2IN3A

Crystal structure of a putative protein disulfide isomerase from nitrosomonas europaea
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
208
structure length
204
Chain Sequence
EKPVLWYIADPMCSWCWGFAPVIENIRQEYSAFLTVKIMPGGTNTPLLPEKRAQILHHWHSVHITTGQPFTFENALPEGFIYDTEPACRGVVSVSLIEPEKVFPFFAAIQRAFYVGQEDVAQLAILKKLAVDLGIPESRFTPVFQSDEAKQRTLAGFQRVAQWGISGFPALVVESGTDRYLITTGYRPIEALRQLLDTWLQQHG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a putative protein disulfide isomerase from Nitrosomonas europaea
rcsb
molecule keywords Hypothetical protein
molecule tags Isomerase
source organism Nitrosomonas europaea
total genus 63
structure length 204
sequence length 208
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-10-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.472.60 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Cyclin A; domain 1 putative protein disulfide isomerase domain 2in3A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2in3A01
3VI5A 3LEFA 1WPIA 3ZFBA 3QFAC 3HA9A 4OCFA 5J4UA 1LU4A 2LRTA 4HDEA 2GS3A 4MDCA 1SKRB 3Q6OA 4HU7A 2GT6A 4IN0A 2DIZA 4MH3A 1PSQA 1O81A 2XPDA 1XVQA 5KN3A 2ZNMA 1GULA 3I43A 3UVHA 1SJ6A 3HKRA 4TXOA 5C00A 2HRFA 4O5RA 4TXOB 2HT9A 1VF3A 1SK0A 1S3DA 1ERWA 2GZYA 2NBSA 3DKSA 3ZZXA 4I2TA 3GTUA 2B1KA 3GTUB 4E8EA 1JFUA 1JHBA 3FW2A 3RHCA 2KHPA 1A0RP 1Z6NA 2IPAA 3IC4A 4ZIJA 3GX8A 5B6MA 4KSOA 1XPVA 2GZPA 2CZ3A 5ID2A 2YJ7A 4L5OA 3APSA 1U6TA 4GLTA 3RPNA 3GHAA 2FY6A 5DCGA 6GSTA 3FZ9A 4NWYA 4QL9A 1X0RA 1MDJA 2PMTA 1WWJA 4KE3A 5ECPB 4MP4A 1Y25A 1B4PA 4TR4A 4KDYA 2PVOC 3IHQA 2CT6A 2O7KA 2VUPA 2OE0A 1O8XA 2H1GA 1NHOA 4JBBA 4I8BA 4KH7A 2VCWA 1X9SB 1PRXA 1ZOFA 1YEPA 1AQXA 1XZOA 2MMOA 2L4CA 1GTAA 4YQVA 1S3CA 2A4VA 5B6NA 