The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
63
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structure length |
63
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Chain Sequence |
GSMAEEVVVVAKFDYVAQQEQELDIKKNERLWLLDDSKSWWRVRNSMNKTGFVPSNYVERKNS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Specificity determinants of a novel Nck interaction with the juxtamembrane domain of the epidermal growth factor receptor.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
Cytoplasmic protein NCK1
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| total genus |
7
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| structure length |
63
|
| sequence length |
63
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-06-29 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2HDA A; 1BU1 A; 4F17 A; 1KFZ A; 2DMO A; 1NYG A; 3KFV A; 1RI9 A; 4JZ3 A; 1VA7 A; 3PVQ A; 1OPL A; 5IH2 A; 2SEM A; 2YSQ A; 4E6R A; 3LH5 A; 1U06 A; 1WDX A; 4J9C A; 1HJD A; 1VYV A; 4Y92 A; 4J9E A; 2KBT A; 1LCK A; 3R6N A; 3VS3 A; 2DBK A; 1M30 A; 1IO6 A; 4J9F A; 1PKS A; 2KR3 A; 1AZE A; 2L3Q A; 3TSZ A; 1GFC A; 4JPB W; 4J9D A; 2NUZ A; 4JZ4 A; 2PNI A; 2AZV A; 2CUB A; 4DEX A; 1QWF A; 2KT8 A; 1H3H A; 3VS6 A; 1AD5 A; 1T3L A; 1WFW A; 1UGV A; 3EG1 A; 1UJ0 A; 4RTT A; 1KSW A; 1X6B A; 2YUO A; 1M3A A; 2IIM A; 5HCK A; 1Y57 A; 2ESW A; 2DX1 A; 3EHQ A; 1AWW A; 2RQU A; 2ABL A; 1H92 A; 4AFQ C; 3UA7 A; 1K4U S; 2G6F X; 2OJ2 A; 2KRN A; 3M0T A; 2CH4 A; 2RQR A; 1VYU A; 2YUP A; 2X3W D; 1WIE A; 1YWO A; 4AFS C; 1E6H A; 1PRL C; 1PNJ A; 2HEQ A; 4HVU A; 4F14 A; 2MOX A; 3M0U A; 2A37 A; 2DL3 A; 1AWJ A; 1ZSG A; 2A28 A; 2FG0 A; 2V1R A; 2AKL A; 2HSP A; 3O5Z A; 2L0A A; 2RMO A; 4OML A; 2E5K A; 1AZG B; 3SHW A; 5I22 A; 4QT7 A; 1U5S A; 1X43 A; 1GRI A; 1GFD A; 3ULR B; 4M4Z A; 2KXD A; 2VKN A; 2DE0 X; 1K0X A; 2EYY A; 3RNJ A; 