2I0CA

Crystal structure of the glur6 ligand binding core dimer crosslinked by disulfide bonds between y490c and l752c at 2.25 angstroms resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
NRSLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITCVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKITIAICQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCPS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Conformational restriction blocks glutamate receptor desensitization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i0cA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i0cA02
3I6VA 2VD2A 1OQGA 5TP9A 5F1QA 3KOSA 4IO5A 1IITA 2X26A 4E0XA 3A3UA 4F39A 3QIMA 4OFOA 4U23A 2QRYA 3P7IA 5I58A 4JBZA 4U1OA 1JW4A 3QSLA 5CMKA 3CSBA 1AH5A 3H6WA 4P0GA 4NWDA 1QUKA 4MLVA 1NNTA 2RCBA 3Q28A 4ZDMA 5I57B 3MP6A 1SVXB 3CFXA 2I6EA 3OENA 4BDRA 1MDQA 1MQDA 1SW4A 3GLBA 1B40A 1QULA 3FZVA 2DXYA 3VLVA 1LGBC 1QJMA 3C36A 4ZEIA 4HTGA 3TFLA 1FTKA 3ZKKA 3C4MA 4X1BA 4KCDA 4XXUA 4H65A 5KCJA 3R7XA 3RN8A 4NE4A 2F97A 3H4ZA 4LATA 1LFIA 2R9JA 4N07A 3MZ9A 4FAJA 2DS9A 2F35A 1GTKA 4H1XA 4GWOA 4G8MA 2QS1A 3RUMA 4OWDA 3FVNA 3WAEA 1MXWA 4OFJA 1AMFA 3PMWA 2HQ0A 5I2KA 3QUJA 1B32A 5I2NB 4ZZEA 1R6ZA 4QHQA 1M5DA 3QAXA 4QSCA 1VSOA 4XIGQ 3ZKLA 4THIA 3SEXA 3ONMA 1TFDA 1WDNA 1YPNA 4Q8RA 1R9LA 2FA7A 3N94A 2Y7WA 3SETA 1FQAA 4Q5TA 4YB5A 2ESNA 3B6WA 2RINA 2XXHA 4ELPA 2OZZA 1B9JA 1QKAA 1ZKBA 3TYHA 3VDFA 3E13X 4XKNA 1MQJA 4KCCA 1UTHB 3PUZE 2WKYA 1FQCA 2M8CA 3TODA 3FV1A 2H99A 4IGTA 4KD5A 3HN0A 5DTBA 1CB6A 2E0SA 4R6YA 3FV2A 4NF4B 2D3IA 4PFTA 2AL4A 1I6QA 1L5TA 4OESA 3UN6A 2UVGA 2DWAA 1B4HA 5AA2B 3OEMA 4LP2B 4H8IA 3T22A 4JWYA 2F7CA 3B6QA 1LCTA 2O51A 4ESXA 3N5LA 4EF2A 2ZYNA 1US5A 3EQ1A 2I58A 1ZBMA 