The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
64
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structure length |
64
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Chain Sequence |
b'MEEVTIKANLIFANGSTQTAEFQGTFEQATSEAYAYADTLKQDNGEWTVDVADQGYTLNIQFAG'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Protein stabilization and the hofmeister effect: the role of hydrophobic solvation
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Protein L
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| source organism |
Peptostreptococcus magnus
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| molecule tags |
Immune system
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| total genus |
15
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| structure length |
64
|
| sequence length |
64
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-01-11 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2ON8 A; 1ZXH A; 1K53 A; 1IGC A; 2IGH A; 4KGT A; 1IGD A; 4MAC A; 1YNT E; 2EEL A; 5HFY A; 1PGX A; 1GB4 A; 1JML A; 2KQ4 X; 3UI3 A; 4WH4 A; 4KGR A; 1MVK A; 1FCC C; 4OZB A; 2J52 A; 1F2R I; 2RPV A; 1D4B A; 5JXV A; 1IBX A; 2J53 A; 2PTL A; 2GI9 A; 2LUM A; 1FD6 A; 4HKZ E; 3FIL A; 2JSV X; 1XCT L; 2GB1 A; 2I2Y A; 1MI0 A; 4IKG A; 2I38 A; 1EM7 A; 2LHD A; 4D2K A; 1MPE A; 1K51 A; 2N9L A; 1HZ5 A; 1FCL A; 2IGG A; 2JXT A; 1YMH E; 2LHE A; 4OZC A; 1MHH E; 1PGB A; 2PW9 A; 5BMI A; 2K0P A; 1KH0 A; 5BMG A; 2JU6 X; 2PLP A; 4HJG E; 2IGD A; 2NMQ A; 1QKZ A; 1XCQ L; 4IOI E; 1K52 A; 2N7J A; 2QSD A; 1PGA A; 2ZW1 A; 1C9F A; 1MHX A; 2JWU A; 2KWD A; 2KN4 A; 1K50 A; 2N9K A; 4GLS C; 4KGS A; 3V3X A; 1IBX B; 2JZP A; 5BMH A; 5HHD G; 2ZW0 A; 1HZ6 A; 1XF5 L; 1HEZ E; 1F2R C; 3FIL B; 4OZA A; 1Q10 A; 1UWX A; 3MP9 A; 1P7F A; 2OED A; 1P7E A; 2KAC A; 2ONQ A; 5HI1 A; 2KDM A; 2QMT A; 5HG2 A; 2RMM A; 3GB1 A; 1GB1 A; 2LGI A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2J0M A; 4AS1 A; 3AE5 B; 4GB9 A; 2EEL A; 2KWU B; 1STE A; 5LNK 1; 1QQR A; 3AUL A; 3I9V 1; 4YXD B; 2D5G A; 1TYG B; 1WJN A; 1T0S C; 2M56 B; 3W5V B; 1CK1 A; 3AEG B; 4ARI A; 1RWS A; 2KYW A; 1NVI D; 1CQV A; 2J0J A; 1J19 A; 2PE6 B; 1KLG D; 2ZZP B; 2DWQ A; 2MCN B; 3EFU A; 2WXM A; 2GOW A; 1YX5 B; 4II2 B; 2L0F A; 1QLB B; 4K7U A; 4IDI A; 3L17 A; 2Q5W D; 2KJH B; 