2J23A

Cross-reactivity and crystal structure of malassezia sympodialis thioredoxin (mala s 13), a member of a new pan-allergen family
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
HHHHLVPRGSVQVISSYDQFKQVTGGDKVVVIDFWATWCGPCKMIGPVFEKISDTPAGDKVGFYKVDVDEQSQIAQEVGIRAMPTFVFFKNGQKIDTVVGADPSKLQAAITQHSA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Cross-Reactivity and 1.4-A Crystal Structure of Malassezia Sympodialis Thioredoxin (Mala S 13), a Member of a New Pan-Allergen Family.
pubmed rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN
source organism Malassezia sympodialis
molecule tags Immune protein
total genus 32
structure length 115
sequence length 115
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2j23A00
3IV4A 1GL8A 3CRTA 3GX8A 2HRNA 2DSAA 3FZAA 3E3EA 2GVPA 4XS6A 2O87A 1OE8A 5G2ZA 2XBQA 1T1VA 5ECHB 3CTFA 2R6KA 1Z9HA 5DALB 5HR1A 3HJPA 1XOAA 2RUFA 20GSA 13GSA 5D9VA 2WDUA 3KCMA 2C4JA 4L5LA 5G5FA 4WF4A 2VL9A 2YWIA 2CV4A 1V58A 1WPIA 4MF6A 4JEDA 1IYHA 4N0ZA 3VWXA 2C8UA 1XWBA 4ACSA 4JRRA 3ISOA 2HSHA 1TK5B 2GZZA 2HXKA 2PGTA 3KD0A 1TRUA 1GRXA 1WJKA 3DRNA 5J9CA 5J9BA 2FA4A 1MDIA 2CVDA 3TRXA 4X1UA 1O6JA 2FHEA 1XBSA 5JWQB 4DEJA 1T3BA 1MD3A 1F3AA 4BWSA 1FG4A 2IN3A 2HT9A 4RQRA 1OC8A 2YWOA 4BPYA 1XWAA 2F51A 4ZXGA 5DJLA 2J23A 1NW2A 4K0NA 3EVIA 5IQYA 3PR8A 2CX3A 3E9JB 5EY6A 1WE0A 4GXZA 2LEGA 4GSNA 1YJ6A 4HQZA 1T4YA 3TOTA 3O76A 5IMCA 2CZ2A 3LG6A 3GX0A 1F9MA 4LL1B 2IFQB 2GSQA 4TR3A 2FWEA 5LCZA 2H73A 3VWWA 4H86A 5F05A 1DE1A 3ME8A 3RDWA 4ILFA 1YZXA 5ELGA 5DAKB 1HYUA 4HOJA 2G0FA 3ED3A 3CXGA 2PMTA 1SKSB 2I1UA 1A2MA 2P5QA 1OAZA 3DEXA 3HZ4A 5IOXA 2MMOA 5IMVA 4MPFA 3FYGA 3QCPA 4WF5A 2CX4A 3M8NA 2LRNA 3GKMA 4ZIJA 1ZYEA 2OE0A 1XW9A 3G7YA 1AQWA 5KN1A 2PWJA 1SKWB 4GF0A 3TJGA 2OE1A 4POBA 4TR1A 4K9ZA 2GQKA 3LGCA 2GQLA 5GSTA 5G30A 2RLIA 4GCIA 3TJJA 1MTCA 1TK8B 4KDUA 3HCZA 1V40A 3KEBA 1K0BA 2D2ZA 2VLUA 1AIUA 2K8SA 3KH9A 1R26A 1XCCA 4K2DA 3APQA 2YPMA 5IIZA 3VWVA 5D9XA 2C0FA 5IO0A 3QFBC 5HFKA 1S3AA 2CVBA 1CQHA 4GLTA 1ZMAA 4IBPA 2YV9A 2C3TA 