2I6EA

Crystal structure of protein dr0370 from deinococcus radiodurans, pfam duf178
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
272
structure length
272
Chain Sequence
PYRAGWIHFTNVAPILDSLELPPGVTAITGVPTQMNAALLSGEVDIANVSAVEFIRHADTLAALPDFSVAVLGPVYSVNLFHTCPLPELRRVALTSQSAMSVALLEVLLRQKGLSPVLERAEGTAESLLAAGYDGVLRIGDDALREWYGVVGPLTPERTMTSLPHTGRGITVTDLAQEWFDLTGHPFTFAVWAYRKDNPPPAALLQAMREARRRGIGHLAEVSQRHAEKLGLPERVVQHYLWNFRYHLEAPDRLGLREFADLAVPGHAELTF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Deinococcus radiodurans
publication title X-ray structures of two proteins belonging to Pfam DUF178 revealed unexpected structural similarity to the DUF191 Pfam family.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Hypothetical protein
total genus 82
structure length 272
sequence length 272
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02621 VitK2_biosynth Menaquinone biosynthesis
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i6eA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i6eA02
2F97A 5CBSA 1WODA 2F78A 3UIFA 4ZZAA 1H44A 3OEMA 1JQFA 3U1OA 3MZ9A 4KYEA 3PUZE 3CFXA 1MH4A 1NH8A 1LSTA 3K2DA 2V3QA 3KJ7A 2ALUA 3PU5A 3ONMA 2VOZA 1LBCA 3T96B 4RNSA 1N3WA 3TTRA 4N13A 1R9QA 2F7AA 1B3HA 3Q29A 3KSXA 3TDJA 1MS7A 5AA2A 1H43A 1N7WA 3FXQA 3U72A 4F31B 3KOSA 2V25A 2O84X 1AL3A 3OO7A 1SW4A 1Z7NE 4WKMA 3RNNA 4F1YA 4G68B 2HAVA 1SBPA 4OMBA 3K1PA 2D5WA 2GFEA 3TYHA 2AL4A 2H5YA 3IB0A 3CFLA 4NF5B 5CRYA 3SEVA 3B6TA 5A5XB 4K3FA 3UA8A 3H6VA 3T9XB 4TLMB 1FW0A 1MQIA 3K1NA 4X48A 3A09A 2XXPA 1Y9UA 4RA1A 4ELQA 1H45A 3MWBA 4UA8A 2PT1A 5AA1A 3QAXA 4U21A 1ZMGA 1VSOA 1XS5A 4R9GA 1MH3A 3O9PA 4YKIA 1GV8A 2A5SA 4RK9A 4LZ7A 3SERA 1ZKBA 3TTKA 1MRPA 4Q5TA 4KCCA 3JZJA 1M5BA 2XXQA 4GD5A 1FQAA 4QFKA 4PFUA 3ODBA 1FQFA 5H8HA 3KEIA 3TQWA 1LAGE 5DVIA 4KFQA 3K6UA 