The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
|
sequence length |
94
|
structure length |
94
|
Chain Sequence |
GPLGSENRSKTTSTWVLRLDGEDLRVVLEKDTMDVWCNGQKMETAGEFVDDGTETHFSVGNHDCYIKAVSSGKRKEGIIHTLIVDNREIPELTQ
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Fas apoptosis inhibitory molecule contains a novel beta-sandwich in contact with a partially ordered domain.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Fas apoptotic inhibitory molecule 1
|
| molecule tags |
Apoptosis
|
| source organism |
Mus musculus
|
| total genus |
5
|
| structure length |
94
|
| sequence length |
94
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-01-01 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Beta Barrel | Lipocalin | Lipocalin |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2KD2 A; 3MX7 A; 2KW1 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1LIE A; 2RTA A; 4YBU A; 2IZL B; 2CBS A; 1OPB A; 1PM1 X; 2I5Z O; 3VG2 A; 4CK4 A; 2MHD A; 4INN A; 1SWT A; 2RTR B; 5D8J A; 3L4R A; 3MVF A; 2I5V O; 1S44 A; 1VWD B; 3VU1 A; 1LF7 A; 2GH7 A; 4OS8 A; 2F73 A; 2BS6 A; 1U0X A; 2AL0 X; 5JD2 A; 2GC9 A; 5HCE C; 1Y9L A; 1SWL A; 2AKQ A; 5L8O A; 1X8Q A; 1H91 A; 3T1D A; 1KL3 A; 1ML7 A; 3NR3 A; 3VG5 A; 3BY0 A; 3WYP A; 2F09 A; 4CDC A; 2FS7 A; 3P02 A; 2HZR A; 4Y0S A; 2PI3 O; 1LPJ A; 2A13 A; 1E2T A; 3C77 X; 1HY2 A; 4QGX A; 2OY5 O; 4PSQ A; 2RTJ A; 1EPB A; 3RDS A; 3HWF A; 1N43 A; 1DV9 A; 1T68 X; 4Z2P A; 2ASN X; 4GE1 A; 3CQN A; 1JMX A; 4MVL A; 5EDB A; 1KT3 A; 3BX7 A; 1NP1 A; 4O4O A; 3GE2 A; 4O4S A; 5BVS A; 1MX7 A; 1IFB A; 5D45 A; 4ZFX A; 1X8P A; 1SWR A; 4JHQ A; 5DG4 A; 1EUO A; 3RBY A; 2QMI A; 2RTG B; 2FHN X; 2R74 A; 4OMX A; 3RDM A; 5H8T A; 4ORU A; 4TKB A; 4FBV A; 3NQ9 A; 4BQU A; 1SY0 A; 1CBQ A; 5CHK A; 5CSE A; 3VG7 A; 2DJF A; 1RXH A; 1KT5 A; 2AVI A; 2ALL X; 3CKF A; 4JNJ A; 3K3L A; 3TGA A; 1TW4 A; 1KZW A; 3B2L A; 3Q34 A; 1G85 A; 4YGZ A; 2DJG A; 1SWO A; 1PEE A; 3P6D A; 4QYP A; 2QO6 A; 3LTW A; 4OS3 A; 3C78 X; 2IZJ A; 1GKA B; 3JQO A; 3RDU A; 1VPR A; 2IZE