4MF7A 2LRTA 5DQSA 4TXOA 2H66A 3HVSA 2VCTA 3GFKA 1X9MB 3UOMA 2QKEA 2OBKA 3F9UA 5D93A 2I81A 4XHMA 1EEJA 3J7Yk 3BD2A 3UMAA 4K7IA 3VLNA 2GZYA 1SD8A 1ZGNA 4Q5NA 2M80A 4CHSA 1E6BA 2PN8A 4JU5A 2PERA 1J9BA 1WOUA 1QUWA 1Z7PA 1FVJA 4HJMA 3Q6OA 2FD3A 1PN9A 4GWRA 5G1LA 1GSUA 2BJXA 4POKA 2CAIA 1U87A 2DIZA 2QSIA 2CT6A 2YCDA 5L71A 2R2JA 1LJRA 4OMVA 2GDRA 1A8LA 2MBTA 2H6XA 3W8JA 3H1NA 1T7PB 2EIOA 4GRFA 4KE3A 5GZZB 4IVFA 2N5BA 3CSIA 1K0MA 2F9SA 2OJLA 2VO4A 1R7HA 1Y6EA 4PQ1A 2TIRA 3D4TA 3DYRA 3LQ7A 2H1BA 3CTGA 3IA1A 3UVTA 3L4NA 4TXVA 5EL8A 5ENUA 4E8HA 2FWGA 4PQHA 2E7PA 1WWJA 5DCGA 2PU9C 2R4VA 5E4WA 6GSYA 2OE3A 4LMVA 3BCKA 4GTUA 1AAZA 3GSSA 1SD9A 1BAYA 2KP2A 2TRCP 1VGLA 3QAWA 1VF3A 1AC1A 1EP7A 2P0GA 4L8EA 2OA7A 3DVXA 3UEMA 5CP1A 5CO3A 3BBYA 5ECRB 4IELA 2IJYA 1M0UA 3KTLA 2O89A 5A4UA 4PQIA 1XVQA 1AQXA 1V57A 2E2GA 4ZB9A 3PGTA 1QGVA 1TW9A 2XPEA 3QMXA 5AGYA 4TKYA 4ZL8A 4TOPA 1W4VA 3F4SA 3GHAA 4ZL7A 4XTSA 4DSSB 1K0DA 2VM1A 2ES7A 5HR3A 4F82A 3SBCA 1BJXA 4AJ8A 2MMNA 2IMEA 3A3TA 4EF0A 5B7CA 1NM3A 2V41A 3EU4A 4ZB8A 3LJRA 1GUMA 6GSTA 2VL3A 2LJAA 2H0HA 4DSRA 5G5EA 3EINA 1TDIA 3ERGA 4I6XA 4EDYA 1YKCA 2KLXA 4KSMA 4O32A 1M2BA 1K0NA 3DD3A 5HFGA 1XXUA 1YF0A 2YP6A 3GNJA 5F8BA 2A4VA 3GTUB 1PKZA 4JBBA 4L0WA 1CQGA 2JADA 3F6FA 4MZBA 2QGVA 1H4OA 3IK9A 2E0QA 1GSFA 1FHEA 3G7JA 3GH9A 4MMMA 1N2AA 1KBNA 4OO4A 2JL4A 19GSA 2H01A 1THOA 1B4QA 1O81A 1TXXA 2H0IA 1QMVA 1GLPA 5CNWA 2MZCA 1TJDA 1OKTA 3WT2A 5DVBA 1RW1A 2HSYA 2ON5A 2BMXA 1YEXA 4AF2A 3IK7A 2IMKA 2V32A 5G1KA 1Y25A 2B1KA 3D21A 3HVVA 3F6DA 1K0CA 3V1WA 2C3NA 1B8XA 3VPTA 5F07A 2F8AA 3UBLA 1FVKA 3GA4A 2L6CA 2GSRA 5KN0A 1ABAA 2H71A 2C0DA 3H4KA 1PD21 4EKZA 3HY2A 4N30A 1HD2A 1FO5A 4F9ZA 3PH9A 1PGTA 4PNFA 1HNAA 2PPTA 4TR4A 3F0IA 2LQQA 3ERFA 1WP0A 1WRYA 2NPBA 5D9WA 2B3SA 2LJRA 5LD0A 4O92A 3C7MA 3UVHA 1JHBA 1MEKA 2F8FA 4XCSA 2AYTA 3TB2A 4KA0A 5JCWA 1DSBA 2FWFA 3J7Yb 1XOBA 1XWKA 1X9WB 5J4UA 3IR4A 3ZIJA 3GKKA 2VCXA 4O5RA 4YQUA 4FIWA 2WJUA 5GAPD 16GSA 3NOFA 3KM6A 1OYJA 1U3IA 1G0TA 4N0VA 1MDKA 4G10A 2H72A 2N5AA 4L5OA 3GSTA 3R2QA 1GTBA 