2I3VA

Measurement of conformational changes accompanying desensitization in an ionotropic glutamate receptor: structure of g725c mutant
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGCNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Measurement of Conformational Changes accompanying Desensitization in an Ionotropic Glutamate Receptor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 76
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i3vA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i3vA02
2VHAA 4HCWA 4H6DA 3RUMA 4O3AA 3K01A 3H6TA 3S9LC 3PMXA 1IITA 1IEJA 1PBQA 4GQOA 2I49A 1UQWA 1SYIA 3KJ7A 4GWOA 5K2XA 2WKYA 2DVCA 4BLAA 3KSJA 3TYHA 4GXSB 4TOZA 3C35A 2F35A 1MQGA 3W15C 2FYIA 1VSOA 3FIRA 1TFDA 4F2OA 4YMAA 1T0KA 1MXYA 1RYOA 3K2DA 3PMVA 4IY5A 2G93A 3K6XA 2DXYA 2VOZA 3VVFA 1M5BA 3FVKA 1RYXA 4X48A 2FNCA 3UA8A 5DYHA 3DP6A 3O6IA 1PBPA 1N76A 2QRYA 4QF9A 1MQHA 5DTBA 4YMBA 3RN8A 3A09A 4ELQA 2XXTA 1LFIA 4JSDA 2O6AA 1A54A 3Q27A 3FV2A 5DT6A 4DCXA 1Q35A 1QKBA 3OXNA 2GRVA 2OZZA 4G4PA 3MZ9A 5H8QA 3LSWA 2GFEA 1YAEA 4PP0A 3TODA 3B7DA 1FQBA 1B5IA 1MXUA 1AH5A 4EQ7A 4UACA 3IOWA 3IJOB 3V8XB 1AIVA 3E13X 4ESWA 2E1SA 4P11A 4YB6A 4ND9A 3HPIA 4JBZA 3MP1A 1CE2A 1POY1 1B3LA 3H3GA 2XXXA 3OSQA 2D3IA 1SYHA 2I3VA 3M3KA 3PPQA 2UVHA 5JK4A 1NNKA 4YKPA 4F1UA 3GBBA 1AL3A 1SI1A 3GBAA 1XOCA 2O7UA 4DIGA 5IKBA 3IB2A 3CFZA 2PX1A 3D4GA 3FASA 4I8CA 3O28A 2DSFA 2P1SA 1H44A 4GVOA 2HEUA 3FXUA 4DXBA 5I58B 3C9HA 4GL0A 1JETA 1R9QA 1MY2A 2NOOA 4YZZA 4TLLB 3FD3A 3LSFB 1ZU0A 4KYSA 3Q26A 4YU0A 3K4UA 3K6WA 3S9EA 1B7HA 2PMSA 5JTYB 1MDQA 4Q30B 3EPEA 1D4NA 1R9LA 1IQ7A 5I2KB 1F9BA 4DZ1A 4F3GA 1B9JA 4H65A 4F19A 4O3CA 3IB0A 4RPOA 2XX9A 3O66A 3UIFA 1USYH 3IX1A 1B3GA 1B5JA 