2I6EA

Crystal structure of protein dr0370 from deinococcus radiodurans, pfam duf178
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
272
structure length
272
Chain Sequence
b'PYRAGWIHFTNVAPILDSLELPPGVTAITGVPTQMNAALLSGEVDIANVSAVEFIRHADTLAALPDFSVAVLGPVYSVNLFHTCPLPELRRVALTSQSAMSVALLEVLLRQKGLSPVLERAEGTAESLLAAGYDGVLRIGDDALREWYGVVGPLTPERTMTSLPHTGRGITVTDLAQEWFDLTGHPFTFAVWAYRKDNPPPAALLQAMREARRRGIGHLAEVSQRHAEKLGLPERVVQHYLWNFRYHLEAPDRLGLREFADLAVPGHAELTF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title X-ray structures of two proteins belonging to Pfam DUF178 revealed unexpected structural similarity to the DUF191 Pfam family.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Hypothetical protein
source organism Deinococcus radiodurans
molecule tags Structural genomics, unknown function
total genus 82
structure length 272
sequence length 272
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02621 VitK2_biosynth Menaquinone biosynthesis
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i6eA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i6eA02
4OMBA 3UK4A 1UTBB 1T0KA 2O1MA 5CMMA 4QHQA 4GVOA 1ZKBA 4G8NA 2DXYA 2HZLA 3S9NC 3O6HA 4H1XA 2DE2A 2ONRA 1B7ZA 1NNFA 4PP0A 4EDPA 4GIZA 3C35A 1B05A 5CI5A 3N26A 1Y4CA 2Q2CA 1MH3A 4ZECA 3OMBA 3VXBA 2F8DA 5J1DA 3T96B 3KEIA 1MPBA 4GFRA 3QSLA 4KCCA 2KLFA 1TXFA 4R6KA 3IOWA 3K00A 2ZYMA 1Y3QA 3EPEA 1M5EA 2ZNSA 1XT8A 1QUJA 2O1LA 1QVSA 1NNKA 3N5LA 3MP8A 1Y1MA 4LQ2A 1NNTA 2ZXTA 4BDLA 3OXNA 3O28A 2QSXA 1XS5A 4GWOA 1FQDA 3KSJA 1B52A 4BDMA 1O64A 3HV1A 1DSNA 2AL4A 3D4GA 1JW1A 4DIGA 1P1WA 2Y84A 3MP1A 3K6UA 5FTIA 1J1NA 4IO3A 3C33A 3RPWA 3BFTA 3O97A 1XOCA 3EQ1A 4MBPA 3MZ1A 4LZ8A 3DELB 3E9XA 3GZGA 2HCAA 5JEIA 3C9HA 4ZE8A 2ZMBA 4NTLA 3S9EA 1MS7A 4G4PA 1OVTA 1A99A 4G68A 3RQTA 1NKXA 3MP6A 3C4MA 2XD3A 3K6WA 4PE5B 1PB8A 3OELA 5I56B 1SYHA 3CFXA 4HCWA 4KHZE 2GRVA 4ISUA 1NFTA 4OFJA 4YKJA 3LBSA 4G68B 2I3WA 3M3FA 2PMSA 5CBSA 2Y7IA 3FJMA 3TQLA 1ATGA 3CVGA 3C32A 1IXHA 3GBAA 2FNCA 5KZTA 2D5WA 4LVQA 4F3GA 3O6IA 4NE4A 3H7MA 3H03A 