2JACA

Glutaredoxin grx1p c30s mutant from yeast
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
b'MVSQETIKHVKDLIAENEIFVASKTYCPYSHAALNTLFEKLKVPRSKVLVLQLNDMKEGADIQAALYEINGQRTVPNIYINGKHIGGNDDLQELRETGELEELLEPIL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of Glutaredoxin Grx1P C30S Mutant from Yeast.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAREDOXIN-1
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Electron transport
total genus 39
structure length 108
sequence length 108
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-11-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2jacA00
4NHZA 1A2LA 2B6MA 1YQ1A 3EWLA 2L5LA 1V58A 2H6ZA 2K6VA 2GT6A 5J3RA 1AQVA 1OVNA 5JWRB 5IQYA 2MYGA 4PURA 1GTAA 3H1NA 4EDZA 3PINA 3FZ5A 1X9SB 2CT6A 3RDWA 1MDKA 2LRNA 5AIXA 2AAWA 4N10A 4XS4B 4YQMA 3DYRA 2DJJA 3A2XA 19GSA 2LJRA 4EC0A 3UARA 1UN2A 5JWOB 1U87A 1GL8A 3GSTA 3N5OA 3WGXA 3FZAA 5ECIB 4TR3A 3IA1A 1NHOA 1YF1A 2VLTA 5D9XA 3TKSE 1H4OA 2JADA 3BJ5A 3W8JA 2ON7A 2O8VB 4ECBA 4ILFA 3Q6OA 4JBBA 4IBPA 2PGTA 2VIMA 2HYXA 3FYGA 1DE1A 3D21A 4WR5A 3VURA 1G6YA 4D73A 3F6FA 9GSSA 5D93A 3F4SA 3VWVA 2H0GA 2J9HA 1PMTA 2DJ0A 2H19A 1OC8A 2GSRA 1PD21 1IYIA 5B7CA 1K0CA 3IAS2 3UVHA 2P0GA 1B8XA 3DMLA 5IMVA 5IOWA 1PGTA 1TK8B 5D73A 1TKDB 3GL5A 5J9CA 3EMPA 5IMCA 3F3RA 1FG4A 4O92A 2K8SA 3D4MA 2N5AA 4L8EA 3PGTA 2CX3A 4ISDA 4EDYA 1G6WA 2H76A 4X0XA 5G1LA 1F3BA 2LRTA 3RHCA 2MBSA 2E0QA 4HU7A 2CX4A 3RAZA 1RK4A 3CTFA 1DSBA 4ACSA 4RQXA 5IPHA 3E3EA 2B1LA 4LL4B 3GL3A 3H79A 1FAAA 3LGCA 2IWTA 2H71A 2FGXA 1YEXA 4PX1A 2H0HA 3RHBA 4HZ4A 1GULA 1O8WA 1GH2A 4IJ3A 1GSFA 2HLSA 5D8IA 1THXA 5IMAA 3FR9A 5HR2A 3H8QA 1TDIA 2YNXA 5A4UA 4P3YB 3LEFA 3QDNA 3IOSA 4ZB6A 4KX4A 2V1MA 4IQAA 5E59A 2RUEA 1ERTA 4DEJA 3ZVJA 3J7Yb 2G2QA 3ME8A 1ZZYA 1JFUA 4YAPA 3MSZA 3IHQA 4WF4A 1K0NA 1TU7A 4ID0A 2IIYA 3IE3A 1M2BA 5DDLA 2A2SA 3APQA 2YPMA 3JCML 1T3BA 1TRUA 3G7IA 1V2AA 3LJRA 3KMNA 4DSRA 3P2AA 3IK9A 4Z7XA 4IKHA 4HZ2A 2IMEA 4OD7A 1PX6A 3MAKA 1K3LA 2PBJA 2CZ2A 2RLIA 