3I9Q A; 4JJD A; 1ZUK A; 2CSI A; 1WXB A; 2JM9 A; 3VS0 A; 4HVW A; 3GBQ A; 1RLP C; 3NHN A; 1T3S A; 2K7A A; 1JXO A; 3IQL A; 2EYZ A; 4AG2 C; 1HD3 A; 2KYB A; 2RNA A; 1UG1 A; 1ZX6 A; 1UJY A; 4RTV A; 5FWB A; 2HBW A; 2EKH A; 1RLQ C; 2EVR A; 2CT4 A; 1T0H A; 2DL8 A; 2KRO A; 1X2K A; 1QKX A; 1K1Z A; 2ED1 A; 2YUN A; 3M0Q A; 3H0H A; 3FJ5 A; 2AKK A; 2DVJ A; 1TUD A; 5IXB A; 1YNZ A; 1BBZ A; 2D8H A; 2BZX A; 1W70 A; 1JU5 C; 2D1X A; 1PHT A; 2LNH B; 1SSH A; 2VVK A; 1M3C A; 4F16 A; 1UE9 A; 2FRY A; 2DJQ A; 4LUD A; 4RTX A; 4AFZ C; 4D8D A; 4RTZ A; 2KGT A; 2RF0 A; 2LCS A; 4Z8A A; 2EGC A; 2J7I A; 1G83 A; 1WXU A; 2MIO A; 1I0C A; 2FRW A; 2OI3 A; 1X2Q A; 1ZUY A; 2DL7 A; 2LJ3 A; 3PVL A; 4RUG A; 3VRZ A; 4A63 B; 4ESR A; 2ROL A; 2M0Y A; 2J6F A; 2JS2 A; 4IIM A; 1T0J A; 4ORZ A; 2EGE A; 2J6O A; 1FYN A; 2O9V A; 1CKA A; 3H0F A; 1MV3 A; 2DL5 A; 2J05 A; 1SRL A; 1YCS B; 1X69 A; 1ARK A; 2RPN A; 1CSK A; 4OMP A; 1UEC A; 3EGU A; 2JXB A; 1NEB A; 4LE9 A; 3REB B; 5FWC A; 2K79 A; 1YWP A; 1WYX A; 2HCK A; 2F2V A; 4WCI A; 5EC7 A; 2LQW A; 2CSQ A; 1EFN A; 1HSQ A; 2SRC A; 1XOV A; 3M0R A; 3QWX X; 4Z89 A; 2LMJ A; 4RTY A; 1RUW A; 2ROT A; 3ZL7 C; 1QCF A; 2FO0 A; 1PRM C; 1Z9Z A; 2LZ6 B; 2KYM A; 3I5S A; 2ED0 A; 3SEM A; 2A08 A; 4ZNX A; 1UTI A; 2FEI A; 2GTJ A; 2O2O A; 3REA B; 2H8H A; 3VS1 A; 2O9S A; 1ZLM A; 4LUE A; 1K76 A; 1UUE A; 2YT6 A; 2KXC A; 1B3Q A; 1A0N B; 1UHF A; 5FW9 A; 3VS5 A; 1AOJ A; 1OOT A; 2VWF A; 1GBR A; 3NPF A; 3I5R A; 1CKB A; 1TUC A; 1WI7 A; 1OV3 A; 2KRM A; 2EW3 A; 2X3X D; 1SHG A; 4X1V A; 1TG0 A; 1X6G A; 2EYW A; 2LJ1 A; 2W0Z A; 5IHN A; 3EHR A; 2DF6 A; 4EIK A; 2EPD A; 2M51 A; 1NG2 A; 1JEG A; 3TSW A; 1W1F A; 2F2W A; 1NLO C; 1M27 C; 1WLP B; 2EQI A; 2KRS A; 1SHF A; 3I35 A; 2FPF A; 2LQN A; 3VS2 A; 1NLP C; 1AWO A; 4RTW A; 1Z9Q A; 2DRM A; 4DEY A; 1S1N A; 2DRK A; 4AFU C; 2JMA A; 2L3S A; 1SPK A; 1J3T A; 2DBM A; 2C0I A; 2K9G A; 