The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
64
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structure length |
64
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Chain Sequence |
b'MEEVTIKANLIFANGSTQTAEFQGTFEQATSEAYAYADTLKQDNGEWTVDVADQGYTLNIQFAG'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Protein L
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| molecule tags |
Immune system
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| source organism |
Peptostreptococcus magnus
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| publication title |
Protein stabilization and the hofmeister effect: the role of hydrophobic solvation
pubmed doi rcsb |
| total genus |
15
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| structure length |
64
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| sequence length |
64
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-01-11 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LUM A; 1K51 A; 1IBX A; 2QMT A; 1P7E A; 3GB1 A; 1UWX A; 2J52 A; 5HFY A; 2JSV X; 4KGR A; 2PTL A; 4OZC A; 3UI3 A; 1XCQ L; 5HI1 A; 1XCT L; 2LGI A; 1D4B A; 1K53 A; 3FIL B; 2ON8 A; 1MVK A; 1PGA A; 3MP9 A; 1F2R I; 1YNT E; 2RMM A; 1MHX A; 4KGS A; 2LHD A; 2N7J A; 2OED A; 4KGT A; 3FIL A; 2J53 A; 4HJG E; 1EM7 A; 2IGG A; 2IGH A; 5HHD G; 2KAC A; 1F2R C; 2PLP A; 4WH4 A; 5BMI A; 2KWD A; 3V3X A; 1HZ6 A; 1K52 A; 4OZB A; 1MI0 A; 1QKZ A; 1XF5 L; 2GI9 A; 2ONQ A; 4HKZ E; 1PGB A; 2N9K A; 2LHE A; 2QSD A; 5BMH A; 2I2Y A; 5JXV A; 5BMG A; 1HEZ E; 2KDM A; 4GLS C; 2KQ4 X; 2RPV A; 4IOI E; 1IGC A; 2ZW0 A; 1K50 A; 2I38 A; 1GB1 A; 2IGD A; 2PW9 A; 2ZW1 A; 2JXT A; 2GB1 A; 2JU6 X; 1HZ5 A; 2NMQ A; 2KN4 A; 4IKG A; 1P7F A; 1YMH E; 5HG2 A; 1JML A; 2N9L A; 1FD6 A; 1FCL A; 1C9F A; 2JWU A; 2JZP A; 1IGD A; 1KH0 A; 4MAC A; 4OZA A; 1MPE A; 1MHH E; 1PGX A; 1GB4 A; 1FCC C; 2EEL A; 1ZXH A; 1Q10 A; 1IBX B; 4D2K A; 2K0P A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1KLU D; 1WGK A; 1PDX A; 1Y56 A; 1FRD A; 1FM0 D; 2KLC A; 3T3O A; 3DVN U; 3ZTC A; 2KMM A; 