5F7VA 4GF8A 3V89B 1UTBB 3IB2A 5ITPA 1N04A 4HS7A 1SQYA 4IY5A 4JSDA 2UVIA 4DCYA 2UVGA 1TWYA 4H65A 4XXUA 4HW8A 3T66A 2ONSA 3FV1A 3MQ9A 3E13X 1GGGA 4EF1A 2I4CA 3GBAA 1LCFA 3QIMA 1NH7A 5AA2B 4LP2B 4RYAA 3TKDA 4OESA 3VVDA 1II5A 3O2AA 1POTA 3IOVA 2VD2A 3VDFA 4LQ2A 3TCFA 4H0WA 1MXXA 2DXYA 1N3XA 2OWSA 2I3VA 4OFJA 3T93B 4JWYA 1P1QA 2O7UA 1SW1A 3TQLA 2XHDA 3UK4A 3SDFA 1GTKA 5KZTA 2QPQA 1H3DA 4X1DA 3UP9A 1LBBA 5DEXB 1QKBA 4RY1A 3MC2A 3GLBA 1B7UA 2Y7KA 5CM6A 1IXHA 2XXIA 1UIVA 5DT6A 2P1SA 3M3FA 4LVQA 1A99A 5K2YA 4YMBA 3IOWA 1N84A 5HBCA 1UTHA 1QKAA 1Y4TA 1Y1MA 3GBBA 2XXHA 2QMWA 4XTCQ 5H8SA 1TT1A 5I84A 1KWHA 2DE2A 3SEWA 3VFJA 5I56B 2ZXTA 1MY3A 1DTGA 3OMBA 4H8IA 1HSJA 4GWOA 3UGWA 3K01A 5H8HB 4ZEBA 4QSCA 1CE2A 3RY3A 1Y3QA 4FEDA 2LAOA 4G77A 4U1ZA 4TOZA 4FECA 3B6WA 1FCKA 3DP6A 3H06B 4BDLA 3U94A 1M5DA 5H8NA 2RF1A 4IO3A 3IB1A 4H5FA 4EUOA 3W15C 3FJGA 4FORA 3VLVA 1FQEA 4YB5A 4YKJA 2HZKA 4OFOA 2FYIA 2UVHA 5JK4A 3CIJA 1JVXA 5CMMA 4NWCA 2Y84A 4F2OA 4I8CA 2PVUA 3HV1A 4NF6B 3RTWB 1B5IA 3PPPA 1L5TA 2O68A 3TAJA 5B70A 1B2HA 5DYHA 3V83A 4GQOA 1Z7ME 3H7MA 3TCHA 1MQJA 1JETA 1B9JA 2ZYKA 3G3HA 5IKBA 4GXAA 2F7BA 1SI0A 3IJXB 4GRKA 1OLAA 2OZZA 5H8FB 4QHQA 4JWOA 4F3GA 2FNCA 4Z7EA 4P0GA 3B6QA 3TZAA 1QVSA 3RPWA 1IXIA 3OO8A 3Q25A 3D4GA 4OWDA 3OENA 4R6HA 3HO7A 2HQ0A 1FTMA 2H99A 1M5CA 2THIA 3O6GA 3V8XB 3VLWA 4YICA 2A5TB 5B7DA 4EF2A 4G4PA 4G68C 1UQWA 4LONB 1ZIUA 4AQ4A 1S50A 4ZEDA 1B1HA 1M5EA 2QRYA 3S9LC 1YAEA 3KG2A 1US5A 2OBGA 3A3CA 3IX1A 1N76A 2VGQA 4HTGA 3C35A 5M2VA 4PETA 3EHSA 4O3BA 1SI1A 1S9TA 4AB6A 3MUQA 3TTMA 2QSXA 3F11A 2O1LA 1NNFA 5FHNA 4IB2A 1MQHA 4C1TA 4EQ9A 2O51A 4KQPA 5A5XA 1DMBA 4EQ7A 1B6HA 3U92A 4M1VA 1BP5A 1PB8A 3KBRA 3IL1B 1FQBA 1F9BA 3K0VA 2Q2AA 1EH3A 3G3JA 4U22A 4R72A 4E0XA 2F36A 1URGA 3OELA 3UORA 2DWIA 2P2AA 1B52A 2Q8JA 4F1UA 4I62A 1TFAA 2UYFA 4ZEFA 4JXIA 2DXRA 