2I0BA

Crystal structure of the glur6 ligand binding core elkq mutant dimer at 1.96 angstroms resolution
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
RSLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREEVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKITLAILKLQEQGKLHMMKEKWWRGNGC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Conformational restriction blocks glutamate receptor desensitization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 86
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i0bA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i0bA02
3Q26A 5I56B 5DVFA 3EPEA 1R9QA 2ZXTA 3QSLA 4X9TA 2REJA 5ITOA 1US4A 2DE3A 3H6WA 3ONMA 1US5A 5F7VA 4YB7A 2Z22A 3UORA 3WAFA 3FD3A 2H98A 2Y7WA 4GXSB 1OLAA 4GL8A 2I0BA 3PU5A 2FNCA 1NKXA 1JVXA 1FTJA 3T9UA 3OOAA 2HCAA 4YICA 4N6PA 3VXCA 4KPTA 4O3AA 2F6GA 5L9OA 3V5AA 1UTHB 4XKNA 1LB8A 1TT1A 2V93A 4KHZE 4XKQA 5ICQA 5ELVA 1A40A 4AB5A 3U72A 3U8QA 2V3TA 2XXUA 1NNPA 3M3KA 2O6AA 1USYE 1DTGA 4F3SA 1TXFA 5AA4B 4BDLA 2F35A 5L8DA 4MFIA 3I3VA 2D3IA 1Z7NE 1ZTYA 3RLFE 2I0CA 2WKYA 4RJZA 4NF5B 5H8FA 1EU8A 2HXWA 4RXLA 3EHSA 2YLNA 1QUIA 2AIXA 4EUOA 1OVBA 3LSXA 4LUBA 1POY1 5I57A 4FIMA 3K1MA 1MPCA 3C31A 4LA9A 3N6UA 4G8HA 2OWSA 3PPRA 2XXQA 1SW1A 3SEVA 4Q8RA 3HSTA 3ZS6A 2ZNSA 1Y1MA 3C33A 1BIYA 2P0SA 5DYHA 3HCQA 1SD3A 1MRPA 3CSBA 1LFGA 3T9HB 5EYFA 1QKBA 4M1VA 5H8HA 3IOWA 3PD8A 1PC3A 3OELA 2R71A 3D4GA 4F1YA 1OLCA 1XT8A 1JNFA 4QFKA 4WEDA 4OHNA 1HSLA 1GTKA 1JW4A 3OMBA 4PFUA 3O6HA 4G68C 4PP0A 1UQWA 4PETA 1VFEA 1ZIUA 3H03A 5B7DA 1Y3NA 2Q8JA 3E4RA 4PFYA 2QS4A 2DE4A 3V83A 4F18A 1MXWA 4RK2A 2OBGA 2KLFA 4YU0A 3Q27A 4H6DA 1A8EA 1UTBA 3ECRA 2F34A 3E13X 4KCDA 3G3JA 4IO2A 1HSJA 1B7UA 1LFHA 1JETA 4G8NA 1NFTA 3TCFA 