2J9ZA

Tryptophan synthase t110 mutant complex
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
267
structure length
251
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLAIIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Salmonella typhimurium
publication title Betaq114N and Betat110V Mutations Reveal a Critically Important Role of the Substrate Alpha-Carboxylate Site in the Reaction Specificity of Tryptophan Synthase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE ALPHA CHAIN
total genus 95
structure length 251
sequence length 267
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2006-11-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2j9zA00
1QO2A 5I3HA 4O13A 1PCKA 1W37A 3EXTA 3FYPA 1G7VA 3BO9A 3W7RA 4ZQRA 3TDFA 4DPQA 1LDCA 4KFNA 3NM1A 3W1UA 5CGQA 4U28A 5BMXA 5FEPA 1TPC1 1Q6OA 1RQEA 5LNUA 3ABRA 4IX2A 3W6YA 2DZPA 1FQ0A 1IXOA 2OX1A 3B03A 4RZ4A 3W1RA 4BK9A 4JIQA 4WJEA 3DBPA 3HOJA 1AMKA 3LRLA 3CIXA 4P2VA 1XM3A 4UFKA 3LLDA 3CTLA 3NL3A 3OVRA 2DORA 3W7OA 5DCBA 4UTJA 1W5PA 2OZ0A 4OQVA 1F74A 4NNCA 2CLKA 3LHYA 4AF0A 4ZQMA 1Z42A 3NXFA 3LLFA 4Q33A 4FNPA 1XI3A 2EKCA 2RDWA 1K3UA 3W07A 5KZDA 3IV3A 1WDWA 4WX2A 1VR6A 2A7PA 1TCDA 2OMAA 4MPQA 1F6KA 2YYTA 4NNAA 2A85A 3BK0A 3LCFA 2ZYFA 4WUIA 2PRHA 5CZJA 3BW2A 3WJZA 1TTQA 1JQXA 3F4WA 3S5OA 4I7VA 3NQEA 3MYOA 4XQ6A 3TSDA 1ZALA 3N9RA 1W8SA 2ZRWA 5J5DA 5EPDA 1KM5A 2TMDA 5KINA 4AWUA 1OX4A 3LCGA 3ATYA 5DCDA 1QPOA 2WOQA 2CLIA 4BR1A 1XDLA 3O15A 3M44A 5GVJA 3RLVA 1W0MA 3DFSA 4JTIA 1KFBA 2R8WA 4QSHA 1FCBA 4WY0A 2FDSA 4FXSA 3W2JA 5FEWA 1YYAA 4AMAA 3MBDA 1KFLA 1EP1A 2VFHA 2WNQA 3THAA 5LHEA 1XCFA 1K7EA 3GNNA 4QIUA 5F4SA 1RR2A 2DZTA 3MUXA 3PS7A 3LCIA 3GKAA 1A5CA 1VYPX 4O17A 1CX9A 4JTFA 1DOSA 5FF3A 2ZA3A 1I2NA 3HG2A 2QCFA 2GOUA 3TA6A 1TTJA 3QPZA 1U83A 4ORIA 1RPXA 1ME8A 1F73A 4GRSA 3TX9A 4ADSA 3G1AA 1KLYA 3N73A 1SQ7A 3W7LA 5C55A 3DHFA 1XDMA 4FHAA 3NL5A 4PL1A 1NF7A 2J9YA 2ABAA 2WV8A 5D33A 5DBTA 3TU9A 4MOZA 4JDYA 1OYBA 3GYEA 4IWWA 5ABTA 4ZQCA 3KRUA 4O11A 4R33A 4JTJA 