The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
59
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structure length |
59
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Chain Sequence |
b'APWATAEYDYDAAEDNELTFVENDKIINIEFVDDDWWLGELEKDGSKGLFPSNYVSLGN'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structures of invisible, excited protein states by relaxation dispersion NMR spectroscopy
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Actin-binding protein
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| molecule tags |
Structural protein
|
| total genus |
11
|
| structure length |
59
|
| sequence length |
59
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-04-30 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4R0K A; 4M4Z A; 1CSK A; 1WFW A; 2RQW A; 4RTV A; 4ESR A; 1VA7 A; 4A63 B; 2JT4 A; 3H0H A; 1J3T A; 2DL8 A; 1YWO A; 2DE0 X; 3I9Q A; 2V1Q A; 2DF6 A; 4GLM A; 4Y92 A; 2AKL A; 3UAT A; 2ENM A; 1N5Z A; 1KFZ A; 1XOV A; 3EG3 A; 1PKT A; 2KRM A; 1WA7 A; 1GBR A; 1RLQ C; 1X2Q A; 2LP5 A; 2EYY A; 1MUZ A; 2O9V A; 1GCQ C; 1WLP B; 2AK5 A; 3I5S A; 2FEI A; 4OMO A; 1Y57 A; 2L0A A; 2F2X A; 2AKK A; 1ABO A; 2HEQ A; 1UGV A; 2DRM A; 2RQV A; 1YNZ A; 2OAW A; 1NLP C; 1M30 A; 1NEB A; 1H92 A; 2EPD A; 2PTK A; 2J6K A; 4OMM A; 2P4R A; 2B86 A; 1AD5 A; 1BK2 A; 4X1V A; 2LNH B; 3PE0 A; 3VS3 A; 2CUB A; 1SHG A; 4HCK A; 3VS0 A; 1W70 A; 3PVL A; 1W6X A; 2RQU A; 2VVK A; 4LN2 A; 2SRC A; 3ULR B; 4E6R A; 2DBM A; 2RF0 A; 1WX6 A; 2ED0 A; 4D8D A; 2FRY A; 2MIO A; 2CH4 W; 1E6G A; 4Z8A A; 2JM8 A; 2JMA A; 1K1Z A; 4RTW A; 1ZUY A; 4F14 A; 2KT8 A; 2CUD A; 1QKX A; 1TUC A; 2RQR A; 1I07 A; 1KJW A; 1TUD A; 5IH2 A; 4DEY A; 2FG0 A; 4RTZ A; 4F17 A; 1WDX A; 3EG0 A; 2GTJ A; 1UJY A; 2HCK A; 3VS7 A; 1W1F A; 2CT4 A; 2J06 A; 2RPN A; 2L3Q A; 3NPF A; 4Z88 A; 2KE9 A; 2NUZ A; 1K0X A; 2CT3 A; 