2IIRA

Acetate kinase from a hypothermophile thermotoga maritima
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
400
structure length
400
Chain Sequence
MRVLVINSGSSSIKYQLIEMEGEKVLCKGIAERIGIEGSRLVHRVGDEKHVIERELPDHEEALKLILNTLVDEKLGVIKDLKEIDAVGHRVVHGGERFKESVLVDEEVLKAIEEVSPLAPLHNPANLMGIKAAMKLLPGVPNVAVFDTAFHQTIPQKAYLYAIPYEYYEKYKIRRYGFHGTSHRYVSKRAAEILGKKLEELKIITCHIGNGASVAAVKYGKCVDTSMGFTPLEGLVMGTRSGDLDPAIPFFIMEKEGISPQEMYDILNKKSGVYGLSKGFSSDMRDIEEAALKGDEWCKLVLEIYDYRIAKYIGAYAAAMNGVDAIVFTAGVGENSPITREDVCSYLEFLGVKLDKQKNEETIRGKEGIISTPDSRVKVLVVPTNEELMIARDTKEIVEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Acetate kinase from a hypothermophile Thermotoga maritima
rcsb
molecule tags Transferase
source organism Thermotoga maritima
molecule keywords Acetate kinase
total genus 132
structure length 400
sequence length 400
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2006-09-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2iirA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2iirA02
4BRIA 5BREA 1JCGA 1E4FT 3A5OC 1KAZA 4FOEA 2A40A 2Q0UA 5AQNA 4J8FA 4CZFA 1ZXOA 3KVGA 3WT0A 4BR7A 4ISGA 3ZX3A 5BRDA 4JNEA 4BRCA 1V4SA 3A5LC 2H3GX 2P9KA 3VGMA 2GWKA 4BG8A 1NWKA 3ULEB 2I7PA 2Q0RA 5KQ8A 1HKBA 3QFUA 4WQ5C 4BROA 3GDQA 4CZIA 3QBWA 3G25A 2YHWA 1NGDA 2KHOA 4H0PA 3IDHA 2P9PA 4WYBA 2BTFA 1GLJO 4IWVA 2OANA 3ENHA 3WXIA 3IMXA 4CBWA 4JD2B 2E20A 4CD3A 3JXUA 3CQXA 4RCHA 3HTVA 1OKJA 2W41A 4RTFD 3O80A 3EZWA 5AQPA 3SMSA 4BR0A 5F0XA 4CZLA 3CI5A 1BO5O 1ZC6A 2HMPA 2Q31A 1U6ZA 4H5VA 3WXLA 2Q36A 4H0OA 5BPMA 1GLDG 1HKGA 4FPAA 2FSNA 1K8KA 4CD1A 4YDUC 3MMVA 3A0IX 2FXUA 2QWQA 2ZGZA 3GOIA 5KPTA 2D0PA 1KAXA 1HUXA 4M7XA 1BDGA 5JMVA 4FOIA 1G99A 1NLVA 3EN9A 1ESVA 2GTDA 4BRLA 4CBUA 4EIAA 1IJJA 4AM7A 3TPQA 1S3XA 4K25A 5AQYA 2ZWHA 1WUAA 2PBDA 1XQSC 3AAQA 5AQMA 5FPEA 4H0TB 1SQKA 1NGCA 1C0GA 3ZETB 3DAWA 4MLHA 5BR9A 3CJ1A 3LM9A 3CIPA 3ZEUB 4C23A 3CHWA 2J4RA 3GE1A 3HI0A 2NRHA 4BRKA 2IVOA 4K41A 4DQ8A 3CJBA 1T44A 1T6CA 2YI1A 2FF6A 3R6MA 5ELZA 3A8YA 4FO0A 3DXMB 1RDWX 4ISEA 4BR2A 4ISFA 3VEYA 4BVOA 4RWTA 1NGHA 4B1VA 3W3DA 2Q1NA 3FZFA 4GY2B 4PKIA 3BF3A 3WEEB 2I7NA 