2I6EA

Crystal structure of protein dr0370 from deinococcus radiodurans, pfam duf178
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
272
structure length
272
Chain Sequence
PYRAGWIHFTNVAPILDSLELPPGVTAITGVPTQMNAALLSGEVDIANVSAVEFIRHADTLAALPDFSVAVLGPVYSVNLFHTCPLPELRRVALTSQSAMSVALLEVLLRQKGLSPVLERAEGTAESLLAAGYDGVLRIGDDALREWYGVVGPLTPERTMTSLPHTGRGITVTDLAQEWFDLTGHPFTFAVWAYRKDNPPPAALLQAMREARRRGIGHLAEVSQRHAEKLGLPERVVQHYLWNFRYHLEAPDRLGLREFADLAVPGHAELTF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title X-ray structures of two proteins belonging to Pfam DUF178 revealed unexpected structural similarity to the DUF191 Pfam family.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Deinococcus radiodurans
molecule keywords Hypothetical protein
total genus 82
structure length 272
sequence length 272
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02621 VitK2_biosynth Menaquinone biosynthesis
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i6eA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i6eA02
3T9HB 2UYFA 4I62A 2PT2A 2ANJA 1AMFA 3KOTA 1PBPA 1WODA 4KHZE 1QW0A 4QFKA 1NNKA 4F22A 2DE3A 1POTA 2F78A 3H6UA 3EHTA 5F1QA 3QK6A 2HCAA 5KCJB 5I2KA 1Y3PA 5I57A 4WEPA 3S9NC 3OEKA 3U94A 1JEVA 3IL1B 1GGGA 4EQ9A 1SVXB 3OO7A 1O7TA 4GWOA 1BIYA 3G3HA 3H3GA 1Q1KA 3PUWE 3O28A 1ZBMA 4OFOA 4IO4A 3D4GA 5DEXB 4GOTA 3C32A 5DVFA 4DDDA 2ONKE 2XXTA 1A40A 1IZ1A 2VGQA 4GXAA 2HAUA 3USDA 1I6BA 2I4BA 2ZNTA 5CMBA 2XXYA 1PEBA 3G3GA 5L9SA 4X1BA 1T0KA 1OVTA 1HSJA 1B9JA 3OMBA 3DP6A 1ZLQA 4IO5A 5JK4A 2DWJA 2QMWA 2ESNA 1A54A 3VVEA 1LAFE 3HCQA 3BKIB 3KJ7A 4QRZA 3KSXA 1P1NA 1MY3A 1PDAA 5CBSA 1J1NA 3IOWA 4RYAA 5I2NA 3VE1B 3OSQA 5KDTA 3K00A 3QUJA 4IY5A 2QL3A 4U4SA 5EHSA 4PQJA 1MY1A 2QPQA 2OZZA 3O66A 4ND9A 3SESA 3Q26A 1GV8A 4JWXA 2V84A 2HXWA 1QKAA 3VLWA 1TXFA 4LA9A 3DP8A 4PP0A 4H8JA 1SW4A 5FTIA 3SETA 1IXHA 1EH3A 4QF9A 4R75A 3N26A 2Q89A 1H3DA 1WVJA 5H8QB 5CMKA 5L8DA 2A5SA 1DTZA 1SDXA 2IA4A 1SYHA 4LZ8A 3CSGA 4G2ZA 4HCYA 4C1UA 4TLLB 4NF4B 1B5IA 1MDP1 1MXVA 5JTYA 4TQUQ 3TPAA 