2J23A

Cross-reactivity and crystal structure of malassezia sympodialis thioredoxin (mala s 13), a member of a new pan-allergen family
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
HHHHLVPRGSVQVISSYDQFKQVTGGDKVVVIDFWATWCGPCKMIGPVFEKISDTPAGDKVGFYKVDVDEQSQIAQEVGIRAMPTFVFFKNGQKIDTVVGADPSKLQAAITQHSA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Cross-Reactivity and 1.4-A Crystal Structure of Malassezia Sympodialis Thioredoxin (Mala S 13), a Member of a New Pan-Allergen Family.
pubmed rcsb
molecule tags Immune protein
source organism Malassezia sympodialis
molecule keywords THIOREDOXIN
total genus 32
structure length 115
sequence length 115
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2j23A00
3M1GA 1B4QA 1TU7A 2L5LA 3WT1A 2L6DA 1EGOA 1PGTA 3GL3A 5JCGA 2LQQA 1BG5A 3TKSA 5ENUA 3MSZA 3MWHA 5ECQB 4DSSB 6GSSA 1ZOFA 3BBYA 1X5CA 3GH9A 3KD0A 2LJRA 5F05A 3QFAC 1WE0A 2NDOA 2B1LA 3U6VA 5CRWA 3FKFA 3SWLA 1QFNA 1UA5A 4TVEA 2FD3A 4IJIA 4POBA 4RI6A 1GLPA 1MDKA 2FWEA 5HR3A 1RQMA 3A5WA 3PINA 4Q5FA 4PNFA 1YJ6A 2ON5A 4POLA 3LYKA 3GKXA 3HA9A 3D4MA 3W8JA 1B4PA 3I43A 2IJYA 2DJ2A 2HSHA 2LKUA 1HNAA 1TK5B 2WULA 3WYWA 2HYXA 1BEDA 3MAKA 4KSMA 2HNLA 1VRSD 3DEXA 1WP0A 3D6IA 1SL0B 2NPBA 3CMIA 5IOXA 3DRNA 1VF3A 1KEBA 3VWVA 2IIYA 5LD0A 3TJKA 1T4YA 1QGVA 3VWXA 2H0GA 3ZZXA 3BOAA 4K1FA 2TRXA 1TDIA 4LL1B 3M9KA 4V1Ag 2P5RA 3VLNA 1HQOA 3FZ5A 4MLYA 1TI1A 3L9VA 4Q5QA 5CRGA 1XW5A 1PL1A 5IIZA 5ID2B 1B8XA 3FHKA 2PMTA 4ZBDA 3L9UA 4V2MA 1ZMAA 3TKSC 2B5EA 1A0FA 2DC5A 2DLXA 1TK8B 2HSYA 4MABA 5DJMA 5AN1A 4XRAA 1GUKA 2VM1A 3LYPA 4I6XA 2C0FA 2HZEB 3HD5A 5HFKA 2LJKA 3DKSA 4V1Ap 3QAVA 1A2JA 4BWSA 3GSTA 1MD4A 2B6MA 2H8LA 4IW9A 4G19A 