2I0CA

Crystal structure of the glur6 ligand binding core dimer crosslinked by disulfide bonds between y490c and l752c at 2.25 angstroms resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
NRSLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITCVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKITIAICQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCPS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Conformational restriction blocks glutamate receptor desensitization.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 2
total genus 83
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i0cA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i0cA02
4ZEKA 4JSOA 2QMWA 4JBZA 4HTGA 3ILTB 1TT1A 1II5A 1MXWA 1MG1A 1F9BA 3LR1A 3KJ7A 2Q8JA 3QXMA 2HCAA 2UVGA 5ICQA 3FGSA 3GBBA 4G8MA 1H3DA 5FHOA 5ISUA 4OESA 2Z8FA 1URGA 3GZGA 4O3CA 1FQFA 4R6KA 3THIA 3CSGA 3FXUA 2ONKE 5TU0A 3SDFA 4XTCQ 4TLLB 1Q35A 4F39A 4AB6A 2D3IA 2OLBA 3OOAA 1LLSA 4RXLA 3TDJA 2H99A 2V25A 1QJMA 3RTFB 4EQBA 3G3HA 4XIGQ 3RGYA 4AQ4A 4OVJA 1XVYA 4EQ9A 3OSRA 1MXXA 4NMYA 4XXUA 2YJPA 2Q9TA 3FD3A 2DVZA 3O28A 5JK4A 2HEUA 3MZBA 3TTLA 3KN8A 3VXCA 1I6AA 1XOCA 3LSFB 4BDLA 3EN3A 4IB2A 4KYSA 2F78A 2B65A 4ECFA 2XXXA 3D4CA 2VD3A 5L9MA 3FUZA 3JV9A 2Y84A 4YU0A 4M1VA 1JVYA 3P7IA 2V3UA 1A99A 4DCYA 4MLVA 3PD9A 5CBRA 2DWJA 1UIVA 2HXWA 2X26A 3PMVA 5JEIA 1LFGA 4G68A 2X7PA 3IORA 4PP0A 4LP2B 4RPNA 1IITA 2ZYKA 4OYVA 1OVBA 1IEJA 4RA1A 3R26A 4GWOA 1SVXB 2I3WA 2Y7KA 3SEVA 3CSBA 3HN0A 4KQPA 3K6VA 3K0VA 1UQWA 3O66A 1AH5A 4ZE9A 3TPAA 3Q25A 3RLFE 3M3FA 4F18A 3C31A 3K1PA 2VOZA 3L6GA 1URDA 2AIXA 3S9LC 2UVJA 4KHZE 3T66A 3S9MC 1JEUA 3IOTA 2P2AA 3MP6A 2OBGA 4RJZA 1S9TA 3KN3A 1GVCA 2OCUA 1Y3QA 2XX8A 1SW5A 2Z22A 1HSLA 1B2HA 2VHAA 