2Y7KA 4GLIA 5I56B 3IB1A 2F5XA 2I48A 2QS4A 4ONYA 3T9VA 3W9VA 1R9LA 2HEUA 3VV5A 1LAXA 1SW5A 2Z23A 3H7MA 4OFJA 3VLUA 1SQYA 5TPAB 1IQ7A 3PMXA 3RT8A 2I0BA 4LQ2A 2OJTA 4QSCA 2VP1A 1LB9A 4H5FA 2G93A 5EHMA 2I58A 1ZKBA 1AOVA 4GIZA 3N5LA 4BDMA 3K6UA 1B0HA 1D4NA 4IGTA 3OEMA 2HFBA 5AA1A 2PX1A 3MVXA 2XXQA 5ISUA 2BJJX 4U21A 2B3FA 4KD5A 1B05A 1Z7NE 3MVZA 4JB7A 2YLNA 4ECFA 5H8HA 2PMSA 2F35A 5DVJA 4LONB 4JBZA 1YTVA 4XXUA 4AB5A 4U1OA 4QSDA 3PUXE 2QSXA 1B46A 3B6WA 2V3TA 4M1VA 4DXBA 1EZ9A 2AIXA 1NH8A 2ONRA 4F3BA 1A7LA 4TOZA 4FJPA 1JNFA 4OENA 4EQBA 1TFAA 2E1SA 5AA4B 3LC8A 3B7DA 2PBWA 3MVYA 2DQVA 1B3EA 4JWYA 3OENA 3H06B 4QFOA 5BWJA 1MY0A 1Z7ME 3O97A 5K2YA 5ITPA 3CR9A 1N3XA 3D4CA 1YPNA 4FEDA 3H6WA 1LAGE 3PPOA 3CG3A 3IORA 4H65A 1MM7A 5ELVA 3S2VA 4OMBA 3K02A 1I6AA 4I9DA 1LFHA 1QJMA 3N6TA 4G68A 2H99A 5H8NA 3FJ7A 4IGRA 2G29A 4R2FA 4RJZA 2F7BA 1MPDA 3M3LA 5B70A 3DLNA 2DVZA 4RPNA 2O1MA 5KZTA 5HPQA 2Y7RA 4EDPA 2I3VA 5AA2B 1TFDA 4U2RA 5CMMA 4NF5A 3HPIA 1DPEA 4RA1A 1MQDA 3O6GA 1Y9UA 4ZEFA 1AIVA 2F36A 2DVCA 3PD8A 1Y4TA 4Q30B 1USYH 3ODBA 4BLAA 3VDFA 2ONSA 2Q8JA 3FVGA 3DM0A 3W15C 1FW0A 4XKNA 1B7HA 4DE8A 3FUZA 3EPEA 4G8NA 5H8SA 1UTBA 1B3FA 1PB8A 4F3SA 1LCTA 4NTLA 4JSOA 5J1DA 1RKMA 4OXVA 3JZJA 4U22A 1YAEA 3KN8A 2V3UA 4KYSA 1QKBA 1N7XA 4YB6A 2P2AA 2I49A 1B52A 2GHBA 4YMAA 4PFWA 2F6GA 4IO7A 4KPTA 3U72A 3S9EA 4N07A 3JYRA 3ZKLA 4FIMA 2ALUA 3RLFE 4OERA 1MQJA 1PC3A 4N6PA 4DXUA 1Q35A 3FGSA 1XC1A 1URGA 4O3BA 2H9BA 2XD2A 4PFYA 4GXSB 2DP8A 2LAOA 3FXUA 2O51A 1H44A 4KCDA 3G3IA 3G3KA 2Z8FA 2V25A 1XHYA 3C31A 2XXUA 2XX7A 3CFXA 3LSFB 3HO7A 2RC7A 3PPPA 1MQHA 4F3PA 3TUSA 3MZBA 4EQ7A 1NMUA 4XKPA 3U1OA 4OHNA 2UVHA 1B3HA 4JSDA 3QXMA 3IJOB 3TELA 2M8CA 3EHUA 3FVNA 2Q2CA 2ABHA 4WEDA 1GR2A 4ZEKA 1LBBA 1UTHA 2O7IA 2DXYA 1MRPA 4U1ZA 5I56A 3MQ9A 3VXBA 4MFIA 3C34A 2XXHA 4ZEDA 1UIUA 3CFLA 4JWOA 4F29A 1P1QA 3TEPA 1MH4A 2X7QA 3TDJA 1B7UA 2AL5A 1JVYA 3PD9A 4KYEA 3K2DA 4DCYA 2B65A 3H6TA 3PPQA 3IOVA 3TTMA 4QFPA 4NF8B 1YCJA 4OFLA 4YKIA 4Z7EA 4C1TA 1O64A 1ZMGA 2GHAA 1JW5A 4EXLA 3U92A 3RTWB 3LUYA 4YKKA 5TP9A 1B0LA 