2HZFA

Crystal structures of a poxviral glutaredoxin in the oxidized and reduced states show redox-correlated structural changes
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
110
structure length
110
Chain Sequence
HHQMAEEFVQQRLANNKVTIFVKYTCPFCRNALDILNKFSFKRGAYEIVDIKEFKPENELRDYFEQITGGKTVPRIFFGKTSIGGYSDLLEIDNMDALGDILSSIGVLRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of a Poxviral Glutaredoxin in the Oxidized and Reduced States Show Redox-correlated Structural Changes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutaredoxin-1
molecule tags Electron transport, oxidoreductase
source organism Ectromelia virus
total genus 33
structure length 110
sequence length 110
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.8.5.1: Glutathione dehydrogenase (ascorbate).
pdb deposition date 2006-08-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2hzfA00
5B8AA 2L4CA 1MTCA 3BCKA 2VL9A 1I9DA 18GSA 3IA1A 2E7PA 4GCIA 1Q4JA 4XS6A 4O32A 4F2IA 1J9BA 2HNLA 4MZBA 4BVYA 3H4KA 4HEA2 1JZOA 5LCZA 3ZLPA 4O92A 2ES7A 4ZB9A 4HU9A 3O6TA 3KJYA 2YV7A 3MAKA 2B6MA 4TRXA 1EOGA 4Z7XA 3TKRA 2XPEA 4IW9A 4OWYA 2JL4A 4MJEA 1LJRA 1UN2A 4KCAA 3RDWA 1GUMA 1EGRA 3KXOA 2YWMA 5ECIB 1F3BA 2K18A 4YQVA 1TTZA 1A2JA 3UAPA 3HYPA 5IMFA 1MDJA 3M1GA 4MZWA 4JU5A 5F06A 1QFNA 4BVXA 1ZYEA 6GSWA 2FY6A 2DIZA 3VFIA 3NIVA 1ON4A 2WJUA 1PKWA 2HFDA 5IOXA 2WCIA 3CTFA 1JFUA 1XZOA 4X1UA 3I69A 1EP8A 2X99A 5EL8A 1HQOA 3QOUA 3E3EA 4G19A 2LQQA 5A4UA 2OJLA 3ZL5A 4WF5A 1S3AA 3RBTA 1PMTA 4TKYA 5G1LA 16GSA 1B9XC 3UJ1A 2XHFA 2YWNA 2MBSA 1ILOA 5E59A 3HCZA 2GSSA 3C73A 4POLA 2L6DA 5A4VA 1M0UA 3IK9A 3CRUA 2L6CA 2VLUA 2WGRA 3M9JA 5J4UA 1G6WA 4MH2A 2PWJA 1A2LA 1M99A 1YF1A 1BJXA 4POKA 1GTAA 