1UBI A; 1C4P A; 3DBS A; 4M02 A; 3SDL C; 1MPE A; 3BVZ A; 2WXP A; 2JXT A; 1KF6 B; 2IPK D; 2D3C A; 3VTV A; 3OJ4 B; 1V80 A; 5BMG A; 2MBQ A; 3ZDM C; 2KAJ A; 1XLQ A; 1K52 A; 3VUW A; 4LCD E; 2BB6 A; 2QSD A; 4JX1 C; 4G0N B; 4A20 A; 2CR5 A; 3GZN I; 1ZPS A; 3A9K B; 1LO5 D; 1UUP A; 1P3Q U; 2BYF A; 2UU7 A; 2ZPN A; 2DHZ A; 3CWI A; 2V1Y A; 2C7N B; 3PLU A; 4GU2 A; 1L5P A; 3NY5 A; 3PVL A; 4J6I A; 4K7W A; 1JRU A; 3P4Q B; 4KKJ A; 1WX8 A; 3BVM A; 4IM2 A; 3TEZ A; 2RPQ A; 3T3O A; 2DAJ A; 3PGE A; 4KKI A; 2LGI A; 4LNN A; 2R2Q A; 3NZS A; 1AYF A; 1OTR B; 2AEH A; 1GPX A; 2DLB A; 4HPM B; 2BWF A; 4M00 A; 4I6L B; 1E8X A; 3A9K A; 5FKA C; 4MH8 A; 1KJT A; 3HHM A; 2L00 B; 3U7D A; 3TMP B; 4B9K A; 4TMA B; 1NYR A; 3IAS 1; 2FCN A; 1C1Y B; 4P7I A; 3ZUN A; 3KWV A; 3L54 A; 3DHH C; 1EO6 A; 3W1S C; 1P98 A; 4NY0 A; 2C5L C; 1YD8 U; 4DWF A; 2UYZ B; 4WUR A; 2BYE A; 4QAY A; 1WYG A; 2KFK B; 3TEX A; 4KDI C; 4MGI E; 1EU4 A; 1XCQ L; 3AE9 B; 2NPT B; 2LUE A; 4WWN A; 2Y5B B; 1V5O A; 3ZXV A; 3B2F A; 4FUL A; 2LXC A; 1WF9 A; 1JRO A; 3W9C B; 1S1Q B; 2BYT A; 1E10 A; 1NDD A; 3GS2 A; 2KZR A; 2IY0 B; 3Q3M C; 1IBX B; 2GLS A; 3EFC A; 2HTH A; 1P1A A; 3Q3O C; 3LYY A; 3HK0 A; 3DBL I; 3BYY B; 1NYQ A; 2BF8 B; 3ZJT A; 1ZKH A; 2VRR B; 3C19 A; 2MWS B; 4CHK A; 1WE6 A; 2WU5 B; 3EUB 2; 4WQM A; 3V62 A; 1NEN B; 4O1N A; 3P1M A; 4K81 A; 2BTE A; 2JY6 A; 2KFK A; 2BS3 B; 2NPT A; 4BZA A; 4KGT A; 4NJ6 A; 1VZ8 A; 1YQ4 B; 3U2S C; 2K3U A; 2PKO A; 4RFB A; 1DYQ A; 3V60 A; 3KWL A; 1E7P B; 3QA8 A; 3B2G A; 2ASQ A; 1EF5 A; 1D5M C; 1IBX A; 1SJE D; 2AQ3 B; 2LJ5 A; 5MPO A; 2SEB D; 5IAA C; 2GI9 A; 3PTF C; 3UIP B; 1WYW B; 2INC C; 1E8Z A; 4A90 A; 1UH6 A; 4WWP A; 1TS4 A; 3Q8A A; 2V4L A; 3O65 B; 2K39 A; 1BT0 A; 4W9D A; 2MA9 B; 2FIF A; 4AOF A; 3AEE B; 4S0R A; 1L0Y B; 2E3T A; 2HJ8 A; 1WWT A; 4K1R B; 3W1Y A; 2D3B A; 5FR6 A; 1TY0 A; 1HTQ A; 2WXQ A; 4N6E B; 1TIF A; 1WXS A; 3NVW A; 4BBN F; 5EE0 A; 4GXB A; 3PZ7 A; 2X8X X; 3BY4 B; 4WJO A; 4ACF A; 2JWU A; 1WX7 A; 4LLG M; 2KJ6 A; 4OW0 A; 4L23 A; 5DPT A; 4KGS A; 2WX1 A; 4GDK B; 2MP2 B; 3N20 C; 1UBQ A; 1N62 A; 1VZ6 A; 1WFY A; 3TL5 A; 1XF5 L; 2WGS A; 3IG3 A; 1T3Q A; 3PRP B; 2CKH B; 1YIW A; 3U52 E; 3I3T B; 1P7E A; 3NVY A; 4PS7 A; 1EUV B; 5D3D A; 4ZRI A; 3RNB C; 1VDV A; 1I4P A; 1J7C A; 4IUM B; 3BWU D; 1IGD A; 3SFD B; 1YNT E; 1I35 A; 1N63 A; 1JML A; 3APF A; 4TUU