1QUJA 4HW8A 5JTYB 5I59B 4GXAA 2OWTA 1A40A 4R72A 3OO9A 1Y3PA 2QJEA 3Q29A 3CR9A 2XD2A 1SD3A 4Q0CA 4OYVA 1P1WA 5H8FB 4H67A 4UA8A 4EQ9A 5AA4B 5I84A 3U1OA 5L9MA 3A3CA 1FQFA 4EDPA 3W15C 4DE8A 2ONKE 4IY6A 1EZ9A 5EHMA 2IA4A 3SDFA 4Z7EA 4QFLA 3GZGA 5KDTB 3MC2A 3OOAA 2UVJA 4IY5A 3FJMA 4H0WA 1IEJA 2ZNUA 2UYEA 1P1OA 4I1DA 3PPNA 4PFWA 1GVCA 1Z7NE 1H76A 4OFLA 5F7VA 1B58A 5IAIA 1A7LA 3OO6A 4YKPA 4YKKA 2XX8A 3PUVE 5CMMA 2B3FA 1MXVA 1MY4A 3N6UA 3OO7A 1TWYA 2O7UA 4YMAA 3V89B 2PBWA 5FTHA 1MXXA 4L17A 3MUQA 3CG3A 4YICA 3T9HB 2ALUA 1B05A 2Y7RA 5B70A 1I6AA 1JQFA 2DWHA 4NF6B 2OCUA 3VLWA 4OETA 1MPCA 4ONYA 3VE1B 4LZ5A 4FE8A 1MH4A 3MZ1A 3FVKA 1NNKA 2O6AA 2I3VA 4FEBA 5L9SA 2VD3A 4N6PA 3OO8A 4NEDA 1HSJA 4XKPA 2XX7A 3B6TA 2F8DA 2I48A 5FTIA 3IX1A 3SERA 4OZ9A 1NL5A 1USYE 1A8EA 4RK9A 2PX1A 4LQ2A 1LB8A 4DZ1A 3TEPA 3IL1B 2V93A 5K2XA 3EF7A 3CFLA 1Y1ZA 1XVXA 1B46A 1POTA 2YJPA 4R6KA 1B0HA 2UYFA 5I2NA 4QSDA 4KFQA 1N3XA 3VV5A 2Y84A 5H8NA 1UQWA 1SYIA 1D9YA 2QS3A 3LR1A 3H6VA 1D4NA 1ZLQA 1VFEA 4C0RA 3KGCA 3H6TA 1DSNA 4BDOA 3H3GA 1GGGA 2FNCA 3OD7A 4ZEBA 4O3AA 4AQ4A 1P1QA 1AIVA 1Q1KA 2O69A 2YLNA 1XS5A 2DYXA 3S9LC 1UIVA 3D4GA 1N84A 2ZNTA 1I6BA 3DLNA 4K3FA 2IEEA 1B6HA 2XD3A 3T9UA 1M5CA 3CI8A 4ZEDA 1FQDA 2DXRA 4FIMA 4YZZA 1A8FA 3HPIA 5AE4A 4MF3A 1B51A 4EXLA 2V3TA 1Z7ME 2Z8FA 3TMGA 2V3QA 3IAZA 2HAVA 5ELVA 4FORA 5DVJA 1NH7A 2ZYMA 2Q9TA 2F78A 1A99A 1KWHA 1B3HA 3PPQA 1DPEA 3TZAA 4YB7A 1A54A 3IOUA 5AA2A 5LOMA 3UIFA 4GQOA 3SEUA 1USYH 2Y7KA 1FTOA 1B3FA 3RTWB 1YTVA 2Z23A 4F22A 2VOZA 5JK4A 4POWA 4AB6A 3SESA 1A55A 4KHZE 4R75A 2Z22A 3KZGA 1N7XA 1JETA 1Y1MA 3N6TA 2HEUA 1SBPA 5ICTA 3U8QA 4OHNA 3IB0A 5H8FA 1B5HA 2XXXA 4NF5B 5AA4A 3EHSA 4LA9A 4LQ5A 2REJA 3O6HA 3G3GA 2H4IA 2RF1A 2ZYOA 1S50A 3FGSA 4WEDA 5K2YA 4R6HA 