2B86 A; 2L2P A; 2GGR A; 3QWY A; 1SRM A; 2F2X A; 2KEA A; 1UFF A; 1NEG A; 2PZ1 A; 2C0T A; 3H41 A; 2CDT A; 2JMC A; 3JV3 A; 1V1C A; 3NGP A; 1JQQ A; 1YP5 A; 2ENM A; 2FPE A; 1ABQ A; 5IHK A; 4CC3 A; 1GCQ C; 2CUD A; 1KIK A; 4GBQ A; 4HCK A; 5GJW B; 4JJB A; 1W6X A; 1GCQ A; 2NWM A; 2EYX A; 2C0O A; 3EG0 A; 3U23 A; 2LJ0 A; 2JT4 A; 2DIL A; 3VS4 A; 1AWX A; 1MV0 B; 2P4R A; 2BZ8 A; 2DNU A; 2PTK A; 3C0C A; 5ECA A; 2MCN A; 3VS7 A; 1KJW A; 2JTE A; 2KE9 A; 2J6K A; 1BK2 A; 2K2M A; 4D8K A; 4CC4 B; 3UA6 A; 2A36 A; 1YN8 A; 2LX7 A; 1M3B A; 1ABO A; 2QDL A; 3EG2 A; 3VRY A; 2CH4 W; 1B07 A; 2I0N A; 2XMF A; 2DM1 A; 3H0I A; 4J9H A; 2GBQ A; 3PE0 A; 1AEY A; 1WA7 A; 1E7O A; 2D8J A; 1H8K A; 2AZS A; 2CT3 A; 1QLY A; 2YUQ A; 4HVV A; 2LP5 A; 3A98 A; 4JJC A; 2FPD A; 2JW4 A; 5IXF A; 2DA9 A; 2K6D A; 3EG3 A; 1VYT A; 1WX6 A; 2RQW A; 5L23 A; 2JS0 A; 4IIO A; 2ECZ A; 1PKT A; 1AVZ C; 1ZUU A; 2K3B A; 4KRT A; 1U3O A; 2W10 A; 5GJV B; 1K9A A; 1OPK A; 1OEB A; 3THK A; 4Z88 A; 2DL4 A; 3M0S A; 2GQI A; 2O31 A; 1GL5 A; 4K11 A; 1MUZ A; 3RBB B; 4AG1 C; 4CC7 A; 1NM7 A; 4HXJ A; 1X27 A; 1SEM A; 2KNB B; 4OMO A; 1WXT A; 2OAW A; 1JXM A; 4RTU A; 4LN2 A; 2AK5 A; 1M8M A; 3NMZ C; 1K0S A; 1I07 A; 1G2B A; 3UAT A; 3TVT A; 3UF4 A; 2CRE A; 1PWT A; 1Y0M A; 1QWE A; 4OMN A; 4OMQ A; 1NYF A; 1UHC A; 1UDL A; 3M0P A; 2BTT A; 2EGA A; 2GNC A; 4J9G A; 4LNP A; 4OMM A; 2L3P A; 1FMK A; 1ZBJ A; 2JM8 A; 2RN8 A; 1QKW A; 5IHI A; 4J9B A; 1N5Z A; 4CC2 A; 4R0K A; 2RQT A; 1GCP A; 1E6G A; 4GLM A; 3CQT A; 1GBQ A; 1JO8 A; 2DLP A; 4J9I A; 2O88 A; 4FSS A; 2J06 A; 2DYB A; 2RQV A; 5I11 A; 2YDL A; 2EBP A; 2V1Q A; 1BB9 A; 1I1J A; 2GTO A; 2BZY A; 2D0N A; 2KT1 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2HDA A; 4UC4 A; 4E7H A; 2CP7 A; 3G6E T; 3A8G B; 3ME9 A; 1VA7 A; 1G5V A; 1OPL A; 3OYA A; 4KUI A; 1HK9 A; 4E6R A; 1ACM B; 2OTJ Q; 1U06 A; 1NJI U; 1BCM A; 1VYV A; 3G4S Q; 