2IJYA

Nmr structure ensemble for the reduced dsba disulphide oxidoreductase from vibrio cholerae
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
181
structure length
181
Chain Sequence
b'AQFKEGEHYQVLKTPASSSPVVSEFFSFYCPHCNTFEPIIAQLKQQLPEGAKFQKNHVSFMGGNMGQAMSKAYATMIALEVEDKMVPVMFNRIHTLRKPPKDEQELRQIFLDEGIDAAKFDAAYNGFAVDSMVRRFDKQFQDSGLTGVPAVVVNNRYLVQGQSAKSLDEYFDLVNYLLTLK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Probing the Flexibility of the DsbA Oxidoreductase from Vibrio cholerae-a (15)N - (1)H Heteronuclear NMR Relaxation Analysis of Oxidized and Reduced Forms of DsbA.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein dsbA
source organism Vibrio cholerae
molecule tags Oxidoreductase
total genus 50
structure length 181
sequence length 181
ec nomenclature ec 1.8.4.2: Protein-disulfide reductase (glutathione).
pdb deposition date 2006-10-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2ijyA00
3UVHA 2K8VA 2H01A 4WXTA 2K6VA 4PNFA 4FYCA 3KMNA 4BVYA 3I6AA 3KD0A 3GL5A 2DSAA 5H5RA 1MD3A 2C4JA 2YWIA 4V2LA 3ZRDA 2E2GA 1PX6A 4FYUA 4Q5FA 2C3QA 4EKZA 2FWGA 2AHEA 4WEYA 1ZYEA 2AB6A 5DQSA 5CRHA 4K7IA 3ZIJA 1O8XA 4D73A 5B6MA 1TRVA 3I9V2 2EIQA 3CRTA 3KIJA 1THXA 3UBKA 5ABRA 4DSSA 1QFNA 1URMA 2R6KA 2OBKA 2TIRA 4XS1A 4D73B 1SJZA 4PUAA 2CZ2A 2YJHA 4PURA 4PXOA 1PRXA 2PUKC 3UARA 1T7PB 2H30A 1OAZA 1EGRA 1A2LA 1FVKA 1ERWA 2H19A 2HXKA 3NZNA 5KN0A 2RM5A 6GSWA 4LMVA 5ID2B 4ACSA 5ENUA 1R5PA 2AJQB 4MCUA 5ECRB 1EV4A 1DE1A 3CSIA 3L9SA 4TN8A 3ZITA 1T4ZA 4ECCA 1E2YA 5G2ZA 2WCIA 1PQNA 3TB2A 2CQ9A 4MABA 1U87A 2YNXA 2H66A 5FHIA 1J08A 3TJJA 2EC4A 3F6DA 1SL1B 3RHCA 2XPEA 3CYNA 3E3EA 4N0VA 4MH2A 3KTLA 2VO4A 4FIWA 2F51A 4ZIJA 6GSYA 1A2JA 3D4MA 3KXOA 3M0FA 