The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
8
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sequence length |
63
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structure length |
63
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Chain Sequence |
GPFCGRARVHTDFTPSPYDTDSLKIKKGDIIDIICKTPMGMWTGMLNNKVGNFKFIYVDVISE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
NMR solution structure of the HACS1 SH3 domain
rcsb |
| molecule keywords |
SAM domain-containing protein SAMSN-1
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| total genus |
8
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| structure length |
63
|
| sequence length |
63
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-01-27 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07653 | SH3_2 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4AFU C; 1T3L A; 2KXC A; 2DE0 X; 2J6F A; 2K9G A; 1UG1 A; 1Y0M A; 2GBQ A; 3THK A; 2GNC A; 3TSZ A; 3EG2 A; 2JM9 A; 3VS6 A; 1QWF A; 2RMO A; 4F17 A; 3UAT A; 1I07 A; 1E6G A; 2CH4 W; 2KYM A; 1KSW A; 4CC4 B; 2DM1 A; 4HVU A; 4M4Z A; 4IIM A; 2DBK A; 1OEB A; 1TUD A; 1UGV A; 1WA7 A; 2KYB A; 4OMN A; 2CUB A; 3M0P A; 2LCS A; 2MCN A; 1RUW A; 2CT3 A; 3NHN A; 1CSK A; 1BU1 A; 3JV3 A; 2ROT A; 1CKA A; 2JT4 A; 2EGE A; 2RQT A; 4RTY A; 1UHF A; 2AK5 A; 1K1Z A; 1WI7 A; 1EFN A; 1G83 A; 2K7A A; 4AFS C; 1UE9 A; 2O9S A; 2YUO A; 1GCQ C; 1AWJ A; 4GLM A; 2ABL A; 2CSI A; 3EHR A; 2XMF A; 3UA6 A; 1OV3 A; 2FRY A; 2D8H A; 2ENM A; 1RI9 A; 4F16 A; 1SRM A; 2DBM A; 1K9A A; 3NPF A; 5IXB A; 3VS4 A; 1AZE A; 2MOX A; 4DEY A; 2EYW A; 1PRM C; 2KEA A; 5I11 A; 1Y57 A; 1Z9Q A; 5FWC A; 3H0I A; 2JMA A; 1HJD A; 1WFW A; 3IQL A; 3RNJ A; 2O88 A; 1M30 A; 2CUD A; 3SEM A; 2LJ0 A; 2BTT A; 1ZUK A; 3M0S A; 2DX1 A; 2DLP A; 3TVT A; 1QLY A; 2EYX A; 3PVQ A; 1BBZ A; 2KRM A; 3M0T A; 1GL5 A; 1HSQ A; 1M3A A; 1WXT A; 1UEC A; 3C0C A; 1T0H A; 1PNJ A; 2A08 A; 3GBQ A; 1ZLM A; 4JJC A; 1JQQ A; 2RNA A; 2EKH A; 2KRS A; 3NGP A; 4AFQ C; 1X69 A; 2HSP A; 2BZY A; 2FPE A; 1AEY A; 