2K8VA

Solution structure of oxidised erp18
Total Genus 27
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
27
sequence length
157
structure length
157
Chain Sequence
MHHHHHHMSDGHNGLGKGFGDHIHWRTLEDGKKEAAASGLPLMVIIHKSWCGACKALKPKFAESTEISELSHNFVMVNLEDEEEPKDEDFSPDGGYIPRILFLDPSGKVHPEIINENGNPSYKYFYVSAEQVVQGMKEAQERLTGDAFRKKHLEDEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
publication title Solution structure and dynamics of ERp18, a small endoplasmic reticulum resident oxidoreductase .
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin domain-containing protein 12
total genus 27
structure length 157
sequence length 157
ec nomenclature ec 1.8.4.2: Protein-disulfide reductase (glutathione).
pdb deposition date 2008-09-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13899 Thioredoxin_7 Thioredoxin-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2k8vA00
5F06A 2LJRA 4XRAA 3EURA 1ZOFA 2L4QA 3KTLA 4OCEA 2L6CA 4IQAA 3MDKA 3IV4A 3Q6OA 3DWVA 2B7KA 2GZYA 3IR4A 1X0RA 1FW1A 2L6DA 3QFBC 4MCUA 4WR5A 1UA5A 3LYPA 3RPPA 5DVBA 1K3OA 2WCIA 2DIZA 3QAWA 4XCSA 2HSHA 2O89A 4ZL7A 1SL0B 1M7TA 5KN3A 4XIHA 4N11A 2AAWA 1SKWB 3VWWA 2MZCA 2PERA 4IW9A 1UN2A 4K0GA 4PQIA 2LJKA 4ZBBA 4EXJA 1GRXA 1TKDB 3W8SA 2PUKC 4K0NA 4MZBA 2H6XA 2WGRA 2AYTA 3BCIA 5JWOB 4XHMA 3L4NA 2RUEA 4PQ1A 1GL8A 5D9XA 5ECIB 1F9MA 1HNBA 2YCDA 1DSBA 2FLSA 1O85A 4KX4A 4ZIJA 2YP6A 3HJMA 3IRAA 5DJMA 3FZ5A 4F0BA 3VLNA 2IWTA 5EVOA 4LL1B 3GURA 5DJLA 2LSTA 1XWKA 2IL3A 3OR5A 4FYBA 1SKRB 4FYCA 1Z5YE 1TW9A 4WBJA 3TJFA 2PBJA 2E2MA 1XW9A 5G1LA 2P31A 1QFNA 5B8BA 3KH7A 5DDLA 3ZREA 3O6TA 2QGVA 5JWQB 1RQMA 2PGTA 1M9AA 3KTBA 2RUFA 3CTGA 3US3A 1B8XA 4QL7A 5ECSA 1GTBA 1Z7RA 1Y6EA 2LRCA 2DJ0A 