4LVGA 2E6FA 1YPIA 3A5VA 2BX7A 1PIIA 3BLEA 2QCLA 1WYIA 1KM1A 5LHFA 2G97A 2RKXA 4O0ZA 2E5BA 3W7MA 3I65A 5FESA 4O16A 3E0IA 1TV8A 4MY8A 2AAMA 4JGDA 1LRNA 2GUUA 3NQ6A 5HULA 3W7GA 4RX0A 4HKPA 3FS2A 4YMZA 5E1QA 2Z6IA 4ALDA 3QF0A 1HL2A 3STEA 1R47A 2GQAA 3LV5A 3GR7A 2J88A 1RVGA 3TUUA 2NXHA 4PCFA 1TTIA 4G1KA 4TR9A 1UASA 4H6KA 3W83A 3S5ZA 1SW3A 4LT9A 2QUUA 2E6DA 3MI3A 2WSYA 1GWJA 3L5LA 3CU2A 3BARA 1OF8A 1AW1A 4WXYA 3N2MA 1ML1A 3MI2A 3W2KA 3PSWA 4UTTC 1T96A 2EPHA 5DY2A 2QCEA 1KV8A 1YDOA 3NM3A 3UY7A 2ZCGA 4O12A 3W1NA 3PULA 4B5NA 4FNRA 4Q4KA 4UCGA 4NVTA 1DORA 3W7JA 5AFDA 2OT0A 3T44A 4OU1A 4IX0A 3P84A 4A22A 2ZDRA 4ZVJA 1TMHA 4R34A 2BXVA 1JRBA 1H1YA 1OK4A 1GVSA 1VHCA 4P61A 3O6CA 1SW7A 5DXXA 1HO4A 5IM51 3W7PA 4YCPA 1EB3A 3LOTA 4UFMA 5HR7A 2QF7A 3HB9A 1JRCA 1RV8A 3C61A 1VJIA 1PVNA 4X9SA 4UFJA 2X1SA 3TR2A 1GVFA 3CLMA 2CZ5A 3IIOA 3JRKA 3NQ7A 2I14A 2ZZ4A 5AHIA 4RKAA 4N9BA 1YDNA 3JR2A 4O4VA 4O19A 1NEYA 1IXPA 1XBXA 4MYXA 5C54A 4MVAA 1OFRA 4XBSA 3PVFA 1TPVA 3O63A 3MP3A 4FB7A 3S8HA 3L0NA 5F4XA 3WK2A 2Z2UA 1UCWA 4QJ1A 5D2XA 3RLUA 3VCRA 4UR8A 1KM6A 1FY6A 1TV5A 3NZRA 1NVMA 5L9FA 4K36A 4OWGA 3F1QA 1JUBA 3QQ0A 1Y0EA 1XUZA 2VOMA 1QO5A 3DU0A 3Q58A 4QNEA 4JTUA 2CWNA 2ZRYA 5E93A 5D03A 4O10A 2A7RA 5FF0A 4DF2A 5DELA 4N4QA 4AVFA 3B06A 3NOEA 2E5DA 4IMFA 3HO8A 3LCLA 4Z08A 3P8IA 5CKSA 4LTSA 3NGJA 4CQ8A 3F4NA 4M6VA 4HPXA 3HPSA 4XKYB 2X2GA 2VFDA 5D09A 1JR1A 1WV2A 1LBMA 3INPA 3A22A 3S9YA 1P5BA 3FKRA 3LXCA 1H7XA 4LW7A 3W74A 1PHWA 1HFBA 1TB3A 2W79A 4RJEA 4ML9A 3GDRA 5AHFA 4HNUA 3MWAA 3E02A 3TAKA 1KTCA 2I1OA 3UWUA 1F05A 5BW6A 1XUUA 5AN7A 4C1KA 1O60A 3UWQA 1GYLA 1XL9A 4TIMA 3IGSA 4JTHA 1OK6A 2QCDB 3ZFHA 4ORMA 1VRDA 1P0NA 2E6YA 3B05A 3W1AA 3U2OA 3B4UA 3W1TA 1BKSA 3UY8A 4JIPA 1I2RA 3TMQA 4K37A 2ATSA 4O28A 4I7UA 4DF0A 1SSDA 3O06A 3EWUA 4M6PA 2VEKA 1M6JA 4IMCA 1AK5A 1OFQA 4Z0JA 2QAPA 4GUJA 4MLRA 2GQ9A 4YL2A 4M7TA 5AHNA 2A1YA 3FA5A 3BG9A 4CCCA 3HG4A 3NL2A 1H51A 2X16A 1GTHA 3IGXA 5EYWA 5KITA 1W56A 3KX6A 3HJZA 5G4EA 1O94A 4FIRA 1UJPA 1I2OA 4O4WA 5D04C 3S6DA 