3TJJA 5AISA 2H01A 4MZBA 4KX4A 2RM5A 3GKMA 4FO5A 5IO0A 3O3TA 2IMKA 2IMIA 2Z9SA 2B7JA 3F3QA 4JEDA 4KDXA 1SL1B 6GSYA 1BJXA 1PQNA 1GH2A 2IMEA 2FCHA 3WGXA 3IK9A 4GXZA 2R5GA 4NWYA 5IMAA 4IHUA 1Y25A 2LRCA 1Z9HA 4K7IA 1SKRB 5DVBA 2FHEA 4TR1B 4LMVA 5GSTA 1YF0A 4ZBAA 3TB2A 2FWGA 2XBIA 1ABAA 2VO4A 4HUAA 4OCEA 3GUSA 5AIVA 5EVOA 3C1RA 4MH3A 3H4KA 3TOUA 5E59A 4ZXGA 2LSTA 3TRXA 1B9YC 3HVSA 11GSA 4TKYA 1M0UA 4GSSA 2YJHA 1Q4JA 1SKSB 2TRCP 3BJ5A 1EV4A 1TK0B 5IPGA 1N2AA 1WJKA 5J9BA 4KB3A 4EE0A 1TRVA 2ES7A 2H0HA 1PL2A 1TOFA 2CVDA 3DWVA 4XS4B 2X8HA 2GQKA 4MCUA 2H30A 1GLQA 5HFIA 1TRWA 5ECIB 5ECSA 3UVTA 3VURA 2WB9A 5C00A 1EWXA 3DXBA 1EEMA 1A8YA 3IHQA 3QR6A 2H66A 3ZFBA 1ERTA 4BL7A 1FW1A 1SJ6A 1JZOA 1SENA 4FYUA 4BVYA 5G5FA 4F03A 3FZ9A 1AQVA 2VD0A 5A4VA 5KN2A 4G2EA 1M9AA 2K18A 4HDEA 3N5OA 1XIYA 4ZL7A 2DBCA 4RQXA 4OMVA 1DSBA 5F07A 4V2LA 1YDKA 5ABRA 2MMAA 3M9JA 1JLVA 5JCWA 5E4WA 3WGEA 5CREA 5H5RA 2YCDA 1S3CA 4PGTA 4AJ7A 1BAYA 2I3YA 4JR4A 4MMMA 1WRYA 2HRNA 3UBKA 5ECOB 1X9MB 3EC3A 1GTBA 1Z7PA 1DBYA 3EMXA 4TXOB 1GTIA 3GIXA 4X43A 3EINA 3HVVA 4HEA2 3F63A 3TKQA 2YWIA 1EOGA 2MYGA 4EL1A 4HOJA 3KH7A 4ULXA 1XWBA 4L5LA 3EVIA 2CX3A 3LORA 3M0FA 2WGRA 5HR1A 4ZB9A 2IN3A 4ML6A 5CRDA 3UARA 2ZUPA 2YWNA 1HYUA 1E2YA 1JZRA 3HJOA 1EOHA 1U3AA 1THXA 4D73B 2KUCA 1GUHA 3UEMA 4CW9A 5D9XA 1GSDA 2JSZA 4ACSA 3HDCA 2CZ2A 3LEFA 5ECHB 1THOA 3PH9A 2OJLA 1T3BA 4YQMA 2KOKA 1GSUA 2GZYA 1O8WA 2YANA 1A2LA 2V6OA 3HY2A 3GSSA 2GQMA 3FY7A 1B9XC 3IRAA 1SL2B 3CSHA 3BCKA 2KLXA 3LG6A 2O85A 1A0RP 3QAGA 3GTUA 3QPMA 1QQ2A 2YV9A 3F8UA 3GA4A 2FNOA 2P31A 3LSZA 5CNWA 1K0BA 2DSAA 4IBPA 2GSSA 4DEJA 3RAZA 1HNCA 1X9SB 3FK8A 4TW5A 2A4VA 4GSNA 4MF5A 2GSQA 3GL5A 3FZ4A 2ALBA 1Q98A 