A; 1SGH A; 2D11 A; 3ZNI D; 1TKY A; 1V8C A; 2XNA C; 4WAA A; 3PPA A; 3QC8 B; 5JZE B; 4GDK A; 2N1V A; 2MP2 A; 2WX0 A; 3H6N A; 3V05 A; 2JZZ A; 5EE3 A; 1WGD A; 2NR2 A; 1QOA A; 3NVV A; 1KLV A; 1XLO A; 1WM2 A; 1E0Z A; 2NBW B; 3TSS A; 4XGA B; 2KN5 A; 4ZYS A; 1C78 A; 2WP9 B; 1GJZ A; 1DOI A; 1FCL A; 2IBI B; 1JWB D; 2ZJD A; 3P4P B; 2M19 A; 1GNU A; 3QX1 A; 1FFU A; 2KFJ A; 3CSF A; 1Y8R C; 2A4Z A; 2XEW A; 1M94 A; 3Q8E A; 3DHI C; 4ZRQ A; 4GDL B; 3P42 A; 1MHX A; 3DVN U; 3EHV A; 1I4R A; 1VLB A; 3DBR B; 2HJ1 A; 2V3P A; 1WMH B; 4ANX A; 4KIK B; 1L6U A; 1Z5S B; 2G4D B; 4IM0 A; 2FCS A; 1UD7 A; 1KTK A; 3KUC B; 3PHW B; 2WWZ A; 2FUG 1; 4FXC A; 4XWT A; 4DHJ D; 1WSP A; 3DHG C; 4F1S A; 1C3T A; 3KLS X; 5H92 C; 2RDG A; 1J7A A; 1T5X D; 3PV1 A; 2TSS A; 2KMM A; 2NBU A; 3LJ3 A; 2DNF A; 2KDM A; 3P2B A; 5GMV A; 2N9X A; 2QMT A; 3ZRC A; 1GB4 A; 4LTU A; 1KLU D; 4L2Y A; 2D3A A; 3V6E B; 4F8C B; 1J8C A; 1ET9 A; 3S2A A; 1D5Z C; 4G50 A; 4GDL A; 5LXI B; 2PVG C; 3Q8B A; 3KYC D; 1F9J A; 3PZD A; 2LAS A; 4KGR A; 2J4X A; 2WHI A; 1WMH A; 1WJ4 A; 4KIK A; 4RMA A; 2BQQ A; 2K5P A; 4EZJ A; 1XT9 B; 4K3C A; 4E71 A; 4JLC A; 5JXV A; 1M4V A; 4G3X B; 4DXG A; 4IC7 B; 1MJD A; 3PSE B; 5AUK A; 3VTU A; 2XN9 C; 1JWU D; 1Y56 A; 5IKC M; 1I7H A; 4LK0 M; 3FKY A; 2RSU A; 2KD0 A; 3NS8 A; 1VR9 A; 1QOB A; 4XDC A; 2ACZ B; 4II3 B; 2J0K A; 4CYE A; 3QAQ A; 5G2N A; 3WCQ A; 2WS3 B; 2EMS A; 2CHW A; 2AL3 A; 2PLP A; 3KUZ A; 2HDE A; 2BS2 B; 4E74 A; 2WXR A; 2IYD B; 3UQB A; 2QIE B; 2MJE A; 1SB3 C; 1WIA A; 4ZHP A; 2GBK A; 1SE9 A; 4ZRP A; 3TUO A; 1FNU A; 3ZVV A; 2YEP F; 1WXQ A; 1E7V A; 2KMC A; 5TSS A; 4YTM B; 4IM3 A; 1V2Y A; 3O13 A; 4EFO A; 5IA7 A; 3LDZ E; 2D10 A; 2LI5 A; 1GC6 A; 3ABV B; 4YSY B; 2MRP A; 2C7H A; 3VVW B; 1TGZ B; 1OQQ A; 2CHZ A; 2NVU I; 1WGR A; 3V61 A; 2C7M B; 4ICU A; 3Q8F A; 1KRH A; 2R61 A; 2K25 A; 1E5W A; 1V1O A; 2RDB C; 1ZXI A; 5G5H A; 4EE2 A; 2ZVN A; 1F0Z A; 1V97 A; 3UI3 A; 4ZHO A; 2LZ6 A; 4HPP A; 3RUL A; 1IYF A; 2HTM E; 1V1P B; 1TS5 A; 2J52 A; 3BZD B; 2DZK A; 1F2R I; 2REX A; 2L05 A; 2HE7 A; 3UF8 A; 4C56 C; 2WDR B; 2JPH A; 2LRW A; 3RT3 B; 2K1F A; 2MBE A; 4OHJ A; 3AN1 A; 2V4I B; 1OQY A; 3IVF A; 3Q3N C; 3CF6 E; 2SAK A; 5AZF A; 4LNK A; 4RF1 A; 2I38 A; 4D2K A; 1WR1 A; 2EKI A; 1R4N I; 2WXL A; 4RF0 A; 1B9R A; 2N1W A; 2PIA A; 4OZC A; 2GMI C; 1FMA D; 4IWQ A; 4JL9 A; 2PJH A; 