The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
8
|
sequence length |
56
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structure length |
56
|
Chain Sequence |
MQYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Dipole tensor-based atomic-resolution structure determination of a nanocrystalline protein by solid-state NMR
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
|
| molecule tags |
Immune system
|
| source organism |
Streptococcus sp. 'group g'
|
| total genus |
8
|
| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-07-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| X | PF01378 | IgG_binding_B | B domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4HKZ E; 4OZA A; 5HI1 A; 1FD6 A; 1K52 A; 1XCT L; 4MAC A; 2IGD A; 2NMQ A; 1F2R I; 1K53 A; 2N7J A; 2RPV A; 2GB1 A; 2KN4 A; 4KGS A; 5HFY A; 4HJG E; 1YNT E; 1QKZ A; 1IGD A; 1IBX B; 1MPE A; 2QSD A; 1JML A; 2LHD A; 2I2Y A; 1PGB A; 1FCC C; 2JXT A; 2GI9 A; 3FIL A; 5BMI A; 2PTL A; 1PGA A; 1PGX A; 2RMM A; 2N9L A; 2ON8 A; 1EM7 A; 2N9K A; 1MHX A; 1K51 A; 1IGC A; 1F2R C; 1MVK A; 1D4B A; 4KGT A; 2I38 A; 1Q10 A; 2LUM A; 2PW9 A; 1P7E A; 1P7F A; 3UI3 A; 3V3X A; 2ZW1 A; 1XF5 L; 2KDM A; 1FCL A; 2KWD A; 2EEL A; 1UWX A; 2LGI A; 2KQ4 X; 2JZP A; 3GB1 A; 3FIL B; 2J53 A; 2KAC A; 2JU6 X; 2J52 A; 4KGR A; 1XCQ L; 2PLP A; 4D2K A; 5HHD G; 1GB4 A; 2ONQ A; 2OED A; 1HZ6 A; 1MHH E; 1HEZ E; 4IOI E; 1KH0 A; 2K0P A; 3MP9 A; 1ZXH A; 4IKG A; 4OZB A; 5BMG A; 1MI0 A; 2IGH A; 5HG2 A; 4OZC A; 5BMH A; 1IBX A; 2LHE A; 1C9F A; 1YMH E; 2JSV X; 2ZW0 A; 2IGG A; 5JXV A; 1HZ5 A; 4GLS C; 1K50 A; 2QMT A; 1GB1 A; 2JWU A; 4WH4 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2GBR A; 3KQ4 A; 4TKN A; 1T0Q C; 5CHF A; 3SFD B; 3ZGZ A; 4KVG B; 4JWS C; 3EFU A; 4LNF A; 2Z0D B; 1I4Q A; 4A3O A; 2PKO A; 2N9E B; 3RNE C; 2WXP A; 2WXI A; 1UH6 A; 4X57 B; 4KKJ A; 4K7U A; 4KSL C; 4HLE A; 2Z8L A; 2DYM A; 3M3J A; 4RNA A; 1JWM D; 4GDL B; 2LJ5 A; 4YL8 A; 2WXF A; 4IC7 B; 2N9K A; 4MGK E; 4W9F A; 2KDI