2AYTA 2IL3A 4PQHA 4KAEA 1X9MB 2LJRA 3KMOA 2C0GA 2R37A 5F07A 4Q5RA 5IOWA 1JZRA 2VO4A 4MF7A 2H66A 1SJIA 2VD0A 3UBKA 1NHYA 1R5AA 4GSSA 4K7OA 5F05A 3O3TA 4PUFC 1TDIA 3GKKA 3DVXA 1FOVA 1Z7RA 3BBYA 3KTLA 3UEMA 3CMIA 4ZB8A 3ZIJA 2YCDA 1PGTA 1QQ2A 4CDOA 2LRCA 1H75A 4IELA 5ECMB 3CTGA 4MZWA 1JZWA 2TRXA 17GSA 1EWXA 3TOTA 3L9VA 4TVEA 3W8SA 1X5DA 3HHVA 4XRDA 1M2BA 1R4WA 3CBUA 3H4KA 3QR6A 4ZBAA 1PQNA 5DVBA 4DEJA 3FK8A 3P2AA 3VFIA 2R2JA 3QOUA 5EY6A 1OVNA 2VL2A 3FRCA 5AGYA 5E59A 1GUKA 3DD3A 3RPPA 5CAXA 5CRGA 2LQQA 3KH7A 2N5AA 1XFLA 3F4SA 2NVLA 1TI3A 1B4QA 3RBTA 4Z7XA 3GX0A 2VCVA 4X1UA 3LXTA 4OO4A 1TU8A 5HR2A 1SK1A 3GMFA 1Z3EA 4Q5FA 2ON5A 1SKWB 1RQMA 1XWKA 1ZL9A 3GKNA 2BJXA 3HZ4A 2R6KA 2IMDA 2IIYA 4GQCA 4PXOA 4HOJA 3HZ8A 1QFNA 4ZL7A 3IK7A 3KTBA 1J9BA 3HJPA 3TKRA 3WGXA 2VIMA 3UVTA 4EXJA 4WF4A 4TR3A 3H79A 1AAZA 1VGLA 2YV9A 1U87A 2GT5A 4KX4A 4BPYA 3P90A 1WIKA 4I97A 5AISA 2B7KA 2J9HA 4Q5QA 1T1VA 1Z6MA 13GSA 1ZMAA 2EIRA 4WXTA 2VD1A 2FCHA 2RUFA 2PU9C 4K9ZA 2L6CA 3GH6A 2LKUA 3DVWA 2IN3A 2LSTA 2REMA 1U3IA 2LRNA 1TK8B 3M0FA 2OE1A 1TTZA 4FO5A 4IS0A 1WJKA 1ST9A 1SJZA 2K8VA 3L9UA 3V1WA 1W89A 3A2WA 3TGZA 3GKXA 3IBHA 1BX9A 5AN1A 3ZRDA 1YY7A 3PINA 3FZAA 1URMA 3US3A 3HXSA 1RW1A 4MPGA 1SYXA 5KN0A 1T8EB 3VWWA 5IIZA 4OFMA 2YN1A 2C0EA 5G30A 1Z9HA 2L5OA 1UVZA 4OCEA 3IDVA 5D96A 3A3TA 3DMLA 2P5RA 1XW9A 4N10A 2H70A 2DIYA 3DRNA 1A2JA 2K8SA 3BOAA 4POKA 2PWJA 2RM5A 4O92A 3G7JA 4ML1A 3MDKA 3O6TA 5DALA 2DMLA 5DALB 1WRYA 4I6XA 1SD8A 3VI7A 4GSNA 5GAPD 5AIVA 2X8HA 3KZQA 3RDWA 3VK9A 5LNKe 1OC8A 1G6YA 3GIXA 2I4AA 3JCML 5INYA 2H71A 4EF0A 2WCIA 1WOUA 1QMVA 4DSSA 4ZL9A 3ZITA 4DSSB 1V40A 1DBYA 1K0NA 4AF2A 1M9BA 3KP8A 4YQMA 2DJ3A 4YAPA 3LORA 3C7MA 2XPEA 2GDRA 1M7TA 2IMFA 3MWHA 2NTOA 2O89A 2WFCA 1TK5B 