2I3VA

Measurement of conformational changes accompanying desensitization in an ionotropic glutamate receptor: structure of g725c mutant
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGCNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Measurement of Conformational Changes accompanying Desensitization in an Ionotropic Glutamate Receptor.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 76
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i3vA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i3vA02
4G77A 2G93A 3FZVA 4ND9A 2PYYA 3KN7A 2DXYA 3RY3A 1NNKA 3SERA 5IKBA 3PMXA 4GWOA 1VFDA 3MC2A 2G29A 3KJ7A 1B4HA 2UVJA 3MUQA 4YU0A 1NNTA 3SEYA 1TT1A 1UIUA 1B5IA 1B0LA 4DCXA 4THIA 3FXRA 1N04A 2ONKE 3Q26A 4LZ7A 2F36A 1FQBA 1LCFA 2I4CA 2ZNTA 2RINA 4YMAA 1PC3A 1PBQA 2A5TA 4YKIA 1MH4A 2H25A 3QUJA 1QKAA 3B6WA 3E4RA 3FASA 3HPIA 3QIMA 4IO4A 4RA1A 3N5LA 4F1YA 4KPTA 1PB7A 4F22A 3M3FA 4H1XA 1Y9UA 3IOVA 3U8QA 4DIGA 2GHBA 4JSDA 1MQJA 1GTKA 2QPQA 2YPNA 2Z8EA 3HSTA 1US5A 5H8QB 2ESNA 2PMSA 4QFNA 1N3XA 3C31A 2I4BA 3FUZA 4OENA 1ZBMA 4R6YA 5CI5A 2HEUA 4F31B 4ZZAA 1IITA 1EZ9A 1IXHA 3LC8A 2DWHA 5L9OA 3QSLA 5HPQA 4Q30B 5H8NB 1SW1A 1R9QA 3TUSA 2F7AA 2W7YA 3CVGA 5I57B 1UTHB 2CMOA 3MZ1A 2THIA 4QFPA 5HM4B 5H8HB 3TQLA 1M5CA 1LLSA 4MH5A 1SVXB 5J1DA 4DE8A 4ZE9A 2DE3A 3G3IA 3CFLA 3MWBA 3I5OA 1A8FA 4E0XA 5TU0A 2I0CA 2VD2A 3JV9A 3KN8A 4KCDA 4H65A 5LOMA 2Q88A 2WKYA 3IO4A 4WKMA 3R7XA 4KR5A 3KBRA 3MW0A 2RKMA 3FGSA 2V3UA 5L9MA 2GFEA 5H8QA 2VD3A 1MG1A 3FJ7A 1ATGA 2GH9A 5FHOA 5ITOA 2AL4A 1DMBA 2XXQA 2UXAA 3U92A 3VVEA 1JVYA 4EQBA 2I58A 2OLBA 3G7WA 3EF7A 4IGRA 3T96B 5FHMA 4GXAA 5KCJA 3B6QA 2QMWA 3L6GA 3MBPA 4F3GA 4ZEKA 1Y1ZA 1MY3A 4IO3A 5K2YA 3QAXA 3PGFA 1B32A 2B3BA 