2HFDA 4TR4A 4TW5A 1QGVA 3VURA 1K0AA 1W4VA 5GZZB 1SK0A 5DAKB 2RM5A 5ECOB 1JZDA 1PGTA 3GIXA 2CZ2A 3EU4A 1FOVA 3DYRA 1HQOA 2EIOA 3WD6A 2R5GA 3O76A 5D8IA 3IK9A 19GSA 1U3AA 2H75A 4IS0A 5FHIA 2H1GA 1ZYEA 3FW2A 3CSIA 2LRNA 4NPBA 3D6IA 3A2VA 3WT1A 5IPHA 1GSUA 3GH6A 3HVXA 2K18A 7GSSA 4FH8A 3WGXA 1YEPA 4EF0A 3CRTA 2LEGA 3RPNA 3GKMA 5DQYA 2G2QA 1A24A 3NOFA 3EVIA 3TJBA 2P5QA 2OE1A 5AGYA 1GWCA 1G6WA 4GF0A 22GSA 4KCEA 4IP6A 3BOAA 2LV3A 1OVNA 2HRFA 2ON7A 4GTUA 2GS3A 3NIVA 4BWSA 3BJ5A 1WOUA 5DAKA 2Z9SA 3I6AA 3IBHA 4Q5QA 1TDIA 2GT6A 1V9WA 4DVCA 4I2UA 1XXUA 2WRTA 3ZMKA 3DXBA 3ISOA 2PPTA 4PUFC 5A4WA 1TK8B 4CHSA 5ECQB 3MNGA 4ZL9A 5ABRA 2A2SA 1NM3A 1G7EA 3TB2A 2P5RA 1FO5A 2X64A 3D21A 4TR3A 2F8FA 5CAXA 3UBLA 3EU3A 1BG5A 1PRXA 3M3MA 2R2JA 2PVOC 4I97A 3C71A 1A8YA 3FYGA 5IMAA 5F8BA 2G0FA 3EYTA 3TKSC 3M9KA 3I43A 4RI7A 1T00A 4WR4A 3KCMA 5HFIA 3UJ1A 2QC7A 20GSA 3RHCA 1GH2A 3IHQA 2B1LA 1TI1A 1YQ1A 3CRUA 4F82A 1SJZA 5DALB 3F4RA 4HU7A 4BWQA 2JSZA 3J7Yb 3EINA 3HD5A 3V1WA 3DVXA 1Z6NA 1MD3A 2YWNA 3KMNA 4YAVA 3M9JA 2H0HA 1A23A 3FEUA 3D5JA 1V98A 1MDIA 2H66A 5L71A 9GSSA 1YY7A 2OBKA 4ILFA 2OADA 3EC3A 3IK7A 1JFUA 5ID2B 4EUYA 4TKYA 3TCOA 3TDGA 3TOUA 1OKDA 1GSQA 4MK3A 2JADA 2XBIA 2R4VA 5G1KA 3F63A 4L0UA 5CP1A 1JZWA 4RI6A 4YQVA 4MF7A 2H76A 3F6FA 2H74A 1TRVA 1ZGNA 3L9SA 1ERUA 2VUPA 4ID0A 1EEJA 5KN2A 3FZ9A 4IJ3A 4P3YB 1GSYA 1UC7A 4HOJA 4ZBAA 1AC1A 4DEJA 5DQSA 3KM6A 1O73A 4XTSA 3QMXA 1Q4JA 1XWGA 2YOIA 1SYRA 5CREA 2TRCP 2H30A 1XWAA 2FCHA 1M0UA 2WJUA 2ON5A 3FRCA 2VCZA 1ZMAA 2CAQA 5HR3A 4J2FA 3LFLA 2H72A 2JU5A 4ZB6A 5D9TA 3K8NA 2K9FA 1E2YA 2V6KA 5ID2A 2C0GA 3IPZA 1ERTA 1GTUA 1XVWA 4FYUA 2IMIA 2VL3A 3F3QA 1JZOA 4LA1A 4POLA 3A2XA 1ILOA 3RAZA 1SKSB 1GUKA 4OD7A 2XPEA 1Z7PA 3KXOA 3ME8A 