The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
64
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structure length |
64
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Chain Sequence |
MEEVTIKANLIFANGSTQTAEFQGTFEQATSEAYAYADTLKQDNGEWTVDVADQGYTLNIQFAG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Immune system
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| source organism |
Peptostreptococcus magnus
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| publication title |
Protein stabilization and the hofmeister effect: the role of hydrophobic solvation
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Protein L
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| total genus |
15
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| structure length |
64
|
| sequence length |
64
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-01-11 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1GB1 A; 5HI1 A; 4KGS A; 2EEL A; 4D2K A; 5BMG A; 2QSD A; 4OZB A; 1FD6 A; 2LGI A; 1KH0 A; 4MAC A; 1PGX A; 2ZW0 A; 2KQ4 X; 2PLP A; 2N7J A; 2GB1 A; 1HZ6 A; 2I38 A; 1PGA A; 1XF5 L; 1JML A; 1IGD A; 1MHH E; 1EM7 A; 1F2R I; 1IGC A; 1Q10 A; 3GB1 A; 2J52 A; 2KDM A; 1MHX A; 1D4B A; 1IBX A; 2OED A; 2J53 A; 2IGD A; 2JSV X; 1FCC C; 2LHD A; 4IKG A; 2RMM A; 2IGH A; 1QKZ A; 1PGB A; 2ON8 A; 2N9K A; 1F2R C; 2PW9 A; 2KWD A; 2N9L A; 1HZ5 A; 5HG2 A; 3UI3 A; 3V3X A; 3FIL A; 1XCT L; 1K51 A; 5JXV A; 4IOI E; 2QMT A; 1P7F A; 4KGR A; 1K52 A; 4OZA A; 2KAC A; 2PTL A; 1C9F A; 5BMH A; 2KN4 A; 2ONQ A; 3MP9 A; 4OZC A; 5HHD G; 4WH4 A; 2JU6 X; 2LUM A; 5BMI A; 1FCL A; 2JXT A; 2IGG A; 2GI9 A; 5HFY A; 1XCQ L; 2NMQ A; 2JZP A; 4GLS C; 1IBX B; 1MPE A; 4HJG E; 1UWX A; 1YNT E; 1HEZ E; 2ZW1 A; 1K53 A; 1MVK A; 1K50 A; 1ZXH A; 4HKZ E; 2LHE A; 2JWU A; 4KGT A; 2K0P A; 2RPV A; 1P7E A; 3FIL B; 1GB4 A; 1YMH E; 2I2Y A; 1MI0 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1FFV A; 2JPH A; 1QF6 A; 2A5U A; 3PV1 A; 2WXO A; 2XEW A; 2BYF A; 2JRH A; 2CHX A; 1T0Y A; 3NY5 A; 3UIO B; 1C1Y B; 2W3R