3WQUA 1X9JA 3IUCA 3CJAA 3I33A 3H3OB 4MO4A 1P8ZA 5LJWA 3GL1A 2AA4A 3O6WA 3A5NC 1NMDA 3L6QA 2GEMA 1XUPO 3S41A 2P9SB 2P9UB 2E1ZA 2IVPA 3C7NB 4M7YA 2YJEA 3UKRA 2QWNA 3LDNA 2CGLA 5F2RA 4H0XB 2AP1A 3H45C 4JN4A 4BRFA 3A5MC 1HX1A 5BPLA 4NB4A 2IIRA 3QDKA 3DWLA 1XC3A 3VEXA 2YHYA 4CBXA 3VPZA 3SLCA 3DJCA 3UE5A 2DPNA 3CERA 3VF2A 1BA1A 4MO5A 4BRMA 1Z6RA 1SAZA 3LL3A 1GLFO 2QXLA 5EX5A 2A6AA 2P9KB 4CZGA 5BN8A 4MLEA 4BRQA 3HSCA 5ADXH 5JLFA 3AAPA 4I6MA 2VWBA 1X3NA 5E84A 2D1KA 3U8XA 2HF3A 3FFKB 2W40A 4K43A 2CH6A 4K42A 4XH1A 4B9QA 3BF1A 5EXWA 3VENA 1YAGA 2P9PB 3L0QA 3R8EA 3RSEA 2E1YA 3OHRA 3BEXA 1R59O 5AQXA 1U2VA 2CH5A 2YCHA 2E2OA 3LM2A 3O5BA 2GUPA 3O1WA 2ASMA 3EKUA 2PAVA 3ATVA 4B1YB 4FL9A 1NGGA 4PL7A 1RGIA 3HBTA 2E2NA 4EHTA 1NGBA 2ZGYA 3GBTA 4A2AA 4B1ZA 5ADXA 2A5XA 3O08A 3ATUA 2D0OA 1GLCG 2QWMA 3VEZA 4H5WA 5JLHA 5FPNA 2NLXA 2V52B 1RFQA 5FPMA 3LDPA 4KBOA 4CZMA 3UB5A 5AQVA 5BN9A 3BP8A 2E2QA 3D2FA 1BUPA 4BGAA 3VEVA 5AQWA 3FZMA 2ZF5O 4B1WB 1MA9B 1KAYA 4IJNA 1TYQB 3FR0A 1BG3A 4JD2A 3DXKA 1DEJA 1D4XA 3FZKA 4FWNA 2P9IA 4BG9A 3WXKA 2HOEA 3WQTA 1TUUA 3M1FA 4O5FA 1JCFA 4H03B 4AM6A 3KHYA 2D4WA 2ASOA 1BWFO 5EY4A 3VGLA 4BGBA 2A3ZA 4BR5A 3ID8A 5AZJA 5TKYA 2EWSA 4CI6A 3QFPA 1HLUA 3H46O 4L3QA 3FE1A 3FZHA 3SJHA 5AQLA 4BC5A 4IXCA 4IZ9A 1WOQA 4BC3A 4H5TA 4BRPA 3FZLA 1T6DA 4HTLA 1NGEA 3KZBA 1X3MA 4BC2A 5CE3A 5AQUA 4EFHA 5AQQA 3MK6A 3MN6A 2P9NA 1ATSA 3VF6A 5EVZA 4FWLA 2A42A 2Q2RA 3TU5A 4A2BA 1NBWA 3BUZB 3UKRB 4BQLA 4WQ4A 4FWKA 2A41A 4XH5A 5KPRA 5KQDA 4JHDA 3ZX2A 4WQ5A 4H0YB 2P9LA 4DB3A 2V51B 4A61A 3D2EA 1DGKN 1NGFA 3D7EO 1HJOA 4HWIA 3WEEA 1JCEA 2QWLA 3VERA 3QB0A 2F9WA 4H5RA 3MN7A 5E26A 3WXJA 3J8AA 4IO8A 5LY3A 4XH4A 3VF4A 2P9SA 5FPDA 1IG8A 5KPZA 1GLAG 3FGUA 4B1UB 1DKGD 5AZIA 3B8AX 4E1JA 2E8AA 5AQGA 3R9PA 3U9ZA 5AQHA 1SZ2A 3LDQA 3AY9A 3H1VX 1HKCA 3JS6A 4XEIA 1Q18A 4YDUA 1ATNA 1LOTB 3GG4A 3UKUA 5EOYA 3RSEB 3HM8A 3MN5A 4BR4A 1NGAA 4BRHA 4F9OA 1U2VB 3U4LA 3SK3A 3QMLA 2FLOA 4Z94A 5AQFA 3QBXA 1QQNA 3O1BA 4EAHD 4EHUA 3IFRA 3LDLA 4CZKA 1NGJA 1LCUA 3VGKA 4GNIA 4FWOA 2NZTA 4NO7A 1TUYA 2YHXA 3EKSA 1Z05A 3F9MA 4WQ4C 1QHAA 5AQIA 3ULEA 5JICA 5BRHA 3H3NO 3MN9A 5LJVA 1QZ5A 4PKGA 3ENOA 