2HZFA

Crystal structures of a poxviral glutaredoxin in the oxidized and reduced states show redox-correlated structural changes
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
110
structure length
110
Chain Sequence
b'HHQMAEEFVQQRLANNKVTIFVKYTCPFCRNALDILNKFSFKRGAYEIVDIKEFKPENELRDYFEQITGGKTVPRIFFGKTSIGGYSDLLEIDNMDALGDILSSIGVLRT'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of a Poxviral Glutaredoxin in the Oxidized and Reduced States Show Redox-correlated Structural Changes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutaredoxin-1
source organism Ectromelia virus
molecule tags Electron transport, oxidoreductase
total genus 33
structure length 110
sequence length 110
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.8.5.1: Glutathione dehydrogenase (ascorbate).
pdb deposition date 2006-08-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2hzfA00
4X0XA 4AJ6A 2E0QA 2K18A 1PRXA 5ID2A 3KGKA 3JCML 2VUPA 2JSZA 1XW9A 2HZEA 5G5EA 1HQOA 2B1KA 4GSSA 1SYRA 1MDJA 18GSA 4AJ7A 1ZMAA 4FYUA 3TKQA 1BEDA 1BQ7A 4OFTA 4MA9A 5GAND 2CZ2A 1UA5A 2H76A 4GXZA 5FT3A 3U6VA 3ISOA 1NM3A 2I3YA 1XVQA 4O7HA 5IMZA 4TN8A 3LYPA 1GTIA 5H5RA 2JZTA 2B5YA 2ZCTA 3GFKA 2GSTA 4EXJA 2CV4A 3FR9A 2LV3A 3IR4A 3D6IA 1XWBA 5CRHA 5E59A 1M9BA 4PURA 3I43A 4XTSA 1JZOA 1XVWA 2PWJA 2OACA 4N0VA 1A23A 1K0OA 2G2QA 1ON4A 2WJUA 4JR6A 4CW9A 3A3TA 2AUVA 4OFNA 4EF0A 1OE7A 1MDKA 2HLSA 4JBBA 1EZKA 1RQMA 4RUVA 20GSA 1O8WA 5ECLB 3TJBA 2YN1A 3GURA 1W89A 2V32A 5GAPD 1EWXA 5D8IA 2FHEA 4V2MA 2GSSA 2H1BA 4TKYA 4MP4A 3TKPA 4G10A 2WS2A 1WJKA 2BJXA 4N10A 2YWNA 1PX6A 2WGRA 5D73A 1O81A 2IPAA 4OCFA 3GA4A 1KNGA 1Z6MA 2MMAA 2XBQA 3ZFBA 3CSHA 1TW9A 3C73A 1PD21 3ZMLA 2PN8A 2ZNMA 2R3XA 