2JZSA

Solution structure of the reduced form of the n-terminal domain of pilb from n. meningitidis.
Total Genus 31
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
31
sequence length
144
structure length
144
Chain Sequence
MVPHTLSTLKTADNRPASVYLKKDKPTLIKFWASWCPLCLSELGQTEKWAQDAKFSSANLITVASPGFLHEKKDGDFQKWYAGLNYPKLPVVTDNGGTIAQSLNISVYPSWALIGKDGDVQRIVKGSINEAQALALIRDPNADL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Solution structure and dynamics of the reduced and oxidized forms of the N-terminal domain of PilB from Neisseria meningitidis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB
molecule tags Electron transport
source organism Neisseria meningitidis serogroup a
total genus 31
structure length 144
sequence length 144
ec nomenclature ec 1.8.4.11: Peptide-methionine (S)-S-oxide reductase.
pdb deposition date 2008-01-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2jzsA00
2VM1A 1B48A 3O6TA 3VFIA 1FO5A 1ABAA 1GNWA 1VF2A 3G7YA 4O32A 5IQYA 4JU5A 3GH9A 3W8JA 2AV4A 1SL1B 1TU8A 2HT9A 2YNXA 1G6YA 3C71A 2VCWA 2LKUA 4ULXA 1XOBA 4G10A 5HR0A 1BYEA 4KX4A 3LXZA 4ECCA 2V41A 1K0AA 3BCIA 2C1YA 1XWAA 2MMAA 3QAVA 4MJBA 4HI7A 3QOUA 3D4TA 4X1UA 4MCUA 3M9KA 3TKPA 1JHBA 1OVNA 4PNGA 2YCDA 4EUYA 1GLPA 4K9ZA 5AN1A 3LYKA 3TKSC 3M0FA 3C73A 2Z9SA 1GTBA 5CYYA 2C8UA 1SKRB 1OC8A 6GSVA 2OADA 2CQ9A 4KDUA 3TJGA 5CRWA 4TN8A 1ZYEA 5GAPD 3APQA 1XW6A 2ES7A 4L8EA 1PL2A 2IMEA 1VGLA 4J57E 4TR4A 2O87A 1E2YA 4EL1A 1M99A 2KHPA 3LWAA 1MDKA 3UOMA 5ECIB 4KAEA 3UARA 2B5XA 3GKNA 5ECOB 2K9FA 1X5EA 3EMPA 5J3RA 1ZL9A 4TW5A 1U6TA 3ZFLA 2A2SA 3DMLA 3GKXA 1H75A 4O92A 4Z7XA 1F3BA 5G2ZA 1E6BA 3UJ1A 1TTZA 1VF3A 4WBJA 5CP1A 4MZCA 1SYRA 1S3AA 3FKFA 2H66A 2EIOA 4GSNA 1AUCA 