4FJZ A; 3AI5 A; 1L0X B; 3NUH B; 1QKZ A; 2FCQ A; 2DZI A; 1JQ4 A; 2KAN A; 3H8H A; 5KHO A; 1V86 A; 3BYT B; 2GRI A; 2MH7 A; 3R2T A; 1J0G A; 1V1P A; 1RFA A; 3ZNH B; 1ZDX A; 3TIX A; 4RGT A; 3N32 A; 4KZ0 A; 3VRB B; 3QWZ B; 3J9C A; 3RI7 C; 3N1Y C; 1S3S G; 2JZP A; 4W9E A; 3AED B; 4GOC A; 3K9O B; 4E3C A; 2CU1 A; 1HEZ E; 4HVB A; 2AX5 A; 4NQK E; 2DEN B; 1HTO A; 2CJO A; 3V6C B; 1XD3 B; 5HI1 A; 2W9N A; 2KC1 A; 2NCN A; 1SIF A; 4DDI D; 2ON8 A; 2KLC A; 1B1Z A; 4PT5 A; 5IN7 A; 1UGJ A; 3DDC B; 2KX3 A; 4B0M A; 5HFY A; 3ECI A; 2WYQ A; 3BII D; 4I6P A; 2FNJ B; 1FM0 D; 1MVK A; 2VZK B; 3WAN A; 1ACC A; 4JIO U; 4JGH B; 2O6V B; 2KK8 A; 2M0A A; 2MBO A; 4NJC A; 3L10 B; 5D94 A; 2L76 A; 3X23 A; 2LRU A; 2IZV B; 2AQ1 B; 5AZH A; 1V81 A; 3R2I A; 4W9J A; 1EU3 A; 4WQO B; 4CO7 A; 3ZNZ B; 1E6E B; 3VR8 B; 3TJP A; 4S17 A; 1YN4 A; 4OVZ A; 1KM7 A; 1JWM D; 4BBN C; 1LFD A; 1SSN A; 4MGY E; 2QJL A; 1PGB A; 2QHO A; 1T0Y A; 2WU2 B; 4HCP B; 3H7S A; 2FBW B; 1C79 A; 1FXA A; 5D2M B; 4BKT A; 1C9F A; 1YJJ A; 3ZLZ A; 3U8Z A; 3B0A A; 2O6V A; 4A9A A; 2KC2 A; 4LJO B; 3PO0 A; 4YT0 B; 2JVC A; 5AUI A; 2KN4 A; 4HDQ A; 1GAQ B; 1YN5 A; 4P1B C; 4LNI A; 1J7B A; 4LJP B; 3K9P B; 4C7Y A; 2W3S A; 1WXA A; 2ZW0 A; 1I4G A; 1FNV A; 2I1J A; 1LM8 B; 1A70 A; 2DZM A; 1TKE A; 1P7F A; 2XK5 B; 2KO3 A; 3VQI A; 1WR6 E; 1E8Y A; 1CZP A; 2K8B A; 4WJP A; 5HG2 A; 3U7Z A; 2GBR A; 1RFK A; 1KOT A; 3CIR B; 4HXD A; 3WAO A; 2LGX A; 4FBJ B; 1SE4 A; 3AEC B; 3HUI A; 2DYO A; 1YX6 B; 2WNM A; 2BGF A; 1QOF A; 3A33 B; 4DXF A; 4XYC A; 1T0R C; 1PUT A; 5CX3 A; 2G9H D; 2NBV B; 2RD0 A; 1E9M A; 2IO1 B; 3CMM B; 2RGF A; 3RYT A; 2MBB B; 1AW7 A; 2Z8L A; 2QC8 A; 2RR9 A; 4IWP A; 2LUM A; 3KQ4 A; 4N58 A; 4XX5 A; 2QCZ A; 1OEY J; 1XCT L; 3DVN V; 3AEF B; 1XLP A; 2PPH A; 1ET6 A; 2XK5 A; 1OFF A; 3ZIM A; 3NZ3 A; 2I1K A; 3PRM B; 4ANV A; 1K51 A; 1HZ5 A; 4GGQ A; 4LDT B; 2K9X A; 1YMH E; 2WXJ A; 3AU5 A; 1L2N A; 3I63 C; 3H7P B; 1VRA B; 2XBB C; 3HRD D; 2JU6 X; 1WJU A; 2KTR B; 4IOI E; 1VCB A; 5TR5 A; 1Q0W B; 4C4V B; 4RM8 A; 3D32 A; 2ZW1 A; 5JHA A; 2B76 B; 3MJW A; 2Z0E B; 3KH0 A; 3QQ8 B; 2W55 A; 1WRD B; 2IO2 B; 1I4H A; 4P6V F; 3RNG C; 2ZEQ A; 1GOZ A; 1HQR D; 4RNA A; 3DVG Y; 3H9D A; 4XDD A; 2CJN A; 4EZL A; 5T8I A; 3GP7 A; 2OED A; 2KAC A; 4ANW A; 2KNB A; 3LB8 C; 5J18 A; 1K8R B; 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