2Q2AA 2UVHA 2UYEA 3DLNA 4HTGA 5DTBA 4NF4A 4U2RA 3RT6B 1B58A 2HZLA 3JYRA 4EXKA 4F3BA 5CBRA 4WEPA 3ZKLA 5KDTB 1LAHE 2HZKA 3HCQA 4IO6A 1LAFE 1OVTA 1DPPA 4I62A 1QUJA 4YZZA 4FATA 2Q9TA 3C35A 1B1HA 4QF9A 4LONB 4OFLA 2ZNSA 3LSFB 1B40A 3OMBA 4MLQA 2AYSA 3U1OA 1O7TA 3CRBA 3C33A 3DP8A 3O97A 4POXA 1B2HA 4QFLA 1MQIA 2QS4A 3E13X 4TLLB 4NF5A 3SESA 1EU8A 3L6HA 1FTJA 1Z7NE 4KI0E 3PD9A 1MM6A 1Y3NA 3GBBA 1LFIA 3PPNA 2Z8FA 3H6UA 1IXGA 4G68A 1R9LA 3PU5A 4XXUA 1Q35A 3LUYA 4JB7A 3S9MC 3ILUB 4AQ4A 4NF6A 1S7YA 3M8UA 3THIA 1JETA 4KQPA 2DP8A 4BDNA 4RYAA 3USDA 2FNCA 3SKPA 2DVCA 3MZBA 4C1UA 2DS9A 1JW4A 1B4ZA 5ELVA 4F3PA 2QSXA 1IQ7A 3TYHA 2DWAA 4ZECA 1NKXA 4MLVA 1A54A 4DDDA 3FXQA 3KFMA 2H5YA 3H6WA 2B65A 4JWYA 1GV8A 3W9WA 3UK4A 1FQAA 2FA7A 2AIXA 4NTLA 2RCAA 3T66A 3S9LC 1MXZA 3VLWA 5F1QA 1AOVA 3EN3A 3KSXA 3G3GA 3CSBA 5I2KA 2Z23A 1R1NA 1FW0A 1XC1A 3HV1A 5CMMA 4LZ5A 3S2VA 3TEPA 2ZYNA 2HCAA 2OJTA 4HS7A 3FV1A 2Y7WA 3K00A 3Q27A 1BLFA 3OO8A 1NMUA 4KFQA 1L5TA 1WVJA 3IOWA 4N07A 4YICA 1MPDA 3GLBA 5I57A 3KSJA 4RPNA 4R74A 3IORA 4HCWA 1DPEA 2VOZA 3RTWB 3K02A 1LB8A 4U4XA 1AIVA 2UYFA 3P7IA 4ONYA 5CBSA 2ZNUA 4U4SA 2DE2A 2ONSA 1PBPA 3IR1A 4HW8A 1OIBA 2E1SA 3TODA 4R75A 2O51A 1UTBA 3OD7A 1TFAA 4POWA 2O1LA 3G3JA 3PUYE 3EHTA 1FTLA 4BDMA 1MQHA 1QVSA 5B7DA 4TQUQ 2KLFA 1KWHA 1S50A 3FVKA 3TPAA 2Q2CA 4KD5A 3VDFA 5I84A 3WAEA 2REGA 4ZE8A 3FVNA 4R2BA 4ZEBA 3RUMA 4ZEIA 2ABHA 3KGCA 3V5AA 2ALUA 3OOAA 1N76A 1SI1A 1SDXA 1Y1MA 3KOTA 3R26A 4OYVA 3DELB 4R2FA 3TCHA 3MJNA 1LFHA 3KN3A 1MS7A 4KYDA 5B70A 3CIJA 3OO7A 4EF1A 3FJMA 3MP1A 5CMBA 1D9VA 3M3LA 4G2ZA 4AB5A 3GXAA 4JXIA 5CMKA 5ICTA 3ECRA 1QJMA 3BBRA 4U22A 4NF8A 1A55A 4E0WA 2H4IA 2NOOA 4ELRA 3TAJA 2LAOA 1DOTA 2ONRA 2XXXA 4JSOA 1P1UA 3H6VA 4I9DA 2IEEA 