4IBPA 4P3YB 1SENA 4F0BA 3QD9A 4ILFA 1I9DA 2HZEA 1GSEA 2H75A 5IPHA 1TI1A 4POMA 2VCZA 5ECLB 4YH2A 2JZRA 1TP9A 3LXZA 4KB3A 1WE0A 5DJLA 3GN3A 2WRTA 2F8FA 1K3YA 5KN1A 2ON7A 2DC5A 4GQFA 2JSZA 1W4VA 2OACA 2HLSA 5HFIA 1EOGA 2V1MA 5J9BA 5IO2A 3CSIA 3HVVA 2XC2A 1YDKA 4L0WA 4AJ6A 1Y6EA 3C1SA 10GSA 4IQ1A 1XBSA 1M2AA 4F03A 3ME8A 2YOIA 1O85A 5G1KA 4JR6A 3TKSE 2B5XA 2G2QA 2F8AA 2A2RA 2IWTA 3WT2A 1AQWA 2HI7A 3KCMA 4POLA 2VLTA 4EDZA 1EEMA 4HQSA 3ZMKA 4I5QA 4V1Ag 5B7CA 1MTCA 2J23A 4GCIA 4MJAA 2FWHA 3IV4A 2PGTA 4TRXA 1FVJA 3TUEA 3C8EA 2BTOT 1OYJA 4ZB6A 2KUCA 1ON4A 2TIRA 3EC3A 1TKDB 1XW5A 4J56E 1T00A 4N11A 18GSA 2QSIA 3F9UA 2TRCP 4PQIA 1HQOA 5JCGA 4FYUA 2CQ9A 4HQZA 5LD0A 1KNGA 2WJUA 1T3BA 4EVMA 5JWRB 5B8BA 6GSYA 2KOKA 4KGIA 3GL5A 1G7OA 2VCXA 3IE3A 4V2LA 3ZTLA 2OE3A 3BCIA 3QAGA 3GSTA 1YF1A 2LQOA 4N30A 4F0CA 3I9V2 3KXOA 2CZ2A 2IFQA 2GZZA 3KGKA 3F63A 5ID2B 2GTUA 3F8UA 3MNGA 2F9SA 3FY7A 1TRWA 4GWRA 4FYCA 3BCKA 4RQRA 4XCSA 2VL9A 4LA1A 2DLXA 1EV9A 5IMCA 2B7JA 2C1YA 1TOFA 2B5YA 3A2XA 22GSA 1V2AA 4BWQA 5ELAA 5H5QA 1EGOA 2CVBA 1GTIA 3ISOA 3RHBA 3ZREA 4WR4A 2HSHA 5H5RA 1NM3A 1TJDA 5DBQA 5G2ZA 2FA8A 4BWSA 4K0NA 3UIWA 1I5GA 3ERGA 1GUHA 2LS5A 4O32A 2GQKA 1YJ6A 2EIQA 3MSZA 1H4OA 2WB9A 2MBTA 4ECBA 3E3EA 3Q18A 3C73A 2LEGA 2FWGA 3KH9A 3D4MA 1M99A 1UA5A 1YKAA 5D9WA 1NW2A 5J5NA 4JR4A 3TJBA 4TR0A 1TK0B 4D73A 3ZVJA 2LJKA 2H1AA 4D73B 4OWYA 4HJMA 2HSYA 3UAPA 4TXVA 4WKWA 2LTKA 5C04A 3G7IA 2JU5A 3LFLA 1GL8A 5CO3A 1PKWA 4PUAA 2L5LA 1G7EA 5EL8A 2RM6A 4ZBDA 4XS4A 3FYGA 1AIUA 3GUSA 1BYEA 5HFGA 1OC9A 3NIVA 1OC9B 2FHEA 3TKPA 1WP0A 5D9XA 5G1LA 3KMNA 1V57A 1YZXA 3K8NA 4GXZA 4IVFA 4YQUA 2FGXA 3VWVA 1X9WB 2GGTA 3QCPA 2B3SA 4F82A 3UL3A 2MZCA 3S9FA 4RI7A 1M0UA 2BMXA 5ELGA 2YWOA 2QGVA 4WBRD 5F8BA 1IYHA 