3PD8A 4DZ1A 3HPIA 4LZ8A 1D9YA 1EU8A 1A8EA 1ELJA 1B5HA 1P1UA 2E0SA 3Q28A 1NNKA 4ZECA 5AA3A 3H4ZA 3FASA 4RPOA 1DPEA 2ZNSA 1UTBA 1LAXA 1VE4A 3MVXA 3I6VA 4IGRA 1I6QA 1B32A 3PV0E 4BDMA 2ZYMA 4F18A 1B3EA 4ZS9A 3PUWE 3N6UA 2DVZA 4LZ5A 4BDNA 4ZDMA 3G3FA 2BJJX 1M5FA 3EHUA 4YAHX 2PYYA 3GZGA 3K6XA 2RC9A 2OWTA 3DM0A 1LFIA 4F22A 4F3BA 1IXGA 2WKYA 3SEUA 3KFMA 3PPQA 4C0RA 4N07A 3IK6B 3Q26A 1MPCA 4N6PA 3KGCA 1OMPA 3FVGA 2O7IA 1B7HA 4DDDA 1TFDA 5HM4B 4NMYA 5DEXA 1GR2A 3RGYA 1I69A 4KI0E 1AIVA 3FATA 1D9VA 5L9MA 3IORA 2PMSA 4Q8RA 4QFNA 4U23A 4NE4A 3H6WA 2IEEA 4GFRA 1MDQA 3R26A 1HSEA 1LFGA 3E4RA 4IO2A 5IAIA 4YB6A 2KLFA 4R2BA 1USYE 4ELOA 4PQJA 1LB9A 5LOMA 3OEKA 5I56A 1J1NA 1OVTA 4DCXA 1O63A 2HAUA 1O7TA 4GLIA 4YB7A 4X1BA 1JEVA 2B3BA 4KR5A 1B1XA 1URSA 3G3IA 4F2QA 3OSRA 4IY6A 4HCWA 4TQUQ 3JYRA 2DVCA 3CR9A 3W9WA 4Q30B 1AH5A 1B3FA 3RT6B 3FXUA 2ZMBA 1XC1A 5DTBA 4BDRA 1NL5A 1R9LA 3C32A 4DXCA 4MBPA 1ATGA 3ZKLA 3S9MC 3I5OA 5CMKA 1N0TA 3CG3A 2Y7PA 2I6EA 4OENA 2DYXA 1XT8A 2OK2A 3FVNA 5CBRA 4OHNA 5BUUA 4U4XA 3MPLA 3CG1A 4DE8A 4NF6A 3TUSA 4RXLA 4FJPA 2XXYA 1MY4A 1MM7A 1XVXA 2REJA 1Y20A 3C31A 4IO7A 4IO5A 3U93A 3P7IA 4U4SA 2DWHA 3IO4A 3I3VA 1BKAA 3VVFA 2IA4A 5HPQA 4OEVA 1MQDA 3LSLA 2H98A 3T9UA 5FTIA 4MF3A 1B40A 2R9JA 2OCUA 1IIWA 3FJMA 5H8FA 4QFOA 1MXYA 3MW0A 4KD5A 3H6UA 2ANJA 3L6HA 3EF7A 4GOTA 3QXMA 3M3LA 4ZEKA 1IUDA 1N7XA 2Y7WA 5CMCA 3VE1B 4O3CA 1Y1ZA 2XD2A 3QYTA 2XD3A 2F34A 5FHMA 3OXNA 2ESNA 3DLNA 3KN7A 4XIGQ 2A5TA 2ZYNA 3LUYA 2DWAA 4IGTA 2Y7RA 3IOTA 1Y3NA 1QULA 5JTYB 4H5GA 3FVKA 1MDP1 1MG1A 2Z8FA 1JVYA 2DWJA 2ZNTA 1NNPA 1B4ZA 4LATA 4OVJA 1SYIA 1A55A 4YMAA 1URDA 3GXAA 3FJ7A 5KCJA 3LSWA 4X9TA 3BFUA 1QW0A 3SETA 1A54A 4PFYA 2G93A 4UACA 3FZVA 1VR5A 2E1SA 3KSJA 1SW2A 3HHGA 1SVXB 1ZJLA 4PFWA 5ITOA 3THIA 2I48A 3Q27A 2XXTA 1OQHA 2I0CA 1RYOA 1B0LA 3H03A 1MPDA 3N94A 4G2ZA 3RTFB 