2IJYA

Nmr structure ensemble for the reduced dsba disulphide oxidoreductase from vibrio cholerae
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
181
structure length
181
Chain Sequence
AQFKEGEHYQVLKTPASSSPVVSEFFSFYCPHCNTFEPIIAQLKQQLPEGAKFQKNHVSFMGGNMGQAMSKAYATMIALEVEDKMVPVMFNRIHTLRKPPKDEQELRQIFLDEGIDAAKFDAAYNGFAVDSMVRRFDKQFQDSGLTGVPAVVVNNRYLVQGQSAKSLDEYFDLVNYLLTLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Probing the Flexibility of the DsbA Oxidoreductase from Vibrio cholerae-a (15)N - (1)H Heteronuclear NMR Relaxation Analysis of Oxidized and Reduced Forms of DsbA.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein dsbA
molecule tags Oxidoreductase
source organism Vibrio cholerae
total genus 50
structure length 181
sequence length 181
ec nomenclature ec 1.8.4.2: Protein-disulfide reductase (glutathione).
pdb deposition date 2006-10-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2ijyA00
3GN3A 2WB9A 3VWVA 1Y6EA 1A0FA 1O81A 3HDCA 1OVNA 3G7JA 5HFIA 2OBIA 4WXTA 5DJLA 3FRCA 3G7IA 1SD9A 2IMDA 4JZQA 3HXSA 1SK1A 4QL9A 4NV5A 2BTOT 3ZIVA 3FZ9A 4L8EA 1WE0A 1YEXA 2IMFA 3GL5A 2M72A 4ECJA 4NPBA 2REMA 2C1YA 4Q5NA 3LORA 3TRXA 1K0MA 2AAWA 3QAVA 2L6CA 2YANA 1A0RP 3D4TA 4IP1A 4BWSA 5IM9A 3LWAA 1WWJA 2M46A 1F37A 4MPGA 2X8CA 2I9HA 1XVQA 2GS3A 2R4VA 4J57E 4PQIA 2VAFA 5B8BA 2JSYA 4ID0A 3W8JA 3MNGA 1XFLA 2HRNA 1PL1A 2EIRA 3RPPA 2V2GA 3LXZA 3GTUA 3ZRDA 1EGOA 2VL2C 4KGIA 2H0GA 1V2AA 4EL1A 4FYCA 1RQMA 5JCGA 2IMEA 3N9JA 4TW5A 4HZ4A 5HFKA 3GA4A 1U3IA 1K0AA 4TN8A 5F07A 4MZBA 2CQ9A 5G1KA 4ZBDA 3KXOA 3LGCA 4HQZA 5ID2A 4HU7A 2C4JA 4EC0A 2H1GA 1OC9B 2OE1A 2C3QA 4K2DA 3F9UA 4RQXA 2H75A 2F9SA 2IMIA 3N5OA 4ML6A 2JACA 5J3RA 4CDOA 4HUAA 1S3CA 2MBTA 