The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
64
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structure length |
64
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Chain Sequence |
MEEVTIKANLIFANGSTQTAEFQGTFEQATSEAYAYADTLKQDNGEWTVDVADQGYTLNIQFAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Protein stabilization and the hofmeister effect: the role of hydrophobic solvation
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Peptostreptococcus magnus
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| molecule tags |
Immune system
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| molecule keywords |
Protein L
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| total genus |
15
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| structure length |
64
|
| sequence length |
64
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-01-11 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4D2K A; 1UWX A; 2KQ4 X; 2PLP A; 2N9L A; 4MAC A; 5HI1 A; 2J52 A; 5JXV A; 5BMH A; 1K52 A; 1XCQ L; 2KAC A; 1MHH E; 4HJG E; 5BMI A; 2KN4 A; 2I2Y A; 1YMH E; 1C9F A; 1F2R C; 2JXT A; 3GB1 A; 3UI3 A; 3V3X A; 4IOI E; 2N7J A; 4KGS A; 2LHE A; 1MHX A; 1K50 A; 3FIL A; 5HFY A; 4OZA A; 1GB4 A; 1PGB A; 2PW9 A; 2JZP A; 1JML A; 1IGD A; 1HZ6 A; 2GB1 A; 1K53 A; 1EM7 A; 2ON8 A; 2J53 A; 1K51 A; 1HEZ E; 1P7E A; 2NMQ A; 1IBX A; 5HHD G; 4HKZ E; 5BMG A; 1MPE A; 2IGH A; 2KDM A; 2RPV A; 1ZXH A; 4GLS C; 2N9K A; 1QKZ A; 1IGC A; 1MVK A; 2ZW0 A; 2KWD A; 1D4B A; 2GI9 A; 2JU6 X; 2I38 A; 1Q10 A; 2ONQ A; 4IKG A; 1HZ5 A; 1KH0 A; 1YNT E; 1XCT L; 5HG2 A; 1FD6 A; 2PTL A; 4OZB A; 2JWU A; 2QSD A; 4KGR A; 4OZC A; 1FCL A; 2OED A; 1XF5 L; 1MI0 A; 2JSV X; 1PGA A; 2LHD A; 1PGX A; 2LGI A; 4KGT A; 1P7F A; 1IBX B; 2RMM A; 2QMT A; 1FCC C; 1GB1 A; 1F2R I; 4WH4 A; 2EEL A; 2ZW1 A; 2LUM A; 3MP9 A; 2IGG A; 3FIL B; 2K0P A; 2IGD A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1R4N B; 2KQ4 X; 2WXL A; 2V4I B; 4M01 A; 4N6E B; 5EE0 A; 1F77 A; 1GAQ B; 4FN2 A; 2GBM A; 1M94 A; 2MSE D; 3NVZ A; 3TMP B; 3DBH B; 2IO1 B; 1I4P A; 5TSS A; 1XT9 B; 3Q14 C; 3IT4 B; 4EE2 A; 3NZU A; 4HVB A; 3U2S C; 2KN4 A; 3NVV A; 3AE8 B; 2FID A; 1XD3 B; 2ZNV C; 4JE3 B; 2LVQ A; 2UYZ B; 2DYM A; 4JQW C; 4L23 A; 1LM8 B; 3VR9 B; 1SSN A; 4NY0 A; 5E6N A; 3RUL A; 3QQ8 