3EYTA 2H76A 2E7PA 1GSDA 5DCGA 2FWEA 4EE0A 3QDNA 1B4QA 3N5OA 2CAIA 3KTBA 4XHMA 1VF4A 3RDWA 1PL1A 1LU4A 3TOTA 3EWLA 2F9SA 1K0AA 4DEJA 2C80A 5JCWA 5L71A 3TOUA 1K0DA 2JZSA 3ZTLA 1OVNA 1R5AA 2FLSA 5J3RA 2HZEA 5ECLB 1BYEA 1I9DA 5GSSA 2H70A 5HQPA 4NXIA 3GSSA 2I81A 5F8BA 3LQ7A 5E59A 1XFLA 2LRCA 2DLXA 4YAPA 3IPZA 1KNGA 1ZGNA 5IIZA 2KHPA 3E0UA 1PA3A 2O85A 1SL2B 3UVTA 3IDVA 2GSTA 2V2GA 1ILOA 3K8NA 1DUGA 3E9JB 4MZWA 5IOWA 1F6MC 2I9HA 2IN3A 2RM6A 4PGTA 1F37A 1A23A 5DVBA 3VI5A 1U3IA 1PX7A 3HZ8A 1J9BA 1JHBA 2B1LA 4LL1B 1TU8A 1EEJA 5ECNB 1Q98A 3GN3A 4KDYA 3CSHA 3I43A 1EP7A 5DALA 1YJ6A 4HUAA 2FWHA 3HZ4A 1AUCA 1GL8A 3PINA 4GRFA 5B7CA 2FA4A 3C1RA 1GUHA 1O73A 2I1UA 4HQZA 3F8UA 2VLTA 3KZQA 2VL2A 3QFBC 2IL3A 1IYHA 2DJJA 2GQLA 5IM9A 4Q5RA 4K6XA 1GH2A 2P5RA 2KLXA 4HI7A 2H1BA 4GSTA 1RK4A 2BJXA 4FO5A 3GHAA 2WS2A 5C04A 1ZL9A 3H1NA 4MF5A 4JEDA 1GP1A 2FUG2 2IMEA 1OC9A 1OYJA 3U6VA 5ELGA 2CAQA 1QGVA 2ES7A 4KE3A 1SYRA 5AIXA 3BOAA 5IOXA 1AXDA 4TXVA 4QQ7A 3P2AA 2YPMA 3ERGA 2HT9A 3GFKA 2CVKA 3GTUB 2OA7A 5FWGA 1TK0B 2XBIA 4MF6A 1K3LA 3HVSA 2V32A 1YKCA 1WRYA 4TRXA 1GSSA 3HDCA 5B8AA 1DE2A 2L6DA 4QL7A 5DQYA 1FVJA 4ZL9A 1TK8B 1N8JA 1V98A 2IIYA 1SYXA 3ZMKA 1FB6A 20GSA 3IV4A 2B7KA 4DSRA 3TRPA 1GTAA 4ZB8A 1IYIA 2XBQA 3GRXA 1AQVA 18GSA 2PVOC 3F6FA 3F4SA 3GKXA 1X5EA 1AW9A 1SKSB 3WGXA 5CNWA 2QGVA 1PSQA 2JADA 4XRDA 1X0RA 4XRAA 3TGZA 3TCOA 3G7YA 4POBA 1TP9A 2HI7A 2GQMA 1FOVA 3FZAA 3LXTA 4GWRA 4I2TA 1Z7RA 4ZBBA 4V2NA 4IS0A 1X5CA 1S3DA 4AJ8A 4YH2A 12GSA 1M2BA 3H8QA 3L4NA 4TR1A 1BQ7A 1ON4A 1R26A 2KP2A 3EU3A 1KBNA 2KUCA 3ME7A 1B4PA 3ZL5A 4ULXA 3GUSA 2H6ZA 4MJAA 1WE0A 2G0FA 4GSNA 4IBPA 3GH6A 2B3SA 3L0HA 2RUEA 2CVBA 1VF3A 5ELAA 3CSJA 1YF1A 4GTUA 5EPFA 17GSA 1XBSA 2CVDA 3EU4A 9GSSA 2FCHA 