2I0BA

Crystal structure of the glur6 ligand binding core elkq mutant dimer at 1.96 angstroms resolution
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
RSLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREEVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKITLAILKLQEQGKLHMMKEKWWRGNGC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Conformational restriction blocks glutamate receptor desensitization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 86
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i0bA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i0bA02
3FJGA 3S4UA 2ONKE 1JEUA 4OTEA 4R9GA 3THIA 4DXBA 1EZOA 1MM7A 2F7CA 4OYVA 2I0CA 1Y4TA 1JEVA 4EF1A 2Z8EA 1TWYA 4FECA 3S2VA 2NWJA 1H44A 2O7UA 4GWOA 2W7YA 1B5JA 4LZ8A 4NF8B 3TTLA 3OD7A 3R7XA 2ONSA 1MPDA 4ZE8A 2UYEA 2I0BA 4TLLB 1P99A 4X48A 1SD3A 4LUBA 4JBZA 4JB7A 1IZ1A 5ISUA 1L5TA 3H06B 2PMSA 2XXVA 3HCQA 3IX1A 4ZZAA 3MC2A 1P1QA 1Q35A 5I56A 3EPEA 1ZMGA 2B3BA 4HCYA 4M1VA 3E9XA 2HAUA 2I48A 3K00A 3RT8A 2NOOA 1URSA 3RLFE 3KGCA 1N7XA 3H6VA 1MDP1 2G93A 4OQOA 3FV1A 4ELOA 1TXFA 3PGFA 2RCBA 3TTKA 1CB6A 2GHBA 2A5SA 1KWHA 4QSDA 5I58B 1POTA 2DOJA 4PFTA 3N26A 2M8CA 2H4IA 3G3GA 2DXRA 2F7AA 3PMVA 4EXKA 3CI8A 4OEVA 5AA2D 2O84X 2VOZA 1IXCA 3OEKA 4F1UA 5A5XA 3RTWB 3DP8A 1MXWA 1NNFA 1LAXA 1A54A 1SBPA 3PPPA 1N7WA 4EQ7A 1GV8A 2Y7PA 1D9YA 2O1MA 2B65A 4BDOA 2V3UA 1B4ZA 4OENA 2QS1A 5K2XA 1SVXB 4JWYA 2DE2A 4OFOA 4NF6A 3UP9A 2GHAA 1B5HA 2F35A 4JSOA 4YB6A 1PC3A 3TYHA 3OOAA 2QS3A 1UTBA 5CRYA 2XX8A 3EHSA 3OO8A 3QXMA 3H6TA 5AA2A 2LAOA 1ZU0A 4NF5B 1PBQA 1GTKA 3KBRA 1D3KA 4I8CA 4ECFA 4FEBA 2D5WA 3RPWA 3IR1A 1LAGE 3IJXB 5HM4B 1JW5A 2GRVA 4KI0E 3H4ZA 3HN0A 4PE5B 2Q2AA 2F6GA 1POY1 3T9XB 3CFLA 2ONRA 1VFDA 4QF9A 