A; 4M0W A; 3C19 A; 1RLF A; 5HKH A; 2N0S B; 1R4M I; 1SSN A; 1TKY A; 4LJO B; 1YN5 A; 1YJI A; 2LGX A; 3BY4 B; 3RNA C; 2C7H A; 1V1P B; 3JYU A; 1WE7 A; 2INN E; 3RUL A; 4W9L A; 3W2D A; 4AWJ A; 1FM0 D; 2VH1 A; 1JRU A; 4NQK E; 3ZLZ A; 1WF9 A; 3VDZ A; 5DCN A; 4ZRI A; 2WXG A; 3O65 B; 3DHH C; 3U30 A; 3DOW A; 4MM3 A; 3KH0 A; 1YD8 U; 5G2N A; 2WXJ A; 4FN2 A; 2VH2 A; 4DK5 A; 5AUK A; 3RFZ B; 1MHH E; 3PTF C; 3T9L A; 1UUP A; 3EGR A; 1EUV B; 1MI0 A; 2JUO A; 2WXN A; 5C3J B; 2KDE B; 4RMA A; 4USA A; 4EZJ A; 3RPF C; 1HE8 A; 2BKF A; 3BVG A; 3PRP B; 1RAX A; 2J0K A; 2WDQ B; 2XNA C; 2KKC A; 2ACZ B; 1K50 A; 3UIN B; 2LXC A; 4OVU A; 1EO6 A; 1UD7 A; 2BF8 B; 4OZA A; 3AN1 A; 1IUE A; 4B0M A; 4MAC A; 3T3N A; 2MBH A; 2K8C A; 4UDU C; 1WJN A; 2WHI A; 4PK1 A; 2W55 A; 1E8Z A; 3UGB B; 1FNU A; 2D5G A; 1JRO A; 1XO3 A; 1CK1 A; 1SEB D; 1RWS A; 2BS2 B; 1WXQ A; 1NBF C; 1PDX A; 2CU3 A; 3DBH B; 3DQV A; 2GRI A; 2KAN A; 3QHT A; 1PYW D; 3TEZ A; 4FJV B; 1FMA D; 1UEL A; 2O6V B; 2KTF A; 2FCQ A; 5FR3 A; 3HRD D; 4FBJ B; 2PEA A; 4AJY B; 2V4I B; 3VUY A; 1TTN A; 1WX8 A; 4BAX A; 3UIP B; 3SU8 X; 3AE5 B; 3DPD A; 1TS5 A; 4JX1 C; 3L08 A; 1E8Y A; 2W82 A; 4B9K A; 1BT0 A; 2J4X A; 4BBN F; 1G6J A; 2BGF A; 3MJW A; 4IDI A; 2MA9 B; 1DOI A; 3RNB C; 2I1K A; 2YEP F; 1BUI C; 2IZV B; 2M0A A; 1RM6 C; 2JU6 X; 1SXT A; 2RSU A; 3OJ4 B; 3QAR A; 4LNI A; 1GB4 A; 1RFK A; 5FKA C; 3LDZ E; 2D3B A; 3ALB A; 2KFK B; 3DBH I; 2KVR A; 3QK0 A; 1SE4 A; 4A9A A; 1D5M C; 5G5G A; 4N9F 4; 3N1Z C; 2Y5B B; 4BKS D; 2E6X A; 1GC7 A; 4MT5 A; 5CX3 A; 2BB5 A; 3NY5 A; 4ZHO A; 1FIQ A; 1YX5 B; 1L2N A; 4HCP B; 3ZJU A; 2BKR B; 3ZXR A; 1XCT L; 1V49 A; 4GGQ A; 2D3A A; 1TKE A; 1TIF A; 1F0Z A; 3AEE B; 1I4G A; 4RH6 A; 1D6E C; 5L83 A; 2PVG C; 1DOY A; 1C3T A; 3NHE B; 4XDC A; 2KHW B; 2KJH B; 3KW5 B; 3R2I A; 4LDT D; 2KC2 A; 4W9D A; 3WCQ A; 4WJP A; 2BYF A; 2RD0 A; 2I1J A; 2FCN A; 2CJN A; 3P2B A; 3A9J A; 2RDG A; 2QSD A; 3BYY B; 2N7E A; 3ZRC A; 2A4Z A; 3M62 B; 4DXA B; 3FIL A; 4ZYN A; 2J42 A; 1SB3 C; 4JWU C; 4FLH A; 4GOC A; 1K8R B; 2QHO A; 1FFV