4TKYA 2OBIA 1AQVA 4DSQA 3LQ7A 4V2NA 5IMAA 1ERUA 3A5WA 4EUYA 3LWAA 1ERVA 2ZUPA 4GRFA 1B48A 4NAXA 3F4RA 2H73A 5DQYA 3VWXA 2CAIA 4DSRA 2AHEA 1K0BA 2HNLA 1XIYA 5IQYA 4NXIA 3GURA 4AJ7A 3QAVA 1X5CA 4HJ2A 3F6DA 2YV7A 1QK8A 1PX7A 4ZB9A 4BVYA 4MF6A 4H86A 4L8EA 5CYYA 1HYUA 3G9BA 1LJRA 1EZKA 2E7PA 1SU9A 3IPZA 1MD4A 1R5PA 3GYKA 2HRNA 2M80A 3TJKA 2E2MA 2PN8A 4PURA 2L6DA 3D21A 5DCHA 2H0IA 3TJFA 1F37A 2GQMA 2KP2A 1AC1A 5A4WA 2X8CA 2C0FA 2HXKA 2PBJA 4MF5A 3CXGA 1KTEA 2AAWA 3FR6A 3TRQA 3M9JA 5IMDA 5ENUA 1Z5YE 4ECIA 1TW9A 4PQ1A 1OKTA 3IK9A 4MABA 3UJ1A 4QQ7A 2V41A 5IM9A 3GNJA 1FG4A 2WULA 3EMXA 5ECOB 1ZCPA 3M9KA 1EOHA 4FIWA 2P31A 5F06A 3WGEA 2RIIA 1ZYEA 2N5FA 4BA7A 1A23A 1V58A 2P0GA 2LV3A 3KIJA 3HVSA 3QFBC 3QPMA 1T7PB 4XTSA 5CRWA 3WD6A 5LCZA 4FH8A 1N8JA 1AXDA 2C8UA 1A24A 2YPMA 5AIXA 2YANA 4WETA 4NHWA 4K2DA 3D5JA 3AY8A 3TOUA 9GSSA 3F0IA 1FHEA 5G5EA 1NSWA 3TDGA 4NV5A 2AUVA 2OJLA 1TXXA 2MMNA 1ZZYA 2XBIA 4KCEA 2H74A 1GSQA 1ZGNA 5CRDA 3TJJA 3UOMA 4MZBA 4MA9A 4WF5A 1DUGA 3ERFA 2EC4A 2WDUA 1JZDA 1YF0A 4PNFA 2VL2C 1JLWA 2PUKC 1MEKA 1F3BA 5DAKA 4HU9A 1QXHA 4ZBBA 4J57E 4PX1A 1VF4A 4N0ZA 5A5KA 2KLXA 1SK2A 2FWEA 2GVPA 2NDOA 4J2FA 2H1BA 1HNCA 2OA7A 2GQLA 4NPBA 3M1GA 4E8HA 3W8JA 5COHA 2DMMA 2V6KA 2YP6A 2V6OA 4TOPA 3J7Yk 4WR5A 3HYPA 4EKZA 5G31A 5L71A 3A2VA 4DVCA 5GSSA 5HR1A 2VL3A 1PL1A 3U6VA 1O6JA 3NOFA 2GSQA 2JSYA 4EL1A 4LL4B 5DJMA 2FA4A 1OE8A 2VLUA 4OFNA 3ZFLA 2MBSA 3E9JB 1GSFA 1B9XC 3DGQA 2FLSA 3LGCA 2RLIA 4Q5NA 3VURA 4MLYA 5F0GA 1EGRA 5CNWA 3LJRA 5ECIB 3VWUA 3H8QA 2HZEB 5IO0A 4MZCA 4PGTA 1THXA 2H8LA 3APQA 3ZMLA 1VRSD 2VM1A 1SKSB 2C80A 4MK3A 4K8MA 4TR1A 3ZIVA 4TR1B 3J7Yb 2OBKA 5H5SA 1UC7A 4MMMA 5ECQB 1A2LA 3DEXA 2H76A 3DWVA 3P7XA 2YNXA 1GTUA 3IXRA 4L0UA 1ERTA 4OO5A 3ERWA 2VLVA 