1JZWA 1K3YA 1T8EB 5IO2A 3TJBA 1LJRA 1PN9A 5CP1A 3TGZA 4ECCA 4ILFA 1SL1B 3FW2A 2XBQA 3QAWA 3A3TA 1ZCPA 2YJHA 4EDZA 5L71A 2H1BA 5HR3A 1GWCA 3A2XA 3FEUA 2VCWA 4XCSA 3ZVJD 2DJ3A 2VCZA 2VCXA 2E2MA 1TRWA 4ZL9A 1SK2A 1C72A 1GUKA 3C73A 2H66A 5ECOB 3HYPA 5DCGA 2V41A 3IA1A 4GQCA 4MZCA 2O7KA 2DSAA 3DWVA 1X5DA 1TRSA 4FYUA 2DIZA 6GSUA 3NOFA 4G9HA 3HA9A 4DSSB 2JU5A 2CVBA 3F6FA 3V1WA 4KH7A 4FIWA 1AQVA 2YZHA 4JRRA 1BYEA 1OAZA 1EEJA 2OA7A 4Z7XA 3GV1A 1GSEA 4HJ2A 2X99A 1PD21 3IOSA 2L4CA 3RHBA 2DBCA 1G6YA 2VLTA 2GT5A 1BQ7A 1ZYQB 5F8BA 4TXVA 1LU4A 3TJJA 1TK8B 3IXRA 2WJUA 2EIOA 2FWFA 4EUYA 1TKDB 4L0UA 4N30A 3GKXA 4NXIA 1XOAA 1SL2B 3CBUA 5DJMA 2MBSA 2FHEA 1F3BA 4N10A 5A4UA 3BCKA 5FWGA 1PX7A 1YKCA 1A2MA 2F8AA 1EOHA 3ERWA 3TOUA 1A2JA 4MP4A 5ECRB 2LNTA 2V6KA 2H1AA 5DQSA 3TRPA 4K6XA 4ZB8A 1XWBA 3CTFA 1DBYA 2D2ZA 1B4QA 1R7HA 2F8FA 3GUSA 3RBTA 2H76A 3VPQA 2WRTA 2AYTA 1VRSD 4KCAA 1SYXA 1XZOA 5IO0A 1AQWA 1SKSB 4V1Ag 5E59A 1U87A 5F06A 1TK5B 3ZFBA 5E4WA 3EURA 3PGTA 4IW9A 4V1Ap 2DJKA 4YQVA 2V32A 4IQ1A 3ZYWA 3FK8A 2AJQB 9GSSA 2O8VB 4FH8A 2GSRA 2LJKA 4TRXA 1PQNA 3RDWA 3CTGA 1QK8A 3TKQA 1DSBA 5ECMB 5IMZA 4MH2A 1XVWA 1HNBA 3KH7A 1O8XA 4XS1A 3ERFA 2HYXA 22GSA 3VFIA 1O7UA 1VF2A 1T7PB 2YWNA 3ZZXA 2YV9A 3WYWA 3GFKA 4P3YB 1SU9A 3D22A 2N5AA 1TU7A 2GSQA 3GL3A 2I4AA 3UOMA 5D9VA 4X43A 2OACA 1K3OA 3MAKA 3DGQA 3P7XA 5IQYA 2DMLA 2X64A 1WRYA 5J9BA 4F0BA 3TCOA 2VD1A 1AUCA 4ZL7A 3VI7A 2JZRA 5F05A 1F2EA 2FD3A 3L78A 4PXOA 4OD7A 4OFTA 3EC3A 2PWJA 1GSDA 1JLVA 5DAKA 3BBYA 3QFAC 5AGYA 3HD5A 2HI7A 1XWGA 3KGKA 3DVWA 4NWYA 4OO4A 2GGTA 1EGRA 1WMJA 1TI3A 2KP2A 3HVSA 3EWLA 1T3BA 1B48A 2NVLA 2B7JA 4HS1A 3TKRA 2ES7A 1NW2A 2LTKA 1K0NA 6GSTA 2H19A 3QR6A 1EV4A 1SYRA 2F51A 2H30A 3CXGA 4JR6A 4L5LA 3D4MA 5CNWA 