The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
4
|
sequence length |
44
|
structure length |
44
|
Chain Sequence |
RCQYGWQGLYCDKCIPHPGCVHGICNEPWQCLCETNWGGQLCDK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Ribbon | Laminin | Laminin |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2DDU A; 2D1J B; 2H9E L; 2Y82 B; 1IQL L; 1HAE A; 3OLT A; 1IVO C; 2W2O E; 4BTU A; 4TGF A; 3F6U L; 1YUK B; 1CQE A; 4LMF A; 4D0E A; 1APO A; 1IP0 A; 2RHP A; 4ISI L; 1C5M F; 1URK A; 3H5C B; 4JYU L; 3LAQ A; 3MQE A; 3IIT B; 4Y79 B; 3PGH A; 1FSB A; 1WU1 B; 1FFM A; 3U73 A; 2J34 B; 1TLE A; 2WPK E; 1F0S B; 1MQ6 L; 1N7D A; 2VWO L; 4Y7B B; 1WHF A; 3M37 L; 3SOV A; 4YT7 L; 3FCS B; 1CEJ A; 1FAK L; 2I9A A; 4RUT A; 1J9C L; 3CEN L; 1U67 A; 2FLG A; 1EPI A; 1ATB A; 2XBW L; 4RRX A; 1CVW L; 4ISH L; 3TH3 L; 3HPT A; 3N8W B; 5JBA E; 2NPR A; 4XLW A; 2G00 L; 3KQD L; 1NFX B; 1UZP A; 2F9B L; 1JBU L; 5CKN A; 3U7U G; 2OYE P; 2GD4 A; 2P26 A; 4LOR A; 2W2P E; 1K36 A; 2OYU P; 2W2N E; 1EPJ A; 1QFK L; 1V3X B; 1LQD A; 2WPM E; 2WYJ B; 3HO4 A; 4OTY A; 1IQG L; 1G1T A; 3Q3K B; 4M10 A; 2WG3 C; 3NJP C; 3LTG D; 2P28 B; 2ADX A; 2VWL L; 3ZYG A; 2Y38 A; 3F1S B; 2P93 L; 1FE2 A; 4JZE L; 3R05 A; 2W3K B; 2J38 B; 1YO8 A; 2XC5 L; 1DIY A; 2BOH A; 2BO2 A; 2BQ7 A; 1ATE A; 4BXS A; 1PXX A; 4CUF A; 2Y5H L; 3ENS A; 1GK5 A; 3HO3 A; 3GCX E; 2Y7Z B; 2P16 L; 3DEM A; 2Y5F L; 1K37 A; 4Z0L A; 5CIS A; 2MGP A; 5L2Y L; 3SW2 A; 1ATA A; 1APQ A; 2BOU A; 4YZU B; 4ZXX L; 3LC5 B; 4JZD L; 2P3F L; 2XBV L; 3FBY A; 2BOX A; 1L5G B; 2J4I B; 1YUF A; 2EI7 B; 2J95 B; 3NTG A; 5JVZ A; 1JV2 B; 4RRZ A; 2BMG A; 5JB9 E; 3KRK A; 1XKA L; 5K0H B; 3N8V A; 1HT8 A; 4BDW A; 2WPL E; 3TK5 B; 4ZAE B; 4BDX A; 5IKQ A; 3HO5 A; 2Y5G L; 1A3P A; 1UZQ A; 1EPG A; 2BQW A; 2K2T A; 1HJ7 A; 2J2U B; 2W2Q E; 4NA9 L; 4G1M B; 3CA7 A; 1FAX L; 5I46 L; 2VWN L; 3KCG L; 2B7D L; 1G2L B; 2W86 A; 5JW1 A; 3ZYJ B; 2P95 L; 1KLJ L; 1LPZ A; 4BTT A; 3NTB A; 1DQB A; 2AYL A; 4M11 A; 1N1I A; 1PTH A; 5IKT A; 3RR3 A; 1YUG A; 1IJQ A; 1X7A L; 4O1Z A; 4OTJ A; 3N8X A; 4BTI A; 1IQJ L; 1NFY B; 1HAF A; 1IQM L; 3KQC L; 1L3Y A; 1ADX A; 2VH6 B; 2FD6 A; 4RRW A; 1OB1 C; 1IOX A; 3GCW E; 2WFX