2YT6 A; 5EC7 A; 1ZUU A; 2B86 A; 2VKN A; 1YWP A; 4J9D A; 4OML A; 4ZNX A; 1JEG A; 1E6H A; 2K79 A; 3SHW A; 2GGR A; 2LJ1 A; 3VS0 A; 1TUC A; 2D1X A; 3REB B; 3M0U A; 1U5S A; 1MV0 B; 3H41 A; 1WXB A; 1JXM A; 2JMC A; 1UUE A; 1K76 A; 2NWM A; 2AZV A; 1PKS A; 4ORZ A; 3A98 A; 2GQI A; 1N5Z A; 2O9V A; 1GFC A; 2YUN A; 2J6K A; 4J9G A; 2DIL A; 2E5K A; 2KXD A; 4LE9 A; 4CC2 A; 1A0N B; 2M51 A; 4E6R A; 4AFZ C; 2L2P A; 3EG0 A; 4OMQ A; 2X3W D; 2ECZ A; 2MIO A; 2DNU A; 5L23 A; 1X43 A; 1WXU A; 4AG1 C; 2HDA A; 2LX7 A; 4RUG A; 2DRK A; 1S1N A; 3M0Q A; 1SPK A; 2L3P A; 3H0H A; 1VYU A; 1AVZ C; 1NLP C; 1PKT A; 2PTK A; 5FW9 A; 4EIK A; 1X27 A; 2EGC A; 2SEM A; 3I5R A; 2EPD A; 2K2M A; 1YN8 A; 4OMO A; 3VS5 A; 3KFV A; 4LN2 A; 5ECA A; 5HCK A; 1KJW A; 1YWO A; 5IHI A; 1GRI A; 3REA B; 4AG2 C; 3VS2 A; 4F14 A; 5IHK A; 3UA7 A; 1Z9Z A; 1AD5 A; 1QWE A; 1V1C A; 2X3X D; 2ROL A; 4J9E A; 1IO6 A; 3RBB B; 4CC3 A; 1U06 A; 1SHF A; 2ED1 A; 1NG2 A; 4OMM A; 3I35 A; 4OMP A; 2I0N A; 2K3B A; 3O5Z A; 2F2V A; 3VS1 A; 1JU5 C; 1ABO A; 1AOJ A; 1I1J A; 3ZL7 C; 1MUZ A; 2DVJ A; 2P4R A; 1U3O A; 2G6F X; 1UJY A; 3VRY A; 2PNI A; 4LUE A; 1M3B A; 2RN8 A; 2C0T A; 2FRW A; 2SRC A; 2DMO A; 4RTX A; 1RLQ C; 3EGU A; 3VS3 A; 2L3Q A; 1GBR A; 1M3C A; 1BB9 A; 2DYB A; 2KRO A; 4D8K A; 4RTU A; 4LNP A; 2RQV A; 2DF6 A; 4Y92 A; 1K0S A; 1B07 A; 2DJQ A; 1YP5 A; 2KT1 A; 4RTW A; 1JO8 A; 2FO0 A; 1T3S A; 4IIO A; 2VVK A; 1B3Q A; 2V1R A; 2YUP A; 1AWO A; 2EBP A; 3VS7 A; 4RTZ A; 3I5S A; 3EHQ A; 3PE0 A; 2M0Y A; 2CSQ A; 1NLO C; 1TG0 A; 2AKL A; 2KT8 A; 1CKB A; 3NMZ C; 1KIK A; 1MV3 A; 2KE9 A; 5FWB A; 1H3H A; 2A28 A; 3FJ5 A; 2RF0 A; 2DRM A; 3QWX X; 1X2Q A; 4HXJ A; 1J3T A; 1NM7 A; 2KRN A; 2LQN A; 1UDL A; 2RQU A; 2YDL A; 2FPD A; 1X2K A; 4JJD A; 4JZ4 A; 1GBQ A; 3UF4 A; 4J9F A; 4WCI A; 1ZUY A; 2JS2 A; 1G2B A; 2A37 A; 5IXF A; 2J06 A; 2FG0 A; 1PRL C; 2C0O A; 4JZ3 A; 4D8D A; 2CDT A; 1WYX A; 2HBW A; 2D8J A; 1K4U S; 2CT4 A; 4J9H A; 2EYY A; 4LUD A; 1OOT A; 1VYT A; 1WLP B; 1RLP C; 2GTO A; 3M0R A; 1VYV A; 1NEG A; 2HCK A; 1ARK A; 2GTJ A; 1SEM A; 2JTE A; 4QT7 