3ZLPA 1B9XC 4TVEA 3ZYWA 2HZFA 4F03A 4ML6A 4IJ3A 1PX6A 3LORA 7GSSA 1PL2A 1S3DA 1I5GA 5JCGA 5JWRB 4KGIA 3HHVA 4YQVA 4MZCA 3TKSE 2IMFA 4AGSA 4WR5A 3E0UA 1SKRB 4J56E 1F2EA 5CRGA 1PRXA 3U5RE 3UBKA 3Q18A 3L9UA 5B6MA 11GSA 2XBIA 3QR6A 1N8JA 2VLVA 4IQAA 3QAVA 1ERVA 3LFLA 2JZTA 3HXSA 3FKFA 2O85A 4KAEA 2GGTA 4MJAA 2BTOT 1XW5A 3GN3A 2PVQA 3MNGA 3GUSA 4JR4A 5A4VA 1O85A 4WBRD 3CYNA 1C72A 1VF4A 4IW9A 4NHZA 2LTKA 3KJYA 4HUAA 2JSYA 5DQYA 5H5QA 3MAKA 2HE3A 22GSA 3IRAA 1F6MC 4IP1A 2K9FA 1DBYA 3N5OA 2H70A 5F0GA 5IMDA 3LXTA 2GTUA 1XFLA 2M46A 2I4AA 5HR0A 3RBTA 3QPMA 4IHUA 2B5EA 9GSSA 1R4WA 4N11A 5IOWA 4IS0A 3EE2A 2YJHA 1PX7A 1OC9B 4YH2A 5ECKB 4TR1B 1IYIA 4PUAA 4V2NA 5IMZA 4GSSA 4HQSA 1YY7A 4ECIA 4POLA 5COHA 1FB0A 2GLRA 1F3BA 1G6YA 1J08A 2HYXA 2IFQA 3IDVA 1E2YA 3G9BA 2B6MA 3O3TA 2AUVA 2VCZA 2JZSA 4KUNA 4KNDA 2HNLA 1X5DA 1LU4A 5DAKA 5D8IA 2DJ0A 5ID2A 3QAGA 3QOUA 2H6YA 3D6IA 2WZ9A 4OFNA 3D4MA 2GSTA 4ML1A 1K3YA 1A2JA 2VCVA 18GSA 5HR2A 3IC4A 5A4WA 3NZNA 4NWYA 4I97A 3LSZA 3FY7A 2LJKA 3UIWA 3FW2A 2O7KA 1UA5A 2OADA 4XIHA 2VCQA 3RPNA 3H93A 3APSA 1XIYA 3ZREA 1TP9A 2HZEA 3CSHA 2C80A 3Q74A 4EUYA 3F4TA 1EWXA 3ZL5A 5GSSA 1XZOA 2X99A 1GNEA 1O8XA 4BVYA 4HS1A 2IMDA 5ABRA 5ECNB 1GWCA 1F37A 4RI6A 4XRAA 4X43A 3GMFA 4PUFC 2LRCA 3IOSA 2VM2A 3EWLA 2R37A 1B9YC 2DJKA 1LBKA 1GSYA 1SJ6A 5HQPA 4MABA 1FOVA 2L6DA 1JZRA 4KCAA 2JU5A 3GV1A 1YQ1A 1I9DA 3N9JA 1SL0B 3MDKA 3KMNA 1YEPA 1TI1A 4HEA2 1Z7RA 3IHQA 1U88A 3EYTA 1TU8A 4ZBDA 1OVNA 3FEUA 1OE7A 1SJIA 3C8EA 1TU7A 4LLRA 4I2TA 2YOIA 3FR9A 4ULXA 2ZNMA 2B7KA 4IKHA 4NV2A 1SYRA 3P8WA 2HRFA 3FR3A 3US3A 2KP1A 2EIQA 3ZFLA 2R5GA 2CZ3A 5FWGA 2FLSA 3LWAA 3LYPA 5E59A 1K0OA 3K8NA 3TRQA 6GSVA 2WRTA 3UL3A 3DVWA 1EGOA 1JZDA 1M2DA 1T8EB 1BG5A 3A2WA 3ZZXA 2XHFA 4G19A 4KDXA 1JZWA 4PURA 3H8QA 4AJ6A 3W8SA 3QDNA 1V2AA 4DVCA 1G7OA 4D73B 2RIIA 1Z5YE 3FZ9A 3EC3A 4GSTA 4PNGA 5C04A 2YWMA 1NSWA 2G2QA 4F2IA 1GSSA 3GKXA 2TRXA 4G9HA 1TKDB 2RM5A 1X5CA 1Q4JA 3H79A 2YV7A 1V98A 1GH2A 1MDJA 1QK8A 5CREA 3ME7A 3HD5A 3C1SA 5D96A 3KP8A 2C0EA 3CBUA 1UN2A 3VI7A 2PVOC 3CRUA 