5KCJB 3VLVA 2ZYOA 3KN7A 3N5LA 1EZOA 4QFLA 4E0XA 5AE4A 3UK4A 2OK2A 2KLFA 4MFIA 4ONYA 4ZEBA 2O69A 4DXBA 2ZXTA 3IJXB 1MDQA 4HS7A 1MY4A 2HAVA 1B9JA 4ZEFA 3C34A 3LUYA 4GIZA 3O97A 4ESXA 5H8FB 4LA9A 2DXRA 1VSOA 4OXVA 4H67A 3E4RA 1M5FA 4UA8A 1B51A 1LGBC 1B46A 1BKAA 1B32A 5I84A 1B1HA 3HHGA 4OFOA 1FQDA 1FTKA 3OO9A 2G29A 3RT6B 3TFLA 3TUSA 3KGCA 1M5DA 3TEPA 4KCCA 3SESA 3S9NC 3EHTA 5AA2A 3FJMA 2DS9A 2O84X 4F19A 1H44A 1BLFA 2VP1A 1QW0A 3IAZA 4WEDA 1LFHA 3U93A 2V93A 1SQYA 5L9OA 1OLCA 3U94A 3N26A 3QSLA 1A7LA 1UTHA 3E9XA 5B7DA 2E1SA 4YKPA 3TELA 2F6GA 4EXLA 3OSQA 3D4GA 1N3WA 4PFUA 2Z8EA 1DPPA 1SBPA 2XXIA 4M4GA 3M3LA 5AA3A 4GLIA 2UXAA 4LZ8A 2UYFA 1NNPA 1MH3A 3MZ9A 4JWYA 4OMBA 3MPLA 2XXHA 3FVGA 1B7ZA 5I56A 1OIBA 3UGWA 4FEDA 4IY5A 1YPNA 3E3KA 3V8XB 1POY1 4Z7EA 4OERA 3KSJA 4BDNA 1DSNA 3U92A 4QSDA 1RYXA 4PQJA 3U8QA 1JW4A 3K2DA 2HFBA 3O6GA 4Q8RA 3USDA 3DP4A 4R6YA 3BFUA 4IO4A 1URSA 1FTJA 3A3CA 3CG1A 3PPRA 1MPDA 2A5TB 3BFTA 2B3BA 4E0WA 3S9EA 3C4MA 2F97A 1MH4A 4ELPA 4NTLA 1XHYA 3SEXA 1SD3A 1EH3A 4PFWA 5H8NB 1ZJLA 3CFZA 1DTZA 3IOVA 5L9SA 3KJTA 4G2ZA 4FAJA 3IOWA 5HM4B 1FQCA 3VLUA 3ODBA 1PBQA 5ICTA 1NL5A 1NNFA 1MPCA 2P1SA 5KZTA 2V3TA 5I58B 3PGFA 3LSXA 4ZZAA 1IIWA 3CIJA 1MQDA 1FTMA 4G4PA 4TQUQ 4DDDA 5DVJA 1A40A 1UTBB 4YB5A 3RPWA 2E0SA 1P1NA 4KCDA 1H43A 3HCQA 5DEXB 3TAJA 2F36A 2GHAA 2ALUA 3TTMA 3TYHA 4N07A 2F6PA 3GBAA 2XXYA 4GL0A 1JW5A 3S4UA 3K1MA 2PVUA 2GHBA 3CFLA 2LAOA 4TLMB 4POXA 4P0GA 4OEVA 2ZYNA 1IQ7A 1MM7A 4H5FA 3WAFA 1MY3A 5AA1A 1YAEA 3M8UA 3K01A 1SI0A 4GFRA 1A54A 1JQFA 3H6TA 3MJNA 1ATGA 3SERA 5B70A 3DP6A 4U4SA 1TXFA 1VFEA 2DQVA 2I4CA 3KOTA 4PFYA 1MY2A 3T9XB 5AA2D 1AL3A 3K02A 3ZKKA 3PPQA 5DTBA 4GQOA 4MH5A 1AOVA 3V83A 1ZU0A 3H6UA 4IO2A 3G3JA 2Z23A 1DOTA 2OWTA 3N94A 4C1TA 2DWAA 2F7AA 1B40A 3V89B 