B; 2D3A A; 4S0R A; 4ZYN A; 4XX5 A; 4KIK B; 1CK1 A; 1EM7 A; 1XQQ A; 3R7Q A; 3T3O A; 1UUP A; 1WGH A; 4MEL A; 2KHW B; 3HHM A; 2YEP B; 5G5G A; 4BKS A; 1KF6 B; 2D3G A; 4AOF A; 2M19 A; 1SBB B; 2AYO B; 3ONS A; 1C78 A; 2L05 A; 5E6O A; 3NVW A; 3ZXR A; 4DDG D; 2WWZ A; 1IGC A; 2KAN A; 2HDE A; 2KXJ A; 5DPW A; 4YL8 A; 3HIZ A; 1NEN B; 1ZDV A; 1YJI A; 3PTF C; 1WM2 A; 3VR8 B; 3ZLZ A; 4LLG M; 5C3J B; 3RZW C; 3HM6 X; 3NY5 A; 1JWU D; 4AP4 C; 4DWF A; 4ITK A; 1H8C A; 5T8I A; 1KJT A; 2JX5 A; 4XGA B; 2KFK A; 3CMM B; 1FXA A; 4II2 B; 1E10 A; 1PGX A; 1RFA A; 4B95 A; 4AQ7 A; 2CR5 A; 4J3O D; 2WXM A; 2QMT A; 1WYW B; 3B9J A; 3U8Z A; 1L4Z B; 2KJR A; 1C1Y B; 4KV2 A; 1M4V A; 2AQ3 B; 2EMS A; 2N9E B; 2K8H A; 2IGG A; 2H89 B; 3AB5 A; 1LFD A; 1UWX A; 2L8J A; 2N9L A; 2O6V A; 1N5W A; 2K1F A; 4URK A; 4MSQ B; 4WJO A; 3A9K B; 2ZVO A; 3R7R A; 2PE6 B; 3OAW A; 3X23 A; 2W82 A; 4OVV A; 3SHQ A; 1TT5 B; 4PS8 A; 2KT7 A; 4ZHP A; 2FCQ A; 2KN5 A; 2KK8 A; 4YTN B; 3SD5 A; 4HRO A; 4C4V A; 2J7Q B; 2EKE C; 4P7I A; 4HRS A; 3E56 A; 1JWA D; 2KJH B; 2NTT A; 3DQV A; 3DBR B; 3A4R A; 2BB5 A; 4KX6 B; 3EFU A; 4A3P A; 2BYT A; 5L95 C; 4AS1 A; 1CZP A; 4ZHO A; 2FCN A; 5AZF A; 3W1S C; 1P3Q U; 1JWS D; 3I63 C; 1TKG A; 2HTM E; 2G9H D; 3BK1 A; 1TJE A; 2RSU A; 3JYU A; 3APC A; 3IAS 1; 2INC C; 1FMA D; 2J42 A; 4W9K A; 4IWO A; 2HTH A; 1EWY C; 4MM3 A; 4PT5 A; 3ECI A; 2FIF A; 2WXF A; 1JW9 D; 1D3Z A; 5FR3 A; 2VH2 A; 4K3B A; 3DWG C; 1C4A A; 2K8C A; 2UWQ A; 1E8X A; 2LRW A; 4DHJ B; 1XO3 A; 2QSD A; 5LLI A; 3KWV A; 1EU4 A; 2IJ0 A; 3Q69 A; 3ZKJ C; 2MBB B; 1I4X A; 1RYJ A; 2GBJ A; 4B0E A; 1BML C; 2KWV B; 2RPQ A; 1IBX B; 1D5Z C; 4AJY B; 2N9X A; 1T6B X; 4G50 A; 4H2A A; 3M63 B; 2KOX A; 3FIL B; 5DPS A; 2IGD A; 2IYD B; 3NRZ A; 3RD2 A; 4C7Z A; 3BK2 A; 1AAR A; 2MRP A; 3UIN B; 4ARI A; 1WX8 A; 4FUL A; 1TY2 A; 1N61 A; 5BMH A; 4BOZ B; 4TSS A; 3O65 B; 4GGQ A; 2WGS A; 4Q2J A; 1DOX A; 2CJN A; 1DYQ A; 4GSW A; 4YSY B; 1E6E B; 2C7N B; 4P1B C; 3U7D A; 3ENE A; 3PSE B; 2I2Y A; 1C9F A; 1OQQ A; 2RDH A; 2RD0 A; 1FM0 D; 3CSF A; 2WXK A; 1C79 A; 3TEZ A; 1WY8 A; 1FRR A; 1MHX A; 2CU1 A; 4K7U A; 1P1A A; 3IBE A; 1JWM D; 2C5L C; 3BYY B; 3IHP C; 4K3C A; 4WQO B; 2QHO A; 3BVZ A; 2OHF A; 2MHJ A; 3ZW3 A; 5DPT A; 2KZR A; 3N1X C; 5DCN A; 4HKZ E; 3AEG B; 1WXV A; 2PKO A; 3ALB A; 4GLS C; 2JZ3 B; 1RLF A; 2NPT B; 1OQY A; 1YQB A; 