The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
TTYKLILNLKQAKEEAIKELVDAATAEKYFKLYANAKTVEGVWTYKDETKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
NMR structures of two designed proteins with high sequence identity but different fold and function
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Gb88
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| source organism |
Artificial gene
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| molecule tags |
De novo protein
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| total genus |
13
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-10-25 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2QSD A; 1P7E A; 2ZW1 A; 4OZC A; 1IBX A; 3V3X A; 4HKZ E; 4GLS C; 1F2R C; 1K52 A; 1MPE A; 5BMG A; 2ZW0 A; 1JML A; 1HZ6 A; 2OED A; 4KGT A; 4WH4 A; 2PLP A; 2QMT A; 1UWX A; 2KWD A; 1MHX A; 4KGR A; 4IKG A; 1GB4 A; 2LUM A; 2JXT A; 1GB1 A; 2N9K A; 3FIL A; 1K51 A; 1KH0 A; 2IGH A; 1QKZ A; 2JSV X; 5HG2 A; 2LHD A; 5BMH A; 1XCQ L; 1K50 A; 4HJG E; 2KDM A; 2JWU A; 1D4B A; 5BMI A; 2RMM A; 1PGA A; 1XF5 L; 1FCL A; 2KAC A; 3UI3 A; 1FCC C; 2JU6 X; 2ON8 A; 1FD6 A; 1YMH E; 2RPV A; 4OZA A; 2JZP A; 1PGB A; 4MAC A; 1PGX A; 1IGC A; 1HZ5 A; 1ZXH A; 2GB1 A; 1IBX B; 1YNT E; 2LHE A; 2GI9 A; 1MHH E; 1P7F A; 2PW9 A; 1MI0 A; 3GB1 A; 2NMQ A; 2J53 A; 2KQ4 X; 2LGI A; 1HEZ E; 2EEL A; 1XCT L; 5HFY A; 2N7J A; 2I38 A; 2IGD A; 2PTL A; 2KN4 A; 1EM7 A; 2N9L A; 4D2K A; 2IGG A; 1MVK A; 5HHD G; 1IGD A; 1F2R I; 4KGS A; 1C9F A; 5JXV A; 3FIL B; 3MP9 A; 2I2Y A; 1K53 A; 5HI1 A; 2J52 A; 4OZB A; 1Q10 A; 4IOI E; 2ONQ A; 2K0P A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4RGT A; 2JVC A; 1P7E A; 5DPW A; 2YLM A; 3MC9 A; 1UZX B; 4HPL B; 3PT2 B; 2M56 B; 4BKS A; 4FAD A; 4DHZ E; 1C78 A; 3DDC B; 4L1B A; 3AMZ A; 3NJT A; 2ZW0 A; 1WXS A; 4WWP A; 4HCP B; 2EKE C; 2A5U A; 4REZ A; 4M0W A; 1RYJ A; 2LRW A; 3PO0 A; 4DDG D; 4JPS A; 3W1Y A; 3UGB B; 3R2I A; 1TKY A; 1V80 A; 1B9R A; 4I6P A; 5H92 C; 1WGR A; 3BVZ A; 