4NHWA 5DCHA 1RK4A 4V1Ag 3FZ4A 4QL7A 1KTEA 2MYGA 3WGEA 1ZYQB 2NTOA 1URMA 5C00A 3P2AA 2L5LA 5ECIB 4QL9A 4FH8A 4MPGA 3UAPA 3ZVJA 1SK0A 2PBJA 1PQNA 3VPQA 4XS4B 1ILOA 2CVKA 5ECLB 1TRWA 3RAZA 2KHPA 2K8VA 1G6WA 4WR4A 3RPPA 2VLTA 3D0ZA 6GSXA 2HFDA 2V6KA 4DSSA 1JFUA 4LL4B 4Q5FA 1NHOA 2DJ2A 4PGTA 2MMZA 2YZHA 1EGRA 3KTBA 4P3YB 3TJBA 3VK9A 3L0HA 3GH6A 3LXZA 5ECPB 1ERUA 1AXDA 4F0BA 1GSQA 1T4ZA 4GQFA 2I9HA 3M9KA 2IMIA 5ECQB 4YQMA 2IIYA 5AIVA 1K3OA 3W6GA 2L4QA 3GRXA 3HJOA 17GSA 1ZOFA 1NHYA 2K18A 2CAQA 1X5EA 4KDYA 5KN3A 2GS3A 4ZBAA 3WGDA 1YKAA 3WT1A 2YJ7A 2JSZA 3D5JA 2C1YA 2DLXA 1YF1A 4CDOA 1YDKA 3ZFBA 1SENA 4LMWA 3GTUA 1O73A 1EP8A 2ZCTA 5JWOB 3HZ8A 4WEYA 1WIKA 5DDLA 2XC2A 4POMA 2LNSA 2H30A 3DWVA 2FNOA 1K3LA 4KCEA 2NVLA 4IGJA 2GT6A 2MBSA 5CRWA 1A0RP 4EC0A 3TDGA 2AHEA 3ZITA 2A2SA 1GTAA 1EZKA 2MMAA 2ZUPA 4OD7A 2L4CA 3NIVA 4TW5A 1M99A 1UC7A 4BVXA 2B5XA 4YAPA 2O8VB 4O7HA 4IP6A 5IM9A 1PSQA 3QD9A 5G31A 2WCIA 2OACA 2WS2A 4ZL9A 5H5RA 2X8HA 1QFNA 4MK3A 4K0GA 1USBA 3CSJA 4OFMA 5H5SA 3TKSA 4K7OA 1VF2A 1WMJA 4EL1A 4OFTA 4DSQA 5B8BA 1ERWA 1G7EA 3BCIA 4RI7A 1PL1A 2B1LA 3AY8A 1B48A 3GURA 4Q5QA 4WXTA 1JLVA 1Z6NA 2L59A 2DJ3A 2VUPA 3M3MA 4F0CA 2HLSA 4HU7A 4X0XA 3ZTLA 4MZWA 3APOA 3GKNA 3QFAC 1GULA 3I43A 1XW6A 3D22A 4ZBBA 2LS5A 3VFIA 3M1GA 4MH3A 5DALA 2VOCA 1XWCA 4J57E 4XS1A 2WB9A 1AW9A 3HYPA 5J3RA 1KEBA 3TKSC 1SYXA 1ON4A 1HNCA 4NXIA 1A0FA 2YANA 2LKUA 4FO5A 4BWQA 1MD4A 5CRHA 2H0GA 2EIRA 4KW6A 1EOGA 3IXRA 2IWTA 5J41A 1M7TA 2GSSA 5ECOB 5J5NA 2LNTA 3I6AA 2WULA 2H74A 3C1RA 4ZILA 2I3YA 3M9JA 3HVXA 4EXJA 5AISA 4FYCA 4AJ7A 4ID0A 4FYUA 2GZPA 3RHCA 4MCUA 1ZL9A 2NBSA 4EO3A 1SL2B 2H8LA 2C0GA 3FRCA 1HNBA 2DMLA 2YN1A 5ECSA 2VIMA 1SJZA 1GUKA 2LUSA 3IBHA 2RM6A 2F3MA 3PINA 1VF1A 3KMOA 1A24A 1K0AA 2YZUA 5IMFA 4BL7A 1ZCPA 5A5KA 3GL3A 5ID2B 2LQOA 3TOUA 1TTZA 2R3XA 3DKSA 1T00A 1AUCA 1GLQA 4JR6A 2FWHA 4CW9A 2DIYA 2OBIA 2XPDA 5CRDA 3SWLA 3HJMA 4PXOA 2N5FA 2DBCA 4J2FA 2JACA 4XRDA 4MH2A 2VAFA 4G2EA 4HZ4A 1OC9A 8GSSA 3EMPA 4ECJA 2JZRA 2V1MA 4TRXA 4NMUA 4Z7XA 1AQVA 6GSUA 1ACVA 2HZEB 2AV4A 