2JZSA

Solution structure of the reduced form of the n-terminal domain of pilb from n. meningitidis.
Total Genus 31
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
31
sequence length
144
structure length
144
Chain Sequence
MVPHTLSTLKTADNRPASVYLKKDKPTLIKFWASWCPLCLSELGQTEKWAQDAKFSSANLITVASPGFLHEKKDGDFQKWYAGLNYPKLPVVTDNGGTIAQSLNISVYPSWALIGKDGDVQRIVKGSINEAQALALIRDPNADL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution structure and dynamics of the reduced and oxidized forms of the N-terminal domain of PilB from Neisseria meningitidis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB
source organism Neisseria meningitidis serogroup a
molecule tags Electron transport
total genus 31
structure length 144
sequence length 144
ec nomenclature ec 1.8.4.11: Peptide-methionine (S)-S-oxide reductase.
pdb deposition date 2008-01-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2jzsA00
5KN3A 1ST9A 4TR3A 1AQWA 3UBKA 3GURA 5CRGA 4EXJA 2F51A 3SWLA 2AYTA 11GSA 2C3QA 3HJMA 1QMVA 2VCXA 1X5EA 2WGRA 3OR5A 3MSZA 4HJMA 2CV4A 2LQOA 1SK1A 3QR6A 2VAFA 2H73A 3O6TA 4KAEA 1EEMA 4AJ7A 2L4CA 2GSSA 2DSAA 2I3YA 1IYIA 4LMVA 2K9FA 3RBTA 1PKWA 3I43A 4OFNA 1N2AA 3L78A 4JR6A 3E0UA 3HY2A 2TRXA 1ILOA 4E8HA 3LYKA 1YDKA 6GSWA 1V58A 2YPMA 5C04A 3KD0A 1YF0A 3TRXA 2PPTA 4XIHA 3UAPA 4X43A 3ISOA 2LNTA 2L59A 3TKPA 2RLIA 1K0DA 1V9WA 1HNAA 3RHCA 2X8HA 4K6XA 2WZ9A 4J57E 4F0BA 2NBSA 2O85A 3IXRA 4TKYA 1QK8A 1ZYQB 5DALA 5ECHB 2IFQB 1HQOA 4MF7A 3D0ZA 2OA7A 2PERA 5J41A 2GT6A 3GSTA 1ZGNA 2VCTA 4WETA 2YP6A 2AHEA 4YH2A 3KM6A 1OC9A 2IIYA 4X0XA 3NZNA 4RUVA 4TR4A 4QL9A 3H79A 2TRCP 2N5FA 4TR0A 4EO3A 3D21A 2VIMA 2HFDA 2H0HA 3AY8A 3TCOA 3QAVA 1CQGA 1LU4A 2PVQA 3GHAA 2E2MA 2OACA 