A; 1LM8 B; 2QDF A; 2L83 A; 3NG0 A; 2KDB A; 3P4R B; 3W1S A; 4HJK A; 4RF1 A; 5E6N A; 2IY0 B; 2LWP A; 4S17 A; 4ANX A; 4LK0 M; 4AP4 C; 1YN3 A; 4DHJ B; 4XE0 A; 1VZ8 A; 3K9P B; 2QC8 A; 2E3T A; 4RM9 A; 1N61 A; 1ESF A; 2MCN B; 3RI7 C; 2R2Q A; 4DHJ D; 2K8B A; 4HDO A; 2J0M A; 1AAR A; 3Q8F A; 2MBE A; 5DPT A; 1XF5 L; 3ZNZ B; 1V86 A; 2KWD A; 3ZUN A; 4L2Y A; 1H8C A; 4HDQ A; 3Q14 C; 3AED B; 3RUI B; 3SEB A; 2CJO A; 5C1Z A; 2DAF A; 2JZP A; 3HVZ A; 4ZDV A; 1V2Y A; 4RGT A; 2UYZ B; 2HJ1 A; 2JRH A; 1VCB A; 1JW9 D; 4MH0 E; 3N1Y C; 3PGE A; 1YQ4 B; 4RFB A; 4YTN B; 4NJC A; 3PRZ A; 5CHW A; 1SBB B; 1OGW A; 2WDV B; 2JX5 A; 2LHE A; 2W3S A; 1Y56 A; 3R3M A; 4KV2 A; 3ABV B; 3ML9 A; 4JGH B; 3QX1 A; 4US8 A; 2JWU A; 1WRD B; 4BBN C; 3Q69 A; 2ZVO A; 3H8H A; 3X0W A; 2PIA A; 3AE2 B; 1EWY C; 2LGD A; 3BII D; 3AU4 A; 3L54 A; 1MFW A; 1VDV A; 2RGF A; 3W5V B; 3VRB B; 5JHB A; 1OEY J; 2YEP B; 4WAF A; 1SJE D; 4P1C C; 1YQ3 B; 4HPM B; 1E10 A; 1IGD A; 4FHJ A; 5BYS A; 1KOT A; 1OQQ A; 2MBB B; 2INC C; 4ASW C; 2PE6 B; 4MEM A; 4MSQ B; 3R7R A; 2MEK A; 3KYC D; 2WXH A; 3RZF A; 2M19 A; 1WGH A; 3AU5 A; 2L0F A; 3L0W B; 1GNU A; 2NBU A; 1C77 A; 1ZKH A; 3BWU D; 3NJT A; 1WXM A; 2ZPY A; 2WXR A; 4GDK A; 2KZR A; 4NAW B; 2YLM A; 4B0E A; 4ZOH C; 2I38 A; 2ZJD A; 2JZZ A; 3Q2A C; 4KX6 B; 2ZNV C; 3SDL C; 2XK5 A; 1WY8 A; 2DZI A; 2PMV A; 2GBK A; 3ZYY X; 3ZJT A; 1WM2 A; 2ZNV B; 4BVU C; 2V4L A; 2V1Y A; 1TBE A; 2KWV B; 3P4P B; 4KGR A; 3V61 A; 1WZ3 A; 4R3D A; 4J3O D; 3PT2 B; 4OZC A; 1ZOY B; 4GSW A; 3ZQ4 A; 5EE1 A; 1KFY B; 2CHW A; 1J7A A; 1SF0 A; 2WU5 B; 5JZE B; 1V8C A; 3PHW B; 1D3Z A; 4GDL A; 2AYO B; 4G0N B; 3TUO A; 1E5W A; 2BPS A; 5KHO A; 3BYT B; 4L1B A; 4QAY A; 3KUZ A; 3ZKJ C; 1V1P A; 3ZNG C; 3U7D A; 3X23 A; 3HIZ A; 2BW2 A; 2KMA A; 2V3N A; 3VTW A; 1XLN A; 4NPN A; 4YWG G; 3KUD B; 2ZEQ A; 4IM2 A; 2IBI B; 2LUE A; 2H89 B; 5D3D A; 4C00 A; 3DDC B; 3VAW A; 2Z59 B; 1N60 A; 1ZDX A; 4KDI C; 2QIE B; 2ASQ A; 1E8W A; 2EMS A; 1E7V A; 2L05 A; 5D3I B; 1SGH A; 1D4B A; 2ZZP B; 1KLV A; 2KVZ A; 2L76 A; 1FO4 A; 5EE9 