2H71A 2OBKA 1THOA 3BCIA 4JU5A 5HR1A 4BWQA 1M0UA 4KCEA 1O73A 3EMPA 4K9ZA 4ACSA 2B3SA 3H79A 4POKA 3F8UA 5CRHA 3F3RA 5IOXA 1OYJA 4IP6A 4J2FA 1FO5A 2VL2A 4EF0A 7GSSA 2FUG2 3U5RE 1O8WA 5C00A 3M1GA 2XPDA 3FYGA 2PVOC 4GRFA 2FNOA 4O92A 3CMIA 2ZNMA 2CAQA 2AHEA 5G5FA 2HZEA 2LNSA 3LSZA 3WD6A 2WS2A 3H8QA 1VF3A 4GTUA 5J41A 4XS4B 2C80A 3NZNA 2LUSA 3K8NA 2FGXA 1NSWA 3GX0A 2FWGA 2VUPA 2PVQA 5CRWA 1TXXA 2CVKA 1V57A 3IPZA 4GSTA 2XHFA 2OADA 4MJBA 3FR6A 1MDJA 5D9WA 4MZWA 3UMAA 4BVXA 2J23A 1PSQA 4KX4A 2H6YA 1OKTA 4G2EA 4N0ZA 2WDUA 1EP8A 2C0DA 4ZIJA 3EE2A 4OFMA 4IKHA 2EIQA 1MD3A 1GNWA 4AJ7A 3UAPA 4GWRA 4MK3A 2IN3A 3FZAA 4EE0A 4PURA 3P90A 4HDEA 2C8UA 4QQ7A 5CO3A 2M80A 3KMNA 3L9SA 3HCZA 3J7Yk 3KIJA 3C8EA 3DXBA 3D6IA 2RM5A 3UEMA 8GSSA 2JSZA 1XOBA 3HJPA 5GAPD 2C3NA 2NDOA 1PA3A 4L0WA 3BOAA 3ZTLA 2P5RA 3P2AA 5ELAA 3C1RA 2GLRA 4EXJA 1HNAA 2GVPA 2YV7A 1BG5A 3C71A 1K0DA 4KDXA 4TR3A 3I69A 1PRXA 4K8MA 4MPFA 2PN8A 1TJDA 4POMA 3VWUA 3ME7A 2ON5A 4CW9A 18GSA 3WGEA 1PMTA 3EYTA 1Z6MA 1ILOA 4YAPA 5IIZA 1MEKA 1JHBA 2VLUA 5ID2B 4GSNA 4MJCA 3G7YA 3IK9A 1B9YC 2FCHA 4YQMA 3VK9A 1EZKA 2EC4A 1EOGA 1MDIA 4NHZA 4OWYA 2GZPA 3EU4A 4ULXA 1TDIA 3QAGA 2IL3A 1SL0B 3HHVA 4PX1A 5ECQB 2ALBA 5A4VA 1FW1A 3CYNA 3FR9A 4AGSA 3GMFA 4IN0A 4HEA2 3NIVA 4AJ8A 4IVFA 4KW6A 4MDCA 5D9TA 1X5CA 1G7OA 4I5QA 1SK0A 1Q98A 1YJ6A 1ZMAA 2OKAA 3O3TA 3EVIA 4POBA 3ZREA 4LMWA 5KN0A 1G6WA 2PBJA 5B7CA 4TXOB 1F6MC 2N5BA 4WF4A 2CX3A 3IE3A 2JADA 3ME8A 4AF2A 4BPYA 2TRXA 4NV2A 4JE1A 3QFBC 1XWKA 4TVEA 1SJZA 5LCZA 3E3EA 2H74A 4PUFC 1YF1A 2HZFA 2OE0A 4PUAA 1YZXA 3LXTA 1TW9A 1X9WB 2WULA 3TB2A 1J0FA 3D21A 2OJLA 1M9BA 4L5OA 1PL2A 4V2NA 4E8EA 4LL1B 2LSTA 3M9KA 5G2ZA 1ERWA 2E7PA 5F0GA 4ZB6A 1AAZA 1ERUA 4KAEA 3ZLPA 4EVMA 3UARA 1RK4A 3UBKA 