3EHQ A; 4J9G A; 1SSH A; 3M0U A; 2ROL A; 4LUE A; 4CC7 A; 1X69 A; 2FPE A; 1G2B A; 1AZG B; 1QKW A; 1Y0M A; 4K11 A; 1NG2 A; 1MV3 A; 2DL3 A; 3U23 A; 3QWY A; 3M0R A; 1QLY A; 1FMK A; 1JU5 C; 2C0O A; 1GL5 A; 1H3H A; 4HXJ A; 2V1R A; 3VRZ A; 2DNU A; 5HCK A; 1WYX A; 4AG2 C; 1UEC A; 4J9F A; 1ZUU A; 2K3B A; 2X3X D; 2KRN A; 3H41 A; 3O5Z A; 2F2V A; 4HVU A; 2LX7 A; 2ESW A; 1X43 A; 4JJB A; 3VS4 A; 2KRO A; 2BTT A; 2BZX A; 4LNP A; 2RNA A; 2KNB B; 2DVJ A; 1JXM A; 1X6B A; 1YCS B; 4AFZ C; 2EBP A; 2EVR A; 2G6F X; 4J9D A; 4IIM A; 1CKB A; 2O2O A; 1M27 C; 3VS6 A; 1K76 A; 1UHC A; 4JPB W; 1CKA A; 1M3C A; 2GBQ A; 1GCP A; 2EW3 A; 1T0J A; 4HVW A; 1AWW A; 2LQN A; 2DL7 A; 2GTO A; 1JXO A; 4FSS A; 2C0I A; 1OEB A; 1MV0 B; 1B07 A; 2QDL A; 3CQT A; 2RMO A; 2YDL A; 1Z9Q A; 2JS2 A; 3M0P A; 5IXF A; 2O88 A; 1YN8 A; 1SRL A; 1AWX A; 1HD3 A; 2GNC A; 1YP5 A; 1M8M A; 2HSP A; 1T3S A; 1BU1 A; 4QT7 A; 2JXB A; 3H0I A; 3UA7 A; 1YWP A; 1E7O A; 2H8H A; 2W10 A; 1G83 A; 2SEM A; 4CC2 A; 5IHN A; 1OPK A; 2FO0 A; 2LJ0 A; 1UFF A; 1SEM A; 1S1N A; 1NM7 A; 3M0Q A; 2CDT A; 2DL4 A; 1RUW A; 1HSQ A; 3TVT A; 1SPK A; 1K9A A; 5FWC A; 1X2K A; 2O9S A; 1BBZ A; 3REA B; 2VKN A; 1RI9 A; 1NLO C; 2KGT A; 2ABL A; 2E5K A; 2KXD A; 2DJQ A; 2L3P A; 5L23 A; 1NYF A; 2YUN A; 2LZ6 B; 1NEG A; 2D8J A; 1WXB A; 5I22 A; 2K7A A; 3M0T A; 3RBB B; 1ZLM A; 1A0N B; 3NGP A; 1K0S A; 1GFC A; 2J6F A; 1I1J A; 1PRM C; 1PHT A; 3I5R A; 2YUO A; 1OOT A; 1PNJ A; 1H8K A; 2JW4 A; 2EGC A; 3VS5 A; 1WXU A; 4WCI A; 2FPD A; 4KRT A; 2EGA A; 2LQW A; 5FW9 A; 2OJ2 A; 1TG0 A; 2EGE A; 4GBQ A; 1WI7 A; 3REB B; 2EKH A; 2EYZ A; 1AOJ A; 3THK A; 1SRM A; 1WIE A; 2JTE A; 2J6O A; 5I11 A; 4AFS C; 1Z9Z A; 4J9H A; 4ZNX A; 2DX1 A; 3NHN A; 4AFQ C; 3VRY A; 3R6N A; 1UE9 A; 1ARK A; 1T0H A; 3TSW A; 2A37 A; 3EGU A; 2YUP A; 2D0N A; 4JZ3 A; 1ZUK A; 2D8H A; 1ABQ A; 3TSZ A; 1V1C A; 1VYT A; 2OI3 A; 4OML A; 