B; 2RCT A; 3BS2 A; 3LHN A; 3ZW0 B; 1GT3 A; 5LJG A; 4C5P A; 4FBO A; 4NW4 A; 2OFA A; 1SWJ A; 4I3B A; 4BGF A; 3D96 A; 1X89 A; 2A3F X; 2FHL A; 3SZJ A; 2CZT A; 4Y0Q A; 1HMT A; 1IKJ A; 1I04 A; 3KFH A; 1ZND A; 3PH6 A; 1DF8 A; 4BX6 A; 4QGV A; 1CJ5 A; 2JN3 A; 4A8Z A; 2MF6 A; 1FEL A; 3PPT A; 3ELZ A; 1SLE B; 3WZO A; 1LFO A; 3WXQ A; 3VG3 A; 1VWB B; 4I9S A; 3RWX A; 1LIC A; 5HWZ A; 2CM9 A; 1JQP A; 1OPA A; 1SWQ A; 1STP A; 2WQA E; 2Y3E A; 1QG5 A; 2Z4H A; 1CRB A; 1OBU A; 1BRP A; 3EC5 A; 4GH7 A; 4IB9 A; 4LKP A; 4GGT A; 2LBA A; 4Z2O A; 3TGB A; 5B11 O; 3UEU A; 2W2F A; 1D3S A; 3AEH A; 1SRJ A; 4IAB A; 1KOI A; 1SWU A; 1SY1 A; 2RTO B; 3AUM O; 3BLG A; 3NBX X; 3PEC A; 4O49 A; 4CPH A; 2OZQ A; 4R0B A; 4EEJ A; 3D4R A; 5HBS A; 1SRG A; 4I6S A; 3TF6 A; 1YUP A; 2Q39 A; 5K67 A; 4KCA A; 2X4M A; 1Y0G A; 3VE2 A; 4YGH A; 2QCB A; 1SRI A; 1A3Y A; 3PP6 A; 4Y59 A; 1G74 A; 1KL5 A; 1YIV A; 1XCA A; 4A1Y A; 1JZU A; 1A2D A; 4Y5D A; 2XKL A; 3CQR A; 3WBG A; 3P6C A; 3PK2 A; 4O3Z A; 4RUU A; 5FQ6 E; 5H9A A; 4ZHH A; 2K62 A; 1KXO A; 3T2X A; 3ZW1 B; 3PQS A; 1SWC A; 1SXX A; 4AZP A; 1N0S A; 5LJB A; 4B55 A; 4MIS A; 5FFH A; 4CSB A; 1B4M A; 4IB8 A; 1MM9 A; 1QY2 A; 1NC9 A; 1UYO X; 1SWK A; 2Q9S A; 1ZNG A; 1R0U A; 3HWD A; 4ORW A; 1OSP O; 4BX5 B; 2G7B A; 4ZH9 A; 1GT5 A; 1VWG B; 4HFO A; 4K19 A; 5F6Z A; 1OEJ A; 1UYN X; 4YH0 A; 5CYB A; 4XME A; 4HPA A; 3WJD A; 1X71 A; 3MM0 A; 4COT A; 1SWN A; 1VWJ B; 1HXZ A; 3HPE A; 4OKA A; 3FEL A; 4DQ3 A; 2ACP X; 1SWA A; 2WWP A; 3ZQ3 A; 5AEO A; 1BRQ A; 5H9K A; 2JOZ A; 2ZAG A; 2GJ5 A; 3HK1 A; 3ZW2 A; 1RSU B; 3MBT A; 4LZV A; 2FTB A; 1GT4 A; 2JW1 A; 4GJV A; 4OS0 A; 4BX6 B; 4ZGU A; 2IZD B; 4YFP A; 2HLV A; 1SLF B; 1VWA B; 2IZG B; 1EPA A; 1LCW A; 4GZV A; 4U9C A; 5HA0 A; 3FR4 A; 2X8S A; 3V8U A; 4AYH A; 1AVG I; 2RTH B; 3FW5 A; 4FGI B; 1FEN A; 5IRW A; 3WJF A; 1TVQ A; 2HNX A; 2FWV A; 2WQ9 A; 3ZWE A; 3RSW A; 1ADL A; 2KW1 A; 4YGG A; 4BX7 A; 2RTF B; 1QFT A; 1VWR B; 1P6P A; 2KTS A; 3HTY A; 4OMW A; 5BVQ A; 1GX9 A; 2Q2M A; 4ORY A; 2C4I A; 4GNW A; 4GJS A; 5F2B A; 1KT4 A; 1FEM A; 4DNE A; 