5KN1A 5KN2A 4ECJA 2LJKA 1EGOA 4EE0A 3FR6A 1Y6EA 3GTUA 5DCHA 5DQSA 2YJ7A 22GSA 4MK3A 3M0FA 3P2AA 4NMUA 4KH7A 2E2GA 1OE8A 4AJ8A 4K7IA 4N0VA 1OKDA 2B1LA 3RHCA 4I2TA 1KBNA 3L4NA 3GHAA 2FWGA 3CYNA 2MMAA 1SL1B 3O3TA 4FH8A 2H01A 5ELGA 4TR4A 1XPVA 5A4WA 3KTLA 2V6OA 4FYBA 2NBSA 2PGTA 4D73A 2I3YA 2H6XA 1XBSA 1NW2A 1A8LA 3IRAA 3K8NA 4MP4A 4IJ3A 1QXHA 5ELAA 2NDOA 3HA9A 2GQMA 2OBIA 2XBIA 3QR6A 4MJCA 4IBPA 3FW2A 2CX4A 4HOJA 4MLYA 1RK4A 4MJAA 4XS4B 2PVQA 1X5DA 3RPPA 2FD3A 4F0BA 3CSJA 1I5GA 3TDGA 4OCFA 3WT2A 3FY7A 2H6YA 4ZILA 1BYEA 1YQ1A 2G2QA 1MDIA 4PQHA 2R4VA 3HVVA 1WIKA 4MF5A 1B48A 1DE1A 2XPDA 3CSIA 4PURA 4LMWA 4O5RA 1URMA 4KDYA 2JSZA 1F3AA 1NHOA 1SD9A 3H93A 2H30A 5ECNB 4J2FA 1M9BA 4ZBAA 5CYYA 2AJQB 2K9FA 4PXOA 3EC3A 2VLTA 5G2ZA 2RM5A 3D5JA 3HZ4A 4XTSA 4P3YB 1PX6A 3C1RA 2VLVA 1GNWA 5GSTA 1PL2A 3KM6A 4MA9A 5ID2B 2H6ZA 8GSSA 4K8MA 7GSSA 2JZTA 1THOA 2LNTA 1K0MA 4TOPA 4WXTA 1ML6A 1YZXA 4BWSA 1PRXA 3MSZA 1PL1A 1HNBA 1WE0A 1AC1A 1X5EA 5J9BA 5CNWA 1SU9A 9GSSA 3GRXA 1R5PA 5LNKe 1THXA 2H0IA 5D9XA 4TVEA 3HVXA 1GUHA 3R2QA 3IOSA 1PKZA 2DJ1A 2H19A 5IMDA 5HQPA 1FB6A 1TU8A 2CQ9A 3C7MA 2H75A 2V32A 4F9ZA 4BA7A 1TW9A 1Z9HA 1G0TA 3LGCA 2MZCA 1T4ZA 1FO5A 4BPYA 2C80A 3RAZA 4HJMA 3H1NA 3ZRDA 2VD0A 4MDCA 2O89A 4MH3A 2GZPA 3VWXA 3GX8A 5ENUA 3GSTA 1R26A 3EU4A 5AN1A 1O6JA 2CX3A 2NTOA 3D4TA 5D9VA 1TK5B 4GRFA 2WRTA 2HLSA 2I4AA 4Q5FA 3LFLA 5IQYA 2IN3A 4K2DA 2R37A 1A2MA 3IV4A 3DWVA 1BAYA 2OA7A 20GSA 5ECQB 3EMXA 3D22A 1GSUA 2N5FA 3UEMA 3DIEA 1SL2B 2HXKA 1SK2A 1LBKA 5DJLA 2IMEA 2VOCA 2P0GA 4G9HA 2DBCA 1EEMA 1TP9A 1G7EA 5J9CA 4KA0A 2VO4A 2YN1A 4IQAA 2DJ3A 5G5EA 4KDUA 3LYPA 3QMXA 4MF7A 1GSYA 2JZRA 3ZTLA 2OE1A 3RPNA 3LXTA 1ZMAA 3CMIA 4V2MA 1VF4A 5H5RA 3VWWA 3NZNA 1OAZA 1GTIA 