4OZ9A 3LUYA 3Q27A 2OCUA 2HAVA 1B0HA 5H8SA 5KCJA 3MWBA 2H99A 3IO4A 2O6AA 2I49A 3C35A 4F3SA 2XXYA 5L9SA 2UXAA 5DT6A 1FQBA 5ICQA 1I6BA 3Q29A 3T96B 2YJPA 1FQDA 1A99A 3A09A 3KJ7A 4HCWA 2XHDA 4R75A 5AA3A 3MVXA 4H8IA 2DWJA 2X26A 3UA8A 1N04A 3QIMA 2I3VA 3S9EA 3K1PA 2R9JA 3K2DA 3OELA 3LSFB 1NL5A 1Y3PA 2DVZA 4DCXA 3OSRA 2RF1A 3K1MA 2V84A 4HS7A 3L6GA 3VLVA 3MZBA 3FUZA 1B1XA 4OETA 1UTHB 5H8NA 1OIBA 3W9VA 1BP5A 2XXTA 3FVKA 1B58A 2X7QA 1MQJA 2FYIA 1GVCA 4TOZA 4LZ7A 2AL4A 2E1SA 4R6HA 1SDXA 3MP8A 5ELVA 3G3IA 4G4PA 3G7WA 5DYHA 1A7LA 3IAZA 1I6QA 3U8QA 1QUIA 5HBCA 3EN3A 2Q88A 4IO7A 3TTRA 2XXWA 3P7IA 3HV1A 4YU0A 3KEIA 3RN8A 4PFUA 1MRPA 3LBSA 1B05A 4O3BA 1ZLQA 4G68A 3TQWA 3ZKKA 5AA1A 4KQPA 3M3FA 2YLNA 4U23A 3W15C 4R2BA 4G8NA 4F3GA 1IXGA 1P1NA 4JWXA 2XXUA 3TEPA 2Y7RA 3A3CA 4R9FA 3PUZE 1HSJA 1B9JA 3VE1B 5CC2A 4THIA 2DVCA 1SYIA 4WEDA 1NKXA 5ICTA 1S50A 1SI1A 2F97A 4HW8A 1OLCA 3SESA 1B6HA 3SERA 2ABHA 3ONMA 3FGSA 3R6UA 1JW4A 3CIJA 4GVOA 1NNTA 3FXQA 2F6PA 2OZZA 3OMBA 1T0KA 4HTGA 3MJNA 1FCKA 3H6WA 2OLBA 4QFOA 2VGQA 3MZ9A 3FD3A 5I2NA 4G8HA 1UQWA 5H8FA 1SW5A 3T9UA 2QRYA 5TPAA 4PETA 3IOUA 1QKAA 4U1ZA 2Z23A 2HFBA 1Y9UA 4OWDA 1N3WA 1H76A 5DEXB 3EQ1A 1SI0A 4XKRA 4E0XA 3V89B 1EZ9A 4GQOA 1ATGA 4KCDA 3K02A 1LBBA 2Y7KA 4KYSA 4ISUA 2DQVA 2ZNTA 1XS5A 2DWAA 4EXLA 4P11A 3TCHA 3SETA 3VLUA 4Z7EA 4KCCA 2V3QA 3GBAA 4Z0IA 1PEBA 3O2AA 1FTKA 1MPBA 4U4XA 4E0WA 1MQGA 3OXNA 2XXIA 4GF8A 5JTYB 4N13A 4O3AA 3FZVA 1AH5A 4NMYA 2G29A 3VFJA 5M2VA 1XC1A 1MM6A 2IEEA 1Y3NA 3CSBA 4NWCA 5CM6A 1A8EA 1D4NA 3V8XB 4LZ5A 1PB9A 3CSGA 4AB5A 1FQFA 5LOMA 1NFTA 1UIUA 3DP6A 1B2HA 4XKPA 4C0RA 3RT6B 3PD9A 1QUKA 3TCGA 4FJPA 3C32A 3MAMA 1MY2A 1VFEA 5I2KA 3TFLA 2PVUA 2F34A 3FV2A 4MFIA 2YPNA 2QL3A 3JYRA 4RJZA 1LGBC 1MXVA 3IORA 