2A2RA 5D9TA 4TXOB 2H1GA 3UARA 2AAWA 3KZQA 4NPBA 3BJ5A 3HKRA 4V2LA 2KUCA 1DUGA 3WGXA 4MA9A 3DMLA 4V1Ap 2GQMA 4NV5A 1PMTA 4MDCA 5IMAA 4I5QA 2FA8A 5DJMA 3FHKA 5ECMB 3I9V2 1ML6A 3ZRDA 1GTUA 3FR6A 1XVWA 2H6ZA 2NDOA 3VURA 3M0FA 5KN2A 2VL2A 2AJQB 12GSA 3IAS2 1OKDA 1DE2A 3DIEA 3MWHA 2X8GA 2DJJA 1M9AA 2LV3A 1Z6MA 4MJCA 3I69A 1W89A 1EOHA 4K1FA 4OO5A 3LYKA 2H1DA 3BOAA 5EVOA 1FAAA 4L0UA 2FUG2 4KSOA 3L9SA 3UJ1A 3WD6A 3MSZA 1EV9A 3A2VA 1M2AA 4HU9A 4HDEA 4IN0A 4BA7A 1ERTA 2WGRA 3ZVJD 3EURA 1GNWA 2EC4A 1SK1A 1U6TA 4EDZA 10GSA 2H1AA 2YWNA 3RHBA 4WETA 2DC5A 3F3RA 3TJKA 2X64A 2VL2C 2C3QA 3IAM2 1O8WA 1THXA 3P7XA 4OCFA 4JZQA 1S3CA 2REMA 1GSEA 2FCHA 1TRVA 2RUEA 3KH7A 2QC7A 1HQOA 4HJ2A 3G7IA 3KGKA 1Z3EA 3DGQA 2OKAA 2PUKC 1GP1A 4ECCA 4PX1A 2J9HA 5LNKe 1BQ7A 3EU3A 1FW1A 2Z9SA 1QXHA 1PKWA 1ST9A 3OR5A 2VD1A 6GSWA 4ZB6A 1BX9A 4MJEA 2KOKA 1EEMA 3FK8A 1RQMA 3HA9A 3HDCA 3IE3A 1VRSD 2LSTA 1GTIA 3L9VA 1TOFA 2B5YA 4IJIA 5ELAA 4GQCA 4TR0A 5FT3A 5B6NA 4KH7A 1BEDA 2H75A 4EVMA 5FHIA 3ZMLA 5D73A 3O6TA 5F06A 1X9SB 1EV4A 4HI7A 3JCML 3EMXA 3VWUA 2CQ9A 1GUHA 2AB6A 4MJBA 3Q19A 1A8YA 1ZZYA 2HI7A 4K6XA 2IPAA 5CAXA 2VCWA 4V2MA 4FYBA 2ON7A 4D73A 3C73A 3GIXA 5IPHA 3C71A 5INYA 5JCUA 3IPZA 4RQXA 1BYEA 2YNXA 5GAND 3TRPA 2WFCA 1KNGA 1O7UA 2P31A 3F4RA 1GSDA 1R5AA 2E2MA 4TN8A 5DBQA 3GYKA 4KB3A 2H19A 4N10A 6GSSA 1J0FA 5KEJA 2ALBA 4MLYA 3L78A 1FB6A 3TKQA 3GL5A 3CMIA 1UVZA 2IL3A 5AN1A 1XPVA 1SK2A 2V6OA 3A2XA 3P90A 5IO2A 1M9BA 4NAXA 4WBJA 5IPGA 5B8AA 3U6VA 2P5RA 3KIJA 4ISDA 3F3QA 4EE0A 3ERWA 4E8EA 3ZIVA 2K6VA 4XS4A 3A5WA 4YAVA 2B7JA 3FZ5A 3WYWA 2L57A 2L5OA 3TGZA 4MP4A 3KXOA 14GSA 3TKPA 5CYYA 3TUEA 2GT5A 1TK0B 4K7NA 2CA8A 3DXBA 2DMMA 1Q98A 1JLWA 2X8CA 4JE1A 1TI3A 3TJFA 4Q5RA 3F63A 2H76A 2VD0A 1JZOA 1R5PA 3KP9A 2FY6A 5HFIA 1XWGA 4WKWA 1X0RA 1QQ2A 1U3AA 4QQ7A 2FGXA 3TKRA 4ECBA 4HZ2A 3F8UA 3TCOA 1OC3A 1V9WA 1SL1B 1H75A 1TRSA 3ZMKA 4I8BA 1A23A 2V2GA 2M72A 3S9FA 1PA3A 3VI5A 4I2UA 4OCEA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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