A; 4II2 B; 4ZHO A; 2XBB C; 1YD8 U; 2HTM E; 3SR6 A; 5LLI A; 1YQB A; 3RNE C; 3TEY A; 4M0W B; 2WHI A; 3ZDM C; 4W9K A; 2WDT B; 4K3B A; 1QOB A; 2KX0 A; 4JLC A; 4OVZ A; 4GSW A; 2J52 A; 3PZ8 A; 1DYQ A; 2KQS A; 2L00 B; 3HM6 X; 2V1Y A; 1FXA A; 4O1N A; 2KJH B; 4BVU C; 2WXL A; 1SE4 A; 4R3D A; 3ZO5 B; 2KJR A; 1WE7 A; 4KDL B; 1D6E C; 2WXQ A; 3DVN U; 4B9K A; 2KJ6 A; 1V97 A; 1VZ7 A; 5J2R A; 2ZEQ A; 1E5W A; 5J18 A; 2KMM A; 5FR3 A; 2KQ7 A; 3NS8 A; 3C0R B; 4PS8 A; 3PHW B; 1FNW A; 3W1Y A; 3VHT C; 3MP9 A; 1HA5 A; 1IYF A; 5FK9 C; 1WZ0 A; 3P63 A; 2TSS A; 4AP4 C; 4P1C C; 4RGO S; 3URY A; 2BWE S; 3W2D A; 3UQA A; 1RAX A; 2ZZP B; 3NS1 A; 2LAS A; 2N4F A; 3B1L X; 2LD9 A; 4F1S A; 4WJP A; 4MH8 A; 3BK2 A; 2YEP F; 2WQY B; 3QAQ A; 3EEC A; 4M8N A; 2WDQ B; 1E8Z A; 2M19 A; 4K1R B; 2JUO A; 4TQ1 A; 1ZDX A; 2BS3 B; 1GB4 A; 3Q14 C; 1GB1 A; 1NEN B; 2KMA A; 5GMV A; 3PPA A; 2BF8 B; 2PIA A; 3I57 A; 2J7Q B; 4EZK A; 1V2Y A; 3GE3 C; 2LWP A; 1PDX A; 4BZA A; 4DBG A; 2MW5 A; 3NHE B; 4XWW A; 4M8M A; 1KLU D; 2LJI A; 3A1Q B; 1H4R A; 3PRP B; 5D6J B; 2E3T A; 1FXI A; 4DXF A; 3DHI C; 4W9D A; 1I7H A; 3DVG Y; 2L83 A; 1IGC A; 4W9J A; 1N5W A; 4PT5 A; 1N60 A; 1B9R A; 4KX6 B; 4MJS B; 4GDK B; 2BYV E; 2FCS A; 3NVZ A; 4RCO A; 3V61 A; 1OFF A; 1QQR A; 3R7R A; 4PYU A; 2K9X A; 3CF6 E; 3NOB A; 1RFK A; 1OQQ A; 2V3S A; 2ZCB A; 3APF A; 2L32 A; 3ZJU A; 1YN3 A; 2AQ1 B; 3A33 B; 3P4S B; 2FCN A; 1TKY A; 5JXV A; 1F1H A; 3NVV A; 5CX3 A; 5D3D A; 1UNS A; 4XGA B; 5FR6 A; 3DVN V; 4WWM A; 2FBW B; 3VRB B; 1JW9 D; 2KTF A; 4HDQ A; 2H88 B; 5CHV C; 4ZOH C; 2NPT B; 1VD2 A; 3HK0 A; 2L8J A; 2GBM A; 2YLM A; 2MP2 A; 2BQQ A; 3N1Y C; 1E7V A; 2MLB A; 1E9M A; 2NBV B; 3UIP B; 4AUQ C; 1D5X C; 1E7P B; 3VH4 B; 3R2I A; 3X23 A; 2JXX A; 2KKC A; 3SFE B; 1V6E A; 4L1B A; 2EKE C; 3CSF A; 2ZPN A; 1UD7 A; 3O65 B; 5IP4 D; 2KWU B; 1J7B A; 4JQW C; 1E7U A; 5AZF A; 2LZ6 A; 5IAA C; 2IY0 B; 3H8H A; 3N3K B; 4WAA A; 2D3C A; 1SGH A; 3RNB C; 3DDC B; 4WQO B; 3DWG C; 3H7P A; 1FNU A; 4ZRP A; 2R2Q A; 5TSS A; 1HTQ A; 2QIE B; 1WGY A; 1PYW D; 3Q69 A; 4FLH A; 2SEB D; 5LNK 1; 2BB6 A; 2WXH A; 2L76 