3DEXA 3W6GA 3UJ1A 5KN1A 1M7TA 3VWVA 4KCAA 2AYTA 1SL0B 1PN9A 2VCTA 2LTKA 3SBCA 2PERA 1FHEA 1MDKA 4DVCA 3G7JA 5LD0A 1MDIA 4EUYA 6GSXA 2YWOA 4J56E 1NHYA 2X8CA 2F8AA 3Q6OA 3C73A 3APSA 5HFKA 1AIUA 5F0GA 4KX4A 1X9WB 2JU5A 5ECQB 2VUPA 4GXZA 2MMAA 2OE1A 3DD3A 3VLNA 1A0FA 2RLIA 2G2QA 3C1SA 1A24A 1AAZA 2X8HA 3LGCA 4NWYA 4MK3A 4AJ6A 3N9JA 3IR4A 3CXGA 2C0DA 3D22A 3BCKA 5IPHA 5A4UA 4K1FA 4BWQA 3BJ5A 2GTUA 3KH7A 2H73A 10GSA 3ZYWA 3GV1A 1HNCA 4ZL7A 1XPVA 4IW9A 1FG4A 5ECHB 3F4RA 4ZBDA 1QUWA 4V1Ag 5DAKA 4ZB6A 2R4VA 2FWFA 1ERUA 3FR9A 1XXUA 3DIEA 3KM6A 3MDKA 4L0UA 5ECIB 1UA5A 3A2XA 5DAKB 3US3A 3GURA 4JBBA 2I4AA 1XOBA 1AC1A 2TRXA 4RI6A 2C3TA 4OFNA 4X43A 3DVXA 3LORA 3RAZA 4IJ3A 3RPNA 3A2VA 4HJ2A 2VAFA 4IQAA 4I2UA 1XWKA 1YQ1A 2YCDA 3FZ5A 5D93A 2JACA 3FK8A 2FGXA 3P7XA 1EP8A 4POMA 4IKHA 2H74A 1SD9A 4PQHA 4Q5QA 3V1WA 2NDOA 3F9UA 1X9SB 1GSYA 6GSTA 3DYRA 3MNGA 3LEFA 1TRSA 1SK1A 1M9BA 2HZFA 3QAVA 2F3MA 22GSA 1OC8A 4Q5NA 13GSA 1TRWA 5HFGA 5D73A 1Y6EA 4BL7A 3VWXA 2LJAA 5H5SA 2VLVA 3QAGA 4DSSB 4N10A 1WOUA 4TW5A 3IBHA 3AY8A 2HFDA 2WFCA 3IK7A 3UAPA 4EDZA 2JSYA 3GYKA 2H1AA 2O8VB 2DIYA 3OR5A 2VM2A 2LNSA 2L5LA 1ZMAA 4MZBA 4PNGA 3WD6A 3BBYA 2C8UA 3VI7A 5CYYA 3PR8A 3HD5A 1GRXA 2I3YA 4WF5A 4GCIA 4GSSA 1VF2A 1GNEA 1GSEA 1XWGA 4K0NA 2E0QA 4TXOA 1YEXA 1C72A 5EVOA 1BJXA 4O5RA 3HJOA 4CW9A 4BA7A 3ME8A 2RIIA 1UC7A 1X5DA 2WB9A 1M9AA 1ABAA 1GNWA 3IRAA 4AJ7A 4HJMA 1ZCPA 5IMDA 4MMMA 3VURA 3BD2A 3WT2A 3M1GA 4AGSA 2ON7A 5HR0A 5JCUA 3DMLA 5B8BA 3VK9A 4F9ZA 4BPYA 4KAEA 4XCSA 2D2ZA 4RQXA 5CO3A 4MA9A 2NTOA 2C3NA 5GSTA 4QL9A 4IVFA 1K0BA 3ZVJA 2L5OA 4G2EA 2CA8A 3A5WA 2M46A 3HVXA 3LXZA 3BCIA 2HZEB 1EV9A 3F63A 1SJIA 3MSZA 5D9XA 2GSRA 1TKDB 3TDGA 3C71A 2LJKA 2P5QA 3CTGA 2IMDA 2GLRA 4MDCA 4PQIA 1FW1A 