2VCPA 4LC9B 1K8KB 3CJCA 4H5NA 4BRNA 5F1XA 2FF3B 3D2FB 5BPNA 4Y0WA 4BC4A 3CQYA 3P4IA 3W0LA 2QM1A 4FWSA 3DXKB 1YXQA 3ZX0A 5AQZA 1S22A 2E88A 3AARA 3CETA 2UYTA 2P9IB 4A62A 3C0BA 3EL2A 1QQOA 2FSKA 2QWRA 1NM1A 5I9EB 4DCHA 1MWMA 3WUHA 2ITMA 1BOTO 1NGIA 2IVNA 1Y64A 1ATRA 1BA0A 5AR0A 3HZ6A 4BREA 2E2PA 5AZJB 4BRAA 4CZJA 5AQSA 3O8MA 1KXPA 2ASPA 1ZBSA 4FWQA 2CGKA 1QQMA 4QS9A 2VYPA 5AFUH 3H1QA 2QWPA 1TYQA 4O8KA 4BVPA 4FWPA 1YVNA 1GLLO 2BUPA 4B1XB 4BRGA 1HPMA 4FSVA 3VEOA 4BRDA 3H6EA 1EQYA 2YJFA 3VETA 1V4TA 3ZETA 3I8BA 5AQTA 3MCPA 2F9TA 3U9DA 2P9NB 4QS8A 2QWOA 1BU6O 1MWKA 3ZEUA 3L4IA 3M3ZA 3LDOA 5AQOA 4BQZA 3O4WA 3VESA 5B8HA 4JHDB 4CZHA 2P9LB 1CZAN 3CJ7A 1YUWA 3DXMA 3EO3A 3D2EB 3FLCO 5AFUA 1E4GT 5AQKA 3SMPA 2GELA 4PL8A 2HF4A 1H1VA 5AQRA 5BRFA 4PKHA 1C0FA 4CZEA 2FSJA 1J6ZA 2V7YA 4JAXA 3VEWA 2QW9A 3CJ9A 4FWMA 1GLBG 2P9UA 4M63C 5AZIB 2GWJA 3C7NA 4H0VB 4CJ7A 4BR9A 4I6MB 3QICA 2CGJA 4QS7A 4IJAA 4FPBA 5AQJA 3M6GA 3MDQA 2V7ZA 4DHYA 3VOVA 3UKUB 2WUSA 1GLEG 2Q97A 4FWRA 1QZ6A 1MDUB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BRIA 3KIOA 1RDAA 2Q0UA 5AQNA 1S5JA 4X65K 4BDZA 4J8FA 4DV0K 3KVGA 3AVCA 5CZ2A 5BRDA 4NXNK 4KHYA 3CC2N 4E1NA 1LAVA 2QI2A 4M3WA 4DFJA 1TKTA 3LAKA 1BI4A 1HKBA 4H4MA 1QSLA 1JL2A 3EY1A 3KLIA 1N5YA 1VK0A 4B3SK 5J2NA 2KHOA 3VQEA 4WYBA 4F4KA 4FJ5A 1D8YA 1LW0A 4Y1CA 2OANA 4RW9A 1Q9YA 4KPYA 4K0KK 3ULDA 3THWB 1SL0A 1O1WA 3NF7A 5CHIA 3PX4A 3KLGA 3JXUA 1JXBA 3HTVA 4CIGA 3SMSA 4IFEA 4WCEL 3TSPA 1VRUA 2G8VA 4FJJA 2E6LA 2Q36A 4H0OA 4M3ZA 1B92A 4DV5K 4FPAA 3THXB 3TI0A 5GAHP 4W5QA 3GOIA 1VSKA 5KPTA 2D0PA 2UUBK 4AILC 4FVUA 2IS3A 3HK2A 2QXFA 4GVEA 1D9DA 3EN9A 1ESVA 2GTDA 3ZSVA 4CESA 3E1YA 4RG8A 3DOKA 1IJJA 3O9QA 5M1NA 3K5NA 5AQMA 4I7FA 5FPEA 3V9WA 3ZETB 3DLHA 2X6SA 1F21A 4KAZA 2KLAA 5BR9A 4C23A 1E3MA 2IOCA 4ILHA 4CGHA 4EP5A 1WN7A 4K41A 4Q0BA 1T44A 2BH1A 4DQQA 5HOOA 4M3TA 4YY3K 2FF6A 4LFAK 1NK6A 4OPHA 1C0MA 2ZE2A 4FO0A 4ISEA 4RWTA 2JWKA 3OS0A 1OH7A 4E7JA 4JI5K 4FZYA 1U48A 1TL1A 3FZFA 2QK9A 1X9JA 5C2DA 4OVLA 1JLCA 4W5OA 2AA4A 4DFPA 3A5NC 4FJ9A 3S41A 2P9SB 2P9UB 3ZSQA 2XRIA 4CJVA 2YJEA 3CCRN 3ZCMA 3UKRA 2QWNA 5F2RA 4H0XB 4DU1A 4KHWA 1HX1A 