2LHD A; 2LI5 A; 2NS5 A; 3BII D; 3PSE B; 1P3Q U; 1ZOY B; 4BKT A; 3KW5 B; 1AAR A; 2L7R A; 1WJN A; 2AWT A; 2OJR A; 4FHJ A; 2VZK B; 1V8C A; 1JWS D; 2WXJ A; 4LDT B; 3VRA B; 3Q3N C; 2D3B A; 4JQW C; 4TV3 A; 4LTU A; 2Y5B B; 3Q3F A; 5BYS A; 3WAL A; 4XYC A; 2ON8 A; 4C56 C; 2K25 A; 2CHX A; 4OZA A; 3U7D A; 2K8C A; 3U30 A; 1ZW7 A; 1NEK B; 3N1Z C; 2MJE A; 4X57 B; 4YSY B; 2MRP A; 1TTN A; 3MFG A; 4A3P A; 4KKJ A; 1P7F A; 3AE9 B; 2KHW B; 5DCN A; 1RFK A; 2DAJ A; 3NZS A; 1Y8R C; 1C77 A; 2QC8 A; 2OJW A; 4PS7 A; 3DWG C; 1PYW D; 2D2Q A; 1WE6 A; 1EF1 A; 2PEA A; 4C4V B; 4DWF A; 5E6N A; 4AJW A; 4RGM A; 3VUX A; 4K7U A; 2UU7 A; 2I1K A; 1CZP A; 1IGD A; 2KDI A; 1Y56 A; 2DYB A; 1R7S A; 2WXR A; 4DBG A; 3MP9 A; 1TS3 A; 4DDI D; 3APD A; 4BBN F; 1E8W A; 2J52 A; 2Y3A A; 1I4Q A; 4P1C C; 3RI7 C; 3QAQ A; 5G5G A; 1YQB A; 2LGS A; 2KTR B; 3PRM B; 4ZYS A; 3L17 A; 2M4N A; 3IAM 1; 1FNV A; 3W5U B; 2D3A A; 3ZXR A; 5FR3 A; 2WXG A; 1VJK A; 1I4G A; 3QX1 A; 4WWO A; 3BYT B; 1YN4 A; 3E56 A; 2KWV B; 3C0R B; 3ZNG C; 1JCK B; 2C9W B; 1FNU A; 3FIL A; 3RNB C; 1F77 A; 1KH0 A; 4HDQ A; 3ZYY X; 2HE7 A; 3QK0 A; 1BUI C; 1J19 A; 3S2A A; 4HJG E; 2BPS A; 1DGJ A; 2MJ3 A; 5D94 A; 1GPX A; 5EE1 A; 4ACF A; 2RGF A; 1KM7 A; 1FCL A; 3QHT A; 2RDH A; 3HVD A; 2LVQ A; 1T5X D; 3GZN B; 1L6U A; 2PJH A; 5DPR A; 2AQ2 B; 3PHW B; 2QDF A; 2DLB A; 3N1X C; 3UF8 A; 2IPK D; 3DVN U; 4RM9 A; 3AI5 A; 1J7C A; 4P1B C; 1V5T A; 1R4M B; 1WI0 A; 1LQB A; 3AE4 B; 4G50 A; 3AE3 B; 2LHE A; 5MPO A; 4TQ0 A; 3ML8 A; 2KAJ A; 4HVB A; 1V2Y A; 4FA6 A; 4L2Y A; 2IO3 B; 3EEC A; 2CKH B; 4FJV B; 3BVM A; 4WJN A; 3VTV A; 2N9E B; 1A70 A; 3X0W A; 2IGD A; 3A9J A; 3V05 A; 2KN5 A; 4BAX A; 1UUP A; 1QOF A; 4F7Z A; 2QEJ C; 1OQR A; 5GMV A; 4TQ1 A; 2G9H D; 1L4Z B; 1DYQ A; 3V6C B; 3APC A; 2KC2 A; 2M1M A; 4RF1 A; 3IG3 A; 4LK0 M; 4XDC A; 2IZV B; 2NPT B; 1NDD A; 1HA5 A; 3NG0 A; 3DPD A; 4C4V A; 2ZNV C; 4G0N B; 4IUM B; 5L95 C; 1QIL A; 5JZE B; 4P16 A; 3HRD D; 2ASQ A; 3N32 A; 3Q8A A; 4EOY A; 3RNE C; 3C8Y A; 3DCG A; 4PYU A; 1I35 A; 5JH5 C; 3VR9 B; 