1HYUA 2RUFA 1U88A 3FHKA 5ECMB 3F3RA 3F0IA 4N11A 2GSQA 2FY6A 4YQMA 2X99A 2VIMA 1SK2A 1RQMA 4YQUA 5COHA 3ISOA 1S3CA 2P0GA 4WF4A 1B9XC 4MF7A 3QAWA 3IE3A 4F0BA 3APQA 2VCWA 1VGLA 2PBJA 4IJIA 3HVVA 5DBQA 2NBSA 1Q4JA 1YY7A 3UMAA 2B5EA 1K3YA 2LS5A 3LYKA 2ON5A 3MWHA 5ECSA 4EDYA 1SKRB 4OWYA 1U6TA 3O76A 1HQOA 4NAXA 2B1KA 1QQ2A 2ZUPA 1VF1A 5GAPD 5DALB 3TRXA 4HZ2A 2GT6A 3TKRA 2B5YA 4DSQA 2XPDA 1PGTA 4ZB9A 2LJRA 4K0GA 4POLA 2DJ1A 5JWQB 3RBTA 3A3TA 5EY6A 4L5LA 2YZHA 5G31A 1LBKA 3QPMA 5DJMA 4AF2A 3A2WA 3M3MA 4MH3A 2LQQA 4IHUA 1OKDA 2YANA 2MMOA 4NMUA 2PMTA 3GX8A 5IPGA 2DC5A 2J23A 2WZ9A 3J7Yk 4WR4A 3FR3A 4YAVA 2OJLA 2VL2C 5J9CA 3H4KA 2JSZA 1NSWA 1JZOA 1OC9B 5EL8A 1F9MA 4XTSA 2FA8A 5H5QA 1GWCA 1XW9A 1J0FA 1MDJA 1SENA 5DCHA 5INYA 4ECBA 3ZZXA 4IN0A 1I5GA 1BX9A 1M99A 2IJYA 1VRSD 4HS1A 1GTIA 2N5BA 3VWUA 3J7Yb 5KN2A 1OE8A 1A2MA 1CQGA 2VL9A 8GSSA 2B7JA 2O89A 3HY2A 3VPTA 2XHFA 3TUEA 3D4TA 4WKWA 3KMOA 2K9FA 3IHQA 2PVQA 3D5JA 1WIKA 1DSBA 1TJDA 3G9BA 3C7MA 3CBUA 4ZILA 1JZRA 2M80A 4FYBA 1F2EA 3U5RE 4ZL8A 5JWRB 3ZFBA 1SK0A 4J2FA 5D8IA 2L4QA 3IOSA 3GNJA 4MPFA 2CT6A 5DDLA 2KOKA 2C0GA 1KEBA 4IP1A 4MP4A 7GSSA 1V58A 2GT5A 3LG6A 4MJEA 1ERTA 4TR4A 2DBCA 3GIXA 1MTCA 3IA1A 4J57E 3M8NA 1XWBA 2JZTA 5D9TA 1Z6NA 2H6XA 1NHOA 1GLQA 3QOUA 1O85A 3ZMLA 1V57A 2C1YA 4HQSA 5ECPB 4NPBA 4K2DA 3FYGA 4KCEA 4TR1B 4KDUA 5F06A 1U3AA 1THOA 2F8FA 1HD2A 1GLPA 2HRFA 3QR6A 1JLWA 3P90A 4PX1A 4LA1A 2A4VA 5DJLA 3APOA 5LCZA 4TVEA 3GKNA 4OFMA 2HSHA 2CZ3A 4KSMA 2GZPA 2QKEA 5G5FA 3TKSA 3W8JA 2R5GA 2IMKA 3FR6A 4BVXA 5HR2A 3FKFA 4L5OA 2JZRA 2B5XA 4JRRA 1TXXA 2LV3A 1M2AA 3FZ4A 1B48A 2LRNA 4MJBA 4MZCA 2OADA 2OBIA 3GL3A 2YWNA 2PGTA 2H72A 5A4VA 3DGQA 1FB0A 4RQRA 3WT1A 3HYPA 5FT3A 4X1UA 5GAND 3GX0A 1OKTA 1K3OA 2FD3A 