4LVQA 4OHNA 4RPOA 4PETA 1N7XA 1GR2A 1XOCA 2VGQA 2Y7RA 5AA2A 1IIWA 1MXWA 4U21A 4FEDA 5K2XA 4FJPA 3TTNA 2OCUA 3T9XB 2OZZA 4IO7A 1RYOA 4XKRA 2RF1A 3UIFA 2ANJA 4GFRA 5M2VA 4YKKA 2O84X 5TP9B 4NF6B 2GRVA 1B05A 2XX8A 3KJTA 3U93A 4G8MA 4PFYA 3SEVA 4LQ2A 1YTVA 4G68B 1XS5A 2F8DA 4F1VA 3IL1B 3H3GA 5FTIA 3K1PA 2F34A 3VFJA 4ELQA 4HCYA 4OFJA 3RQTA 1MY4A 1N7WA 2X7PA 1UQWA 2Y84A 3PPPA 5AA2D 2OBGA 4XIGQ 5L8DA 4ESXA 1POTA 1FCKA 1SQYA 2F35A 3OO6A 3KOSA 1PB8A 5H8HA 3RT8A 4FE8A 2XXWA 1URDA 4FORA 4PP0A 3SDFA 1DTGA 3ZSFA 1YCJA 2X26A 3MZ9A 3FJGA 1B3FA 3HHFA 3I6VA 3RNNA 5JK4A 1O64A 1FTMA 1B6HA 1P1NA 2Y7PA 2YJPA 4R9FA 1N3WA 3EQ1A 1ELJA 3H06B 5AA4A 3C9HA 1OVBA 3Q25A 2Q89A 1A40A 1EH3A 1SD3A 2OWTA 5A5XA 1B51A 1M5EA 3LSLA 4ZS9A 3TTLA 3Q28A 2FYIA 2HFBA 2I3VA 2RCBA 3EPEA 2V3TA 3EHSA 1O63A 2E0SA 3N94A 3O6GA 4M4GA 1B9JA 3IB2A 4X48A 3V89B 5AE4A 4IB2A 5KCJB 3HHGA 2XHDA 1B3LA 1B5HA 1M5FA 5I56A 3A3CA 1PDAA 2Z22A 3KEIA 2RC7A 4IGTA 4UACA 4XKQA 1TFDA 3ODBA 1FQEA 4GLIA 1Y4TA 1MY0A 1QUIA 2QS3A 3ONMA 4GD5A 4GF8A 4YKJA 4F19A 4Q8RA 1JNFA 2UVGA 3B6TA 3PUWE 2Y7KA 1B0HA 4O3BA 5BWJA 3S4UA 3FD3A 3R6UA 3U72A 5JEIA 1IXCA 2I3WA 3TKDA 3K2DA 4H67A 4QFKA 3T9UA 3N6UA 1I69A 2M8CA 1A8EA 3W9VA 3VLVA 1I6BA 2DYXA 2I48A 3C32A 3CR9A 4QSDA 4ELPA 1MQDA 1B3HA 3MVYA 1P1QA 5JTYA 1LAXA 3M3KA 3RLFE 1SW4A 4OEVA 1VSOA 1AL3A 1NNPA 3IOUA 4U1OA 3T22A 3T93B 3K6WA 3VXCA 4H6DA 4OFOA 5EHMA 2F6GA 4PFTA 2VP1A 3D4CA 2ZYMA 4YB6A 5HBCA 3HN0A 1MY1A 2UVIA 3IX1A 3OSRA 3UORA 1SW2A 3ZKKA 1Y4CA 3TELA 1WODA 2D21A 4OETA 2QS1A 4JWXA 3C34A 2Z8DA 3TDJA 5IAIA 2HQ0A 4NE4A 1JVXA 1MQGA 4BDOA 4EUOA 5ITPA 2XXRA 3G3FA 1A7LA 2QMXA 1URSA 1MH3A 3PMVA 3QUFA 3QYTA 1HSLA 4OWDA 4YKPA 1B7HA 1CB6A 2PT1A 4GL0A 2H99A 2O7IA 4TOZA 5TPAA 1ZJLA 2I49A 3A09A 