5ELAA 3UIWA 1SL2B 3W6GA 4K8MA 4FO5A 1GTBA 2YCDA 2NTOA 2AV4A 3KXOA 2XPDA 5L71A 3KGKA 1FB0A 4MMMA 1WOUA 2ZNMA 3ZFBA 3DVWA 3E9JB 5EPFA 5D9TA 3TJJA 4V2NA 3GRXA 1XXUA 3ZMLA 3D4MA 1U6TA 1JZOA 2VCWA 4IHUA 2OE1A 2TIRA 2VLUA 5CP1A 2D2ZA 3M0FA 2V6KA 3CMIA 1VF2A 4ZBAA 2YZHA 4MK3A 5F07A 4IJ3A 2B1KA 3Q19A 1F3AA 1ON4A 2IMKA 3WT2A 5IMAA 3KCMA 1GSEA 3FZ4A 2DIYA 2CVDA 1B48A 2H8LA 4G19A 4DEJA 3IE3A 3PR8A 3TGZA 3IK9A 5DVBA 3IRAA 1B9XC 2VLTA 4MZWA 4WBJA 2IFQA 2QSIA 4OD7A 2GQLA 1Z3EA 5GAPD 3TKSC 3P90A 4I2UA 4TVEA 22GSA 1VF3A 1TRVA 4PX1A 1TDIA 1O81A 3QPMA 3N5OA 1AXDA 1PL2A 2FWHA 1EZKA 4OFMA 5H5SA 1XIYA 2H1GA 3A2VA 3TRPA 3APQA 5CO3A 2GLRA 4N10A 1SJIA 3NIVA 3QFBC 1E2YA 3VFIA 1XWAA 4MJBA 5CRDA 1R4WA 1B9YC 3ZYWA 5KEJA 5IQYA 4EF0A 2H6YA 4XS6A 3EINA 1HNBA 4LL4B 1B4QA 1FW1A 10GSA 1V98A 3G7IA 4HJ2A 5ID2A 4NHZA 2E2GA 3L4NA 5B7CA 3L9UA 4GLTA 1K3YA 2VD1A 3LEFA 2FD3A 4IN0A 3WYWA 2A4VA 4G2EA 14GSA 1ERVA 2FNOA 1TXXA 2PU9C 5AIXA 3F8UA 5JCGA 1DBYA 2GVPA 1QUWA 2H71A 2F8FA 1M2BA 1XWCA 4OO5A 3KTBA 2O89A 3ERFA 2YANA 2A2SA 3CTGA 3FZ5A 5KN2A 2H19A 2N5BA 3CXGA 1K0MA 4YQMA 5KN0A 4P3YB 1XW6A 2B5XA 3LXZA 2X8GA 3G7JA 2HSYA 3I69A 1IYHA 5LD0A 3DD3A 4NAXA 5F0GA 5DDLA 4PQHA 2HSHA 4EE0A 2FWEA 2DC5A 1SKRB 3HDCA 3GNJA 1FG4A 1G6WA 1O8XA 3DYRA 1XVWA 1K0CA 4K7NA 4XHMA 4QL7A 3RHBA 3ZVJA 5IM9A 5J4UA 1TK8B 3TB2A 1E6BA 2FUG2 4WEYA 1TRUA 2L4QA 5HR0A 4YAVA 4MZBA 13GSA 4OFTA 2K8VA 4G10A 4O92A 3CSJA 3GIXA 4POMA 1HNCA 5G5EA 1ERWA 4RQRA 3QD9A 2FGXA 1K0OA 1RK4A 3G9BA 4ZL8A 2MBSA 4AF2A 2H72A 1G7OA 3WGEA 4FYBA 1ZYEA 5LNKe 4KA0A 5FWGA 5DCGA 3HZ4A 1CQHA 2VCVA 3GTUA 4PQIA 2V6OA 1J08A 2KP2A 1GL8A 2CAQA 3HD5A 5H5RA 6GSVA 3EU3A 1TKDB 2LEGA 1Z6NA 4K1FA 2JACA 4MZCA 3IAM2 4NV2A 2IJYA 2MMAA 3A3TA 2IL3A 5IMFA 3TKRA 