1RWS A; 3ZDM C; 5FKA C; 3ZXR A; 4XYC A; 2H88 B; 1PGA A; 3ZRF A; 2KX0 A; 2Z8L A; 2QEJ C; 3NZS A; 2A4Z A; 2LHD A; 1TKG A; 3HUI A; 3PLU A; 4YTP B; 1Z5S B; 5HHD G; 1SGH A; 2WXN A; 4HVB A; 4GSW A; 2KTR A; 1YOV B; 1QIL A; 2M56 B; 5HKH A; 5J17 A; 1ET6 A; 3A33 B; 3OJ3 A; 1HTQ A; 3AH7 A; 4OZB A; 2MRP A; 3B9J A; 1B1Z A; 2IBI B; 3L10 B; 2NBU A; 2IO0 B; 4HKZ E; 3PHW B; 2NCN A; 4DHJ B; 1WXA A; 4W9E A; 1N62 A; 1RLF A; 4WQM A; 2IY1 B; 4PK1 A; 2KC1 A; 4ITK A; 4W9D A; 4TUU A; 2OJW A; 4N59 A; 2AX5 A; 4HRO A; 1BML C; 3TEX A; 2MH7 A; 4BBN F; 3VAW A; 3ZKJ C; 2CHX A; 4C4V B; 3R8B A; 1PQS A; 2GMI C; 2JXT A; 1WWT A; 5IOI A; 3QIJ A; 1EF5 A; 3PZ8 A; 4YXD B; 3W5U B; 2JWU A; 1CQV A; 5AUK A; 3VTW A; 1YIW A; 3BZD B; 4ZRP A; 3ETR A; 2BQQ A; 1M4V A; 3NS8 A; 1V5T A; 4HPL B; 4BZA A; 1ZW7 A; 2BWE S; 2R2Q A; 4KV2 A; 1WJ4 A; 3BIN A; 1QOG A; 3SEB A; 2M19 A; 2M8S A; 2QMT A; 4TMA B; 3C19 A; 4PS8 A; 1LFD A; 2WXI A; 4ZDV A; 4AP4 C; 3J9C A; 1V81 A; 3ML8 A; 2BW2 A; 2LD9 A; 1JRO A; 3SFD B; 3PPA A; 1EU3 A; 5BO4 B; 3V05 A; 2KWV B; 2OED A; 4F1S A; 3Q3M C; 3ML9 A; 1T0S C; 3W1S C; 3PGE A; 1TJE A; 5H92 C; 1RFA A; 2MJ3 A; 1SXT A; 2AQ2 B; 4US8 A; 3MTN B; 4XDC A; 1TKE A; 4C7Y A; 1VCB A; 3BY4 B; 1X1M A; 1YX5 B; 4NJ7 A; 5TSS A; 2SEB D; 4IM0 A; 1K52 A; 1QKZ A; 4PS3 A; 4AUQ C; 4RF0 A; 1H4R A; 4KZC A; 2KDE B; 2G45 B; 1VRA B; 1WI0 A; 5IKC M; 2K8C A; 1ZDX A; 1GJZ A; 3AE2 B; 1V2Y A; 2BVC A; 3JSV B; 3OAW A; 1AW7 A; 4IG7 B; 2SAK A; 3UIN B; 1XLP A; 2O2V B; 2KQ4 X; 3AB5 A; 4PYZ A; 3A1Q A; 1PFD A; 4RGO S; 3IAS 1; 5D94 A; 5FR3 A; 2HDE A; 3ECI A; 3K9O B; 3QA8 A; 3NZU A; 2JU6 X; 1IUE A; 5HG2 A; 1SJE D; 2Z0D B; 4MSM B; 1FCL A; 2QDF A; 4FHJ A; 3LB8 C; 2W54 A; 2KO3 A; 2OOB B; 2RSU A; 1HTO A; 4M00 A; 2WU2 B; 4ARC A; 2J0K A; 5GMV A; 4F7Z A; 4IM3 A; 2D10 A; 2LGD A; 4W9J A; 1VZ6 A; 2EKI A; 3X0W A; 3B2G A; 1SE3 A; 3IVF A; 1VJK A; 2RPQ A; 4LLG M; 4JWU C; 4B0E A; 3ONS A; 2KMA A; 4RGT A; 1V1P A; 2AYO B; 3DOW A; 3LDZ E; 3W1Y A; 4K3C A; 5DCN A; 3FIL B; 3R66 C; 1KJT A; 1FO4 A; 2C60 A; 1YN4 A; 4FN2 A; 2OJR A; 2KXJ A; 4W9I A; 4MGZ E; 5FR6 A; 1EM7 A; 2KVR A; 