1WHK A; 2DPP B; 1Q7Y C; 1LCK A; 3OSS C; 1JJ2 S; 3VV0 A; 1RAA B; 5GMK j; 3L2Q A; 1IO6 A; 3CC2 Q; 2K2V A; 3ER0 A; 4PJO B; 2EQM A; 3EFO A; 1YFN A; 1FMV A; 4V2S A; 4M78 A; 4DEX A; 1QWF A; 1VQP T; 1AD5 A; 1T3L A; 4WF2 A; 1IHW A; 1PSF A; 1UGV A; 2CGH A; 1UJ0 A; 2EWN A; 3QPH A; 3QYH B; 4RTT A; 1QVG P; 2AHJ B; 2OTJ A; 2IIM A; 5HCK A; 1Y57 A; 2WAC A; 1K73 C; 3J80 E; 3JRZ A; 2X51 A; 1Y07 A; 2G6F X; 2OJ2 A; 2KRN A; 3M0T A; 1ZSZ C; 3QO3 A; 2E4H A; 1BI3 A; 2EYQ A; 1VQ6 T; 4BAC A; 2YHT A; 4AFS C; 4M77 E; 1Y96 A; 4PJO F; 1E6H A; 1VQL T; 2HEQ A; 1QVG S; 4C0F A; 1VQM A; 2A37 A; 3M56 A; 1ZSG A; 2KVQ G; 1MNE A; 5CAI A; 3MP6 A; 1XQH A; 2F5T X; 3CC7 Q; 3O5Z A; 4BD3 A; 2L0A A; 4OML A; 1AZG B; 3SHW A; 3CCS A; 1WPY A; 1U5S A; 1GRI A; 2KXD A; 4LDV A; 2DE0 X; 2EYY A; 3BDU A; 3I9Q A; 1PCX A; 4JJD A; 4QQD A; 1OZ3 A; 1DJ7 B; 3FB9 A; 2K3X A; 4HVW A; 3V7S A; 2RM4 A; 4MZP A; 1B7T A; 2ATC B; 5CR2 A; 3EFR A; 2CS7 A; 1RAH B; 1YJW Q; 1UJY A; 4FSX A; 5LL6 S; 2HBW A; 2EKH A; 1RLQ C; 3NTI A; 5I2M A; 3CPW A; 3BE3 A; 2CT4 A; 3D7S B; 1T0H A; 3CCL T; 3X26 B; 1K1Z A; 1M1K R; 2ED1 A; 2ZPF B; 3H0H A; 2XHC A; 3QYG B; 5KYX B; 1YNZ A; 2R5M A; 1Q86 U; 4A54 A; 2BZX A; 3X25 B; 1JRI A; 4TVR A; 3RR6 A; 2COW A; 1PHT A; 2LNH B; 5KYW B; 4MDX A; 2EIF A; 2QQ9 A; 2OTJ T; 1M3C A; 2E65 A; 1UE9 A; 5GAO l; 1YJW A; 4C5H A; 2KGT A; 2RF0 A; 2EGC A; 1G83 A; 1VQ8 Q; 5GAO p; 1P92 A; 4Z89 A; 2OI3 A; 1X2Q A; 1ZUY A; 2LJ3 A; 3VRZ A; 2ROL A; 2JS2 A; 3E19 A; 3OYY A; 4KH1 B; 4ORZ A; 2J6O A; 3CBO A; 2RHU A; 3H0F A; 4VUB A; 2DL5 A; 2MF2 A; 2RO0 A; 1VQM T; 1M90 C; 2RPN A; 2RJF A; 5GAO m; 3EGU A; 2JXB A; 1NEB A; 1VQN A; 3EG9 B; 3HFO A; 3CCJ Q; 2K79 A; 4Y28 E; 4PJL A; 1YWP A; 3CCS T; 4XU1 A; 2HCK A; 1KC8 U; 2COZ A; 2F2V A; 2XU8 A; 4WCI A; 1TSF A; 5EC7 A; 1VQ8 A; 2VUB A; 1HSQ A; 3JSC A; 1XOV A; 3M0R A; 3QWX X; 1KD1 U; 3PIO A; 2HQH A; 4EMK B; 3RUX A; 1RUW