A; 1ZSG A; 2IIM A; 4Z89 A; 1QCF A; 4RTT A; 2AKK A; 2W10 A; 1GCQ A; 2CH4 A; 2KGT A; 4ESR A; 3QWY A; 2DL7 A; 1K0X A; 1UFF A; 4KRT A; 3R6N A; 3LH5 A; 1SRL A; 3H0F A; 1E7O A; 1M8M A; 4J9B A; 1PWT A; 2PZ1 A; 2O31 A; 3I9Q A; 2VWF A; 1UHC A; 4JPB W; 4A63 B; 4K11 A; 1BK2 A; 1GFD A; 2J6O A; 2YUQ A; 1HD3 A; 2BZX A; 2DL8 A; 2L3S A; 2RPN A; 1UJ0 A; 4RTV A; 2J7I A; 1QKX A; 1X6G A; 2DA9 A; 1OPL A; 4JJB A; 4HVW A; 4DEX A; 2KR3 A; 3ULR B; 1VA7 A; 2EQI A; 1QKW A; 2L0A A; 4HCK A; 4Z8A A; 5IHN A; 5I22 A; 2JS0 A; 2H8H A; 2RQW A; 2V1Q A; 1NYG A; 2AZS A; 1WIE A; 1JXO A; 5IH2 A; 1SSH A; 1H92 A; 2O2O A; 1SHG A; 2C0I A; 1NYF A; 1UTI A; 1AZG B; 4R0K A; 2ED0 A; 1AWX A; 2LJ3 A; 2JM8 A; 3TSW A; 2LP5 A; 2RQR A; 1OPK A; 4Z88 A; 2BZ8 A; 1YNZ A; 2F2X A; 2EGA A; 1GCP A; 2JXB A; 3CQT A; 2YSQ A; 4GBQ A; 2DL3 A; 1T0J A; 4CC7 A; 1XOV A; 2EW3 A; 1W70 A; 2QDL A; 2FEI A; 2LNH B; 2FPF A; 4J9I A; 1W6X A; 2LQW A; 2KBT A; 2LMJ A; 2JW4 A; 1ZX6 A; 4HVV A; 1H8K A; 3VRZ A; 2DL5 A; 2K6D A; 2F2W A; 2OAW A; 2DL4 A; 2HEQ A; 3PVL A; 4FSS A; 1W1F A; 2A36 A; 1X6B A; 2ESW A; 2NUZ A; 4J9C A; 2EYZ A; 1WDX A; 1NEB A; 1ABQ A; 2D0N A; 1FMK A; 2OI3 A; 2LZ6 B; 1LCK A; 3EG1 A; 1M27 C; 1KFZ A; 1I0C A; 2CRE A; 2EVR A; 3U23 A; 1AWW A; 1PHT A; 2KNB B; 4X1V A; 3EG3 A; 1YCS B; 2W0Z A; 2J05 A; 5GJW B; 1ZBJ A; 2OJ2 A; 1FYN A; 5GJV B; 1WX6 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2OTJ T; 1FMV A; 2KXC A; 2DE0 X; 5CKB A; 2QEX Q; 4JLG A; 3OB9 A; 4TVR A; 4E47 A; 1OI1 A; 3MKD A; 4FYW B; 1QVF S; 4WTO B; 4JRP A; 1S72 T; 3EG2 A; 1RAF B; 1OZ2 A; 1K73 U; 2RMO A; 4KH0 B; 3PFS A; 3HRT A; 4F17 A; 3BE3 A; 3HL8 A; 1VQO A; 3LLR A; 3CC7 A; 4M4Z A; 2DBK A; 1OEB A; 1WA7 A; 4MDX A; 4ZN1 A; 4B6M A; 5CKD A; 2K3Y A; 4IUU A; 4EMK B; 4N4G A; 4M75 B; 3JB9 G; 1VQN T; 4C8Q B; 2EGE A; 4PJL A; 2AK5 A; 4BI8 B; 1EFN A; 2YUO A; 2O9S A; 3H6Z A; 1RAI B; 4GLM A; 2CP3 A; 3UA6 A; 3OYA A; 4A4K A; 2VC8 A; 2FRY A; 2D8H A; 3OW2 S; 5DM7 R; 3G71 A; 3NPF A; 2K5I A; 2EFI A; 2ZPH B; 4FU6 A; 1M1K R; 5D7U A; 2QG9 B; 2YWW A; 1Z9Q A; 3H0I A; 1YI2 