2JBMA

Qprtase structure from human
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
289
structure length
289
Chain Sequence
MDAEGLALLLPPVTLAALVDSWLREDCPGLNYAALVSGAGPSQAALWAKSPGVLAGQPFFDAIFTQLNCQVSWFLPEGSKLVPVARVAEVRGPAHCLLLGERVALNTLARCSGIASAAAAAVEAARGAGWTGHVAGTRKTTPGFRLVEKYGLLVGGAASHRYDLGGLVMVKDNHVVAAGGVEKAVRAARQAADFALKVEVECSSLQEAVQAAEAGADLVLLDNFKPEELHPTATVLKAQFPSVAVEASGGITLDNLPQFCGPHIDVISMGMLTQAAPALDFSLKLFAKE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural and Kinetic Characterization of Quinolinate Phosphoribosyltransferase (Hqprtase) from Homo Sapiens.
pubmed doi rcsb
molecule keywords NICOTINATE-NUCLEOTIDE PYROPHOSPHORYLASE
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 93
structure length 289
sequence length 289
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2006-12-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2jbmA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 2jbmA01
4A29A 3MP5A 5K4XA 1VCVA 1WV2A 3W1AA 3O63A 3B0PA 3L0KA 2O7QA 1F6KA 4JY8A 3PBUA 3O8AA 4AH7A 5G1TA 1M7PA 4NZFA 4EIVA 5K7JA 5DN1A 2A2IA 4Z1AA 1XUUA 4WY0F 2ABAA 4S1FA 1TV8A 3BLEA 2QCNA 3UPWA 5AOUA 1DORA 4ADUA 1OX4A 3EX4A 3GZ3A 2VFHA 4YMZA 2YCEA 1FDYA 3I7QA 3NGJA 1SO5A 2YPIA 3WK1A 3WK2A 2ABBA 2FPYA 4JEQA 1TPUA 3W75A 5BOOA 5DELA 3BGJA 1Q6LA 4UMCA 3C6CA 3TV8A 2CWNA 4Z08A 3TK7A 4RR4A 1Z41A 2E5BA 3G24A 1SO6A 4KFNA 4UXDA 1TQJA 3W7NA 1M7OA 3EEGA 1K8XA 3C2OA 1YPFA 3FOKA 1JUKA 2A6LA 2VEKA 1X8FA 3B4UA 3P80A 1O5XA 1TRDA 2WSYA 2FPVA 3P82A 3TAKA 5D04C 1WXJA 3S9YA 2YSWA 1WDWA 2GVLA 4IXHA 3A24A 3UWWA 1KV8A 4R53A 2C0AA 1KFCA 1V7YA 3BW2A 2R94A 2WV8A 1LLWA 4TU1A 5K2ZA 2DORA 1VYSX 3LLDA 1PV8A 2NV2A 1ICSA 5TIMA 2BTMA 3P5YA 5A8GA 5HWMA 2A0NA 5KINA 1VCFA 1ZFJA 2Z0IA 3W83A 3I68A 1DV7A 1H7WA 2C3ZA 5DCEA 2ISWA 1PHQA 4X2RA 4O28A 1R30A 5FEZA 3LHVA 4DF2A 4XTDA 3DENA 3W7GA 2BXVA 4O1DA 2E6FA 3GB6A 3LM7A 5G2HA 3HGJA 4OGZA 1QO2A 1KBIA 1XM3A 2RDWA 3PSWA 2QDHA 4WJEA 1GVSA 3OG3A 2GOUA 4BI5A 1H5YA 2WJZA 1LRNA 3IVSA 2ISVA 1XDMA 3NL6A 1OVDA 4NJGA 3BK0A 3M9YA 4JTEA 4ORMA 3UY8A 3HBLA 4Y90A 5HWNA 2A21A 