1EO6 A; 3KUC B; 5AZG A; 1FXA A; 1JRO A; 2KTR A; 1YIW A; 2HJ8 A; 2M8S A; 3UQB A; 4A8X C; 1T0Q C; 2CJN A; 3DBL I; 3UI3 A; 2BKR B; 1PUT A; 4LCD E; 4RM8 A; 2FNJ B; 1YMH E; 1OTR B; 3P1M A; 1OFF A; 1NVI D; 5KHQ A; 1UD7 A; 1YN3 A; 3JYU A; 4NPN A; 3GE3 C; 4HCN B; 3GE8 C; 2FBW B; 4ARI A; 4NY0 A; 2BS2 B; 1YNT E; 1FXI A; 4OVZ A; 2E6X A; 4M8N A; 2IO0 B; 3P42 A; 2NBW B; 4PS3 A; 1WGG A; 2JPH A; 2KZR A; 2CU1 A; 2JRI B; 1P9D U; 2CS4 A; 3H9D A; 2H89 B; 2K6D B; 1C9F A; 1UBQ A; 2UWQ A; 1L5P A; 3N9Y C; 3T9L A; 3AE1 B; 3WAM A; 4WQO B; 4FXC A; 1SIF A; 2ONQ A; 3LYY A; 3T3N A; 2K0P A; 4FJY A; 1WZ3 A; 2NVU I; 1U4A A; 1WH3 A; 3ZNI D; 2XN9 C; 2NTT A; 3K9O B; 3V60 A; 1E10 A; 4RNA A; 4CO7 A; 1GNU A; 2IY1 B; 1F52 A; 2ZVN A; 3CIR B; 3B2F A; 3SD5 A; 2LUM A; 2L32 A; 2G4D B; 3UQA A; 2XNA C; 3NVZ A; 2GBM A; 3Q8C A; 1XD3 B; 1R4N I; 4FUL A; 1GC7 A; 1LO5 D; 4NAW B; 3SFD B; 3W1S A; 2IJ0 A; 2DX5 B; 2JZZ A; 3RT3 B; 1JW9 D; 2NPT A; 3T8M A; 2O6V D; 1D5Z C; 2A4Z A; 1WY8 A; 1QLB B; 3JSV B; 3AH7 A; 4YTN B; 4GMV A; 2GOW A; 3ENE A; 1M94 A; 3AE6 B; 1MG8 A; 2CU3 A; 2HDE A; 2NBV B; 5BYR A; 2L83 A; 3TUO A; 3QAR A; 1N5X A; 3L13 A; 2GRI A; 4GDK B; 2V9H A; 3DBR I; 3IVF A; 1HQR D; 1J7B A; 2KQ4 X; 2G45 B; 3LB8 C; 2VH2 A; 4XX5 A; 4FLH A; 5T8I A; 2PTL A; 4UDU C; 2IND C; 2N4F A; 1MVK A; 2KOX A; 2MBE A; 2RSU A; 3B08 A; 1ET9 A; 4KGS A; 4MH0 E; 5HI1 A; 2IYD B; 4YT0 B; 1I4X A; 4IOI E; 1H8C A; 2DHZ A; 4KDL B; 3A4S C; 1L0V B; 1T0R C; 2G3Q B; 3B1L X; 1L0Y B; 1N6Z A; 4OZC A; 4C00 A; 2L3Z A; 4JE3 B; 3TCA A; 1RWS A; 2GBJ A; 2KO3 A; 2YEP F; 4RCO A; 3ZW3 A; 1DOY A; 1SJE D; 2KDB A; 1E7U A; 2KFK B; 3CSF A; 4KGR A; 4M01 A; 3DHI C; 1BT0 A; 4USA A; 1WGK A; 2KK8 A; 3ZXV A; 2Z8L A; 4ICU A; 1WJ6 A; 4KIK A; 4FBJ B; 2FCM A; 4BFR A; 5CHV C; 5C3J B; 5BMH A; 1IYF A; 3L54 A; 4EUT A; 5AUI A; 4NQK E; 1GAQ B; 1TIF A; 2KJR A; 1FCC C; 1D6E C; 2AYO B; 3NRZ A; 4WUR A; 3SU8 X; 1L0X B; 1D5M C; 5D7G A; 3PV1 A; 3MTN B; 3RD2 A; 3U2S C; 1TBE A; 4EZK A; 2KWU B; 2WDR B; 4DXF A; 1IBX B; 1E6E B; 2K8H A; 2KYW A; 2NCN