3TUEA 5D96A 3GSSA 4KGIA 3ME7A 4DSQA 1X9MB 3D22A 3UOMA 4GXZA 3ZFLA 2H1DA 2AUVA 4EC0A 2IFQB 4D73B 4ISDA 3I69A 1DUGA 4NV2A 2R3XA 3VK9A 3VI5A 5ECKB 3VI7A 3G9BA 4LL4B 3H8QA 2H6ZA 4HJ2A 2F9SA 4NXIA 1R5PA 1ZL9A 3HKRA 3TJGA 1PX7A 2FD3A 2K6VA 2B7JA 2N5BA 4XS1A 5A4VA 4IJIA 3RDWA 5HFGA 2YANA 2HSYA 2C80A 2CQ9A 3GTUB 5IMZA 2C4JA 1TK5B 3FZ4A 3EWLA 1GLPA 2I9HA 4PUAA 1FG4A 1ZYQB 3Q18A 3QCPA 4HQSA 4HQZA 3UEMA 1WRYA 2FY6A 5IM9A 3EMXA 4RUVA 3BCKA 4KSMA 2F51A 4N10A 3KH9A 1SJIA 2V32A 2HNLA 3GFKA 1AW9A 1FB0A 4I2TA 3PINA 3E9JB 5D93A 2LRTA 3E3EA 5ECLB 2I1UA 2ES7A 1OE8A 4NHWA 1ST9A 1TU7A 2OKAA 3ZL5A 1G0TA 5H5QA 4KB3A 4LMWA 3HZ4A 3F9UA 1AIUA 1K3LA 4NWYA 1U6TA 2R37A 5GSTA 3KMOA 2X8GA 5J9CA 2JZRA 4J56E 1EP8A 4MH3A 3R2QA 4K7NA 2OA7A 6GSWA 5ENUA 3GNJA 1Y25A 4HS1A 1WWJA 4OO4A 2H73A 3C73A 3GKKA 4ULXA 3GX8A 16GSA 1J08A 3GTUA 4G2EA 3BBYA 1FHEA 4ML1A 5LNKe 1EGRA 5HFKA 1AQWA 4H86A 2YWIA 5HR0A 4KDUA 1F2EA 2FWGA 1B4QA 5CYYA 1OC9B 2XPDA 1HNAA 3HHVA 3HJPA 1TTZA 2QSIA 6GSYA 1B4PA 4K9ZA 3IE3A 3HDCA 12GSA 1GUMA 5C04A 5GAND 2R6KA 4ZXGA 2MBTA 4L5LA 3VWXA 5GSSA 2LQQA 2CT6A 1I9DA 4BPYA 5A4UA 2GLRA 3P2AA 2NTOA 4PGTA 3M8NA 5B7CA 4HI7A 4OWYA 2VCWA 4FO5A 2IMKA 2X8HA 1EP7A 4BL7A 3EE2A 1O6JA 3C1RA 5G2ZA 1PQNA 4MMMA 2CVDA 4EKZA 4NMUA 4FIWA 1V57A 2L59A 3GSTA 5B6MA 1EGOA 3UIWA 1FVKA 2OJLA 1BEDA 3QAGA 2EC4A 1VF3A 2C0DA 2VD1A 2GSRA 4AJ7A 4EL1A 1SENA 4QQ7A 3CBUA 4QL9A 4GRFA 3GN3A 4Z7XA 3FR9A 4ZBDA 2DMMA 3LQ7A 2ALBA 4MH2A 4KDXA 4K7OA 1GP1A 1OC9A 2LNTA 2VOCA 4LMVA 2M72A 2CAIA 3U5RE 5KN0A 1XFLA 3LYKA 1URMA 1PKZA 3VWVA 4ACSA 1A0FA 4WBRD 2O7KA 3UL3A 3TKPA 3G7YA 1ON4A 2KOKA 5G30A 4KSOA 3S9FA 4J57E 3FK8A 4WETA 3HXSA 1OYJA 2C3NA 1KNGA 4MF6A 4YQUA 1EWXA 3TGZA 2H6YA 2JL4A 1YDKA 1VRSD 1Q98A 3G7IA 