2IA4A

Crystal structure of novel amino acid binding protein from shigella flexneri
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
277
structure length
277
Chain Sequence
APAAGSTLDKIAKNGVIVVGHRESSVPFSYYDNQQKVVGYSQDYSNAIVEAVKKKLNKPDLQVKLIPITSQNRIPLLQNGTFDFECGSTTNNVERQKQAAFSDTIFVVGTRLLTKKGGDIKDFADLKGKAVVVTSGTTSEVLLNKLNEEQKMNMRIISAKDHGDSFRTLESGRAVAFMMDDALLAGERAKAKKPDNWDIVGKPQSQEAYGCMLRKDDPQFKKLMDDTIAQVQTSGEAEKWFDKWFKNPIPPKNLNMNFELSDEMKALFKEPNDKALN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Putative periplasmic binding transport protein
publication title Structural and functional study of novel amino acid binding protein from Shigella flexneri
rcsb
source organism Shigella flexneri 2a str. 301
molecule tags Protein transport
total genus 91
structure length 277
sequence length 277
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-09-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ia4A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ia4A02
5I84A 5AA4A 2RCBA 3PUYE 3FVNA 3B7DA 1MXUA 4P0GA 3O9PA 1L5TA 2I4CA 5J1DA 2R6GE 2V25A 5KDTB 1UIUA 2HZKA 1B46A 4OFOA 3IR1A 3U8QA 3O66A 4EQ7A 2ONSA 4MLQA 3TCFA 1IXCA 4LQ2A 3DP6A 4KD5A 3LSFB 3CVGA 4WEPA 1AOVA 4IO6A 1MDQA 3BBRA 4NEDA 2OWSA 4OERA 4X9TA 4O3BA 3R7XA 3CRBA 1US5A 4F2OA 2H4IA 2I48A 3PU5A 4X48A 2O7UA 5F1QA 1FCKA 1Y4TA 4YZZA 3PD9A 1P1WA 3FXUA 3RN8A 4N13A 2P2AA 4MH5A 4RK2A 4GLIA 5I58B 2GHBA 3FASA 3FUZA 3PUWE 1A99A 5AA2D 1CB6A 5EHSA 3T9VA 3HHGA 2PT1A 4OFLA 3KOTA 1SVXB 3O6GA 5DVIA 5HM4B 5AA2B 3C4MA 4G4PA 1PEBA 3H3GA 1ZTYA 4NF8B 3VV5A 3OEKA 4EQBA 2OLBA 3CFXA 4GVOA 3C9HA 1FW0A 2HEUA 5EYFA 2O51A 2DVCA 4O3AA 1P1UA 1LB9A 1A7LA 2V3TA 1XVXA 3G3FA 5ITOA 1QJMA 4EUOA 4G8NA 3IAZA 4YKPA 5CBSA 1DPPA 3TTMA 2OCUA 1IUDA 4YB7A 1MDP1 2ZMBA 3FVGA 1B0HA 4IO7A 3V83A 4ZZAA 3PUVE 1FQEA 4PQJA 