1O85A 1G6YA 1GP1A 4ZB8A 4PQ1A 1F3AA 2MBTA 2P5QA 4PUFC 2GT5A 3VK9A 5G2ZA 5J4UA 4TN8A 5IMCA 3GURA 2JACA 4EC0A 1FOVA 5A4UA 3KGKA 4YQVA 4OO4A 1FHEA 1T8EB 2PWJA 10GSA 1T00A 2DJKA 2H0IA 4MDCA 3TOTA 1ZGNA 3IDVA 1WIKA 2PU9C 1S3DA 1OE8A 3DVWA 1ZCPA 4PXOA 3C7MA 5J5NA 4NV5A 1IYIA 4ECBA 5H5QA 4G10A 3HZ4A 1U3IA 2JZSA 1M7TA 3S9FA 2FWFA 4XRDA 4NV2A 2OBIA 4FH8A 4N11A 3UIWA 2L57A 2H1GA 4OWYA 3RPPA 1K0DA 2H73A 3LWAA 1G7EA 2PGTA 2QGVA 3HVXA 19GSA 3DD3A 1A2MA 5DDLA 3WGDA 3QCPA 5DAKB 3VPTA 2I81A 1EP8A 3C71A 4KDYA 2C0EA 4OCFA 2VCZA 4PNGA 4TR4A 4WF5A 5DALB 4NHZA 2NVLA 5B6NA 2MBSA 4ZIJA 2BTOT 3MNGA 3F9UA 1XOAA 2C0GA 3DMLA 3FR6A 2K8SA 3F4RA 1XCCA 2GDRA 1OYJA 3ZMKA 1M2AA 1V9WA 2JZTA 4RI7A 2IMFA 1UC7A 3C1SA 3A2VA 2HI7A 1SK1A 3P2AA 18GSA 3IOSA 4FYBA 1VF2A 2LNTA 4F9ZA 3W8SA 1MEKA 1KNGA 2GS3A 3L78A 1H4OA 3KTBA 1A8LA 2YJ7A 4PURA 1GSFA 2VL9A 3TRQA 1PMTA 1NHYA 2WS2A 2AUVA 3ZVJD 2B3SA 1HD2A 5B8BA 4PUAA 1O6JA 2WFCA 1Z6NA 1QUWA 3D4TA 3IAS2 3KP8A 3H79A 2FY6A 3CSJA 3R2QA 2LRNA 3NOFA 2PN8A 4WR4A 1F6MC 1XBSA 5J9CA 2YZHA 2PPTA 4GQFA 1CQHA 4G9HA 1SD8A 3TGZA 4EO3A 5L71A 2PERA 1NM3A 5AIXA 2OE1A 3BCIA 2F3MA 3QAWA 2AAWA 2HZFA 6GSTA 2V41A 2LJAA 1S3AA 5D8IA 2L6CA 2LV3A 3CRTA 2H1DA 3TKSE 1EGRA 1EZKA 4XIHA 4MK3A 2GVPA 5IMVA 1GTAA 1O8XA 2VAFA 3EU4A 3BD2A 5IPHA 2CVKA 2LNSA 3HCZA 1URMA 4IP6A 1ON4A 3LQ7A 2M72A 4RQRA 4AGSA 2EIOA 3Q18A 3N9JA 1R5PA 5H5SA 3CYNA 1OC9B 5HQPA 3F4TA 2A2SA 2MMZA 2OADA 3E9JB 3HZ8A 3AY8A 3UOMA 3Q19A 13GSA 4I8BA 4HS1A 4KNDA 3ED3A 2WJUA 3ISOA 3FW2A 1F3BA 4KAEA 2C3TA 1TI3A 5AGYA 4EVMA 4KSOA 3RHCA 1T4ZA 4EXJA 1O73A 1M2DA 4K2DA 4HU7A 3GFKA 4N0ZA 5DQSA 2EC4A 3HKRA 1OC8A 1PRXA 3GYKA 4I2UA 2VD1A 4MP4A 3FEUA 2L59A 4LLRA 14GSA 3KP9A 1X5EA 