4ZBBA 4MF5A 2RUEA 4N0ZA 4L5LA 3H4KA 3TJFA 1MDJA 1ZOFA 4MPFA 1SD8A 4MP4A 19GSA 1BX9A 2GZPA 1G0TA 4I97A 3ZLPA 3O3TA 1TW9A 2XHFA 5DBQA 4NPBA 4NXIA 4GTUA 2VO4A 4OCFA 1JZWA 3APSA 1AQVA 4O7HA 3IK7A 2YJ7A 4PQ1A 5IO2A 3M8NA 4ZB8A 3FRCA 2C0FA 4IGJA 2MMNA 3TJGA 1WMJA 2H66A 2R3XA 3GSSA 4K7OA 4JR4A 5DCHA 2EIQA 1M7TA 1O7UA 1EOGA 3US3A 1GP1A 3FR9A 4XRDA 1ERTA 1PX6A 1FO5A 4F9ZA 3KIJA 3K8NA 5G1KA 3D22A 4KDUA 1NM3A 4DSQA 3ME8A 1GTUA 3VI7A 2HLSA 3DEXA 4PNFA 2QC7A 1KTEA 2GGTA 3RAZA 4RI6A 3KMNA 1WPIA 4ZB6A 5HQPA 2K8SA 4IQ1A 3F4SA 1J9BA 4WKWA 3SBCA 5E4WA 1GUHA 2IMFA 4K2DA 2ES7A 1OKDA 1O8WA 3TRQA 5IMVA 3IDVA 1M2DA 2PMTA 5D9XA 4MDCA 3QCPA 5D73A 1DE2A 1U87A 2IMIA 3IHQA 2JZTA 1LJRA 1SJ6A 1RQMA 4YQUA 1W4VA 4X1UA 4H86A 3ED3A 1GWCA 2M46A 4Z7XA 2R4VA 1GLPA 1MD3A 2VUPA 1ABAA 1BYEA 12GSA 1R26A 2YV9A 7GSSA 3KJYA 3KP8A 3TKSA 5J5NA 3ZL5A 3VI5A 1XZOA 2AB6A 2ALBA 2AUVA 3C71A 2YNXA 3ZRDA 2JL4A 2P5RA 5F05A 2DJKA 5D9WA 2WFCA 4XS4B 5D96A 3O76A 4MF6A 2FA8A 3DGQA 4NHWA 2KHPA 17GSA 3LSZA 2LSTA 5IOXA 4EVMA 5ECPB 2EIRA 4EDZA 1USBA 1PD21 2I81A 5B6NA 2OE3A 3EC3A 1ZMAA 2P31A 3Q18A 3VLNA 4KCEA 4MLYA 2G0FA 3CBUA 4BVYA 4HZ2A 2WJUA 3GUSA 4ML1A 2VL2A 3ZIVA 3VPTA 6GSSA 2FWGA 5ECIB 5E59A 1X5DA 1GH2A 1T7PB 2I4AA 2VLVA 5D8IA 2E7PA 1TU7A 3KH9A 2H6XA 1XPVA 5HR2A 3C7MA 2WDUA 5A4WA 5IPGA 2YWIA 5A5KA 1A2LA 5IMCA 2LKUA 1PX7A 2DJJA 4TXOB 5ECOB 5JCWA 5CREA 1GNEA 1SYRA 2HXKA 2N5AA 3GX8A 3TOUA 5DJLA 1Z6MA 1K3LA 4K9ZA 3ZTLA 2DJ3A 1JZDA 2M80A 3EU4A 3A2XA 4MJCA 4XRAA 1AIUA 4ILFA 1B8XA 1A23A 2GZYA 3HA9A 1GNWA 3CRUA 2H70A 4ZL7A 1X9WB 3UMAA 1ERUA 1PGTA 1AAZA 4HU7A 2P5QA 2LQQA 5B8AA 2YWNA 2F8AA 2NDOA 3BBYA 1O6JA 1PA3A 4ID0A 1SL0B 5HR3A 1JFUA 1MD4A 3LGCA 3LWAA 3F0IA 2R2JA 3J7Yk 1O73A 3GYKA 1RW1A 3V1WA 1GTIA 