2IIRA

Acetate kinase from a hypothermophile thermotoga maritima
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
400
structure length
400
Chain Sequence
b'MRVLVINSGSSSIKYQLIEMEGEKVLCKGIAERIGIEGSRLVHRVGDEKHVIERELPDHEEALKLILNTLVDEKLGVIKDLKEIDAVGHRVVHGGERFKESVLVDEEVLKAIEEVSPLAPLHNPANLMGIKAAMKLLPGVPNVAVFDTAFHQTIPQKAYLYAIPYEYYEKYKIRRYGFHGTSHRYVSKRAAEILGKKLEELKIITCHIGNGASVAAVKYGKCVDTSMGFTPLEGLVMGTRSGDLDPAIPFFIMEKEGISPQEMYDILNKKSGVYGLSKGFSSDMRDIEEAALKGDEWCKLVLEIYDYRIAKYIGAYAAAMNGVDAIVFTAGVGENSPITREDVCSYLEFLGVKLDKQKNEETIRGKEGIISTPDSRVKVLVVPTNEELMIARDTKEIVEK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Acetate kinase from a hypothermophile Thermotoga maritima
rcsb
molecule keywords Acetate kinase
source organism Thermotoga maritima
molecule tags Transferase
total genus 132
structure length 400
sequence length 400
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2006-09-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2iirA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2iirA02
3ATVA 3MDQA 2QW9A 3MN5A 4BGBA 3ENHA 3VOVA 4HTLA 1V4SA 3GE1A 5AQUA 3UE5A 3A5MC 2V51B 3UKUA 1Q18A 4H5NA 4FPBA 3CETA 2Q0RA 2VYPA 1QQOA 2YCHA 4FOEA 4GY2B 1LOTB 3FFKB 3WUHA 1NGIA 3WT0A 4FWOA 4CI6A 3FLCO 1Y64A 3H45C 3A5NC 1MWMA 4H03B 3VEVA 3J8AA 4RCHA 2GWKA 4CD1A 1BO5O 4MO4A 4H0VB 3JXUA 4K43A 3RSEB 2E1YA 3LM2A 4PL7A 4H0TB 2W41A 1SZ2A 2WUSA 4WQ4C 4CZJA 2AA4A 3QFPA 3ZETA 2OANA 2Q31A 1BG3A 4BRLA 4ISGA 1U2VB 3AAPA 4QS8A 4XH5A 4BRIA 4BVPA 4B1YB 4BVOA 1LCUA 1V4TA 2NLXA 3ZEUB 5AQZA 2P9IA 1WOQA 3IMXA 2PAVA 4KBOA 4BRNA 3FZHA 2Q2RA 2UYTA 3WXLA 2P9NB 3BF1A 5AQNA 3ENOA 3FZKA 5EVZA 5E26A 5AQHA 1DKGD 5BN8A 1RFQA 2NZTA 3VEOA 1XC3A 1RGIA 1IJJA 1SQKA 4C23A 2Q0UA 1H1VA 1TUYA 1YXQA 2HF4A 4IWVA 4CD3A 3QDKA 1JCEA 2P9KA 1GLFO 3EN9A 3QB0A 2GELA 4K25A 3U8XA 1K8KB 3P4IA 4FO0A 1QQMA 1NLVA 3CQYA 1JCGA 5AZJA 3ZX3A 3M6GA 4ISEA 3O4WA 1XUPO 5AQXA 3CHWA 2BTFA 5EX5A 5FPNA 3WEEA 3O5BA 3A5OC 1GLCG 4JAXA 4QS7A 1GLJO 5FPMA 3ZETB 4BR0A 3HTVA 4XH1A 1NGBA 3VGLA 4AM6A 2A3ZA 3I33A 5AQFA 4XH4A 1E4FT 3FZLA 1KAXA 2P9LA 1X9JA 4IZ9A 4EIAA 1BOTO 3AY9A 2FSKA 1ZBSA 4BG9A 2E88A 1YAGA 2CH6A 