4RTU A; 3I35 A; 2M51 A; 3H0F A; 1U3O A; 1VYV A; 2DM1 A; 2L2P A; 2A36 A; 1AWJ A; 1T3L A; 1GFD A; 2XMF A; 2BZ8 A; 2DLP A; 1GRI A; 2K2M A; 2YUQ A; 2O31 A; 2PZ1 A; 2KBT A; 2DBK A; 4LE9 A; 1X27 A; 1UTI A; 1GBQ A; 2PNI A; 4DEX A; 2ECZ A; 2IIM A; 1M3B A; 4Z89 A; 1EFN A; 1ZSG A; 5IHK A; 2RQT A; 2AZV A; 3M0S A; 4J9I A; 1U06 A; 2KT1 A; 4JZ4 A; 4OMQ A; 2K6D A; 1QWF A; 4JJC A; 1RLP C; 4JJD A; 4RTT A; 5IXB A; 1JO8 A; 2J05 A; 1WXT A; 2GGR A; 1B3Q A; 2J7I A; 3A98 A; 2X3W D; 1JQQ A; 2F2W A; 1UDL A; 1UG1 A; 4IIO A; 3LH5 A; 2LMJ A; 3FJ5 A; 3PVQ A; 1QWE A; 2DA9 A; 2JMC A; 2L3S A; 4AFU C; 2K9G A; 1LCK A; 3EG2 A; 1AEY A; 2CRE A; 2MOX A; 1UJ0 A; 2HDA A; 1PRL C; 1OV3 A; 1ZBJ A; 1ZX6 A; 1X6G A; 1K4U S; 4RTX A; 1SHF A; 2JM9 A; 2MCN A; 1JEG A; 3RNJ A; 2KRS A; 4J9B A; 2W0Z A; 3NMZ C; 2EYW A; 4D8K A; 1U5S A; 4EIK A; 3UF4 A; 2NWM A; 1QCF A; 2CSQ A; 2YT6 A; 2FPF A; 2KYM A; 2K79 A; 2LJ3 A; 1BB9 A; 2C0T A; 3GBQ A; 4OMP A; 3IQL A; 3VS1 A; 1HJD A; 1I0C A; 4RUG A; 2GQI A; 2HBW A; 2DL5 A; 1UHF A; 5IHI A; 5ECA A; 4J9C A; 2LCS A; 1OPL A; 3UA6 A; 4F16 A; 1FYN A; 1M3A A; 1AVZ C; 1E6H A; 2AZS A; 4ORZ A; 2DRK A; 4OMN A; 4CC4 B; 2RN8 A; 1PKS A; 2BZY A; 2D1X A; 1GCQ A; 1IO6 A; 2DMO A; 2VWF A; 2LJ1 A; 2ROT A; 3VS2 A; 2I0N A; 4CC3 A; 5FWB A; 1VYU A; 2M0Y A; 4LUD A; 3SEM A; 3SHW A; 2A28 A; 3KFV A; 1PWT A; 4HVV A; 2YSQ A; 1KSW A; 2ED1 A; 2EYX A; 5GJW B; 4RTY A; 3QWX X; 1AZE A; 1AWO A; 2CH4 A; 2KEA A; 2KXC A; 1NYG A; 2FRW A; 5GJV B; 4AG1 C; 3EHR A; 1KIK A; 1UUE A; 3EG1 A; 4J9E A; 2DIL A; 2KYB A; 2EQI A; 2DYB A; 2CSI A; 2A08 A; 2KR3 A; 3JV3 A; 3C0C A; 5EC7 A; 3ZL7 C; 2JS0 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1VQ9 T; 2Y4X A; 3O8V A; 3SB2 A; 4M4Z A; 4M75 C; 1WFW A; 2RQW A; 1IRX A; 4J6W A; 4ESR A; 3OA6 A; 1VA7 A; 2OX7 A; 3KBG A; 2JT4 A; 1MMA A; 1J3T A; 2DL8 A; 2JN0 A; 1G3Y A; 1D0Z A; 2DE0 X; 5LJ5 d; 