1B05A 3PPNA 3A3UA 2XX9A 2R71A 2QS1A 1BP5A 3LSXA 2O1MA 2UVIA 5KDTA 4WXJA 1SW5A 4DCXA 2RCAA 1MQIA 1XVYA 4L17A 5AE4A 3Q28A 4Q0CA 4ISUA 2G93A 1OLAA 3TCHA 4XXUA 1UTBB 3VXBA 1CE2A 2H98A 3S2VA 1F9BA 4F1YA 2XD2A 1MQGA 3GZGA 3PUZE 2AL5A 3SDFA 2H25A 1XC1A 1MM6A 3M3FA 4F2QA 1BKAA 3GLBA 1Y20A 4F3BA 1SI1A 1BIYA 4BDRA 1BTJA 2D5WA 1LCFA 4BDQA 1EZ9A 2UVHA 1A8FA 3LUYA 3MVYA 3TAJA 3OEMA 1H43A 5KCJA 3JV9A 1XS5A 3BKIB 5CMBA 4ZEKA 1MQDA 1FQAA 1SW4A 1P1QA 5AA2A 1VE4A 4NF8A 2F6PA 1LAHE 4JWXA 4MBPA 3K1NA 1PB7A 3LBSA 4NE4A 5L8DA 3TQWA 4R2BA 3S9NC 3MC2A 1AL3A 3K1MA 4LVQA 3SETA 4OVJA 4ND9A 3RUMA 4POXA 3G7WA 2Y7KA 4H1XA 4G2ZA 4EXLA 1S9TA 4Q5TA 3ODBA 4JSDA 2DE3A 4ZE8A 5CMCA 2REGA 4ZDMA 1SD3A 4LQ5A 3E9XA 3QSLA 4R9FA 1DTZA 3IB0A 1IQ7A 3G3JA 3TPAA 2QPQA 3N5LA 1LLSA 2DE2A 1LAXA 4GWOA 1I6BA 5KZTA 5JTYB 1H44A 5BWJA 5JK4A 1UTBA 5F7VA 4NWDA 1MH3A 1GV8A 2F35A 3OMBA 2H5YA 3OD7A 1B40A 1R1NA 3WAFA 3B6QA 2DWAA 4I1DA 3MP1A 1H3DA 1FTJA 3OENA 1R9QA 2ZNUA 3KBRA 3R6UA 3W15C 1XHYA 2AYSA 4QFNA 5ITPA 5CM6A 3FVKA 1EZPA 4F18A 2OWTA 3UIFA 4KFQA 1QKBA 3W9WA 2XX8A 1QVSA 4THIA 1PB8A 5AA4B 1B3HA 3TYHA 4JDFA 1B4ZA 4LUBA 1AMFA 4KCDA 5FHNA 2B65A 2DQVA 2F7CA 5AA3A 1LFGA 4EF1A 1PBQA 2HFBA 2QJEA 4R73A 1EZOA 2PMSA 4PFUA 4C1TA 4U22A 2NOOA 2LAOA 2I3VA 1OIBA 3FJMA 1Z7NE 1ANFA 1MQHA 3EF7A 2XXTA 1LSTA 3IO6A 4Q30B 2H99A 1FQFA 3HPIA 3OO7A 4X1DA 3BFTA 2I0CA 1B32A 3W9VA 1UIVA 1NNTA 3MJNA 2THIA 2KLFA 1NFTA 4KI0E 1O63A 3UGWA 4GIZA 4XKNA 3MVZA 3E4RA 3ONMA 1B3LA 4MFIA 1LAGE 3B6WA 4RK9A 1OMPA 4QSDA 3MP6A 3TTNA 1M5CA 1D9YA 4OESA 2UVGA 2VHAA 3K0VA 4YKKA 3FV2A 1GR2A 1JW4A 4LATA 3RNNA 3U92A 4XKPA 1US4A 1P99A 3I5OA 2QRYA 4IY5A 4FE8A 3O6IA 4G68B 3JZJA 4GL0A 2Z8EA 3M3LA 2O7IA 3EHUA 4F1VA 3ZS6A 4H67A 3IOVA 2Q2CA 1NNPA 2OJTA 2O68A 3EN3A 5H8SA 4XIGQ 4TLMB 3K01A 4O3CA 1PC3A 3CSGA 1XT8A 4KHZE 3K6VA 2VP1A 2PVUA 