2MMZA 3F9UA 3EYTA 3TUEA 3VPQA 4Q5NA 2H01A 4TR1B 2O8VB 3QDNA 3MNGA 2XC2A 2J9HA 2H1AA 1KNGA 1NSWA 2F9SA 2XBQA 3UJ1A 2DJ1A 4TRXA 5ABRA 5J3RA 5G31A 1U3AA 1YZXA 4AJ6A 5GZZB 2CVKA 3PINA 1K0NA 1B4PA 3HJOA 3CTFA 6GSXA 1VRSD 5KN1A 4KDXA 2CX3A 4IBPA 2MZCA 1WE0A 5CNWA 3H1NA 2ZCTA 2YOIA 3L9VA 3P7XA 4JU5A 2C0EA 3VURA 4HU9A 4BA7A 4L0UA 1HD2A 1QXHA 1G6YA 3ZITA 1I9DA 2I9HA 3VWVA 5AIVA 1EP7A 1WRYA 5EL8A 4JEDA 3WD6A 3HCZA 4KDYA 2VCQA 4LA1A 1M9AA 2C8UA 3M3MA 2IPAA 5IMDA 3I9V2 3TJKA 2EIOA 5DJMA 1UC7A 4KUNA 1JHBA 1A2JA 2HRNA 3BOAA 3MAKA 3C8EA 3CSIA 1U3IA 2RUFA 3L0HA 3ZVJD 5FHIA 1X5CA 1JLWA 2L5LA 3EE2A 5ELGA 4I5QA 2EC4A 4L5OA 4MABA 2GQKA 1OE7A 4BWQA 2IN3A 2PWJA 5ECKB 2L6DA 4F82A 1MEKA 2YV7A 4FYUA 3LORA 3WGDA 4ECJA 4L0WA 1PSQA 5JWRB 5ECNB 1F37A 2OBKA 2WRTA 2J23A 4KGIA 4KH7A 4V1Ag 2JADA 2H0GA 4OMVA 2RM6A 1M99A 4IVFA 2ZUPA 2WULA 3NOFA 4KE3A 4GSTA 2HRFA 1PQNA 2X64A 2DMLA 5COHA 1XOAA 3ZFLA 2CX4A 1BJXA 4Q5RA 3KH7A 4F0CA 4GWRA 1FB6A 2O87A 6GSYA 1PL1A 2LS5A 2RIIA 1XCCA 3HVXA 4BWSA 3TDGA 1FVJA 4IJIA 2X8CA 2KP1A 4KNDA 4IW9A 4EC0A 4ECCA 3F6DA 2B7JA 5ENUA 5IOWA 2GS3A 4ZB9A 2B7KA 5DQSA 2ON5A 1EGRA 4DSSB 2CAIA 4WR5A 3FY7A 2PVOC 2CT6A 4I6XA 3EMXA 3GV1A 3ERWA 5C00A 2HZEB 2XPEA 1QFNA 4L8EA 5FT3A 1XBSA 2AAWA 2Z9SA 3CYNA 3P2AA 5HFIA 3APOA 1AQXA 1I5GA 3Q6OA 2B5EA 3IAS2 2REMA 2WB9A 4AJ8A 4WF5A 1XVQA 4IELA 3M1GA 1FVKA 1TOFA 3E3EA 1FAAA 2GZZA 4IP6A 5J9BA 3GH6A 2OE0A 3IV4A 1BG5A 3DKSA 3KZQA 1F2EA 4CW9A 1Y25A 4N30A 1PKZA 1EV4A 2MMOA 5G30A 3GL3A 1GSQA 1OAZA 4GSSA 1YY7A 2K6VA 2M72A 1XW5A 2YZUA 3GFKA 4ZIJA 1ZL9A 3DVXA 2LRNA 1Q98A 5ECMB 5G5FA 3HYPA 4QQ7A 3F3RA 3UOMA 1W89A 2QGVA 1OYJA 3PH9A 5DALB 2DMMA 2L57A 3IA1A 3ME7A 4GQCA 2C0DA 1H75A 3GKXA 2YN1A 4F03A 2AJQB 3GKNA 3BD2A 4G9HA 1A8YA 