5KDTA 2I6EA 4DDDA 5H8HA 3WAFA 1USYE 3K0VA 3DLNA 3ECRA 4G8MA 2PX1A 3OO7A 2P1SA 1IEJA 4Q0CA 4F3BA 3MPLA 4LONB 1JETA 5FTHA 4N6PA 3H03A 3CG1A 3GXAA 2DWIA 5I59A 1TT1A 1H3DA 4WXJA 3N94A 3VLWA 2UYFA 3O29A 1PBPA 2O51A 3RY3A 3PUVE 2QS4A 3IB0A 2XXPA 1N3XA 1WDNA 4DIGA 2FNCA 4Q5TA 3V83A 1H43A 1LCFA 1YAEA 4JXIA 2Q9TA 2ZYMA 2A5TA 1MXZA 5L9OA 2NVUB 2V93A 5I57B 3BBRA 4EUOA 1GGGA 3K6UA 1N0TA 4POXA 3U93A 1LBCA 1XVXA 1RKMA 4DLDA 1YPNA 2HZKA 4KR5A 4RK9A 5TP9B 3I5OA 3LSWA 4POWA 3DM0A 3CFXA 1JNFA 2NUVA 1AL3A 1MH4A 5EHSA 4JDFA 3K01A 3K6XA 3N6TA 5JEIA 1S7YA 2D3IA 3BFTA 4MLVA 3PV0E 2PYYA 4MBPA 3H3GA 3JZJA 4GXAA 3U1OA 3S9NC 3IJOB 1QULA 4BDMA 3OENA 5H8QA 2Z22A 4KFQA 5F7VA 5TU0A 1Z7ME 1B51A 2DXYA 4IY5A 1P1WA 1Y20A 1NNKA 3DP4A 1ANFA 4ESXA 1JVYA 4AB6A 3RTFB 1AIVA 4DCYA 1FQCA 4GOTA 1Y1ZA 4U2RA 4F3PA 1P1OA 4R2FA 1XVYA 3O6IA 5EHMA 4U1OA 3TPAA 2XXXA 3H6UA 4IGRA 4F2QA 3EHTA 3C4MA 5I56B 5FTIA 1FQEA 1B0LA 1JW1A 3O66A 1B3LA 3IB2A 2Y84A 3L6HA 4F29A 4F19A 5L8DA 4FIMA 4XKNA 3D4CA 4WKMA 3TAJA 1YTVA 1CE2A 2QSXA 4NF4A 2QS2A 2ZXTA 2XXHA 4OXVA 1EU8A 3FASA 3V5AA 5CMBA 3FIRA 3CR9A 4FE8A 1MPCA 4F22A 1ZKBA 4U21A 1NNPA 4IY6A 1MQDA 3HPIA 3PUXE 5AA4A 4PFYA 3H7MA 3TTMA 3IOVA 2HXWA 4XIGQ 4QHQA 1DPEA 3KOTA 2Y7WA 2PBWA 5A5XB 4XXUA 3WAEA 2Z8DA 4ONYA 2X7PA 1MH3A 1WODA 3B6TA 1IUDA 1DSNA 2ZNUA 3TCFA 1R9QA 1BIYA 2DP8A 3IK6B 2F7BA 4BLAA 3MPKA 4G77A 5L9MA 4OVJA 4H67A 4GLIA 1O63A 2O1LA 5FHOA 3SEYA 4NF6B 1AOVA 1Y3QA 3C9HA 4IB2A 3QSLA 3A3UA 1UTBB 4PQJA 1BLFA 3FVNA 3VXCA 3R26A 5AA2B 3GZGA 1FQAA 1YCJA 3E4RA 4IO4A 3FATA 1P1UA 4F2OA 3TODA 2XD3A 4MF3A 1Z7NE 3PUWE 4KYDA 4QSCA 4C1TA 3K1NA 1II5A 1B7ZA 4LVQA 1F9BA 2V25A 3C36A 4WEPA 3JV9A 2HCAA 4UACA 2ZYKA 1B40A 4PFWA 3VDFA 2XX9A 3B7DA 2O68A 3PPOA 3RGYA 5KCJB 3SDFA 3MW0A 1N76A 