4IMDA 5AN7A 1JCNA 2XN2A 4NXSA 3BLFA 3PUDA 4JTIA 4UR7A 4M19A 1IXQA 2E6DA 2B7PA 4EVZA 1UCWA 3A23A 4POCA 3QPYA 4YLWA 4I9AA 1N8FA 4RKAA 2WO5A 3NQCA 2ZZ4A 1OX5A 5I3IA 4AHPA 3HF3A 3GX9A 4UMAA 4OHQA 3TFCA 4JICA 3L5MA 1SW0A 3CHVA 4PL1A 4JTKA 3W7CA 3GLCA 1BEUA 5LHFA 3PF3A 3N3MA 4DXVA 4O16A 1TREA 3FS2A 3N14A 5D2WA 1T99A 1S5WA 2FLIA 4NUWA 4YXGA 4ALDA 5CPNA 3CQ0A 3E12A 1X1ZA 3A22A 3TSDA 1XUZA 5BW6A 3RLUA 4CNNA 4UFHA 3UWUA 3PB2A 2VC6A 1W3NA 4X22A 1WAUA 3TA6A 3HG4A 3M5VA 3FJ6A 2BZNA 3CLMA 1AK5A 1DKWA 3DHFA 1KA9F 1I4NA 2QCDB 4Z1BA 1TTJA 3W22A 1JRCA 3OBKA 2WPBA 1ZHAA 3DHDA 3AJXA 3O15A 4KWWA 5EYWA 1WOBA 3QF0A 3R12A 3S5OA 3SSJA 4Q4KA 3R89A 3IIPA 4WY0B 2ZZ1A 1TPEA 2XN1A 3IIOA 3EKLA 1E51A 4MFDA 2V0TA 2ZRVA 4XKYB 2QAPA 2CZEA 4O10A 2E77A 4AF0B 4P61A 3W1QA 4UTMA 4BI6A 4K37A 5F2MA 1EP1A 3MWAA 4PL2A 3CWNA 3NQ6A 3DFTA 4BI7A 1NEYA 3UYCA 5KZDA 4O17A 3W88A 4GUJA 2EPHA 3NQDA 1GG1A 4IQLA 3NVTA 4RJEA 1QPNA 3TAOA 4BR1A 1KW1A 3OHIA 5DXYA 4DO4A 4QM1A 2RDUA 1TV5A 3NZ1A 2W6RA 2YX0A 1FCUA 3NQVA 2Z6JA 5DLCA 5LGZA 1VR6A 2WNQA 5E0KA 3SIZA 4D2JA 1F6PA 1KM0A 3T4CA 4HPJA 3W7JA 4LOCA 2VEPA 5HMSA 1H63A 1SSGA 4DPPA 2VFEA 1VQTA 3CPRA 2QCHA 1YXCA 3EXRA 5F2LA 5LNVA 3EWYA 4UTTC 3LCGA 1AW1A 4IX0A 1KFBA 2I14A 3W73A 5FEXA 2FTPA 1L6SA 1GOXA 2NLIA 1TPVA 4O52A 1Z48A 2A7NA 5BNKA 1L6YA 5DY2A 3C2FA 1ME8A 3Q94A 2V2DA 1OK4A 3JS3A 2QDGA 2PRLA 2PURA 2GPTA 1N55A 5MHBA 1EP3A 4UMBA 4HHPA 5AC6A 3QW4B 5G5IA 4M6QA 3S8HA 1QR7A 3UZJA 1F2JA 1PCWA 4Y96A 1YLVA 1H50A 3M44A 1W56A 1QOPA 3FYOA 4UCGA 2CW6A 4UFLA 3UWVA 4MLRA 4K8EA 1SQ7A 1PL9A 1LBFA 4FXSA 3VFLA 3L9CA 1TJPA 3W2JA 1SO3A 2QKFA 4YL2A 2Z2UA 1IXNA 2VXNA 1OX4B 3P67A 3LXAA 4O1AA 3T78A 3G8RA 1IXOA 3MBFA 4PEKA 2Y61A 4M7SA 5C2XA 2YXGA 4JNMA 3SY5A 3PULA 2VEMA 3W1MA 3WJSA 3NL3A 3C0JA 3HMJG 4KFOA 3CWOX 2FIQA 2GVJA 2RKXA 4S2CA 2C6QA 5AC7A 5AB3A 1OK6A 1B4EA 4KFPA 4UTKA 3EX1A 3NQAA 3C8FA 3BG5A 1HO4A 4QISA 2C13A 1UASA 2YW4A 3LHZA 3LHTA 4LC6A 3PG9A 5AYZA 5C6MA 1VCGA 1O5KA 3V1PA 3W2KA 1DHPA 3G1FA 2RH9A 3HG2A 5LNUA 2CLMA 3OVPA 3LCHA 4CQ9A 1H61A 3GXPA 1J4EA 3G1AA 2NZLA 4DO5A 3S5ZA 4LNYA 1SSDA 2JKEA 