2BB6 A; 2GI9 A; 3QIJ A; 3PVL A; 1Z5S B; 1Z2M A; 1SEB D; 5H92 C; 2M8S A; 3VRB B; 4HDQ A; 2INN E; 2AQ2 B; 5HKH A; 1QOB A; 1KH0 A; 3MC8 A; 5IP4 D; 3DBH I; 2V0G A; 4DK5 A; 4GDL A; 5KHQ A; 3NZ3 A; 3P4P B; 2DWQ A; 5FKA C; 2KYW A; 4RCO A; 1GOZ A; 2CHX A; 2GOW A; 2I1J A; 2LGX A; 2QCZ A; 1WR6 E; 1R4N I; 2L76 A; 4N58 A; 1L0V B; 2FUG 1; 5DPR A; 2GBR A; 3R2T A; 3NG0 A; 2WDV B; 2DHZ A; 3QAR A; 3VTW A; 2WX1 A; 5EE9 A; 2JYT A; 3BVM A; 2WXG A; 4GN1 A; 3GE3 C; 1A70 A; 4A55 A; 1AWD A; 2L83 A; 1E8W A; 1WJN A; 2BPS A; 3OJ4 B; 3C19 A; 1EF1 A; 1UGJ A; 1FFU A; 4W9E A; 2I1K A; 4DHZ E; 4HPP A; 5D94 A; 3DPD A; 3V3X A; 4IOI E; 4ANW A; 5CX3 A; 5E6J A; 2V3P A; 3AE3 B; 3URY A; 2FE8 A; 5EE3 A; 2XBB C; 3HRD D; 1JML A; 3H6N A; 3WAL A; 4AWJ A; 4YSZ B; 2AQ1 B; 3SR6 A; 1V97 A; 1VDV A; 2MLB A; 4LNO A; 2JT4 B; 2GMI C; 1MG8 A; 3RI7 C; 3SDL C; 3I57 A; 2ZW0 A; 3ZTC A; 4DDI D; 3UF8 A; 1WR1 A; 2W3R A; 3VVW B; 1EF5 A; 1UBI A; 4NAW A; 4WAA A; 3E9S A; 4HEA 1; 1GJZ A; 4EUT A; 3VH3 B; 3APD A; 3MJ5 A; 2JF5 A; 2LUE A; 5CHW A; 2ZZP B; 4FHK A; 4KGR A; 4XDC A; 2JQR B; 5L83 A; 2KTR B; 4F1S A; 3P4Q B; 1CMX B; 4B9K A; 1LO5 D; 2L0T A; 4ANX A; 1P7F A; 2NBV B; 1IPG A; 1CQV A; 2Q5W D; 3HK0 A; 4FAD A; 1PYW D; 2M0A A; 5LNK 1; 3SU8 X; 1FFV A; 3DHG C; 4EZJ A; 3RPF C; 4HPL B; 3L13 A; 3KUZ A; 4ASW C; 3U52 E; 3I5J C; 5D6J B; 1I4Q A; 2IO3 B; 2WXJ A; 3AED B; 4IC7 B; 2WHI A; 3KYD D; 1WRI A; 1V8C A; 4LNF A; 2LHE A; 2VZK B; 3M95 A; 1HXY D; 4JGH B; 2JUO A; 2X38 A; 3PRE A; 1ZGU B; 1RAX A; 4LDT D; 4GDL B; 1YN5 A; 4LTU A; 3UIP B; 4CO7 A; 4W9L A; 1WXA A; 4NJC A; 4N9F 4; 2LJI A; 2KX3 A; 3Q8E A; 2BTE A; 4F7Z A; 1QZE A; 2KO3 A; 1VLB A; 1OFF A; 1P9D U; 2CKH B; 3BWU D; 1EWC A; 3Q3F A; 3IXS A; 2KKC A; 3ZQ4 A; 3Q6B A; 3VTV A; 2JU6 X; 4KKI A; 2LXC A; 4RGN A; 1LQB A; 2KX0 A; 3SFE B; 2A4Z A; 2IBI B; 3AE4 B; 2WLB A; 2Z0D B; 1V1P B; 3RN9 C; 3V6E B; 3LB8 C; 3AE6 B; 3KUC B; 3LDZ E; 2NCN A; 3VH4 B; 2O2V B; 2VH1 A; 3Q8F A; 2GBK A; 2N7D A; 1VD2 A; 4IM0 A; 4XE0 A; 4B6W A; 5JH5 C; 3UQB A; 4MGI E; 1WJ4 A; 2KWC A; 1L6U A; 1BXT A; 2XN9 C; 4ZOH C; 1T0Q C; 2YEP F; 5JZE B; 5GMV A; 4MAC A; 3VAW A; 1WRD B; 3H8H A; 3PHX B; 3EA6 A; 3Q8B A; 3P2B A; 3R3M A; 1DOI A; 2Z59 B; 4ZRI A; 2TSS A; 1ENF A; 1STE A; 1ZP0 B; 3W9C B; 3BZD B; 2XEW A; 4A9A A; 1WGY A; 3RCZ A; 1SE4 A; 1IYF A; 2D3C A; 2WXQ A; 4XWW A; 