4YMAA 1N84A 1A55A 1SYHA 4NEDA 1OMPA 5CMKA 2DE3A 1M5CA 3IO6A 1NH8A 1MY4A 2NXOA 3RUMA 3O28A 3FJMA 1B3EA 4ZECA 3IB1A 1DTZA 1M5BA 3QYTA 4U4SA 4F1VA 2B3FA 3DELB 3SKPA 1QKBA 2GH9A 1PB8A 3FXUA 2RKMA 5ITPA 3I3VA 3VVEA 3TDJA 4NF8A 3ZKLA 3SEVA 1GR2A 2DE4A 3RQTA 3ILUB 3M3KA 4RK2A 4FATA 3VV5A 3SEXA 5KZTA 1LFIA 2GFEA 5H8NB 4YB7A 2UVIA 3OO6A 3PMXA 1MY0A 1MY1A 4F39A 4I62A 3CG3A 3O97A 4OFJA 2F5XA 1M5EA 3N5LA 3GLBA 2VD3A 1QUJA 1I69A 4R73A 2OBGA 5FHNA 1UIVA 3MVZA 1URGA 1US5A 1USYH 4OESA 5BWJA 1BTJA 4H65A 3HHFA 5DVIA 3S9LC 4DZ1A 1VSOA 4FORA 3FVOA 1OQGA 3IL1B 4G68B 5I58A 4YKIA 4P0GA 4ZEDA 3MVYA 3SEWA 3LSLA 3TQLA 3HO7A 4GXSB 1B5IA 3MBPA 1FTJA 3RNNA 3K4UA 3TMGA 4LA9A 4QFLA 3VXBA 4GD5A 3UN6A 3T66A 4FAJA 1IXHA 1O7TA 2KLFA 3OEMA 3KOSA 4R74A 4RA1A 1VR5A 1NMUA 5DTBA 2H5YA 1QJMA 3I6VA 2FA7A 4UA8A 1Q1KA 3MP1A 1MXUA 1OVTA 2RINA 4GL8A 2PT1A 5IKBA 1LAHE 4RXLA 1ZIUA 4RPOA 2ZYNA 2O69A 4GFRA 2R71A 3T22A 5CMMA 1DMBA 3KN3A 4QFKA 2ZYOA 5B7DA 4NF5A 5JK4A 3TELA 3ZSFA 3USDA 4G68C 1LCTA 4F18A 3IOWA 4ZE9A 5I2NB 3E13X 3KJTA 2H9BA 3TTNA 5H8FB 1BKAA 1WVJA 5TPAB 1US4A 3MUQA 3T9HB 2REGA 2Q89A 3GBBA 1HSEA 1RYOA 3MP6A 1B7HA 3K6WA 1SW4A 4N07A 4X1DA 4ZEIA 1XHYA 1MG1A 5BUUA 3EHUA 4NWDA 2E0SA 4YICA 3PMWA 2AYSA 2RC7A 3QAXA 4P0IA 4QRZA 2R6GE 1XT8A 1B32A 3KSXA 1IQ7A 4R6KA 2BJJX 4EF2A 3AXFA 4BDQA 5FHMA 2H98A 4R6YA 1M5DA 4LATA 1S9TA 3PPNA 1SQYA 3G3HA 1OLAA 2F36A 1LAFE 2VD2A 4GL0A 1R9LA 1B7UA 2Z8FA 4X9TA 2I4CA 2H25A 1B52A 4EDPA 2IA4A 4OERA 3PPQA 4JWOA 4K3FA 3LC8A 3S9MC 1JVXA 2I4BA 1J1NA 3Q25A 1R6ZA 5ITOA 4RYAA 1UTHA 5I2KB 1B1HA 2OJTA 2ALUA 4LP2B 3PD8A 1MDQA 3Q26A 4KD5A 3TZAA 3UGWA 3E3KA 5KDTB 2D21A 1SW1A 5H8HB 3U92A 1RYXA 3KN8A 4Q30B 4ZEBA 5DVFA 2V3TA 3U72A 3UK4A 4TQUQ 1MQIA 1IXIA 2Q2CA 3CFZA 5B70A 1VE4A 4O3CA 