1THXA 4MF5A 1QUWA 3KEBA 1TTZA 4F9ZA 5AIXA 2R2JA 3FR3A 4ZBBA 2HFDA 1Q4JA 2MMOA 2MMZA 3TJKA 3GYKA 3F6DA 1X5EA 2LRTA 5IMFA 3TDGA 3L9UA 5IMDA 1SJIA 3HZ4A 5CAXA 1YEPA 3PR8A 1H75A 5H5RA 1JLWA 3WT2A 5AN1A 4BA7A 3KP9A 5FT3A 2I81A 1NHOA 2X8GA 1PX6A 4PGTA 2GSSA 2HT9A 1T4YA 2DC5A 1XW5A 1FB0A 1XW9A 1EP7A 1Z6NA 1GLPA 2H1DA 3LFLA 1W4VA 4ZBAA 2R6KA 5JWRB 3HJMA 1OE8A 1V58A 2LJRA 1FG4A 1HD2A 4D73A 4IHUA 3VURA 3PINA 4WBRD 2RLIA 2NBSA 1J9BA 2L6DA 1I9DA 2YWOA 4HQSA 3UL3A 5CYYA 4KUNA 3E0UA 3UJ1A 5EPFA 5IMCA 2L4QA 4LA1A 17GSA 3GIXA 3KH9A 2LEGA 4EKZA 4K7NA 3GKNA 4RI6A 1QXHA 4GCIA 4XHMA 1R26A 5KN2A 1XIYA 2K9FA 1U6TA 2KP1A 2JZTA 4DSQA 3QCPA 3ISOA 2L5LA 3G9BA 2YZUA 1AC1A 3F3QA 4K7IA 1WJKA 5ABRA 2OE3A 2IJYA 2KUCA 1TOFA 2GT6A 4XTSA 2H6XA 2J9HA 2GDRA 2HSHA 2I3YA 2H0IA 1GSFA 3TOTA 5INYA 1OC3A 1MD4A 1URMA 5JWOB 3APQA 3CSIA 3IHQA 3P8WA 4JEDA 4MCUA 2CT6A 3GRXA 2KLXA 3RAZA 2IFQA 4GF0A 4I2UA 1XW6A 2X8HA 4FYBA 5G1LA 1S3AA 1N2AA 3M0FA 1AIUA 3ZVJA 2LRCA 5LNKe 1A8YA 14GSA 2ON7A 3M9JA 3D5JA 5CRGA 3CRUA 2FY6A 4FO5A 1A8LA 1GTUA 2L57A 3GURA 4IELA 4F03A 11GSA 1YY7A 4ECBA 3DIEA 4F2IA 4F0CA 1Z7PA 5A5KA 1QFNA 1O6JA 1QMVA 5D9XA 1DUGA 1GTBA 2L59A 1U88A 2PGTA 3Q74A 1MTCA 3HJOA 2F3MA 1TI1A 1YKAA 1BJXA 2H8LA 1JFUA 1K3LA 1T4ZA 4MH3A 4XRDA 3SBCA 5DDLA 1ZZYA 1GNEA 1SKWB 2E2GA 1TK0B 2AV4A 5ECPB 5CREA 2C0EA 2LS5A 3ED3A 1S3DA 3ZMKA 3AY8A 3LYKA 3ZIJA 3DYRA 1K0BA 3ZITA 2YOIA 2XPEA 1ZOFA 4WEYA 1JZDA 3CSJA 2B7KA 5ENUA 1K0CA 2HXKA 2FWEA 3BJ5A 1Y25A 3U6VA 1V98A 3KZQA 5JWQB 2E0QA 2VLVA 3KMOA 5G31A 3LYPA 3QD9A 3MSZA 3MWHA 3TJFA 2BMXA 3GSTA 4NMUA 2IIYA 4X0XA 4MJEA 1EV9A 4KB3A 4I8BA 1V40A 5J5NA 4IJIA 2C0FA 2DJ2A 1ZL9A 1Z5YE 4PQHA 4ML1A 2C3TA 2CZ2A 4KNDA 5JCUA 1Z3EA 2C0GA 1BX9A 1YF0A 3GKMA 1JZRA 2KOKA 