2EIQA 3G7YA 3APQA 1OE8A 1QFNA 4K6XA 5AN1A 4O92A 2B3SA 3RHBA 1FVKA 2RLIA 5CRDA 1A8LA 1Z7PA 1SKWB 1B8XA 4HQZA 2MZCA 4NMUA 2C4JA 4KUNA 4XS4A 1GSUA 2JZSA 2R6KA 3FKFA 4KCEA 1AXDA 3P2AA 5B6MA 3BBYA 4HEA2 3KZQA 1J08A 3I69A 3LFLA 1G7EA 1B9XC 4HQSA 1GTAA 4IN0A 5DJLA 3IDVA 3V1WA 1TOFA 2B7JA 3GX8A 4TRXA 1XWKA 2F8AA 1TRVA 2ON5A 1OVNA 1OC9A 3TKSA 4TR1B 3CSIA 3LEFA 5HR3A 1E6BA 1PKZA 1T4YA 2PBJA 3APOA 1V2AA 2PPTA 2I9HA 2LEGA 1FG4A 4I2UA 3ZVJA 5INYA 4MJEA 5IMDA 1GSDA 3LYKA 2AJQB 3ERFA 1AAZA 2E2GA 4PQ1A 8GSSA 3LGCA 3RAZA 2YP6A 1X5DA 4D73B 3DMLA 1BAYA 2GSQA 1ST9A 3QAVA 2H73A 1MD3A 5COHA 1GP1A 2PGTA 3RDWA 3GIXA 2P31A 4MCUA 4IKHA 1U3AA 1XW6A 1YF0A 2VO4A 3VURA 1SK0A 2WRTA 3HCZA 3FZ9A 3ZITA 1GUMA 1OKDA 4OWYA 3LWAA 3L4NA 5FHIA 4LMVA 4YH2A 2J9HA 3CXGA 2DIZA 3I9V2 4TXOA 3HVSA 5F0GA 2J23A 1O73A 2LRTA 1F6MC 3PGTA 2VCTA 2IMDA 3F8UA 5B6NA 3M3MA 4HDEA 2V6KA 3P8WA 3TRXA 2H6ZA 3CSJA 3GH9A 3UOMA 3IK7A 1PQNA 1OC3A 1YKCA 5DCHA 1YEPA 3ZVJD 2KOKA 5D9XA 3GKXA 2DJ3A 3DRNA 5AIVA 3AY8A 3IV4A 1SL0B 4FO5A 4GRFA 2HRNA 4IQ1A 2L5LA 4QL9A 2RUFA 3HYPA 2GT6A 2NBSA 2FNOA 5HFIA 4ECBA 3DKSA 1B4QA 2VL9A 2V6OA 3F3QA 3GSTA 4HJ2A 3CTGA 5KEJA 2DBCA 4I2TA 2YPMA 4ILFA 4HZ2A 2V41A 3TB2A 5IPHA 3TGZA 4F03A 4L5OA 2KP2A 1I9DA 4Q5RA 2PVOC 2RM6A 17GSA 1TRUA 1AIUA 4AF2A 3GRXA 2M72A 3H8QA 2EIOA 3L78A 1FO5A 4DVCA 3HJOA 3LG6A 4TVEA 5KN1A 2LQQA 2H0HA 2GQKA 2MMOA 3D0ZA 3QOUA 4ULXA 2O87A 22GSA 2R4VA 4PGTA 1F37A 5F05A 1X5EA 4XS1A 2HI7A 2FCHA 3GKKA 1A8YA 5DVBA 2K8SA 3WGEA 2CZ3A 1DUGA 3HJPA 2BTOT 3WD6A 6GSTA 1TXXA 3GTUA 1HYUA 3KMNA 2H74A 3UVHA 1V40A 3ME8A 1S3DA 2H72A 3EINA 2IN3A 1GWCA 1F3BA 2JL4A 2YZHA 5G31A 3TDGA 4L0WA 4V1Ap 5JCWA 4F82A 2V2GA 3CMIA 4O32A 1ERUA 3KMOA 4BWQA 1X5CA 14GSA 1EGOA 1Z3EA 1TI3A 2OKAA 