1I6AA 1MS7A 4ESXA 1LBBA 2GFEA 3WAEA 3MZBA 4IGRA 4QF9A 1JVXA 3PPQA 2V84A 1MY1A 4ZECA 3FGSA 2DWHA 2UXAA 1NNFA 2WKYA 3TELA 4LA9A 3VLVA 3G3KA 1D9VA 4YMAA 4QSCA 2XXQA 3EQ1A 4GOTA 4XKQA 2NXOA 3A09A 3IO4A 1B6HA 2XHDA 2V3UA 2Z23A 2HAVA 3S9MC 3ILUB 5ISUA 3UORA 3SEVA 1MM7A 3LSWA 2W7YA 1DTGA 3T9UA 2G29A 1A54A 5ELVA 1VSOA 2UYEA 1B0LA 5CRYA 1B58A 3TTKA 4IB2A 3TCGA 2Y7PA 5DTBA 3RTWB 3H6UA 3MVWA 4G77A 1DOTA 1POY1 1S7YA 4HW8A 1USYE 2DXYA 4G8MA 1ZMGA 1N3XA 2I58A 2XXIA 3KN3A 2Y7WA 5I2KB 4OEUA 4QFLA 1B7ZA 3Q25A 5KCJB 2A5TA 4MF3A 4U23A 3AXFA 3KFMA 1LFIA 3OSRA 1FQCA 5DT6A 4OEVA 1LGBC 2PX1A 2D21A 1HSLA 2Z8FA 4ZS9A 3ZKLA 2V3QA 1UQWA 2XXWA 5I59B 3D4GA 4G68A 5JEIA 2O84X 2F7AA 4GXSB 3H4ZA 2RC8A 3C32A 5CC2A 3OOAA 4TQUQ 4JWYA 3KN7A 1IXHA 2Z22A 5LOMA 5FHMA 3C31A 3KN8A 4ESWA 3VFJA 4KQPA 2F78A 2HCAA 4ELRA 1SDXA 1MPBA 3UN6A 3RGYA 4F29A 3UK4A 4EF2A 3RPWA 2QL3A 2F97A 4ZEFA 5DEXB 1JNFA 3PD8A 1URDA 1Y3PA 1YAEA 4NWCA 4ZEDA 3BFUA 2Y7IA 3KSXA 1OVBA 2B3FA 4YB6A 4YB5A 2F7BA 3T9XB 3VE1B 1VFEA 3QAXA 1AH5A 4GF8A 1N0TA 5BUUA 2ZXTA 2V93A 3QUJA 1EU8A 5TP9B 4OENA 1SYIA 4DZ1A 2GH9A 2I49A 3F11A 4YMBA 2F36A 2Y7RA 1IXGA 2NWJA 3U1OA 1FTLA 4YICA 3RT8A 2ANJA 2Q89A 3HHFA 3SEWA 3O2AA 1OQGA 1YTVA 5L9MA 3VXCA 5HPQA 3Q26A 4QFOA 5I2KA 3V89B 4Z7EA 3LR1A 5ICQA 2I3WA 3IORA 1DSNA 1MPDA 3VLWA 2BJJX 2ABHA 2I4BA 5I59A 4IO3A 1R6ZA 3QIMA 3FVOA 1Z7ME 3C36A 3MUQA 1OQHA 4ELOA 2XXPA 4OMBA 4R72A 4DXCA 2DYXA 2OZZA 3RY3A 1MY2A 2E1SA 3FIRA 3OO6A 1Q35A 3HV1A 4H8JA 5K2XA 1Y3NA 4HTGA 4OFJA 5TPAA 1LCTA 3IB1A 3E3KA 2REJA 3TZAA 1SQYA 1ATGA 1TT1A 4U4SA 2X26A 4R75A 4E0WA 2AIXA 4R6HA 4R6KA 3CFZA 2M8CA 2I6EA 1YPNA 3H6WA 3K6XA 2DVZA 5DEXA 4FATA 1LFHA 4K3FA 2QS2A 4YKIA 3IB2A 1QUKA 5I2NB 4HS7A 2IEEA 1MY0A 4PETA 2ZYNA 4ZZEA 3O97A 1N7XA 3THIA 3T96B 5TP9A 1B3EA 2QMWA 2XXVA 3PMWA 2QS3A 4QFKA 1MY3A 4QFPA 4R6YA 1A40A 2ZNTA 