2I3VA

Measurement of conformational changes accompanying desensitization in an ionotropic glutamate receptor: structure of g725c mutant
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGCNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Measurement of Conformational Changes accompanying Desensitization in an Ionotropic Glutamate Receptor.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 76
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i3vA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i3vA02
3CI8A 3QUJA 1NL5A 2RC7A 4R73A 1JEVA 3KBRA 4ZE8A 2E1SA 3LC8A 3UGWA 1RYXA 2Y7RA 4EUOA 1GV8A 4L17A 1B7ZA 4H0WA 4PQJA 3C32A 1UIVA 3VVDA 5FTHA 2V93A 4DCXA 1M5DA 4NE4A 3PPOA 1SYHA 3I3VA 3O28A 2H9BA 1VFEA 2HEUA 4RPNA 4QSCA 4BLAA 1B46A 5L9MA 3CRBA 2DS9A 3KOSA 3G3JA 3KFMA 3FVGA 1BKAA 3S9LC 4NF6B 2Z23A 3FVOA 3KZGA 4ZDMA 4JDFA 1IQ7A 4OFJA 1QUKA 2ESNA 1Y1MA 4R9FA 1MPCA 1B3FA 5AA1A 3TQWA 3MUQA 3MQ9A 1MM6A 3TCHA 4ISUA 5AA4B 1A55A 3UP9A 4I1DA 2F78A 4LONB 2DWAA 3OSRA 2QL3A 3D4CA 3RT6B 1MQHA 3RTFB 2Y7PA 3IB0A 3PGFA 1H44A 4LZ5A 1EH3A 2XXQA 5I57A 4GLIA 1PDAA 3HPIA 3GBAA 1MG1A 4EQBA 4IGTA 3Q26A 4EF1A 1PC3A 1XHYA 1S50A 2R6GE 3TELA 3PU5A 4HW8A 3HSTA 1OIBA 4ECFA 4ELQA 2NUVA 4U22A 5TU0A 1Y1ZA 1DSNA 4G4PA 1QUIA 1ZMGA 3E3KA 3OXNA 3CSBA 3KN8A 1II5A 4IO2A 2AYSA 3IJXB 4JSOA 1N84A 3MP6A 4LZ7A 3RGYA 1B7HA 1H45A 3HV1A 1QKBA 1XC1A 1FQCA 3JYRA 2O84X 3VV5A 3K6VA 5B7DA 4U4SA 4QSEA 4M1VA 3C9HA 2NOOA 3K6WA 1LCTA 1LAXA 1PEBA 2DXYA 1PB7A 3IOUA 3I6VA 5CMBA 3G3HA 4OEUA 3V8XB 4AB6A 4R72A 4KQPA 1VSOA 2G29A 3OSQA 1B5IA 3MAMA 5ISUA 4H5FA 3MVXA 5ELVA 5TPAA 2QS2A 1I6BA 4KYEA 2UYFA 1H3DA 2VD2A 3C36A 3CR9A 3DELB 2XXYA 2XXVA 4F18A 1S7YA 2A5TA 3OEMA 5KDTA 3TZAA 3UN6A 3EHSA 