1T1VA 4IW9A 3H4KA 2VIMA 1X9SB 1TRSA 2BTOT 1WMJA 5HR3A 4EC0A 2H8LA 6GSXA 5IOWA 2O89A 4WEYA 5GAND 3DEXA 2OE3A 1O8XA 1XPVA 4CDOA 1TJDA 4ECJA 2OBKA 1JZRA 3PGTA 3F63A 3UIWA 5G1LA 5ELAA 1NHOA 2VCVA 1OC3A 4JEDA 4KW6A 3F6FA 1F9MA 2L6DA 3ME7A 1FOVA 4GF0A 4MMMA 1RQMA 4GWRA 2B5YA 3HJPA 2VD1A 5JWRB 2FA8A 3HA9A 2WULA 1WIKA 3LFLA 1EOHA 4AGSA 3HKRA 4FIWA 1JFUA 1B4PA 1JZWA 2HZFA 5DDLA 1BAYA 4ZBBA 4FYBA 1PA3A 3RPNA 5DQYA 1X0RA 2M80A 3DWVA 4EDYA 4OFTA 2N5FA 2NBSA 5ECQB 2YPMA 3LORA 2FGXA 3WYWA 3KMNA 4TXVA 3LJRA 1SJZA 2MMZA 2VL9A 1AQVA 1GP1A 3UMAA 3Q74A 1O6JA 3FZAA 5F0GA 1WJKA 3ZL5A 3L9SA 3MSZA 3GSTA 4IJIA 4KA0A 3KH9A 3TUEA 4IN0A 2DJKA 1ON4A 4IKHA 2P0GA 1WOUA 1XWBA 1X9WB 3L78A 2M72A 2OE1A 1GH2A 1TI3A 3H79A 3LYPA 5CAXA 4MH3A 1K0NA 5IMDA 1Z3EA 4WETA 1HD2A 2LRNA 2V6KA 2VO4A 2GT5A 4N0ZA 3HZ4A 5IMFA 3FY7A 3F4TA 1GUKA 3IA1A 1GNEA 3IE3A 3DKSA 3HY2A 8GSSA 4ZL9A 4YQUA 1MEKA 1YEXA 1WP0A 4EF0A 4WBRD 2GLRA 2H6ZA 3WD6A 1A24A 3ZFBA 3J7Yb 2CAIA 4MF5A 4EXJA 2YZUA 3WGEA 3VURA 4IP6A 1FHEA 2K8SA 4WKWA 2L6CA 1OE8A 3F3QA 2VCQA 1M9AA 2VLVA 4MA9A 19GSA 2MMNA 3MWHA 4F03A 2O85A 2HSYA 2H70A 3GKMA 3EWLA 1G7EA 2EIRA 1YDKA 2CA8A 1XW5A 1PKZA 3GKKA 2JSZA 1Z7PA 2CX4A 2GZZA 4FH8A 3OR5A 2IWTA 5H5RA 1EOGA 3DD3A 1V40A 4HQZA 1G6WA 1SYXA 2C80A 3RDWA 1R26A 1XBSA 1EEJA 3FZ4A 2YV7A 4HZ2A 4CW9A 2DMMA 2H1DA 4XIHA 2C3NA 2LJAA 3DIEA 3GUSA 1K0OA 4F9ZA 1QK8A 5B6NA 3R2QA 3P8WA 2IMDA 1URMA 5ECLB 5J41A 3RHBA 5IMVA 1GSQA 3ERGA 4MH2A 3QD9A 4G9HA 2FLSA 3P7XA 2C0DA 1A2MA 3QMXA 1F37A 4OO4A 4AF2A 4I97A 1TP9A 2N5BA 4MF7A 5IO2A 2I4AA 1XXUA 2F3MA 2IPAA 3I6AA 3KZQA 3TOUA 2E2GA 1SK2A 2C3QA 5B8AA 4XRDA 3EU4A 4HEA2 4TKYA 3CRTA 2I9HA 2PBJA 1W89A 3TRXA 4I2UA 1O73A 1IYIA 1J08A 1JZOA 3FW2A 3LSZA 4OFNA 1YY7A 1GULA 1QQ2A 