2XXXA 3FXRA 3MAMA 4Q8RA 4DE8A 1MXZA 2UVJA 4PFWA 3QXMA 1B2HA 3MBPA 1FQBA 4ONYA 4JWOA 2A5SA 3RT6B 2DS9A 3VLUA 3K2DA 1OLCA 3ECRA 1NNKA 3H03A 3RLFE 1N7WA 3USDA 4IO5A 5IKBA 2DOJA 3Q29A 3CI8A 4RYAA 5H8FA 2FYIA 1ZU0A 2XD3A 3IOTA 1RKMA 2AL4A 3MZ1A 3CIJA 4OHNA 5FHOA 1MXWA 4NTLA 4R2FA 4KYDA 3SERA 3H06B 3KSJA 2QS4A 1USYH 1B51A 1TFDA 4OWDA 3IX1A 4RPNA 4M1VA 3H7MA 3PUXE 1IXIA 3EPEA 1WVJA 2ZNSA 4BLAA 3K00A 3L6HA 5EHMA 3A3CA 2DP8A 1TWYA 3KZGA 2F6GA 1PB9A 3DLNA 5CMKA 3U72A 4GXAA 1S50A 3K02A 5HBCA 3D4CA 1NH8A 1SYHA 2DE4A 4F1UA 4U4XA 1TFAA 4RNSA 2A5TB 4GD5A 2P0SA 3IJXB 5I2NA 2VOZA 3SEYA 4C1UA 4XTCQ 2F34A 1RYOA 1JW5A 3U93A 3TEPA 2YLNA 2VD2A 3QUFA 4LZ7A 5H8QB 3VVFA 5IAIA 3MVXA 1B7HA 5A5XB 1KWHA 4FJPA 4NF6B 3V8XB 3K1PA 1JETA 3KOSA 4IGTA 2H9BA 4LZ8A 3VDFA 4H5FA 4LONB 3UP9A 1VFDA 3LSLA 1IIWA 5AA1A 5DVJA 2XXYA 4F3PA 4HCYA 3KGCA 1VR5A 5K2YA 2P1SA 3PV0E 3TODA 1O64A 3R26A 3OO8A 4M4GA 4ECFA 2DWIA 4ZEBA 2GRVA 4G68C 3FJGA 4TLLB 4KR5A 1RYXA 5FTHA 3TQLA 4RY1A 3I3VA 4WKMA 1T0KA 4FEBA 2PBWA 3FJ7A 2DXRA 1UTHB 4RJZA 1B5JA 3M3KA 3ZKKA 2IA4A 1NH7A 3PMXA 2ESNA 1Y3QA 4IY6A 3N26A 4RA1A 3QYTA 3B6TA 1IITA 4OQOA 1FTOA 3MW0A 3T93B 3TTRA 4FIMA 3S4UA 4PE5B 1M5EA 3PPPA 1IZ1A 1P1NA 3RQTA 4IO4A 1GVCA 4JSOA 3IOUA 1I6QA 2NVUB 4GFRA 4XKRA 3RTFB 2FNCA 5H8NB 4C0RA 3CSBA 4POWA 4IO2A 3K4UA 2RINA 2O1LA 1Y9UA 2Q9TA 3ILTB 4ELQA 4AB6A 4EDPA 3K6WA 3C33A 5ICTA 2HZLA 2Q88A 3UA8A 1M5FA 1N76A 2ALUA 2E0SA 4GQOA 2Q8JA 4N07A 2ZYOA 5CI5A 3V5AA 3LC8A 3MQ9A 3GXAA 1MXVA 5H8QA 4PFYA 5A5XA 3DELB 4NF6A 2RF1A 3H6TA 5B7DA 4H5GA 3IL1B 4BDMA 1ZJLA 2PYYA 2F8DA 1LAFE 1QKAA 2VGQA 4PFTA 1FQDA 4U21A 1WODA 5TPAB 1HSJA 4DIGA 1SW1A 1JVYA 4ELPA 1JEVA 4DXBA 1D4NA 4LZ5A 1II5A 3T9HB 4DCYA 4F31B 4UA8A 1POTA 3G3GA 4QRZA 4Z0IA 3MPKA 1ELJA 4KYEA 4R74A 1M5BA 1UTHA 2HXWA 1XOCA 3CR9A 3HN0A 4F3GA 3MP8A 5L9OA 1SW2A 1DMBA 