2Z8FA 2XD3A 4U1OA 1QW0A 5I57B 3QYTA 3K1PA 4QFOA 3ZKLA 3G3FA 5JK4A 4EQ9A 3BFTA 4DE8A 1IXHA 4DZ1A 2RF1A 4JBZA 2O1MA 1HSJA 4RA1A 2V84A 2UVJA 4JWXA 4LQ2A 2PBWA 4PFYA 2NWJA 1B0HA 3SEWA 1XS5A 3IK6B 5DYHA 3V83A 3EHUA 3O9PA 3T22A 3VXCA 1B9JA 4LUBA 3SKPA 4LZ8A 1FQDA 1QJMA 1QULA 4JSDA 3K6XA 2HCAA 1SBPA 2H99A 1UQWA 4KI0E 4F19A 3CFXA 4EQ7A 3FD3A 1IITA 1IIWA 3MZBA 1MDP1 1XT8A 4OYVA 4ELPA 5IKBA 3E9XA 2ABHA 3HCQA 1BP5A 5DVJA 1YPNA 4LA9A 4LP2B 5ICTA 3SERA 1I69A 2OZZA 2OBGA 1MY3A 4IY6A 4NF4A 1LFIA 1Y20A 4IY5A 2FA7A 5TPAB 1B3EA 1VR5A 1WVJA 3FXQA 5DVIA 3H06B 1N3WA 2D3IA 4YB5A 3GLBA 4PE5B 4Z7EA 4F1VA 5H8HA 4GRKA 2B3BA 1ZKBA 3G7WA 3SETA 1R9QA 3N6TA 2A5TB 4WKMA 5KDTB 2ZYNA 2H98A 2DE4A 1AMFA 2YLNA 2I3VA 1A99A 1UTHA 5I58A 1O63A 4IGRA 4H8IA 2YPNA 1LFHA 3PV0E 5HPQA 3FVKA 1RKMA 4X9TA 3EHTA 4C0RA 1US5A 4YKPA 3TTLA 2AIXA 4FEBA 2DP8A 1D4NA 5KCJA 3PMWA 4X1BA 4GL0A 1USYE 4GQOA 1B1HA 1MY2A 3E4RA 5I56A 1NKXA 3EQ1A 1B52A 1JVYA 4H67A 2DOJA 3IAZA 1JETA 1HSEA 4OETA 2O7IA 2OWSA 3FATA 2HZKA 4TLMB 4HTGA 4DCYA 4NTLA 5FTIA 4G2ZA 5AE4A 3Q29A 5TP9A 1LB8A 4BDLA 1OVTA 1TFAA 1Y3NA 2Q89A 4EXKA 1FTMA 3PUZE 4NF4B 1OQGA 3FJGA 5H8FA 4GOTA 1P99A 1DTZA 4JXIA 2I58A 2VOZA 4M4GA 4IO5A 2P0SA 5H8HB 2P2AA 1P1QA 4E0WA 4KPTA 1MH3A 3GZGA 4EF2A 4IO6A 4ELOA 3OEKA 1O7TA 5L8DA 3IOVA 4ZE9A 1A40A 1UTHB 5I58B 3T9UA 3HN0A 1FTJA 3N94A 5CMMA 1LCFA 2DSFA 3H6VA 3FZVA 1AH5A 2KLFA 1EZOA 3Q25A 3Q28A 3O66A 1FTKA 4QFPA 3TDJA 3BFUA 4X48A 5KCJB 1ZTYA 1JW4A 2I48A 5A5XA 2P1SA 5H8NA 3H03A 2XXRA 1GVCA 1JVXA 3MP1A 2IA4A 5I2NA 3W9VA 4IO3A 4OXVA 2XX8A 1AL3A 5I56B 1P1UA 4OFLA 1ANFA 3OO8A 4UA8A 2DVCA 3BBRA 3TPAA 1XVXA 1R6ZA 2ONSA 4BDRA 2GHBA 4I9DA 2OLBA 5JEIA 4FJPA 4X1DA 2M8CA 1B3HA 3LSFB 3MZ9A 3ZKKA 3MBPA 1WDNA 1B5JA 1SQYA 