3GHAA 4MJAA 1OE7A 1VF2A 4ZL8A 2LV3A 2PERA 3H93A 4PNFA 4K0GA 3GRXA 4TXOA 1C72A 3UMAA 1TK5B 4POKA 5GSTA 2E2MA 3UIWA 4TVEA 2IL3A 1RW1A 5JWQB 1YEPA 1TW9A 1WMJA 5ECOB 2X8HA 1FVKA 3CSJA 1SU9A 2DBCA 2JZRA 4KUNA 2NDOA 5IPGA 3WYWA 3L9UA 1PN9A 3QD9A 1OC9B 1XVQA 2A4VA 4ZB9A 3ZFLA 3GUSA 2O89A 3M9KA 1ILOA 2OBKA 4LA1A 2FHEA 17GSA 5L71A 3BBYA 1O81A 5DCHA 3UJ1A 1KTEA 2H73A 4N30A 3SWLA 2NVLA 3E0UA 2YZHA 1GP1A 4KNDA 2VL3A 2OA7A 2OE1A 3HY2A 3UEMA 2HSHA 2KP1A 4MP4A 3EU4A 5DBQA 1QXHA 1PL2A 4J57E 2TIRA 4NWYA 1JLWA 2YJ7A 3RPPA 5CYYA 3FR3A 3TB2A 1S3CA 2AUVA 1N2AA 5JCGA 1ST9A 1T4YA 4D73B 5ELAA 5D9WA 2YWIA 4XS6A 5ABRA 1Z7RA 2MMZA 2H75A 5G2ZA 3G7JA 4GQCA 1V9WA 4FH8A 4HQZA 2FWGA 4G19A 4L0WA 3TRXA 1TXXA 3ME7A 1K3OA 5JCUA 2VCXA 1JLVA 3BOAA 3UAPA 3MWHA 4MF7A 1ABAA 3MDKA 2LJAA 2WCIA 2GZZA 1XZOA 2B3SA 2LQOA 2V2GA 3FEUA 4BL7A 4AF2A 1PX7A 4MABA 3QAVA 4JU5A 4K7IA 4PGTA 1R5PA 1GUHA 3ISOA 2O87A 4X1UA 2YOIA 1ERWA 2AYTA 2HRFA 5H5QA 3HCZA 2ZNMA 3DIEA 1TRSA 2EC4A 2YV9A 4ML1A 2HXKA 2TRCP 4XRAA 2OE0A 5A5KA 1XW6A 2R3XA 3DRNA 1SKRB 4J2FA 1WIKA 2X99A 1PA3A 3GH9A 1EOHA 5G30A 3KP8A 2K8VA 2BMXA 2X8GA 5GZZB 1M2DA 2LNTA 3FRCA 3FZ9A 1R4WA 4JR6A 4GTUA 3WGEA 1GLPA 1MD4A 3TKSA 1XWAA 3UBLA 3HD5A 4OCEA 1UA5A 4YAVA 3GA4A 3F0IA 2L59A 1XWKA 4IQ1A 4EF0A 5H5SA 5IMFA 4CDOA 3KD0A 3ERGA 1M0UA 1UC7A 2YP6A 3G7YA 4KDUA 2FUG2 1DBYA 14GSA 4O32A 4MH3A 2EIOA 4MLYA 2EIRA 1ERVA 5LCZA 3I43A 3VPQA 4CW9A 4V1Ag 3FZ4A 2PUKC 1V98A 2H1AA 4DSQA 1CQHA 5B8BA 1VF3A 5DJLA 2CAIA 2GSTA 2RIIA 2VD0A 1EGOA 1O6JA 3QFBC 3C8EA 1ON4A 4BWQA 3Q19A 1PKZA 1TJDA 2CZ3A 2QC7A 3HJMA 1MDJA 4G9HA 4TXOB 1HYUA 1ZL9A 2HRNA 2YWOA 1ZYQB 3M1GA 4RQRA 1X5EA 6GSUA 1F3AA 3WD6A 2HE3A 4EO3A 1VF4A 4HEA2 2KUCA 1WP0A 4TKYA 1JZWA 3VK9A 1U6TA 2HZEA 4TOPA 1SK2A 1XBSA 1XOAA 2H1BA 5D9VA 2FWFA 1THOA 2M72A 3PH9A 2C80A 3GKXA 1YZXA 2DMMA 5COHA 2YWNA 5F05A 4OMVA 4HJ2A 4ZB8A 3ZIVA 4FYUA 1X5CA 5G5FA 3EC3A 5ECMB 4OO5A 5FWGA 4OWYA 1XOBA 3S9FA 2IMFA 2VCVA 2LKUA 1Y6EA 1GLQA 2XHFA 5CREA 1Q98A 5ECKB 5DJMA 1VRSD 5HR0A 5CRGA 3KCMA 3CSIA 3CMIA 