4U1ZA 3N6UA 3CI8A 4MBPA 3SEYA 4ELRA 1B2HA 4KD5A 5BUUA 2NXOA 3B6QA 4ELPA 3VVDA 3OO7A 2ZYNA 3S4UA 3SESA 3K6VA 4OETA 3CR9A 3SEUA 4RK9A 5CMKA 2GHAA 1ATGA 4QRZA 1FQCA 3TQLA 2I48A 2H99A 4G8MA 4QFOA 4U4SA 3AXFA 5AA4B 1ZLQA 2REGA 4OEVA 2O1LA 1VFEA 5L8DA 3C32A 4IO2A 5FHOA 5KCJB 2HQ0A 1QW0A 1MRPA 3TELA 1JVXA 4NEDA 1US4A 4LA9A 4XIGQ 5KCJA 3RGYA 4EF1A 3CIJA 1EU8A 4ZEFA 1Y1MA 3PD9A 3Q29A 2F8DA 2RCBA 4JXIA 5F7VA 3IORA 3PUXE 4EQBA 1NNTA 2XXWA 1J1NA 3LC8A 2ZNSA 2F7BA 1LCTA 1UTHA 2REJA 1FTJA 4LATA 4ZDMA 3U72A 1NH8A 2KLFA 1OMPA 3L6HA 1SW1A 2DWHA 2PT1A 1B32A 3ZKKA 5ELVA 4ONYA 5L9MA 4PFTA 2X7QA 1MPDA 5B7DA 2H4IA 2G29A 1AMFA 2ESNA 1UTBA 3N5LA 4R75A 4HW8A 5ITOA 1LBBA 2DYXA 2RINA 3UGWA 3K1PA 2CMOA 1BTJA 4QSEA 1D3KA 1A99A 3IB1A 4K3FA 3KFMA 1B3FA 3IJXB 1I6AA 5KDTA 1FTMA 1XVYA 3G3HA 4R6HA 1PB9A 4KYDA 3ODBA 4H5GA 5FTIA 3RTFB 3PPNA 2ABHA 3QK6A 2PT2A 1Y20A 2DOJA 3CRBA 3MUQA 3QIMA 4R2BA 4QFLA 1MY4A 4O3BA 1ZBMA 4KYEA 5I2NB 3DP8A 2HAVA 1XS5A 2UXAA 3EHTA 3MP6A 4DCYA 4R6KA 3O2AA 4JWOA 5HM4B 3ZKLA 5DEXB 2OK2A 4M1VA 2DWJA 4X9TA 2XXRA 2Q8JA 4GFRA 4Q0CA 4RPNA 2UVGA 2YLNA 2GH9A 4FATA 3I6VA 3TEPA 5TP9B 4IO6A 3T9VA 2O1MA 2XD2A 1IIWA 1OLCA 1MY1A 2PVUA 1JW5A 3CG3A 3ZSFA 4JWXA 1MXVA 4GOTA 5ICTA 4NF5B 3W9VA 3C31A 5TPAA 4GL8A 1ZMGA 4H1XA 3G7WA 3PPPA 4ZEIA 2H9BA 3IO4A 3OENA 2ZYMA 1TT1A 3G3KA 2M8CA 1B7ZA 2XHDA 2H98A 5CMMA 3RPWA 3N26A 5A5XB 5IAIA 4EUOA 1S50A 5L9OA 2O51A 2ZXTA 3MZ1A 4ZE8A 1IUDA 2DE3A 5H8FA 2YPNA 3MW0A 3KOTA 5L9SA 2NWJA 1P99A 2PBWA 4ZS9A 3ILUB 4E0WA 2DE2A 2AL5A 1HSEA 4WEDA 5CM6A 1VE4A 1DTZA 2V3UA 3K0VA 1Q1KA 1SDXA 3FXQA 2P2AA 4LP2B 1ANFA 4QFNA 1YCJA 2VD2A 1IXCA 2RC8A 1QULA 3M3FA 2OCUA 5DVJA 1FTKA 5B70A 1B3EA 1LFGA 1XVXA 1QKAA 5JEIA 4DLDA 1B0LA 3PU5A 5I59B 5CMCA 4OEUA 2ONSA 