B; 4MMZ B; 1CCV A; 4ZXY L; 1HRE A; 4Y76 B; 1HX2 A; 5IKR A; 3SOQ A; 3KK6 A; 1Z6E L; 3HS7 A; 1WHE A; 2XC4 L; 3GIS X; 2WG4 B; 1EMO A; 2Y81 B; 1IGZ A; 1G1Q A; 1DDX A; 4MMY B; 2M74 A; 5L30 L; 1MQ5 L; 2BQ6 A; 1CX2 A; 4JYV L; 3BT1 A; 6COX A; 2FLR L; 1XKB A; 1W8B L; 1JL9 A; 2JKH L; 4A7I A; 3KQB L; 1Q4G A; 4X8U L; 2XBY L; 5JBC E; 4CUD A; 1IQH L; 1HZ8 A; 2P3T A; 1SZB A; 2YGP A; 2Q1J B; 3HS5 A; 1G1R A; 4Y7A B; 4CUE A; 1KSN B; 1LPG A; 1PGE A; 2WPJ E; 3FFG L; 4X8V L; 1IQK L; 2P94 L; 3IJE B; 2W2M E; 1RFN B; 1F0R B; 1EMN A; 2WPI E; 4Z0K B; 2WFT A; 5CKQ A; 2MHP A; 3N8Y A; 1CCF A; 1M1X B; 3LN1 A; 2TGF A; 1EQH A; 2I9B A; 1ZAQ A; 1TPG A; 1DX5 I; 2Y7X B; 1IGX A; 2BZ6 L; 5FDQ A; 3QH0 A; 1DVA L; 2EI6 B; 3HS6 A; 3V65 B; 1G1S A; 1HT5 A; 3EGF A; 4RRY A; 3K9X A; 2FLB L; 1LMJ A; 2Y80 B; 1BF9 A; 3KQE L; 1UZK A; 1CVU A; 1NZI A; 1NFU B; 2VH0 B; 3N8Z A; 1F7E A; 2PHB B; 3CS7 L; 3P5B L; 2W26 B; 4RS0 A; 1P9J A; 4Z6A L; 3LTF B; 1W7X L; 1EPH A; 4XL1 A; 3LN0 A; 1NFW B; 1KIG L; 4XBM A; 2KL7 A; 1AUT L; 4ZH8 B; 4C16 A; 3TBD A; 1HCG B; 4MMX B; 3CFW A; 5JVY A; 1YGC L; 5JBB E; 4D0F A; 3KL6 B; 5EGM B; 3ZYI B; 2XBX L; 1KLI L; 3TK6 B; 2UWP B; 1FF7 A; 1FJS L; 2BOK L; 3C9A C; 4D90 A; 2KB9 A; 2CJI B; 2FZZ L; 1MOX C; 4PH9 A; 3BPS E; 3LIW B; 1PFX L; 5IKV A; 1F7M A; 2P3U A; 3OLU A; 2VVV L; 1EZQ B; 2KV4 A; 3N8W A; 1COU A; 1IOE L; 1IQE L; 2WYG B; 4YT6 L; 1EAI C; 1B9W A; 1XDT R; 4COX A; 4FM5 A; 1IQF L; 3LC3 B; 1ATD A; 4BXW A; 2RNL A; 1UZJ A; 2P3F N; 2RA0 L; 1XFE A; 1IQN L; 1U8C B; 2XC0 L; 2VWM K; 2UWL B; 3TZI A; 4JZF L; 2K2S B; 4Y6D B; 1NPE B; 4X8T L; 4O02 B; 3MDL A; 1EGF A; 1KLO A; 1EBV A; 5L2Z L; 2W3I B; 2YGO A; 3TGF A; 1P0S L; 3BT2 A; 1TOZ A; 5CKM A; 4AQT A; 3ASI A; 5F1A A; 2EI8 B; 1IQI L; 1LPK A; 1PRH A; 3POY A; 1O5D L; 1Z6C A; 5E8D A; 4ZHA B; 3ELA L; 2MGR A; 2VJ3 A; 1EQG A; 2UWO B; 2VVU L; 2WPH E; 2PUQ L; 1I0U A; 3QCW A; 3NT1 A; 2PR3 B; 4NGA L; 4CSY A; 3V64 C; 4E1G A; 4X8S L; 5KIR A; 3N8Y B; 3SOB B; 3Q7D A; 2J94 B; 1G2M B; 3QMO A; 1NT0 A; 3M36 L; 4NG9 L; 1NQL B; 5COX A; 5KN5 C; 5JB8 E; 1HRF A; 5F19 A; 4Y71 B; 2VVC K; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DDU A; 2D1J B; 2H9E L; 