The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
95
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structure length |
95
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Chain Sequence |
b'PAIEVGRICVKVKGREAGSKCVIVDIIDDNFVLVTGPKDITGVKRRRVNILHLEPTDKKIDIQKGASDEEVKKKLEESNLTEYMKEKIKIRMPTL'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure and Stability of the Archael L14e Ribosomal Protein from Sulfolobus solfataricus
rcsb |
| molecule keywords |
50S ribosomal protein L14e
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| source organism |
Sulfolobus solfataricus
|
| molecule tags |
Ribosomal protein
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| total genus |
11
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| structure length |
95
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| sequence length |
95
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-01-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1Q7Y U; 1EIF A; 1KD1 U; 1NJI C; 1W2B A; 4X34 A; 2CKK A; 3J80 E; 3LGF A; 5HY6 A; 3CCE A; 1YIJ T; 2DO3 A; 1KQS A; 3DB3 A; 1X6O A; 3CCQ T; 1K8A C; 1Q82 C; 3CCU T; 2E6Z A; 1KC8 U; 4TVR A; 2KDS A; 3HKS A; 3JAM E; 1QVG A; 1YIJ A; 3J81 E; 3CCQ A; 2IG0 A; 1W2B S; 5IAY A; 1KQS S; 1RL2 A; 1VQK T; 3CC4 T; 1YHQ T; 2MWO A; 2OTJ T; 1KC8 C; 4ZN1 A; 1QVG S; 1SSF A; 1YJN T; 1VQ6 T; 3ER0 A; 1M90 U; 1YHQ A; 3CC4 A; 2OTJ A; 1XNI A; 1Q81 U; 1K73 C; 1YJN A; 3DB4 A; 3CCL T; 1VQ6 A; 3I55 T; 1N8R U; 2QEX T; 1IZ6 A; 1VQ9 T; 1JJ2 A; 3CMA A; 1VQ7 T; 3CCL A; 3CCJ T; 3CCV T; 1Q7Y C; 1VQL T; 1KD1 C; 2E70 A; 3I55 A; 3CC2 A; 5J3B A; 2QEX A; 1VQ4 T; 2KVQ G; 1VQ9 A; 3CCS A; 2JUF A; 5IT9 E; 1VQ7 A; 3CCJ A; 3TRE A; 1VQM T; 1YI2 T; 2LQ8 A; 3CCV A; 1NPP A; 5A2Q E; 1N8R C; 3CME A; 1VQ8 T; 1VQL A; 3CCR A; 1JJ2 S; 1VQ4 A; 3OW2 A; 4ZN3 A; 1VQO T; 1K9M U; 2XHC A; 4CRI A; 1YI2 A; 1VQM A; 2MI6 A; 3G71 T; 2EIF A; 3CPF A; 1VQ8 A; 1M1G A; 4YTL A; 1BKB A; 3CMA T; 2JNG A; 1VQO A; 1M1K U; 1UEB A; 1YJW T; 1Q86 U; 1YIT T; 3CC2 T; 1VQN T; 3OYY A; 3G71 A; 3A5Z B; 3OW2 S; 3CCM T; 2LCL A; 1NJI U; 5DM7 R; 3CCS T; 1VQ5 T; 1QVF A; 3J7A F; 2MWP A; 2LVM A; 3G4S T; 1YJ9 T; 1M90 C; 1YJW A; 1YIT A; 2OTL T; 1VQN A; 2G3R A; 3CCR T; 1Q81 C; 1K8A U; 1Q82 U; 3LH0 A; 5DLQ E; 1VQ5 A; 3CCM A; 3KBG A; 3CPW A; 2JOY A; 4QQD A; 3G4S