3IDVA 5DALB 1J08A 2A2RA 1EEJA 4NXIA 3CSHA 4K0GA 3F8UA 3F4RA 4JR6A 3A3TA 4TXOB 4XRAA 1JZRA 2CAQA 3VPTA 5IOWA 4GSSA 4TW5A 3HY2A 2HSHA 1AQVA 3FR3A 4IN0A 5IMAA 4POMA 4K0NA 4K7OA 3FZ5A 3KH7A 1GL8A 2H1DA 3VWUA 4DSSB 2JACA 3HKRA 1OC8A 3J7Yb 1X9SB 1O73A 1F2EA 3MWHA 4ZXGA 2L59A 3D6IA 4QQ7A 1SENA 5G30A 1FAAA 1K3YA 2GS3A 5CRGA 3Q74A 3S9FA 1R7HA 4G10A 2LNSA 2VCVA 1Y25A 5CRHA 3GNJA 3H79A 2V6KA 2K6VA 3DMLA 1A8YA 3ZMKA 1K0NA 3VPQA 3MNGA 4IGJA 4GTUA 2LJAA 1WRYA 4MCUA 3DEXA 3HXSA 1FVKA 4FO5A 4CDOA 2AB6A 3US3A 3W8JA 1N2AA 2LV3A 4MZCA 6GSXA 1XIYA 4AJ7A 4FYUA 5JCGA 1TU7A 2PMTA 2HE3A 1TI1A 1T4YA 3DD3A 3KIJA 1TRSA 4TXVA 3D4MA 2KOKA 2X64A 5COHA 3UBKA 4N30A 2HYXA 1XWCA 1GSEA 3GFKA 4GQFA 1SJZA 1U3AA 3F63A 1SL0B 6GSTA 2XBQA 1A0FA 1AQWA 1XWAA 2K8SA 3MDKA 4WEYA 2H66A 2YOIA 3SWLA 1AXDA 2GVPA 1S3DA 4I8BA 3APSA 1ERVA 4KE3A 3ZVJA 1FVJA 3UOMA 2FA4A 2H70A 2GSTA 4X43A 3QD9A 2OACA 2ON5A 1A23A 1XFLA 4HUAA 3TKPA 4AF2A 2LRNA 3DXBA 2F51A 4ECIA 2R5GA 2PERA 1R5AA 2CZ2A 19GSA 12GSA 2MMOA 3PH9A 4V2NA 1GH2A 4ZB6A 3F4SA 2YV9A 4EF0A 1JZDA 3GH9A 1EP7A 5G5FA 4YAVA 1PA3A 2HRNA 4PUAA 3H8QA 3W8SA 5C00A 2IFQB 5JCUA 4PNGA 3Q19A 4JE1A 1GULA 2MMNA 3TKSC 4RI7A 2LRTA 4GF0A 1C72A 4XS1A 2B5YA 1B9YC 4GQCA 2LRCA 3NOFA 4HZ2A 2QC7A 2TIRA 3VURA 4XHMA 2E2MA 5IMZA 1SJIA 3FK8A 2H8LA 4HS1A 1JLWA 2YNXA 1DBYA 4FIWA 2YPMA 1MD4A 2H76A 4ISDA 4LMVA 3ISOA 3D21A 4F0CA 1G6YA 2VCWA 4ML6A 2B7JA 2P5QA 1M2DA 3C1SA 2RLIA 3Q18A 4J57E 5J3RA 4QL9A 2LTKA 4L0UA 3FZ9A 2C3TA 2VCXA 4ZB8A 3DYRA 1V9WA 2BTOT 2L57A 3LWAA 1WOUA 4XS4A 3C71A 2WS2A 3KP9A 2H1GA 2TRXA 2N5BA 5AIXA 3WGEA 3L0HA 4HQSA 1T1VA 1ERUA 1AQXA 3GL5A 1O81A 5CO3A 1PQNA 2PN8A 1AAZA 2GQLA 5HR2A 2PVOC 4TR1A 4GXZA 3PGTA 2L4QA 2O85A 1X0RA 4H86A 2WULA 2F8FA 1H4OA 