2GQKA 3WGDA 4MP4A 2FGXA 3EMPA 17GSA 2B5EA 5LCZA 3HJOA 5AISA 1B9XC 3Q74A 4EVMA 2V6OA 1B9YC 2IMDA 3APOA 4GQFA 2B5YA 1BYEA 3NZNA 4HU9A 2GVPA 4K7IA 4L0WA 2NBSA 2B1KA 2B5XA 3CSHA 5D73A 4K8MA 3M1GA 4MJEA 5CO3A 3GA4A 1H75A 1WP0A 1OE7A 3UBKA 4JZQA 3N9JA 2XBQA 3IDVA 4EE0A 1AQXA 5IMDA 1ERWA 2IMEA 2VCXA 3VPQA 1F3BA 1Z3EA 4V2NA 1TRUA 3ZIVA 2EIRA 1M2DA 1USBA 4O5RA 5J3RA 4HZ2A 1X9WB 1ABAA 4WXTA 1E6BA 1OC3A 1GUHA 2VCVA 3DEXA 1X9SB 3APSA 4F0CA 4AJ8A 1VF2A 3DRNA 1SK2A 2MYGA 5AN1A 3CMIA 4CW9A 5IMCA 5COHA 2H8LA 4Q5RA 4X0XA 2VL2C 1QXHA 2MMZA 4POKA 2YJHA 1TXXA 5CRHA 3H4KA 1XPVA 5IOXA 1S3AA 1KBNA 3ERGA 1H4OA 2YZUA 2LNSA 2K8VA 3ZYWA 5JCUA 2IMFA 2LS5A 3FY7A 5HQPA 5DCGA 1BAYA 1T3BA 5H5RA 1XZOA 5C00A 2VAFA 2E0QA 3D0ZA 3GH9A 1XCCA 1MEKA 3QFAC 4KCAA 2LJAA 4O32A 3F8UA 4DSSB 13GSA 2IN3A 2VL9A 6GSTA 1F37A 2H70A 4TR0A 2A2RA 4IKHA 2H0IA 5ECHB 4ML6A 5F05A 6GSVA 1CQHA 5ECMB 3UVTA 3N5OA 2VO4A 1XOBA 1YKAA 5EL8A 3VWUA 4F03A 3H79A 2FWFA 3ZITA 2H1BA 5G5FA 3P8WA 4N0ZA 3HVSA 1XW5A 1HD2A 2FA4A 8GSSA 2RIIA 2X8CA 3O3TA 1CQGA 6GSSA 1X5EA 2CX3A 1M99A 1XBSA 4GLTA 4MABA 1XWBA 1EOHA 3D4MA 1A8LA 2AHEA 1ERVA 3GKXA 1BX9A 1FVJA 2BMXA 1Z6MA 1TP9A 2DJ1A 2FA8A 1KEBA 4MJAA 3GX0A 5KEJA 1IYHA 4MA9A 3F6DA 2IJYA 4MPGA 5DALA 2LKUA 2M80A 2L4CA 4KH7A 5DBQA 3LG6A 5CRGA 3LGCA 3KP9A 2BTOT 3TKSE 3F4TA 4ECBA 2PWJA 4ZB8A 4IELA 4TXVA 4K2DA 5E59A 1JLVA 2DJJA 18GSA 2L5LA 4JE1A 3GL3A 1K0OA 1K0CA 2WS2A 4O7HA 1R26A 2HZEB 3DD3A 2MMOA 4IVFA 3TJJA 4TN8A 4HJMA 3G7JA 1PKWA 3TKSA 1K0DA 5D9WA 2D2ZA 2VM1A 3MAKA 4POMA 1PL2A 2VL2A 1A2JA 1ZZYA 1ML6A 3MSZA 1XW6A 4GSSA 3WGEA 2GQLA 4OFTA 2BJXA 3KGKA 3CXGA 2RLIA 5FWGA 4IQ1A 1JHBA 1N8JA 4XS4B 1V58A 5G31A 2YZHA 2IPAA 1YEXA 2GGTA 2OE3A 2PN8A 5IOWA 5IQYA 3UMAA 2LTKA 4O92A 1GSSA 