1C77 A; 4MJS A; 3RN9 C; 1UD7 A; 1QT9 A; 5FK9 C; 1UBQ A; 2LXC A; 5DPW A; 2QIL A; 3EGR A; 4IM2 A; 2N9X A; 3DPD A; 1WYW B; 1NI2 A; 2WXG A; 1OGW A; 3DVG X; 3AU4 A; 3VFK A; 2KQS A; 3P4Q B; 4P16 A; 3DBH B; 2LVO A; 4ANU A; 3BVG A; 2WNM A; 2ZVO A; 3H8H A; 2PKO A; 3PRP B; 1P98 A; 4GLS C; 2JY6 A; 2DX5 B; 5I4D A; 5G55 A; 2D5G A; 5DPS A; 1XT9 B; 1K50 A; 3L0W B; 2BGF A; 1HE8 A; 2K8B A; 2L05 A; 3KW5 B; 2B3A A; 4DHZ B; 4FLH A; 2ZJD A; 2LEK A; 1YMH E; 4DWF A; 4ARI A; 1FD6 A; 3N30 A; 2INN E; 2MBQ A; 3EEC A; 3KVF B; 2LRW A; 1E0Z A; 1PGX A; 4GDL B; 2C7H A; 3ZDT A; 3APD A; 1TS4 A; 4IWO A; 4AJY B; 2KFK B; 2NVU I; 2NBW B; 3H1U A; 3DQV A; 4GN1 A; 2WXJ A; 3HVD A; 3GB1 A; 1EU4 A; 1PYW D; 1MJD A; 3IBE A; 4XZ4 A; 3T3N A; 2BPS A; 1XCQ L; 2C7N B; 2INP E; 2UU7 A; 2ON8 A; 1NEN B; 2DZK A; 1YNT E; 3KUC B; 1J7C A; 3P2B A; 3W2D A; 2CS4 A; 3QJZ A; 4I6N B; 2ZNV C; 2FUG 1; 3V6C B; 1JRU A; 4XWW A; 2XEW A; 3L54 A; 4TQ1 A; 3MC9 A; 1AYF A; 4LDT D; 2GRI A; 3Q3F A; 2NS5 A; 2Y5B B; 1KLG D; 4AWJ A; 3TL5 A; 1YN3 A; 4K7U A; 2JX5 A; 4CQN A; 4PT5 A; 4JLC A; 2MJD A; 4DQO C; 4M8M A; 2NPT B; 4L23 A; 4G50 A; 4M02 A; 4OHJ A; 4OVU A; 3A9K A; 1L4D B; 4E71 A; 2HJ8 A; 4Q2J A; 1I4P A; 2IPK D; 2JF5 A; 1V1P B; 2RPV A; 2KFK A; 1OEY J; 4MSQ B; 5TR5 A; 2I38 A; 3UF8 A; 2LGX A; 4A9A A; 2O6V B; 4DDG D; 1HZ5 A; 3FAH A; 1L6V A; 2W55 A; 2M0A A; 5CTR C; 3T8M A; 4KDL B; 1WZ3 A; 2QCZ A; 2XN9 C; 2N1V A; 1C9F A; 2DEN B; 1L2N A; 2KDI A; 3AXC A; 3LXF A; 2KC2 A; 1XLN A; 4C7Z A; 3HRD D; 2WU5 B; 2WS3 B; 1C1Y B; 4XDD A; 2K9X A; 3OWE B; 2K3U A; 2PJH A; 4OZC A; 4YSX B; 3VR8 B; 5JHA A; 4W9F A; 3SR6 A; 2PMV A; 3MP9 A; 1UF0 A; 1KTK A; 2KD0 A; 2L52 A; 2N7E A; 3PSE B; 5JZE B; 1F77 A; 3FIL A; 2J53 A; 1JWM D; 1XEE A; 2XK5 A; 1WM2 A; 4I6P A; 1FRR A; 2C9W B; 3U8Z A; 4XWT A; 4YSZ B; 3SDL C; 4MJS B; 3VQI A; 1N63 A; 4ICV A; 1P1A A; 2IO3 B; 2L00 B; 2J4X A; 3BK2 A; 1ESF A; 4HXD A; 3V6E B; 2MHJ A; 1FNV A; 1B9R A; 4ZHP A; 2ZNV B; 2A5U A; 3WIM A; 3N1Z C; 3RCZ A; 5AEK B; 2MQJ A; 2WXO A; 3Q2A C; 4RMA A; 3I57 A; 4TQ0 A; 1V8C A; 3UIP B; 1TKY A; 3T9L A; 4JWS C; 1WF9 A; 3KWL