4RNSA 4LZ7A 4NTLA 4NF8A 3ZSFA 1B7UA 4BDLA 3O6IA 2Y7IA 2AIXA 3QUFA 3SEVA 3KSJA 4POXA 4F19A 4OMBA 1FTLA 3KOTA 3GBBA 4IB2A 2LAOA 4LVQA 4X48A 3PPOA 5M2VA 1NNFA 4RYAA 2I4CA 2I4BA 3VVDA 5CI5A 3TTRA 4PQJA 2V84A 3PD9A 4NWCA 3RPWA 1B2HA 3U93A 1UTBA 5EHSA 3OMBA 2ONSA 4YAHX 4JWOA 4XKQA 1UIUA 2X7QA 1S7YA 1CE2A 4X9TA 4TQUQ 3U72A 5DEXB 3TTMA 2UVIA 4ZZAA 1YCJA 3MP8A 1MXYA 1IQ7A 1RYOA 3DP4A 3TCFA 5L9OA 4O3BA 3FJGA 2P2AA 3H03A 4I8CA 1OVTA 2Z8EA 3N26A 3I5OA 3TTLA 2UXAA 1MM7A 2O7IA 3RY3A 2F6PA 4PE5B 2A5TA 2RCAA 3I3VA 2GH9A 4R2BA 2XX9A 4OEUA 4RA1A 4BDQA 5CBRA 3GBAA 2REGA 1DPPA 3S4UA 3R6UA 5HM4B 3KSXA 3K6UA 1FQBA 4HS7A 1B3EA 4JDFA 1MY0A 3VFJA 1BIYA 5I56B 1BLFA 1EZPA 3C35A 3Q26A 4G68B 3KJTA 1JW5A 2XXQA 5A5XA 3MVWA 4BDNA 3FXQA 2ANJA 4U1ZA 3PD8A 3JZJA 4DCYA 3FASA 4DDDA 3V83A 3IORA 3FVOA 3EHTA 2HZLA 4H8JA 2D5WA 2H9BA 4U4SA 3S2VA 5TPAB 4NMYA 4YB6A 1GV8A 1B5JA 3IO6A 3ODBA 1DTGA 3DP8A 4IO6A 5DYHA 2ZYKA 1LFHA 5L8DA 2Y7PA 4PFUA 1LCFA 4RPNA 2OJTA 1T0KA 3HO7A 2X7PA 3SKPA 1ELJA 4IO2A 3U94A 3LSWA 3T93B 4GF8A 1HSEA 1B7HA 3MJNA 2DVCA 4GIZA 3BKIB 1B3GA 4ZEFA 3T9XB 3L6GA 4QFNA 3MPKA 5H8HB 4EQBA 3HV1A 2V3UA 1AL3A 1MS7A 4C1UA 5ICQA 1IZ1A 3LSLA 1URSA 4GOTA 5TP9B 2XXWA 2W7YA 4ECFA 3UP9A 2I0BA 1B1XA 4QFKA 4G8HA 1VFDA 3T9VA 3ECRA 4WXJA 3RT6B 1IUDA 1SW5A 1RKMA 3PV0E 5I58B 1MY1A 1MRPA 2P0SA 1LAHE 1QVSA 4U21A 3KBRA 2ZXTA 4KYDA 5J1DA 4QF9A 5CMCA 4I9DA 3JYRA 2PMSA 4E0WA 2O1MA 2VGQA 5I57A 1II5A 3OSRA 3CG1A 3UGWA 5BWJA 2E1SA 3SEYA 4TLLB 2NUVA 5AA2D 4TLMB 1LAFE 1DOTA 1BP5A 4FECA 2QS4A 3OELA 1LFGA 3KFMA 3PMXA 3TELA 3G3FA 4F3BA 4F3SA 3E4RA 4F31B 4R2FA 4R9FA 3QYTA 2AYSA 1XC1A 3IJXB 3USDA 3MVXA 4U22A 3RT8A 3THIA 3IOTA 1MXZA 4XKRA 3KN7A 3T96B 2NVUB 2R6GE 2B3BA 1M5BA 1JNFA 4DLDA 2ONRA 4RXLA 5I2KB 4RK2A 4OEVA 3M3KA 1FW0A 2R71A 3W9VA 1BTJA 5TU0A 1OLAA 1N3WA 5CBSA 1EZOA 1YAEA 1RYXA 2AL5A 3HCQA 1B5IA 3C31A 1IIWA 2Q89A 3MW0A 4IGRA 1UTHA 2THIA 3UK4A 1OLCA 1GR2A 1XOCA 3K00A 1NFTA 3LC8A 3MBPA 1JEVA 2CZLA 1TT1A 4H6DA 4QRZA 4G68A 1LBCA 3IJOB 2I49A 4NF4A 3FUZA 1NH8A 1FCKA 1Y3QA 5ITOA 3C33A 1SI0A 4F2OA 4JWXA 4QFPA 1SW2A 3V5AA 1JEUA 4DXUA 4LZ8A 3TDJA 3G3IA 3OSQA 4F1YA 3HHFA 3KN3A 2PT1A 4KQPA 4YMBA 3WAFA 4LUBA 4PETA 4Z0IA 3O9PA 1PB7A 4ZEKA 4ZE8A 3V8XB 1MDP1 3K6VA 1JVXA 5EYFA 3L6HA 5JTYA 3S9NC 4DXCA 4GVOA 5I59A 4WKMA 2QPQA 3IOWA 2HCAA 3D4CA 4KI0E 3LSXA 3EPEA 2DQVA 3G3HA 5H8HA 3MQ9A 2H25A 4GXSB 1LAGE 2ZMBA 2KLFA 4DIGA 2G29A 4FEDA 5BUUA 4KR5A 5KDTA 4QSEA 2OWSA 3H06B 2PVUA 3T66A 3FD3A 1MPDA 2CMOA 3A09A 1ZMGA 5JEIA 4HCYA 2Q2CA 3R26A 4OENA 4ZS9A 3KN8A 4DCXA 1WVJA 1SW1A 4OVJA 4MFIA 3RNNA 2QS2A 1MPBA 1XVYA 2V25A 1POY1 1JW1A 1MM6A 2DE4A 4ISUA 1M5EA 2HZKA 3TUSA 1O64A 2F6GA 2Z8DA 2XXTA 3MP1A 1LBBA 2O68A 3C34A 1S9TA 4OXVA 4GD5A 3PUYE 3RTFB 1B7ZA 3SEWA 4GL8A 4U2RA 1Y3NA 4NF6A 1MH3A 2O1LA 4FJPA 5AA1A 1OMPA 3B7DA 3PMVA 3JV9A 5KZTA 3HSTA 1PDAA 3K6WA 3TCHA 4LONB 3MAMA 3H7MA 1DMBA 4H5FA 1PBQA 4IO3A 1LAXA 4ZECA 3DELB 2VHAA 1D3KA 1PB8A 2Q88A 2NXOA 5CMBA 1EH3A 2DP8A 2Q8JA 3OEKA 2F7BA 3K6XA 4F18A 3PPPA 2F34A 1J1NA 4JB7A 1N7WA 3IB2A 4GLIA 3VXBA 1F9BA 2D21A 1P99A 4F2QA 2OLBA 3U92A 5CRYA 3K4UA 3K01A 3IO4A 4EUOA 1D9VA 3PGFA 5H8NB 1ANFA 5DVIA 4ELQA 2QL3A 4KYEA 4EXKA 1B0LA 3S9EA 3BFTA 1IXIA 2XHDA 3IR1A 3M8UA 3O2AA 3CIJA 4GL0A 2DVZA 2YPNA 1TFAA 4WEPA 1MY3A 1Y9UA 1EU8A 3O29A 2QMWA 2F7AA 4FATA 4OERA 3E3KA 1QUIA 5CC2A 2XXRA 1MY2A 1QKBA 3VXCA 2RC8A 3EHUA 4UACA 5IKBA 1URGA 3K1PA 1B3LA 1SQYA 5DT6A 5FHOA 3Q27A 2Q2AA 2B65A 3CVGA 5H8SA 4RJZA 2DE3A 2GHBA 2I0CA 1LB9A 3O66A 4R74A 1ZTYA 3OXNA 3K02A 3K1MA 2I3WA 