3HG3A 3KFTA 5F2GA 1QPNA 3W2NA 3VNDA 4MJMA 3BW3A 3NL6A 1VCGA 3W76A 4AHPA 4E2DA 2QDGA 4JTTA 2H90A 3FJLA 5FEXA 1UBSA 1TO3A 3I7RA 4XTDA 3DZ1A 2VXNA 5D05A 5D02A 4UUIA 1K7FA 3N9SA 3G1VA 3R5EA 1YLVA 3GXNA 1H7WA 3LDVA 4KWVA 2J6XA 2ZZ3A 2GQ8A 1MSSA 1ZAJA 5HR6A 3S1WA 3VE9A 1QPQA 1SU5A 5EBUA 1KFCA 1KFJA 3M7WA 4Z1CA 1JULA 2EHHA 2HMCA 1QOPA 1A53A 4CQ9A 3A21A 3BVJA 3EX2A 2H8XA 1TTPA 1GPWA 3GLCA 1VS1A 3LTPA 3MHUA 2A5HA 3W1XA 3PY2A 3DI0A 3G8RA 3TMLA 2J9XA 3O16A 1SUXA 2B4GA 4LV4A 4UC5A 1WXJA 1KLZA 1IIGA 3QC3A 2EAWA 1WOBA 4JD4A 4LS2A 5C5YA 4IJBA 3UZJA 1J5TA 3DFTA 1GQNA 4HNTA 4CNNA 4MUZA 3ATZA 1C29A 1KA9F 4O18A 3VE7A 2JGYA 2FPVA 4GBUA 3L65A 2NXGA 2WJZA 3L9CA 2Y63A 5G1YA 4IOTA 2ZA1A 1TRIA 3FOKA 5LGZA 5LGXA 3CM4A 4UFIA 5DY3A 3AJXA 2CZDA 5D2TA 1TQJA 3GX9A 4KKXA 4R53A 6ALDA 4IPIA 2NUXA 4KFPA 2WNNA 4FNSA 1R2RA 3G22A 1X1OA 5F2MA 2BZNA 1EA0A 4JTEA 4NJHA 1L6YA 3NQ2A 2C18A 3W84A 1H62A 1J4EA 3I7SA 1FX6A 3PWAA 1F5ZA 2EGZA 3TAOA 5F2IA 3P7YA 3PAJA 3E96A 3OEXA 3EWBX 4YXGA 1Z44A 3TH6A 3RK8A 3M6YA 2ZZ2A 5BRBA 3G3DA 2BWGA 1OX6A 3GVGA 3EWZA 5IBXC 2YW4A 1DVJA 1F2JA 1EUAA 4LNYA 4E2BA 3W70A 5AHLA 1HO1A 3BG3A 1OHLA 4Y8FA 3SGZA 3PF3A 1FWNA 1SZEA 3NZ1A 1OFBA 2BTMA 2V81A 2X30A 4DQWA 1OYAA 1I2QA 2J27A 1ICPA 2NX3A 3QZEA 4UTWC 4XTIA 3RMJA 4RK8A 4DXVA 5C6MA 3NPWA 4MLJA 3DKJA 3UWWA 2NV1A 2DZSA 3H54A 5I3FA 3TFXA 3EWYA 4WD0A 3LB0A 1LYXA 4UNKA 5H91A 3CIWA 1THFD 4NU7A 3PBWA 3NEVA 5FI8A 1TV7A 2Y6ZA 5K7JA 3CC1A 3RF9A 4MY1A 4AHOA 1GT8A 3HPXA 3S0CA 1OFEA 5K9DA 1O5XA 5HQEA 4EF9A 3MP5A 5CSSA 2C13A 1M7OA 3OBKA 1QDSA 3OIXA 2NXIA 1K03A 5I3KA 4LS0A 3WK0A 1GVQA 2ALDA 3S1UA 4DEFA 5LNWA 1ONRA 3G1XA 4O14A 3GNDA 1BEUA 1SPQA 3L66A 3C2FA 2Y89A 3S5NA 1TPFA 1EPXA 4AH7A 1VGAA 3FJ6A 1G4TA 2PCQA 5AB3A 1JCYA 5K4XA 1LBLA 3F03K 3SJ3A 4S1FA 4UTMA 2ZA2A 3DKLA 3GKFA 5K4ZA 1B57A 5BOOA 4JEQA 1LLWA 3CQ0A 3L67A 4LUJA 3SR7A 3ZR4A 3M5VA 3L2IA 1CI1A 3HGJA 3TROA 2J24A 4N02A 4XKYA 5LZLA 1H7RA 1H5YA 5CG7A 3L68A 1W54A 4GNJA 2AGKA 1TPUA 2JKAA 5T26A 2ZZ5A 4QAIA 3OHIA 4Z1BA 5G1TA 2PURA 3P74A 3B0VC 