1VWH B; 5B5F A; 1AQB A; 1B0O A; 5K68 A; 1LKE A; 2IZC B; 2POA A; 4QZT A; 4CDD A; 1LCZ A; 1VYF A; 2X56 A; 1NQN A; 4MVI A; 3WYQ A; 4WHI A; 5IO5 A; 1FJ1 E; 4GDA A; 3N91 A; 4GU8 A; 4UU3 A; 2A5C A; 1VWN B; 3QKG A; 5HZ9 A; 1JMZ A; 2LA7 A; 2Y32 A; 3KQ0 A; 2A8G A; 4NNS A; 4WFV A; 2IZA A; 5DPQ A; 2NND A; 5HTE A; 3RE5 A; 3STM X; 2RTQ B; 4N7C A; 1I05 A; 3ELX A; 4ZH6 A; 5BVT A; 4IB6 A; 2LBV A; 2GTL O; 1DZK A; 1ALB A; 4GK9 A; 3TZS A; 1KZX A; 3D97 A; 1O1V A; 2OY1 O; 1JBH A; 2OL6 O; 1ICM A; 1TXL A; 2KT4 B; 3VHI A; 3EYC A; 4O9S A; 1BEB A; 2LB6 A; 1SRH A; 4GGR A; 2ANS A; 4GDZ A; 1ZNE A; 4TJZ A; 2FRS A; 2LKK A; 1W5R A; 4ORX A; 4AZR A; 1N9M A; 5B27 A; 3FA7 A; 2A2G A; 1ZNK A; 3QQ2 A; 1YP6 A; 2WEX A; 4KH8 A; 2KTD A; 1Y53 X; 1N4J A; 3APX A; 4NLI A; 4HWM A; 2AT0 X; 3PH5 A; 2AH7 X; 4CV7 A; 1AVE A; 3AKM A; 1D2U A; 1MVG A; 2AT6 X; 1X8N A; 1SXY A; 3G7X A; 4ZHD A; 2OF8 A; 4L3R A; 5EEE A; 4ZHC A; 2IZK A; 2BC3 A; 3JS1 A; 2OF9 A; 5FQ8 E; 1AB0 A; 1MUP A; 4TQ2 A; 5KHP A; 3P6E A; 1YWC A; 1BM5 A; 4NNT A; 2RTL A; 1KT7 A; 3T6F A; 5F1E A; 2L68 A; 2ACO A; 2G8C O; 3SLO A; 3AKN A; 3PED A; 1JIW I; 3S5V A; 1A18 A; 1ERX A; 1JJU A; 2HKD A; 3B2H A; 2GTL N; 3EBK A; 2VFC A; 4LKT A; 4ON1 A; 5AJB A; 2CBR A; 2RTP B; 3B2K A; 1GGL A; 3FA6 A; 4BCS A; 1JYD A; 2FS6 A; 2RTI B; 3I17 A; 1B8E A; 3IFB A; 1VYG A; 1PTS A; 4XMC A; 1U18 A; 4AZM A; 2RTM A; 2RTE B; 1IFC A; 4XMD A; 1EII A; 3NX1 A; 5EED A; 3O22 A; 3CBC A; 3T6L A; 2A5B A; 4CPH B; 4IB7 A; 5LJD A; 1FE3 A; 1SWG A; 1YWD A; 2HZQ A; 2JU3 A; 3B2J A; 5HAE A; 2AT8 X; 2X32 A; 1MOY A; 1QAB E; 1Y55 X; 2A0A A; 3VHM A; 1VWP B; 1N7Y A; 1MEP A; 2AF5 A; 4BBO A; 2UYW A; 1VWO B; 4IAX A; 3NX2 A; 2P8G A; 4N7D A; 5EZ2 A; 4PJ2 A; 3BU9 A; 2A2U A; 4QYN A; 4YKM A; 1KT6 A; 3S60 A; 5D47 A; 2FGS A; 2GTF X; 2X45 A; 1KGL A; 3ZZV A; 1RXK A; 2G78 A; 3WJC A; 4AZQ A; 4CDE A; 1RBP A; 1VWM B; 1OBQ A; 3NP1 A; 3VHH A; 1CBS A; 3CMP A; 2AT3 X; 1SWS A; 4EFG A; 1VWC B; 4Z2V A; 5HTD A; 3U0D A; 1JJJ A; 5EDC A; 2CAM A; 3GAQ A; 5KID A; 2WUT A; 4DCB A; 1BSY A; 2W2A A; 2EU7 X; 5AQ6 A; 3WZP