4MLVA 4XKRA 4PETA 1MXZA 4DCXA 4LVQA 3KN7A 1F9BA 4ZECA 1IXGA 3VFJA 5FHOA 1NNTA 2OK2A 4ZE8A 5DVIA 4OTEA 1FQCA 3PPRA 2PYYA 3EF7A 3FJGA 4RY1A 2Z22A 4F19A 3VVDA 3FV1A 3RTFB 1R6ZA 1FTMA 4C0RA 1DOTA 3VLVA 3FD3A 2I6EA 2V3QA 4Z0IA 2GFEA 4FECA 4I1DA 3M8UA 3PGFA 4LQ5A 2DWHA 4KYDA 3K0VA 5I59B 4NF6B 3CG1A 1I6QA 3FATA 2OWTA 2OLBA 3TMGA 3OO9A 4QHQA 2NVUB 1H43A 3SEXA 2CMOA 5I58B 1OLCA 2A5TA 3S4UA 2ZYKA 3I5OA 2DOJA 3KG2A 3MC2A 1MXWA 2ZYNA 1B1HA 1B7ZA 4FATA 1MQIA 4F1VA 3V83A 2RKMA 3KGCA 4OQOA 2RF1A 1FTLA 4R6YA 2H25A 2HQ0A 5H8FB 5I2KB 5I57B 3A3CA 2H4IA 4GQOA 2X7PA 3R6UA 4H5GA 1TT1A 3Q25A 2QS1A 3MWBA 3WAFA 3MPKA 3UGWA 3ONMA 3RPWA 2OBGA 4G8HA 4FE8A 3SEWA 3DELB 1XVXA 3W9WA 3IJXB 2D5WA 1P99A 1ZTYA 2REGA 1DPPA 4H8IA 2ZXTA 2F8DA 2V93A 1GTKA 4JXIA 2XXRA 5FHNA 3SDFA 3OXNA 1IXCA 5ITOA 3B6QA 3T22A 2F97A 2I0CA 3GXAA 3MZ9A 2O69A 3U8QA 1LCFA 4F1UA 4L17A 1LFIA 1IIWA 1B6HA 1H76A 3RNNA 1B58A 2O68A 4ELOA 1VR5A 2UVIA 3LSXA 4YZZA 3IR1A 2QS2A 4MH5A 5I2NB 2XXXA 5KDTB 1P1UA 1DSNA 3AXFA 3E3KA 3KN3A 3TAJA 1FCKA 5DTBA 4K3FA 4P11A 3CIJA 2H5YA 3KEIA 4GRKA 1OVBA 5IKBA 4YAHX 2Q88A 1B51A 1FTOA 3GZGA 1XS5A 1JETA 4XTCQ 1N0TA 3UP9A 4AQ4A 3ZKKA 1B1XA 1ELJA 5A5XA 3T66A 5DYHA 1PB7A 3FIRA 4H0WA 3DP4A 4G4PA 5L9MA 1QULA 1SYIA 2DSFA 4HTGA 3RN8A 1P1OA 2PT1A 3UN6A 4GL8A 2NUVA 3G3JA 4BDNA 4EF1A 1OQHA 2P0SA 5DT6A 4ZZEA 5B7DA 4DLDA 1XOCA 1B40A 3T93B 3PUVE 5JTYB 2D21A 1VFDA 4F2OA 2QS3A 2XX8A 3T9XB 3UA8A 5KCJA 3TQWA 1EZOA 1A99A 4TLMB 1PBQA 1BKAA 2QJEA 1USYE 2O1LA 4F2QA 4O3AA 3F11A 4HW8A 2KLFA 2VD2A 3O6IA 3IO6A 4EXKA 3MP6A 3O9PA 4NEDA 5DEXA 3R26A 4EUOA 3G7WA 3RY3A 2Y7WA 4P0GA 1M5FA 1VFEA 3K6WA 3RGYA 1SI1A 3PMWA 3TTRA 3IB0A 5BUUA 3QYTA 1TWYA 2VOZA 2UXAA 5CBRA 4DXCA 1LB8A 1R1NA 3I3VA 4YICA 2Y7IA 1MDQA 2PVUA 5FHMA 1M5BA 2HZLA 2UVGA 4NE4A 3FVOA 1IXIA 3MPLA 1URSA 1B3LA 4RNSA 4R73A 4IB2A 4ESXA 3KZGA 4R6HA 4X48A 5I84A 3R7XA 1A8FA 4U4XA 3H6VA 4R9GA 2DE2A 2REJA 4NWCA 3PUYE 5FTHA 5CMCA 4LZ7A 3CI8A 1Y4CA 2XHDA 4X1DA 2DWAA 2O84X 4BDRA 3H03A 3SEYA 3T9UA 3L6GA 1RYXA 4LATA 1O63A 2RINA 4THIA 1FQDA 3EN3A 2UYEA 2XXPA 1D9YA 