2J9YA

Tryptophan synthase q114n mutant in complex with compound ii
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
266
structure length
251
Chain Sequence
ERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Salmonella typhimurium
publication title Betaq114N and Betat110V Mutations Reveal a Critically Important Role of the Substrate Alpha-Carboxylate Site in the Reaction Specificity of Tryptophan Synthase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE ALPHA CHAIN
total genus 92
structure length 251
sequence length 266
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2006-11-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2j9yA00
2EKCA 2QR6A 2DP3A 4FX8A 4N4QA 4O14A 1KLZA 1LROA 1LLWA 1TRIA 3B04A 3CEUA 5HUOA 1EUAA 5C2XA 4FXSA 2QCMA 5D05A 3NA8A 3EEGA 2PRMA 3RNDA 1XKYA 4UFLA 2C0AA 2I9EA 3TMQA 5ABTA 2RDWA 3LBCA 2NX1A 1JCMP 2WO5A 1W5NA 4UR7A 5DLCA 4GUIA 4I9AA 3RFAA 2JKEA 4CNPA 4TO8A 1QPNA 1MEIA 1KM2A 3LTSA 2A7PA 3A9IA 3WJZA 3DAQA 1YXDA 4DBEA 3DU0A 1FDYA 3HGOA 1GVSA 3CHVA 3BGGA 2H6RA 1NFBA 2AGKA 4MY1A 3TJLA 1XC4A 4WXZA 2Z6JA 5EY5A 1ICSA 1O94A 4OU1A 2RH9A 1O60A 4CCEA 3O05A 4DF0A 1ZJIA 1TV8A 2JGYA 1KM5A 3IGXA 4K8HA 1XL9A 3LHYA 3BW4A 3I7SA 3PUEA 3TJXA 1JRCA 3NGJA 3OVRA 2KZHA 1JUKA 4U4MA 2E6DA 3SR7A 1DQXA 3SFKA 4TR9A 1GWJA 3UWZA 2BSLA 4XKYA 3S5NA 1H60A 3H54A 3BARA 1WXJA 3ELFA 4N9BA 4H3DA 3JRKA 4ZMGA 2ZA3A 2V82A 1YYAA 3W7KA 3PY2A 3HPXA 5CPNA 3OIXA 1WAUA 3L65A 4GUGA 4IPIA 1Y0EA 6TIMA 3O6CA 3MI2A 4LS2A 4W9TA 5AB3A 3NO5A 3W22A 4O0ZA 4N6EA 1TPC1 5HJLA 1F76A 1HO1A 1MSSA 4GE8A 3SECA 5AHIA 3ZS4A 3HG2A 1TPB1 1L6SA 1ALDA 1TB3A 4CCCA 3LGEA 4NJJA 5KSWA 5DCBA 1H7XA 1V5XA 3C2RA 4LOCA 1EX5A 5D2XA 3LB0A 4JTTA 1SR9A 5K4ZA 1P0KA 4A2RA 1DHPA 5EL1A 3UPWA 2VFIA 3I65A 3U6WA 5TQLA 1F2JA 1OK6A 4E2DA 3LCFA 3W1LA 3CC1A 3W1RA 4X22A 1BTMA 2DZUA 1KFKA 4Y96A 1TQXA 4XUGA 4OWGA 3VE7A 3W7DA 3NYZA 1EP1A 2VELA 1WQ5A 2VC6A 3HG4A 3G1DA 5LNVA 3M1ZA 1BKSA 4JICA 1VQTA 3ATYA 2DU2A 3EXTA 5EPDA 2ABAA 3KVKA 1M5WA 5FEWA 5TIMA 3CIWA 