2LRQ A; 1PC0 A; 1TUG B; 2RHY A; 1IXD A; 2CP7 A; 2FVU A; 1N5Z A; 1VQL A; 2DTH A; 3OW2 P; 2RI3 A; 2X9H A; 1GBR A; 1RLQ C; 1X2Q A; 4JLG A; 2DD5 A; 2QXF A; 2O9V A; 1NZ9 A; 2F5K A; 4FYX B; 2FEI A; 4OMO A; 3V8L A; 2GCX A; 1JBM A; 1UGV A; 4R56 A; 3FRN A; 1B7T A; 5A0G A; 1NLP C; 5GAN d; 1IB8 A; 1O9S A; 3CCJ Q; 1I5O B; 2RA2 A; 1AHJ B; 2B86 A; 4Y28 E; 4X1V A; 1LPL A; 3E9F A; 4MZP A; 3G4S A; 2DXB A; 4HCK A; 3JSC A; 1YJW A; 3PVL A; 3HP9 A; 3ULR B; 4BY6 C; 5GAN 3; 1IGU A; 2ED0 A; 4FT2 A; 1BIA A; 4KGZ B; 1YJ9 A; 1SF9 A; 3PMT A; 4KUI A; 1ZUY A; 2V26 A; 4F14 A; 2KT8 A; 3OYJ A; 1IGQ A; 1QVG P; 3L2V A; 1KJW A; 4C8Q F; 3HKS A; 4N4I A; 3ZBD A; 1K73 U; 4RTZ A; 3G6E T; 3NTI A; 3MP8 A; 3MEU A; 2E41 A; 1BI0 A; 4HCC A; 4P5N A; 3VS7 A; 1YJN Q; 2CT4 A; 2J06 A; 2L3Q A; 1Q82 C; 2DFU A; 2QA4 Q; 2R5A A; 2DO3 A; 2IG0 A; 1RI0 A; 4O6J A; 4M7A C; 1WHL A; 4J9G A; 2GFA A; 1M2V A; 2YLC A; 1SSH A; 2ROL A; 2V8K A; 4M78 E; 1QKW A; 3FLG A; 3PNW C; 4K11 A; 2FZC B; 3M5A A; 2WSC E; 3OYY A; 3CCV A; 1M90 R; 4FYY B; 1K8A C; 1FMK A; 4M7A G; 1BKB A; 1G3W A; 1WYX A; 2I2L A; 2JTF A; 3QII A; 1UEC A; 2FYK A; 3LWI A; 2Z0W A; 1LVK A; 3I56 A; 2KRN A; 2RHX A; 3CCR Q; 4JJB A; 1QQJ A; 4LNP A; 2K3Y A; 1VUB A; 4J6Y A; 4XK8 E; 3G71 A; 4MML A; 1X6B A; 1YCS B; 2EBP A; 2EVR A; 4IIM A; 2FHD A; 4MMK A; 4LDW A; 1M27 C; 3VS6 A; 4JPB W; 4C5G A; 1OZ3 A; 2R5M A; 2EQJ A; 2QEX Q; 2K2V A; 4FCY A; 3GF5 A; 2C06 A; 1T0J A; 3A8H B; 1W4S A; 1Q7Y C; 3ZEH A; 4LD6 A; 2GTO A; 4FSS A; 2C0I A; 4RG2 A; 2M1H A; 1U8R A; 1KHC A; 5CVI A; 1B07 A; 1U1T A; 2GQV A; 3CQT A; 2RMO A; 3M0P A; 2O88 A; 5A0L A; 3CCE A; 3L2Q A; 3NFC A; 1T3S A; 4J7F A; 3MEA A; 3H8Z A; 1E7O A; 5EG2 A; 3C4S A; 2CGH A; 4M78 D; 5IHN A; 4E47 A; 2FO0 A; 3HFN A; 2EQM A; 3M0Q A; 4ZGJ B; 4FL6 A; 1QVP A; 1SPK A; 1OYX A; 4LDV A; 3EH2 A; 3REA B; 2VKN A; 4DOW A; 3LWH A; 2ABL A; 2E5K A; 2Y4Y A; 2L3P