4ZECA 1LSTA 2CMOA 5TP9B 4OWDA 4ZZAA 1MXUA 4IO7A 4F3SA 4EXLA 2F6PA 2H25A 3K4UA 4YKJA 4QF9A 1ZU0A 4Q0CA 4RXLA 3QUFA 4QRZA 1N0TA 2WKYA 4TQUQ 2XHDA 1B3LA 4KYDA 1MQIA 3CG3A 5H8FB 2Y7KA 5CI5A 5IAIA 1B4HA 3PUYE 3DP4A 3CFLA 1CB6A 1LBCA 3JZJA 2PT2A 2F34A 4RPOA 5B70A 5EHMA 2O1LA 4NWCA 2HAVA 1D3KA 4GL8A 1B58A 2AL5A 3KOTA 3S9NC 4GVOA 3N5LA 2ZXTA 3RT8A 1MY4A 5CC2A 1TFDA 3VDFA 3ECRA 4AB5A 5K2YA 1QUJA 3IOTA 1JW5A 2ZNSA 2F97A 3R26A 4N13A 3TMGA 4WEDA 5L9SA 4R75A 2FNCA 1EZPA 1US4A 5A5XB 1ZBMA 2DYXA 3ZS6A 3IORA 5H8NB 2NXOA 3OMBA 5I2NB 3FV1A 4FORA 1B40A 1AOVA 1YAEA 4IO4A 3O6HA 1L5TA 3JV9A 1J1NA 3K01A 3LSLA 1N7WA 2GFEA 2Q88A 3SEXA 4F39A 4O3BA 3TTKA 2DXRA 4Z0IA 2AL4A 2QJEA 3MPLA 4NWDA 1ATGA 4POWA 1HSLA 1B0LA 1MXZA 4P0GA 3MC2A 4GF8A 3IB1A 2ANJA 1Y9UA 3UORA 2ZNTA 3PMXA 1B32A 1M5BA 3G3KA 4F1UA 3K1MA 5ITPA 1A8EA 1MPDA 4NF5A 1A54A 4KFQA 4KCCA 1MPBA 3RTWB 3N26A 2R9JA 3RY3A 2F8DA 3HHGA 4O3CA 3C4MA 3MW0A 1Y4TA 4ZEFA 1MXWA 1SW5A 3K02A 3GXAA 3L6GA 4JWOA 4G77A 5DT6A 3MP8A 5F7VA 4U4XA 1NFTA 1NH8A 2REJA 3R7XA 4RNSA 3UA8A 3OOAA 3ONMA 2REGA 3SESA 5J1DA 5CMCA 1MXYA 2ZYKA 4R2FA 1T0KA 1B6HA 3RNNA 1URSA 1FCKA 3L6HA 3OENA 4R6HA 3TTMA 4RY1A 5FHMA 4U1ZA 1P1NA 4KCDA 3M3LA 4JWYA 2I4BA 5BWJA 2THIA 3RN8A 4Q30B 4GIZA 3C34A 4H5GA 4U21A 3OELA 1VFDA 3QAXA 4XKNA 1VE4A 3OD7A 4FATA 3C31A 3ODBA 4DXUA 3VVEA 3U92A 1NNTA 3FUZA 3USDA 2RCBA 4OZ9A 3IJOB 4P11A 1OQHA 4K3FA 1XVYA 3VE1B 1SD3A 1ZLQA 2OK2A 2B65A 3KJ7A 1IXGA 4PFTA 5JTYA 3CFZA 1N76A 4MH5A 4KR5A 4GWOA 3DP6A 4I62A 4F2OA 3MVZA 3OO7A 2ZYOA 5FHNA 3E13X 1LLSA 4YB6A 3MZ1A 4NF5B 3VLVA 3RLFE 1EZ9A 2RINA 3PMVA 2XX9A 1DMBA 3B6QA 3T9XB 3ZSFA 5ICQA 3CIJA 3CG1A 1FQBA 4YMBA 2GH9A 1Y4CA 1CE2A 4DLDA 1RYOA 1FQFA 3V89B 4ZZEA 3KG2A 4DIGA 1P1OA 2F6GA 3T96B 2H5YA 