A; 4G3X B; 4JPS A; 1WJU A; 4NAM A; 1NVI D; 1JCK B; 1F77 A; 2ON8 A; 4ANX A; 3JVZ X; 2CR5 A; 1FFU A; 3WAP A; 4MT5 A; 4FUL A; 3J9C A; 3TEZ A; 4WJQ A; 4C4V A; 2BS4 B; 4W9G A; 2M8S A; 3NRZ A; 2K8C A; 1PUT A; 3B08 A; 1V80 A; 1K52 A; 1YN4 A; 4OZA A; 1DOY A; 1GG3 A; 3VFK A; 1SSN A; 4W9C A; 1V1O A; 4L23 A; 2QEJ C; 3R2T A; 1GPX A; 4EEW A; 1HTO A; 2JZP A; 3BIN A; 1L4D B; 2JYE A; 4BAX A; 3E9S A; 2N0S B; 4H2A A; 4TQ0 A; 2R61 A; 3CST A; 1N61 A; 1ROE A; 1NEK B; 4AJY B; 3ONS A; 3L17 A; 3Q3F A; 4N6E B; 3DBH B; 2I2Y A; 4II3 B; 4WWO A; 1TS3 A; 2CHZ A; 4TKN A; 2MBB B; 1WX8 A; 4HJK A; 2DEN B; 3V05 A; 3T3O A; 2INP E; 1UBI A; 1TY2 A; 4HCP B; 4DDI D; 1I42 A; 3PSE B; 1C78 A; 3AI5 A; 4K7S A; 4DXG A; 5C3J B; 1IP9 A; 2M1M A; 2I38 A; 4PS3 A; 4YWG G; 1JML A; 2JT4 B; 4WUR A; 3RN9 C; 3N30 A; 1HXY D; 1T0Q C; 5EE3 A; 2UWQ A; 1WMH A; 1SB3 C; 3HVD A; 3ETR A; 3M63 B; 2DAJ A; 4HKQ A; 3VVW B; 3HM3 A; 5L83 A; 4IDI A; 1EU4 A; 3CMM B; 2YEP B; 1SE9 A; 2K6D B; 3RUI B; 3QK0 A; 2KLG A; 1K51 A; 2IBI B; 2WXR A; 1OEY J; 3AE9 B; 2MJD A; 4LK0 M; 3RNG C; 5LXH A; 3IAS 1; 2N9P C; 3PZD A; 2ONQ A; 4M02 A; 1L7Y A; 5E6O A; 3EA6 A; 3IHP C; 2MWS B; 3NZU A; 3VUW A; 3HHM A; 2QC8 A; 4TSS A; 2N9X A; 3R8B A; 4C56 C; 2IO1 B; 2ZW1 A; 1ZPS A; 3Q6B A; 1B1Z A; 2L52 A; 4KSL C; 4L2Y A; 4KZ0 A; 5G2N A; 1CQV A; 1E10 A; 3UGB B; 3P42 A; 4C4V B; 3GZN B; 5JHB A; 4M0W A; 2RPQ A; 2EEL A; 5JZE B; 5D2M B; 3ZRF A; 4FHJ A; 2BYE A; 4WIP A; 2PEA A; 3MC8 A; 3AEE B; 3VAW A; 1FPY A; 4A6Q A; 2D10 A; 3K9P B; 2KDB A; 3RD2 A; 3HIZ A; 2EKI A; 4MAC A; 2K8H A; 1V81 A; 3B2G A; 3DPD A; 2MCN B; 3M3J A; 2MBE A; 2WXM A; 3ZVV A; 4CO7 A; 1V49 A; 2NBU A; 2GRI A; 5E6J A; 2AWT A; 2KVZ A; 1EF1 A; 1D4B A; 2CU3 A; 2IGD A; 4JE3 B; 1FMA D; 2WXF A; 4A9A A; 4TV3 A; 3T8M A; 3MHS D; 1RM6 C; 1TIF A; 1RFA A; 2IDY A; 4A8X C; 3PRM B; 2NTS A; 1YX5 B; 1KM7 A; 1OTR B; 2JRI B; 2QMT A; 2MBO A; 4DHZ B; 1C77 A; 2FCQ A; 2D3A A; 2Z0D B; 2K5P A; 3TMP B; 1OEY A; 3KWL A; 3S2A A; 3D32 A; 3BVG A; 4LCD E; 3AU5 A; 4ZRK A; 3L13 A; 2DHZ A; 2PKO A; 3VH3 B; 3QQ8 B; 1T0S C; 2PVG C; 1TS5 A; 2D11 A; 4A3O