2LUSA 3FR9A 5J41A 1O85A 5D9TA 2I81A 2GTUA 3EE2A 2RIIA 2YP6A 3LYKA 4WETA 2LQOA 5B6NA 5F8BA 4EDYA 3J7Yk 2HSYA 2DJ0A 4ULXA 2PBJA 1WPIA 4V2LA 5GZZB 1FG4A 1TI3A 1U87A 2YJHA 3O76A 3E0UA 5ID2A 1WWJA 3GMFA 2C1YA 2JZSA 2X8CA 2OKAA 4NHZA 1HYUA 3P8WA 2DJJA 3LG6A 3ZREA 4JR4A 5DAKB 3FEUA 3M3MA 1XW9A 1VF1A 5G31A 4AGSA 3GKKA 3FZAA 3IAM2 1ZGNA 4IS0A 4RUVA 2FGXA 1X5CA 1MD3A 1SK1A 2VL2A 2B1KA 4V1Ap 2CVDA 4MPGA 4X0XA 2VL2C 2EC4A 1VGLA 2CV4A 2J9HA 1FOVA 2FA8A 4JBBA 1Z7RA 2FWEA 3EU3A 3DVWA 4LA1A 2CVKA 5IMVA 1N8JA 4OD7A 5D96A 2X8GA 6GSVA 2GZYA 2D2ZA 1EV9A 3IC4A 1TRVA 4DVCA 1DSBA 4WKWA 3QAWA 4E8EA 1TXXA 2VAFA 1TK0B 2NPBA 2DIYA 5A5KA 1GUKA 2A2SA 1Z6MA 1K0CA 1VF2A 2V41A 4WF4A 5B8BA 2JADA 1TOFA 3ZMLA 1OYJA 1IYHA 1M2BA 2VM1A 1ERTA 2RM6A 3LXZA 5HFGA 1O8XA 1SJ6A 2OE0A 2HI7A 6GSSA 3APQA 1V98A 2E0QA 2MYGA 3ED3A 1YF0A 1HD2A 4PX1A 4NHWA 2C4JA 1GSQA 5GAND 2O87A 2V1MA 1OC3A 2GT6A 2HZFA 3ZYWA 2I1UA 1TDIA 4L5LA 1ZOFA 4O7HA 3TRQA 2K8VA 1EZKA 1K0BA 3ZITA 3DGQA 2C8UA 4N0ZA 2WB9A 3F4TA 2LSTA 1PN9A 4EKZA 1GNEA 4HU7A 1V58A 3TJJA 3CTGA 3G7JA 3HVSA 3KEBA 3LSZA 2VCTA 2C0DA 3F6FA 13GSA 1PD21 2WDUA 3KCMA 3DRNA 4L0WA 3GSSA 2B3SA 3SBCA 3VWVA 1HNCA 5IM9A 3E9JB 4TXOA 4HI7A 1YKAA 1W89A 4YQUA 2M72A 3GIXA 4WR4A 2H1AA 4DEJA 5IO2A 3UBLA 1FHEA 1YKCA 3KMOA 1SYRA 3C8EA 3A2XA 3FRCA 4DSSA 2CAIA 3EYTA 1KEBA 2FHEA 4KCEA 1XVWA 4HQZA 2KLXA 2HT9A 1AW9A 3N9JA 2I9HA 3BBYA 5JWRB 3GL3A 4PQ1A 1UVZA 1GLQA 2LKUA 1F6MC 1T00A 2GDRA 5B6MA 3KTBA 1QUWA 2C3NA 2H74A 2X8HA 2YCDA 4KGIA 2AUVA 4TR0A 3I6AA 3CRTA 5IIZA 11GSA 3GV1A 4OCEA 1NHYA 2GQKA 1ERWA 2HRFA 5IO0A 2ZUPA 3QFAC 4AJ6A 4ZBBA 3GA4A 5H5SA 2VUPA 1XOBA 3IPZA 4KW6A 3EINA 4YQMA 2H72A 2H73A 3TRPA 5DQYA 4KB3A 1BEDA 3G7YA 4ID0A 2P31A 3KD0A 3IK7A 3F0IA 5DDLA 2KP2A 