3UEMA 1TOFA 2HYXA 2P31A 3QCPA 3IK9A 3W8SA 2K8SA 5J4UA 5G5EA 5HR1A 4HEA2 1TDIA 1SU9A 2LRTA 1USBA 1K0CA 2IWTA 4HZ4A 1GTBA 1TW9A 4RUVA 4EVMA 1Z6MA 3GKKA 4KB3A 4XS4A 2YV9A 4CHSA 1YF0A 5E4WA 3UIWA 1WP0A 3DXBA 4K8MA 2DJKA 1PKZA 3IXRA 2EIOA 2KP1A 4KGIA 1T00A 3KJYA 4HU7A 2WRTA 1Z9HA 2VCVA 1GSQA 1Z5YE 2O87A 2PN8A 6GSVA 5IO2A 1A8YA 1K0MA 1TI1A 2H1GA 1RW1A 4KNDA 3EURA 4EXJA 2CX3A 1GSUA 1UVZA 3CMIA 2MZCA 2H1DA 1EOGA 2X64A 3NOFA 5CRWA 3D0ZA 3VWWA 1G6WA 3CTFA 1YKAA 1AQXA 1WJKA 2B6MA 2OE0A 4N30A 2A2SA 2V41A 4G9HA 5CRGA 3HXSA 2VCZA 3I69A 1XWAA 2C0FA 2LUSA 4NV2A 1YZXA 2IMFA 1G0TA 3H79A 3L78A 4KH7A 2HSYA 3LFLA 3LWAA 5LNKe 4PUFC 4KUNA 2O7KA 2GGTA 2OKAA 2LNTA 1QK8A 1ACVA 1T3BA 2XC2A 19GSA 1TI3A 1S3AA 3FW2A 3VPQA 3TJFA 5ID2A 3Q19A 2GSSA 4I8BA 1Y25A 6GSUA 3DVWA 2MMNA 3HJMA 2DMMA 4TKYA 3L9UA 3PH9A 3TJBA 2LKUA 3EINA 4K7NA 3S9FA 3G7IA 1R4WA 3ZREA 2J9HA 2VD1A 4P3YB 1XIYA 3HKRA 3NIVA 3HHVA 4JZQA 1PMTA 3EMPA 4JR6A 5CAXA 1K0OA 2ZCTA 2VOCA 3ZVJD 1M2DA 2TRCP 5A4WA 3IAS2 4TXOB 4OCEA 2GZZA 2V6KA 1WMJA 3GMFA 1B9YC 5AGYA 1OC3A 1ML6A 2VLUA 2YWMA 3GH9A 5KN3A 4ZBAA 3WGDA 3PGTA 4WETA 1AQWA 4IP6A 5CP1A 4WBJA 1EGOA 2GDRA 3WYWA 4EC0A 3VFIA 4KA0A 3LJRA 4XS6A 4O7HA 1A0RP 5IQYA 3UL3A 1R7HA 4V1Ap 3HJPA 1HNBA 1FAAA 1EWXA 4F82A 5AIVA 1SD8A 3TKQA 1HNAA 1TK5B 2WULA 1TRUA 3O3TA 5J5NA 4RI7A 3FZ9A 3GA4A 4I97A 4L0WA 1WPIA 5HR3A 14GSA 16GSA 4N0ZA 5ECOB 3C8EA 2OACA 2IFQA 2GQKA 4POKA 1T8EB 1E6BA 3EMXA 6GSSA 4ECIA 1UN2A 4PQ1A 4ILFA 4MLYA 4TR0A 2DJ2A 2WDUA 3D6IA 4IGJA 3IAM2 2V1MA 2R2JA 1LJRA 2CV4A 2HRNA 3F3QA 3UBLA 3DKSA 3ZIVA 2IFQB 1JLVA 2AAWA 3EVIA 2DIZA 2WJUA 2YV7A 2PWJA 3WGEA 1EZKA 4MPGA 2PU9C 2DJ0A 5IMCA 5C00A 1H75A 2MBSA 5IMFA 5IMZA 2HNLA 2QC7A 2BTOT 2K18A 5J9BA 3DRNA 2C0EA 4BWSA 3FY7A 5HFIA 