2VAFA 3GRXA 3IR4A 5HQPA 2O85A 1TRUA 3VPQA 1EV4A 5D93A 1ILOA 4IQAA 5DQSA 4I2UA 3GKMA 1E2YA 1GLQA 2E2GA 1F2EA 4RUVA 5J41A 4MCUA 3EMPA 1GNWA 4XS1A 3OR5A 3WGDA 5CP1A 1PA3A 2H6YA 2WGRA 3E0UA 2HE3A 2H19A 2JL4A 1XOBA 1M2DA 2LJAA 3PR8A 4LMWA 1FAAA 3WT1A 2I9HA 3M8NA 2DBCA 3L4NA 3ZYWA 2B6MA 2H72A 3HD5A 2C0DA 4N0VA 1K0CA 1XWAA 2AB6A 2R5GA 1BQ7A 1A0FA 1GSYA 2H6XA 1ACVA 2I1UA 1K0AA 5GZZB 1F9MA 3W6GA 1O8WA 3H1NA 3D0ZA 2H6ZA 1GP1A 5KN2A 1Q98A 4V1Ap 3F3RA 3CTFA 1J0FA 2OADA 4JRRA 1MDKA 5D9VA 1K3OA 4OFTA 1T4YA 1YQ1A 2ALBA 4KNDA 3GA4A 19GSA 4NHZA 1UN2A 4ULXA 1K0MA 3QMXA 5HFKA 2DJJA 1Z7PA 1XVWA 3C71A 3DIEA 4OMVA 3CSJA 4EO3A 1HNBA 3CRUA 3TKQA 4AJ8A 4YAVA 2FD3A 1XWCA 1PKZA 1CQGA 1XWGA 1LBKA 2YWNA 4POBA 4WBJA 2ZCTA 4MJBA 2IFQB 1SL2B 3ZVJD 3EINA 5A4UA 5A4VA 1GSUA 2H01A 5E4WA 2VCQA 1FB0A 2H30A 4RQXA 1OC3A 3KJYA 3LG6A 2JZTA 12GSA 2R4VA 1VF1A 1PD21 1GWCA 1C72A 3EU4A 2V2GA 1XXUA 2M46A 1FO5A 2FUG2 4ECJA 2E0QA 1WMJA 3TCOA 2EIOA 4IP6A 2CV4A 1A2MA 2CVKA 2LUSA 2FWFA 1USBA 4LMVA 3TKSC 2L57A 2A2SA 1B9YC 2MMAA 2CAQA 1K0DA 1YEXA 5IMZA 3KEBA 1JLVA 4GF0A 1TRSA 1PN9A 3I69A 4K7IA 3LSZA 6GSSA 1DE1A 1QUWA 2V32A 3VPTA 3N9JA 5HR3A 2D2ZA 1XWBA 1FVKA 5FWGA 3IRAA 2PVQA 1GTBA 3PGTA 5DDLA 4JEDA 2L59A 3L78A 4XHMA 4CHSA 3D6IA 3FR3A 14GSA 2L4QA 4FYBA 4KUNA 4OD7A 6GSUA 3L0HA 2O87A 5ECHB 4IHUA 4EDYA 5J9CA 3CRTA 3LYKA 1K0OA 4XS4B 3FZ5A 3ME7A 2JADA 3FKFA 4KDUA 4ZL8A 11GSA 3L9SA 4AGSA 1HD2A 1EP7A 1MD3A 4GSTA 4HZ4A 2CA8A 3KP9A 1SL1B 1S3AA 2MYGA 3F4TA 1E6BA 3HJMA 2N5BA 2Z9SA 4MH2A 4MJEA 1G6WA 5ECKB 1HNAA 2H0HA 5JWQB 2HYXA 1OE7A 3RAZA 3IAM2 16GSA 1GSSA 3GL3A 2C3TA 7GSSA 1IYIA 5IPGA 1GRXA 3UMAA 2QKEA 3F6FA 1OAZA 4KW6A 2C4JA 3N5OA 5FHIA 6GSVA 3R2QA 1OKDA 1XCCA 1TU7A 1XOAA 1JZOA 1ZYQB 1M9AA 2QC7A 2LNTA 2NPBA 