1P1XA 3BO9A 3BLIA 5CZSA 3TMLA 5KITA 1NF7A 3KAOA 3FA5A 4EF9A 3RLVA 1VPXA 2X16A 5HWJA 4YCPA 4HSOA 3LTYA 4TX9A 3MBDA 1IXPA 4ZL1A 1ZENA 5F4SA 3L0GA 3S1WA 1X1OA 1W3TA 5F2GA 3I7RA 2ZDRA 4O19A 3NO5A 4K8HA 4LVDA 4JX5A 4LS1A 2A5HA 5G2IA 1I45A 4JDYA 4LY8A 3U8GA 3STGA 2AQWA 1H62A 4K38A 2GVGA 4QSHA 3QSRA 1YADA 3GNNA 2CZFA 1SW7A 3F03K 4TMBA 1AW5A 2BSLA 3NQ8A 5HULA 2ZZ7A 3UY7A 1SFLA 2BWGA 1ZAHA 3NR0A 1YDNA 5CZJA 1S5TA 1FXPA 4LUIA 1VGAA 3LBCA 5CZTA 1GVRA 3QH2A 2NX1A 2EF9A 5HR6A 1JR1A 3QQ1A 1WBHA 3EXTA 3G22A 2Y70A 3DAQA 1OJXA 2J88A 1OG0A 1EIXA 2DZTA 1G4TA 5E1QA 4LV9A 4LT9A 1IGSA 1P0NA 4JYDA 4P2VA 4G1KA 1W1ZA 3W9ZA 2ZA2A 3BPWA 1H7XA 1TIMA 4GRSA 5EY5A 5CSRA 3T55A 2ZBTA 3B06A 3EWXA 3S0CA 3M7WA 1W0MA 2YDAA 4BK9A 1MXSA 4XZ9A 3T7VA 3HGRA 1YTEA 3TXZA 1G69A 4O1CA 4Y9AA 1FX6A 5KZMA 4K7VA 1P4CA 1PVNA 3F4WA 3P5ZA 4UTLA 3TSBA 2AAMA 1W5QA 1ML1A 2ZFAA 4FNQA 4O54A 1VYRA 3NM1A 3TQKA 3NQMA 4DEFA 5AYXA 1AMKA 1FWSA 3DI1A 1K7EA 4IMGA 4HNUA 3VE9A 3H54A 3C2EA 1S3HA 1PIIA 1Z42A 4IJBA 3USBA 1H1ZA 3N2MA 6TIMA 4MYXA 2ZQ0A 3B05A 2J24A 2G96A 1ZAJA 1OX6A 1JQXA 1YXYA 5HUOA 2IQTA 1JCJA 3TC6A 3IVTA 1Q6QA 4CCCA 3UWYA 4UNLA 1OFAA 1FCQA 3QM3A 2ZRYA 3SW6A 4NQ1A 3T40A 1VLIA 1NF0A 3MW7A 5G1YA 3UNDA 1K8YA 1K3UA 4Y6GA 3W1LA 4BWLC 1SZEA 1SZFA 2B7QA 1TRIA 4FNTA 1H7OA 2NXHA 2TSYA 2Y85A 2X1RA 5K9XA 3FFSA 4X9SA 4UTWA 2AGKA 4EWND 1OFRA 1OF6A 1LDCA 1DBTA 3CU2A 3IEBA 3H55A 3PSVA 4LWWA 2A7RA 4FHAA 3LCFA 3V75A 2ZRUA 1SU5A 1BWKA 2OZ0A 4FNSA 4L4LA 5SWUA 3W74A 4ORIA 2A1YA 2P10A 1F05A 3S1XA 1TTQA 4M6PA 5IM51 3M47A 4AWTA 1R2RA 3W86A 3W1UA 2A6NA 4LV4A 4GUGA 3GDRA 4YCOA 4UTUA 5FF0A 2CLIA 4GFSA 2GJNA 3M5ZA 3GKAA 5CKSA 3L0NA 2VELA 3AO0A 3LV5A 1GZGA 2HSAA 1QFEA 1DOSA 4ZQRA 3LHYA 3M1ZA 1H60A 2V81A 3KHJA 3P81A 3ABOA 4XTIA 1UB3A 1EA0A 1JULA 1OFOA 4EF8A 5F4XA 1MZHA 1EWEA 4H4IA 1KFJA 2Z1BA 3FJLA 4LVGA 2CZ5A 1DJQA 1FQ0A 2R91A 3PAJA 3MI6A 1SO4A 1S5VA 2GQAA 3K30A 2ZA3A 4E38A 3KRUA 5LNWA 5D32A 1AL8A 2NWRA 1D3GA 2QJIA 4O53A 3H53A 3UZ5A 4PH6A 4A21A 2YW3A 4NJKA 4NNCA 3C4UA 2BX7A 1Q6RA 3TC7A 2QAFA 3BVJA 3W7LA 3GAKA 2XFWA 3TJXA 4QITA 4JTSA 1VC4A 2WQPA 2X1TA 