A; 1YJ9 A; 2OTL A; 3G6E T; 1NZ9 A; 1VQP T; 1YBY A; 1QVF S; 2L3R A; 4RG2 A; 1S72 T; 1NPR A; 3I56 T; 3G6E A; 1VQP A; 5J26 A; 3P8B B; 1KHI A; 3CPW S; 3PIO A; 3CXC A; 1S72 A; 3PIP A; 3I56 A; 3CCU A; 3CD6 T; 1XTD A; 2QA4 T; 5LL6 S; 2JVV A; 1K73 U; 3CME T; 1K9M C; 3CC7 T; 3DLL A; 3CCE T; 3CD6 A; 1M1K C; 3LGL A; 1Q86 C; 3CXC S; 2QA4 A; 5FLX E; 3CC7 A; 1VQK A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3JSC A; 3H0I A; 1QQJ A; 1WHG A; 2CP6 A; 3CPW P; 1RLP C; 4M77 F; 4OP0 A; 2MK5 A; 2QK0 A; 4DQ2 A; 4EDU A; 2EGA A; 2FB7 A; 3EG1 A; 2CZ6 B; 2DBM A; 3FIF A; 2QEX Q; 1G2B A; 2K3B A; 2IG0 A; 4PFP A; 2KRO A; 1TUC A; 1W70 A; 1WX6 A; 3BDU A; 1M1K R; 4PKC C; 4M7D D; 5GAO r; 4ZTJ A; 1G3T A; 1BI0 A; 1QP3 A; 1K0X A; 3ER0 A; 3CC4 A; 2LMJ A; 2DE0 X; 1TS9 A; 1AWW A; 3VUZ A; 4K11 A; 1ZSZ A; 3UAT A; 2JM9 A; 2M16 A; 2RJC A; 3TCJ A; 1VQL T; 3HRU A; 1ZA2 B; 5J3B A; 2OTL Q; 1IB8 A; 3BY7 A; 4L59 A; 3PE0 A; 3S3N A; 1AZE A; 5GAN 3; 4LUE A; 4KBM B; 1JRI A; 4HT8 A; 5HK3 A; 1K9M U; 2L3S A; 4R55 A; 2JNG A; 2RHY A; 5GAN f; 1MHN A; 2JMC A; 5FWC A; 1K4U S; 2FZC B; 1MNE A; 2LVM A; 1PHT A; 4E7Z A; 5IH2 A; 1FMK A; 4LN2 A; 4BD3 A; 3SDZ A; 4LDX A; 1VQP T; 2I0N A; 1YBY A; 3O5Z A; 4J8O A; 1XQH A; 2RM4 A; 1M9S A; 2L0A A; 2PZ1 A; 5LJ3 f; 2AHJ B; 4B6M A; 1OEB A; 2LP5 A; 2EJF A; 3OYH A; 3CD6 T; 2H8H A; 3OS2 A; 3L2U A; 1Q81 R; 3JCM h; 2L5Q A; 2QA4 T; 1K9M C; 4QT7 A; 1YCY A; 2E3H A; 2DMO A; 1N27 A; 4MZM A; 1UGP B; 3WVD B; 4R56 A; 3CXC S; 2X3W D; 4F7U B; 2EAY A; 3CME A; 3OS5 A; 4XTY A; 4ESR A; 2EFI A; 3PMI A; 4C8Q C; 1VQ6 Q; 1X6B A; 3QZ9 B; 3M57 A; 2EQI A; 3CCQ T; 3D7S B; 4C0Z A; 1WLP B; 2DTO A; 2DXT A; 1D0X A; 4AFS C; 4BY6 C; 1VYT A; 4IKF A; 3A8L B; 3CCJ Q; 2EWN A; 2EYQ A; 5EC7 A; 4A4H A; 1VQ4 Q; 2K57 A; 2Y90 A; 4M75 B; 1YWO A; 3GOX A; 1OV3 A; 4DBQ A; 3OBW A; 3SFM A; 1RUW A; 3X26 B; 3H0F A; 3OQ5 A; 2OTJ A; 4IIM A; 4PJL A; 4KUI A; 4J9F A; 2YHT A; 1YJN A; 3QYG B; 3OMC A; 3MO8 A; 2RK2 A; 3I5S A; 1WDX A; 4HCZ A; 5CQX A; 1UGV A; 4C8Q D; 4N0A A; 3U23 A; 2DXU A; 1VQ7 A; 2DD4 A; 3BDL A; 2HL5 C; 2EYY A; 5D6Y A; 1T3S A; 5LJ3 d; 1OZ3 A; 4FSS A; 4KRT A; 2JN0 A; 1K73 R; 2KAF A; 1JU5 C; 2AT1 B; 4LXC A; 5GAN 5; 1QP2 A; 2JMA A; 3QWY A; 4L6V 5; 1PRL C; 1NJI U; 3GLX A; 1YJ9 T; 3TEE A; 2EQM A; 1HD3 A; 2FRW A; 1UJY A; 2KMT A; 5CKE A; 3S3O A; 2CYZ B; 4RMO A; 4E7I A; 