3IAS2 4N30A 2YV9A 2R5GA 1SL2B 5G5EA 1XWGA 2FWGA 4NWYA 1THOA 4E8HA 20GSA 2KLXA 2HRFA 3U6VA 1GWCA 4DVCA 2F9SA 4IS0A 1MDJA 3HCZA 1LJRA 3IV4A 4MPFA 1GTAA 1K0CA 4OWYA 1ZGNA 1TRUA 4ML6A 2TIRA 5H5SA 1ZOFA 2H30A 2H74A 1TK5B 3KTLA 4IQAA 2VL3A 1DBYA 4WR4A 2HRNA 2P5RA 3C7MA 22GSA 3C8EA 1TOFA 1ERWA 3KIJA 4YQVA 4TVEA 4KNDA 4K1FA 5D8IA 4AJ8A 2MZCA 4XS6A 1W4VA 2L5LA 3HXSA 1XZOA 4K0NA 1YKCA 1OYJA 4Q5RA 5ECPB 1GSDA 2GS3A 2YJ7A 5CO3A 2YANA 2GSQA 3IPZA 1THXA 3JCML 2WFCA 3IRAA 4KSMA 3U5RE 3IXRA 4IVFA 2AHEA 2V2GA 2EC4A 4KE3A 1MD3A 5IIZA 3CMIA 3VI5A 3DVWA 4WF5A 1IYHA 1M0UA 4ILFA 1DSBA 4XHMA 4BWQA 1ILOA 2FNOA 3ZLPA 3GRXA 2WS2A 1A0RP 2VAFA 3FR6A 1AXDA 2YP6A 4HQSA 2HFDA 3MDKA 2C4JA 1RW1A 3HVSA 5HFKA 5GSSA 3L9UA 4XCSA 3AY8A 4ZIJA 4MJEA 2NTOA 4GQFA 2I3YA 2BMXA 2H76A 3NZNA 4DSQA 3L9VA 1SD8A 2LNTA 3W6GA 4FYCA 4IQ1A 3C1RA 4YH2A 4XS4A 2A2RA 2H71A 4LL4B 4NV5A 4MF6A 18GSA 5HFIA 2PERA 3C1SA 3IAM2 3CTFA 2ZUPA 4G2EA 4GTUA 1ZYQB 4KB3A 3RHCA 2VM2A 1OE7A 3ZMLA 5F07A 3VLNA 4HU9A 1QGVA 4HS1A 4BVYA 4F0CA 4ZILA 3FR3A 1NW2A 4P3YB 1LU4A 1BQ7A 5DJLA 2C0FA 1HNCA 1SK0A 1A2LA 3DRNA 1MTCA 1QFNA 4RI6A 4V1Ag 1O7UA 4KCAA 1A8YA 4OO5A 5E59A 5FHIA 3J7Yk 2B6MA 1UN2A 1NHYA 1ML6A 4NV2A 3KTBA 2YJHA 5IMAA 4TR1A 2PGTA 2FD3A 1B4QA 5ABRA 1DUGA 4XRAA 5ECNB 4BL7A 1GSUA 1FW1A 1WPIA 2ZNMA 1DE1A 4XS4B 1A23A 1O8WA 2AUVA 4K7OA 4KH7A 2FCHA 4MDCA 2PUKC 2H1GA 3ZYWA 1GL8A 3Q19A 2X99A 5J4UA 2IL3A 5IM9A 2MMOA 1YEPA 3HDCA 2KP2A 4L5OA 2VUPA 2P5QA 3EINA 4IGJA 1EP7A 2DJ0A 3EMXA 1KBNA 3BJ5A 4IJ3A 1K3LA 2GGTA 4I6XA 3V1WA 3VWUA 4GLTA 3KD0A 4OMVA 3GNJA 2VLTA 2WCIA 3O3TA 4DSRA 5AGYA 1Q98A 5DALA 3O76A 3Q18A 2DSAA 2GT6A 3F8UA 3DGQA 5ECRB 5H5QA 2PVOC 2LRCA 5ECHB 1V2AA 1AC1A 3H1NA 4TR1B 3BD2A 2LEGA 3GTUA 5LCZA 4ZXGA 2GQLA 