A; 4GLK A; 2YUN A; 2LZ6 B; 1NEG A; 1X01 A; 2KQW A; 2F5T X; 4PJN A; 1ZLM A; 1VQK Q; 4IUU A; 4M75 A; 2YWW A; 3CPW A; 3A8G B; 1PG5 B; 1H8K A; 2XG8 D; 2EQK A; 1WXU A; 3G7Z A; 5KYU B; 2QGG A; 4WCI A; 4KRT A; 2EGA A; 2ZAE A; 5GAO q; 2CP0 A; 5GMK i; 1TG0 A; 3CD6 Q; 2BE9 B; 3CCM T; 4PJJ A; 3QJ6 A; 2KAF A; 4GY5 A; 4A53 A; 4BD3 A; 3GLX A; 1OU9 A; 1WIE A; 5DLO A; 3LLR A; 2J6O A; 2K5L A; 1VQP Q; 2DZ9 A; 3CPF A; 2KMT A; 3NHN A; 3QO3 A; 3L2W A; 3R6N A; 1ARK A; 3RR6 A; 4NL3 A; 3QXE B; 1KG1 A; 2V8I A; 4HT9 A; 3VKI A; 1M9S A; 3TSW A; 1KQS P; 2RK2 A; 4DBQ A; 3EGU A; 2E64 A; 4JZ3 A; 4KGV B; 1QMC A; 3TSZ A; 2X51 A; 2AIR B; 2ZCF B; 4M7A F; 3M58 A; 5A0D A; 4WTO B; 2OI3 A; 2JJ9 A; 3I35 A; 4BB7 A; 2E3I A; 4M7D C; 2L2P A; 1YI2 Q; 1GFD A; 1N6A A; 3JCM c; 4RKU E; 2CP6 A; 2BZ8 A; 3CPW S; 4BDY A; 2QGF B; 2Y90 A; 5LJ3 e; 2NYS A; 2PZ1 A; 2DBK A; 5AT1 B; 1ZSZ B; 5GAO l; 4V2S A; 1KD1 R; 1GBQ A; 2LC4 A; 2ECZ A; 1M3B A; 1ZSG A; 2ZZD A; 3ER0 A; 3V7S A; 3URG A; 4M78 C; 2KT1 A; 2K6D A; 1RLP C; 4RTT A; 3OYI A; 2HNI A; 2J05 A; 4J83 A; 3A98 A; 4XU0 A; 1YIJ T; 3LH5 A; 1G3T A; 2LMJ A; 5FU6 B; 1QWE A; 4M78 G; 1G8X A; 2JMC A; 5KH6 A; 4PKC C; 2K9G A; 3EG2 A; 2HDA A; 1ZBJ A; 3OBW A; 4X9C A; 4RTX A; 1MND A; 1K73 C; 1SHF A; 2ZPG B; 2KRS A; 3VJP A; 3DB4 A; 2DTI A; 1ZQ1 A; 5FU7 C; 4D8K A; 5GMK h; 3OYA A; 4MDX A; 3CC7 T; 2RM4 A; 2KY9 A; 3QPH A; 2OTJ T; 2C0T A; 1VQO Q; 3VS1 A; 3M4G A; 1I0C A; 4RUG A; 4XU2 A; 2XID A; 2LCS A; 2NUT B; 5KYU A; 1M3A A; 1E6H A; 1WHH A; 4FSX A; 1D09 B; 1OU8 A; 2RHI A; 4A4H A; 1IO6 A; 2DMO A; 2VWF A; 2D6F A; 3OQ5 A; 1VYU A; 2M0Y A; 3OS5 A; 3CBM A; 3EGD B; 4M77 B; 3G6E A; 3S3N A; 3KFV A; 5GAM g; 3PTA A; 1KSW A; 3CC2 T; 3FC3 A; 1AZE A; 1UGQ B; 4XTX A; 2RJF A; 3GNF B; 4X9D A; 4AG1 C; 3EHR A; 1KK7 A; 1VQM T; 1VIF A; 3HHT B; 2NLU A; 1W2B A; 3EG1 A; 3QG1 A; 2ATC B; 2DYB A; 5GAM h; 1QP2 A; 1P92 