1YEPA 1MTCA 4RQXA 1DE1A 3GH9A 3FEUA 2P0GA 3IPZA 4JZQA 2LRTA 1T1VA 5LCZA 4TOPA 2PGTA 2GDRA 1WJKA 3J7Yb 3HVVA 4PUFC 1R7HA 2LJAA 4PNGA 16GSA 1S3CA 5F8BA 4KB3A 5ECSA 3ZMKA 3ZREA 4NMUA 1A8LA 4O5RA 2H30A 2GQMA 2LJKA 4CDOA 3FYGA 8GSSA 3GKKA 2DJ2A 4XCSA 3EWLA 2HZEA 1R5PA 5ECLB 2L5OA 1YEXA 4GRFA 3VK9A 2WCIA 2H6ZA 4NWYA 1NHOA 2YWMA 5D9VA 4ML6A 1F9MA 2CZ2A 2DBCA 4EL1A 1GULA 4ZBDA 3ERGA 2WS2A 4HS1A 1TTZA 4LLRA 1GSSA 2H1BA 2HT9A 4ZL9A 1V40A 2OADA 3QAGA 2CVBA 5GAND 4HQSA 2R37A 1OE8A 1SK0A 4J2FA 1Z7RA 4ISDA 1KBNA 3JCML 2HNLA 4TN8A 2R6KA 5G2ZA 3LJRA 3LG6A 3M9KA 1GLQA 3CRTA 4WR4A 1G7EA 3FK8A 3QAWA 2IWTA 2V2GA 20GSA 2LUSA 2RM5A 4TW5A 3EVIA 2I1UA 1T00A 1K0AA 1Z5YE 3C73A 2V32A 3FW2A 1YKAA 1YKCA 4JRRA 3W8JA 3S9FA 2KOKA 1A24A 2B5YA 3L9SA 2LNSA 3HVSA 3TJBA 3QMXA 2OBIA 2HE3A 1UVZA 1A0FA 1A0RP 1S3AA 1BQ7A 3GL5A 3PGTA 2HYXA 1AUCA 4BL7A 2JSYA 4KW6A 4D73B 3GN3A 3HHVA 2NVLA 4MJAA 3RDWA 4JBBA 2VM2A 4MH3A 5DQYA 4JE1A 4DSRA 2CQ9A 1F3BA 1ACVA 1SL1B 2QKEA 4TXVA 5CYYA 3W8SA 5IO0A 1VF4A 4YQVA 3VWWA 3BJ5A 5IPHA 3MDKA 2V41A 3HKRA 2JU5A 2L6CA 1GSUA 3DMLA 5HR1A 5D93A 2LTKA 1GSDA 2FHEA 3UL3A 5ECRB 1SD9A 1SK2A 5AISA 2ON7A 4V1Ap 4MA9A 2C3NA 4IP1A 1GSFA 2E0QA 3LFLA 5GSTA 5ID2B 4HEA2 1AC1A 2C4JA 1M2AA 2FLSA 1NW2A 3EURA 1SU9A 3KMOA 1OC8A 2GTUA 3RPPA 1UN2A 5F06A 1EP8A 2IMEA 1F6MC 5B8BA 9GSSA 3N9JA 4ZXGA 4GXZA 3F4RA 4Q5FA 5EY6A 4PURA 1Q4JA 1DSBA 1THXA 3H93A 1U88A 3EMPA 2B1LA 1UA5A 1V2AA 3HZ8A 2H75A 2FCHA 4XS4A 4K7IA 2HI7A 1PRXA 3TOTA 2PBJA 4EUYA 1EWXA 4I2TA 2VCZA 4BPYA 2VL3A 5INYA 2C0GA 3QOUA 4WBRD 4GCIA 4FH8A 2BMXA 3G7YA 1X9SB 1BEDA 3LQ7A 1WWJA 5G1LA 4D73A 4K0NA 3MWHA 1SKSB 4OO4A 1SKWB 4PUAA 2C3TA 1XOBA 1SENA 2CA8A 3DXBA 4CHSA 2VM1A 4PXOA 4BVXA 4YAPA 4DVCA 3IR4A 3LXTA 1T4ZA 2LJRA 