4K8MA 5G31A 4LMVA 1SKSB 2HLSA 4YAVA 3EURA 4BVXA 2OE0A 1PX7A 4PX1A 4DEJA 3RPPA 3FHKA 3SWLA 5KEJA 1UA5A 5ID2B 1T8EB 3L4NA 3HYPA 3RBTA 1V57A 4XS1A 1F2EA 3TRQA 4PNFA 2JSYA 4RQXA 1B9YC 2FWHA 3GMFA 3MNGA 2YWNA 4GXZA 4ZB6A 1SJIA 3UVHA 2H73A 2GQMA 5B8BA 2CX3A 3IDVA 2WGRA 1VF4A 5DALB 4OCFA 2H0GA 1XOAA 1H4OA 3KM6A 5KN0A 4OD7A 1C72A 4NMUA 5KN3A 3PH9A 1WRYA 3GTUB 3APOA 4TR0A 5JWQB 2D2ZA 4MK3A 2L4CA 2OACA 3UEMA 1ZMAA 4GCIA 2IMKA 3SBCA 3QAGA 2PMTA 2CZ3A 3ME8A 3IC4A 5LD0A 3QDNA 1YJ6A 13GSA 3L0HA 1M9BA 5HR1A 1KTEA 1FB6A 2DJJA 1EGRA 1YF0A 1HNAA 6GSTA 4MABA 1S3CA 5DCHA 5EPFA 1T4ZA 1V9WA 3TGZA 3ZTLA 3CXGA 1ACVA 2L4QA 3A3TA 2B1KA 1I9DA 5JCUA 5B7CA 2X8GA 3D4MA 1UC7A 2HNLA 3CSJA 4HDEA 4MJCA 1ERTA 4O7HA 1GSSA 5D9VA 3A2WA 2MBSA 2LS5A 4DSSA 3A2XA 2KUCA 2F51A 4PGTA 3A2VA 3KP9A 3KGKA 2PN8A 2H0IA 4EO3A 2GZYA 4NXIA 1QUWA 2GSRA 5DJMA 1AQXA 1VF1A 2LNSA 3P90A 4GRFA 4N11A 3FZ9A 3LEFA 2MBTA 3KMOA 2C0EA 3A5WA 1PSQA 1O81A 2A4VA 2QC7A 1B8XA 4X0XA 4MLYA 16GSA 1BJXA 3EU3A 2I1UA 5G5FA 3QPMA 1XFLA 5D96A 1TW9A 2G2QA 1X5CA 2H6XA 4MZWA 1XW9A 2ON5A 2V6OA 2HZEB 3LQ7A 4I8BA 3GN3A 4LMWA 3WGDA 1OC9A 3TKQA 1EWXA 3M3MA 4DSSB 4PUAA 3CYNA 3HD5A 3VI7A 1T4YA 4ECBA 1K3YA 3UVTA 4F0BA 2B5EA 3GL5A 4EE0A 4ZBDA 4I2TA 2PWJA 1Z7RA 2H1BA 4Q5QA 3CTGA 2HXKA 3QR6A 2CVDA 3F3RA 2H01A 5AIXA 3TB2A 2RUFA 1Z9HA 3BBYA 3ED3A 5D9TA 3UBKA 3HVXA 1JLVA 1TK0B 4KDXA 4HJMA 5CNWA 2LQOA 2TRXA 5IPHA 3CBUA 1G0TA 2TRCP 1KEBA 4X43A 5C00A 3HJMA 2HI7A 4ZL8A 5EL8A 3S9FA 1OC9B 2QKEA 3Q6OA 1K0DA 4IHUA 1OAZA 2YWMA 1XVQA 1ERVA 1SENA 1SU9A 2V32A 1BX9A 1B9XC 4F2IA 4Q5NA 3ZVJD 4JR6A 1U87A 1PN9A 4MJAA 3ZIJA 2GDRA 4POMA 3LG6A 1GTIA 2VCZA 2RM5A 3KCMA 1GUHA 1YF1A 2H0HA 4POBA 3M9JA 3W8SA 1XWKA 2BJXA 5AIVA 2MYGA 1TXXA 4POLA 2HYXA 3BOAA 