3MP8A 2ESNA 5I2KB 5EHMA 1FTOA 4RNSA 3IL1B 1NNTA 4OFJA 1Y1MA 3MC2A 2DYXA 2O51A 1EU8A 1KWHA 1NFTA 3TTRA 2HZKA 5ITOA 4I1DA 1QUJA 4DXUA 3VVDA 4K3FA 5KCJA 2VD2A 4G8NA 3AXFA 3OEMA 1J1NA 1S7YA 5JTYA 3MUQA 1M5BA 4P11A 1Q1KA 1XVXA 1PB8A 3B6TA 5H8SA 3VV5A 4F1UA 5DVFA 1D4NA 1Y9UA 4PETA 2O7UA 2XD2A 5K2YA 3RQTA 3FXQA 4LZ5A 4ZECA 3H03A 1S50A 4U1OA 5FTHA 2PX1A 2R71A 3EHSA 2CZLA 4EQ7A 4TOZA 1LCTA 3ZSFA 4JXIA 1CE2A 3G3GA 4OFLA 3OENA 4ELRA 3CRBA 4PFTA 2RC8A 4KR5A 5H8FA 5CMMA 4NWDA 1QULA 4L17A 2DE3A 4NF5A 3K6XA 3PPOA 3T9VA 4UACA 1Y4CA 4FIMA 1MPBA 3UP9A 4GD5A 3FIRA 3PUXE 1Y20A 4YKKA 3SETA 2I0CA 2QS4A 4P0IA 3G3IA 4HCYA 4XKNA 5KDTB 1JVXA 1LB8A 1PC3A 2ANJA 3KBRA 1AMFA 3C36A 5FHNA 4YZZA 3O6HA 2GH9A 1ANFA 1T0KA 5H8QB 4IGTA 1B3LA 4FE8A 2ABHA 2RF1A 2UVHA 1N7XA 2XXTA 1MY0A 3KFMA 4NF6B 4ZZEA 3IB2A 4BLAA 3I6VA 1B3HA 1VE4A 1SYHA 1CB6A 1YTVA 3OO8A 3CR9A 5HPQA 5JTYB 3ONMA 5FTIA 4DXCA 3QUJA 1OQHA 3UN6A 5BUUA 5CC2A 4OETA 3IK6B 2DWHA 1BIYA 2A5SA 2XX7A 4JSDA 3UA8A 4OEUA 1DPEA 2DSFA 2DP8A 4F2QA 3T22A 5M2VA 3Q28A 2PBWA 3FVNA 4R74A 3ILUB 2HZLA 2QMXA 1WDNA 4GVOA 2REJA 4IO7A 4HCWA 2A5TA 4LONB 4F3GA 4ZEIA 3JZJA 4H65A 2BJJX 1HSEA 1JNFA 2X7QA 2OJTA 4O3BA 2RINA 2XXPA 4NF5B 4BDOA 5H8NA 3OEKA 3KOSA 1FCKA 1EZ9A 3IJOB 1B4ZA 3O6IA 2D5WA 4U1ZA 1Z7ME 2PT1A 1ZLQA 2I3VA 3K00A 2OWSA 1ZIUA 2Y7RA 3QIMA 1MXZA 3H4ZA 1B5IA 1B3GA 3ECRA 4GOTA 1Y4TA 5I58A 1TWYA 2HQ0A 4NF4B 4ND9A 3R6UA 1A55A 2XXWA 1Y3NA 4QFOA 1SW2A 1IZ1A 5I59B 5TP9B 1R9QA 3LSWA 3TTNA 1PDAA 3GXAA 4R75A 4LVQA 1B0HA 3RT8A 1UIUA 3HHFA 3PPNA 1DMBA 1UTBA 2XD3A 4NE4A 4ESWA 5K2XA 1GR2A 5DEXA 3EQ1A 4RK2A 2I48A 1PB7A 5CMKA 3KG2A 1HSJA 5EYFA 2P0SA 4G8HA 4JDFA 3GLBA 3FVKA 1N3XA 1ZTYA 1US5A 4U23A 4ISUA 2H98A 4GRKA 3PD8A 1B6HA 1TFDA 1MXVA 3OD7A 2QPQA 4H1XA 4R2FA 5A5XB 1MQIA 3C9HA 3BKIB 1MQHA 3DP8A 4MLQA 1LAFE 1QVSA 2RC9A 2O68A 3PUZE 1B3FA 2H5YA 3LC8A 2IEEA 5IAIA 1NH7A 1H76A 1USYE 1O64A 2F34A 3TTKA 3VVEA 2PMSA 3PUVE 3TZAA 3JYRA 2FNCA 4DE8A 3W9WA 3C33A 2V84A 4QFKA 3DM0A 1MQGA 4NWCA 3H6WA 1XT8A 5HBCA 2YPNA 3FATA 2Y7WA 3E13X 3PMXA 3IOUA 4IGRA 2QRYA 3U1OA 5I2KA 1MM6A 2V3QA 1MS7A 3I3VA 4R72A 4FORA 3FXRA 4YB7A 2AL5A 3CI8A 3T9UA 4C0RA 3OMBA 1QKAA 2DE4A 3W15C 1NNKA 1USYH 3MZ1A 1ELJA 5TPAB 2R6GE 1B7HA 3N6TA 1LBCA 4U4XA 1AIVA 4ZS9A 3L6HA 2XHDA 1FQEA 5DYHA 3N6UA 4QHQA 1WODA 3RUMA 2VGQA 3H3GA 3SEWA 4QFNA 4YMAA 3MW0A 1JETA 1D9VA 3H06B 2B3FA 3DLNA 2QS2A 3T93B 4MBPA 4BDRA 3UORA 4X9TA 4OQOA 5CI5A 1I69A 4I9DA 1ZBMA 1N04A 1YCJA 3ZKLA 1LAGE 1D9YA 1N7WA 1Y3PA 1B7UA 4O3AA 2PT2A 3WAEA 2H25A 1B52A 2XX9A 3UIFA 4OWDA 1ZMGA 2F7CA 5H8HB 4WXJA 1JW1A 3VE1B 3MWBA 1BTJA 1MY1A 4XKPA 3CFXA 4WKMA 2I6EA 4I8CA 3RY3A 5DT6A 1LFIA 2H9BA 2YLNA 4POWA 5KDTA 3G3FA 2Y7PA 2NWJA 5FHMA 4HW8A 3CG3A 1O7TA 1N84A 3SEYA 4X48A 5CBSA 4G77A 3PU5A 2O1MA 5H8QA 4Q5TA 2D21A 2FA7A 3MVXA 1MXUA 2AL4A 3K6WA 4QF9A 4X1BA 4YB6A 2H4IA 4NF6A 2XXQA 4KYEA 4LZ7A 1VR5A 4QSEA 4GXAA 1L5TA 1I6QA 3PPPA 3KSXA 4ELQA 1SI1A 2OZZA 4JWXA 1MDP1 4YICA 4R73A 4FEBA 2R9JA 3QUFA 3OELA 2I4BA 3LSLA 4ZEDA 2ZNSA 2ZMBA 2O1LA 1O63A 4EF2A 3K4UA 5L8DA 4N13A 4Q0CA 4NF8B 4X1DA 3T9HB 3RN8A 5I2NB 4H5GA 4LATA 3ZS6A 3B7DA 1VFDA 2W7YA 1ZKBA 4R6HA 1I6BA 1FTLA 4RYAA 4LUBA 1GGGA 2NOOA 3M3KA 4OTEA 3MAMA 1GV8A 1QKBA 3HSTA 3TCFA 1N0TA 1SW1A 1P1WA 2Z8DA 5CMCA 2XXVA 5I57B 1R1NA 2O7IA 2ZNTA 4THIA 4FATA 4YMBA 4ZDMA 3FJGA 3OXNA 2RC7A 2NXOA 3TODA 3PUWE 5EHSA 1PB9A 2QS1A 2XXRA 2ZYMA 1QUKA 4ZE8A 4F1VA 1MXYA 1B1XA 1R6ZA 4NEDA 1IXGA 3FV2A 5F7VA 3W9VA 4YAHX 4IO6A 1OLAA 2ONRA 1IUDA 4U2RA 3QAXA 4Z0IA 4KI0E 1US4A 5J1DA 3C32A 1XC1A 2CMOA 4NF4A 3PV0E 4IO3A 4U21A 3QYTA 4EUOA 3G3KA 4QSCA 5I59A 4LQ2A 5TP9A 5IKBA 1FQBA 5AA4A 2NVUB 2DVCA 1NMUA 2HAUA 4IY6A 3A09A 1WVJA 2UVIA 3MQ9A 3FV1A 3TKDA 3VDFA 3U72A 1MRPA 3HV1A 1P1QA 1P99A 2DXYA 5F1QA 3O9PA 1P1UA 2ONSA 4RPOA 4KPTA 1B5JA 3K1NA 2PYYA 3I5OA 5A5XA 1DTGA 4KD5A 2RCBA 1EZPA 3LBSA 1M5EA 4FJPA 2I49A 4DCXA 2F7BA 1POTA 4XKRA 3TCHA 2I58A 1B5HA 2F5XA 3Q29A 3K6UA 3T96B 4RY1A 1B58A 5CRYA 3QK6A 1OQGA 4BDQA 5ELVA 1IXIA 2Y7IA 2REGA 4ELOA 4R9GA 1B05A 1M5CA 1PEBA 2ZNUA 2QL3A 3SKPA 3SEUA 4F1YA 4QFPA 3RNNA 5TPAA 3MVWA 3PUYE 2IA4A 3IO6A 4EDPA 3IB0A 3VVFA 4G68B 2RKMA 3VFJA 3RTWB 1LAXA 4U22A 5BWJA 3C35A 1FQAA 2DOJA 1B3EA 1OVTA 5AA4B 4LQ5A 4Q30B 1B0LA 2M8CA 1TFAA 3B6QA 4F3PA 3IB1A 3DELB 4WEPA 1Y1ZA 3G7WA 4H8JA 4RK9A 2QS3A 1PBPA 1Z7NE 4KYDA 1B4HA 4C1UA 2Q2CA 4OHNA 1LSTA 4DZ1A 4R9FA 3TCGA 1FW0A 3VXBA 4JWOA 2RCAA 3MPKA 1N76A 3HO7A 4F3BA 3H6VA 5H8HA 4R2BA 1LAHE 2F8DA 3MVYA 1H45A 4PE5B 2FYIA 5ITPA 3F11A 4H0WA 3TQLA 1IXCA 1GTKA 4OENA 4H6DA 2GRVA 2F35A 2DE2A 4EF1A 5CM6A 2UYEA 2NUVA 1A8EA 2QJEA 3V5AA 1LCFA 2XXUA 3H7MA 4GL8A 4G68C 3B6WA 3FJ7A 4QRZA 4N6PA 3MVZA 2Q2AA 1MQJA 3O29A 3A3UA 4YKIA 2Q88A 3IR1A 4F3SA 1LBBA 3S2VA 2Q89A 1RYOA 3Q27A 4I62A 1NH8A 1R9LA 2DWIA 3FZVA 4DIGA 3FVOA 1BP5A 3FASA 2O6AA 4H8IA 3TMGA 4EXKA 3MBPA 4YKJA 1JEVA 1A8FA 4NF8A 2AYSA 3KZGA 5I2NA 3R7XA 3OO6A 1IXHA 2THIA 3IO4A 3Q26A 5DVIA 4MF3A 5CMBA 4GF8A 5AA2B 1P1OA 3HPIA 4GXSB 2I0BA 1NKXA 1RKMA 3O2AA 3PMWA 5LOMA 4DLDA 2GFEA 4FECA 3EPEA 5I57A 1LB9A 1D3KA 4JB7A 3VLWA 1UTHB 3EHUA 3BBRA 3IX1A 4OZ9A 4XKQA 4F31B 3EF7A 4BDMA 3KEIA 1SDXA 1XS5A 2WKYA 3OO7A 2G93A 3MP1A 1SYIA 1OMPA 1QUIA 4F29A 4F2OA 4IO5A 2QSXA 3TQWA 4AB5A 5I56B 4F22A 4KFQA 1SW4A 3CVGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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