4QM1A 4O1BA 2VKZG 3S1VA 4EOUA 2H8ZA 2OCZA 1IXPA 1JR1A 3B8DA 1TPUA 3HQ1A 3KAOA 3KHJA 2ZRZA 2JBMA 3MI6A 4GNJA 2Q3RA 3LV5A 4WUIA 5EBUA 2NZLA 4CNNA 1BWKA 3C8FA 1SW7A 5F2LA 4LS1A 5G4EA 4BF9A 4M6VA 2A7RA 3HJZA 3Q58A 2GVLA 1K7EA 2NX9A 3PWAA 3C2VA 3HOJA 2FFCA 4Z1BA 3G1SA 2VEMA 1UB3A 5G5IA 4O52A 4OV9A 3IIVA 4ADUA 4UNKA 2GVJA 1JRBA 1SFLA 3W07A 1H51A 4ZVJA 3TX9A 3TE9A 4LRTA 3S5YA 1OFEA 3NDOA 4UFJA 5FF3A 3PR2A 2C1HA 4DO4A 1WYIA 4X2RA 2ZZ2A 4O4VA 2ZZ7A 3IGSA 5LGZA 2FQIA 2R91A 1QPQA 5D32A 1P0NA 4O1CA 5H2ZA 3KXQA 4AHPA 2G96A 2WNQA 2XN2A 3STEA 1H7OA 3W7CA 4HHPA 2UV8G 2OT0A 4ICNA 5AOUA 2ZYFA 4KWWA 3NL5A 4MZ1A 3A5FA 1K7FA 4LWWA 1YPIA 2ZRYA 3PSVA 5F1VA 1VGAA 3C3NA 1R46A 2CLHA 3M5YA 2ZA1A 4LC6A 3N2MA 5F1UA 3LTYA 4MOZA 1KLYA 3W7OA 3K30A 4MJZA 1THFD 1PHWA 3TFXA 3QPZA 2BLEA 3VE9A 3S9YA 3NZ1A 5DELA 3HGRA 3THAA 1IXOA 4OQVA 3USBA 3STGA 1KM3A 3OVQA 3LCIA 5A5WA 1VS1A 3B03A 2QJIA 1KFCA 3TSBA 3I7QA 5MHBA 1VRDA 2NXIA 2FB2A 2V2CA 2CLMA 3WJWA 3HMJG 1C29A 3HGSA 2HS8A 2NV1A 1HG3A 2YSWA 2G97A 4AVFA 3SGUA 3VCRA 4N2YA 4MZ8A 1QDSA 2B4GA 1H50A 1GTHA 2QAFA 5D09A 1TV5A 3W2NA 3W2JA 1WV2A 4DPQA 4HPJA 4HNUA 1SZNA 3EX2A 4NJKA 3TXVA 5I3FA 3NQDA 5DN1A 1LORA 1F5ZA 3F4NA 3HPSA 4GBUA 5TBOA 2W0UA 3LBMA 3RF9A 4ZZ9A 3BO9A 3QMTA 3G1FA 1TTIA 3C2EA 3B06A 3STFA 5CZSA 1R30A 4AHQA 4AEOA 1ICQA 4HNTA 3OEXA 3G8RA 2VFGA 2YFOA 4NJHA 1I2OA 3W1XA 3NQVA 3GDKA 4HNVA 2ISVA 1MEWA 5CPMA 1P5BA 3CU2A 5HWNA 2CZEA 2PURA 3W86A 4IOTA 3IIXA 3MP3A 1X1OA 1GOXA 3BW3A 4UTHA 3GXPA 1IGSA 5HINA 2BXVA 2VENA 3G1VA 3EX4A 2A6LA 5AHNA 4C1LA 1NSJA 1O5XA 4O17A 1U83A 3A23A 3L0NA 2Y88A 2X1UA 1AW5A 2QUUA 3STCA 2PRLA 3FFSA 5F4XA 5CPOA 1WDWA 2WQPA 3E02A 3B0VC 1OFAA 2CW6A 2E6FA 4LV9A 1KTNA 1UUMA 3UNDA 4MLJA 3M47A 4GUHA 2B7OA 2X2GA 3BVJA 3LCGA 3LHUA 3EX6A 3E96A 5LHFA 1I45A 3BGJA 4DF2A 1OX4B 1W5OA 1EEPA 4Z0JA 3NQEA 3PUOA 1ZAHA 3GIYA 4X9SA 3HB9A 3EWXA 4B5NA 3LLDA 3P67A 4KFPA 4O11A 3DGRA 1S3HA 3TA6A 4NVTA 3T4CA 3N2XA 2J88A 2NXGA 3W23A 2Y6ZA 2E68A 5FF4A 3CM4A 4UXDA 2QCNA 3C56A 3W2LA 3MW7A 2JKAA 3NR0A 