2R2JA 1LBKA 1U3IA 3F4SA 2P31A 4TRXA 2H75A 5IO0A 1GRXA 2C0GA 2FHEA 3KEBA 1Y25A 4EDZA 1QXHA 1FVJA 4KCEA 2O7KA 2VOCA 2PVQA 2NPBA 2B1LA 2KOKA 5G1KA 1AW9A 1X9MB 3FEUA 4NHWA 1PX6A 3EE2A 4K2DA 3TJJA 4PURA 3G9BA 3TJBA 4JRRA 3E9JB 5ECKB 2OA7A 3IR4A 4ECIA 1T3BA 4JE1A 2VCTA 5CRDA 5ENUA 1EV4A 1WWJA 1EGOA 2NDOA 2LJKA 2VL2A 4HOJA 4ZL7A 3PR8A 6GSWA 4HUAA 1K3OA 3QFAC 3LXTA 1GSEA 3FRCA 4D73A 2DJ1A 4ISDA 5LNKe 5A4WA 2CT6A 2I81A 5D93A 2L59A 4LLRA 1V98A 2DJ2A 4WXTA 2CV4A 5GSTA 3GH6A 4BA7A 3G7IA 3MAKA 3ZMKA 1BEDA 1EEMA 1GSYA 2XBIA 1USBA 2RUEA 1PMTA 2GVPA 2YWIA 1QMVA 5IMCA 2JZTA 3RAZA 5COHA 1GTUA 3UBLA 2LUSA 1SKWB 2IMFA 4BPYA 2B7KA 4HU7A 3VPTA 3E0UA 5E4WA 1PD21 3KH7A 1TK8B 1PRXA 5ECSA 5ECMB 4D73B 4PQ1A 5ELGA 1EV9A 4V1Ap 2HSHA 4N10A 3GL3A 1CQHA 5IMZA 2H1AA 1TRVA 2E7PA 3IOSA 5GZZB 2DMLA 12GSA 1FAAA 3PINA 2IJYA 1TKDB 4PQIA 2REMA 4Q5FA 4ACSA 2DBCA 2E0QA 3FR9A 2J9HA 2F8FA 2QGVA 3F6DA 3GX0A 2ON7A 1T7PB 2H72A 5B6MA 2JZSA 3FYGA 5JCGA 4O5RA 4KUNA 3DYRA 1HYUA 2B3SA 4IP1A 1DE2A 4RI7A 2N5AA 1M2AA 4POKA 1U3AA 3GHAA 3KJYA 1GUMA 3ZREA 5KN1A 4YAPA 2XHFA 5ID2A 1GSFA 1O85A 2YN1A 1XCCA 2B7JA 5EVOA 5DAKA 1YQ1A 1TRWA 1NM3A 5J9BA 3TKRA 3KXOA 2CVBA 3HVVA 1OKDA 4PXOA 3ERFA 2DJ3A 1Z6NA 2YZHA 2WJUA 1WE0A 3FZ5A 1S3DA 3TDGA 1MDIA 4N0VA 2GSTA 2GZPA 3I43A 5A5KA 1AIUA 2R6KA 4TR3A 4IBPA 1I5GA 2GSSA 3EC3A 2AYTA 4TXOA 2WDUA 2VD0A 5DVBA 2R3XA 2JADA 4J56E 3GFKA 2VCXA 4PQHA 9GSSA 5CRGA 1YZXA 2JACA 5HR2A 1NSWA 4ID0A 5IPGA 3QFBC 4AJ7A 1YKAA 3EVIA 5DAKB 4V2LA 4ZB9A 3GV1A 4GQCA 1FG4A 5F05A 1K0MA 2LQQA 4RQRA 5DBQA 7GSSA 1RK4A 2K6VA 2CAQA 5CREA 3TKSA 4QL9A 2AJQB 1M2DA 3ZVJA 1R7HA 3VWXA 4TXOB 6GSUA 3LGCA 3NIVA 1TDIA 5FT3A 1Z6MA 1SD9A 3VK9A 4EVMA 4WR5A 1GLQA 1BG5A 6GSSA 3HZ8A 3D5JA 1JLWA 2XC2A 17GSA 