2Y82 B; 1IQL L; 1HAE A; 3OLT A; 1IVO C; 2JJL A; 2W2O E; 4BTU A; 4TGF A; 3F6U L; 1YUK B; 1CQE A; 4LMF A; 4D0E A; 1APO A; 1IP0 A; 2RHP A; 4ISI L; 1C5M F; 1URK A; 3H5C B; 4JYU L; 3LAQ A; 3MQE A; 3IIT B; 4Y79 B; 3PGH A; 1FSB A; 1WU1 B; 1LMM A; 1FFM A; 3U73 A; 2J34 B; 1TLE A; 2WPK E; 1F0S B; 1MQ6 L; 1N7D A; 2VWO L; 4Y7B B; 1WHF A; 3M37 L; 3SOV A; 4YT7 L; 3FCS B; 1CEJ A; 1FAK L; 2I9A A; 2VRS A; 4RUT A; 1J9C L; 3CEN L; 1U67 A; 2FLG A; 1EPI A; 1ATB A; 2XBW L; 4RRX A; 1CVW L; 4ISH L; 3TH3 L; 3HPT A; 3N8W B; 5JBA E; 2NPR A; 4XLW A; 2G00 L; 3KQD L; 1NFX B; 1UZP A; 2F9B L; 1JBU L; 5CKN A; 3U7U G; 2OYE P; 2GD4 A; 2P26 A; 4LOR A; 4GU3 A; 2W2P E; 1K36 A; 2OYU P; 2W2N E; 1EPJ A; 1QFK L; 1V3X B; 1LQD A; 2WPM E; 2WYJ B; 3HO4 A; 4OTY A; 1IQG L; 1G1T A; 3Q3K B; 4M10 A; 2WG3 C; 3NJP C; 3LTG D; 2P28 B; 2ADX A; 2VWL L; 2BT8 A; 3ZYG A; 2Y38 A; 3F1S B; 2P93 L; 1FE2 A; 4JZE L; 3R05 A; 2W3K B; 2J38 B; 2KNI A; 2HOX A; 1YO8 A; 2XC5 L; 1DIY A; 2BOH A; 2BO2 A; 2BQ7 A; 1ATE A; 4BXS A; 1PXX A; 4CUF A; 2Y5H L; 3ENS A; 1GK5 A; 3HO3 A; 3GCX E; 2Y7Z B; 2P16 L; 3DEM A; 2Y5F L; 1K37 A; 4Z0L A; 5CIS A; 2MGP A; 5L2Y L; 3SW2 A; 1ATA A; 1APQ A; 2BOU A; 4YZU B; 4ZXX L; 3LC5 B; 4JZD L; 2P3F L; 2XBV L; 3FBY A; 2BOX A; 1L5G B; 2J4I B; 1YUF A; 2EI7 B; 2J95 B; 3NTG A; 5JVZ A; 1JV2 B; 4RRZ A; 2BMG A; 5JB9 E; 3KRK A; 1XKA L; 5K0H B; 3N8V A; 1HT8 A; 4BDW A; 2WPL E; 3TK5 B; 4ZAE B; 4BDX A; 5IKQ A; 3HO5 A; 2Y5G L; 1A3P A; 1UZQ A; 1EPG A; 2BQW A; 2K2T A; 1HJ7 A; 2J2U B; 2W2Q E; 4NA9 L; 4G1M B; 3CA7 A; 1FAX L; 5I46 L; 4A94 C; 1QIU A; 2VWN L; 3KCG L; 2B7D L; 1G2L B; 2W86 A; 5JW1 A; 3ZYJ B; 2P95 L; 1KLJ L; 1LPZ A; 4BTT A; 3NTB A; 1DQB A; 2AYL A; 4M11 A; 1N1I A; 1PTH A; 5IKT A; 3RR3 A; 1YUG A; 1IJQ A; 1X7A L; 4O1Z A; 4OTJ A; 3N8X A; 4BTI A; 1IQJ L; 1NFY B; 1HAF A; 1IQM L; 3KQC L; 1L3Y A; 1ADX A; 2VH6 B; 2FD6 A; 4RRW A; 1OB1 C; 1IOX A; 1KKE A; 3GCW E; 2WFX B; 4MMZ B; 1CCV A; 4ZXY L; 1HRE A; 4Y76 B; 1HX2 A; 5IKR A; 3SOQ A; 3KK6 A; 1Z6E L; 3HS7 A; 1WHE A; 2XC4 L; 3GIS X; 2WG4 B; 1EMO A; 2Y81 B; 1IGZ A; 1G1Q A; 1DDX A; 4MMY B; 2M74 A; 5L30 L; 1MQ5 L; 2BQ6 A; 1CX2 A; 4JYV L; 3BT1 A; 6COX A; 2FLR L; 1XKB