4NAXA 3E0UA 4CDOA 1GLQA 2YPMA 3KEBA 4MLYA 2OE0A 3HCZA 2N5FA 4JBBA 1NW2A 4L8EA 1QK8A 4GCIA 1ZCPA 3ZMLA 2V1MA 5ECPB 4MDCA 3RHBA 2AV4A 2F8AA 3ZZXA 2I3YA 1LU4A 2C1YA 4TR1B 4RQXA 1LBKA 2MMAA 2HZEA 2VIMA 2YJ7A 2HZFA 4POBA 3ZTLA 11GSA 1A0RP 3KJYA 1YF0A 5LD0A 4N30A 5INYA 1M9BA 2PMTA 2NPBA 2X99A 1GULA 5EY6A 4ZL8A 4ECJA 3TRXA 4BVXA 3CYNA 2J9HA 2B6MA 1T7PB 1WPIA 2FNOA 3TKQA 2FWEA 4L5OA 3J7Yk 1O81A 1TRWA 5G5EA 3AY8A 2DBCA 4KA0A 3HA9A 3C1SA 4JR6A 4XS4A 3W6GA 2IFQA 1PX6A 2O85A 4D73A 3VPTA 2HT9A 4OMVA 3MWHA 2CX4A 1T1VA 1OAZA 2REMA 1T4YA 3KD0A 2ZUPA 2C0FA 1VGLA 2PU9C 14GSA 1EEMA 3HVVA 2LUSA 3KZQA 1J9BA 4DSRA 3LSZA 4TR1A 5ECNB 4RQRA 2C3QA 2ZNMA 3ED3A 4MJBA 1K0NA 2FUG2 2TRXA 2OACA 4YH2A 4GWRA 4Q5NA 2HI7A 1F3AA 2CZ3A 2NDOA 2EIQA 3C7MA 1HNCA 1PL1A 2HE3A 1EZKA 4ZILA 3DKSA 2CVBA 2DSAA 3DIEA 2YN1A 4IN0A 3DMLA 1U88A 4F2IA 4E8EA 3LXTA 3DVWA 1V40A 4TRXA 5IO2A 2I81A 5FT3A 3ZRDA 3P7XA 1TI3A 4AJ6A 4KNDA 3ZLPA 2C3TA 4V2MA 3KP8A 6GSXA 5ELGA 2B3SA 1PMTA 2L57A 2DJ2A 1O8WA 5F0GA 2GQMA 3F0IA 1O8XA 1YZXA 2WDUA 1MD4A 5AIVA 2GZZA 4TOPA 5KN1A 3WYWA 2PVQA 2YV9A 1MTCA 3TKRA 1THXA 4IGJA 2H0GA 4YQMA 1DE2A 3ERWA 4EDZA 2YV7A 5HR1A 2P0GA 1F6MC 3FKFA 1EV4A 3L78A 2GT5A 4KW6A 1GTIA 1PD21 1BQ7A 4KAEA 1AXDA 4BA7A 1X5DA 5B8AA 3QPMA 5JCGA 3GUSA 1S3CA 2YNXA 4X43A 3ZFBA 2WB9A 3GRXA 1VF1A 4E8HA 2HLSA 4V1Ap 1SU9A 3GMFA 2LQOA 3GHAA 3L9VA 1FB6A 1Z9HA 5J4UA 1GSDA 1AQVA 3H93A 5CNWA 6GSUA 1SL2B 4XS6A 4BVYA 2WULA 5CRWA 3HZ8A 5IIZA 1WJKA 1SD8A 4PNFA 2AJQB 1PSQA 1U87A 3IAS2 2HYXA 2H19A 1TK0B 1R5AA 1OKTA 3QDNA 5F07A 4WF4A 1B48A 2O87A 1EOGA 1SJ6A 3A3TA 1A2LA 1HYUA 1V2AA 1NHOA 3IOSA 2XHFA 2C0EA 3LXZA 3TOTA 1WE0A 1OC8A 3L0HA 1GNWA 5AIXA 1T4ZA 1YKCA 4F9ZA 3CSJA 1EV9A 5ELAA 3IC4A 4KUNA 3ZIJA 2YWMA 