4YQMA 2GQKA 1M7TA 2K8VA 1AAZA 4MP4A 4L0WA 2XPEA 4NAXA 2G0FA 2X8CA 5JCWA 4MZBA 3P2AA 1FVKA 1OKTA 4HZ4A 3ZRDA 4KSOA 1JZDA 3F0IA 2YOIA 2HE3A 5EY6A 2V1MA 1SL0B 2VLUA 2H19A 4LL1B 2KP1A 2DIYA 2HZEA 1TI1A 3E3EA 3TKSE 2DLXA 2AB6A 4FO5A 5A4VA 3US3A 2RLIA 2CVKA 5F8BA 5L71A 3I9V2 2RIIA 3IK7A 3VPQA 1ZZYA 2JL4A 5C04A 4QL7A 5DQSA 2PU9C 1R5AA 3TCOA 4ML1A 4JR4A 4KDYA 3UL3A 2FA4A 4J2FA 4JZQA 3EYTA 1PGTA 3H8QA 3GYKA 3NOFA 2NVLA 3TRPA 4K6XA 4GSTA 2LV3A 2IIYA 2O8VB 5J9CA 4V2NA 2IN3A 3IHQA 4MPGA 3QCPA 1EP8A 4NPBA 3HHVA 3IBHA 3ZIVA 2OBIA 1MD4A 2LTKA 4BWSA 1R4WA 3CRUA 4KGIA 2ZCTA 5INYA 5IOXA 2JU5A 5HQPA 4FYUA 1R5PA 1F6MC 14GSA 4AJ6A 3IK9A 2WZ9A 3ZITA 2LRTA 2WRTA 4F82A 2XBQA 1PL1A 11GSA 1A0FA 3APSA 1AQWA 3GURA 3UAPA 3TJKA 1KNGA 2H6YA 2YWOA 2L57A 1G7OA 2FUG2 4HJ2A 4CHSA 2F8AA 2VL2C 4ZB8A 1SK1A 1A2JA 3M1GA 3F4RA 1EZKA 4I5QA 1J9BA 2IMIA 4V2MA 3DVXA 2OJLA 4XTSA 1PQNA 3WGXA 1PKWA 1SJ6A 1U88A 1V58A 3ISOA 3N5OA 3FK8A 2PPTA 2K18A 4PUFC 4ZBAA 4L0UA 1HNBA 3TOTA 5G30A 4WF4A 1A8LA 1N2AA 3ZZXA 5FWGA 1UVZA 3F9UA 3K8NA 3WT1A 5AISA 1XVWA 4G19A 2RM6A 1T00A 4IELA 1F3AA 4H86A 4QQ7A 2E2MA 3G7JA 1FB0A 1VRSD 1M2BA 3H93A 3KP8A 2GTUA 2R4VA 5D9XA 4RUVA 3HJOA 3ERWA 4K0GA 3GA4A 1ERUA 1Q4JA 1XIYA 2XPDA 3D22A 3I69A 3GX8A 5D9WA 4TOPA 1Z5YE 2IFQA 2FY6A 3GIXA 3D21A 3QAWA 2M46A 1Y6EA 2X8HA 1HQOA 6GSYA 2R37A 3CSHA 3N9JA 5JWOB 4EKZA 1X5DA 3BCKA 5J5NA 4L5LA 5DCGA 3DXBA 2AAWA 1N8JA 2J23A 5KN2A 2L5OA 2LJRA 5A4UA 3VWVA 2C3TA 5D73A 2FWEA 2ALBA 2X64A 4E8EA 3TJFA 4LA1A 3VWWA 3D0ZA 2WB9A 3CSIA 1J0FA 4NHZA 2EIQA 10GSA 2IFQB 1TU7A 1ST9A 4GSSA 1K0BA 5F06A 5HFGA 2QSIA 3GSSA 2DC5A 3M8NA 3WT2A 5CRHA 1CQGA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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