A; 4C8Q C; 4DA4 A; 5KCO A; 1C1A A; 3SWN C; 4ELZ C; 3I5S A; 2ED0 A; 3I56 A; 1KG1 A; 3OYB A; 4M7D B; 4C0G A; 3M58 A; 2JN0 A; 5LJ3 d; 3ZFJ A; 3CCJ A; 1ZLM A; 4Q5W A; 2CZ7 B; 4LUE A; 2DJZ A; 1MND A; 3I55 A; 3OSV A; 1KC8 R; 5HK3 A; 1A0N B; 2K5I A; 3VS5 A; 5FU7 C; 1YIJ Q; 3LGF A; 4J83 A; 3MEW A; 3E9F A; 1QCO A; 4M75 C; 4A4G A; 1KHC A; 5D6W A; 1GBR A; 1IRE B; 2LNV A; 3OS1 A; 1M8V A; 3CMA Q; 1WI7 A; 4F7U G; 3INZ A; 2QQS A; 3J7A F; 4X1V A; 2RI2 A; 2LJ1 A; 5A0G A; 4M7D F; 2COY A; 5CKH A; 3GNF B; 3TSW A; 2HL3 A; 1S72 Q; 5CCA A; 1WZO A; 4MZT A; 3FRN A; 1M27 C; 2EQI A; 1M2V A; 2DFU A; 4JJN K; 4E47 A; 1D0X A; 1AWO A; 4RTW A; 4XAX B; 2DRM A; 1FX7 A; 1N9S A; 2IPO B; 4PK4 A; 2L3S A; 3N5B B; 2K9G A; 1JB0 E; 2B86 A; 2L2P A; 4DOV A; 1VQN T; 2GGR A; 2F2X A; 1NEG A; 3HHT B; 3H41 A; 3S3O A; 2VXF A; 2IVW A; 1VQ8 T; 4OGC A; 3DLM A; 3DB3 A; 3NGP A; 1V1C A; 4XU2 A; 1JQQ A; 1YP5 A; 4HCB A; 2YXY A; 1G3T A; 3A5Z B; 4RMO A; 2LT1 A; 2E10 A; 1K8A U; 3I56 T; 4QQG A; 3E1S A; 5GAN 4; 1W6X A; 2VXE A; 4O6J A; 1YJ9 A; 1RI0 A; 3C12 A; 5GAN 8; 2PVG B; 3CCJ T; 1AWX A; 2DNU A; 2PTK A; 3I55 T; 2ZPB B; 2HKQ B; 4HT9 A; 5AT1 B; 4OF1 A; 4D8K A; 4RCB A; 1M4Z A; 4MML A; 1RAF B; 2A36 A; 1YN8 A; 4BI8 B; 1LNX A; 1M3B A; 1ZA1 B; 1K9M C; 1B07 A; 2JTF A; 2DM1 A; 3H0I A; 3OYG A; 3O8V A; 3OQ5 A; 4FT4 A; 3V8K A; 3HRT A; 4ME7 A; 1JJ2 A; 4M7A G; 3EFO B; 1WA7 A; 2D8J A; 1H8K A; 2CT3 A; 4C8Q E; 4M78 B; 2YUQ A; 1I4K 1; 3M55 A; 3A98 A; 2DA9 A; 2K6D A; 1VYT A; 1WX6 A; 2A0F B; 4KBM B; 2XDB A; 1GXI E; 2JS0 A; 2QEX Q; 2X4X A; 2RI3 A; 1PKT A; 1ZUU A; 3HTR A; 4FL6 A; 4A53 A; 4FCY A; 2RA2 A; 3MKD A; 1Q81 C; 3PIP A; 1MMD A; 2X4W A; 5GAN 2; 3MEU A; 1MUZ A; 4P5N A; 4LD6 A; 2E3I A; 4HXJ A; 1X27 A; 3OBY A; 1SEM A; 1YJN Q; 1Y96 B; 4RTU A; 3NMZ C; 4M75 E; 1SF9 A; 1IRX A; 4KGZ B; 3UAT A; 2EJF A; 3SD4 A; 1Y0M A; 1QWE A; 4OMN A; 3V8L A; 1NYF A; 1UHC