1N04A 1A8EA 4IO6A 2HAVA 3TCHA 4YKJA 3A3UA 2ZMBA 1ZU0A 3T96B 1XVYA 3PMVA 4WKMA 3P7IA 3IK6B 5HM4B 5ICQA 3C4MA 1FQEA 3OO8A 4GFRA 1NNPA 4RK9A 5H8QA 1S50A 1URDA 2FNCA 2DWIA 3O29A 2H98A 2DS9A 2ZYOA 4NF4A 4ELRA 3MJNA 1D3KA 2NWJA 3RQTA 1CB6A 4G68B 4G77A 4XKQA 2W7YA 2NOOA 5H8NB 1LGBC 4FEBA 1US4A 4ZZAA 1MH3A 3FJMA 3OOAA 1MXXA 4ELPA 4KR5A 3LSWA 5H8FA 4IY6A 3K01A 5TPAA 1NNFA 1MS7A 2X26A 4NMYA 1KWHA 1B3GA 3MVWA 1B5JA 3TTLA 4BDQA 1NFTA 1NKXA 3C35A 4OESA 4NF5B 1QUJA 3K1MA 4R72A 2R9JA 2UVJA 1Y1MA 1ZJLA 2P1SA 3I6VA 3IO4A 2RCBA 4YMBA 3G3FA 4UACA 4G68C 1MXYA 4MLQA 3MP1A 1B4HA 1IITA 1DMBA 4ZE9A 4E0WA 3KBRA 1MQGA 4PE5B 4P0IA 1UTBB 1A55A 5CM6A 1IUDA 3V8XB 3SEVA 3FVKA 3S9LC 2RCAA 3SERA 4UA8A 3ZSFA 3MZ1A 1MM6A 3HSTA 4OZ9A 4F31B 5CI5A 4GF8A 4BDOA 4H6DA 1US5A 1QVSA 1XT8A 2DE4A 3ILUB 3MP8A 4OEUA 5AA4A 1N7WA 3TKDA 1ANFA 3FZVA 5CRYA 3TZAA 3IOUA 4H67A 5ICTA 1N76A 4QFNA 3IAZA 1GVCA 4GL0A 4OYVA 1B2HA 1LLSA 3O6HA 4OWDA 3FV2A 2ZNSA 3FXQA 5EYFA 5L9OA 1MXUA 2AL4A 2CZLA 3TFLA 2YPNA 2I4CA 4KCCA 2ZYMA 3PV0E 4DIGA 2R71A 3LBSA 2VHAA 2E0SA 3PU5A 3TODA 3RUMA 3CVGA 1NH7A 4R74A 2RC8A 3TTKA 1M5CA 3V5AA 1N3WA 3Q28A 4OETA 3A09A 5IAIA 2XD3A 1SI0A 3V89B 1MPCA 1UTHB 5HBCA 4JDFA 3CFZA 3N6UA 3TQLA 3GBBA 1FTKA 4M4GA 1PB9A 1AL3A 3QIMA 2QRYA 1OMPA 4IO3A 2YJPA 2DXRA 5AA2A 4KFQA 3UORA 4HS7A 1DTGA 1HSEA 1JQFA 3KSJA 2GH9A 3OELA 1MY2A 4FAJA 5AE4A 1Y1ZA 3FXRA 5F7VA 2QMXA 1BTJA 1OQGA 4E0XA 1SW1A 3KFMA 2F6PA 2ZNUA 2VD3A 4U23A 3CSBA 1ATGA 3LR1A 5TP9B 2Z8EA 1NL5A 1EZPA 5JEIA 3E9XA 3WAEA 3K1NA 4N13A 3MBPA 3BFUA 4YU0A 1VE4A 2R6GE 4G8MA 3TTNA 3M3FA 2DYXA 3FASA 4Q8RA 2OWSA 4XIGQ 1Y3QA 5M2VA 3M3KA 1FQAA 2FA7A 5AA3A 5LOMA 1WDNA 3BBRA 3TYHA 3Q29A 3CRBA 4POXA 2THIA 4KI0E 4QFLA 3O2AA 4O3CA 3UIFA 4RK2A 1H45A 1M5DA 1N84A 1RYOA 4ISUA 3H4ZA 1B5HA 4YKPA 2Z8DA 2Y84A 1L5TA 3HHGA 4ZDMA 3ILTB 2Y7PA 4RPOA 3THIA 4ELQA 4IO2A 1SD3A 2XXVA 3E13X 4F39A 4X9TA 3VXCA 3GLBA 5CC2A 1CE2A 3MAMA 3HN0A 2RC9A 3EHSA 1MG1A 4EF2A 1POY1 1JEUA 4KQPA 4LUBA 2AYSA 4LP2B 1P1WA 1M5EA 4R2BA 1OLAA 3OSRA 3ZS6A 4WXJA 2XXWA 4ZEBA 1FTJA 2Q9TA 1BP5A 2A5TB 