A; 1MX8 A; 2RTB B; 3ZI8 A; 3P6F A; 1E5P A; 1VWK B; 1GX8 A; 3JSQ A; 4FQB B; 4IMN A; 2RTK A; 3BX8 A; 4O4X A; 5H9L A; 3WJG A; 4ZJ0 A; 2NNQ A; 2FKJ A; 1RLB E; 3WOV A; 1JYJ A; 1QY1 A; 3WJE A; 5C0N A; 2O62 A; 1BSQ A; 2C1Q A; 5LJK A; 2IZB A; 3P6G A; 3KZA A; 2JGS A; 2OL7 A; 5F7G A; 2G5L A; 4NYQ A; 5B10 O; 1NGL A; 4QQ1 A; 1E06 A; 1Z24 A; 3BDR A; 3S5X A; 5FAZ A; 3WZQ A; 1VYO A; 3F8A A; 4QZU A; 3STN A; 4QRL A; 1UZ2 X; 1DF3 A; 2Q2P A; 1FDQ A; 1HBQ A; 1MDC A; 2NP1 A; 2BLG A; 3B2I A; 3EBW A; 3U03 A; 1OEE A; 3P24 A; 4KC8 A; 1ZNL A; 4ML7 B; 5BYP A; 1QWD A; 3F6Z B; 2QM9 A; 5LKF A; 4EKV A; 4I60 A; 1SWE A; 4IAW A; 1TOU A; 2HMB A; 4BX7 B; 5JR8 A; 4U8U O; 5L3Y A; 5LJC A; 1EIO A; 1IW2 A; 1SLG B; 3FID A; 2BSZ A; 4M6S A; 3RDO A; 1S7D A; 1BWY A; 2IZF B; 1S2P A; 1WBI A; 2FT9 A; 2XST A; 3WVM A; 5AJC A; 3MG5 A; 2PY1 A; 3APW A; 3TGC A; 2QO5 A; 3NQK A; 5B2A O; 5HA1 A; 2OFM X; 1Y52 X; 4CDF A; 2WEW A; 4NV8 A; 1A57 A; 3FIQ A; 3APU A; 4KT5 A; 3UEX A; 1MK5 A; 2BT9 A; 3D95 A; 3HOE A; 5EPQ A; 5B29 A; 1LUQ A; 2X46 A; 4O4U A; 4I95 A; 3FA8 A; 1BBP A; 1NBX A; 1LEL A; 4GNY A; 3EMM A; 4IRW A; 1HMR A; 4ALO A; 3DSZ A; 5D48 A; 4WBK A; 2AMM X; 4Z28 A; 4ALB A; 4GD9 A; 3FYF A; 2FKG A; 2RQ0 A; 3F9D A; 4YDB A; 2OVA A; 4MVE A; 5HZ5 A; 1DZJ A; 1QFV A; 3D9W A; 4Z6J A; 3T2W A; 1YWA A; 1HQP A; 5IRA A; 1CBI A; 2ZSC A; 3WZN A; 3O2Y A; 1LDQ A; 3RDX A; 4ES7 A; 3SAO A; 2UZ2 A; 4YMY A; 1JV4 A; 4U8U N; 4EXZ A; 4XMG A; 1G5W A; 2DM5 A; 3U9P C; 1HBP A; 2R73 A; 4CPE A; 5CE4 A; 4GUZ A; 4YFR A; 1SY3 A; 4A60 A; 1L6M A; 2YMS A; 3HOL A; 3O19 A; 4ZHF A; 2FR3 A; 3BRN A; 3FEN A; 4TNN A; 4ZR2 A; 4EQA C; 1W4T A; 4AZO A; 1GT1 A; 1SMP I; 5KIC A; 2Y3F A; 1NQM A; 1YWB A; 2LFO A; 4BOE A; 2QO4 A; 2ZAI A; 1W6F A; 4Y0P A; 5F6B A; 2OY8 A; 3C76 X; 5HCD C; 2X8T A; 1T0V A; 2BS5 A; 2OFB A; 2RTD B; 1KFF A; 2G79 A; 3CWK A; 4I3C A; 1BSO A; 1PBY A; 3BSZ E; 3RY1 A; 3PQU A; 4O3Y A; 1I4U A; 2X34 A; 3VGW A; 5LJE A; 4YDA A; 4GET A; 3EW2 A; 1NDJ A; 4UU2 A; 3HWE A; 2GTL M; 2QOM A; 2X55 A; 1T8V A; 3E3C A; 5L8N A; 4XMH A; 3RE6 A; 2L9C A; 5LJH