2F97A 2ZNTA 3PUVE 2I4CA 1N3XA 4U2RA 3CFLA 2GFEA 2H5YA 3PUYE 3QIMA 2DE4A 2A5SA 3K1MA 5AA4A 3CR9A 3OO6A 2HAVA 4XTCQ 2XXRA 2ONSA 2VP1A 1B3FA 3CI8A 1H3DA 1PDAA 5AA2A 4NEDA 3MPKA 2Y7RA 4C0RA 3EHTA 2QS1A 3UN6A 5AA4B 1Q1KA 4EXLA 2H9BA 3E4RA 1DPEA 1MDP1 4OFOA 3KGCA 5CRYA 3T22A 1B5HA 2HEUA 4GD5A 4LZ5A 4GXSB 4LQ5A 1LGBC 3W9VA 3KOSA 3FIRA 4LP2B 1IIWA 2QS4A 3T93B 1F9BA 4KFQA 2UVHA 2OCUA 3W9WA 2RC8A 4RY1A 1PB9A 5AA2D 2RF1A 4G2ZA 5HPQA 4RJZA 3N6TA 4X9TA 4U4SA 1Y9UA 5EYFA 2YJPA 4NMYA 2XXYA 2RCAA 2XXWA 3Q28A 3KFMA 3IAZA 1GVCA 4BDNA 3UORA 3G3GA 3TKDA 4DXBA 2DSFA 4EF1A 3G3JA 2ANJA 3FASA 4NWDA 4PFTA 1Z7ME 2G93A 3IO4A 4IY6A 4RPOA 2UVIA 3GBBA 4H5GA 1LFHA 1B4ZA 1DMBA 5CM6A 4K3FA 4IY5A 2FA7A 1DPPA 1RYXA 2F7BA 1YCJA 5JK4A 2QS2A 5KCJB 3PPRA 3TZAA 3MJNA 3PGFA 1SBPA 1JEVA 2I3VA 3DP8A 4KQPA 3TTLA 4KCDA 4O3AA 4OHNA 4IGRA 1WDNA 2Z8FA 4YKPA 4RK2A 5AE4A 3A3UA 4GQOA 3WAEA 1D3KA 4HCYA 1EZPA 1FTMA 2Y7WA 4JSDA 4AB5A 3VLUA 4JWOA 2F78A 1MQHA 4QSEA 1MXXA 3VV5A 2V3QA 1A55A 2XXVA 3FVGA 3QUJA 3PPOA 3CSBA 1BIYA 4NF8A 1MQIA 3LUYA 3PMXA 2B3BA 4KR5A 1YPNA 2XXPA 1B3EA 2RKMA 1SW4A 1AOVA 2OWTA 5CMBA 4Z0IA 1FTKA 5K2YA 1TFDA 3S2VA 1R6ZA 1ZIUA 1LAFE 3K2DA 2PBWA 1IZ1A 3S4UA 4KYEA 3DP4A 3IO6A 3MZBA 1POY1 4NF8B 4EXKA 4WXJA 4PFYA 3EHSA 5FHOA 4HW8A 4EQBA 3KN8A 3VVFA 1M5BA 1XVYA 1YAEA 2LAOA 2OBGA 2THIA 3R7XA 5H8SA 5H8HA 1B1XA 2OK2A 3LSXA 3SEYA 2E0SA 3KZGA 1UTBA 4N6PA 2V25A 1B4HA 2O6AA 3OENA 5L8DA 4DCYA 4IO5A 1B3GA 1FTOA 1H43A 3CG1A 3PUWE 3VFJA 3IL1B 4ZS9A 5H8HB 1TFAA 1DTZA 3USDA 4OVJA 4DZ1A 4OWDA 4P0GA 2B3FA 3FUZA 1QKAA 1B32A 1B7HA 5DYHA 3IJOB 1XC1A 4H67A 1B3LA 1LAXA 2D21A 2ZNUA 4OQOA 1PEBA 3VE1B 4DLDA 5H8QA 1MQGA 1XHYA 2QRYA 2XXTA 2DWIA 3C34A 2X7PA 1OLAA 4EF2A 2Q88A 1NH7A 1B58A 4O3BA 1URSA 4NF4A 1AMFA 1SDXA 5ITOA 5L9MA 3U92A 4Z7EA 2I0CA 3CRBA 1GTKA 4FAJA 4EQ7A 5H8QB 4IO7A 3OEMA 5KDTA 3G3KA 3N94A 1BTJA 2DOJA 5EHMA 1SVXB 3JV9A 4NF4B 2OLBA 4NWCA 5IKBA 4F18A 3HO7A 3TTRA 1SI1A 2F36A 5KDTB 3KJTA 5FTHA 4H0WA 3MWBA 5I59A 1B5JA 2DWAA 2O84X 4KD5A 2GH9A 1URGA 3VLVA 4R72A 2X26A 1QKBA 4E0XA 4H8IA 3MUQA 4ZZEA 3O2AA 3O66A 