4PQ1A 3RBTA 3GN3A 3TOTA 1A2JA 3F9UA 1YKCA 2ALBA 1M9BA 3ZRDA 2H8LA 4E8HA 4I8BA 4KSMA 4BVYA 5DQYA 2FWEA 3BCKA 3TRPA 1UVZA 3PR8A 5D9TA 2YN1A 1HNCA 2QKEA 4ECIA 2GZYA 5CO3A 4NMUA 1OYJA 1MD3A 2I1UA 1K0BA 2GGTA 2IMKA 2L6CA 4XTSA 3OR5A 5E4WA 7GSSA 3QAWA 2H66A 2VAFA 4ZBDA 1GWCA 3UBKA 1BQ7A 1M7TA 1TU8A 2VCZA 2H01A 3A2WA 5HFGA 1QQ2A 5F0GA 4V2MA 1BAYA 1SENA 3CRUA 5G5EA 5JCWA 3ZL5A 2BJXA 1HQOA 1PSQA 4HJMA 1FHEA 3TOUA 5LNKe 1XWGA 1SL2B 2V6KA 1K3YA 4JZQA 3TKSC 1SL0B 4O7HA 3Q18A 2P5QA 4IJIA 4F82A 2YV7A 2G0FA 1OKTA 4IW9A 1YDKA 2H6XA 1AQWA 1GTIA 4MZWA 3IR4A 5CRWA 4BVXA 4RI7A 2GSSA 2JU5A 4PUAA 4YH2A 2JACA 2MBTA 2B7JA 3UVTA 1GUMA 2V32A 2GQMA 1SK1A 5ECPB 3I69A 2GDRA 2CVKA 1KEBA 3M8NA 4V2LA 3HDCA 5HFIA 3ZLPA 5ENUA 3LQ7A 4F2IA 5J4UA 4QL9A 3M0FA 4L5OA 2PVOC 3HHVA 4ZIJA 2AB6A 1Z9HA 3FY7A 3IAM2 2R4VA 3TGZA 4KE3A 1XCCA 3VWWA 1CQGA 2NBSA 1QK8A 4MH2A 2LSTA 3P8WA 2OJLA 2L4CA 12GSA 1GTBA 1EZKA 2O85A 1Z3EA 3DXBA 4H86A 2WDUA 3ZVJD 1PRXA 2R6KA 1EWXA 4NV5A 1TOFA 4I2TA 2V41A 3EMXA 1H75A 2DIZA 3G9BA 3AY8A 4IN0A 1RQMA 3GURA 4WKWA 4LMVA 3D0ZA 3TUEA 2FLSA 3C71A 1A24A 3C1SA 2VOCA 4I97A 4IHUA 4V1Ap 2AV4A 5G31A 2XC2A 2NTOA 1S3AA 2IFQA 3VI5A 2F51A 3D6IA 4MF6A 2OADA 2OACA 4NAXA 2OKAA 4AJ8A 3DWVA 3IDVA 5HFKA 3EURA 4BPYA 4EUYA 2KOKA 2C4JA 5GSSA 1I5GA 2HZEB 1A0RP 4FYCA 2TRXA 1X9MB 3CTGA 1E6BA 4MPFA 3A5WA 4ML6A 6GSWA 4K9ZA 2WRTA 3R2QA 4HQSA 5INYA 3VWUA 5ECQB 4WBRD 2L4QA 3ZITA 2HNLA 5J41A 1YF0A 2YJHA 1ERUA 4KAEA 1GSEA 3FHKA 2WZ9A 4WBJA 2C3NA 5KEJA 3MNGA 2CVDA 3ZZXA 5IMZA 3N9JA 2AHEA 4GSTA 3LXZA 2OBIA 5CAXA 4Q5QA 3GV1A 3HJPA 2I81A 1Q4JA 4IELA 1M99A 4GWRA 4MCUA 2GQKA 1SKWB 2GVPA 2ZUPA 18GSA 1AUCA 4MA9A 4L5LA 3RPNA 1SJIA 3APOA 4AJ7A 4MZBA 4TW5A 2VM1A 2FY6A 1SD9A 2JSYA 1XW9A 5A4WA 2Z9SA 3K8NA 2P5RA 3ZFBA 1BYEA 2J23A 4GQFA 4XS1A 2KHPA 1VGLA 2YWMA 5CNWA 1WJKA 3LG6A 1ZCPA 3HZ8A 2LS5A 3NIVA 3D4TA 4AJ6A 4F03A 3KEBA 3NOFA 4AGSA 1J0FA 4IVFA 2DJKA 4EVMA 2PU9C 1EV4A 3P7XA 1AAZA 4MPGA 3V1WA 4G2EA 4I6XA 1BEDA 5IMDA 2F3MA 1QUWA 5HR3A 2R2JA 3VPTA 4TRXA 3CBUA 1SJZA 2PMTA 