T; 3UPU A; 4PJO E; 1HJD A; 2X9H A; 5KYU A; 3RNJ A; 3BW1 A; 1RAH B; 4F7U F; 4M7D F; 2LJ0 A; 1N27 A; 5C0M A; 3M0S A; 2EYX A; 3PVQ A; 3JB9 I; 1D0X A; 3SWN A; 5AT1 B; 4BY6 B; 2DVE A; 4M7A B; 1V29 B; 1WXT A; 6AT1 B; 4C0F A; 4XTX A; 4RMO A; 4XK8 E; 1PNJ A; 3EGD A; 2IPO B; 4PLL A; 2HKN A; 4JJC A; 1K9M C; 2P84 A; 2RNA A; 4E7L A; 3CC4 A; 4M77 G; 2KRS A; 3JCM d; 2YT6 A; 4ZNX A; 3CD6 T; 1VIE A; 1ZBX A; 1W2B A; 2K79 A; 5LJ3 g; 2GGR A; 1YJW Q; 1Q86 C; 5GAM f; 2NUT A; 4Z02 A; 3H41 A; 2KAF A; 2AZV A; 2DXU A; 3M53 A; 4A53 A; 1Q7Y U; 4OVA A; 2J6K A; 3CCJ T; 4LD6 A; 1VQ6 Q; 1FMW A; 1X6O A; 2X4Y A; 1WZO A; 2BE9 B; 4QW2 A; 3A8M B; 1M1F A; 3CCS A; 4XTZ A; 3S3O A; 2ECZ A; 4FYX B; 2MIO A; 4DA4 A; 5L23 A; 3OA6 A; 2JOY A; 1X43 A; 1ZQ1 A; 2HDA A; 2E3I A; 5GAO q; 4X34 A; 1BI1 A; 1VQM A; 1UEB A; 1VIF A; 2K4Y A; 4RCB A; 3I56 T; 3CCR Q; 2SEM A; 2XID A; 1F1B B; 2K2M A; 1IGQ A; 5GAN e; 4BI3 A; 4KGX B; 3ASK A; 1VQP Q; 1YHQ T; 2COW A; 4M7D A; 4C92 B; 1QCO A; 1LOJ A; 5IHI A; 5FU7 C; 4C0D C; 3CCU T; 3REA B; 2MK5 A; 3VS2 A; 2DKG A; 4F14 A; 3UA7 A; 1Z9Z A; 2ZZD A; 4J9E A; 4KGV B; 3LW5 E; 2GFU A; 1SHF A; 3UT1 A; 5CR2 A; 3CCL A; 3C95 A; 2GCX A; 3M55 A; 1HXD A; 2OTJ A; 1YIT T; 2E12 A; 1X01 A; 3WXM B; 1S72 A; 2VB6 A; 1AOJ A; 1I1J A; 1PG5 B; 2ZAE A; 2VGM A; 3KUF A; 1UGP B; 1VQ5 Q; 1NJI C; 2P4R A; 1OUL A; 1VQ7 T; 1UJY A; 3TU4 K; 5KCH A; 1IXD A; 4RTX A; 1RLQ C; 1OZ3 A; 3VS3 A; 2L3Q A; 5FLX E; 1M1K U; 1IZ6 A; 3CC2 T; 4D8K A; 1OU8 A; 3JCM g; 3G6E T; 4KUL A; 2AHJ B; 4LNP A; 4A54 A; 1B07 A; 2DIQ A; 2L89 A; 1JO8 A; 4IIO A; 2VVK A; 1AWO A; 2WSE E; 1WHJ A; 3I5S A; 4M78 D; 5FU6 B; 4PJO F; 2A3L A; 3CPF A; 2RJF A; 2RD1 A; 1YI2 A; 5GAO m; 1TG0 A; 2KT8 A; 1KIK A; 4MDW A; 5FWB A; 2YRC A; 1KQS P; 4FYV B; 4C92 E; 3E2U A; 1RAD B; 5GAN h; 4PJJ A; 4XTU A; 2CP0 A; 4HXJ A; 1NM7 A; 3OMG A; 1UDL A; 1MMD A; 3CBP A; 3TEE A; 2DO3 A; 2RQU A; 4JZ4 A; 1YCY A; 1X2K A; 4GLK A; 1GBQ A; 2HD0 A; 1YIJ T; 1HK9 A; 1U1T A; 2JS2 A; 3FRN A; 5IXF A; 1IGU A; 1VQL Q; 1PRL C; 2C0O A; 2CDT A; 3E9G A; 1K4U S; 3CPW P; 4LUD A; 4PK4 