A; 2LRW A; 4IM2 A; 4RM8 A; 2AL6 A; 2GI9 A; 4JWS C; 3IAM 1; 2BYT A; 5BYQ A; 5BYS A; 4HJG E; 1LFD A; 2D3G A; 3AE3 B; 4ANU A; 2GBN A; 5EE9 A; 2CJN A; 4GDL A; 1EWY C; 3ZXR A; 3VR9 B; 2GBJ A; 3N32 A; 2BT6 A; 3KUZ A; 3AU4 A; 1RLF A; 1JRU A; 3C8Y A; 1F0Z A; 3A1Q A; 1ET9 A; 4IC7 B; 3L0W B; 3LB8 C; 2JWZ A; 4D2K A; 3NUH B; 2DWQ A; 4WWN A; 1NI2 A; 2MA9 B; 1ESF A; 2Z8L A; 3NJT A; 4LDT D; 3W1S C; 2KN5 A; 3OWE B; 3VTU A; 2C7H A; 2X38 A; 1J19 A; 4RM9 A; 4GN1 A; 4MJS A; 2V3P A; 2MEK A; 4ARI A; 2PLP A; 1WGH A; 2XK5 B; 1J8C A; 3LDZ E; 3UIN B; 1WGK A; 5DPW A; 4W9F A; 2HJ1 A; 4US8 A; 3DCG A; 1JWM D; 2C7N B; 4HPP A; 1I4P A; 3GB1 A; 4BBN C; 2KDF B; 3U2S C; 3Q8B A; 2KDI A; 2J53 A; 1EU3 A; 1SJH D; 3RFZ B; 1OQR A; 2IY1 B; 2WS3 B; 4J3O D; 3M95 A; 1Q1O A; 1QOF A; 5AEK B; 3PLU A; 3UI3 A; 1TGZ B; 1XCT L; 1KF6 B; 4W9E A; 2NPT A; 1C4P A; 1TS4 A; 2LVQ A; 3I5J C; 4M00 A; 4BKS D; 4ANW A; 5D3I B; 3TIX A; 3AE5 B; 3ZIM A; 2IO0 B; 4P1B C; 4OZC A; 5HHD G; 2JU6 X; 2BWF A; 2C7M B; 4BKT A; 2V9H A; 4HEA 1; 1TS2 A; 1TTN A; 1N6Z A; 2KOX A; 3KWV A; 1L4Z B; 3PRE A; 1Z5S B; 4HRO A; 1MVK A; 1ZXH A; 5D7G A; 2VZK D; 1XLP A; 4GMV A; 1C76 A; 4ICV A; 3KUC B; 2K0P A; 2RPV A; 3LJ3 A; 1C3T A; 3IT6 B; 3QA8 A; 4HDO A; 2BKF A; 4KGS A; 2LGY A; 4OVV A; 1ZE3 D; 1M94 A; 2ICI A; 4PYZ A; 4WWP A; 3U7D A; 2QSD A; 1OQY A; 4FN2 A; 1UBQ A; 2KFJ A; 2Y5P A; 3U4E G; 3WCQ A; 3H1U A; 1GC6 A; 4KVG B; 1WF9 A; 2L0T A; 4CYE A; 4EKU A; 2GBR A; 2RDH A; 3AEF B; 2WU2 B; 4GDL B; 2KHW B; 1UEL A; 2QHO A; 4G0N B; 5FKA C; 4DHJ D; 2FCM A; 3AE1 B; 2L3Z A; 2O6V D; 2QJL A; 3FC4 A; 3R7Q A; 1AWD A; 4BFR A; 4IKG A; 1YJI A; 2KDE B; 4ZYN A; 4IWQ A; 1LGR A; 2OHF A; 3N20 C; 2PE9 A; 1QT9 A; 3NG0 A; 3JSV A; 2J0K A; 4X57 B; 1JRP A; 3RYT A; 4E3C A; 1SF0 A; 4US9 A; 5H8Y E; 5CTR C; 3RT3 B; 1Y8R C; 3OG5 A; 4GXB A; 2SAK A; 4C80 A; 1P1A A; 3A4R A; 1P0R A; 1XD3 B; 2JQR B; 3GE8 C; 5H92 C; 1YOV B; 2K8B A; 5G55 A; 2VH2 A; 1F9J A; 4ZRQ A; 1MPE A; 1T6B X; 3ZDT A; 3RI7 C; 2W54 A; 2G45 B; 3AUL A; 2R2O A; 1K53 A; 1UWM A; 3ALB A; 5DPR A; 2K3U A; 3P1M A; 2RDG A; 4A55 A; 3KH0 A; 1G6J