1S1TA 4DV2K 2O8FA 2IIRA 2YHYA 4LD0A 3HP9A 3ZSXA 1SKSA 2HHQA 4BACA 1ZBUA 4MO5A 4RW6A 1SAZA 1VQ7N 2G8WA 1JLQA 4KO0A 4DMNA 4CZGA 3CCJN 4BRQA 5ADXH 4XIUA 3OYLA 3QIPA 4LF4K 4IEEA 4CJUA 2W40A 5C2FA 4DTNA 2CH6A 4K42A 4XH1A 2KFNA 3VENA 2P9PB 2WC9A 3LZIA 1YJWN 3ZSOA 3UIQA 1BCMA 4JI1K 3HT3A 2EHGA 3WNHA 4EZ6A 2ASMA 2PAVA 3CD6N 4E89A 4BY9C 4PL7A 1KLNA 1RGIA 3L2WA 4EHTA 2A5XA 4KHSA 3L3VA 2D0OA 1K6YA 1KSPA 4H5WA 3RMCA 3O4NA 4CIEA 2O8DB 3AVKA 4CF8A 2DTUA 3LDPA 5GAGP 2DFEA 3MX2A 3UB5A 4R79A 1KLMA 5AQVA 3NGIA 3RMAA 4OKKA 2E2QA 4J2BA 1KAYA 4B08A 1TYQB 3SAGA 1BG3A 1RBVA 3QIOA 3T1AA 3BDPA 3FZKA 3QERA 4M41A 2P9IA 4O5FA 4AM6A 3ZSRA 1BWFO 4DFKA 3ZSZA 3PIOL 1RT6A 3TSQA 5TKYA 1N36K 2B4JA 4I9LA 4B3OA 3OTOK 3K0SA 4JK9A 3FE1A 4IXCA 4IZ9A 3WNEA 3I0SA 4BRPA 1L3VA 1L3UA 1A5VA 3HPHA 1N34K 1YI2N 2NRWA 3KZBA 1ASWA 5AQQA 2HNYA 3SQ1A 1ATSA 3VF6A 2QA4N 5EVZA 2A42A 3RR7A 1S1XA 4CJPA 1YITN 1DLOA 3BUZB 3NH2A 5TKWA 3K59A 5J2QA 2P9LA 3QEWA 1FXXA 4DB3A 3V9UA 3CYMA 4FLUA 3D2EA 4DQSA 3TSUA 1HJOA 3WEEA 2QWLA 3QLHA 1CLQA 4CF2A 3EEQA 4H5RA 3MN7A 1QS4A 5E26A 3WXJA 2VG5A 3VQBA 5AJ3K 2KZMA 2Z1GA 4CECA 3Q7BA 3CCSN 4E1JA 3U3YA 3R9PA 3LALA 2FBTA 4G9ZA 3LDQA 2OTLN 3AY9A 2O8EA 5T7BA 4YFUA 3JS6A 4FJLA 4R5PA 1JL1A 3AVMA 5KRSA 2YV0X 4XEIA 2OPSA 1LOTB 5DM6L 3P38A 3K58A 3V1QA 4KI4A 3SZ2A 2NRVA 5CYMA 4Z4FA 1NGAA 4F9OA 4OJRA 2HHXA 2IDOA 2HNDA 4CEAA 3BY5A 4O55A 2YX6A 3MEDA 3NMUA 4FJHA 4OX9K 3QBXA 4L8RB 3O1BA 4EHUA 3CCMN 1DT9A 4FZZA 2HHWA 1NGJA 1R0AA 3DLKA 4NO7A 3S3OA 2YHXA 4ID1A 3LAMA 4WQ4C 5AQIA 5H1SQ 1YT3A 3OJSA 3DLBA 1LV5A 4GW6A 1QZ5A 3HYFA 2XY5A 1HNZK 1VQLN 3ENOA 4FLWA 3MEGA 3SJJA 3OS1A 5J2PA 4C8KA 3SYZA 3THVA 5HROA 4CJ3A 1U45A 4Y0WA 3VA3A 2OYQA 4WF9L 4E3SA 1YXQA 4BE1A 1Z26A 1IO2A 3SUOA 4JI3K 3EL2A 2O4GA 3RWUA 5I9EB 4B9UA 3WUHA 4CJRA 1NGIA 2IVNA 1RCHA 3AA2A 2ZJRL 4CEDA 3THXA 2E2PA 5AZJB 4BRAA 4QCLA 3KKRA 1TK5A 3SQ0A 2ASPA 3NFAA 4FWQA 3VA0A 4DTOA 5AFUH 3H1QA 1KFDA 2BE2A 2QWPA 3EYZA 4FWPA 4CFCA 1YVNA 1GLLO 4F2RA 3MWPA 4Z4EA 4BRGA 2G8IA 3M8SA 4KTQA 1HPMA 1ITGA 2D0CA 4I2QA 4CEBA 4CHPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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