2IWTA 1GWCA 1CQGA 3TJKA 2R2JA 2DSAA 1TRWA 4KAEA 1ACVA 2B7KA 1QGVA 1YDKA 3HD5A 4HDEA 3F3RA 1A0RP 2L5OA 1CQHA 3BCIA 2CZ3A 1MDKA 1U3IA 1RQMA 4YAPA 3GKNA 2J23A 5H5QA 1J0FA 1TKDB 6GSUA 1O8WA 1GRXA 2AAWA 2ALBA 2AYTA 5IPHA 3GKMA 5FHIA 3QPMA 2PUKC 3TB2A 3FZ4A 3BOAA 1KNGA 3UVHA 4XRDA 1RW1A 1LU4A 1FB0A 5C04A 1Z5YE 2F3MA 5CREA 3WGDA 2Z9SA 5CP1A 5GSSA 5FT3A 4RQXA 4IKHA 2FWHA 2HZEB 1OC9B 4MABA 1R4WA 4EO3A 4F03A 4N10A 4IQ1A 2EIQA 3EURA 3UMAA 5DVBA 2L5LA 2DLXA 2IFQA 2WZ9A 1GP1A 1TK8B 4WR5A 1V40A 1A24A 3TGZA 2MMZA 2IPAA 3QCPA 4J56E 4ZL8A 5B7CA 2DJ2A 1Z7PA 3HDCA 5IPGA 1SKRB 2KUCA 4XIHA 2YWOA 5D8IA 3KZQA 1XWGA 3GN3A 1XW5A 4NPBA 1U88A 5DJMA 1QK8A 3GURA 1IYIA 3A5WA 3GUSA 2DJKA 4NAXA 2YZHA 1BX9A 2H71A 2CA8A 1E6BA 5F05A 1BG5A 3IBHA 4ECCA 2IJYA 4EDZA 4L8EA 3Q6OA 3GH6A 3WT1A 4KDXA 1M9AA 4LL4B 4ZBDA 3TKSA 4CHSA 1WJKA 3WGXA 2GT5A 1YJ6A 4ML1A 5KN3A 1Z3EA 5AISA 3D0ZA 1PSQA 1XWKA 1K0DA 1ZCPA 4WBRD 3GYKA 5ECKB 1QMVA 2IMKA 3TKQA 2MBTA 1GTBA 1USBA 3I9V2 4BL7A 3P90A 4NWYA 3L9VA 1E2YA 1K3OA 3EWLA 4CW9A 4EXJA 1B4PA 4OFMA 4IP1A 4MMMA 1YEXA 1SKSB 3DKSA 5D9WA 5EVOA 1B4QA 2LJRA 3TKSE 5ECLB 4IELA 3QFBC 2IMFA 3BD2A 5ECRB 1JZWA 2H0HA 3U6VA 1YY7A 3ERWA 4JRRA 1Z6NA 1K0OA 2VCQA 4L5OA 3IE3A 2O8VB 2O7KA 1F9MA 3ZFBA 6GSYA 1JLVA 1WMJA 1S3CA 2QGVA 3IAS2 4I6XA 4Q5NA 2XC2A 2DMMA 3EMPA 3GTUB 3A2VA 3L9UA 1PGTA 2C3QA 3ZVJD 4HZ4A 4JZQA 3FKFA 2IIYA 1OVNA 3WYWA 2R6KA 1X9WB 4JEDA 2JU5A 1SK0A 3F9UA 3FHKA 1UA5A 3LJRA 4N11A 4PNFA 5DAKA 5IMCA 2VIMA 1XVQA 4ZL9A 1GSFA 3BJ5A 4WBJA 3HZ8A 4KX4A 3IR4A 4KUNA 1SYXA 1U6TA 4E8HA 3HJOA 3EVIA 1DE2A 4D73B 2AV4A 5JCWA 4NV2A 5EPFA 3GKXA 3I43A 2P5RA 2M46A 2C0GA 3QDNA 3AY8A 3ERGA 1XXUA 3OR5A 4ACSA 1OE7A 4TR1B 3TJBA 4ZIJA 3N5OA 4OO4A 4PGTA 5HR1A 3W6GA 3QAGA 