1TRWA 2LTKA 5EVOA 1W89A 1FW1A 1X0RA 4GRFA 3DD3A 2FD3A 3TJGA 3DKSA 4POBA 2FCHA 3US3A 3KIJA 2GS3A 1N8JA 4F9ZA 2R37A 4O5RA 5D96A 1U3IA 3VLNA 5J5NA 1A8LA 2CQ9A 5B8AA 5GAPD 3F4RA 3TDGA 4OFMA 1G7OA 2JZTA 4XHMA 4TR1A 3HXSA 5F07A 4EXJA 1XVWA 2OE3A 6GSTA 4PXOA 5F06A 2GT5A 2N5BA 1R26A 1IYHA 1I9DA 2PPTA 3KTBA 4KH7A 1A8YA 3GKNA 3HVXA 2P31A 5B6NA 3W6GA 1AIUA 3ZMKA 11GSA 3TJFA 3EU3A 4FYBA 2IMIA 4I2UA 2FNOA 1JZOA 4F0BA 2KP2A 1FB0A 2E7PA 2L5OA 2C0FA 6GSSA 4K0NA 4MJBA 4Q5NA 2A2RA 1O85A 3VWXA 3HKRA 3VFIA 5EPFA 16GSA 3CRTA 3WT2A 1EEJA 3TJKA 4GXZA 1NHYA 2VCTA 1YY7A 1GSUA 3C73A 1Z7PA 4LMWA 20GSA 5C00A 3W8SA 3L0HA 1KNGA 2MMAA 3KM6A 3QMXA 4IP1A 1WE0A 13GSA 2WULA 4ZL7A 5ECHB 3HYPA 1NM3A 4TR0A 3LXTA 2MMNA 2D2ZA 2H0IA 3A2VA 3WT1A 4KGIA 1A0FA 3F63A 1U88A 2VLVA 1Z5YE 4PUFC 2HZFA 2I9HA 2E2GA 3LYPA 1QGVA 3F8UA 2WS2A 4OO4A 4QL7A 4WR4A 3FK8A 1ML6A 4Q5FA 3HVSA 2IFQB 5C04A 3L78A 3CYNA 3GTUA 3FR6A 4MMMA 5KN1A 3Q74A 3DVXA 5B6MA 1LU4A 1FOVA 3GIXA 3ZMLA 5G1KA 1XIYA 3C7MA 3EINA 5ECSA 4GSSA 1JZRA 1GTUA 4ZBAA 2JZSA 1MDIA 1SYXA 4ECJA 2H74A 2HFDA 1NW2A 2DC5A 2WJUA 4PQHA 1OE8A 1LBKA 1ZYEA 4CHSA 1WWJA 3IRAA 4MK3A 1B9YC 1T00A 4WXTA 2L6DA 5J9BA 1HNBA 1E2YA 3BD2A 3VI7A 4NHWA 4XRDA 4HDEA 2C3TA 2RM5A 2H1GA 1F6MC 2ON5A 1QFNA 4HU9A 3L9VA 4HS1A 4K7NA 4GSNA 3D5JA 2VL2A 1VF1A 4PNGA 1J9BA 4MZCA 2H6YA 4WF5A 4KB3A 5KN3A 1JZDA 1K0DA 4FIWA 1SJ6A 1X9WB 2B5XA 2JSZA 4F0CA 1WPIA 3NZNA 2VM2A 5ECLB 1O8XA 1GSYA 3GSSA 1LJRA 5A4VA 4HUAA 2PN8A 2C8UA 5EL8A 2VL9A 3M3MA 4NXIA 4KCEA 4BA7A 2EIQA 3U5RE 1O73A 4KA0A 3KJYA 3GFKA 3FW2A 1NSWA 1EGRA 3ZYWA 4TR4A 1T4ZA 4EL1A 2XPDA 8GSSA 3TCOA 3QOUA 1G7EA 4POLA 3KGKA 4K6XA 2AJQB 2CAQA 4IS0A 1EV9A 22GSA 3ZTLA 2FWHA 2LQQA 1T7PB 2X64A 4PQIA 4TR1B 1EEMA 3KH7A 5FT3A 2O7KA 5DALA 4HI7A 1HNAA 1AQXA 4E8EA 4KSOA 1J08A 4NPBA 1F9MA 5H5RA 4K2DA 2HT9A 1WOUA 3TJJA 3I9V2 2VCQA 3HA9A 5DAKA 5IIZA 5CRDA 2F8AA 1GSSA 4LL1B 1TI3A 3O6TA 4X43A 4JRRA 2C1YA 2WB9A 3TKQA 2LUSA 3DGQA 3QFAC 2K18A 3ZIJA 2B5YA 3CSHA 2X8CA 4JR4A 4L0UA 4DSSA 2GSQA 3LSZA 2VLUA 3U6VA 3ZREA 