3R13A 1U83A 1TPDA 3DXIA 3PG8A 3TQVA 2V2CA 3MUXA 4JX4A 3S6DA 3W7IA 1QDSA 1JQVA 2E5CA 1OHLA 1JCMP 2QJHA 4A2SA 1DL3A 3W70A 1EPXA 1UBSA 1I2NA 2PRMA 2J9YA 4JTGA 2HMCA 3F1QA 2CLOA 4NXKA 3KOFA 3W07A 1TPB1 1ME7A 3W6YA 2GQ9A 3GKFA 2TYSA 1TPFA 3IGUA 3UD6A 1JCXA 3NA8A 3NL5A 3TDFA 4N9DA 4RLIA 3PBYA 3IIVA 5CZ0A 4GNJA 3W7QA 1MEIA 2BLEA 2Q8ZA 1G4EA 4DF0A 1F73A 3A9IA 1TMHA 4NJHA 4AWSA 4ZZ9A 2V8ZA 3EWZA 4O0KA 3W76A 3GXTA 4NX0A 4LTSA 1ZNNA 4R7JA 5H2ZA 4IMFA 3NZRA 3W3OA 2E1DA 3HQ1A 3IGXA 1GVFA 2RFGA 3B03A 3GVGA 3TROA 4MKNA 4BFAA 1TYGA 4PFMA 4FF7A 3TR2A 4QNWA 1YDVA 4LVBA 4MUZA 5CGQA 5I3GA 1R2TA 2DU2A 1BKSA 3HJZA 3I65A 3S42A 5IBXA 3MI2A 3BW4A 3QEZA 3HO8A 3R5EA 3LHWA 4PCFA 1W3IA 4NNBA 4HNTA 4AXKA 2V9DA 2OX1A 4C1LA 5KSWA 4JD4A 3W71A 5AHEA 3CIXA 1JRBA 1FWRA 3TW6A 2V5LA 4IX2A 4LS0A 4N2YA 1GYLA 4O18A 4R34A 4CQ8A 3L5LA 4OV9A 2GQ8A 1KM4A 2FPTA 2QCLA 4NVTA 5CPOA 5D38A 4Z0SA 5I3FA 1QPOA 3RFAA 4GE8A 3LCIA 1FWTA 5C54A 4N9CA 1GQNA 1V5XA 2NV1A 4MY1A 3W72A 2E6YA 4FNRA 1LM1A 2WSQA 3S1UA 2H3BA 2VOMA 4DQWA 2Q3RA 1AW2A 1C8VA 2JGQA 3LI0A 1QPQA 4UR8A 2NUWA 1OFQA 3QW3A 1G7VA 1JCLA 5HINA 1JVNA 3FYPA 4MJMA 4MPQA 3NAVA 3G1YA 4ML9A 5AHMA 5LZLA 2ZA1A 1W5NA 2NXIA 4C1KA 4RZ6A 3W7EA 3ELFA 3O6YX 4O13A 5L6UA 3W1NA 1KM3A 4RV8A 3CM4A 2TRSA 4ZQPA 1KTNA 2B7OA 3DGRA 3UWZA 2FJKA 1LLZA 3FKRA 4Z1CA 1W5PA 1XDLA 3UXAA 1TJRA 3O6CA 5BMWA 4FO4A 2KZHA 3E02A 1OFDA 2YYTA 4IPIA 4UIOA 1WBJA 3QFEA 3W85A 3NYZA 1IIGA 4RZ5A 4DELA 4A2RA 5T26A 4I7WA 4I7UA 3NPXA 4B5NA 4LS2A 1ICQA 1FWWA 3C2RA 2C19A 1SZNA 4IOTA 1NFBA 4MYAA 3G1SA 4UFKA 4AVFA 3TU9A 1RQBA 4KKXA 4QQ3A 5TBOA 2C18A 2VENA 3QJAA 4UFMA 4UTWC 3CB8A 4QIUA 4HNVA 5G4EA 3O6DA 4EOUA 4ADSA 1O94A 1K02A 2QCCA 3VE7A 1OYAA 3OVRA 1W37A 4H6KA 1WA3A 1Q3NA 3CC1A 3LRLA 3LCXA 4RCXA 3EX3A 2G95A 1VHNA 4OQVA 5A5WA 1HL2A 2CLLA 2DJLA 2NUYA 3GR8A 2X2GA 5HQEA 2HS6A 1KV5A 4FNUA 3NPVA 4MZYA 2ATMA 3ZWSA 4MIMA 2Z6IA 2YFOA 3SGZA 3IV3A 3UQNA 4J9JA 2VEIA 1RD5A 3LOTA 4Q33A 3GNDA 4GUHA 3WFAA 1DQXA 1G7UA 5K4ZA 3QSTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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