2HT9A 3Q18A 1K0BA 2B5YA 3N5OA 3QAWA 2CA8A 2G0FA 1OVNA 4V2NA 1FOVA 3VWUA 1K0OA 3NIVA 3MSZA 3J7Yb 4TRXA 1SL0B 2RLIA 4NXIA 4TOPA 3KTBA 9GSSA 4KX4A 3ZIVA 1FB6A 5DDLA 3A2XA 4BPYA 3G7YA 1THOA 3FZ4A 4NHZA 2HFDA 2WULA 2H76A 3TRXA 1BYEA 1EEJA 4N11A 4EC0A 3CMIA 4POLA 4O92A 1TKDB 4IP6A 1B48A 3EINA 1V98A 3TCOA 3C1RA 1NSWA 3TJJA 1Z9HA 4KSMA 2O89A 4HQZA 3FYGA 3APOA 4MPGA 5D93A 3E9JB 3QD9A 3LEFA 2YWOA 19GSA 1HNCA 5JWQB 2H0GA 3WYWA 4J57E 1Z5YE 5F06A 1X9SB 1TTZA 1ERWA 5CRHA 4IQAA 2VL3A 1FVJA 3K8NA 5G2ZA 5IMCA 4KDYA 3UEMA 3M9JA 1K0CA 3HD5A 1EP8A 1AQVA 4IN0A 5ID2B 1Q98A 5J5NA 5CO3A 2MMOA 2OBIA 2VLTA 4JU5A 2DMMA 1T00A 2XBQA 4FO5A 1SL1B 2BTOT 2RUFA 2M72A 2B7JA 4JRRA 4XTSA 4MPFA 4MF5A 2NTOA 2KLXA 3DWVA 5ECKB 2LTKA 3APSA 3WGEA 3ZFBA 5COHA 3ME7A 1U88A 1TI1A 2CVKA 4POBA 4ISDA 2LRTA 5CYYA 2FCHA 3TGZA 2BJXA 4NV2A 1EGRA 5D9XA 2D2ZA 1USBA 1B9YC 3LXTA 4POKA 2IMEA 1QGVA 3VI5A 2XHFA 5B6NA 4FIWA 1DSBA 1BAYA 3GKMA 4G10A 5E4WA 4OFNA 1N2AA 1H75A 1THXA 4PUAA 5ECLB 3F6DA 3QFBC 3ERFA 3PH9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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