4GRKA 2QL3A 2OWTA 2Q2AA 3OO8A 1A40A 3G3JA 1FTOA 1H45A 3SDFA 1TFAA 1P1WA 4JWYA 1N7WA 1EZPA 1H3DA 4EDPA 3C4MA 1MQDA 1MXZA 4DXCA 2D21A 4HS7A 1AOVA 4LZ5A 2R9JA 4OHNA 3LSLA 3HHFA 3W9WA 1JEVA 3ONMA 4Q5TA 2DE4A 1LGBC 3VXCA 2IA4A 3TTNA 4IGTA 3KJTA 3C36A 3SETA 5FTHA 4R2FA 3PMWA 3OMBA 3HCQA 5FHNA 1EZ9A 1P1OA 2XXVA 2ZNUA 3KBRA 4M4GA 3E3KA 2XD3A 3TTLA 3U8QA 2V93A 5AA2B 3VLUA 4R9GA 3TKDA 1GGGA 5AA1A 3VDFA 4R74A 4R72A 3TCFA 4QSDA 5CC2A 1MG1A 1VFDA 3DELB 2O84X 3V89B 5H8SA 1NNFA 3H6WA 3M3LA 3SEVA 2FA7A 2OBGA 5TU0A 4OYVA 4FIMA 4Z0IA 2RC7A 4HCYA 3IAZA 3BFTA 3T96B 3TTRA 2ZMBA 4KPTA 3VV5A 1JVYA 4RXLA 1OQHA 2Q9TA 2UVJA 4QFPA 4EXLA 1OQGA 4U21A 2AL4A 3I5OA 3EHSA 2AYSA 5CBRA 4BDNA 1GR2A 1QUJA 1NMUA 4G68B 1EH3A 1FCKA 2Q2CA 2E0SA 4R73A 2Z8EA 3FJMA 4F2QA 5I58A 3S9NC 3H06B 1N3XA 4OXVA 4IO5A 2O68A 2IEEA 3HV1A 4TLMB 3L6GA 2ZNTA 3TMGA 3TUSA 3T9XB 4H67A 3O97A 3IOUA 3HSTA 1PEBA 3ECRA 4NF6B 5JTYA 4LQ5A 4OERA 2B3BA 5I2KA 3PPRA 2GHBA 2DVZA 3PUZE 2RC9A 3E9XA 4WXJA 4OQOA 5BWJA 1NNPA 1KWHA 2NUVA 1IZ1A 3VLWA 3SEWA 3CFXA 3JYRA 2LAOA 1MPCA 2DS9A 3PUYE 3H7MA 2B3FA 4IGRA 1MM6A 1MQIA 1B52A 1XHYA 1NFTA 4P0GA 3H4ZA 3SEXA 2UYFA 1Y9UA 3U92A 2Y84A 2F97A 4KCDA 3CSGA 3A3UA 4YKIA 3FJGA 1A8FA 1H43A 1LB8A 2UYEA 2DQVA 3V5AA 5CI5A 5AA4A 1PC3A 3EF7A 2QPQA 1I6QA 2QMXA 4OFOA 1JEUA 3O6HA 1B40A 3G3FA 1CB6A 1DTGA 3UORA 1B3HA 4I62A 2I4CA 5AE4A 1P1NA 4KFQA 3IOTA 3UP9A 2F34A 1POTA 3SERA 1R6ZA 3FVNA 1MPBA 3TPAA 4F1VA 3R7XA 2X26A 3OEKA 2HAUA 2VD3A 2F7CA 1I6BA 4ZE9A 4YKKA 2Z22A 1Y4TA 2XXIA 4XTCQ 3I3VA 4BDLA 1B1HA 3HHGA 3TFLA 3DM0A 4LQ2A 3USDA 5ISUA 2I6EA 3RT8A 3U94A 4OTEA 3T66A 4EF2A 5AA3A 4FJPA 2V3QA 4OFJA 3FVGA 2I4BA 3T22A 5H8HB 1N84A 2XX7A 4N6PA 4MLQA 1FQDA 3RTWB 5ITPA 1DPPA 1SVXB 1JNFA 3MP8A 3QSLA 