2PUKC 4GF0A 3FZ9A 1KEBA 2R5GA 2B6MA 1GTAA 3FHKA 4ECIA 3FR3A 5CAXA 3R2QA 4KSOA 2FA4A 1EOHA 2XBIA 3F4TA 1SJZA 5J9CA 3FKFA 2OJLA 4TXOA 3HJPA 4N0VA 2IMDA 1T3BA 4NV5A 4WXTA 5CRHA 3D4TA 4V2LA 3GTUB 3VWUA 2VL2C 4KSMA 3F6FA 3DIEA 6GSUA 5IMZA 1GUMA 3KEBA 2HZFA 1DUGA 3TKQA 2H74A 1URMA 2CZ3A 2F3MA 3FZAA 1BAYA 1XWBA 4ZILA 18GSA 1OC3A 2GSRA 1MDIA 3M9JA 2V1MA 1YJ6A 4GSNA 1A2MA 1ZZYA 3TKSE 3LYPA 4N11A 4HDEA 3UVHA 1XWKA 3IC4A 4XTSA 3BCIA 2K18A 5EVOA 4KCAA 2LRCA 2LV3A 4IQAA 2YWOA 1TK0B 4TR1A 3C1RA 1AW9A 5ECQB 4EDYA 4LL1B 4ACSA 4O32A 1TRWA 2KLXA 3GA4A 1VGLA 1TI1A 1TP9A 1EV9A 5DAKB 1TK5B 3CSHA 5A4VA 4MCUA 1YF1A 1QGVA 1EEJA 4E8EA 1TI3A 1LBKA 4EKZA 3D5JA 1H4OA 4POKA 1PN9A 1VF1A 3GMFA 4FIWA 1QQ2A 4AGSA 4V2MA 4MJEA 5CRWA 4ULXA 3UEMA 4HUAA 2NPBA 4POLA 1J0FA 4OCEA 2MBTA 4GQFA 4RI7A 3ZIJA 4F2IA 2VL9A 2YJHA 3DRNA 4HQZA 2MYGA 4WF4A 5HFKA 1THOA 1X9MB 1MDKA 2O7KA 4I8BA 3UARA 3U6VA 4FYCA 1GRXA 1PMTA 1V57A 1XW9A 3KP9A 2KUCA 3RPNA 2GSTA 2DLXA 1GUKA 4OWYA 1FOVA 3P8WA 2A2RA 1WIKA 4MH2A 1GSYA 1Z9HA 4IKHA 1R5AA 2BJXA 2OKAA 4ECBA 4K0GA 4XS1A 5AGYA 3BCKA 2H76A 3DWVA 2JZRA 1FHEA 2VOCA 4HOJA 3Q74A 5HFGA 1Z7PA 5A4UA 3UVTA 1O85A 1OKTA 3WGXA 1SYXA 1C72A 3FR6A 3C1SA 3F3QA 4MPGA 2C1YA 6GSTA 2JSZA 3GKMA 4KX4A 3IOSA 5B6MA 2H0IA 1TU8A 2DJ0A 2G2QA 1NHYA 3U5RE 1Y6EA 3I6AA 4POBA 4J56E 1JLVA 1ZCPA 3KTLA 4HI7A 5JWOB 1K0BA 3UBLA 1N8JA 3HXSA 1YQ1A 4IS0A 5DAKA 3QFAC 2GSQA 1M0UA 3ZZXA 1T4YA 2BTOT 1M9BA 3VWXA 1TJDA 3IBHA 5JWQB 2JZSA 2GT5A 1K3OA 4LMWA 3WT1A 4Q5QA 5JCUA 1S3DA 2C80A 2VD0A 1OVNA 1XWGA 5GSSA 1OC9B 2H1DA 2FY6A 1T8EB 1JZRA 3GX0A 2FWFA 4HZ4A 3D6IA 2B3SA 4PGTA 5IIZA 1HYUA 1X0RA 1TRSA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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