A; 1K24 A; 2HYS A; 2RTN B; 3UAQ A; 5HCC C; 1I78 A; 1SWF A; 3P6H A; 5HZ6 A; 3CBS A; 1TOW A; 4KII A; 2F01 A; 4ORS A; 3SLJ A; 1STR B; 3LV4 A; 2MM3 A; 4NYR A; 3UEV A; 1B56 A; 2MJI A; 1LIB A; 4FBR A; 3H3I A; 1RXJ A; 3KFF A; 1LCV A; 4GKC A; 1DZP A; 1EI5 A; 4I9R A; 1SLD B; 2RN4 A; 5HZQ A; 5IRU A; 2RCQ A; 1LNM A; 3NAD A; 4A1H A; 1GX3 A; 4LQZ A; 4CPI A; 4ZGF A; 1RST B; 2FLJ A; 2W2B A; 4ZCB A; 1DZM A; 2WR6 A; 3SLT A; 3SOT A; 2KD2 A; 3SZH A; 3DTQ A; 1LIF A; 2OVE A; 1VWI B; 4HPC A; 3X00 A; 1HQQ A; 4O3W A; 2VDF A; 4O3X B; 4XMF A; 4TKH A; 4AZN A; 4YCH A; 1LDO A; 4JO6 A; 1QQS A; 1LID A; 1VWE B; 2QOS C; 3VG4 A; 4ARH A; 2WPU A; 5IO6 A; 2MWH A; 2OFR X; 4ODD A; 4HPB A; 5B3M O; 1XKI A; 4L1N A; 1SXU A; 1SWH A; 4YVB A; 1K3B A; 1SA8 A; 1SXW A; 5FQ7 E; 3ZUO A; 4JGL A; 1ICN A; 1GKA A; 2JMB A; 1I06 A; 2FR2 A; 2Q4N A; 4HPD A; 3ZW0 A; 1DC9 A; 2MO5 A; 5HZ8 A; 1GXA A; 3KVN A; 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1AVD A; 2AT5 X; 2E4J A; 3FEP A; 1CBR A; 2OY7 A; 1OBP A; 3STK A; 1KL4 A; 4QGW A; 3KFI A; 5IXG A; 1O8V A; 3NPO A; 1E00 A; 2YG2 A; 4WFU A; 4GRJ A; 4BX5 A; 4YCE A; 4D6B A; 4DQ4 A; 4LZU A; 3S26 A; 3RY2 A; 3EM0 A; 1PMP A; 1HMS A; 4IMO A; 3FR2 A; 4TLJ A; 4U8U M; 1GM6 A; 4MVK A; 4U46 A; 4I3D A; 1HN2 A; 1SWD A; 5H9N A; 2C1S A; 2CM4 A; 2VFB A; 1IKE A; 5F58 A; 3RKG A; 1OEK A; 1IJ8 A; 5K06 A; 1YP7 A; 4Y0R A; 2IFB A; 4GGZ A; 4IBA A; 3OE3 A; 1EAL A; 4NP1 A; 4MIR A; 1U17 A; 1ZRY A; 3UEW A; #chains in the Genus database with same CATH homology 1LIE A; 4YBU A; 2CBS A; 1OPB A; 1PM1 X; 3VG2 A; 4CK4 A; 2MHD A; 4INN A; 5D8J A; 3L4R A; 3MVF A; 3VU1 A; 1S44 A; 1LF7 A; 4OS8 A; 2F73 A; 2BS6 A; 1U0X A; 2AL0 X; 2GC9 A; 5HCE C; 1Y9L A; 2AKQ A; 5L8O A; 1X8Q A; 1H91 A; 3T1D A; 1ML7 A; 3VG5 A; 3NR3 A; 3BY0 A; 2F09 A; 2FS7 A; 3P02 A; 2HZR A; 4Y0S A; 1LPJ A; 2A13 A; 3C77 X; 3RWX A; 4QGX A; 4PSQ A; 1EPB A; 3HWF A; 1DV9 A; 1T68 X; 2ASN X; 4GE1 A; 3CQN A; 4MVL A; 5EDB A; 1KT3 A; 3BX7 A; 1NP1 A; 3GE2 A; 4O4S A; 5BVS A; 1MX7 A; 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