2P0SA 4XKQA 3F11A 2ONRA 5M2VA 4U23A 1SBPA 3RLFE 1P1QA 2ANJA 2ALUA 4G8NA 1B5HA 1FQEA 4G8HA 3PUWE 4N07A 2V3TA 3LR1A 4IB2A 3VVEA 1LAXA 3EHUA 4THIA 3TAJA 2I0CA 4WEPA 4OWDA 2XXYA 1US5A 4L17A 4NF4B 3FV1A 5LOMA 1NKXA 1OLAA 1FQFA 3GLBA 4E0XA 4NF8B 2A5TB 4R6YA 3MQ9A 4C1TA 4H0WA 5I56B 3SKPA 5EHSA 3G3IA 2ONKE 4F3PA 3PGFA 2DWAA 3O29A 3KZGA 4PFWA 1UIVA 5CRYA 5CBSA 5I2NA 1OIBA 4JDFA 2R71A 3Q25A 1D9VA 4U2RA 1HSJA 5DEXA 1SD3A 2Z23A 4I1DA 3TZAA 3RQTA 1B6HA 3FATA 3HN0A 1MXWA 3S9MC 3HO7A 4BDRA 5TP9A 3B6TA 3V83A 1SI0A 5CMBA 3O6GA 1FQAA 1YPNA 2OLBA 4PFUA 2I0BA 4H8JA 4OZ9A 4NF5A 4F29A 4LZ7A 3FUZA 3KG2A 3FXRA 1S9TA 4OVJA 1FTLA 1B4HA 1LSTA 4RY1A 2CZLA 4PETA 1B51A 4F18A 3ILTB 3KN7A 3EN3A 2QJEA 1PDAA 1BP5A 1N3WA 4ELOA 5A5XA 3RT6B 2QS4A 3B6WA 5H8NB 4DXUA 4XKRA 2XX8A 5I57B 3N94A 2THIA 2XXQA 1LAFE 3OO9A 4ECFA 1O64A 4F1YA 3A3CA 1USYE 1O63A 1BKAA 4FEBA 4RNSA 2Y7RA 4F22A 4AB6A 3QXMA 1Y3PA 3LBSA 3U93A 3QYTA 1H76A 1MM7A 4HTGA 4AB5A 3IO6A 5I84A 4MH5A 3FGSA 3QUFA 3EQ1A 4FAJA 4N13A 4C0RA 5FHMA 3E4RA 3R6UA 1ZTYA 4IO3A 4AQ4A 1LB9A 1Z7ME 1PB7A 3LSXA 1URSA 2F7AA 5I59A 3IR1A 3K1MA 4YB7A 1XT8A 1UIUA 4U1OA 1LLSA 1R1NA 2VGQA 1M5FA 4NE4A 1WODA 4MLVA 5J1DA 3Q28A 3FZVA 4FORA 4OESA 2YJPA 2H25A 4IY6A 3CFLA 3KEIA 1ZIUA 1Y4CA 2BJJX 1OVTA 4UA8A 3MVXA 1MXXA 4OENA 3WAEA 2QS1A 4ZZEA 5H8QB 3MZBA 4G77A 2V84A 4OFLA 3MJNA 4LZ8A 1A55A 2AIXA 4ZEKA 3P7IA 2Y7WA 1O7TA 4EXKA 4BDOA 4P0IA 4POWA 5DVFA 1GTKA 4F3BA 1IXIA 4ZEBA 5AA2A 1MH3A 1D9YA 4QSCA 3MVWA 3K00A 3BBRA 4Z7EA 4YB5A 2HZKA 4RA1A 2HZLA 3MBPA 3T93B 4LVQA 1GVCA 1B0HA 4I9DA 4NWDA 4IO4A 1N7XA 1MS7A 3IOVA 2Q89A 1TXFA 1DMBA 4IO7A 4U4XA 5EYFA 3T9UA 1DOTA 3OELA 2UVIA 2O69A 3CVGA 2OWSA 4X1BA 2A5SA 3GZGA 4NTLA 1QUIA 4G68A 4RYAA 4JSOA 2F6GA 1GV8A 3IL1B 