A; 2ZCB A; 4NAW A; 2PVO D; 1FRR A; 1C4P A; 1IPG A; 2KJ6 A; 4LJO B; 5D6J B; 1WGD A; 5D3I B; 1ISN A; 4CHK A; 2N7J A; 1E90 A; 4ZRJ A; 1WWT A; 1EWC A; 3WAN A; 2HTM E; 4P6V F; 1Q1O A; 4JWS C; 1C76 A; 3M95 A; 1DOI A; 4TSS A; 3NZU A; 1Q0W B; 2FIF A; 2E3T A; 2C5L C; 4W9D A; 2V4L A; 2DZM A; 4GDK A; 2N9X A; 5EE9 A; 2K22 A; 2MP2 A; 4B95 A; 2KXJ A; 1UEL A; 1E8X A; 3GOE A; 2Z59 B; 4RH6 A; 2LEK A; 5LNK 1; 4GSW A; 3L0W B; 4ZDV A; 3ZQ4 A; 1GB4 A; 2MCN B; 3V6E B; 3EFC A; 2Z0E B; 4P7I A; 2W3S A; 2N9K A; 1QT9 A; 1TY2 A; 5J17 A; 3MHZ A; 4DHJ B; 1DOX A; 1QKZ A; 2MHJ A; 1TGZ B; 4XDD A; 3KWL A; 3HM3 A; 4ICV A; 4FJZ A; 3PS6 A; 2L0T A; 3PZD A; 2CHZ A; 2KDM A; 4K1R B; 1VZ8 A; 4Q2J A; 2CR5 A; 2QHO A; 3QJZ A; 3VXW A; 2KQ7 A; 3N1Y C; 4WWM A; 2WXI A; 3M63 B; 3O65 B; 2KFK A; 2FCQ A; 2D11 A; 2WXK A; 2KLC A; 5DPS A; 2KWC A; 2D10 A; 2V3N A; 3ZDM C; 3TEY A; 1N5W A; 2DZI A; 3KUD B; 4S17 A; 3QA8 A; 3Q3J A; 4DXG A; 1XEE A; 2PE6 B; 2INP E; 4NJC A; 3RUL A; 5I4D A; 4N6E B; 4W9C A; 4A9A A; 2L05 A; 1F0Z A; 4II3 B; 5CHW A; 4KZC A; 1S1Q B; 3P4Q B; 4DK5 A; 3AE2 B; 3R2T A; 1YX6 B; 2MEK A; 4IM0 A; 3OJ4 B; 4OZB A; 3HHM A; 4GB9 A; 3KYC D; 4E74 A; 1IBX A; 3BY4 B; 2KMA A; 2ZPN A; 1F2R C; 1K52 A; 2WXH A; 3ZGZ A; 1TS5 A; 2O6V B; 2IO1 B; 1HXY D; 3X23 A; 1HZ6 A; 3EA6 A; 2LD9 A; 4MM3 B; 1TS4 A; 1PDX A; 1OQQ A; 3BK2 A; 2B76 B; 2L1A A; 5BO4 B; 3ONS A; 3DOW A; 1NI3 A; 2WX0 A; 2KMC A; 1HE8 A; 3LJ3 A; 2LJI A; 4AS1 A; 1J8C A; 1AWD A; 3NVW A; 3OAW A; 1KTK A; 2BYF A; 2DBY A; 1MG4 A; 2AL3 A; 3EHV A; 1I7H A; 2GBR A; 3RPF C; 2R61 A; 4XWW A; 2BGF A; 1WXA A; 3SEB A; 5J18 A; 1B1Z A; 3ZJU A; 3U4E G; 4NZL B; 2INC C; 1UWM A; 4MH8 A; 1YOV B; 2BS3 B; 3GB1 A; 2DEN B; 2HD5 B; 3CF6 E; 1XLN A; 2MJD A; 4W9H A; 3ZVV A; 2I38 A; 2KN4 A; 1XLQ A; 4RGO S; 3ZKJ C; 3AN1 A; 4FN2 A; 4MGK E; 1N62 A; 3ZRC A; 1AN8 A; 1A5R A; 4EZJ A; 5D2M B; 2WXP A; 1K53 A; 3A33 B; 2OOB B; 4IM2 A; 2PIA A; 3EUB 2; 4A6Q A; 2ZW1 A; 4TKN A; 3TBL D; 1LM8 B; 4B9K A; 1STE A; 1XXG A; 1L2N A; 2W9N A; 3IXS A; 4ASW C; 2PLP A; 1SXT A; 4BBN C; 5IAA C; 1V1O A; 2K1F A; 4W9E A; 2KWD A; 1XO3 A; 1JRU A; 1I4R A; 4J3O D; 1GB1 A; 2M17 A; 4YTP B; 1OQY A; 4KSL C; 4KZ0 A; 1L7Y A; 3JVZ X; 3R8B A; 3R7Q A; 1FXT B; 4LLG M; 3SHQ A; 4PT5 A; 3VAW A; 2FE8 A; 1Z5S B; 2QIE B; 2O6V A; 2ZNV B; 2JWZ A; 2W54 A; 3KWV A; 1RLF A; 1XF5 L; 2L0F A; 5HKH A; 1WSP A; 3N3K B; 3FKY A; 2HTH A; 3VFK A; 1SGH A; 4MM3 A; 2KAN A; 4HEA 1; 2DZK A; 3Q69 A; 3RUI B; 4KSK C; 2JXX A; 4R3D A; 4C80 A; 1ZDX A; 2R2Q A; 3NVV A; 1XLP A; 5E6P A; 3UIO B; 3U7Z A; 2LXC A; 2VH1 A; 1ZKH A; 3RCZ A; 3R3M A; 1MI0 A; 2WDV B; 2KFJ A; 3WAP A; 2IO2 B; 5CHF A; 4W9L A; 3W9C B; 2LJ5 A; 4JIO U; 3AEB B; 3PGE A; 4MSQ B; 4BOS C; 2KVR A; 3PLU A; 3BIN A; 2IGG A; 2IY0 B; 3AEG B; 3ML9 A; 3NS8 A; 2IBI B; 3QWZ B; 1LXD A; 4NNJ B; 1NEN B; 4DHJ D; 2N7E A; 3MJ5 A; 2WQY B; 1WRD B; 1FMA D; 3DHH C; 3N20 C; 1N61 A; 3RNF C; 2LMC A; 3RNC C; 4ARC A; 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2W3R A; 2W82 A; 4O1N A; 1V1P B; 4URK A; 3L4P A; 2MBH A; 2WXO A; 4KKI A; 1SE3 A; 1HTQ A; 4JX1 C; 3SR6 A; 2L8J A; 1WMH B; 2RDB C; 3AM9 A; 4I6L B; 4EKU A; 2BWE S; 1P0R A; 4HXD A; 1IGC A; 3BZD B; 1C1Y B; 2KDE B; 2GBK A; 1UGM A; 2BB6 A; 4L23 A; 2ACZ B; 2MH7 A; 2BWF A; 3DVG Y; 2LUE A; 4K81 A; 1M4V A; 4XZ4 A; 3NZ3 A; 4MGZ E; 4WIP A; 4LNN A; 4BOZ B; 1SF0 A; 2FCN A; 4AUQ C; 4II2 B; 4US9 A; 5H8Y E; 1VR9 A; 1PFD A; 4IG7 B; 2MWS B; 3RFZ B; 1VRA B; 1NBF C; 2I2Y A; 2K6Q A; 1Q10 A; 3LDZ E; 2J0M A; 2IDY A; 1YQ4 B; 2WX1 A; 2H88 B; 1XLO A; 5GXG B; 2FUG 1; 4ANW A; 1YD8 U; 2WXN A; 3P4P B; 3L16 A; 1SB3 C; 4WAA A; 1MPE A; 2BVC A; 4AQ7 A; 2RD0 A; 2WLB A; 2K39 A; 2XK5 A; 5BMG A; 3I9V 1; 3MJW A; 4ZRQ A; 3JSV A; 5LXH A; 1WX9 A; 3PRP B; 1IP9 A; 2WNM A; 2WU2 B; 2MW5 A; 1UBI A; 4LNF A; 2J7Q B; 1XQQ A; 3NOB A; 5EDS A; 2NR2 A; 1EUV B; 1VZ6 A; 1KLV A; 5TSS A; 1KLU D; 5IN7 A; 5LXI B; 1KFY B; 4OHJ A; 1K51 A; 2JT4 B; 1WGH A; 2Z0D B; 3MC8 A; 4WJQ A; 3GZN I; 2DWQ A; 2FUH B; 1QF6 A; 1NYR A; 2R2O A; 1WR6 E; 1R4N B; 3KYD D; 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