3IRAA 4ECIA 3PH9A 2GQKA 5IOWA 1EWXA 5ECHB 2QGVA 1GTAA 3D0ZA 2PUKC 1CQGA 3ERGA 5EVOA 3MDKA 1OKDA 3A2WA 4PNGA 5HR2A 4PNFA 2AB6A 4I2TA 4TR1A 1W89A 4K1FA 4O5RA 5AISA 1FHEA 1WOUA 3KJYA 12GSA 1KNGA 2NPBA 2MMNA 4H86A 5AIVA 2V6OA 3O76A 3ZMLA 2PU9C 4HU9A 2DJ0A 4NAXA 5ECKB 2QKEA 3FZ5A 1NHYA 2WFCA 2BJXA 2B5EA 2RIIA 4Q5QA 4TKYA 2A2RA 2O87A 3GKKA 5D73A 3GX8A 2B1KA 3TJGA 4IJ3A 1F3AA 1I5GA 1A23A 3M8NA 1GSYA 2B5XA 1ACVA 3EINA 5DALA 4G19A 1AW9A 1HYUA 1OE7A 4XS4A 1CQHA 1GUMA 4RUVA 3FZ4A 4IS0A 3TKSE 1MDKA 3W8SA 2FA8A 3HVXA 3IAS2 1NM3A 3WT1A 1KBNA 3W6GA 3GTUB 4WR5A 2YWMA 1GTIA 2GQMA 3OR5A 3FKFA 1IYHA 3DVXA 4EO3A 3KTLA 1M9AA 4G10A 4K0NA 2CA8A 2FA4A 1QQ2A 4PQ1A 4OFNA 16GSA 5B6NA 3TUEA 1DE1A 5KN3A 1A24A 4LL4B 4I6XA 2K8SA 2I1UA 4YH2A 2H70A 2CVDA 2DLXA 1R4WA 4ZL8A 1VF1A 4V2MA 5HQPA 2QSIA 3Q6OA 5G5EA 2VCQA 4OO5A 2B1LA 3SWLA 4WF5A 2YJ7A 4JR4A 2R37A 1X9SB 2VM1A 1GULA 4O32A 3QPMA 3TKPA 1UVZA 2B6MA 3FHKA 5GAND 3Q18A 4DEJA 1O85A 4YQUA 2CV4A 2HSYA 3ZFLA 2RUFA 4HI7A 4DSRA 2VL9A 3E9JB 2H72A 2V1MA 4E8HA 2HLSA 1FAAA 1N8JA 3M3MA 2WZ9A 1Z9HA 2G0FA 5B8AA 5CRDA 2CZ3A 3I43A 1H4OA 3HY2A 1SJ6A 4KDUA 4N11A 2H01A 1OC8A 5IMAA 1TRVA 3F0IA 2VCTA 3IR4A 5B6MA 5KEJA 1ZGNA 4WR4A 4GSSA 1M2DA 2G2QA 3QOUA 3VI5A 2WGRA 2YWIA 4Q5RA 1B4PA 4ZB9A 1B9XC 5DCHA 4KE3A 3TKSC 3EU3A 5GSTA 3F4SA 5D93A 5COHA 2GSTA 1X9MB 4D73B 3A5WA 2YCDA 3UVTA 2LKUA 1GSUA 4TXOA 1G0TA 1ERTA 2XC2A 5GSSA 3LQ7A 5HFGA 1OC9A 4TR4A 3Q19A 2B5YA 4MMMA 1HNCA 1R5PA 2VL3A 5ECIB 1ST9A 3BD2A 1USBA 2CAIA 1FOVA 1E2YA 5DVBA 4ISDA 1VGLA 3UIWA 4ZILA 2CX4A 3S9FA 1IYIA 2YN1A 2PERA 4V2LA 5G30A 2GZYA 2MMAA 1DE2A 2K8VA 3IDVA 1FB6A 3IK7A 1GH2A 3CSHA 3DEXA 4IBPA 4N0VA 3VLNA 3QMXA 3VWWA 5HR0A 4MLYA 20GSA 5H5QA 10GSA 4KSMA 2IFQB 1GSQA 5D96A 1YQ1A 3RPNA 