4NWCA 2X7PA 1Y3NA 3TDJA 4XKNA 3BKIB 1S7YA 3H6VA 2QSXA 1B58A 1MQJA 3C34A 1QUKA 2F5XA 2RCAA 5ICQA 4YAHX 3MWBA 4YKJA 4NF6A 4ZEDA 3RY3A 4QHQA 1A7LA 1LBCA 1EZOA 3KN3A 3OSRA 3MVYA 4LUBA 1N04A 1ZKBA 3G3GA 4QFKA 2DP8A 2XXPA 1JW1A 4KI0E 1M5EA 1QVSA 4FEDA 3THIA 2H5YA 2DXRA 4XXUA 3FJ7A 2XXHA 1ZJLA 4KQPA 5HPQA 2D5WA 1SQYA 3KOSA 3H6UA 4X1DA 2B65A 4GLIA 4G68C 3K02A 1TWYA 3RNNA 3VXBA 4BDQA 4H8IA 4TQUQ 1HSLA 2DWIA 2W7YA 2Y7PA 2R6GE 2V25A 1URDA 4DE8A 5AA2D 1Z7NE 4H5FA 5F1QA 4KHZE 3MVZA 1L5TA 2XXUA 1YTVA 1BLFA 3QUJA 4NMYA 1IXGA 5HBCA 5K2YA 3H03A 3QAXA 4DDDA 3DLNA 4RJZA 3OO6A 1JQFA 1N0TA 2PYYA 2QS2A 4XKPA 3N6TA 3TCGA 1QJMA 4KCCA 1SW5A 3U1OA 2ZYKA 1UTHB 2QS3A 1XC1A 2ZYOA 2Y7KA 3R26A 3OEMA 1SW2A 3VE1B 4PE5B 1B7UA 3TQWA 4PFYA 2I58A 1LFHA 1VR5A 1M5DA 4LONB 1PB8A 2RF1A 1UTBB 2RKMA 1URGA 2VP1A 3IK6B 3VLVA 4WKMA 5H8HA 4EQ9A 1A8EA 3OD7A 2I3WA 3OOAA 1OVBA 1MY3A 4FECA 1MDP1 3WAFA 4R9FA 4RK2A 3UK4A 3MC2A 1M5CA 3MAMA 1MH4A 2Q88A 5KDTB 1LAGE 4GD5A 3TCHA 3K1NA 1I69A 3KN8A 3TTKA 2F36A 4MF3A 4G2ZA 5KZTA 1B46A 3K6UA 1ELJA 1NL5A 4Q8RA 1BIYA 4ZZAA 4NF4A 2Z8DA 1DSNA 1LAHE 2HXWA 4PQJA 1WVJA 3D4CA 4NF8A 2A5TA 2Z8FA 5I56A 2NVUB 3JV9A 2HFBA 4ESXA 3UN6A 4ZECA 4ISUA 4POXA 3O9PA 4GF8A 2HCAA 1DPEA 4F31B 4FE8A 3KSXA 1B4ZA 3JZJA 3ZS6A 2O7IA 3S2VA 2Y7IA 3DP4A 2OJTA 2F78A 1NH7A 3VFJA 5TPAB 1MY0A 1IXHA 3CSBA 4U22A 1SW4A 4BDMA 1Y3QA 4F39A 3M8UA 3MPKA 1JW4A 4GXAA 1FW0A 4MFIA 3TTMA 1Y1ZA 4GIZA 2F6PA 1RKMA 3PPOA 1P1UA 3PD8A 3GXAA 3LUYA 3BFUA 4C1UA 4KR5A 5H8FB 4JB7A 4YICA 3MPLA 2QMWA 3KGCA 3CG1A 1II5A 5H8NA 1LCFA 4F3SA 3PUVE 5EHMA 5I57A 3T9HB 4OMBA 1B1XA 3C33A 1B05A 3FVOA 5DVIA 1WDNA 3PV0E
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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