2XDD A; 2O31 A; 1HSQ A; 2M1H A; 4KH1 B; 1ABQ A; 2OJ2 A; 3CXC A; 2RH2 A; 1S72 A; 1RAA B; 4C92 F; 3CC7 T; 2LJ1 A; 3TU4 K; 3M4G A; 4MZT A; 1IRX A; 1N6A A; 4F16 A; 5C6S A; 2EQK A; 1EIF A; 4M75 A; 1NJI C; 5GMK j; 2DKG A; 2RQR A; 2CP5 A; 5GAM j; 4C0D C; 4C8Q G; 1VQL Q; 2QDY B; 1HXD A; 3O8V A; 2K5L A; 4Y28 E; 5D6W A; 4EPC A; 1ABO A; 1OZ2 A; 3UT1 A; 1Q82 R; 2PQW A; 2DVJ A; 1W2B P; 4ANJ A; 4A53 A; 5KCO A; 1IZ6 A; 1E6H A; 3CCV T; 2LNH B; 1BI2 A; 2E65 A; 4JRI A; 2KVQ G; 4JJB A; 1GRI A; 2ENM A; 2COY A; 4M7A F; 1MGQ A; 2K6D A; 4QVC A; 2FRY A; 1VQP Q; 4ORZ A; 1M8M A; 4M75 E; 2J05 A; 4RTX A; 1Q86 U; 3LH5 A; 2VYT A; 1AT1 B; 2DNU A; 2E3I A; 3NPF A; 3A5Z B; 1N9R A; 3FC3 A; 3CCM T; 3TVT A; 3Q1J A; 3RMS A; 3CD6 Q; 2VB6 A; 2QA4 Q; 2RO0 A; 1VOM A; 2DIL A; 3QXE B; 2JXB A; 2W0Z A; 3G4S A; 2X51 A; 2MF2 A; 1X69 A; 4RG2 A; 5D6X A; 2LZ6 B; 1BI3 A; 5L8R E; 1NE8 A; 5KYN A; 3CCQ Q; 1GBR A; 4JLI A; 1CKA A; 2PNI A; 1IHV A; 2KE9 A; 2OAU A; 1SPK A; 4PJO F; 2FL7 A; 1UDL A; 1E6G A; 3EG3 A; 1WHH A; 4F17 A; 2M51 A; 3M53 A; 2O2O A; 4M7D B; 1Q86 C; 1GL5 A; 1MV3 A; 4M77 C; 4M78 C; 2KK4 A; 3EGU A; 2ECZ A; 2L3Q A; 1UFF A; 2KYB A; 2DM1 A; 2E6N A; 1AD5 A; 3INZ A; 4MMK A; 4OMF B; 4E7J A; 3RER A; 2CP2 A; 2DTI A; 2HQE A; 2EBP A; 4FM4 B; 3VRZ A; 1CKB A; 2M0O A; 1YHQ T; 4KGV B; 4EMK B; 3M55 A; 2DIQ A; 1OOT A; 1QVG S; 4E47 A; 1B7T A; 2QGG A; 3GF5 A; 2AK5 A; 1SHF A; 2A28 A; 1Y71 A; 5KH6 A; 5AYF A; 1RLQ C; 4DBF A; 2BZY A; 1WGS A; 4M78 D; 2X3X D; 1YJ9 Q; 2VV5 A; 3OYG A; 1KC8 R; 1VQ9 A; 5IT9 E; 1MND A; 1NPP A; 3VV0 A; 1GCP A; 4A63 B; 3DLM A; 2AIR B; 2GQI A; 1VQ8 A; 1ZUY A; 3QJY A; 4YTL A; 1B3Q A; 2EJG A; 1KD1 R; 1TWB A; 2OX7 A; 1WXU A; 2PUO B; 2FYK A; 2E5Q A; 5KE3 A; 3VJP A; 2G6F X; 1H64 1; 5FW9 A; 2QQS A; 2D8H A; 5FU7 B; 3X28 B; 2VUB A; 2LCS A; 4NOY A; 1TU0 B; 1X27 A; 3M9Q A; 3PNW C; 1QVF S; 2IVW A; 1N9S A; 2DK3 A; 2DVE A; 2AZS A; 3M0T A; 3QKJ A; 2CH4 A; 3PIO A; 3MEA A; 2YRC A; 3NTI A; 5GAN j; 1JO8 A; 2BZ8 A; 4JPB W; 2EQU A; 2EYW A; 1NM7 A; 4AG2 C; 1RI0 A; 4J7I A; 1SSH A; 2ZPH B; 4JJC A; 1R77 A; 3EAE A; 4BE0 A; 2PUK B; 3NFC A; 5CIU A; 2CP7 A; 1QVG A; 4FCY A; 5LJ3 j; 2P0P A; 2LCC A; 4M78 G; 1LJO A; 2GFU A; 2YRV A; 4E2F B; 3CCV Q; 3JB9 D; 1KQS S; 1RL2 A; 4C8Q B; 3EG9 B; 1VQK T; 2YSQ A; 2FPE A; 2CSQ A; 2ROT A; 3QO3 A; 1D0Y A; 4C5G A; 2LQN A; 1K8A R; 4BY6 B; 1KK7 