A; 2LRU A; 4HPL B; 2PW9 A; 4IW0 A; 4PS7 A; 2MH7 A; 4OW0 A; 1P7F A; 1Z2M A; 5D7G A; 3N30 A; 3UI3 A; 4TUU A; 3FKY A; 3PLU A; 3URY A; 4K7S A; 2WP9 B; 1NI3 A; 2L7R A; 2LVO A; 2G3Q B; 2D3G A; 2J53 A; 2LZ6 A; 3AV8 A; 3PHX B; 1E8X A; 2DZM A; 2KMM A; 4E3C A; 2LVQ A; 2V0G A; 4ANV A; 3DBS A; 2AQ3 B; 4MGY E; 3IXS A; 4P1B C; 5HG2 A; 1TGZ B; 3DBR B; 1WSP A; 3WA0 A; 1RYJ A; 4K3B A; 2BWE S; 2KK8 A; 2QCZ A; 4H2A A; 1CQV A; 3EFC A; 5G5H A; 2O6V A; 1V97 A; 1A70 A; 1XQQ A; 1WMH B; 2O2V B; 4II3 B; 2JXX A; 4OVZ A; 2N7J A; 3BVM A; 3DVG X; 2KLG A; 3NVW A; 1UBI A; 5D6J B; 1T6B X; 3PSE B; 2MWS B; 2WU2 B; 4LLG M; 1DGJ A; 5HFY A; 1V5O A; 4JL9 A; 3J9C A; 2BVC A; 1QF6 A; 3SHQ A; 4HVB A; 3GE8 C; 4FJY A; 1WX9 A; 4HK2 A; 1Q0W B; 2WQY B; 4BKS A; 3W5U B; 3VHT C; 4DXF A; 3AE3 B; 1C1Y B; 2KFK A; 4MJS B; 4RCO A; 4FA6 A; 2PJH A; 1LQB A; 2HE7 A; 3A33 B; 2CKH B; 4I6N B; 1WE6 A; 3SFE B; 1YX6 B; 3MC9 A; 4B6W A; 1SJH D; 2JPH A; 2QEJ C; 2KDM A; 3Q8C A; 2V3P A; 5TR5 A; 1L0Y B; 2K6D B; 1WRI A; 4WJO A; 2DYB A; 2FNJ B; 3V60 A; 3PVL A; 2FCM A; 3FAH A; 4LTU A; 1WYW B; 3DWG C; 5BYQ A; 1TZ1 A; 2ICI A; 4IOI E; 4LJP B; 1JWA D; 4NAM A; 2K8H A; 3PZ8 A; 4AUQ C; 2G4D B; 3B1L X; 1GOZ A; 4C7Z A; 2IPK D; 4G3X B; 4YSX B; 1WGR A; 1HZ5 A; 1HA5 A; 2KMC A; 3MC0 B; 2C5L C; 2FIF A; 3ZW3 A; 3I3T B; 4PT5 A; 2GBN A; 3HVD A; 2B3A A; 3IT6 B; 5L95 C; 3NZU A; 4E71 A; 3NZ3 A; 4KGS A; 3U2S C; 2MJD A; 1N62 A; 4P16 A; 3NS1 A; 2KWC A; 1WGK A; 1IBX B; 2UU7 A; 3ZVV A; 4N59 A; 4F7Z A; 1J8C A; 1I4H A; 1PGB A; 1V1O A; 3WIM A; 1QIL A; 2ZVN A; 3I63 C; 1X1M A; 1L7Y A; 2RMM A; 5J2R A; 1H4R A; 4E74 A; 1TS2 A; 3HM6 X; 3OG5 A; 2JF5 A; 3V6E B; 4DXG A; 1HTO A; 1I42 A; 2W9N A; 1L0V B; 2L52 A; 3BZD B; 1Q10 A; 1NEK B; 2WXQ A; 2FBW B; 2WYQ A; 2KYW A; 2MHJ A; 3V3X A; 4A20 A; 3VFK A; 1AN8 A; 4ZRP A; 4ZRJ A; 2KAC A; 4CYE A; 4D2K A; 5EDS A; 5HHD G; 3WAL A; 2OED A; 1UGJ A; 2G1E A; 1XXG A; 4M8M A; 4IWP A; 4PYU A; 1ZXH A; 3AE6 B; 5BMG A; 2L8J A; 1NDD A; 2IGH A; 3M63 B; 3P4S B; 1QOF A; 4FHK A; 3QJZ A; 1NI2 A; 1TKG A; 3VUW