2HZLA 3B6TA 3DLNA 3RUMA 3O29A 2UVHA 3EN3A 1IZ1A 4OERA 2QS1A 5M2VA 4HCWA 3H3GA 2Z22A 2HFBA 3H7MA 1BTJA 2GHAA 1S9TA 3MVYA 1EU8A 3PPRA 4GD5A 1M5FA 4YAHX 3FXRA 5ITOA 5H8QA 3H6UA 1LBBA 2QS4A 2F7CA 5DTBA 4G68A 3LSXA 3IX1A 4XKPA 1MDQA 2PYYA 2GRVA 4N07A 4OQOA 1JW1A 1Y3PA 2VGQA 4PFWA 3VXBA 2XXTA 3TCFA 4QFLA 4ZS9A 1Y3QA 3HHFA 4OFOA 3V5AA 5I2KA 4C1UA 2LAOA 2E0SA 3B6WA 2UXAA 4H1XA 1UTBA 2G93A 5JTYB 1GR2A 1ZJLA 2XXUA 2I3WA 4FIMA 1DTGA 1YTVA 5CBSA 4PETA 4G8MA 2V25A 3PPPA 4FEDA 2V3QA 4BDOA 4XKQA 4NMYA 4XKRA 4OEVA 2Z8DA 3M3KA 4ZEDA 5DEXA 4U23A 5L9OA 3OO9A 3U1OA 1A8FA 2V3UA 2ONRA 4F2QA 2RC9A 2DWJA 1O64A 3IR1A 1Z7NE 4LQ5A 2OWTA 4F22A 3SEUA 5HM4B 1IXIA 2O51A 1B4ZA 3ILTB 3S4UA 3H4ZA 3RPWA 1B5HA 1PBPA 1POY1 3O97A 3LBSA 4PP0A 2V3TA 1LAHE 3O6IA 5CRYA 3C33A 3O6GA 4OTEA 2ALUA 1USYH 3WAFA 4F3BA 5H8QB 1SW2A 1NMUA 1H43A 1TXFA 4MBPA 1PB8A 4G68B 1JQFA 4DXCA 2XX7A 4RK2A 2DVZA 3EF7A 4I8CA 2QPQA 4R9GA 1P1WA 1R9LA 4NF8A 1DPPA 1SVXB 4BDMA 1QVSA 3I5OA 3KN3A 3K00A 1MQGA 3MJNA 3T9VA 5AA2D 2O7UA 1QKAA 5I2KB 3KN7A 1KWHA 4GXAA 1FQEA 4N6PA 1JEUA 1UTBB 1XOCA 2Y7WA 2X7QA 4F31B 3M8UA 1PBQA 3BKIB 3QK6A 3KSXA 4NEDA 1B05A 3PPQA 2O6AA 2DWHA 3FGSA 1A7LA 3KJTA 3IB2A 1GTKA 2Y7IA 4FE8A 1NH7A 3T66A 3N6UA 2I4CA 3B7DA 2RKMA 2OCUA 2HQ0A 5DEXB 3PD9A 2PMSA 5DVFA 4WEPA 2DQVA 4ZEIA 1LFGA 3MPKA 2UVIA 2DE3A 1IEJA 3A3CA 4C1TA 2VD3A 2PT1A 2F7AA 3TYHA 2RC8A 4G68C 3W9WA 2F5XA 2PVUA 5CMKA 4RJZA 2HXWA 1M5CA 2B3FA 1AIVA 3ILUB 3K2DA 1SDXA 1NNPA 4THIA 3FJ7A 3K1NA 5AA2A 4RK9A 2PX1A 4YKIA 2XXWA 1B7UA 2VP1A 2QS3A 2VHAA 4R6YA 5I84A 3OO6A 3TFLA 5I59A 2RCAA 3W15C 2FYIA 3IL1B 4QSDA 3S9EA 4YKKA 4NF8B 4R6KA 4PFUA 4KHZE 3IO6A 1FQAA 4Q8RA 4P0IA 4OHNA 1BLFA 2ZMBA 2XXHA 1NNFA 3HO7A 4MLVA 4OENA 3FASA 4ZEBA 2D21A 3MVWA 