3MWAA 3ZFHA 2E09A 1N7KA 3VKJA 1HTIA 5BMWA 4JD4A 3TCEA 1BWLA 3RLVA 4O57A 4O1AA 2X16A 2LLEA 2E6AA 1G6CA 3TKFA 3FKRA 3QQ1A 4JTSA 4NNBA 1WBHA 4UTTA 3ATZA 5CZ0A 1D3GA 3TMLA 2QKFA 4PFMA 2AQWA 4FNRA 2YGYA 1UASA 4CCDA 3WK3A 4DPPA 2YW3A 4YMZA 1OFBA 3TU9A 3PG8A 1TTJA 3LCWA 4UR8A 4M7SA 5GVJA 4NU7A 3G1YA 4FNTA 2Z6IA 1OX4A 3LHTA 2NWSA 2C16A 4O15A 5U7SA 2HSAA 5DBUA 1VYPX 3M9YA 4N6FA 1KBJA 5I3JA 4RZ4A 3BLEA 3TV8A 4LW7A 1XBZA 1LRQA 3NL2A 4RKAA 1GEQA 1QOQA 1NVMA 2W79A 4N4PA 4WOZA 3EKLA 5HQEA 3ZR4A 4UTTC 3WJXA 3LOTA 1G4PA 4MJMA 3GZ3A 3BLIA 3QW4B 2R94A 4LS0A 3MMTA 3H55A 4IMDA 1SPQA 2D73A 2ZCGA 3GYEA 3DFTA 5KINA 3QEZA 3D0CA 1ICPA 4IXXA 1Z44A 1TJPA 3C6CA 4UFMA 3W70A 1O5KA 3LHVA 2ZZ6A 3Q37A 4DELA 1LOQA 2H3BA 4WY0B 4MY9A 4RXGA 2CFFA 1EB3A 1I8JA 5AC8A 3CWOX 1DBTA 5FF2A 2RDTA 1LLZA 1EWDA 4RZ6A 3G0UA 4PA8A 2F84A 4A3UA 2DZPA 1MZHA 2EHHA 4I7WA 2E5DA 4EWND 4CQAA 2FJKA 1I4NA 3W7MA 1KA9F 4LVBA 3G24A 4LVFA 3UXAA 1YTEA 2I14A 2R14A 1YDNA 1AL7A 4R7JA 3G0XA 4PTNA 2VOMA 1TMHA 3GR8A 3EB2A 5LGXA 3DHFA 4JX4A 1N55A 4AWUA 3P82A 1G69A 1ADOA 1Q6RA 2WKJA 3IVTA 2GOUA 4FO4A 2E5CA 3W84A 3BG3A 5HR7A 3W88A 1ME7A 2ZZ5A 4QNEA 5CZJA 1P1XA 2RDUA 2Y70A 1XM3A 4AWTA 4ZQOA 3C2FA 3LV6A 1K03A 5FF7A 4R34A 3PVFA 1ONRA 1U5JA 5AYYA 2WPBA 3L0GA 1JUEA 3S8HA 4Z0SA 7TIMA 5HWJA 1HUVA 1F7BA 4JNMA 4O0KA 3C52A 1GQNA 2G95A 5FEZA 5I3GA 1Q3NA 3KRUA 1BEUA 2QCGA 4JGDA 4KFNA 3ABQA 2HTMA 6ALDA 4GC4A 4TX9A 4K7YA 5HNRA 2ALDA 3W73A 1SW3A 3HG3A 5KZDA 1KFJA 3TH6A 1X8FA 2YR1A 3RU6A 1SZGA 4BI6A 5AFDA 5AHMA 1PIIA 2ATSA 3NXFA 4KKXA 3TSMA 8TIMA 3NQAA 3FS2A 4AAJA 2Q8LA 3QYQA 3NPVA 5DY3A 1T8XA 5D2WA 5FEXA 1SO5A 2WOQA 4Z08A 2ZQ0A 4EIVA 1OYBA 1FBAA 1X7FA 2Y62A 4LT9A 1R2RA 1F6PA 2P0OA 2DJXA 4YL2A 1A5CA 3ABRA 4FNUA 4RCXA 5L6UA 3GKAA 1YDVA 1K02A 2PRHA 2B7PA 4RK8A 5EYWA 5LKYA 4RR4A 1GYLA 1VHNA 3EXSA 1YDOA 3LHWA 2TSYA 3A22A 4UC5A 1AL8A 4MPQA 2A85A 4E38A 2IQTA 4ZQRA 2C6QA 1OFRA 3NQ6A 1LYXA 1JVNA 1G4TA 3S0CA 2Z0IA 3PUDA 2EAWA 3SJ3A 1PVNA 3HF3A 3W1QA 1TYGA 4JXCA 4ZQPA 1QWGA 3S5ZA 1PCWA 3PBVA 3GDLA 4JIQA 