2XC2A 3ZFLA 5ID2B 2OADA 5ECPB 1GTUA 1JFUA 4L5LA 2HZEB 5CRGA 3F3RA 2VL2A 3ZLPA 5JCGA 2R37A 2L5OA 3GH6A 1GTBA 1ZGNA 3EU4A 1EOHA 1YF1A 3EC3A 3KEBA 2A4VA 1WMJA 4ZIJA 5B7CA 3EURA 4WF4A 3DWVA 4WEYA 4IHUA 5J9BA 4KW6A 5ECNB 3WT1A 1SK1A 3QCPA 2C1YA 1SYXA 4YAPA 4KB3A 4I5QA 1HNAA 3GL5A 4POKA 2LJAA 3A2XA 4MF6A 4GQFA 1HD2A 3DGQA 4RQXA 1SKSB 1Y25A 3K8NA 4LL4B 3W6GA 5IMFA 2YANA 5D9WA 2B5EA 3PR8A 1SD9A 4I8BA 1PN9A 1AC1A 3LJRA 1O85A 3GN3A 5CNWA 4HU9A 1TK8B 4GF0A 4NV2A 2P5QA 3SWLA 2GTUA 2H19A 4MF5A 5DQSA 1HNCA 4KDUA 4PNFA 2VD1A 1SJ6A 5CP1A 3QAWA 1Y6EA 3E0UA 2LUSA 5DQYA 1JLVA 4K7OA 1EV4A 4KE3A 4KSMA 2VCZA 5ECSA 2A2RA 2N5FA 1AQVA 1R4WA 4MDCA 3HA9A 4GCIA 3DEXA 1V9WA 2HXKA 3BCKA 3VPTA 2H6XA 5IM9A 3F4RA 2D2ZA 3F9UA 5ECOB 1A24A 3VI5A 1F2EA 2VCWA 3WT2A 3TKRA 5ECRB 1U88A 5JWQB 4MJCA 3FR3A 4X43A 2IIYA 5GZZB 3CBUA 3ZYWA 3FY7A 1DBYA 1LBKA 2FD3A 5DALA 4JEDA 4K2DA 1XW5A 4XS4B 3L9VA 3IBHA 2XPEA 3UAPA 1OKTA 4POBA 4EDZA 1TK5B 2DJ2A 2MMZA 5F06A 3R2QA 1R5PA 2DJ0A 3KXOA 1SD8A 1T7PB 5LCZA 2DJ1A 4TXVA 1GH2A 2FUG2 3J7Yb 3ERWA 2MYGA 1XFLA 1OC9B 1VF2A 2C0GA 5DDLA 1K3OA 2VCVA 4IBPA 4ECJA 3OR5A 4ZBDA 5J3RA 1VF3A 2L57A 3NIVA 3F4TA 1TRWA 5ELGA 1THXA 2IMIA 4ML6A 5EL8A 2OE1A 10GSA 3FR6A 5DAKA 3US3A 1DE2A 3D21A 3KCMA 1PL2A 5A4UA 2HNLA 6GSUA 4G2EA 2IMFA 2LS5A 4J2FA 4X1UA 2VLVA 3J7Yk 1A0FA 3MAKA 2GLRA 2QGVA 2DMLA 5DJMA 3P90A 2XPDA 2E2MA 2TRXA 2L6CA 4BA7A 5IIZA 4KNDA 4EE0A 4RI7A 3C7MA 1EV9A 2HT9A 1MTCA 3TUEA 4K8MA 3U5RE 1XOAA 1EOGA 1FHEA 4ID0A 4TXOB 2GT5A 4PX1A 4EUYA 4HOJA 4DSSA 3CYNA 1ACVA 3DIEA 2VL3A 1UN2A 2P0GA 3G7JA 1F9MA 2CVKA 2ON7A 4TR3A 5AISA 1AQWA 3CTFA 1BX9A 1U3IA 2B7KA 2FWHA 4LMWA 2VIMA 1XOBA 3TKSC 4MZCA 4MABA 4Q5QA 3BOAA 5IQYA 4JE1A 4FH8A 3M9KA 3HXSA 5FWGA 1ZZYA 4H86A 