2V2GA 3A2WA 2DC5A 3ERFA 3TOTA 2TRCP 4XCSA 1MEKA 2NVLA 4NV5A 3UVTA 5AGYA 4I2UA 1V2AA 1XWBA 5HFIA 2IMIA 5L71A 2FNOA 2H1BA 5CRDA 2OBKA 4KSMA 1JHBA 5CAXA 1M2AA 5INYA 3F3QA 2F8AA 3HHVA 3FYGA 2KHPA 3ZZXA 3LEFA 4RQRA 2EIRA 4POBA 3GX0A 1UC7A 1O7UA 2ON7A 4EC0A 4ZL7A 4FYCA 4GWRA 2VL3A 4I97A 2CT6A 4GSNA 2FLSA 3M8NA 4IVFA 3CBUA 1XOAA 3ZIVA 2R3XA 4GLTA 3UARA 2FCHA 2QKEA 3U5RE 1SKWB 2VD1A 5KN0A 1XW6A 4TN8A 4ILFA 3PR8A 3UIWA 1B8XA 1NM3A 3RHBA 5GAPD 3APOA 4BWQA 1QQ2A 1K3LA 3TCOA 2PU9C 5D93A 4V1Ag 5CRWA 5G1KA 3UL3A 5HFKA 5JWOB 3TJFA 1WP0A 5JWQB 1SD8A 1GSDA 5KEJA 3L78A 2F9SA 1AIUA 4EUYA 2YWIA 5HR0A 5HR3A 2DMLA 1W4VA 4QL7A 3ZIJA 2GSQA 4K9ZA 3TOUA 1K0AA 3VK9A 4LLRA 4LL1B 3LQ7A 5EY6A 2AHEA 3TRXA 3V1WA 2QSIA 5ECPB 3HJMA 4I5QA 4KNDA 4RI6A 3LORA 3TUEA 2YZUA 4ECBA 3VLNA 1ZZYA 1X9MB 5LD0A 4HJ2A 1BQ7A 4PQIA 2YANA 2GLRA 4Q5RA 1T3BA 2PPTA 4MJBA 5DALA 2KP1A 5FWGA 2IMDA 2EIOA 1YEPA 3VI5A 2IL3A 2RUFA 3VI7A 3KH9A 4TR3A 1GTUA 1ZYQB 4K1FA 1T7PB 2GZZA 4MF6A 1Q98A 3ME7A 2H0GA 3HJPA 3ZFLA 2FWFA 3JCML 2OE3A 5E4WA 2B5EA 1VF3A 1ST9A 2OADA 5ECSA 14GSA 3KP8A 4YH2A 3ME8A 1AUCA 2M80A 3M9KA 4IP6A 2CVBA 1NSWA 5DBQA 3TJGA 5AIVA 1FW1A 1M7TA 2RUEA 4OFTA 4OFNA 4K7NA 2GGTA 2LS5A 5ABRA 2WFCA 3P7XA 4PUFC 1DUGA 3KGKA 1EV4A 1GSSA 3QAVA 4OO5A 5D73A 4EVMA 1KTEA 3DVXA 1OKTA 2C0EA 2ZCTA 3CXGA 2VCZA 5J5NA 4DSRA 5ECMB 2ZNMA 3KMNA 4G2EA 17GSA 2REMA 5F0GA 4K6XA 1F37A 2FUG2 1EWXA 1TRUA 1ZL9A 10GSA 4GSTA 3IXRA 1V57A 3F6DA 4MPFA 3L9SA 2VM2A 1XCCA 5F07A 1H75A 2BMXA 4IHUA 1ABAA 2GSRA 2B5XA 1GLPA 1VRSD 4OMVA 4Q5QA 4DSQA 4IJIA 5ECOB 1EOHA 5DCGA 2C0FA 2JSYA 4KSOA 1HNAA 4EL1A 2LEGA 4F82A 2BJXA 1T8EB 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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