A; 1UZX B; 2M0X A; 4DXA B; 3NZ3 A; 3AE4 B; 1DGJ A; 1FNW A; 2BS4 B; 3QAQ A; 2BB6 A; 1GOZ A; 1C4A A; 1JCK B; 4HDO A; 2M4N A; 3AU5 A; 3TSS A; 3IAM 1; 2NTT A; 2JXX A; 4E74 A; 1CMX B; 1GB4 A; 4G0N B; 3CF6 E; 2DYM A; 1V86 A; 3WAL A; 3ZNZ B; 2YVC A; 1JQ4 A; 2J42 A; 4ANV A; 4CHK A; 2Q5W D; 4HRS A; 3MFG A; 4ZHO A; 1F2R I; 2LWP A; 5DPT A; 3RFZ B; 1G6J A; 2PIA A; 3DHH C; 2GBR A; 1ROE A; 3HM6 X; 2K6D B; 1V80 A; 3U4E G; 3KH0 A; 1E10 A; 2LJ5 A; 4KGT A; 1L7Y A; 3ZRC A; 3DDC B; 1D5M C; 2GBM A; 4JGH B; 4TV3 A; 4WUR A; 2KWD A; 4M8N A; 5BMI A; 3O65 B; 3TEY A; 3N3K B; 1NVI D; 2BKR B; 1UH6 A; 3RUI B; 2EKE C; 1WZ0 A; 3KUD B; 3HHM A; 2HTH A; 3RNE C; 1YD8 U; 4ZRQ A; 1CK1 A; 3VTV A; 3AE8 B; 1KF6 B; 3L4P A; 4A55 A; 5IA7 A; 5IAA C; 2LI5 A; 4FJV B; 4N58 A; 3W1S A; 1Q1O A; 2N9E B; 2MA9 B; 3Q69 A; 1IGC A; 4II2 B; 4K3B A; 3GZN I; 3S2A A; 1EWC A; 3DWM A; 1E9M A; 1A70 A; 1RAX A; 4EKU A; 1BT0 A; 4IKG A; 4W9L A; 3N20 C; 1YX6 B; 1IGD A; 3CIR B; 2KT7 A; 2LGS A; 2R2O A; 3H7P A; 2O6V A; 4P6V F; 1E8W A; 1HXY D; 5CHV C; 4LNN A; 4ANW A; 2FCM A; 3TCA A; 4NY0 A; 1RFK A; 4BVU C; 3NVW A; 4HKQ A; 2GLS A; 3ZLZ A; 2LVP A; 3E9S A; 3I63 C; 4MGI E; 1I7H A; 1JW9 D; 4GU2 A; 3APC A; 1WX8 A; 4M0W A; 1MVK A; 2CKH B; 4IUM B; 3P4P B; 3DBH I; 3B0A A; 2LMC A; 4NAM A; 1Q5W B; 3DWG C; 1F9J A; 2DNF A; 3M63 B; 5G5H A; 2IGG A; 4HLE A; 1KRH A; 3I3T B; 5AZF A; 1SE9 A; 1SIJ A; 2PLP A; 2JWZ A; 1FEH A; 2CJO A; 1OQQ A; 3PV1 A; 5E6N A; 4MH0 E; 4WJP A; 1HZ6 A; 1AAR A; 2KX3 A; 5CX3 A; 3V61 A; 3E56 A; 2KMC A; 1PGB A; 2XNA C; 1C79 A; 1UGM A; 2WXQ A; 2DYO A; 4NNJ B; 2QSD A; 1ZUD 2; 2KDB A; 2PVO D; 3NRZ A; 2Y5C A; 3ZQ4 A; 3KUZ A; 2MP2 A; 3HVZ A; 1OQY A; 3P1M A; 4BKG A; 2WXH A; 3OJ4 B; 2W3R A; 1MG4 A; 1WH3 A; 5LXH A; 1WR6 E; 4UDU C; 4YL8 A; 4NJC A; 2BYE A; 2Y3A A; 1WMH A; 3MHS D; 2FBW B; 2G4D B; 2IO1 B; 2JQR B; 4DXF A; 3GP7 A; 3NY5 A; 4P7I A; 3ENE A; 2DZM A; 4BOS C; 1TBE A; 2V3P A; 4JX1 C; 3P42 A; 2L7R A; 4KGR A; 3V60 A; 4DHZ E; 1R7S A; 1I4H A; 2AEH A; 4P1B C; 3QHT A; 2LGI A; 3RNA C; 3B1L X; 2EMT A; 4KSK C; 4KVG B; 3PRZ A; 4KX6 B; 1MHX A; 2ZZP B; 4KGS