5CSRA 3ZWSA 4WQ6A 3BG9A 4JTEA 3NNTA 2BX7A 3N34A 5AC6A 5BOOA 4K36A 4IMCA 4RLIA 3TW7A 2FPTA 4MYAA 3NQFA 3G1XA 4FX7A 5AC7A 5DY2A 1GYNA 1K8XA 2ZRWA 3IVSA 4RXFA 2OJPA 3MYOA 1TCDA 1MXSA 2CZDA 1UBSA 3PBYA 4IMFA 3MHFA 3T78A 2VFHA 3TAOA 1H1YA 4ORMA 5LNUA 3I6RA 4CQ9A 3UD6A 4QNWA 3B0UX 2ABBA 3QMSA 4K37A 2FB3A 1PHQA 2CLFA 3SZ8A 3P81A 5FF0A 1RR2A 2X1RA 1SUXA 2WNNA 3W6YA 1KTBA 3PB0A 3P62A 4JTIA 2DZXA 1JQXA 3R8RA 3L5AA 4LUJA 2GQ9A 2YW4A 4JR5A 1YTKA 4GWEA 1XUZA 4Y9AA 4K39A 2C3ZA 1GJPA 1OX6A 2QCDB 1EA0A 4EF8A 2V0TA 5L9FA 1OYCA 4ZQMA 1FY6A 4UMBA 4NXSA 3SGZA 1RZMA 5G2IA 1NEYA 3KRZA 1UJPA 2C13A 2QDHA 3UWVA 3QZEA 3W83A 1QFEA 3LLFA 3P5YA 1VPXA 2WJZA 4OV4A 3TQKA 3UWWA 1RQBA 2A4AA 4HSOA 5AHLA 3VNDA 2E5BA 1R2SA 4UMAA 5CG7A 1K7XA 3EWWA 4GXMA 4E2BA 3C2OA 3DZ1A 1GZGA 3W7PA 3T55A 4JX5A 1A5BA 4K8EA 1IXQA 1M6JA 3EKZA 4XBSA 3BV4A 1L6WA 2QDGA 4MLRA 1DKWA 4JY9A 3P8IA 2QJHA 1A50A 2ZTKA 4JX6A 1OFQA 4IMEA 3P84A 4BFAA 1ZNNA 1GVOA 3FOKA 2H3DA 5E0KA 3AJXA 5KZMA 2TPSA 3M16A 4HT3A 4FEZA 4LU0A 4YWIA 3PULA 1C8VA 3S1UA 1WX0A 3FYOA 4M5PA 4JDYA 4FX6M 1AK5A 3DHDA 2NV2A 3RMJA 5J5RA 5KMYA 2YCEA 3MP4A 3CWNA 3N9SA 3MO7A 1CW2A 2CZFA 5D03A 2C14A 3N14A 4R33A 2J6XA 4O16A 1J5TA 2J9YA 2Y7EA 1FWSA 4UTWA 2VFEA 1XCFA 2PC4A 2B7QA 1VCGA 3SIZA 3OBKA 5LSMA 3W7EA 3W7IA 3FEMA 5K9CA 3NVTA 1KV8A 3MBFA 1RPXA 4NT0A 3E49A 1LBFA 2YDAA 1A5SA 1K3UA 5F4WA 4S2CA 1PE1A 3UY8A 1ZCOA 4O10A 4KFOA 4Z1DA 1YXYA 1QOPA 2QCEA 5F2IA 4ORIA 3TNOA 1LOLA 3LTPA 5C54A 2Q3OA 3ANYA 3NZRA 1H63A 4O28A 2QCFA 4QISA 1FWTA 4PH6A 1LOSA 4S2BA 5AHFA 2YPIA 4BI7A 4NQ1A 1VLWA 3I7RA 3I68A 4UTWC 5LNSA 1EPXA 2QCHA 2ZFAA 3W1UA 1PL9A 3UWQA 3FJLA 1ME8A 1LRTA 3N73A 4NZFA 2ZZ1A 3TK7A 4XWUA 3F4WA 3GAYA 2DORA 4I7UA 4JYEA 4QIUA 3G0SA 4JIPA 4O1DA 5K7JA 1FWRA 4JS3A 1XI3A 1W3IA 1VJIA 2XFWA 5CSSA 1OVDA 4YCPA 3P61A 2C15A 1DL3A 5C5YA 1Z48A 3QFEA 4Z1CA 4PL2A 5E1QA 1W3NA 3W1NA 5DCEA 3MYPA 2TMDA 1HL2A 1MEHA 3LCXA 3QF0A 2ZA2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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