2H98A 4R9GA 3FJ7A 1ATGA 4F3PA 4G4PA 4GFRA 3PPRA 1FTMA 2NOOA 4RY1A 5H8QB 3F11A 1VR5A 1B1HA 4G8NA 3K1NA 4C1TA 4F3GA 1SI1A 1MXUA 3TAJA 1TXFA 3E9XA 3MVYA 5ITPA 1H45A 1AOVA 3S9MC 1WODA 4MBPA 4YU0A 5DVFA 3IK6B 3IOVA 3BBRA 3PUXE 3ZS6A 3O6GA 3G7WA 4ESWA 4OTEA 3GXAA 4NF5A 2O84X 5HPQA 1OIBA 3KEIA 3MVZA 2PT2A 4EQ7A 3H6UA 3KJ7A 4NF8B 4EF1A 4ZE9A 2GRVA 3PUWE 4Q30B 3Q25A 2DWIA 4DXBA 4H5GA 1HSLA 1LSTA 1MG1A 5AA3A 1MQIA 3CRBA 1R9QA 1ZU0A 1XT8A 3O97A 1BKAA 1B52A 3UORA 1H3DA 3ILUB 5CM6A 1ZJLA 4R73A 2OBGA 3TTNA 4F1VA 1URDA 4ND9A 4MH5A 4QFOA 2XXPA 1IXCA 1VE4A 2XXVA 2QSXA 1NMUA 5HBCA 3VLUA 2A5SA 2UVHA 1UTBB 3C9HA 1IXGA 3MWBA 1B4ZA 2HAUA 4KYSA 2DOJA 3W9WA 5KCJB 3AXFA 1N0TA 3LUYA 4PP0A 2HFBA 3BFUA 4M1VA 1H44A 2QMXA 1OVBA 5DEXA 4GRKA 3O28A 2ABHA 2NWJA 1JVYA 4IO4A 4O3CA 4ELRA 4F29A 1FQEA 4YKJA 1N04A 4JSOA 1OQHA 3TKDA 2RC9A 1SDXA 3TPAA 2RKMA 4XTCQ 3CSGA 1MQGA 4RPOA 4ELOA 3ILTB 2A5TB 1N76A 3C32A 4BDMA 3G3JA 1Y4CA 3FIRA 4N13A 1PBPA 2BJJX 2RC7A 4G2ZA 4X1DA 4P11A 3LSFB 4I62A 4JXIA 1O63A 2G93A 2GHAA 1ZIUA 3M3FA 2XXIA 1QW0A 1Q35A 3FATA 3FVGA 5I56A 4YKIA 1MQHA 3PU5A 4KPTA 1PC3A 4OQOA 3QK6A 3RGYA 3LBSA 5A5XB 4TOZA 1M5FA 3RQTA 4PFYA 4U4XA 1Y20A 3DM0A 3VVFA 1XHYA 4IO7A 2XXYA 2F5XA 3KG2A 2DE2A 1P1NA 2DSFA 2DWJA 5FHNA 2P1SA 2PYYA 3TQWA 2ZNSA 5TPAA 5ISUA 4AB5A 1NNPA 4HCWA 1PEBA 5B7DA 3DP6A 1IXHA 4JSDA 1Y4TA 1R1NA 3FXRA 2FYIA 4F1UA 4P0IA 5FHMA 4MLQA 1PB9A 1I69A 5H8QA 3CFZA 3MZBA 3TTKA 1O7TA 4G77A 3FXUA 2OK2A 3HHGA 3IB1A 1US4A 4BLAA 3RLFE 2VP1A 1SYHA 3VVEA 1P1UA 3QXMA 1H43A 2GFEA 4G68C 1DTZA 3G3KA 1FTJA 3TCGA 2XXUA 2HXWA 3M3LA 1LLSA 4M4GA 3K2DA 3EN3A 3TQLA 2F36A 3K0VA 2H5YA 1NKXA 3MPLA 3UA8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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