A; 1EF1 A; 1E7P B; 3L08 A; 3AE1 B; 1YJI A; 2WXM A; 2X8X X; 1GAQ B; 3R7R A; 4GDK B; 2MSE D; 2FIF A; 2QJL A; 2KWC A; 4WH4 A; 1C4C A; 3C8Y A; 1XD3 B; 2KHW B; 1UEL A; 1DOI A; 2XK5 B; 4HCP B; 1S3S G; 2L76 A; 1WX9 A; 4GDL A; 3TUO A; 3RUL A; 2MCN B; 2XBB C; 1I4X A; 4FAD A; 2Y5P A; 1I42 A; 4GXB A; 4JIO U; 1AWD A; 1RRB A; 5D7G A; 2I2Y A; 3H6N A; 3ZW3 A; 3RD2 A; 4AS1 A; 2CHZ A; 2MEK A; 2KJH B; 2G4S A; 1V49 A; 2M17 A; 3BYY B; 4YTN B; 4USA A; 3X23 A; 3AEE B; 5JHB A; 3ZYY X; 1SE4 A; 2GOW A; 2IO2 B; 5G5G A; 1WGG A; 1QOF A; 3TIX A; 4ZOH C; 4RM8 A; 2G1E A; 3AEB B; 3NVZ A; 2QC8 A; 1E90 A; 1WYG A; 1A5R A; 1IBX B; 3OLM D; 3PVL A; 2JVC A; 2K0P A; 4NJ6 A; 1V97 A; 3R2T A; 3ZJU A; 1K51 A; 3A4R A; 1J19 A; 4DBG A; 1Z2M A; 1TT5 B; 1P0R A; 2YLM A; 3ZVV A; 1I35 A; 3Q8F A; 4LDT B; 3SFE B; 2PTL A; 3IT4 B; 3UI3 A; 1LXD A; 1D4B A; 4BKS A; 3MC8 A; 2ZVN A; 3A9J A; 2N4F A; 4BKS D; 2KJ6 A; 2FUH B; 2EMS A; 1E8Y A; 1YQB A; 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4CYE A; 1EO6 A; 1WXQ A; 3EFC A; 4GDK A; 2KNB A; 1CZP A; 2FCQ A; 5AUI A; 2LVQ A; 1ZE3 D; 2D3B A; 5JXV A; 1E6E B; 1SJH D; 5LNK 1; 4A3O A; 2BYF A; 4IWP A; 1ZP0 B; 3NJT A; 2D3A A; 1BXT A; 1TY2 A; 1ZPS A; 1VZ8 A; 3QK0 A; 4ZRJ A; 3C0R B; 2L0T A; 2BS2 B; 1QQR A; 1TZ1 A; 1N5W A; 4TSS A; 1STE A; 2R61 A; 1BUI C; 3HK0 A; 4EZL A; 3M62 B; 4KSL C; 1WFY A; 1WGD A; 1KH0 A; 2RDH A; 3Q8B A; 3DVN V; 3ALB A; 2WXL A; 3TJP A; 1L0V B; 5E6P A; 2D2Q A; 3RYT A; 4O1N A; 3DCG A; 3Q14 C; 3DHI C; 1EUV B; 3Q8E A; 3PZD A; 4EE2 A; 2D11 A; 2DWQ A; 1HA5 A; 1GC7 A; 1IBX A; 3QAR A; 1OTR B; 4DK5 A; 1LO5 D; 3AEG B; 4KKJ A; 3NS1 A; 5D3D A; 3U30 A; 2TSS A; 4GGQ A; 1FNU A; 4K7W A; 3UQA A; 3ZNG C; 1QLB B; 4EEW A; 3DHG C; 5J18 A; 4WWP A; 2HTM E; 3IHP C; 4JL9 A; 4II3 B; 3TEW A; 3A9J B; 1V1O A; 5D3I B; 4FXC A; 1WX7 A; 1DOY A; 2JRH A; 1XO3 A; 1RM6 C; 2REX A; 3WAN A; 4RFB A; 1SF0 A; 4L2Y A; 1D6E C; 1JAL A; 1KOT A; 4JQW C; 4E3C A; 3AE7 B; 1NI3 A; 4WJO A; 4C56 C; 1E7V A; 4M0W B; 2O6V D; 3AMZ A; 1MI0 A; 1ZDV A; 3URY A; 1AN8 A; 2N9K A; 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