4TOZA 3CFZA 5I2KA 3OO9A 3PU5A 4I62A 4OZ9A 2DE3A 3JZJA 4X48A 2QS3A 1L5TA 4FE8A 1P99A 5I59B 1UIVA 1M5DA 4IO6A 3CSGA 3T9XB 1VR5A 3F11A 3TPAA 3DLNA 4FEBA 5TP9B 3W15C 3H6TA 2QJEA 1TT1A 5I56A 1Y20A 4FJPA 3PPPA 5I2KB 1SI0A 2R9JA 4PFWA 4RNSA 1JETA 1I6AA 1B6HA 4H5FA 4N13A 1R9LA 4DXUA 3ECRA 2XXUA 1I69A 4F3SA 1S50A 3IB0A 4FIMA 4ZZAA 5ISUA 4JBZA 3UA8A 4TLMB 1GV8A 4RXLA 2B65A 1ZBMA 4RA1A 3TYHA 4AQ4A 5H8FA 3MC2A 2NWJA 3KJ7A 4QFNA 2DYXA 2ZYNA 3TCHA 3T9UA 4YMBA 2VD2A 1MY2A 3BFUA 3HCQA 4I8CA 4R2BA 1FQAA 5H8FB 5BUUA 3DP6A 3UIFA 3QXMA 2I49A 1O7TA 3TTKA 3TELA 2F6PA 1SW1A 1S9TA 3ZSFA 4BDOA 1MY3A 3FJGA 2RC7A 3PMVA 1NMUA 1B7UA 2VD3A 3OO7A 3LC8A 4OEUA 3RY3A 4XKQA 4IO4A 3U72A 3MZ9A 5DTBA 2CMOA 2PT2A 1PB7A 3SEXA 4JWXA 4RPNA 2UVJA 5L9SA 1EZOA 3LSFB 4KPTA 5M2VA 2GHAA 2XXHA 5CBRA 1CB6A 1MY4A 2UVGA 1MXUA 3I3VA 1H45A 1GR2A 1MM6A 1R1NA 4MF3A 4OENA 4R74A 1USYE 1O63A 3TODA 3O29A 1ZU0A 3UP9A 4XIGQ 1MG1A 1IQ7A 1B9JA 1MY1A 2ESNA 2DWHA 2PT1A 1BP5A 4I1DA 3PMWA 4YMAA 1UIUA 5B70A 3ZS6A 2Q2AA 4GRKA 3M3KA 4ZEDA 3V8XB 5CMCA 1ZJLA 4YB7A 1Q35A 3IOVA 1OIBA 3TCFA 2UYFA 3VVEA 4YB6A 4GL0A 4OESA 1URDA 1M5FA 4ND9A 4HS7A 1FQBA 4H8JA 3QAXA 1MY0A 4RYAA 2I4BA 5HM4B 3TMGA 1MXZA 2ONKE 1IXCA 2XXIA 1B0LA 3EN3A 3CG3A 3EHUA 3ONMA 3PUZE 1MM7A 1ZMGA 3H06B 4EQ9A 3V83A 2PX1A 3JYRA 3RLFE 3B6QA 1LAHE 4L17A 5DVFA 2VOZA 4ZEBA 5KCJA 4G8HA 3N6UA 4OXVA 3KN3A 5H8NA 3D4CA 5JTYA 4FEDA 1B40A 3PD8A 4ELRA 1VFEA 4U1ZA 1LFGA 3OSRA 3OEKA 4R73A 4YKKA 5AA3A 4Q0CA 5CC2A 1AH5A 1B2HA 1R9QA 4H65A 2IEEA 3P7IA 5F1QA 1OQHA 1P1OA 4AB6A 4QFPA 3I5OA 1FCKA 1LBCA 1RKMA 5H8NB 4OTEA 5JTYB 3KOTA 1HSLA 3K4UA 3AXFA 4F39A 5ITPA 3RN8A 4JXIA 3MQ9A 2DXRA 1EZ9A 5ICQA 3TTNA 4QFOA 5HBCA 2XX8A 4UACA 4OYVA 4XKNA 4ESWA 1SQYA 1IXIA 4PFUA 4BLAA 3VDFA 3H6WA 2DWJA 2VGQA 4RK9A 4X1BA 4POWA 1UQWA 3SDFA 3OOAA 2UXAA 4LZ7A 4OETA 4U4XA 4UA8A 3K02A 5LOMA 3IOUA 5ICTA 3BBRA 4U22A 1D4NA 4XKPA 5DT6A 1UTHA 4F2OA 3IB2A 3U8QA 1P1NA 3FVOA 3GLBA 2YLNA 2NVUB 3S9LC 4IO2A 2Y7PA 1LBBA 3FXUA 2P1SA 2H4IA 5DVJA 1JEUA 1UTHB 3L6GA 4QFKA 2R71A 4YZZA 3O6GA 5L9OA 2H25A 4NF6A 3FV1A 3U93A 4P11A 