3MVZA 2X7QA 5I58B 2PBWA 2O6AA 5FTHA 1MY2A 2H9BA 3VXBA 3D4GA 4R9GA 3PPOA 5JTYB 3SEXA 3F11A 3CG3A 4UA8A 3FVGA 1D3KA 2PX1A 3WAFA 4QSCA 2P0SA 1TXFA 1Y3QA 1EZPA 4QSEA 3K6VA 3KZGA 3H6TA 4Q0CA 4H5GA 4P0GA 4RK9A 4MFIA 3OO9A 4GL8A 5I56B 2F7BA 1DTZA 1OMPA 3K0VA 3OXNA 2XX7A 4YB7A 1P1OA 2R9JA 3RPWA 4X9TA 1MXUA 3UP9A 3OEKA 3VLUA 4DXCA 3CG1A 3N6TA 4IO2A 4Z0IA 1XT8A 3MAMA 3SEWA 2NXOA 1PEBA 3LSWA 4X1DA 2AL5A 2PT2A 1YAEA 2DQVA 1BTJA 4GIZA 1Z7ME 3K1MA 4NWDA 4U23A 4EQ9A 5AA2B 2F5XA 4FEBA 1FQCA 2A5SA 3BKIB 1H45A 2D3IA 4H8JA 4AB6A 4ECFA 5ICQA 4R6HA 1S9TA 1NFTA 1SYHA 3CSGA 3PV0E 4X1BA 1HSJA 3O66A 1B1XA 3MQ9A 2HXWA 5CRYA 2Q8JA 4NWCA 1NH8A 2R71A 1B3EA 2NUVA 4GRKA 4OZ9A 4PFUA 4JWOA 1BKAA 2I0BA 1I6QA 4GVOA 1ZMGA 3BFTA 3E9XA 4RY1A 1LGBC 5EHSA 1JQFA 1P1WA 2V25A 3VVFA 2QRYA 2YLNA 1POY1 5I59B 2XXTA 3MP6A 5EYFA 4DLDA 4OQOA 1QUKA 3LSXA 3HO7A 4OERA 2IA4A 3IO6A 1USYE 4YMBA 5KDTA 4H8IA 4EDPA 4YAHX 3ZS6A 4BLAA 3IB1A 1HSEA 1RYXA 2Y7IA 3O29A 3SEUA 4BDRA 2R6GE 5TPAB 3S9EA 3FVOA 2ZMBA 4OVJA 5AA1A 4LATA 4I8CA 3K01A 1ZKBA 3DP6A 3UA8A 4IY6A 2V3QA 4QRZA 3C36A 5CM6A 1T0KA 2PVUA 4MBPA 1YPNA 1WDNA 4H0WA 1VFEA 5DT6A 4GOTA 4KYSA 4MF3A 3N26A 1N0TA 4RK2A 4QFOA 3H4ZA 4OESA 1CE2A 1DSNA 1AH5A 4ZEFA 4DXUA 3TFLA 3PUVE 1OLAA 4IY5A 1FQDA 4NF8B 4JDFA 3T9VA 4KYEA 1B3GA 3UN6A 3UGWA 2DWJA 4XTCQ 3PPQA 1ZLQA 1B5JA 1SI0A 1B7UA 2CZLA 2RC8A 4OXVA 4KCCA 4F2OA 2ZYKA 2XXIA 3QK6A 3VE1B 3VVDA 2QS2A 4QHQA 5I2NA 4BDLA 5I2KB 1JEUA 1GGGA 4YB5A 4LUBA 1TWYA 3EHUA 3PD8A 1LAGE 1LBBA 1VR5A 3K1NA 2V84A 2F97A 4ELOA 5DVFA 4ESWA 1SBPA 2OK2A 4LA9A 3GBAA 5I58A 5I59A 1ZIUA 1MDP1 3IAZA 3KG2A 4P11A 3OEMA 4PFWA 5F7VA 5FHNA 1Y20A 2DWIA 3OENA 3PMWA 3PPRA 3IOTA 3RTFB 1MXXA 1J1NA 2O7UA 5H8SA 1JW1A 1Y3PA 3K6XA 4PQJA 4ZZEA 4BDQA 