A; 3CBM A; 1UDL A; 3SDZ A; 4DBQ A; 3M0P A; 3BDL A; 4LNP A; 3A8M B; 2L3P A; 4AT1 B; 2RN8 A; 2WSF E; 3DKM A; 2QDY B; 1YJ9 T; 3A1P A; 1IGU A; 3KBG A; 4PFZ A; 1YJN A; 1E6G A; 4BDY A; 1V76 A; 4J9I A; 2HAX A; 2O88 A; 5KYU A; 4FSS A; 3CCQ Q; 4FW1 A; 2LCL A; 2YLB A; 4KGX B; 2XDD A; 1WQ7 A; 4C92 E; 2V1Q A; 4KGV B; 1BB9 A; 2FB7 A; 1I1J A; 3UPU A; 1VOM A; 2D0N A; 2KT1 A; 1BU1 A; 4F17 A; 7AT1 B; 1KFZ A; 3RIR A; 3NTK A; 5CKE A; 2DMO A; 1IHV A; 4JZ3 A; 2LDM A; 2SEM A; 2YSQ A; 3LH5 A; 1YHQ A; 4Y92 A; 1WJQ A; 2CP3 A; 2D6F A; 2DBK A; 4J9F A; 1TS9 A; 4FYV B; 1AZE A; 2CZ0 B; 3S3M A; 4M77 G; 3A8O B; 1Q82 C; 2AZV A; 1RAE B; 2KT8 A; 3OYL A; 4X9C A; 3M5A A; 3OB9 A; 1WFW A; 4XU3 A; 3EG1 A; 1QMC A; 1WHJ A; 1X6B A; 2YUO A; 2ESW A; 3EHQ A; 1AWW A; 4E2F B; 4DBH A; 1UEB A; 2RQU A; 4KT0 E; 2DTO A; 4OB3 B; 1K4U S; 3GOX A; 3ZEH A; 4BY6 B; 2X3W D; 1WIE A; 5GAO r; 1PRL C; 4KUL A; 4F14 A; 1YJN T; 2HBP A; 3G71 A; 2DL3 A; 3LW5 E; 3LH0 A; 5GAM g; 2A28 A; 2FG0 A; 3HL8 A; 1X01 A; 2ZAE A; 2YWW A; 2QGF B; 2E5K A; 1X43 A; 3GLX A; 3QJ6 A; 1ZUK A; 5GAM f; 1D1C A; 1SKU B; 3QKJ A; 5IAY A; 3FIF A; 3DLL A; 2K7A A; 4DBF A; 5GAN h; 4NOY A; 2EYZ A; 1N8R C; 1RAC B; 2P84 A; 5EG2 A; 2KYB A; 1YHQ T; 2M0O A; 2RNA A; 1UG1 A; 2RD1 A; 4RTV A; 3J81 E; 2QK0 A; 4EMH A; 5KYN A; 2EVR A; 5GAM j; 3FC3 A; 2DL8 A; 2KRO A; 1X2K A; 4L5G A; 1WQW A; 2FYK A; 4N0A C; 1K73 U; 3M0Q A; 3H8Z A; 3JB9 G; 5DLO A; 2KAF A; 2NUP A; 2XK0 A; 1W4S A; 5IXB A; 4JS4 A; 3JCM c; 5KYY A; 4PNO A; 1W70 A; 2LRQ A; 1M2V B; 2DO3 A; 4II1 A; 1OU8 A; 5IN1 A; 2XID A; 3M4G A; 3CCR A; 2KSS A; 2KDS A; 4LUD A; 4RTX A; 4AFZ C; 4D8D A; 2LCS A; 3JCM Q; 1D3B A; 2F69 A; 2J7I A; 4EMG A; 4M7A F; 1M1F A; 4DOW A; 1PC0 A; 4PJO E; 2MIO A; 1I0C A; 4A63 B; 4ESR A; 4ZGD B; 4E7K A; 2M0Y A; 1YI2 A; 1T0J A; 5GAO q; 2O9V A; 1MV3 A; 3RES A; 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