3C8EA 3IA1A 2GSQA 2DJ3A 4OFNA 2VCTA 5A5KA 4AF2A 4PNGA 4NHZA 3I9V2 3QAVA 10GSA 2VD0A 1BJXA 1WMJA 4JEDA 3GKNA 2VLUA 4MPFA 4MF5A 1RW1A 3DGQA 1SL1B 2FHEA 2VM2A 3FHKA 1RK4A 4JU5A 4JRRA 2H71A 5ECRB 2CVKA 1J0FA 3TJKA 3LJRA 3GYKA 5DCHA 1LJRA 1QMVA 3ZVJA 3Q19A 4I6XA 1PA3A 4V2LA 2ZCTA 3HY2A 1YF1A 4PQHA 4EDYA 2HXKA 4HZ4A 1GSFA 5D9VA 1NSWA 4ECCA 5IO0A 4WF5A 3UARA 3RBTA 4K6XA 3U6VA 4ZB9A 1YJ6A 3TRQA 1M2BA 1SD9A 2DC5A 2KUCA 3LEFA 1IYIA 4N0VA 2FWHA 1GSEA 1C72A 1SYXA 2JZSA 4TVEA 4JR4A 1XWCA 1XIYA 4G19A 4G9HA 4MZWA 2VCQA 2KLXA 4HUAA 1FAAA 3HYPA 1TU8A 1N2AA 2A4VA 1AAZA 2DLXA 3A2WA 4AGSA 1M2AA 2KP1A 1MDKA 2GDRA 1K0MA 1A2MA 2VLVA 1TRSA 3QOUA 3VFIA 1AUCA 2GSTA 5IMFA 3UVHA 1QUWA 3A5WA 1SK1A 3PGTA 2HRNA 2GTUA 2KP2A 1XOAA 4MJCA 2E7PA 2WZ9A 2WFCA 3BD2A 5E4WA 5H5SA 4PURA 1T8EB 3LORA 3FR3A 1GTAA 2K8SA 2O8VB 2VLTA 2N5AA 1X5CA 2XC2A 3GL5A 3QR6A 2E2GA 1JZRA 2GZPA 4EO3A 1K3YA 2KHPA 1G6YA 4GSTA 5HR2A 4YAPA 1DBYA 1W89A 1S3DA 3SBCA 4OFMA 5JWRB 1DE1A 4NV5A 4GQCA 2TIRA 4IHUA 4DSSA 3M0FA 1THOA 1K0BA 1GNEA 3PH9A 1XVQA 2MBSA 3CTFA 3L9UA 4LLRA 1ACVA 2CV4A 2CA8A 4IP1A 2H1AA 1R7HA 1JLWA 3IXRA 5CRDA 3ZVJD 2C8UA 3KIJA 4TXOB 4K1FA 5J41A 4PX1A 4GSNA 4ECIA 3FZAA 1I5GA 4OO5A 2AB6A 2OBIA 2JZTA 4I5QA 2F3MA 1KTEA 3FR6A 1TOFA 2H01A 3H1NA 3ERFA 1VF4A 5GAPD 3GV1A 3LWAA 2RM6A 2YWOA 2L5OA 3UAPA 2DMLA 4XRDA 4KDYA 1UVZA 1G7OA 5EPFA 1U3IA 3JCML 4V1Ag 2MMNA 3F3RA 2V41A 3D4TA 3SWLA 3W8JA 2GSSA 5J5NA 4WKWA 5IMVA 2M46A 5B6NA 3P90A 4X1UA 1NHYA 1TJDA 4HDEA 4KE3A 2IIYA 4HEA2 2J23A 2NVLA 3QD9A 4MZCA 4OCFA 2I4AA 3APQA 1MDJA 3F4SA 1PN9A 5J9BA 4I8BA 1O7UA 3WT2A 2JACA 2DJKA 4TXOA 3TRPA 2DIYA 3IAM2 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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