A; 2MSE D; 1E7P B; 1FXI A; 2D10 A; 2RDH A; 4YXD B; 2CHZ A; 2IO3 B; 3AEG B; 3GZN B; 2C60 A; 1CMX B; 4TQ1 A; 1WGY A; 4XYC A; 1L5P A; 3ECI A; 3DWM A; 4ARC A; 2NPT B; 4AJW A; 2AQ2 B; 2KT7 A; 1P3Q U; 1ZW7 A; 3B2G A; 4NAW A; 1C4P A; 2DNF A; 4ANW A; 1BXT A; 3TMP B; 3ZO5 B; 2FUG 1; 1C78 A; 2K25 A; 3PO0 A; 5D94 A; 1YNT E; 1WX7 A; 1KF6 B; 1QKZ A; 2G9H D; 3RNC C; 3UF8 A; 2AWT A; 1ZUD 2; 4LDT B; 4DBG A; 2KJ6 A; 3KYD D; 3IHP C; 1GC6 A; 4K1R B; 1TT5 B; 1MG4 A; 1IPG A; 3AI5 A; 3TSS A; 4WWP A; 4IWQ A; 4CO7 A; 1T0S C; 2EMT A; 4JIO U; 3TEX A; 2KQS A; 2D3C A; 2Z0E B; 3CST A; 3GZN I; 1P7E A; 3DHG C; 3JSV B; 1U4A A; 3MHZ A; 4LNO A; 4IG7 B; 2NBV B; 2D07 B; 4GU2 A; 3WAO A; 2EEL A; 1C76 A; 3LXF A; 4US9 A; 3PZ7 A; 4M8N A; 2KQ4 X; 3AXC A; 1NEN B; 3ML8 A; 1WWT A; 1WXA A; 1XCQ L; 2WWZ A; 4NY0 A; 4MM3 B; 1WJ4 A; 1I35 A; 3A9K B; 4XX5 A; 1TYG B; 1P9D U; 1Y8R C; 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3ZNH B; 1EU4 A; 2PE9 A; 4A90 A; 1ET6 A; 1UNS A; 4NZL B; 4G50 A; 1WJU A; 2A5U A; 3RD2 A; 1TY2 A; 5J18 A; 4MJS A; 1KM7 A; 2C7N B; 3C8Y A; 3LB8 C; 2BT6 A; 1YOV B; 1FFU A; 1V80 A; 5AUI A; 3NVY A; 4HWI B; 1J7B A; 3APF A; 1SE3 A; 1KLG D; 2GB1 A; 3U7Z A; 2KN4 A; 3RMK C; 3ZJV A; 1I4P A; 2IO2 B; 2W3R A; 4BZA A; 4MH8 A; 4AQ7 A; 2MP2 B; 3VH4 B; 4NJ7 A; 1JML A; 2DWQ A; 1ENF A; 1VD2 A; 4WQM A; 3MFG A; 1ZGU B; 1SIJ A; 2LEK A; 2LAS A; 1E7U A; 1K51 A; 1WXS A; 1KJT A; 1WI0 A; 4WUR A; 1XEE A; 3U52 E; 4C56 C; 2NTT A; 2BYT A; 1MJD A; 3QAQ A; 4W9H A; 2WXM A; 3A1Q B; 3AEB B; 2K1F A; 1VZ7 A; 3P63 A; 2KO3 A; 2ZW1 A; 4C4V B; 5KHQ A; 4IWO A; 1TS3 A; 1FCL A; 4KZC A; 4P6V F; 5JH5 C; 2Y3A A; 1WR1 A; 4Q2J A; 3KLS X; 2NCN A; 2LRW A; 2FID A; 1P0R A; 3PS6 A; 3ZTD A; 3PV1 A; 1SE2 A; 2WDT B; 1IBX A; 2N1W A; 4O1N A; 2BB6 A; 1F9J A; 4YSY B; 1P1A A; 2H88 B; 2ZW0 A; 3Q8A A; 5LXH A; 2CS4 A; 4BKG A; 1JWU D; 3OJ3 A; 1RRB A; 4B95 A; 2G45 B; 1V9J A; 5EE0 A; 1F52 A; 1FD6 A; 2M56 B; 3ZDM C; 2BYV E; 4BOZ B; 1B9R A; 4JE3 B; 3GP7 A; 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