1WXS A; 2DYB A; 4BKT A; 2YLM A; 1WSP A; 4A6Q A; 1WFY A; 1HZ6 A; 4I6P A; 5C23 A; 5BYQ A; 2G3Q B; 2IO0 B; 4CYE A; 3NZS A; 2LD9 A; 1WGR A; 1HQR D; 3MC0 B; 3BY4 B; 1YD8 U; 2WXI A; 1HTO A; 4UDU C; 3RNE C; 1EUV B; 3W1S A; 2CS4 A; 2M56 B; 2MBE A; 1D4B A; 2Y5P A; 2I38 A; 3TUO A; 2DYO A; 3UIO B; 2C9W B; 1ET9 A; 4WJQ A; 1BUI C; 3HUI A; 1YNT E; 3ZTD A; 1FD6 A; 4BFR A; 2PTL A; 1GNU A; 3AE1 B; 4CQN A; 4MSM B; 2KD0 A; 1FNV A; 1YQ3 B; 4JIO U; 1SXT A; 2MBO A; 1XLO A; 1YJJ A; 1ZPS A; 4OVZ A; 3MJW A; 1NEK B; 3AEA B; 1E5W A; 1AYF A; 1C77 A; 1ISN A; 1I4H A; 2RMM A; 3L0W B; 1R4M B; 5CHF A; 3SEB A; 1FCC C; 3QJZ A; 3ZIM A; 2WX0 A; 2YVC A; 4OW0 A; 3MP9 A; 2JRH A; 3IVF A; 2MX2 A; 3PZ7 A; 1V86 A; 2QJL A; 3SFD B; 2KTF A; 1SE2 A; 1QLB B; 2XNA C; 5G55 A; 3QHT A; 1L2N A; 4WUR A; 3EUB 2; 1ACC A; 2W3S A; 3NS8 A; 1I35 A; 1FEH A; 2KMM A; 3IFW B; 3W1Y A; 2KWU B; 1MFW A; 1F52 A; 4YWG G; 1GPX A; 2REX A; 2D2Q A; 3ML8 A; 1QF6 A; 3ZJT A; 2ZCB A; 1YMH E; 4W9C A; 4GMV A; 3BYT B; 2L7R A; 3QK0 A; 4XDD A; 4CHK A; 1V1P A; 2QC8 A; 5J18 A; 2SAK A; 2MCN B; 2WU2 B; 1QT9 A; 4IG7 B; 3JSV A; 3N32 A; 3KLS X; 5I4D A; 5AEK B; 3AE5 B; 4HCP B; 5BMG A; 1WF9 A; 2KDM A; 2QDF A; 4MEM A; 4JWU C; 4TKN A; 1FIQ A; 2KMA A; 2KWD A; 1F9J A; 2QIL A; 1SJE D; 3D32 A; 4I6N B; 1UZX B; 2WU5 B; 4C56 C; 2L52 A; 1JQ4 A; 3KH0 A; 2XK5 A; 3DBL B; 5HG2 A; 2UU7 A; 2M17 A; 4R3D A; 4IUM B; 1H4R A; 3LJ3 A; 2V3S A; 2L1A A; 2JWU A; 4DBG A; 4BVU C; 5IO9 A; 3IAM 1; 3MTN B; 2JSV X; 3AEE B; 3QX1 A; 4KGT A; 1NI3 A; 2MEK A; 1T0R C; 3H9D A; 1G6J A; 2BKR B; 3DHI C; 1L4D B; 2JWZ A; 1XLP A; 3K9P B; 4IDI A; 1V81 A; 3CF6 E; 5EDS A; 2KDE B; 4KZ0 A; 2PLP A; 3TEX A; 3Q8A A; 3KW5 B; 4IWP A; 4NJ6 A; 5FR6 A; 1GC7 A; 2D07 B; 2K9X A; 1ZE3 D; 2BW2 A; 3DVN V; 2GRI A; 2PE9 A; 3VHT C; 5KHO A; 1FNU A; 3I9V 1; 3OJ3 A; 5C2T B; 3QAQ A; 4ZRJ A; 2A5U A; 3AUL A; 1JCK B; 3PLU A; 1YIW A; 1V1O A; 3DBR I; 1GG3 A; 2DLB A; 2V3N A; 3B2F A; 1BT0 A; 2BWF A; 4DHJ D; 4IM2 A; 5MPO A; 2MBH A; 3AU5 A; 1R7S A; 3M62 B; 2GB1 A; 2J53 A; 3JW0 X; 3PRP B; 1K51 A; 2BS2 B; 2PJH A; 3B08 A; 1YN3 A; 1SIJ A; 4YSX B; 3A4S C; 2DZI A; 4ZRQ A; 2LAS A; 4GXB A; 3OG5 A; 2HJ1 A; 2RPV A; 1E0Z A; 2MWS B; 1N6Z A; 1OQR A; 1MVK A; 1QKZ A; 2ACZ B; 1SIF A; 4W9F A; 4G3X B; 4RFB A; 2DZM A; 3MHS D; 5AZH A; 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