5TKYA 4CBUA 3BEXA 4O5FA 4FOIA 3CQXA 1HPMA 4FWMA 4ISFA 4B1ZA 4BR5A 4BR9A 4WQ5C 3VENA 2F9WA 3VEXA 5AQIA 4CZGA 4BRGA 5CE3A 1X3MA 3W3DA 5LJWA 2QWPA 1QHAA 1NGDA 4XEIA 3DAWA 2CGJA 1Z05A 1QQNA 1BA0A 1NWKA 4A2AA 2GUPA 5AQLA 3U9ZA 4CBWA 4BC2A 4BRFA 5LJVA 3L6QA 3SMPA 1OKJA 3WXIA 3ZX2A 5AZJB 4EAHD 2E8AA 3QICA 4JHDB 3CIPA 1HKGA 3IDHA 4LC9B 5KQ8A 2GTDA 3L0QA 2P9PA 2E2QA 1T6DA 5ELZA 2P9UB 2KHOA 3MN7A 3MCPA 1Z6RA 2D0PA 3QFUA 3SJHA 3EKUA 3G25A 1NGEA 4IO8A 2QWNA 4EFHA 1HLUA 2E20A 2FSNA 3BUZB 3CI5A 5JICA 2YHYA 5AQTA 4IJAA 2Q97A 1GLEG 5BREA 3O08A 4Z94A 3GBTA 5FPDA 3KZBA 3I8BA 4H5VA 4BR4A 3C7NB 3FR0A 1NBWA 4JN4A 1J6ZA 3FZFA 3O8MA 3MMVA 2A5XA 4O8KA 1S22A 1NM1A 4L3QA 4YDUA 4DCHA 1YVNA 5B8HA 2ZWHA 4EHTA 3DXMA 3GL1A 3D2EB 4BQLA 4FSVA 3CJCA 3QMLA 3DXKB 3UB5A 3EL2A 5BRFA 4AM7A 2QM1A 3CJ9A 1MDUB 3ATUA 3QBXA 5E84A 1ZC6A 4J8FA 3H46O 1IG8A 3H3OB 1CZAN 2W40A 2QWLA 4H0PA 4BRHA 4NB4A 4BROA 2ASMA 4FWRA 1G99A 2P9PB 3UKUB 1BWFO 1KAYA 3B8AX 1GLAG 4PKGA 3VESA 2HF3A 1GLBG 1NGCA 2YHWA 2J4RA 4BR7A 5AQVA 2E2NA 4WQ4A 4CZLA 1U6ZA 3VGKA 1GLDG 1HX1A 2CGKA 5AQGA 3ZX0A 4BRAA 1BUPA 2E2OA 3VF2A 3FE1A 3EO3A 4BQZA 3H1VX 3DWLA 1E4GT 3LM9A 3O1WA 3AARA 4K41A 2D1KA 2FSJA 3BP8A 1TUUA 1KXPA 3KVGA 4E1JA 3F9MA 1HUXA 5JLFA 3IUCA 4H0XB 4H0OA 3MK6A 2ZGYA 4B1WB 2QWRA 5BN9A 3R9PA 3CJ1A 3SK3A 5AQQA 5AQSA 2P9IB 3CJ7A 5AFUH 2CGLA 4M63C 2HOEA 3DXMB 4FWLA 1TYQA 4BRKA 3LDQA 1MWKA 2V52B 1C0GA 3C0BA 2ASPA 4MO5A 3MN6A 4WYBA 4HWIA 5BRDA 3VEWA 3D2FA 2ITMA 5JMVA 5AZIA 3WQUA 3M3ZA 1BDGA 1YUWA 3LDOA 4BG8A 2I7NA 3SMSA 4H5RA 4IJNA 4BR2A 4BGAA 1QZ5A 3WXJA 2P9KB 3VERA 3RSEA 2D4WA 1T6CA 4EHUA 5BR9A 1D4XA 3MN9A 2FF3B 2GEMA 1ATRA 5AQKA 3TPQA 3S41A 5EXWA 2Q1NA 4FWNA 3O1BA 5BPNA 4BRMA 5KPZA 1U2VA 4CJ7A 4MLHA 4CZMA 2YHXA 4CBXA 2QXLA 4Y0WA 3EKSA 3ZEUA 3WEEB 3BF3A 2ASOA 3VF4A 3GG4A 3HSCA 3H6EA 1NGAA 2P9NA 4PL8A 5F0XA 5AQMA 3FGUA 1ATSA 4QS9A 2P9LB 1NGFA 3H1QA 2AP1A 4BC5A 5AFUA 1TYQB 4BRDA 4YDUC 1BA1A 3O80A 4K42A 2QWOA 2D0OA 5AQJA 3DJCA 1C0FA 1X3NA 3A8YA 5AQOA 5AQRA 3TU5A 4CZKA 1DGKN 5F1XA 5BRHA 3LDPA 5JLHA 4RTFD 1ATNA 4CZFA 5KPTA 5F2RA 1BU6O 3KHYA 5FPEA 2IIRA 3D2FB 3LL3A 1XQSC 5AZIB 3WXKA 3R6MA 1ESVA 4RWTA 3L4IA 