1LAHE 4NWDA 4F1YA 1SBPA 3U93A 1QUIA 4PFUA 4ZS9A 2NXOA 5AA2D 4YB7A 1I69A 4Q0CA 3MUQA 3KOSA 1LSTA 2D3IA 3EQ1A 4Q5TA 3N94A 2F7AA 3IOTA 3BFTA 4FORA 5K2XA 1R9QA 1EU8A 3VVFA 3JV9A 2XX9A 3PPNA 4H1XA 2Q2AA 1OIBA 1QUKA 3HHFA 4NF8A 4MBPA 3K4UA 2F34A 4BDLA 1B4ZA 1II5A 3C9HA 1MPBA 1D9VA 3K6VA 1S7YA 4MF3A 3L6HA 4PFTA 4OEVA 2O7UA 5TU0A 1UIVA 2OCUA 4GD5A 2WKYA 2HZKA 3E4RA 3LSLA 3PUZE 4LZ5A 4RXLA 5H8HB 3B6TA 3K6XA 4QSEA 4F3GA 2B3BA 1AH5A 1VSOA 1B32A 3SKPA 4F18A 1JW1A 1ZIUA 4HCWA 2IEEA 3GBAA 4I8CA 3RT6B 3KJTA 1UQWA 4R6KA 1FQBA 3QSLA 1BLFA 4R9FA 4ZEIA 3TCGA 1Y20A 2FYIA 3UK4A 3HV1A 1S9TA 3S9MC 1SW2A 1MY4A 1JVXA 3OD7A 1HSLA 3SEUA 4AB6A 5I59A 4NF6A 4YB5A 1JW4A 3IX1A 3MW0A 1FQFA 2I3WA 2F7CA 2GRVA 3IB2A 3TCFA 3OO6A 3QUFA 3Q27A 3QAXA 5A5XB 4ESWA 3C36A 4GVOA 4DZ1A 1IEJA 5I58A 2O6AA 4POWA 3ECRA 3C33A 2XXIA 1LFGA 1Y3NA 3K1PA 4OVJA 1LBCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ZZWA 2UYFA 3T9HB 4I62A 2PT2A 2ANJA 1AMFA 3KOTA 1PBPA 2GQ1A 1WODA 4KHZE 1QW0A 4QFKA 1K9ZA 1NNKA 1FPDA 4F22A 2DE3A 1POTA 3PTYA 1FPGA 2F78A 2XA5A 3EHTA 3H6UA 5F1QA 3QK6A 2HCAA 5KCJB 5I2KA 1Y3PA 5I57A 4WEPA 3S9NC 3OEKA 3U94A 1JEVA 1RDYA 3IL1B 1GGGA 4EQ9A 1SVXB 1LBYA 3OO7A 1O7TA 4GWOA 1BIYA 3G3HA 3H3GA 1Q1KA 3PUWE 3O28A 1ZBMA 4OFOA 4IO4A 3D4GA 5DEXB 4GOTA 3C32A 5DVFA 1SPIA 4DDDA 2ONKE 4OVQA 2FHYA 4N6DA 2XXTA 1A40A 1IZ1A 2VGQA 4GXAA 2HAUA 3USDA 1I6BA 2I4BA 2ZNTA 4O8MA 5CMBA 2XXYA 1PEBA 3G3GA 5L9SA 1LEVA 4X1BA 4MEVA 4X04A 1T0KA 1OVTA 1HSJA 1B9JA 3OMBA 3DP6A 1ZLQA 4IO5A 3GYYA 5JK4A 3RPLA 3KC1A 2DWJA 4NN3A 2ZZVA 2QMWA 2ESNA 1A54A 4MNCA 3VVEA 1LAFE 3HCQA 3BKIB 3KJ7A 4QRZA 3KSXA 1P1NA 1MY3A 1PDAA 5CBSA 1J1NA 2QVUA 3IOWA 4RYAA 5I2NA 3VE1B 3OSQA 5KDTA 3K00A 3QUJA 2JJKA 4IY5A 2QL3A 4U4SA 5EHSA 4PQJA 2Y5KA 1MY1A 2QPQA 2OZZA 3O66A 4ND9A 3SESA 3Q26A 1GV8A 4JWXA 2V84A 2HXWA 1QKAA 3VLWA 1TXFA 4LA9A 3DP8A 4PP0A 4H8JA 1SW4A 4N15A 5FTIA 4N4UA 3SETA 1IXHA 1EH3A 3EKIA 4QF9A 4R75A 3N26A 2Q89A 1H3DA 1WVJA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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