3U8QA 3K0VA 2QSXA 3G3IA 1D9VA 1LGBC 4YB7A 2XXPA 1MY1A 3F11A 4GXSB 3IO4A 3K6UA 3T9HB 3TAJA 1POTA 3CSGA 3FIRA 3LUYA 1OVBA 3Q27A 3LSWA 2F36A 3TCGA 1WODA 3VLUA 3VLWA 1B51A 4YMAA 1Z7ME 1MQJA 1NNKA 4FAJA 3TEPA 1MM7A 1URGA 3SEYA 1FTOA 1N3XA 5LOMA 2UYEA 3VVFA 1IXCA 4QFNA 1JNFA 5KZTA 2O69A 3S9MC 3TODA 1BIYA 2D5WA 5CM6A 1H76A 1OLCA 3QIMA 2I49A 3KGCA 4ONYA 4DXBA 2X26A 2CZLA 3FV2A 3PPNA 3O2AA 1MRPA 1R1NA 2DWIA 2Z8EA 3T93B 2NVUB 5AA2B 3KSJA 3FJMA 1DOTA 4HCYA 1MY0A 3U93A 1N7XA 3WAEA 3EPEA 4AQ4A 1OMPA 4XIGQ 5I59B 1I6QA 2IEEA 2XD2A 4DDDA 5H8SA 1F9BA 4TOZA 3TTNA 2OJTA 1MQDA 4ZEKA 1I6AA 3R6UA 4MFIA 3P7IA 2Q2CA 4GFRA 3H6WA 2Q8JA 2I0CA 1B2HA 4RYAA 5CBRA 4G8HA 4R2BA 4H65A 3FXUA 3G3GA 1LAGE 4F3GA 4O3AA 3A09A 2YJPA 3TTRA 3U72A 5F1QA 1MXXA 4ESXA 4UACA 2QMXA 4F3PA 3TQLA 1B3GA 3M3FA 3GBBA 3DM0A 3PD8A 4F29A 3A3UA 2ZYMA 3PUWE 4QFKA 2X7PA 4Q5TA 2ZNUA 3THIA 3QSLA 3CVGA 3TKDA 1SI0A 4JB7A 3RQTA 2Q9TA 5BUUA 3H6TA 4XTCQ 3VFJA 2W7YA 1D9YA 3LR1A 1B1XA 4U2RA 1FW0A 3IOWA 4OMBA 1ELJA 1TT1A 4LATA 1DPEA 2A5SA 1UIUA 4EDPA 4ESWA 4ND9A 3PUVE 1TWYA 4H8JA 4WXJA 5K2XA 2UVGA 4F1YA 4QHQA 2F7BA 4BDQA 4OVJA 2XXIA 2BJJX 4G8NA 4NF6A 3KEIA 4E0XA 4IB2A 2QRYA 2ONKE 3MWBA 1MXVA 1OLAA 5HBCA 1PB9A 3PUXE 4KD5A 5EYFA 1LAFE 3U94A 3UIFA 1SYIA 3QXMA 5AA3A 3S2VA 1IUDA 2O68A 2Y84A 4YICA 4XXUA 1YCJA 5AA4A 4TLLB 1LB9A 4H6DA 3D4GA 3C35A 1N04A 4YU0A 1SI1A 3TUSA 1MS7A 5EHSA 2F35A 4BDNA 4POXA 4MLQA 1MH4A 1URDA 3DP8A 2H4IA 1SW1A 1Q35A 4LVQA 2R71A 4MF3A 2Q2AA 4HS7A 3SEVA 5FHOA 2I0BA 1SW4A 1ZIUA 1FTLA 2I6EA 4ELRA 1M5EA 4KYSA 3UK4A 1Q1KA 3FVNA 4YZZA 4OESA 2DE2A 3AXFA 4FECA 2HAUA 2XXXA 1GGGA 3SDFA 4R74A 2QMWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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