4AJ6A 3GSSA 3L0HA 3KD0A 1E6BA 2TRCP 4MA9A 5C04A 2VO4A 3VPTA 3DMLA 4HJMA 4DSSA 4JBBA 3J7Yb 1XBSA 2A4VA 1J08A 2RUEA 1XWCA 3HZ8A 2TIRA 1BAYA 3TRQA 1G7EA 2H73A 3KTBA 4WETA 4RQRA 4ZXGA 4MF7A 5KN1A 3VWXA 1BEDA 4RI7A 2LRNA 3HVVA 3APOA 1R5AA 2WCIA 5J4UA 1KTEA 2N5FA 1GRXA 2YP6A 1PKZA 1HQOA 1ON4A 4MF6A 1K0OA 1TP9A 4BVYA 1UA5A 5DAKB 3US3A 3A2VA 1EEMA 1RW1A 1WPIA 1M7TA 3F63A 3R2QA 1KEBA 19GSA 3ZL5A 4TR0A 4KSOA 3HKRA 4IGJA 1FVKA 2R5GA 6GSXA 2KHPA 2R3XA 2GQLA 4XIHA 2PPTA 3KP8A 2IMKA 4POLA 1UN2A 1GL8A 2LQQA 4X1UA 2FWHA 5ELGA 3FY7A 3I9V2 2Z9SA 1ZYEA 2YPMA 5DQYA 2DJ1A 4O7HA 1LBKA 1T00A 1PKWA 1WP0A 2VM2A 1Z7RA 2K18A 5IMVA 1X0RA 1GSSA 4DVCA 5J9CA 2IWTA 4NHWA 4QL7A 4LMVA 2A2SA 2L5OA 4GXZA 4IQAA 13GSA 1SD8A 1V9WA 4KDYA 2YNXA 4KA0A 2VD0A 2O89A 3GHAA 1FVJA 2K6VA 1JZOA 2HZEB 4OCFA 4BL7A 6GSYA 2MZCA 2GTUA 5IPGA 3H4KA 5A4WA 2JZSA 4MABA 2QC7A 3UBLA 3IBHA 5LD0A 4MJAA 4YAVA 5ECNB 4TR1B 2LV3A 5D8IA 1AXDA 5EL8A 4WKWA 3I6AA 1XCCA 2XBIA 3DRNA 6GSWA 2HNLA 4HOJA 4Q5FA 1UC7A 2PMTA 3F4TA 4I97A 2IPAA 3GNJA 3EMXA 1U3AA 2AUVA 5FHIA 4K0GA 2FLSA 3L4NA 5DBQA 2DJJA 2P5QA 1B8XA 1TRUA 2VCVA 4TOPA 3LG6A 3IV4A 3LJRA 3KM6A 2LJAA 6GSVA 1PGTA 1M2AA 5DALB 3GH9A 3C7MA 5IPHA 2GZZA 1AQXA 4CHSA 2DIYA 1GUHA 2H0HA 1M2BA 3GH6A 2P31A 3L9VA 3F4RA 1F9MA 3H93A 3IAM2 3UVHA 2VOCA 1A2LA 3DKSA 2NTOA 3IC4A 3RHCA 1VF4A 1SENA 1GLQA 3LEFA 4HZ2A 3TKSA 4EDYA 1WIKA 2HRFA 6GSSA 4XS6A 4XRAA 1XPVA 5GZZB 4GLTA 3QDNA 2VIMA 1GP1A 3H1NA 3DD3A 1SKRB 3WGDA 4J56E 5JCWA 2ZCTA 5EY6A 3O6TA 4K7OA 3C1SA 2DMMA 2O85A 1T1VA 5ECSA 2LQOA 1ML6A 1QGVA 3CRTA 4OMVA 3WGXA 3APSA 1YDKA 4F82A 3JCML 2ZUPA 1M99A 5H5SA 2P0GA 1TU8A 5ECLB 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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