3G7YA 1X9WB 4POKA 1GSEA 2HE3A 1QXHA 1GNWA 3HJMA 1RW1A 2H19A 1TJDA 2YPMA 1GSSA 2C80A 1NW2A 2VCWA 2H72A 3H93A 3A2XA 3TCOA 2L4CA 3TRPA 3I6AA 4JR6A 2I1UA 5ECPB 2B5XA 4F82A 1YKAA 4EKZA 4BWQA 3CBUA 2WRTA 3ZFLA 2O87A 1TU8A 2F8FA 5J41A 1XOBA 4ZBBA 3LFLA 2N5FA 4WR5A 5KN3A 2IWTA 3J7Yb 5JWQB 1YEPA 3KH9A 3O6TA 2HRFA 4ID0A 1GL8A 2C1YA 1K3YA 2VUPA 5CAXA 4Q5NA 5DJLA 3FZAA 1LU4A 2O89A 4EDZA 3QFBC 3VWUA 3J7Yk 5DCGA 1UN2A 2RUEA 1ZYQB 2XHFA 2H1BA 3GX0A 4IQ1A 3PGTA 4JBBA 1BQ7A 2JSYA 3HXSA 1NHOA 3KTLA 1XWKA 1I9DA 3W6GA 3EE2A 5ID2A 2RLIA 5GAND 2HXKA 4I5QA 3G7JA 5FWGA 2C0DA 3D0ZA 2C3NA 1EP7A 1RK4A 3KXOA 4GF0A 1TP9A 3KJYA 4ZL8A 3LGCA 1PA3A 4WETA 4KCAA 1MDJA 3IAM2 4AF2A 4L5OA 2CV4A 4WKWA 2HZEA 5A4WA 3UBLA 5HFGA 3ERFA 4YH2A 1JZWA 2BJXA 5D9WA 2NBSA 5ECRB 1YZXA 3D21A 4K0NA 2RM6A 2R4VA 4XS6A 1ZL9A 2QSIA 2IFQB 2E7PA 3WT2A 3EURA 4AJ8A 1OKTA 4GQCA 2XPDA 3EU3A 2QKEA 4I2TA 2R37A 3KMOA 1XXUA 3ZL5A 1SK2A 1PX7A 4FYCA 5KEJA 2PBJA 2B7KA 9GSSA 1XZOA 3RPNA 3K8NA 1R4WA 4KGIA 1TXXA 4BPYA 2XC2A 1LJRA 3G7IA 3GKNA 5C04A 4IVFA 4X1UA 1LBKA 4ZB6A 3LXTA 4DVCA 4WBJA 5D73A 1GSYA 2YP6A 5D9TA 3EWLA 4TR1A 4TXVA 3GMFA 3VI5A 3EMPA 2J23A 4PQHA 2YV7A 2L5OA 3RBTA 1K3OA 5HR2A 1YEXA 5ECNB 2JU5A 1PKZA 5GZZB 2R3XA 1JFUA 1U88A 1G0TA 1JHBA 4BA7A 1FVKA 2FA4A 1MTCA 4DSRA 3CXGA 2GT6A 2H75A 5COHA 4NXIA 1DUGA 2DJ0A 5D96A 2O7KA 1JLWA 1AC1A 2ZCTA 2N5BA 2TIRA 2H70A 2AJQB 4ML1A 4L0UA 1ERUA 2B1KA 2V32A 3APOA 4MZCA 1CQGA 2X8CA 2GSRA 4RUVA 2DMLA 20GSA 3G9BA 2IL3A 2K8VA 4KCEA 3KM6A 1J0FA 1W89A 1SJZA 2L4QA 4J2FA 2OACA 2FUG2 3US3A 2CZ3A 2VCQA 1HNBA 1YF1A 4K8MA 4GCIA 2DJ1A 2HLSA 2AV4A 4WXTA 3RHBA 1R26A 4IN0A 3UMAA 2X8GA 3L0HA 3TKPA 1B48A 4LA1A 1G7OA 2IMDA 2FA8A 2PVQA 4HJMA 4TR0A 1QK8A 3ME8A 4GWRA 5ELGA 2GGTA 3OR5A 4HZ2A 2P0GA 1M99A 4IP1A 1ZYEA 2KP1A 2V1MA 4MF6A 1G6WA 4TR3A 2YWMA 5IM9A 4XCSA 1FO5A 2H74A 3ZVJA 2QC7A 6GSUA 2EIRA 3DGQA 2GZPA 3F6DA 1DE2A 4QQ7A 3L9SA 3P7XA 5B6MA 1SK0A 1VF1A 3ERWA 4TXOA 5KN1A 2X64A 1OC3A 1V40A 1A23A 3F4SA 5CYYA 3LJRA 4V2NA 1TTZA 3Q6OA 2OBKA 1GUMA 1F37A 4HQSA 4WF4A 1XVWA 1X0RA 2CT6A 4JRRA 4POMA 2A2RA 3IV4A 2F9SA 4EDYA 4D73A 3PR8A 4N30A 3E0UA 2VCTA 3QOUA 2CAQA 1KBNA 2CVBA 3L4NA 5B7CA 3FR3A 4OFNA 3A2WA 1EEJA 2MZCA 2FWHA 5A5KA 2I4AA 4K6XA 2E2MA 3I69A 4IS0A 4PQIA 4WEYA 5KN0A 4EUYA 2ON7A 3GNJA 2REMA 4YQUA 3GN3A 2OE3A 4N0VA 1TRSA 4ECCA 1XWCA 8GSSA 1JZDA 1Y6EA 2CAIA 1ERWA 3GH6A 4O92A 2JADA 5GAPD 2ZNMA 1V2AA 2LEGA 1XVQA 4NPBA 2K9FA 3JCML 2X99A 3QDNA 4MH2A 2RIIA 4H86A 4X0XA 1SU9A 1K3LA 4ECIA 2AYTA 4MA9A 2XPEA 1VGLA 4XHMA 3ZIVA 2WCIA 2LUSA 5EPFA 4Q5RA 2CA8A 2M46A 1XPVA 1OVNA 2VM2A 1ERVA 1XWGA 5F8BA 2GTUA 3TJGA 1Z3EA 5G5EA 2F8AA 1AIUA 4PX1A 5EY6A 5DCHA 17GSA 4NHWA 3KEBA 22GSA 4MJBA 1SJIA 5ECLB 3IC4A 4Z7XA 4YAPA 3RDWA 3UJ1A 3ERGA 1XW6A 1T1VA 1XW9A 1GWCA 3HHVA 3VPQA 1KTEA 1E6BA 4TOPA 5CO3A 2BMXA 4JU5A 5IOWA 1N8JA 1V98A 2VIMA 1O7UA 3IXRA 1YKCA 4XTSA 3ZYWA 5F06A 4HJ2A 2RUFA 3APQA 3KMNA 2B5YA 1PN9A 3F6FA 3FYGA 4IELA 5DAKA 4E8EA 4HQZA 3IPZA 4MPGA 2DJ3A 3UAPA 3IBHA 4MJEA 1ST9A 5F0GA 2N5AA 3IA1A 5DALA 4DSSA 2O8VB 1U87A 3C8EA 1Z6MA 4GSTA 1J08A 4HI7A 3H8QA 3TUEA 2VL2A 1ML6A 2D2ZA 1WOUA 2JZRA 2OA7A 1EV9A 2C8UA 4GLTA 3GHAA 5IMDA 4CDOA 3QMXA 2VOCA 4K7NA 4KW6A 3WD6A 5D9VA 4IJ3A 3IR4A 1WWJA 2C3QA 5IQYA 2MMNA 1AAZA 4OD7A 4ILFA 2M80A 4WBRD 4MJAA 3F3RA 3KIJA 1C72A 1SYRA 7GSSA 1U6TA 2GSTA 3UVHA 4LMWA 3H1NA 3F0IA 3Q74A 3HJPA 2H6XA 1QMVA 4JE1A 2H76A 2G2QA 1GULA 1PX6A 3M8NA 