4OVJA 1DMBA 2Q2CA 3K6VA 3GBAA 3IX1A 2XD2A 3THIA 3GBBA 3FV2A 3IAZA 1N76A 1MXUA 1Y4CA 4JDFA 2IEEA 1Y4TA 4Q5TA 1B3HA 3FJMA 4F3PA 4DLDA 3OEKA 4MBPA 3TKDA 4ISUA 3PUYE 1WVJA 2F8DA 3N26A 2QMWA 1Y3PA 1IITA 4U2RA 1Y1ZA 2DWIA 1FTKA 1FTMA 4BDMA 2DQVA 3GXAA 4ZZEA 3H6UA 3IJOB 1QJMA 4FEBA 4DXBA 4FECA 4C1TA 3SEYA 2ZMBA 4BDOA 4GIZA 2Z23A 4TQUQ 1LBCA 4JBZA 2NVUB 5I59A 1B9JA 3KSJA 4NF6B 4I9DA 4P0IA 4X1BA 3PUVE 3C36A 2DYXA 3FVNA 2HEUA 2F7CA 3JYRA 4MF3A 2OJTA 4HTGA 3CFXA 1AIVA 4QFNA 4DDDA 3H6VA 1NH7A 5DTBA 4XIGQ 4NF4A 1B5JA 3G3HA 4DXCA 4M4GA 4U1OA 2ONSA 4R6YA 2O1MA 1ZBMA 4H5GA 3USDA 3ILUB 4ZEFA 3HN0A 3KZGA 1JEVA 1RYXA 1R9LA 2Y84A 1MDP1 3QXMA 4YKPA 3S9EA 3O66A 1M5FA 3U94A 3LUYA 2O84X 3LSFB 1XS5A 3VLVA 2V3QA 2NXOA 5EHMA 1ANFA 1MDQA 2D21A 3OEMA 1Y9UA 4RYAA 5KCJA 2I58A 1S7YA 2VHAA 2XXRA 4NWDA 1OQGA 3RT8A 2A5TB 5IAIA 1ZU0A 1N0TA 5I2NB 4GLIA 2GHAA 3SEXA 2THIA 4Z0IA 2OZZA 4FORA 1FQAA 5KZTA 2DOJA 1VE4A 3IO4A 5AA1A 3N5LA 4ZEKA 4F1UA 4GQOA 4IO3A 5TU0A 3TTKA 3K1NA 1A54A 1KWHA 4KR5A 1RKMA 4PQJA 2AYSA 3LSWA 3T96B 4GFRA 5TP9A 1M5BA 4H5FA 2Z8EA 3RPWA 1LBBA 1D9YA 1MY4A 3MUQA 3T93B 4ELQA 2R6GE 3BKIB 2DWHA 1H3DA 3MP6A 4IO6A 2B65A 5H8NA 2G93A 4H67A 4R2FA 3FIRA 2GFEA 3N6TA 4EF1A 1VFDA 5IKBA 1PB9A 5AA2A 4DIGA 4FJPA 4ESWA 2P1SA 3VFJA 1MXXA 3PPPA 2PVUA 5FHNA 1JW1A 1SW2A 4NEDA 3FJ7A 5FHOA 3MC2A 1NMUA 3OSRA 5JTYA 3MVYA 3G7WA 2I3VA 5I58A 1FCKA 1EZ9A 1OIBA 1CB6A 3OSQA 3FGSA 5I2KB 4IGTA 1B32A 4RY1A 4G77A 4IO7A 1F9BA 3V8XB 4OEUA 3H6TA 3T66A 2F7AA 3K01A 1MY2A 3B6TA 1NNKA 1MS7A 3MP8A 1JQFA 4XXUA 4FE8A 3WAEA 3MJNA 3HPIA 1EH3A 5K2YA 3EN3A 4GXAA 1I6QA 4IO4A 1BLFA 1S50A 5CC2A 2PBWA 5DEXA 3L6HA 3B6WA 1MH3A 4GVOA 2ONKE 3FXQA 4F1VA 3DM0A 5A5XB 1ZMGA 3SERA 3K0VA 3IB2A 1P1QA 4WEPA 2I49A 1DPEA 4O3BA 2DVZA 3KGCA 3O28A 3TQWA 3CIJA 1B3LA 4U21A 5FTIA 2DP8A 2DE2A 3OXNA 1GR2A 3U93A 1I6BA 1TWYA 4YKKA 3PPQA 3O2AA 4NF8A 1B46A 1WDNA 4FATA 3VXBA 3TAJA 4ZE9A 4ZDMA 1NNTA 3C9HA 2RC7A 2V84A 3MW0A 1B2HA 4FAJA 1Y20A 1FQDA 3V89B 5CMMA 3TEPA 3PV0E 1B40A 3FXUA 3M3FA 1A55A 2QMXA 3SETA 1ELJA 4OFJA 4ELOA 3CSGA 1FW0A 5KDTA 3SEWA 3F11A 1B6HA 3TCGA 2DVCA 5H8QA 3T9XB 4QSCA 3Q29A 4OESA 5CM6A 1R1NA 2XX8A 4NE4A 5FHMA 3FUZA 1Q35A 3SESA 5I56A 3CG3A 1L5TA 3SEUA 4F19A 1UIVA 1B1XA 4G68B 3FVKA 4THIA 3N94A 4ZECA 1MXYA 4JXIA 4JB7A 4BDNA 4F2OA 1CE2A 3H3GA 4OYVA 2XXTA 5DVIA 1I6AA 3KN3A 4E0WA 2FYIA 3IL1B 4R6KA 4G2ZA 2FA7A 4OETA 3FXRA 2X26A 4LZ8A 3I5OA 5L9SA 4OEVA 1GV8A 3H06B 3IB0A 1M5CA 1PBPA 2F5XA 3UK4A 3JZJA 5CRYA 3RN8A 1P1WA 4H0WA 2UYFA 3TTMA 3IO6A 2D5WA 5HPQA 1UTHA 3S9LC 1SW4A 1Z7ME 1QVSA 2PT2A 4LP2B 3HO7A 1N7WA 2I3WA 2Q88A 1R6ZA 5TPAB 3K2DA 4PFWA 5AA4A 3UN6A 4KFQA 3TTLA 2HQ0A 2H5YA 4DCYA 3O6GA 3R7XA 2XXWA 4L17A 1MG1A 3KBRA 5TP9B 1GGGA 4KYEA 4NF5A 3KJTA 4F3BA 1Y3QA 1MQDA 4R9FA 1SDXA 4QHQA 2UVIA 1JW5A 4MH5A 4GF8A 1IXGA 1XOCA 1XVYA 1LLSA 3VLWA 4H8IA 4QFOA 1JEUA 1POTA 3Q25A 1PB8A 3K4UA 4JWXA 3EQ1A 1MPDA 1P1UA 4H8JA 4O3CA 4PFTA 1MQHA 1B1HA 4KYSA 2H9BA 3O97A 3OD7A 4GWOA 3EHUA 5ICTA 1N7XA 1DSNA 3PUXE 5F1QA 4YB6A 1LCFA 4Q30B 2O69A 4ZE8A 3C32A 3E9XA 4UACA 3A3UA 1B4HA 1B52A 2GH9A 1EZOA 3UA8A 2XXHA 3MZ9A 3TPAA 4ECFA 4U4SA 1XVXA 2ZNTA 4U1ZA 1H76A 1B3EA 3OO6A 3VE1B 3FVOA 2ZNUA 2HZLA 2ZYNA 2DWJA 2Y7RA 4JSDA 1PB7A 3B7DA 3RUMA 3DP4A 4OMBA 3C34A 2VD2A 3AXFA 3RT6B 1MM7A 2ABHA 3EHTA 3UP9A 1AOVA 3TYHA 4R73A 4G8MA 1BKAA 2UVHA 5ISUA 1D4NA 3Q28A 4OQOA 2PX1A 1IZ1A 4P11A 4ZEDA 4G4PA 4DE8A 1YPNA 4BLAA 3T9VA 1ZLQA 1Q1KA 4IB2A 3UGWA 1FQFA 3MBPA 3ZKLA 3PGFA 3MPLA 3S2VA 3GLBA 3U1OA 1XC1A 4OXVA 3L6GA 4U22A 3S4UA 3KSXA 5DT6A 4YMBA 4C1UA 3PMVA 4PE5B 1MM6A 3OENA 5CBRA 1YAEA 3CR9A 1VSOA 5H8FB 1D9VA 2GHBA 4EXKA 5M2VA 5I57B 4R6HA 2QS1A 3W15C 3BBRA 1SI1A 3MVZA 3MZ1A 4EQ9A 1OVTA 2HZKA 4LQ2A 4ZEIA 4NWCA 1J1NA 4N13A 4R74A 3IB1A 4EXLA 4EQBA 2V3UA 1M5EA 4NF6A 1YTVA 3DP6A 3DP8A 2XX7A 2RF1A 4H1XA 5I84A 4U4XA 1M5DA 5H8HB 4ZS9A 3IR1A 2UXAA 4Z7EA 1S9TA 1BP5A 2A5SA 2HAUA 3VVDA 3K6UA 3PMWA 3SDFA 3U92A 3LBSA 3K00A 4QFPA 5AE4A 1MQIA 3G3KA 4WXJA 4KCCA 3IOVA 2Y7IA 1P1NA 2QS3A 4ND9A 3KOSA 3LSLA 5JEIA 1B05A 1JVYA 3A09A 4YZZA 4MLVA 2F7BA 3LR1A 1N3XA 1LAHE 2OLBA 3VDFA 3CRBA 1SBPA 1UTBB 4OTEA 5JK4A 3IOTA 3M8UA 3FVGA 1N04A 1FTOA 4GOTA 3H4ZA 1H43A 2Q9TA 1AMFA 2F97A 1LAGE 4QSEA 4OFLA 3ILTB 1URSA 1MY3A 2H99A 4LVQA 2QL3A 3TDJA 2OK2A 1B7HA 4KD5A 1URDA 2XXYA 4YAHX 3PD9A 2DS9A 2RC8A 3K6WA 1SI0A 2I4BA 3K1PA 1FQEA 3W9WA 2A5TA 1AL3A 1MY0A 5I2NA 3IORA 3FZVA 4BDQA 2VGQA 1LAXA 3TCHA 1DTZA 1WODA 1DOTA 1FQBA 4XTCQ 3KFMA 1NL5A 3TELA 3RTWB 3QK6A 2QJEA 1YCJA 1QKAA 3RY3A 2Z8DA 4IY5A 1B5HA 3KJ7A 1TFAA 3I6VA 3VLUA 1OMPA 3PPOA 1XHYA 1NNFA 5AA3A 2VD3A 3KOTA 2O68A 1OQHA 2CMOA 2I48A 4ELPA 4Q0CA 4AQ4A 3M3LA 2QPQA 1QW0A 4OFOA 1A99A 4XKRA 1MXVA 4RNSA 4QF9A 5I59B 1QUJA 4QFLA 2XXXA 2XHDA 2ZYKA 1T0KA 4ZZAA 1MH4A 3CI8A 3HHGA 2Y7KA 5K2XA 2ALUA 3ZSFA 1LCTA 2B3BA 4RPOA 1GVCA 2Y7PA 3RQTA 2DXRA 1LGBC 1HSEA 2YPNA 1LB9A 2QS2A 2NWJA 4NF4B 2GRVA 4JWYA 2RINA 1I69A 2AL5A 1MY1A 1BTJA 4WKMA 3MVXA 3TTNA 1P99A 3SKPA 4OERA 4GRKA 3QUFA 1DPPA 5I2KA 1B3FA 1ZKBA 4HW8A 3O9PA 2LAOA 2ZYMA 4HCWA 3IK6B 2BJJX 2VP1A 3MP1A 1IQ7A 3S9MC 1H44A 3KEIA 3R26A 4R72A 5H8SA 3FJGA 1SVXB 2W7YA 3G3GA 3RGYA 2RKMA 5LOMA 3QYTA 4F2QA 2IA4A 4NTLA 1O64A 3K6XA 4LZ7A 5KCJB 2XD3A 4F29A 4K3FA 3QIMA 1SW5A 3B6QA 1B3GA 3MPKA 4QRZA 4E0XA 1MQGA 3GZGA 3HV1A 3W9VA 3FASA 1N3WA 1H45A 3QAXA 4GL0A 3OO7A 4NMYA 4TOZA 3PPNA 3RTFB 5A5XA 3C4MA 3KG2A 3QUJA 4FEDA 1NH8A 4H65A 4KI0E 1IEJA 2RCBA 2VOZA 2QRYA 4DCXA 2UYEA 1ATGA 3BFTA 4ESXA 5BUUA 1IXHA 4XKPA 2RCAA 2F6PA 4F31B 3C35A 2CZLA 3KN7A 4KYDA 4POWA 4EF2A 5CMBA 4ELRA 2E0SA 3MVWA 3CFLA 2NOOA 4QSDA 5H8NB 2O7UA 1MQJA 4I1DA 1O7TA 3KN8A 3PMXA 1LSTA 1MXZA 2XXIA 2G29A 2NUVA 2DXYA 3JV9A 5EHSA 2UVJA 4EQ7A 3RNNA 1A8FA 4IO5A 4AB6A 2DSFA 4P0GA 4RA1A 1RYOA 1LAFE 5B70A 1IUDA 5BWJA 4UA8A 2P2AA 3OO8A 4X1DA 5AA2B 5FTHA 1UIUA 4DXUA 3VVEA 4TLMB 3OO9A 2M8CA 3TZAA 4DZ1A 1B51A 4C0RA 3IOUA 5JTYB 2PMSA 2R9JA 3LC8A 3TTRA 5I58B 1VR5A 1P1OA 3TFLA 2O1LA 4OENA 2X7PA 3O29A 3FATA 4LONB 2ZYOA 3D4CA 1B58A 4TLLB 5L9MA 4G68A 4F3GA 3DLNA 2X7QA 4YKJA 1ZJLA 3TODA 1MPBA 3BFUA 4X48A 4HS7A 5ITPA 1N84A 2I6EA 3FV1A 3E3KA 5CMKA 1IIWA 3ZKKA 5AA2D 3UIFA 5CI5A 2H4IA 2H25A 2UVGA 3PUWE 2XXPA 4ZEBA 3CG1A 2OCUA 5DEXB 1FQCA 3TQLA 4IGRA 5DVJA 4YMAA 5HBCA 5CMCA 4JSOA 2RC9A 3EF7A 4R75A 1PBQA 3DELB 4ONYA 1II5A 1B0LA 4R9GA 3G3IA 4U23A 2REGA 4YB5A 3H7MA 4GD5A 3T22A 1QULA 4F22A 4KQPA 3P7IA 1IXIA 1USYH 5HM4B 2PYYA 4JWOA 4YKIA 4OWDA 2HAVA 4EDPA 1SQYA 5TPAA 1TFDA 4F39A 3K02A 3PUZE 1SYIA 1PDAA 4N07A 2V25A 5CBSA 3A3CA 2ONRA 4IY6A 1B0HA 2PT1A 1QUKA 1O63A 4NF8B 4RPNA 4I8CA 3G3FA 2O7IA 3IJXB 1IXCA 2XX9A 1B7ZA 1EZPA 2HFBA 2YJPA 2AL4A 1A7LA 3MWBA 1SYHA 2Z8FA 2F78A 1URGA 3MQ9A 4LZ5A 3VV5A 2B3FA 3CFZA 2F36A 4R2BA 2Q89A 4OZ9A 3TUSA 3TMGA 2DWAA 4LQ5A 3MAMA 3R6UA 4I62A 3S9NC 3CVGA 1B4ZA 2QSXA 2XXVA 4MLQA 2Q2AA 4POXA 1LFIA 5KDTB 3MZBA 2OWTA 1FTLA 4BDRA 5J1DA 2ANJA 4HCYA 5H8QB 2E1SA 2I4CA 4LATA 2ESNA 3O6IA 1PEBA 3HHFA 4RK9A 1D3KA 3ODBA 3VVFA 1AH5A 1B5IA 2O51A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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