A; 4XTU A; 2EJF A; 5EC7 A; 2EQU A; 1D0X A; 4LDY A; 1HYO A; 2HZY A; 3UT1 A; 2MYS A; 4DBR A; 4LXC A; 1YWO A; 4RMO A; 3I55 Q; 1YHQ Q; 3DLL A; 1UGP B; 2DAQ A; 2DF6 A; 4GLM A; 2AKL A; 3UAT A; 4XU1 A; 2ENM A; 1ZSZ A; 3OYL A; 3CCL Q; 4EMK A; 4E7Z A; 1OX9 A; 3V7C A; 1VQ4 Q; 2EYY A; 1ZHI A; 5FRN A; 4L6V 5; 2AK5 A; 3I5S A; 3M53 A; 1Y57 A; 5IN1 A; 2LDM A; 2F2X A; 4IUV A; 2AKK A; 5CKB A; 2HEQ A; 2DRM A; 1M1K U; 1XNI A; 4DBF A; 2MWO A; 5CCA A; 2EPD A; 1VQ6 Q; 1GXI E; 3BY7 A; 3V7R A; 6AT1 B; 4JJN K; 1VQN T; 4EDU A; 1AD5 A; 1BK2 A; 1W2B S; 1TS9 A; 3A8M B; 1WQW A; 4E7I A; 2NUP B; 2ZPH B; 3VS0 A; 3JCM J; 4M78 F; 1M1F A; 1W6X A; 4OVA A; 2RQU A; 2VVK A; 1RAD B; 2RF0 A; 5CAI A; 2DXU A; 2RD1 A; 2X4J A; 2FRY A; 4NL2 A; 4F7U B; 3EGX A; 1E6G A; 3HPW A; 2MK5 A; 5HY6 A; 2JMA A; 1K1Z A; 2P0P A; 4RTW A; 1RAE B; 3HL8 A; 1TUD A; 5IH2 A; 4ATO A; 4M7D A; 5GMK j; 2NUT A; 4F17 A; 2JOY A; 2CZ0 B; 1UJY A; 2QQB A; 4KBM B; 4JDS A; 3OYE A; 2ZPE B; 3CMA T; 3S3O A; 4Z88 A; 4MZT A; 2KE9 A; 2NUZ A; 3JCM h; 3KXT A; 1M2V B; 1Y96 B; 2DIQ A; 2CT3 A; 1YJN A; 4C92 A; 1VQ8 Q; 4KH0 B; 3CCU T; 4XAX B; 2DEQ A; 2VYT A; 4Y91 A; 3L1A A; 4M77 A; 3EGD A; 4N0A C; 1M1G A; 4C5I A; 2IVW A; 1Y0M A; 1BYM A; 3CCS T; 2E12 A; 1K9M U; 2JZ2 A; 3BDL A; 1MV3 A; 4N4G A; 3U23 A; 4ZN1 A; 2D0Q B; 4OMF B; 5LJ5 e; 2C0O A; 3CBO A; 1FWZ A; 3CCM A; 2F69 A; 2DNU A; 3CBP A; 5HCK A; 2CZ7 B; 5GMK l; 1EZZ B; 3QUI A; 2DXT A; 3M59 A; 2K3B A; 3X28 B; 4C8Q B; 4JRP A; 2X3X D; 3H41 A; 3INZ A; 2F1L A; 4HVU A; 1X43 A; 5J26 A; 3VS4 A; 1QVF A; 2QTV A; 1VOM A; 3JB9 H; 3E9G A; 5GAM j; 3CCQ Q; 1VIE A; 3T9N A; 3SDZ A; 3VYG A; 3OYN A; 5M9O A; 4J9D A; 2EAY A; 2H3E B; 4E2F B; 2EKO A; 2AT1 B; 1LOJ A; 1VQ5 T; 2RO0 A; 2DIG A; 3JCM W; 2CP2 A; 1M3C A; 4C0F A; 2RJE A; 3UDC A; 3RIR A; 4HVW A; 1AWW A; 1TSF A; 2GF7 A; 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