3OHRA 5KPRA 3VEYA 1K8KA 2F9TA 4NO7A 1S3XA 4JD2A 4BRCA 2A40A 2ZF5O 2A42A 5AQWA 5LY3A 3IFRA 3CJAA 2E1ZA 4I6MA 4CZEA 1EQYA 2HMPA 4BC4A 5BPMA 2V7ZA 1KAZA 1NGHA 2IVPA 5AQPA 3GOIA 2PBDA 4FWPA 2P9SA 1HJOA 3CJBA 2IVNA 2ZGZA 1T44A 4F9OA 4JNEA 2BUPA 2QWMA 3O6WA 3VETA 2E2PA 2IVOA 5I9EB 5AQYA 1SAZA 2A41A 2YJEA 3HZ6A 4A61A 4B9QA 1DEJA 3U4LA 3VF6A 1QZ6A 3FZMA 1P8ZA 3A5LC 3ULEA 3LDLA 3QBWA 4PKIA 3VPZA 4H0YB 1RDWX 3VGMA 4A62A 3UKRA 2FF6A 2YJFA 1ZXOA 4GNIA 4DQ8A 5ADXH 2QWQA 3SLCA 2A6AA 4FWSA 3HI0A 4FWQA 1JCFA 4M7YA 4JD2B 3EZWA 2I7PA 4BRQA 3LDNA 4JHDA 5EY4A 4FPAA 3AAQA 4BREA 4I6MB 5EOYA 4B1XB 2NRHA 2P9UA 3M1FA 4PKHA 4BC3A 3R8EA 2P9SB 4MLEA 5AR0A 1WUAA 2V7YA 3U9DA 3CERA 2EWSA 4A2BA 4B1UB 1GLLO 3ID8A 3W0LA 5BPLA 3D7EO 2H3GX 3VEZA 3H3NO 4IXCA 4H5WA 4B1VA 2FLOA 4M7XA 1NGGA 2VCPA 2GWJA 3C7NA 3HBTA 4FWKA 3WQTA 4BRPA 4CZIA 1HKCA 1R59O 3ULEB 4H5TA 4CZHA 2Q36A 3A0IX 4DHYA 2DPNA 3GDQA 1MA9B 3UKRB 4FL9A 1HKBA 2VWBA 2CH5A 3JS6A 3D2EA 1NMDA 3HM8A 5ADXA 3DXKA 4DB3A 5KQDA 2FXUA 4WQ5A 1NGJA 2YI1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1T3VA 4CJKA 3MN5A 1LWCA 3CCEN 3VOVA 4DWIA 3GE1A 3OS0A 4FJNA 4ZTJA 3OYNA 3HSTB 2OA8A 3UKUA 1Q18A 3MX5A 3TANA 4FPBA 2VYPA 1IH7A 4JI3K 4FOEA 4DLEA 3ZCMA 3OYMA 1NU0A 1KCFA 1NGIA 3WT0A 4FWOA 3FLCO 3PX4A 4Q5VA 4CIFA 3VEVA 4CJWA 3J8AA 5GAGP 4X65K 1IO2A 3NGZA 3E9LA 4MO4A 4KB1A 1YJWN 2E1YA 2W41A 4DUZK 3S3OA 4O4GA 1SKWA 2DFEA 3MECA 4WQ4C 1TGOA 4PUOA 2Q31A 2HHHK 4BRLA 3KWGA 1HNWK 2A1SA 4BVOA 2WC9A 3ZEUB 3HPGA 4NYFA 3KD1E 4C8KA 3QEXA 1TKTA 3WXLA 2WOMA 2P9NB 3DRPA 3WNEA 3ENOA 3J7YP 1Q9YA 4ILHA 4WE1A 4FJIA 4DV7K 1DLOA 4MDAA 5E26A 4Z4HA 5HROA 1DKGD 1LAVA 3M5RA 4KH5A 4B3MK 2KW4A 2W6KA 1RGIA 4CHPA 1JLAA 2ZM6K 3SCXA 1SQKA 3BZCA 4WFNL 1KLNA 4CIEA 2P9KA 2YHAA 5GAHP 1GLFO 1VSMA 5FLXO 3LALA 2X6SA 4FO0A 4BWMA 3NF8A 2HNDA 3O4WA 1XUPO 1HYSA 3HT3A 1HNIA 4EZ9A 1VSFA 1HYZA 3SAHA 5EX5A 2R7YA 4C8OA 1NK7A 3O5BA 1U4BA 4JAXA 1C1CA 1GLJO 5FPMA 3ZETB 5M1QA 3DLGA 4BR0A 4Y1DA 4Z4FA 3DOKA 4QAGA 4E7JA 1ILYA 5AQFA 3NF6A 1J5EK 1VQNN 1LWEA 3AVKA 2P9LA 4YY3K 1X9JA 2NRWA 3NE6A 1UAXA 3LP2A 3CC2N 4GMJB 4GKKK 1HNVA 2RN2A 4W5TA 1YAGA 4FW2A 5GADP 4CJLA 3CQXA 1O13A 