4H1XA 3HHFA 1PB7A 2RKMA 2Q2CA 3OO9A 3TFLA 4IO6A 3O6IA 2V3TA 3C33A 3O28A 3UN6A 5L9SA 2X7QA 4MLQA 5EHSA 4OXVA 4F29A 1SDXA 1B05A 1I6AA 3E9XA 3K02A 1LCTA 5BWJA 3TPAA 4DXUA 3KZGA 2RCBA 3O6HA 4F19A 3FXRA 4XKRA 2YPNA 5F1QA 3LBSA 2VHAA 2B65A 5H8QB 3CFZA 5I2KB 4FATA 1QUKA 3TTLA 3HCQA 4GXSB 4FIMA 3VLUA 1NFTA 3S2VA 4QFLA 3QUJA 1B58A 4NEDA 1NMUA 2Q9TA 2CZLA 3R7XA 3N5LA 4F3SA 4GIZA 2UYEA 3OSQA 1B4HA 1JW5A 2O69A 4R75A 4KCDA 5KCJB 1PC3A 4NF8A 4XKPA 1YPNA 3JV9A 2QMXA 1FTLA 5DVFA 1EZOA 4IO4A 1GVCA 4FE8A 1Q35A 2I3WA 2RC8A 3TEPA 3RN8A 4R6YA 2CMOA 2V84A 1D4NA 3MJNA 2ZYOA 1PB9A 2DP8A 3CI8A 3S9NC 5ISUA 2ABHA 1XVYA 4I9DA 2AYSA 2PBWA 3CRBA 4ND9A 4OETA 1Y3PA 2NUVA 5L9OA 2W7YA 3DELB 3KN3A 2O1MA 3FD3A 4TLLB 3IAZA 3O29A 4EXLA 1MM6A 5CI5A 3M8UA 3EQ1A 2XX7A 5I57A 1FTJA 4ISUA 4THIA 3K1MA 1P99A 2G29A 4EQBA 3D4CA 4G8NA 2DE3A 4U2RA 2NVUB 2YJPA 3S4UA 4EDPA 1LB8A 2GHAA 3IO6A 3PUYE 3MAMA 1Y4CA 5AA2D 1LGBC 2Z8EA 3C36A 2H25A 4KYSA 1JW1A 1PBQA 1VFEA 3SESA 4MLVA 2GHBA 1AMFA 4RJZA 3PD9A 1US4A 3MZ1A 4NF8B 1WDNA 2HXWA 2OLBA 1HSLA 3T22A 1LAHE 1BIYA 5TPAA 2H9BA 1SW5A 3TODA 4JDFA 2I4BA 2Y7IA 3ECRA 2NWJA 1FTKA 1LFHA 1MXUA 2AL5A 3PMVA 3N26A 4BLAA 2B3FA 1P1OA 3OOAA 1PEBA 5I58B 1D3KA 2RINA 4QSEA 3SKPA 3CVGA 1DTZA 5JEIA 1FQDA 2DS9A 3M3KA 4QRZA 2Z22A 3IJOB 3RT8A 3VV5A 4L17A 2NOOA 2QS3A 1OLCA 4KHZE 1IZ1A 4GL0A 4QFPA 2I58A 4JSOA 4ESXA 5L8DA 3TMGA 4F1VA 5I57B 3LSFB 3PGFA 1MQGA 3OD7A 2O6AA 1H76A 4YZZA 1IXCA 1JW4A 2FA7A 4F39A 2D3IA 1FQCA 5JTYA 3WAEA 1A8FA 2D21A 3B7DA 1NKXA 3PUVE 3W9VA 3SEYA 2RC7A 4OQOA 1RKMA 4ZEIA 2QL3A 1B5JA 3PMXA 4Q0CA 1RYXA 5ICTA 3C9HA 3N6TA 4DLDA 2HZLA 2XXUA 4YKKA 1QUJA 3SEXA 1OVBA 3PMWA 2XXVA 4WEPA 4PE5B 1LAFE 4RPNA 4XKNA 3T9HB 5FTHA 2RCAA 5TPAB 5DVJA 3K4UA 1USYH 3MBPA 1IEJA 3HN0A 4OZ9A 1MY0A 2GH9A 3BKIB 4AB5A 4ZZEA 1OIBA 3PPRA 1MXVA 5EYFA 4MH5A 4H8JA 1MPBA 5EHMA 3RQTA 4KPTA 1BLFA 4E0WA 2OJTA 5ICQA 4R73A 5CMBA 4HCYA 4ZE9A 4NTLA 1PDAA 2XXWA 4R74A 2I49A 4M4GA 4YU0A 1B7ZA 3BBRA 3RUMA 2V3UA 3OO6A 4GL8A 2PX1A 2X26A 5AA4A 4RK2A 2R71A 3TTNA 2XX8A 4NF4A 2F6PA 4BDOA 1CB6A 3LSXA 2ONKE 2XXRA 3VVEA 2NXOA 3PPNA 1DPPA 4OERA 4F3PA 5I2NA 4ONYA 2QS2A 2X7PA 1YCJA 1P1NA 3MP6A 3S9EA 4H6DA 5H8QA 2R6GE 3ZSFA 4C1UA 3ILTB 2XX9A 1MXZA 5I2KA 2F8DA 4O3AA 5K2XA 1R1NA 4JBZA 4PFTA 3PPOA 3QSLA 2F7CA 2F35A 5KDTA 4KYDA 1IITA 2M8CA 1S7YA 3VXBA 2HEUA 1I6BA 3AXFA 4MFIA 2QS1A 2DOJA 2DQVA 1WVJA 2Z8DA 2PT2A 3G3KA 4XKQA 2ZNUA 2AIXA 1AOVA 3R6UA 2DSFA 3FV2A 3HSTA 3E3KA 4POXA 4P0IA 5FHOA 3TELA 4WEDA 3C4MA 1JNFA 4YKPA 3O66A 4GVOA 3G7WA 2F6GA 1SYHA 3C34A 4QF9A 3LC8A 3LR1A 2HCAA 1B0HA 3ILUB 1NNTA 4NWDA 5I59A 4OYVA 3KJTA 4ZE8A 1EZPA 1OQGA 1SD3A 2GRVA 5TP9A 3EPEA 3CSGA 2P0SA 1Q1KA 3FIRA 5CC2A 1B3LA 2QJEA 5AA4B 3T9VA 2UVJA 1R6ZA 1EZ9A 3USDA 1POY1 1YTVA 4NF4B 5TU0A 2QS4A 2I0BA 3IOUA 4JB7A 3DP8A 4R6KA 3G3GA 3H6TA 2XXXA 1O64A 4G8MA 1MY1A 5AE4A 1ANFA 5I2NB 3MVYA 1UIUA 4R9FA 1IQ7A 3KOTA 3ZKKA 1UTHB 4ESWA 1DOTA 1B51A 1TXFA 4OFLA 3KN8A 2VD3A 3MP1A 3EN3A 1T0KA 2HFBA 3L6GA 3FVOA 4LQ5A 3TCGA 3BFTA 1JEUA 2Z23A 5KDTB 2YLNA 1ZBMA 2Q89A 3MPKA 4POWA 4ELPA 1P1WA 3ZS6A 1A7LA 3WAFA 2DE4A 3IR1A 2Q88A 2REGA 2ONRA 5H8NB 2UXAA 4DIGA 1QUIA 4P11A 3V5AA 4PP0A 3K00A 5J1DA 1ZTYA 3U8QA 1B46A 4U1OA 5I58A 1MXWA 1VFDA 4JWXA 4G68A 2VP1A 1ZU0A 1LLSA 4LA9A 4FAJA 4R2FA 3MP8A 5I59B 3K6VA 3FUZA 2V93A 3QK6A 4NF5A 5ELVA 3PUXE 5TP9B 1XOCA 4ELRA 4FEBA 4H67A 3O97A 1XHYA 4G8HA 3A3UA 3EHTA 4I1DA 2H4IA 3FGSA 1QJMA 3K6WA 3MVZA 4DXBA 1ZLQA 4EXKA 3CSBA 3RLFE 4Z0IA 3MZBA 4OTEA 4QSDA 2F5XA 3VXCA 1DSNA 1PBPA 3H3GA 1B3GA 1BTJA 4WXJA 1FTOA 1MY2A 4BDQA 3QUFA 3DP4A 4ECFA 1A40A 3MVWA 4LUBA 4OEUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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