1US4A 2F78A 1II5A 2OWSA 2P1SA 3FATA 4N6PA 2ZYOA 4Z7EA 3V8XB 3CFXA 4XKPA 1QKBA 3TCGA 2B3FA 3TTRA 3O9PA 3CI8A 1OQGA 4EF2A 1SYIA 2QJEA 2XXPA 5DVJA 1BIYA 2HAUA 4EXLA 5AA4B 2V93A 4RJZA 1LCTA 4L17A 4PE5B 3LR1A 4DZ1A 1H43A 2NVUB 4F29A 2BJJX 1SW5A 1MM7A 1AMFA 3PUZE 2XXYA 3MVXA 5DEXB 5BUUA 4C1TA 2DSFA 2QL3A 1PB9A 3K6UA 4FIMA 4WEDA 1B46A 3B7DA 1QW0A 1USYH 1ANFA 1FQFA 4P0IA 2HAVA 3DP4A 1MXVA 1URGA 5KZTA 1LSTA 4F1UA 2DXRA 4DCYA 1N84A 4O3CA 4F3SA 3MVWA 4F18A 5H8FA 3AXFA 4M1VA 3IK6B 3IJOB 2ZXTA 3O6IA 1IUDA 4RNSA 1XHYA 4LQ5A 1MPCA 2DOJA 4OMBA 4WXJA 3RN8A 4C0RA 3V83A 4DXBA 4R73A 1QULA 2F6PA 3H03A 1GVCA 5AA3A 2XXVA 5ISUA 3RGYA 3FV2A 4FECA 1VE4A 2H98A 4U1ZA 1B7ZA 4GQOA 3BFUA 2I6EA 3OSQA 5H8NA 3K4UA 3O2AA 3H7MA 4R72A 1H44A 3IB0A 4NEDA 3TQWA 5TP9A 4G4PA 3VV5A 3W15C 4FAJA 3S9NC 3MP8A 4K3FA 4H5FA 5CMCA 4F39A 4RXLA 3CFZA 3A3UA 3O28A 1ZTYA 1MRPA 1MXYA 3O6HA 3QXMA 1D4NA 4G68C 4OEUA 1F9BA 1OQHA 1RKMA 2DE4A 1IEJA 4KHZE 3T9HB 4NF4B 1H3DA 4N13A 1H76A 4OTEA 3TZAA 4ZEDA 3U94A 1Q1KA 5DYHA 4NMYA 1OLCA 4JBZA 3IJXB 1I6AA 4I1DA 4Q5TA 1XVXA 1BP5A 1M5BA 1UIVA 3FXUA 2P2AA 1A99A 4LP2B 2XX9A 4XKNA 5DVIA 2O69A 3GZGA 1NNFA 1FTKA 2REJA 3G3HA 4O3AA 4ZDMA 2RC9A 4IO5A 3I3VA 3OELA 2O1MA 3DM0A 2NWJA 1R6ZA 1XVYA 2F7CA 2DVZA 2VHAA 1NL5A 3MPLA 5DEXA 3SETA 1LFGA 3TMGA 3TTMA 4GXSB 1MDQA 1M5DA 3JZJA 2XD3A 1LB9A 1JW5A 4ISUA 5L9SA 4G8NA 1NH7A 4EQ7A 3PUXE 4LZ8A 1UTHA 1IXIA 3Q29A 3LBSA 1FTOA 1UTBB 3C4MA 4R6KA 3TCFA 2XD2A 4F2QA 5A5XB 5CC2A 1ZU0A 5H8FB 1D9YA 2A5TB 1MPBA 1P99A 3G3KA 2GHAA 4TLMB 1LBCA 1EZOA 1IZ1A 2XXHA 1JEVA 2XXUA 3MPKA 3ILTB 2O68A 4NF5B 5I2NB 4G8HA 1B52A 3FIRA 2D5WA 3E3KA 3TTKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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