4IDKA 4B1ZA 4BR5A 1U49A 4BR9A 3VEXA 4KHQA 3L2UA 1ASUA 4X62K 5HRNA 3W3DA 3PO5A 3OS2A 2RE2A 3CCQN 1QHAA 1NGDA 3WNGA 1RT4A 2HNYA 1L3UA 3B6OA 4FJMA 1NNEA 2GUPA 2VGNA 2XY8A 2OPPA 4BRFA 2B5JA 3SMPA 2NRTA 4OPKA 1WAFA 4FLWA 3CIPA 4DV6K 3KD5E 1W7AA 1C0MA 5SWMA 3O9UA 5IWAK 2O8FB 4B9VA 1WLJA 2E2QA 3RTVA 1WSFA 4XIUA 2P9UB 2KHOA 4HCBA 3QFUA 4IKFA 3O9QA 1RBVA 4E0DA 4F4KA 4IO8A 2VG7A 3SPYA 2O8EB 3TAEA 3BUZB 1BI4A 4CFCA 4DG1A 2HHUA 2KLAA 5J2NA 1C1BA 5C10A 1X1PA 4CF8A 1VK0A 3I8BA 4AHVA 1NOZA 4JN4A 4FK2A 1SUQA 1OH6A 1XMQK 4O8KA 1S1WA 1NM1A 4IFYA 4CECA 3O3FA 2IC3A 2ZWHA 4LY7A 2WONA 2G8KA 3GL1A 4YOVA 4HHTA 1VQ9N 4AM7A 2DY4A 4YOXA 3ATUA 3MEGA 3H46O 3H3OB 4CF1A 1CZAN 2NNWA 4CF0A 3O4QA 2IDOA 3CFOA 3VMFB 4FWRA 3UKUB 3VQCA 1KAYA 4AHUA 3B8AX 4C1NI 4HCCA 4LF9K 3VESA 1JLEA 1NGCA 4BE2A 2J4RA 5C2FA 5JS1A 3NVKA 4CF2A 1EWRA 2GBZA 3DLLL 1GLDG 4KTQA 3ZT0A 2CGKA 3TTFA 1S9EA 1SKSA 1RT1A 4R5PA 3I8DA 1SV5A 3Q7BA 4IFVA 2Z1HA 3FE1A 4C8LA 3O1WA 3AARA 2D1KA 1VSEA 3J81O 3BP8A 4H0XB 3TAMA 3MK6A 2ZGYA 3QERA 2QWRA 3R9PA 4DTRA 3RWUA 3L3UA 2P5OA 3CC4N 5M1PA 3HJFA 2DTUA 1TYQA 2KQ2A 2D5RA 5K14A 3K59A 1S72N 2JWKA 4OX9K 4DTNA 3O9SA 1WNSA 2NUBA 4J2DA 4LF4K 2ITMA 1U04A 5JMVA 3DLBA 3O9TA 1QS4A 5AZIA 2HBMA 3LDOA 3O3HA 1JL1A 1NJZA 3SMSA 4N5SA 4H5RA 3SV4A 2DFFA 4BR2A 4CW7B 1Q86O 4JI1K 2P9KB 3AVAA 1VQ7N 3MN9A 3AA2A 3HPHA 1SL0A 5AQKA 4ICLA 4DTXA 1VSHA 3SUNA 5GIOA 3P1GA 3SYZA 5EXWA 4FWNA 3O1BA 3V6DA 5KPZA 1A5XA 2VG6A 4MLHA 4CZMA 2YHXA 3EKSA 1LW0A 1XNRK 1RTHA 1S1VA 3VF4A 1VQPN 4J2EA 3HSCA 2BGGA 5DMRA 1GOCA 3FGUA 1VAZA 2P9LB 4QS9A 4BDZA 1QHTA 1NGFA 2HVIA 3N4PA 4LFAK 5A2QO 3NFAA 4K42A 3HVRA 2NRZA 1C0FA 3A8YA 2X6NA 5AQOA 5AQRA 2HMIA 1DGKN 4CFAA 5KPTA 2FBTA 5F2RA 2IIRA 3LL3A 1XQSC 3WXKA 3F73A 3R6MA 4RWTA 1VRTA 4N41A 3VEYA 2EHGA 3ALYA 1K73O 1FJGK 3EY1A 3IG1A 2A42A 1Q9XA 4JI2K 4I6MA 2GUIA 1ZBUA 1Z26A 1WSHA 2KZMA 4CZEA 4JKEA 1I39A 3C6HA 5BPMA 3P5JA 1NGHA 4GKJK 3L2QA 4DR1K 4CJSA 1OH8A 4B9UA 4AHSA 1HJOA 3QIOA 1YI2N 4HTUA 2IVNA 1RT3A 2ZGZA 4JS5A 3C6UA 2BUPA 4M3RA 1S5JA 5HBMA 4CHNA 5KI6A 2E2PA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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