1N0TA 2GHBA 2F34A 2Z22A 1MDQA 1IEJA 4ZDMA 2OZZA 2A5TA 2V3UA 3Q29A 3TCGA 4R75A 3KBRA 5A5XA 4NF5A 3K6XA 5FHNA 4NF6B 1DOTA 1A54A 1IUDA 1D9VA 2O7IA 3RT8A 1MRPA 4BDQA 2O69A 4LATA 1N04A 4LUBA 3A3CA 1MXYA 2A5TB 5CMKA 1FQFA 5IAIA 2HQ0A 5A5XB 4NF5B 3OSQA 3ZKLA 3HN0A 3G3HA 1FW0A 4G68C 1LSTA 4OEVA 4ELPA 1JNFA 3TQWA 3MAMA 1AL3A 3C31A 3FXRA 4XXUA 4GOTA 1ZLQA 1EH3A 2PVUA 1ANFA 1M5CA 1OVBA 3MBPA 2XX9A 4C1TA 1OQGA 4M4GA 1WVJA 4XKRA 1JVXA 4R6HA 2D3IA 3THIA 1SYIA 3QK6A 4DDDA 2F5XA 3Q27A 1ZTYA 1A7LA 1N84A 4FECA 2Q89A 3L6HA 1BLFA 2REGA 5EHSA 3K1NA 2Z8EA 3SERA 4ZEFA 1H44A 2H99A 2R6GE 3M3LA 4PETA 3WAFA 3H6VA 2IA4A 3C36A 3QYTA 1FQEA 2DS9A 1B0HA 5TP9A 5I84A 4R6YA 4KI0E 4F22A 3U94A 3U1OA 3FVNA 1NNPA 3PUXE 1MQJA 4X1DA 1B5IA 3IK6B 2V3TA 2I6EA 3B7DA 3FATA 3ILUB 4WEPA 2Q9TA 3RT6B 4QF9A 1WODA 5K2XA 1LCTA 1QULA 2I0BA 3RNNA 5BWJA 5DVIA 3LSLA 2G29A 1LB8A 4ONYA 1LFIA 1CE2A 1XVXA 3R6UA 3MVZA 3B6WA 4FORA 3FV2A 1LCFA 4YICA 1A8FA 4ELOA 1A40A 3R26A 4O3CA 2V84A 1A8EA 3FZVA 4G77A 2QL3A 2AL5A 3TAJA 4GXAA 1VSOA 4ECFA 3FJ7A 4MLVA 4QSDA 1Y4TA 3MVYA 2FYIA 3SEWA 2DVZA 2F6GA 4EUOA 1YTVA 2F7AA 4C1UA 1IXGA 4F29A 3PD9A 3HHFA 3IORA 4YKIA 4YAHX 3A09A 3TTMA 5I58A 2HAUA 3ZKKA 4QSCA 3VXCA 2Q8JA 3LSWA 4TLLB 4F1YA 2QMWA 4I9DA 2XHDA 4LONB 2I48A 1FQCA 1VE4A 3K1PA 4WKMA 4R9GA 4U1OA 3K01A 1PC3A 3PPQA 4F31B 4OERA 4WEDA 3HPIA 3K0VA 4DCXA 5I58B 3QUFA 3KSXA 2QMXA 3E3KA 1JW4A 4MH5A 3SESA 1JVYA 1SD3A 4JWYA 1PBPA 3T9VA 1B46A 2PYYA 2OWSA 2XX7A 2V93A 3TDJA 4F3BA 4LA9A 4IB2A 4YB5A 4ZE9A 3RGYA 2P0SA 2W7YA 5TPAA 3UGWA 3FVKA 1HSJA 2XD2A 3E13X 1FTLA 4KYSA 1QW0A 2O51A 1AIVA 3KG2A 2Z23A 2HZKA 1US4A 4M1VA 3ODBA 3HSTA 1OLCA 4ESXA 4P0IA 3IX1A 3GXAA 3H3GA 4QFLA 5TPAB 1MXWA 1OMPA 4R2FA 3G3FA 5AA2B 4U21A 2P2AA 3O9PA 2DP8A 3RTWB 4F3PA 1LAGE 4GLIA 4ZEIA 4Q30B 3SETA 4F19A 5I2NA 1MXVA 1Z7NE 1HSEA 4PQJA 2X7QA 1ELJA 1VFDA 3MVWA 2RINA 2H98A 3Q26A 4GF8A 1MPCA 4F1UA 3TEPA 4ELQA 2AIXA 3HHGA 2I58A 1LLSA 4KYDA 2XXXA 4IGTA 3V89B 2VHAA 3VLWA 5I2NB 5B7DA 4F2QA 4E0WA 1IITA 3PPNA 1I6BA 4FATA 3OD7A 3SEVA 4QRZA 4ZEKA 1POTA 2ALUA 3I6VA 1N7WA 1SW2A 