2LNSA 2JACA 5D73A 3NZNA 3F3QA 4KSMA 4ML6A 4PNGA 2R3XA 2WS2A 4IW9A 4BVXA 1N2AA 2C3NA 4HUAA 6GSXA 1GNEA 1V98A 2FNOA 3MAKA 3SWLA 4IKHA 2VM2A 2WZ9A 3P8WA 1Q4JA 3TB2A 5CREA 4KA0A 4BL7A 1B8XA 5G5FA 1FW1A 3FHKA 2GSSA 3HY2A 3ZL5A 4X43A 1K3LA 4G9HA 4K7NA 2DJ0A 1VF2A 3WYWA 2K9FA 1GLPA 4IP1A 2YZHA 1XW6A 1RK4A 1KEBA 3GV1A 2YZUA 3BD2A 4RI6A 2B1LA 4CW9A 4KCAA 1T4ZA 20GSA 3EWLA 1BAYA 2CX3A 1PX6A 1BG5A 4XS6A 1G0TA 1THOA 1AW9A 4NMUA 1A8LA 3TRPA 3TJGA 2DJ1A 2DJ2A 5IMFA 4HZ2A 1SL0B 4HEA2 4G19A 3D4TA 4ISDA 2MMZA 1DSBA 2AV4A 4HI7A 5J3RA 2RUEA 4G10A 4JZQA 3Q74A 6GSWA 2GSTA 1A8YA 2I81A 1BJXA 2HZFA 2PPTA 5D8IA 2I3YA 3EU3A 1U3AA 4WEYA 2K6VA 3VLNA 3SBCA 2VOCA 2VCTA 4TN8A 2YWIA 4JE1A 5DAKB 4KDXA 1R7HA 1PMTA 4K0GA 3UBLA 2H0GA 3DXBA 2DSAA 4JU5A 4NV2A 4QL7A 8GSSA 4K6XA 3CYNA 4MPFA 3FR9A 4LL1B 1GSDA 2DJKA 2G0FA 3FZ4A 3Q19A 4O7HA 1BEDA 3HDCA 3I6AA 3FEUA 3TRXA 3C1RA 4ID0A 5JCWA 2O8VB 4MJCA 1MDIA 2YJHA 3GSSA 2ES7A 5IOXA 4ECCA 2X64A 3UARA 3U5RE 2JZSA 2XHFA 2B5EA 2X99A 5ECSA 5B8AA 2OKAA 3G7YA 1KBNA 2F51A 2GSRA 5GSTA 2CVDA 1AUCA 3GFKA 2XBQA 3IAS2 1CQHA 5EPFA 5CRHA 2IMIA 3O76A 3D22A 3QDNA 5D9TA 4IJ3A 2P5QA 4HS1A 1EEJA 2H1DA 1SYRA 3BJ5A 2X8GA 1EP8A 3KM6A 2IMEA 4ACSA 1F6MC 1R26A 4K1FA 3IOSA 1ABAA 3DYRA 5KEJA 4EC0A 3HCZA 2F3MA 4XRAA 2IMKA 1J08A 2GLRA 2C3QA 4LLRA 3EYTA 4ZXGA 3CSHA 1X5EA 3M3MA 1V9WA 2HFDA 2CX4A 2PERA 1U88A 5FT3A 4V2MA 4XIHA 4IJIA 2KP1A 3H93A 4F9ZA 2IJYA 5HR0A 4F2IA 4TW5A 3HVXA 1PL2A 3HJOA 5ECRB 1QGVA 1O73A 3APOA 1FB6A 5GAND 5JCUA 3TKSA 5EVOA 1YKCA 3IA1A 3LYPA 3ZLPA 1TRVA 2YWMA 1GUMA 3QAWA 1GH2A 3KD0A 1F3AA 1SD9A 5IMVA 4EE0A 4G2EA 5ECNB 3ED3A 4IGJA 4L5LA 4ZILA 1DE2A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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