A; 4NAW B; 4ZRJ A; 2LI5 A; 2MSE D; 5IKC M; 4AQ7 A; 1H8C A; 1E8W A; 1WY8 A; 3HUI A; 2BKR B; 1JRO A; 3ZNG C; 4F7Z A; 3AE2 B; 2GLS A; 5LXI B; 3LXF A; 3TSS A; 1QLB B; 1GNU A; 2V4I B; 5AUK A; 4YSZ B; 2WX0 A; 4FA6 A; 3WAO A; 4N9F 4; 3PO0 A; 1TKG A; 1XT9 B; 1D5M C; 1C79 A; 4MGZ E; 3IXS A; 3U52 E; 1UGJ A; 2FUH B; 2GB1 A; 3OAW A; 3AE7 B; 2KWC A; 4NNJ B; 3AE8 B; 5L95 C; 5CHW A; 2YVC A; 1Y56 A; 1J7A A; 2KD0 A; 1AN8 A; 1TKE A; 1TZO A; 4WAF A; 2BB5 A; 1YQ4 B; 2KX3 A; 2LVO A; 3MHZ A; 3Q3M C; 1HE8 A; 4KKI A; 4GB9 A; 5IOI A; 1WI0 A; 2KYW A; 1BT0 A; 3BYT B; 4GU2 A; 2DX5 B; 1RRB A; 2W55 A; 3MTN B; 2WP9 B; 1SE2 A; 1KLG D; 3W5U B; 2X8X X; 2KFK A; 2RDB C; 3I63 C; 3PRZ A; 3QHT A; 3Q3N C; 3ZGZ A; 2MJ3 A; 1KJT A; 4RNA A; 2NMQ A; 2JVC A; 4GLS C; 3MFG A; 4K81 A; 4NJC A; 2WWZ A; 2WX1 A; 2AX5 A; 3P4R B; 3CWI A; 3UQB A; 2I1J A; 3DBL I; 4RGM A; 3VTV A; 4RMA A; 1WJ6 A; 2KC1 A; 3WAL A; 3W9C B; 2AQ3 B; 1V86 A; 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3P4P B; 1GJZ A; 3KQ4 A; 3PHX B; 3IVF A; 1L5P A; 3L4P A; 3WAM A; 2CU1 A; 1XLQ A; 5BYR A; 2KQ4 X; 2LFI A; 4IG7 B; 1VLB A; 1MHH E; 4UDU C; 4DHJ B; 4XE0 A; 3TL5 A; 2O6V B; 3BII D; 1EF5 A; 3GS2 A; 1BXT A; 4ZHP A; 5C2T B; 2WU5 B; 2WXN A; 1ET6 A; 2N9E B; 3IFW B; 3VUX A; 2W9N A; 2N9K A; 2IND C; 4K7W A; 3ZTC A; 2PPH A; 1RWS A; 1ZKH A; 2N1W A; 2L1A A; 2OOB B; 3A4S C; 3DBR I; 2NTT A; 3FIL A; 3RPF C; 4XX5 A; 2MBH A; 2WGS A; 1KTK A; 2G3Q B; 3AB5 A; 4JL9 A; 4MGK E; 2NCN A; 3OLM D; 1L0Y B; 5KHQ A; 1FCL A; 1N62 A; 3IBE A; 2J4X A; 1VRA B; 1SIF A; 4HK2 A; 4E74 A; 1ISN A; 3E56 A; 4A20 A; 4W9L A; 3QIJ A; 3VXW A; 1T3Q A; 1K50 A; 3Q8F A; 3U7Z A; 1NYQ A; 4DXA B; 2NVU I; 5C1Z A; 2ASQ A; 2L0F A; 4ICU A; 4IM3 A; 4MEM A; 4MDK E; 4G50 A; 4NY0 A; 2V0G A; 1WXM A; 1DGJ A; 2PE6 B; 2KMC A; 2DLB A; 4M01 A; 1YX6 B; 2E6X A; 1IPG A; 1QOA A; 4HRS A; 2LJ5 A; 4KV2 A; 1E90 A; 4LTU A; 4EZJ A; 3OJ4 B; 3ZYY X; 1KH0 A; 1FO4 A; 1VR9 A; 2C60 A; 4GOC A; 4P7I A; 1FXT B; 3A9J B; 4HPM B; 2KXJ A; 3TEW A; 2HDE A; 1P9D U; 4PK1 A; 2KO3 A; 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