A; 2HDA A; 6AT1 B; 2A36 A; 3M56 A; 4ZTF A; 5CKB A; 5HKC A; 1MMD A; 1UB4 A; 2XI9 A; 2WSF E; 1N8R U; 1G3S A; 3MHX A; 2K5I A; 3CCM Q; 2DXB A; 4P5N A; 4ELZ C; 2F69 A; 2DPP B; 3S6W A; 1AWX A; 2DYB A; 3JCM X; 2R58 A; 4HCK A; 4OML A; 1VQO T; 2XHC A; 3MP8 A; 1M2V B; 1M1G A; 1PCX A; 1PD1 A; 1MMG A; 3JV3 A; 2ZAE A; 4FW2 A; 1VQN T; 1XOV A; 3BW1 A; 4D8K A; 1QVF A; 2HL3 A; 1WPY A; 3UPU A; 2KEA A; 5CKF A; 3R6O A; 1WQ7 A; 1QW1 A; 3X25 B; 3M0P A; 4XTV A; 4F14 A; 3A8G B; 3V8L A; 4JUV A; 1WXT A; 1RI9 A; 4UC4 A; 2B86 A; 2CZ7 B; 3HHT B; 4J9E A; 3VS2 A; 2V26 A; 4C92 C; 3VS0 A; 3CPW S; 1KHC A; 1ZBJ A; 4HVV A; 4GLK A; 2PTK A; 3I56 A; 3E2U A; 1GCQ C; 1BB9 A; 3PFS A; 3VUB A; 4EMG A; 1RAH B; 5A0G A; 3PTA A; 1ZSG A; 1YHQ Q; 2L89 A; 4CC4 B; 3LGL A; 1YNZ A; 3EG2 A; 4C8Q A; 3EG9 A; 2X9H A; 3QG1 A; 5HK0 A; 2F1L A; 3VU3 C; 3CCE A; 1VIF A; 1KQS A; 2HQH A; 2O9V A; 4QQ6 A; 2A3L A; 1WJQ A; 2MAM A; 1SG5 A; 3RES A; 5LJ5 e; 2K3X A; 4KUD K; 3J81 E; 2HSP A; 3GBQ A; 3HFO A; 3UWN A; 3P8D A; 2RF0 A; 4RTT A; 4FT4 A; 4M4Z A; 1ACM B; 2JT4 A; 4C5H A; 2ZPE B; 2A37 A; 4ZGE B; 1M90 U; 1C1A A; 4PK4 A; 2A08 A; 2ZCF B; 2FZG B; 1QVP A; 3DB4 A; 3CCL T; 3UF4 A; 4PFZ A; 2P4T A; 1M2V A; 4V2S A; 4IUR A; 3OYL A; 4M7A C; 3H6Z A; 1VIE A; 5IHK A; 2QEX A; 2A0F B; 1UHF A; 1Z9Z A; 5LJ5 g; 1VQM T; 1YI2 T; 3V7C A; 5GAO l; 5A2Q E; 3HL8 A; 3L2Z A; 2F2X A; 4C8Q E; 1RAI B; 1M1F A; 2EJ9 A; 2KT1 A; 4NS5 A; 2CT4 A; 4QVD A; 4AG1 C; 4OMQ A; 4FYX B; 4KT0 E; 4XTW A; 1UHC A; 1M1K U; 1YIT T; 4F7U F; 2BZX A; 5I22 A; 1VUB A; 1M90 C; 4RCB A; 3JRZ A; 3CCR T; 1XJW B; 1QKW A; 2EGC A; 1OUL A; 5GAM g; 3CPW A; 1F1B B; 1RAF B; 2OTL A; 3SWN C; 2RB6 A; 1TXQ A; 2PVO B; 3L1A A; 4FT2 A; 4M75 F; 4PJO C; 1RAC B; 2QQR A; 4E7L A; 4NL2 A; 1K9M R; 4RCC A; 2CH4 W; 1I07 A; 4IUU A; 2LC4 A; 2P0Q A; 4BE1 A; 1VQK Q; 2KXD A; 4C92 G; 3I35 A; 4A4F A; 1M1K C; 3SEM A; 1VQK A; 2HBP A; 1I5O B; 1JXM A; 1UGS B; 4AT1 B; 3LGF A; 2K2V A; 1X6O A; 2EKH A; 2E6Z A; 3LYI A; 2PU9 B; 1UUE A; 3M54 A; 1PSF A; 3JAM E; 1I5L A; 1WQW A; 4M78 B; 8AT1 B; 1Y96 B; 4OMO A; 5GAN 4; 3JCM P; 3MP6 A; 2LX7 A; 4ZN1 A; 2NYS A; 2RN8 A; 3WXM B; 5FRO A; 1VQO Q; 3I5R A; 1Q81 U; 1ZLM A; 4NL3 A; 2DRM A; 1VQ6 A; 4XQ3 A; 4OMN A; 1VQN Q; 1IGQ A; 4A4K A; 2E70 A; 5I11 A; 3GIB A; 4F04 B; 3CCJ A; 3HP9 A; 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