3ME7A 3E3EA 4J57E 4YAVA 3FR9A 2KHPA 1Z7RA 2MMOA 1FAAA 3TDGA 3ZTLA 6GSXA 4KDUA 1FG4A 1VF4A 4XS1A 1TRUA 3A3TA 1ACVA 2CX4A 3DIEA 4QL7A 5DQYA 2LTKA 2R6KA 1MDIA 1K0NA 4K9ZA 2DIYA 3D5JA 4ZILA 2AHEA 1OAZA 3ZIJA 1J9BA 3UL3A 2VCVA 3GTUB 4QL9A 2HT9A 2PVOC 4IKHA 3C73A 2LS5A 2LQOA 4I97A 3D22A 2VLVA 2E2GA 1R7HA 1FB0A 4MJCA 2YOIA 1UVZA 3P90A 4OO5A 3O76A 1W4VA 1AUCA 1AW9A 3VWWA 2R2JA 4ZL9A 1OC9A 1YY7A 4BVXA 2VL2C 4EF0A 2G0FA 3DVXA 4N10A 3SBCA 4FIWA 1K0CA 3TJBA 2VLUA 1R5AA 5IO2A 2I9HA 2H1AA 1V58A 2XBQA 4GRFA 2VCXA 1DE1A 2EIQA 5EL8A 1IYHA 4KUNA 3CRUA 5DBQA 5FHIA 1K0AA 4MPFA 3M3MA 1Z5YE 5IMFA 2K6VA 2YNXA 3GRXA 3VI7A 5G30A 1A24A 3GX8A 4CHSA 4HU9A 4NMUA 5J3RA 4E8HA 3ZREA 5HR0A 1GRXA 4LL4B 3NIVA 12GSA 1TKDB 4L0WA 5JCUA 2WDUA 5D93A 3GKKA 1X5DA 3NZNA 3CTFA 3VFIA 1SD9A 3ZRDA 3MDKA 2FLSA 4MF7A 3KCMA 2GZZA 1GNEA 1T7PB 2FGXA 1M2BA 3QD9A 1AQWA 5LNKe 5IMZA 4HZ4A 6GSVA 1O81A 1AXDA 2CQ9A 5CRHA 4DSQA 1K0OA 2F51A 2H6ZA 2PUKC 1K0MA 4MZWA 2YWOA 1F2EA 3DYRA 5INYA 2WZ9A 2LRTA 4P3YB 2J9HA 3U5RE 2DJJA 4KE3A 16GSA 1PSQA 4OFTA 1FB6A 5JWOB 2V2GA 3IK7A 1H75A 4IGJA 4F0CA 1MD3A 5LCZA 1GSQA 1ILOA 2OE0A 3CSIA 4TRXA 1PKWA 2HFDA 2IPAA 3ZITA 2JL4A 3FRCA 6GSWA 5G1KA 1TW9A 1FVJA 1YQ1A 2VL3A 2H71A 3P8WA 2YN1A 4XS4A 4KH7A 4OFMA 5B8AA 4IQAA 4O7HA 2GLRA 1ZZYA 1SYXA 4K0GA 3KZQA 1GTUA 4JZQA 4NAXA 2VLTA 1V57A 4F2IA 1NSWA 1OKDA 2KP2A 3CTGA 3ZLPA 5G31A 3V1WA 4KA0A 1AQXA 2GQLA 2YZUA 4GTUA 1XFLA 3ZMLA 1WMJA 3GV1A 4ECJA 3EYTA 5CP1A 1BX9A 3IE3A 4AJ6A 1WPIA 1BYEA 4O5RA 5GSSA 2AB6A 4J56E 3I9V2 5FT3A 4K7OA 5ELAA 5G1LA 1USBA 1XWAA 2DMMA 2C4JA 5ECKB 2H6YA 2IFQA 1OE7A 2V6KA 5ECMB 3TJFA 1PD21 1I5GA 2E0QA 3HYPA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite