The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
56
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structure length |
56
|
Chain Sequence |
TTYKLILNLKQAKEEAIKELVDAATAEKYFKLYANAKTVEGVWTYKDETKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
De novo protein
|
| source organism |
Artificial gene
|
| publication title |
NMR structures of two designed proteins with high sequence identity but different fold and function
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Gb88
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| total genus |
13
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-10-25 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3FIL A; 2ONQ A; 1P7F A; 2EEL A; 2JSV X; 2PLP A; 5BMH A; 2IGH A; 3MP9 A; 1PGA A; 2QSD A; 1MHX A; 1KH0 A; 2N9K A; 1PGB A; 2ZW0 A; 1IBX B; 2GB1 A; 5HFY A; 1MVK A; 1K53 A; 2JZP A; 2QMT A; 3UI3 A; 1IBX A; 1FD6 A; 2ON8 A; 1K51 A; 1P7E A; 2NMQ A; 1F2R C; 1HEZ E; 5HHD G; 2KWD A; 1EM7 A; 1YNT E; 2RMM A; 2I2Y A; 4IKG A; 4KGT A; 5BMI A; 1XCQ L; 4HKZ E; 1ZXH A; 2PTL A; 4OZB A; 4KGS A; 2RPV A; 4IOI E; 1MPE A; 2PW9 A; 4OZA A; 1K52 A; 2JXT A; 1JML A; 2LHE A; 2ZW1 A; 5JXV A; 3GB1 A; 1GB1 A; 1IGD A; 2KQ4 X; 1FCL A; 1GB4 A; 2J53 A; 2KN4 A; 5BMG A; 2N9L A; 2LHD A; 4D2K A; 5HG2 A; 3FIL B; 1MHH E; 2KDM A; 1HZ5 A; 2JWU A; 4WH4 A; 2JU6 X; 1YMH E; 2IGG A; 2N7J A; 1C9F A; 2GI9 A; 2KAC A; 4KGR A; 3V3X A; 2IGD A; 1MI0 A; 1F2R I; 1D4B A; 2LUM A; 4HJG E; 1XCT L; 1FCC C; 1PGX A; 4GLS C; 2LGI A; 5HI1 A; 4OZC A; 4MAC A; 2OED A; 1QKZ A; 1UWX A; 1K50 A; 2I38 A; 1Q10 A; 2J52 A; 1IGC A; 2K0P A; 1HZ6 A; 1XF5 L; #chains in the Genus database with same CATH topology 3W1S C; 1E5W A; 5LNK 1; 1T3Q A; 1PUT A; 1DOY A; 3NVZ A; 4RGT A; 1EU4 A; 4GXB A; 2EMS A; 3AEC B; 2RD0 A; 1Y8R C; 1E6E B; 1UZX B; 4KIK A; 3RNB C; 1T6B X; 2OHF A; 2OJW A; 1RLF A; 5AZH A; 2KD0 A; 1J19 A; 1MVK A; 2INP E; 5FK9 C; 3VFK A; 4CO7 A; 4B0E A; 3IG3 A; 1RWS A; 2M19 A; 2ZCC A; 2MEK A; 4L23 A; 2JZZ A; 4IM0 A; 3CMM B; 4FAD A; 4IKG A; 1XQQ A; 3SR6 A; 3O13 A; 3TUO A; 1ET6 A; 2QCZ A; 1VRA B; 3ZDM C; 4K1R B; 2IYD B; 4GMV A; 3EUB 2; 2MRP A; 1DGJ A; 1YN3 A; 1UGJ A; 1QLB B; 5TSS A; 5JXV A; 4ASW C; 1ZP0 B; 4LCD E; 2OOB B; 3ZKJ C; 1OFF A; 3RUI B; 4ACF A; 1GB4 A; 3SD5 A; 2R2O A; 1STE A; 1WZ3 A; 3R7R A; 3BY4 B; 4ARC A; 2JWU A; 2NBV B; 1FNV A; 4WAA A; 2HE7 A; 2MBQ A; 2XEW A; 2C7N B; 2N7J A; 4ZHO A; 1R4N B; 2JF5 A; 4YWG G; 1FRD A; 1A70 A; 2MBE A; 2JWZ A; 3D32 A; 4GGQ A; 3I5J C; 5HI1 A; 2JT4 B; 3AB5 A; 4K81 A; 4M01 A; 4JWS C; 1RFK A; 2KN5 A; 3PTF C; 1K50 A; 1R4N I; 4W9G A; 3UIO B; 1HZ6 A; 4W9D A; 3TEZ A; 1JWM D; 1V49 A; 1JWB D; 4N9F 4; 2J0M A; 4BKT A; 3TJP A; 5DPT A; 1IP9 A; 2LEK A; 2LZ6 A; 3KWV A; 3L54 A; 4TQ1 A; 3DHG C; 4P16 A; 2DAJ A; 2LGS A; 1M94 A; 3RNC C; 1WGG A; 1CQV A; 2BYE A; 2ASQ A; 3VR8 B; 3LDZ E; 4NJ6 A; 2JZP A; 4BBN C; 2QMT A; 4IM3 A; 3L4P A; 3BK1 A; 1V81 A; 2IO2 B; 2L0F A; 4NJ7 A; 2JY6 A; 3LB8 C; 3BIN A; 1L2N A; 3H7P B; 1RFA A; 4A6Q A; 1XO3 A; 2BWF A; 2UYZ B; 4RF0 A; 1SGH A; 2WP9 B; 2PE6 B; 4A55 A; 1XD3 B; 3N3K B; 3DCG A; 3CF6 E; 2WXR A; 2G9H D; 4A3O A; 4RGO S; 1WXQ A; 2PPH A; 4OZA A; 5L83 A; 2PMV A; 4YT0 B; 4E74 A; 3M3J A; 4GDK A; 3H1U A; 5G55 A; 1UUP A; 1YQ4 B; 2ZNV B; 3E9S A; 3PHX B; 3PRP B; 1WRI A; 3VUX A; 5EE3 A; 4NAW B; 4BKS D; 3W5U B; 4WH4 A; 3U8Z A; 2DZI A; 2KTR B; 2KK8 A; 2KZR A; 1JRO A; 3DDC B; 5T8I A; 1D5X C; 3ZYY X; 2KDI A; 4NNJ B; 3RN9 C; 4AUQ C; 3L0W B; 3Q8C A; 2LGI A; 4A9A A; 5BO4 B; 1ACC A; 5BYR A; 1F52 A; 1B1Z A; 2WX0 A; 1AN8 A; 1QKZ A; 1NEK B; 3K9P B; 2J0K A; 2Y3A A; 2MA9 B; 3FIL A; 4ANX A; 2XK5 B; 2JSV X; 3JSV B; 1T0Y A; 2MSE D; 3RNF C; 4ZRK A; 4MM3 B; 2KX3 A; 1UH6 A; 2UWQ A; 2WXP A; 2LMC A; 3DBH I; 4XZ4 A; 5D7G A; 2C60 A; 1I35 A; 2RR9 A; 3DBL B; 2NCN A; 4B6W A; 4JPS A; 3TEY A; 1F9J A; 2C9W B; 2WU5 B; 4WQO B; 2CU3 A; 3AM9 A; 3A4R A; 2TSS A; 1OGW A; 2RSU A; 2AL3 A; 4QAY A; 4M00 A; 3PLU A; 2O2V B; 1GPX A; 2HDE A; 3RUL A; 3Q3O C; 4NZL B; 3IFW B; 3A9J B; 3WIM A; 3T9L A; 2K1F A; 3DBL I; 1WX7 A; 3N20 C; 2PE9 A; 4ZRP A; 3VRA B; 2H88 B; 2KAJ A; 3PZ8 A; 3W1Y A; 4A8X C; 3FKY A; 4RGN A; 3ZRF A; 2N7D A; 5E6O A; 1GOZ A; 1BUI C; 4IOI E; 4J6I A; 3ZUN A; 1K52 A; 1J7B A; 3V60 A; 1KLV A; 2N0S B; 1E10 A; 2QJL A; 2ICI A; 1A5R A; 3DBR B; 1FRR A; 4D2K A; 5HG2 A; 3OJ4 B; 5J18 A; 1P3Q U; 1AYF A; 2X38 A; 2Z59 B; 3AE4 B; 4ZRI A; 4WJO A; 4CYE A; 5I4D A; 2NTT A; 1T0R C; 3PS6 A; 1J7C A; 4OVZ A; 2BVC A; 2KYW A; 4C7Z A; 2IY0 B; 1F0Z A; 3CWI A; 4MJS A; 3VXW A; 3VTV A; 3DBR I; 3ALB A; 3U7Z A; 2KQ7 A; 4B95 A; 1T0Q C; 1GNU A; 3DVN U; 1BML C; 1JCK B; 4W9I A; 4EOY A; 1L0Y B; 3GZN B; 3IXS A; 2PVO D; 1M4V A; 3VTU A; 2WXN A; 2N9E B; 3QAQ A; 2V4I B; 1FEH A; 5CHV C; 2IO0 B; 3PGE A; 2G45 B; 1WJ6 A; 2VH2 A; 4HPL B; 2BT6 A; 1Z5S B; 2LJI A; 2AQ2 B; 2AYO B; 2XBB C; 3W9C B; 4CQN A; 1QZE A; 4AP4 C; 5IA7 A; 4G11 A; 4XWT A; 2WXK A; 2N9K A; 3R7Q A; 2ZVO A; 2FUH B; 2C5L C; 3GZN I; 2CHX A; 3EC8 A; 1HTO A; 3R8B A; 2DZJ A; 3AXC A; 1PQS A; 3IVF A; 3BVM A; 3QCA A; 4KDI C; 3V62 A; 5C3J B; 1QIL A; 2REX A; 4EZK A; 1YN4 A; 1WR1 A; 1Y56 A; 1V6E A; 1V80 A; 1S3S G; 1I4X A; 2OJR A; 4EFO A; 5EE0 A; 1QOF A; 1C77 A; 2K8B A; 1TJE A; 1ESF A; 2QDF A; 2RPQ A; 3RMK C; 3V05 A; 4XYC A; 2L52 A; 1C78 A; 3ZO5 B; 3DBS A; 4XDD A; 1EWY C; 5C23 A; 4LDT B; 2MH7 A; 3X0W A; 1TS5 A; 1WGY A; 4TSS A; 2V0G A; 4WWO A; 1C4A A; 2WXG A; 5BMG A; 3R66 C; 3VRB B; 2QIL A; 1SJE D; 4HWI B; 1KFY B; 4DWF A; 3VAW A; 2G4S A; 1L4D B; 2IGG A; 2KHW B; 3H8H A; 1C3T A; 1V1O A; 1CK1 A; 1KLU D; 3MJW A; 4GSW A; 2CHZ A; 3I57 A; 1P0R A; 4LJP B; 3DHH C; 4IWQ A; 4KKI A; 2MX2 A; 4OZC A; 5KHO A; 4S17 A; 5FR6 A; 2LAS A; 4KSK C; 3M63 B; 3KH0 A; 2EEL A; 1KM7 A; 2WYQ A; 1LXD A; 1WSP A; 1OTR B; 2JYT A; 2WNM A; 4M02 A; 1WX8 A; 4WWM A; 3BVG A; 4JIO U; 3P4S B; 1WGR A; 3Q3M C; 1C1Y B; 2YEP B; 4MH8 A; 2JRI B; 2ZCB A; 4LNI A; 3ENE A; 5DCN A; 4IW0 A; 1UBI A; 3NJT A; 1MG8 A; 1KTK A; 3T3O A; 3KUC B; 1HEZ E; 5LXI B; 3UF8 A; 1OQQ A; 3RZF A; 1GC7 A; 2ZNV C; 1WJU A; 4IDI A; 4P1B C; 5IAA C; 1FNU A; 2AQ1 B; 4GU2 A; 1ROE A; 2D07 B; 1V1P B; 4MSM B; 2PKO A; 3QIJ A; 4EZJ A; 1V5O A; 4KGS A; 3Q3N C; 3TIX A; 1TS4 A; 1EF1 A; 2GLS A; 4KKJ A; 1RM6 C; 4EZL A; 2M8S A; 4URK A; 2MJE A; 3ABV B; 4MGZ E; 1P1A A; 2AWT A; 3AED B; 1L4Z B; 3ZNG C; 2BPS A; 3X23 A; 3V3X A; 1N62 A; 4GDL B; 2YVC A; 4DBG A; 4HJG E; 2L05 A; 1XCT L; 4TV3 A; 1R4M B; 1YD8 U; 2CKH B; 3ZQ4 A; 2K39 A; 3ZLZ A; 3VHT C; 1RRB A; 2CJN A; 2WHI A; 3ZJT A; 2DZM A; 4MEL A; 1WI0 A; 2ONQ A; 2LGY A; 3QJZ A; 4YTM B; 1R4M I; 2BYT A; 5GXG B; 3A33 B; 1TIF A; 1CZP A; 3MP9 A; 2NBU A; 3DQV A; 5AZF A; 1LQB A; 2N4F A; 4LTU A; 3QQ8 B; 1Q1O A; 1Z2M A; 1YJJ A; 4HPP A; 3VR9 B; 3OG5 A; 3H7S A; 1WM2 A; 2BS4 B; 2BYF A; 2GBN A; 1VZ7 A; 1TBE A; 2IZV B; 1N6Z A; 3VTW A; 1CMX B; 4FJZ A; 4C00 A; 3RPF C; 2RDB C; 1F1H A; 3UIN B; 2WXM A; 4BOZ B; 3URY A; 2H89 B; 3EFC A; 1YJI A; 4EEW A; 2M1M A; 4G50 A; 3U30 A; 5D6J B; 4HPM B; 1JRP A; 2IJ0 A; 1WGK A; 3VVW B; 2DNF A; 1ZKH A; 1ZGU B; 3MC8 A; 2G4D B; 1ZOY B; 2WXQ A; 1WFY A; 2LRU A; 1HQR D; 2LHD A; 3PVL A; 1E8Y A; 3FIL B; 4LDT D; 3B0A A; 1JWA D; 2JU6 X; 2V3P A; 3ZIM A; 1IYF A; 1NBF C; 2IBI B; 3B2G A; 1L0V B; 2GI9 A; 4BBN F; 1SSN A; 2M56 B; 4B9K A; 3ZNH B; 1QT9 A; 1WMH A; 2L83 A; 1JWS D; 2L0T A; 2Z0D B; 2JZ3 B; 4L1B A; 1VDV A; 3UGB B; 3DWG C; 3KLS X; 1IUE A; 2K22 A; 1L7Y A; 4PYZ A; 2WDT B; 1U4A A; 1SXT A; 1QQR A; 1C76 A; 4LNK A; 2I38 A; 2DYB A; 5E6P A; 1KOT A; 4AJW A; 3DWM A; 4KZ0 A; 5G5G A; 3B08 A; 1AWD A; 3QX1 A; 1KJT A; 2L32 A; 3OLM D; 3U52 E; 1IBX B; 3TSS A; 2KMM A; 2CJO A; 4K3C A; 2KOX A; 3SFD B; 2GRI A; 4I6N B; 3TBL D; 4AOF A; 5IOI A; 1I4R A; 4PT5 A; 2LFI A; 2ON8 A; 1P7E A; 2D10 A; 3OAW A; 5IP4 D; 1FFV A; 4IC7 B; 2Z0E B; 1FXT B; 4IG7 B; 1C79 A; 1ET9 A; 3BK2 A; 5AUI A; 1WM3 A; 2EKI A; 2M0A A; 5CHF A; 3DOW A; 3HVD A; 3EEC A; 3ZJV A; 3ZGZ A; 1P98 A; 2CU1 A; 2NPT A; 3I3T B; 4XGA B; 1YX6 B; 3ML9 A; 3V61 A; 3RNE C; 5MPO A; 5E6N A; 2WXH A; 4H2A A; 4RF1 A; 1LM8 B; 2ZW1 A; 3I63 C; 2NR2 A; 1FFU A; 2L1A A; 1TGZ B; 3UQB A; 3KYD D; 1HZ5 A; 3P1M A; 1XLQ A; 3ZNI D; 4TUU A; 5JZE B; 3Q8E A; 4FA6 A; 3FC4 A; 2KAC A; 3MC9 A; 5G5H A; 4DHZ B; 4XX5 A; 3PRE A; 1E0Z A; 3GP7 A; 2KJ6 A; 4IWO A; 3PLV A; 2MP2 A; 4YTN B; 2FID A; 1TS2 A; 3AE7 B; 1C4P A; 4JE3 B; 4ZYS A; 4W9F A; 1SEB D; 2FE8 A; 2ZJD A; 2WLB A; 1L6V A; 1J8C A; 1I7H A; 4DXG A; 4ZRJ A; 4HCP B; 2LWP A; 2N1W A; 1E90 A; 3AEB B; 2WDV B; 2EKE C; 3KWL A; 3A1Q A; 2V3S A; 2N1V A; 3HK0 A; 1MHX A; 3DVG X; 2W82 A; 5AUK A; 1KH0 A; 1PGB A; 2K8H A; 2BTE A; 2KDF B; 4W9L A; 1UWM A; 2LRW A; 2MJ3 A; 1WIA A; 4LNF A; 3A4S C; 3ZXV A; 3UQA A; 3TEW A; 4HEA 1; 2I1J A; 1TYG B; 2MJD A; 2KMA A; 1V9J A; 4RFB A; 1TTN A; 3ETR A; 4LNN A; 1FNW A; 2O6V B; 1P9D U; 3C19 A; 4HVB A; 3BYY B; 1NI2 A; 3OJ3 A; 2JPH A; 2VZK B; 4BAX A; 4WJP A; 2WGS A; 4P1C C; 1ZE3 D; 3B1L X; 3NY5 A; 3LJ3 A; 4LJO B; 2KQ4 X; 2D3G A; 1FCL A; 5AEK B; 3AE5 B; 3HM3 A; 2N9L A; 1Q0W B; 2L00 B; 2KXJ A; 4BZA A; 1LO5 D; 1SJH D; 2K25 A; 1EF5 A; 1YMH E; 1VR9 A; 3DVN V; 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1XLP A; 2DHZ A; 3PO0 A; 3Q2A C; 4MAC A; 4PS7 A; 3L17 A; 5D3D A; 4P6V F; 1YQ3 B; 3QHT A; 2GBR A; 4W9C A; 1LGR A; 2JUO A; 4KIK B; 2V4L A; 2INN E; 5BMH A; 3NZ3 A; 3K9O B; 2D2Q A; 2JRH A; 3WAP A; 3HVZ A; 4G0N B; 2XK5 A; 3JSV A; 3LYY A; 2FCN A; 2G3Q B; 2KWC A; 1YOV B; 3P42 A; 1B9R A; 3EA6 A; 4MM3 A; 1JWU D; 1TY0 A; 2NVU I; 4KDL B; 1YN5 A; 2D11 A; 1GUA B; 4MGY E; 2MCN B; 2NMQ A; 3PZ7 A; 4DQO C; 3AMZ A; 3IT4 B; 3NOB A; 4OVV A; 2KKC A; 2O2V A; 2KDB A; 3GE3 C; 3RD2 A; 2G1E A; 5L95 C; 3NZU A; 4RGM A; 4N6E B; 3AU4 A; 1S1Q B; 2O6V D; 1SE2 A; 3VDZ A; 4AQ7 A; 4Q2J A; 2DEN B; 3FAH A; 4KX6 B; 4YSZ B; 2VZK D; 1FXI A; 3BYT B; 1PYW D; 4XWW A; 2WXJ A; 3GOE A; 2MLB A; 2LI5 A; 4JL9 A; 3NS1 A; 1GB1 A; 4BFR A; 4PK1 A; 1X1M A; 2A4Z A; 4HK2 A; 3IAM 1; 3L13 A; 4M8N A; 3R2I A; 3W1S A; 4REZ A; 1LFD A; 3RCZ A; 3PRM B; 1WY8 A; 2WXL A; 1WXA A; 3MFG A; 3NVV A; 4XC2 A; 3RZW C; 3ZDT A; 1V86 A; 3L16 A; 3CIR B; 3P4R B; 3KQ4 A; 1RYJ A; 4W9E A; 1SIF A; 1GC6 A; 2MWS B; 1ZXI A; 1YX5 B; 1YQB A; 3IHP C; 4JX1 C; 3WAN A; 3VUW A; 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