2M8CA 3TFLA 1P1UA 3FXQA 5I57A 1II5A 2NUVA 2ABHA 2O7UA 2WKYA 1QJMA 5ELVA 4DE8A 3OO8A 1Y1ZA 3KN7A 1EU8A 1MPDA 2QPQA 1TWYA 4TQUQ 1KWHA 1QUKA 1Y3PA 1MQDA 3SKPA 3RUMA 5I57B 3V5AA 3EF7A 3VVDA 3IOTA 5F7VA 3TUSA 3SEUA 1P1QA 3T66A 1N3WA 3G7WA 1MH4A 2DQVA 1B1HA 3H4ZA 5FHMA 4N07A 1B51A 2ZYOA 4JSOA 4MLQA 3MPLA 2OJTA 2F7CA 2F35A 1H76A 1DTGA 3ILTB 4Q8RA 1N76A 4GL8A 1US5A 4THIA 4G8MA 2NXOA 3M8UA 2DVCA 3IB1A 4U23A 3MW0A 4Q5TA 2BJJX 3T9HB 3S9MC 3LR1A 1QUIA 4JDFA 2HFBA 3FD3A 1NH8A 3H6UA 1JW5A 1JQFA 3BKIB 4HTGA 4OFLA 1BKAA 3IR1A 1GGGA 2Y7KA 3Q25A 2RC9A 5TU0A 1D9YA 2REJA 2O68A 4DXCA 4R9FA 2RCBA 2NOOA 1I6QA 3PV0E 4BDRA 2AYSA 5DEXA 2YPNA 1USYH 3B6TA 5AA1A 1RYOA 1NL5A 1B3HA 4POXA 1PBQA 2UYEA 1Y3NA 3G3IA 1SW5A 3K6VA 1FTJA 3CIJA 2HXWA 2CZLA 3DM0A 5DEXB 4JB7A 4F1VA 2XXQA 4MFIA 3FGSA 3IJXB 2E1SA 1S7YA 3MVXA 1N7XA 2ZYKA 2Z8DA 3RTFB 1LB9A 4H6DA 4YU0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OMBA 3UK4A 1UTBB 1T0KA 2O1MA 5CMMA 4QHQA 4GVOA 1ZKBA 4G8NA 5IM2A 2DXYA 2HZLA 3S9NC 3O6HA 2BJIA 4H1XA 2DE2A 2ONRA 1FBCA 1B7ZA 1NNFA 4PP0A 4EDPA 4GIZA 3C35A 1B05A 5CI5A 3N26A 1NV2A 4AS5A 1Y4CA 2Q2CA 1MH3A 4ZECA 3OMBA 2GQ1A 4JVCA 3VXBA 2F8DA 5J1DA 3T96B 3KEIA 1MPBA 3NOHA 4GFRA 2PFZA 3QSLA 4KCCA 2KLFA 1TXFA 4R6KA 3BIHA 3IOWA 1FPEA 3K00A 2ZYMA 1Y3QA 3EPEA 1M5EA 2ZNSA 1XT8A 1QUJA 2O1LA 4GX6A 1QVSA 1NNKA 3N5LA 2F3BA 3MP8A 1Y1MA 3EKIA 4LQ2A 1NNTA 3B50A 2ZXTA 4BDLA 3OXNA 3O28A 4XFEA 2QSXA 1XS5A 4GWOA 1FQDA 3KSJA 1IMDA 1B52A 4OANA 4BDMA 1O64A 3HV1A 1DSNA 2AL4A 3D4GA 1JW1A 5IGAA 4DIGA 1P1WA 2Y84A 3MP1A 3K6UA 5FTIA 1J1NA 4IO3A 2QVVA 3C33A 3RPWA 3BFTA 3O97A 1XOCA 3EQ1A 4MBPA 4XEQA 3MZ1A 4LZ8A 4PC9A 3DELB 3E9XA 3GZGA 2HCAA 5JEIA 3C9HA 4ZE8A 2ZMBA 4NTLA 3IFCA 1JP4A 1IMAA 3S9EA 1MS7A 4N6KA 4G4PA 3MYUA 1OVTA 1A99A 4G68A 2WYKA 3RQTA 4MX6A 1NKXA 1FJ6A 3MP6A 3C4MA 2XD3A 3K6WA 4PE5B 1PB8A 3OELA 1LBWA 5I56B 1SYHA 3CFXA 4N6DA 1FPJA 4HCWA 4KHZE 2GRVA 4ISUA 1NFTA 4OFJA 4YKJA 3LBSA 2P3VA 4G68B 2I3WA 3M3FA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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