1PBPA 3FV1A 3SKPA 3Q27A 4NF5B 1FTKA 4GL8A 2NUVA 3N6TA 4OXVA 1Q1KA 4BDOA 5CBRA 1QUIA 1ZLQA 1MH4A 1H45A 1IEJA 1QW0A 2XXRA 3GBAA 3E13X 3FZVA 4OTEA 4NF4B 1B1XA 2DWJA 1GTKA 5H8NA 4FORA 2ZYKA 4JB7A 1NMUA 3L6GA 2Q2AA 5M2VA 3TMGA 5I57B 3U94A 2YJPA 3G3IA 1MXXA 3TFLA 4LP2B 1Y1MA 4KCCA 3P7IA 4JBZA 4H65A 1O7TA 1GGGA 3TUSA 3DP4A 4U1OA 3N6UA 1PDAA 4AQ4A 2ZYMA 1MPCA 5H8FB 2F5XA 5I58A 1N04A 5H8HB 3T22A 4OETA 4YU0A 3EHTA 1Y4CA 1URGA 4DLDA 1N3WA 1MY4A 3N94A 1J1NA 1B1HA 3PPOA 2R9JA 4FECA 1MRPA 2UYFA 3VVEA 5FTIA 1QULA 2O6AA 4OZ9A 1R9LA 3OXNA 4DDDA 2RKMA 3TTLA 4I62A 2I0BA 3G3HA 3KEIA 1P1OA 3C34A 4YKJA 1SI0A 4F39A 3OSQA 1DPEA 4X1BA 4JXIA 1WDNA 3PPRA 1MXYA 4KPTA 4P0IA 5B70A 5DVFA 1YCJA 4N6PA 4MLVA 4NF5A 4HCWA 2XX7A 2Z8DA 3SEUA 2HQ0A 1B3FA 3KJTA 1B3GA 1LB8A 3CG1A 4YAHX 2CZLA 4R9GA 3ZSFA 5L9SA 1A55A 5I56B 1B5IA 1B9JA 4NF4A 3O28A 4EQ9A 1I69A 3S9EA 2B3BA 3HO7A 5TU0A 1M5DA 2O69A 3JYRA 1MG1A 3DM0A 5I57A 3FATA 4F22A 4BDLA 3O6HA 1NKXA 2FA7A 4FEDA 4PP0A 4NMYA 5CMMA 4WEDA 3EHSA 4GRKA 4BDNA 3K6UA 3SEXA 3DP8A 1SBPA 1ZBMA 2QMXA 3VVDA 3KJ7A 4G8HA 3OO9A 5H8HA 2OBGA 2RC7A 4RPOA 1JEUA 1JQFA 4F3SA 3FXQA 4U1ZA 2OK2A 3C35A 3PGFA 3IJOB 4H6DA 3HSTA 1TXFA 1URSA 1D3KA 2CMOA 3QK6A 1B52A 1Y1ZA 3CG3A 2Y84A 3HCQA 2QSXA 4ZE9A 4I8CA 4I9DA 2DSFA 4FAJA 2ONKE 1MQJA 2ONRA 2XXUA 3FD3A 4H0WA 3PMVA 3GBBA 4EXKA 2X7QA 2GHAA 1B5HA 4UACA 1A8EA 2VD3A 3O29A 1JW1A 3TKDA 1NL5A 4AB5A 3TDJA 2D3IA 2YPNA 1B7UA 2XXHA 1HSEA 3H6VA 2PT2A 4E0XA 3I6VA 5JTYA 1ZIUA 4DXUA 1OVTA 1QUJA 5DYHA 2RC9A 3IOWA 5I56A 1LBCA 4H8IA 4KYSA 3MZ9A 4P11A 4RXLA 4TOZA 3MWBA 3MPLA 4F19A 3CFLA 1AIVA 4QSEA 1FTMA 1N84A 1H76A 3IK6B 4OYVA 1ZKBA 3T66A 1EH3A 3KG2A 4ZEIA 3OELA 1BLFA 3S9LC 2X7PA 4QHQA 2HAUA 4U2RA 1B4HA 3M8UA 3SESA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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