3MSZA 2FWFA 4BL7A 1RW1A 2REMA 3IAS2 3M9JA 1KTEA 1BYEA 3RHCA 3QDNA 5B8BA 3FZ5A 4JR4A 5A4WA 1TU7A 2YWIA 5IMVA 1QXHA 1K0AA 4HI7A 5B8AA 2F3MA 4LA1A 4Q5FA 1TP9A 2WCIA 1NSWA 1TJDA 2L59A 2FWEA 6GSXA 1TK0B 1B9YC 1PMTA 3FEUA 1YEXA 1M9AA 2NVLA 2WFCA 2I1UA 2H6YA 1AW9A 5LD0A 4K0GA 1BJXA 2PUKC 5JWRB 5G2ZA 4IP6A 4ML1A 3E9JB 2DSAA 2VLUA 1QGVA 2NDOA 5LNKe 2YCDA 2CAIA 5HR0A 1AQXA 3EMXA 5C04A 2VOCA 2B6MA 2LRCA 5H5QA 1I5GA 2R2JA 2LRNA 1G7OA 4PUFC 1LU4A 2GSRA 2H75A 2EIRA 1GL8A 5AIXA 1URMA 3ERGA 3O6TA 3GTUB 1XIYA 1DSBA 1V98A 3KP8A 1SL1B 2RIIA 4IW9A 2O89A 3TKSE 2JADA 3VK9A 1X9SB 1N8JA 5IO2A 4YQUA 2LSTA 4XRAA 1WRYA 1JHBA 1FW1A 3E3EA 1PA3A 5J41A 1Z6NA 4EDYA 5CO3A 1T8EB 3HVXA 2WULA 1S3AA 2VLTA 1ZL9A 5C00A 2F9SA 4NWYA 1A2MA 1X9MB 2GZYA 5ELAA 3LSZA 2WDUA 4TR4A 4PUAA 1T4ZA 3A2WA 1XWGA 2X64A 4KA0A 1TRSA 1TDIA 3QR6A 1Z7RA 2LQOA 2AV4A 5J5NA 2GVPA 1XCCA 5IMAA 1K0DA 2H30A 2F8FA 1NHYA 4MPGA 4CHSA 1B48A 3GSSA 2O8VB 1R5AA 2XHFA 3Q19A 1K0CA 2GS3A 5EPFA 3H1NA 1EEJA 2AB6A 2KUCA 1G0TA 2FWGA 3ZIVA 2H1AA 3HJMA 4OO5A 1EP8A 1UVZA 2KHPA 4BVYA 2KLXA 1QMVA 1EP7A 1M2DA 13GSA 3HHVA 4L8EA 2TRCP 2V1MA 2OE0A 5DBQA 2YNXA 3W8SA 2OBIA 2AYTA 4KH7A 5F07A 2HYXA 2B1LA 1AUCA 2TIRA 4EVMA 4K1FA 19GSA 2JZRA 5G1LA 4V2NA 1SU9A 9GSSA 1Z9HA 2H0GA 4EO3A 2CA8A 3VWUA 1VGLA 3RPPA 3GNJA 1J0FA 3L9SA 2VM1A 2M80A 1N2AA 3ZL5A 1O7UA 1A0RP 3VPQA 3IOSA 6GSVA 2K9FA 3KIJA 1IYHA 4QL7A 3M1GA 3D4TA 4MK3A 3CRTA 3QFBC 4BPYA 4MZWA 4TW5A 5ECQB 3UMAA 1SK2A 5DCGA 3RPNA 3TOTA 4OCEA 3IA1A 2VCQA 4TR0A 4EL1A 1JZWA 2IMEA 3KTBA 1RK4A 2LTKA 5DALB 1MEKA 4PQIA 4HJMA 1TI1A 3TRQA 3KM6A 1XWAA 4JRRA 2F51A 3I6AA 4PQHA 3HD5A 1QQ2A 2FY6A 1A2JA 3ZMKA 3D5JA 5J4UA 1OC8A 3GV1A 2JACA 4IP1A 5CRWA 3WGXA 4YQVA 5G30A 1CQHA 4K9ZA 1YKAA 2O85A 2HZFA 