1R46A 1PCWA 3W2UA 3S5YA 4LVBA 4CNOA 4QNWA 3LCHA 4FO4A 3TC7A 4RV8A 1EIXA 2ZTKA 1OABA 4O52A 3L5MA 2ZTJA 3YPIA 3DI1A 3R12A 3LHTA 1A5AA 1N7KA 2FPYA 3T40A 4LUIA 4GXMA 4DO5A 2QEZA 2FFCA 1VQTA 5HUOA 2QCDA 1WQ5A 4QISA 1OFPA 3LERA 1QFEA 3PUEA 3QSRA 4O15A 2A0NA 1TPEA 3TCEA 2A6LA 3TV8A 2A6NA 1JQVA 5L6UA 3C2EA 4CCDA 2Y7FA 2FB3A 4JYDA 5DBUA 3WJWA 2E6AA 3TSMA 4HPJA 1SO3A 5FEZA 1L6WA 2V9DA 3M43A 4BWLA 3LHVA 5AHEA 3Q2DA 3W7HA 1G7UA 3G1DA 3NO5A 2VEIA 3KAOA 2CLOA 3TJXA 3P82A 2I9EA 4ZQNA 4EOUA 1Q6RA 2XN0A 3BPWA 4OHQA 1GEQA 2W6RA 1X8FA 3KVLA 5D2YA 1EX5A 3P81A 4RXFA 1D3GA 3FEMA 3UPWA 3GK0A 4GC4A 1XBVA 1OFOA 3TJLA 4BI7A 1SFJA 3LHZA 2V30A 3MO7A 4LVAA 4S2CA 2ZRUA 1FCVA 3PSVA 4KWWA 1C9DA 3A5FA 5LNVA 1DL3A 1K8XA 3GXPA 2BSLA 2VFFA 1XC4A 3VFLA 3TXVA 4EF8A 2QCGA 1YADA 2CLMA 3L5AA 5F1VA 3V75A 4IMDA 5I3GA 3UNDA 4LC6A 4POCA 4UMCA 1YTDA 4RLIA 3M16A 3C56A 4IXHA 4S2BA 3HGSA 5G2IA 3OA3A 1EEPA 3E49A 2G96A 2R14A 3MI6A 3FFSA 3OG3A 5KTLA 4IMEA 3TC6A 2FQIA 3L21A 3TE9A 1SSGA 2E09A 1O95A 2QKFA 4JX5A 4MYAA 1GVRA 5AC8A 1DJQA 3W1LA 2WNZA 1R2SA 3W7IA 5F4WA 1L2UA 3MBFA 4FX7A 1ALDA 4MFEA 1MXSA 4J9JA 3CEUA 1B4KA 2QJGA 2CZFA 3W7DA 4N9DA 3QW4B 1LZOA 3W73A 5HWNA 1YXCA 3NQGA 5I3JA 2DJLA 1YPFA 4UTUA 4RZ6A 4GUHA 4M5PA 1KV5A 3V1PA 4HNVA 4PFMA 5J5RA 4E38A 4OE7A 1G4EA 4MZ8A 3MYPA 2Q3OA 5IBXA 4WZHA 5C2XA 4NZFA 3DAQA 2KZHA 2DZUA 3QM3A 4MKNA 3PG9A 4A29A 2XN1A 1W5OA 3QQ1A 4BFAA 1TPWA 2QCCA 4NQ1A 3W3OA 4UTWA 3S42A 3NPVA 3O6YX 4PC8A 4JX4A 4FF7A 3HPZA 2J9ZA 3QH2A 3BLFA 2JKEA 3GDMA 3NAVA 2DZVA 2C14A 2V82A 5LNRA 2DU2A 2FJKA 2YCEA 1ME7A 3NPUA 2B7PA 3PR2A 4UNLA 4KFOA 2ZRXA 1I2PA 2Y7GA 4EVZA 3PC0A 1H60A 5CPLA 1T99A 1TYGA 2X1UA 5D2VA 1MO0A 4AXKA 3STGA 4JXCA 2F7FA 1GG0A 4Z1AA 1M5WA 1FDYA 3G0SA 4JS3A 3W86A 2YYUA 1ICQA 1OVDA 3VI2A 1ZENA 3IIVA 4FX6M 2GPTA 4K7VA 3P5YA 2E68A 2YZRA 4OV4A 4A3UA 3UXAA 3HMJG 4OBTA 1Q3NA 5K9XA 1B3OA 1LTDA 1X6UA 2WKJA 1VH7A 2TYSA 2YFNA 3ELFA 2C1HA 1KFEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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