3TKRA 4YQVA 1B4PA 1BJXA 6GSXA 4XCSA 2XBIA 2FA4A 3TRQA 1M2AA 1OAZA 1MEKA 4K7OA 4QQ7A 2ZCTA 1OKDA 1V40A 1B48A 3IV4A 3GNJA 4I5QA 2PWJA 4ZXGA 3LYKA 4TN8A 1S3DA 1K0AA 5IO2A 4KW6A 1YKAA 2H70A 6GSYA 1KBNA 1TK0B 4LLRA 2NPBA 2XPEA 1URMA 2CA8A 5CRHA 1PQNA 2JL4A 2H72A 5IOXA 1BX9A 3D22A 1B4QA 5AN1A 4GCIA 3EYTA 4KDXA 3GTUB 4GLTA 2BTOT 3UL3A 4RI6A 2IPAA 4WEYA 3QR6A 2DMLA 4K1FA 1XW5A 1XWCA 1QMVA 4ZBBA 1V57A 2DJ3A 1A23A 3IBHA 2F8FA 2I3YA 5ELGA 1XWBA 2VL2C 5ID2A 2IN3A 4Q5RA 1OC3A 5ECRB 2KLXA 2H1DA 4N0VA 2ES7A 2VO4A 4ZILA 2C0EA 4N0ZA 2LRCA 5HQPA 1T1VA 2RUFA 1PL1A 2DJ2A 4IGJA 2VCWA 4OFNA 1USBA 5IM9A 1G0TA 1FO5A 3DVWA 1SYRA 3GKMA 3GYKA 2I4AA 4XS4A 1B9XC 2M80A 1YJ6A 5KN2A 3TKPA 3KXOA 3ERFA 4FO5A 2YCDA 3QAGA 1ACVA 1XFLA 3GKKA 2PVQA 3IPZA 3GX8A 1JHBA 5CP1A 5AIVA 2IJYA 2L57A 1GSQA 1SKSB 2B1KA 2XBQA 2MZCA 3KMOA 4BWSA 3LORA 3APSA 1AXDA 1R5AA 1FB6A 5EY6A 2B7KA 4XIHA 3GH6A 2LJKA 4OFTA 2WGRA 3BCIA 1Z6NA 4N11A 2C0DA 4ECCA 1AC1A 4NV2A 1PKWA 1K0MA 3CXGA 3WGDA 2QSIA 2HI7A 3FKFA 4MF5A 5LD0A 2RM6A 3F6DA 2CVBA 10GSA 4JEDA 5IO0A 2LEGA 1GSDA 3TJBA 5FHIA 5AISA 1T8EB 1GUKA 1SD8A 3HVVA 5HR1A 4G10A 5DALB 1SL1B 4OCFA 2DJ1A 3QPMA 1GNEA 2V6OA 4V2NA 1R7HA 1XPVA 3GX0A 4KDYA 2GLRA 5GAND 2IMDA 2DLXA 5DAKB 3F3QA 4K8MA 3A3TA 2CV4A 3KH9A 4EKZA 1X5DA 2GTUA 3J7Yk 3QCPA 3E9JB 5AGYA 3H4KA 1TP9A 3ED3A 1TRVA 1XXUA 3GMFA 3F4TA 3HZ4A 3HJOA 1SK0A 2FA8A 5ECNB 5KN0A 3O3TA 1Y25A 2WFCA 1U3AA 1EOGA 4GF0A 1Z6MA 3LFLA 4KCAA 2QGVA 1DE2A 2F9SA 4HOJA 2YANA 4MJEA 4DSSB 5DQSA 2MMOA 3SBCA 1WRYA 2H30A 2GZPA 4ZL9A 1GNWA 2M46A 1TTZA 3L4NA 3IC4A 4POMA 1EP8A 4MJCA 1BG5A 5DCGA 2K9FA 3DEXA 1M9AA 3IK7A 2HSYA 2C0GA 1DUGA 3O76A 1FVJA 2LNSA 4TXVA 1HD2A 1F37A 3KP9A 4MDCA 3M9JA 5DVBA 4IP6A 1MTCA 1TI1A 2GQLA 3EVIA 1AW9A 4J56E 4RUVA 4WETA 3UOMA 3I6AA 3L9SA 2N5FA 2VUPA 2B5EA 2DSAA 3C1RA 3ERWA 6GSVA 1ZGNA 4JE1A 3LWAA 4DVCA 1F2EA 3EE2A 1ZMAA 4ULXA 4EE0A 4YQUA 2YZUA 1ZOFA 1GRXA 1A2MA 3IXRA 2R5GA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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