4MJAA 3GKNA 1GSSA 1WE0A 3Q74A 3H4KA 4I97A 4WF5A 3QFAC 3FRCA 3G9BA 4KSOA 3QPMA 4MLYA 5IOXA 1SL2B 2QC7A 5D96A 2LKUA 1PL1A 4OFMA 4IQAA 2YV9A 3GX0A 5DAKB 4K7IA 2WZ9A 3QAGA 1H75A 2VD0A 4KDYA 2AAWA 3FHKA 3ZIJA 4J56E 2NTOA 1WP0A 4HS1A 2CVBA 2FA8A 4ZL8A 5F8BA 5ENUA 5A5KA 3BJ5A 5IPGA 4ZL7A 2EC4A 6GSYA 1U6TA 1LJRA 1O8XA 2PVQA 4E8EA 3ZRDA 1M7TA 1WPIA 5HFGA 5HFKA 5IO0A 4ECIA 4XS6A 1ERVA 5D9TA 3F0IA 1XZOA 1U87A 3GYKA 4KX4A 2IFQA 4ACSA 3UARA 1ERTA 3GUSA 4NV5A 2IMKA 1H4OA 2H71A 3F4SA 1J9BA 2C3NA 3D4MA 2X8GA 3IE3A 2H8LA 3N5OA 3W8JA 4LLRA 5JCUA 2GGTA 4GSNA 4NAXA 5CAXA 1M2BA 2H01A 4TOPA 4AGSA 1ML6A 3MNGA 6GSSA 1ZOFA 3KP9A 2C0EA 1DE1A 1YDKA 2DJJA 2PERA 4HZ4A 3EVIA 4OMVA 1K0NA 2HSYA 4NHZA 4WKWA 4DEJA 1TKDB 5GSSA 1V58A 2RM5A 4POLA 2Z9SA 2CQ9A 4P3YB 3N9JA 3FZAA 4GTUA 2HSHA 3NOFA 5EVOA 3DYRA 4IS0A 1K3YA 2OA7A 2QSIA 3FK8A 3EU3A 3VWXA 3TRPA 1M2AA 3MWHA 3TOUA 4HU7A 2E7PA 4ZL9A 5CYYA 4QQ7A 2YJHA 4IJ3A 4GLTA 3VFIA 3DD3A 7GSSA 4XHMA 5HR2A 4V1Ag 1JZDA 2CT6A 3DXBA 4NPBA 3UBLA 4KAEA 1XPVA 5HQPA 2X99A 3VI7A 3L0HA 1T00A 5D93A 5ECIB 4Z7XA 3HVVA 3GL3A 4WXTA 1WWJA 1F3AA 3FYGA 2QKEA 1KEBA 3KJYA 6GSWA 1T1VA 2FA4A 2G0FA 2CX3A 3HKRA 5E4WA 1FB6A 3UBKA 5ECHB 1XWCA 3A2VA 3L9UA 1ILOA 4G19A 3BCIA 2OJLA 4G9HA 3ZZXA 1OYJA 3RBTA 3TJKA 3KH9A 2GZZA 1WIKA 4EKZA 1HNBA 2B5XA 3DVWA 1OAZA 3G7IA 4ZBAA 4KGIA 3TCOA 5KN3A 5A4VA 1MD4A 2YV7A 1R7HA 4PNGA 4MH3A 3KTLA 1GSEA 2C0DA 2K6VA 2N5AA 2P5RA 2PU9C 3GKMA 3FZ4A 1GLPA 1K0BA 3KH7A 3C8EA 3IRAA 3PH9A 1QK8A 1PGTA 3Q6OA 2YWOA 1YQ1A 1K0MA 2GQMA 2MBSA 2PMTA 1GUHA 2DLXA 3DVXA 1IYIA 1WOUA 4RQRA 1M0UA 2LJRA 3H93A 5IOWA 4MZBA 2H1DA 1YY7A 4MH2A 2BMXA 1O6JA 4ISDA 4ZBBA 4CDOA 16GSA 1VF1A 1ABAA 3C71A 4BWSA 5JWOB 2XBIA 2K8VA 1GNWA 4J57E 2YOIA 4FYBA 1GRXA 