A; 1W8B L; 1JL9 A; 2JKH L; 4A7I A; 3KQB L; 1Q4G A; 4X8U L; 2XBY L; 5JBC E; 4CUD A; 1IQH L; 1HZ8 A; 2P3T A; 1SZB A; 2YGP A; 2Q1J B; 3S6X A; 3HS5 A; 1V1I A; 1G1R A; 4Y7A B; 4CUE A; 1KSN B; 1LPG A; 1PGE A; 2WPJ E; 3FFG L; 4X8V L; 1IQK L; 2P94 L; 3IJE B; 2W2M E; 1RFN B; 1F0R B; 1EMN A; 2WPI E; 4Z0K B; 2WFT A; 2BT7 A; 5CKQ A; 2MHP A; 3N8Y A; 1CCF A; 1M1X B; 3LN1 A; 2TGF A; 1EQH A; 2I9B A; 1ZAQ A; 1TPG A; 1DX5 I; 2Y7X B; 1IGX A; 2BZ6 L; 5FDQ A; 3QH0 A; 1DVA L; 2EI6 B; 3HS6 A; 3V65 B; 1G1S A; 1HT5 A; 3EGF A; 4RRY A; 3K9X A; 2FLB L; 1LMJ A; 2YGQ A; 2Y80 B; 1BF9 A; 3KQE L; 4GU4 A; 1UZK A; 1CVU A; 1NZI A; 1NFU B; 2VH0 B; 3N8Z A; 1F7E A; 2PHB B; 3CS7 L; 1LK9 A; 3P5B L; 2W26 B; 4RS0 A; 1P9J A; 4Z6A L; 2WZP P; 3LTF B; 1W7X L; 1EPH A; 4XL1 A; 3LN0 A; 1NFW B; 1KIG L; 4XBM A; 2KL7 A; 1AUT L; 4ZH8 B; 4C16 A; 3TBD A; 1HCG B; 4MMX B; 3CFW A; 5JVY A; 1YGC L; 5JBB E; 4D0F A; 3KL6 B; 5EGM B; 3ZYI B; 2XBX L; 1KLI L; 3TK6 B; 2UWP B; 1FF7 A; 1FJS L; 2BOK L; 3C9A C; 4D90 A; 2KB9 A; 2CJI B; 2FZZ L; 1MOX C; 4PH9 A; 3BPS E; 3LIW B; 1PFX L; 5IKV A; 1F7M A; 2P3U A; 3OLU A; 2VVV L; 1EZQ B; 2KV4 A; 3N8W A; 1COU A; 1IOE L; 1IQE L; 2WYG B; 4YT6 L; 1EAI C; 1B9W A; 1XDT R; 4COX A; 4FM5 A; 1IQF L; 3LC3 B; 1ATD A; 2HOR A; 4BXW A; 2RNL A; 1UZJ A; 2P3F N; 2RA0 L; 1XFE A; 1IQN L; 1U8C B; 2XC0 L; 2VWM K; 2UWL B; 3TZI A; 4JZF L; 2K2S B; 4Y6D B; 1NPE B; 4X8T L; 4O02 B; 3MDL A; 1EGF A; 1KLO A; 1EBV A; 5L2Z L; 2H9E C; 2W3I B; 2YGO A; 3TGF A; 1P0S L; 3BT2 A; 1V1H A; 1TOZ A; 5CKM A; 4AQT A; 3ASI A; 5F1A A; 2EI8 B; 1IQI L; 1LPK A; 1PRH A; 3POY A; 1O5D L; 1Z6C A; 5E8D A; 4ZHA B; 3ELA L; 2MGR A; 2VJ3 A; 1EQG A; 2UWO B; 2VVU L; 2WPH E; 2PUQ L; 1I0U A; 3QCW A; 3NT1 A; 2PR3 B; 4NGA L; 4CSY A; 3V64 C; 4E1G A; 4X8S L; 5KIR A; 3N8Y B; 3SOB B; 3Q7D A; 2J94 B; 1G2M B; 3QMO A; 1NT0 A; 3M36 L; 2BSF A; 4NG9 L; 1NQL B; 5COX A; 5KN5 C; 5JB8 E; 1HRF A; 5F19 A; 4Y71 B; 2VVC K; #chains in the Genus database with same CATH homology 2DDU A; 2D1J B; 2H9E L; 2Y82 B; 1IQL L; 1HAE A; 3OLT A; 1IVO C; 2W2O E; 4BTU A; 4TGF A; 3F6U L; 1YUK B; 1CQE A; 4LMF A; 4D0E A; 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