1URDA 5I59B 2RC9A 3ILTB 4OMBA 4ZDMA 4ELQA 4ND9A 4ZEFA 1I6AA 2VHAA 4IO2A 2XX7A 3B6QA 1MQHA 4YAHX 3ODBA 4QFNA 4ELPA 3W9WA 1QVSA 5I84A 1DTGA 3OSQA 2Y7IA 2F78A 3PPRA 2A5TB 2O7IA 4MH5A 2QJEA 1OVBA 3QK6A 1LFHA 2XXRA 2HZLA 4F1YA 2DSFA 4OFLA 1ELJA 2OWSA 4H8JA 4I9DA 1OQHA 4XTCQ 4H6DA 4RPNA 4C1UA 5EYFA 4ELRA 2DYXA 2THIA 2XXQA 5J1DA 4BDRA 4JSDA 2CMOA 4ZS9A 1ZBMA 2RC8A 2ESNA 1A8FA 4QFPA 4DE8A 4YKJA 3CRBA 2WKYA 4M4GA 1JQFA 1TFAA 2UVJA 4H5GA 4YZZA 1MXYA 1PDAA 3KN7A 4RNSA 2I58A 3QUFA 5H8QB 2QPQA 4ESWA 3PU5A 2HQ0A 4GRKA 4TLMB 4Q8RA 5IAIA 1Y1MA 2XD2A 2I3WA 1LSTA 3SEUA 4F31B 1DOTA 2DS9A 2UVGA 5DEXA 2OWTA 3K6VA 3VVFA 1LLSA 1B3HA 4YKPA 3MVWA 4IO3A 4R72A 3G3KA 5CMCA 4KHZE 4DXUA 3IOTA 4PP0A 1TFDA 2AIXA 3QUJA 4LQ2A 2DWHA 4KYEA 5CI5A 4H1XA 4OHNA 3EF7A 2ANJA 4YMBA 1MXXA 5F1QA 4H0WA 4ZEKA 3D4GA 3CVGA 1O64A 5JTYA 1FW0A 3N6UA 4NF4B 5CBRA 3FXRA 3KZGA 3FVGA 2P2AA 3FJ7A 3KFMA 4YB5A 3VVDA 4L17A 1H45A 1HSLA 2QMXA 4ZZEA 4NE4A 4DXCA 1B3FA 5AA4B 2QMWA 4MLQA 1D9VA 4I1DA 3U94A 4XKQA 4X1BA 2UVHA 3Q28A 4IO6A 4IGTA 3T9VA 1IITA 4OEUA 2ZNSA 4BDNA 1QW0A 4U22A 3MQ9A 3MZ1A 1PB7A 1A40A 4RY1A 4GIZA 4FEDA 2AL5A 5DVJA 3KG2A 1EH3A 3HHGA 3TUSA 1LFGA 1ZTYA 2CZLA 4EQBA 3G3JA 4H5FA 1NH7A 3LSXA 1LB9A 5HPQA 1B3GA 4BDLA 3OO9A 3C34A 1ZJLA 1B46A 2VP1A 2P0SA 1Y4CA 3LR1A 4LQ5A 3O6GA 3KSJA 4AQ4A 4KPTA 3B6WA 4G2ZA 3UORA 4QSEA 2PT2A 1SW2A 3PUYE 3T93B 1M5FA 3G3FA 1MY3A 3UIFA 5K2YA 2RCAA 1DPPA 1XOCA 1FTOA 3BKIB 5AE4A 1LB8A 4YKKA 1R1NA 2REJA 5I57A 1AMFA 2HEUA 2F8DA 3C33A 3M3LA 4IO5A 4EQ9A 3TKDA 1EZPA 3O6HA 2Q8JA 3O9PA 1FTLA 2ZMBA 3F11A 1MS7A 5CBSA 5TP9A 4NTLA 2OK2A 3BFUA 3ZS6A 1FTMA 3HSTA 1B4HA 1IIWA 3C31A 3M8UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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