1JZRA 1TTZA 3EMPA 4XCSA 3GHAA 1K3LA 5G1KA 1T3BA 5H5SA 4K7NA 2HE3A 3IAM2 2C3QA 3C1RA 4WBRD 3CRUA 5EY6A 3EE2A 2IL3A 4MJBA 4IELA 1UC7A 1SKRB 1EGRA 2LNSA 4IJIA 4FYCA 4YQMA 1SJIA 2JU5A 1G6WA 2CVDA 3O76A 3EYTA 4ECCA 3H79A 3EWLA 1NHOA 2C0FA 3ME7A 3UVTA 2H66A 1XXUA 1NW2A 4O5RA 4OO4A 3VWVA 2R5GA 5J9CA 3KD0A 2YJ7A 1GLQA 2HRFA 5CREA 2L4QA 1B4PA 3VWWA 4TR1A 4HUAA 5L71A 1GULA 3GMFA 3PINA 1X0RA 2H70A 4F9ZA 4MF7A 3IK9A 2VAFA 1ZYEA 2FLSA 1EEMA 4I6XA 4MPFA 2RUEA 4EC0A 2GDRA 3IHQA 1Z5YE 4V2LA 5HR1A 4WR5A 3TJFA 3LXTA 4D73A 1X9WB 1A2LA 4YAVA 1V57A 2LNTA 1C72A 4GWRA 2L6DA 3S9FA 2VCXA 2I4AA 4DSRA 1ERWA 4F2IA 5G5FA 1GSQA 3BD2A 2ES7A 3UEMA 2H0IA 3M8NA 4OD7A 3LXZA 1PKWA 1FAAA 3LQ7A 2JSYA 3D22A 2DMMA 2IJYA 1SJZA 4ZB8A 2MMNA 4K0NA 2CX4A 1SENA 3HDCA 1FVJA 4GQCA 2YWMA 3Q18A 4JZQA 3A5WA 4MMMA 1KBNA 2O7KA 4AJ8A 3VLNA 2VL2C 2NPBA 3MDKA 2GQLA 3ZREA 4FIWA 1JLWA 2L4CA 1PX7A 4N30A 3WYWA 1GNEA 3IPZA 4ZILA 4WR4A 5IMCA 2IFQB 3QMXA 1GUKA 2X8CA 4E8HA 3HY2A 5GSTA 1E2YA 3HZ4A 1CQGA 2CAQA 4N11A 2AHEA 2C8UA 3F6DA 4NXIA 2DJKA 2A2SA 4N0ZA 4ZB6A 5KN2A 1BG5A 5ECKB 3IXRA 2C3TA 4DSQA 2GZPA 4GSTA 2I81A 5D9VA 5ECMB 4JU5A 3UIWA 1TU8A 1THOA 1GSFA 4IGJA 2FGXA 1ZYQB 3IC4A 3QD9A 3HZ8A 2C80A 4ZB9A 5KN0A 1USBA 3LORA 2ALBA 3F6FA 4L0UA 1GSYA 4KDXA 2H1GA 4NHWA 4LL1B 1QUWA 1PSQA 3UL3A 1VRSD 1Q98A 2DIYA 2KP1A 3WGDA 4ZXGA 1YZXA 4Q5NA 1VF4A 4KCAA 1FOVA 2M46A 3F63A 4IVFA 4WBJA 1Q4JA 1S3CA 2OE3A 2YZUA 2VM2A 4F0CA 1FB0A 2MBTA 2HFDA 2X8HA 4WETA 1W4VA 3TJGA 2LJKA 4RI6A 1YJ6A 3TJJA 1M99A 4PXOA 3O3TA 2IWTA 5ABRA 2DC5A 3ZTLA 1R26A 3NZNA 12GSA 4XIHA 3C1SA 11GSA 4POMA 3ED3A 3P7XA 4XRDA 3UJ1A 5AGYA 3SBCA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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