4OO5A 2AUVA 1TU7A 2R3XA 1BEDA 3KEBA 1EEMA 2REMA 4GLTA 1PD21 1CQHA 1G7OA 2Z9SA 3QMXA 4OD7A 1K0NA 3GSTA 4G10A 1T4YA 3MAKA 3KP8A 1W4VA 1O8WA 1JZDA 3DWVA 2H8LA 5G1LA 2YP6A 4OCFA 5J41A 3QFAC 4O92A 4I5QA 3GTUA 3TJGA 1WWJA 4TOPA 4HOJA 1XVQA 1Z3EA 4KW6A 4E8EA 4F2IA 3HA9A 4F0CA 1XVWA 5F07A 3LYPA 4G19A 1NM3A 2IPAA 3ERWA 2N5FA 3P8WA 4NHZA 5AN1A 1XWCA 5IMAA 4OO4A 2DMLA 3Q74A 2MMZA 4KSOA 4GF0A 4Z7XA 5G30A 1YEPA 2YZUA 3R2QA 4HDEA 5D9WA 3KCMA 1ZYQB 1ST9A 2DJ3A 1F3BA 2VCXA 1QMVA 2ZNMA 2H0HA 3M9JA 5JWOB 4OMVA 4K7OA 4E8HA 11GSA 2VM1A 2FNOA 2YJ7A 4HU9A 1GULA 5F05A 4FH8A 3FRCA 3LSZA 1XOAA 4X0XA 1GUMA 2AV4A 5GZZB 3CRUA 4GQCA 2VD0A 1A8LA 1N2AA 2H71A 3TKPA 2H0GA 1G7EA 5D96A 1XCCA 4ML1A 4IELA 1QXHA 3ZFLA 1M0UA 2E2MA 2L4CA 1JZWA 3EC3A 5IO0A 5B6NA 3QD9A 4MJCA 1GTUA 4OFTA 2MYGA 4JU5A 1ZOFA 5A5KA 3RHBA 4O32A 4ECJA 1YDKA 1O81A 2V6OA 3ERFA 3FEUA 2JL4A 2GS3A 3TKSE 1O6JA 3UOMA 4NV5A 2MBTA 4YQVA 3ED3A 1BG5A 3F4TA 4XIHA 2L57A 1MEKA 3M9KA 3TRQA 2ALBA 4F03A 1V2AA 4ML6A 4L8EA 1O7UA 3O6TA 3RPPA 4LLRA 3D21A 2HLSA 2GVPA 4IQ1A 4KDXA 2VCQA 1EOHA 1GUKA 4GQFA 4V2MA 1GSFA 2N5AA 1MD4A 2VL3A 2QSIA 1W89A 3Q18A 1ZZYA 3KH9A 1Z7PA 3HCZA 5CREA 3L9VA 4I6XA 1V9WA 3TJKA 3GKMA 5G1KA 4NHWA 2M72A 2NPBA 3H93A 1PKWA 4ID0A 2L59A 1T1VA 4EF0A 4H86A 4CDOA 2EIRA 5JCGA 3TKSC 2PPTA 1ERVA 4EO3A 5IMVA 5AISA 2CX4A 1F3AA 5CRDA 1NW2A 4WR5A 5ECKB 5D9VA 1XW5A 4EL1A 2A2RA 2HE3A 2BMXA 4LL4B 1XW6A 1SJ6A 2GZYA 2OE3A 1X9MB 2LSTA 1BAYA 2H75A 2YN1A 3SWLA 2IMIA 1OE7A 2LQOA 1KTEA 1DBYA 2LEGA 3IC4A 2R37A 4TR3A 3KGKA 4JE1A 3ZLPA 1V40A 5KEJA 3EE2A 4JR4A 2H6YA 2NVLA 1FO5A 4ZXGA 2L6CA 4XS4B 3KP9A 1PL2A 1JFUA 2WGRA 4ISDA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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