A; 2LVM A; 3CD6 A; 3SFM A; 1VQO Q; 1N6A A; 5KYU B; 1VYT A; 2I2L A; 2GTO A; 3M0R A; 1VYV A; 3CC7 Q; 3OYY A; 2V26 A; 4E7I A; 1R8O B; 1D1C A; 4M78 C; 4QT7 A; 1ZSG A; 4ATO A; 1XTD A; 2AKK A; 2LT4 A; 3SWN B; 4J6W A; 3CCJ A; 1YJ9 Q; 1M8V A; 3HP9 A; 4M75 F; 3A8G B; 4C8Q F; 4ZTJ A; 2A0F B; 4J6X A; 3CBM A; 2FHD A; 4F7U G; 4M7D G; 2C06 A; 2L5Q A; 4J9B A; 4OP0 A; 3I9Q A; 3EH1 A; 1UHC A; 2RHZ A; 3EG9 B; 1AHJ B; 1RAA B; 2J6O A; 1M2O A; 2BZX A; 2DL8 A; 3RKY A; 1MHN A; 4JUV A; 3JCM Q; 1QKX A; 1TS9 A; 1X6G A; 2YXY A; 2KR3 A; 1VA7 A; 3GIB A; 4HCK A; 1YHQ A; 5CQY A; 3FC3 A; 2JS0 A; 2H8H A; 2RQW A; 2YRV A; 1TU0 B; 2V1Q A; 1NYG A; 3CCU A; 1WIE A; 1Y96 A; 4M7A F; 2QA4 T; 1UTI A; 4FT2 A; 2V8I A; 1D3B A; 5DY9 A; 2DIG A; 3HSB A; 4CRI A; 2ZPI B; 3QO3 A; 4LDX A; 3A8L B; 2V8K A; 2ZPE B; 2F2X A; 1YNZ A; 1D1B A; 2EGA A; 1YIT A; 2LC4 A; 4BUG A; 2LCC A; 2YSQ A; 4NL2 A; 1T0J A; 2HSE B; 4CC7 A; 4ZGD B; 1XOV A; 2RH2 A; 3BFM A; 1NPR A; 4PJO C; 2CYZ B; 2YRD A; 3JCM V; 5GAN 4; 2RM4 A; 2QGF B; 5GAM e; 1NBE B; 1W6X A; 5CIU A; 3OYD A; 1VQ7 A; 2DEQ A; 2QXF A; 2JW4 A; 3OMC A; 4AT1 B; 4VUB A; 2CZ7 B; 2K6D A; 4OMF B; 4EMK A; 1Q82 C; 4C8Q A; 4FSS A; 3CC2 A; 2A36 A; 1X6B A; 3VV0 A; 3L2W A; 1VQK Q; 3G4S T; 3G6E A; 1IRE B; 1NEB A; 2WSC E; 1VQ8 A; 1ACM B; 5KYX B; 1M27 C; 1KFZ A; 2DTO A; 1I0C A; 2VAS A; 1KQS A; 1I5L A; 5LJ5 f; 2RHY A; 3D7S B; 3V8J A; 1XNI A; 1C0M A; 1WHG A; 4IUQ A; 3OYK A; 1YCS B; 2W0Z A; 1DJ7 B; 2J05 A; 5GJW B; 4C92 F; 3KXT A; 3BDU A; 2K5F A; 2PUK B; 4M7A A; 3L2V A; 3CCL Q; 2J6F A; 3CPW A; 2JNG A; 5HK0 A; 2OTJ Q; 2PVD B; 1YIJ A; 3M9Q A; 3VS6 A; 3NFC A; 4ELZ C; 3OYB A; 3A1P A; 1I07 A; 3MCA B; 3JB9 D; 3EH2 A; 1KSW A; 4HVU A; 4IIM A; 1K9M R; 1TUD A; 2KYB A; 4JS4 A; 1RUW A; 2CT3 A; 3NHN A; 4M7D E; 3JV3 A; 3E9F A; 3MET A; 1CKA A; 3RDV A; 5GAM h; 1KQ1 A; 4PJO G; 1K1Z A; 1VQN Q; 1P92 A; 1GCQ C; 5LJ5 j; 1OQK A; 2ABL A; 1Q86 R; 3EHR A; 1OV3 A; 2ENM A; 2EYQ A; 4BB7 A; 3CC4 T; 3CCV Q; 3M4Y A; 1WHL A; 3J80 E; 2MPX C; 3DB3 A; 5CK9 A; 2MOX A; 4A4E A; 3URG A; 4DEY A; 4B9X A; 1PRM C; 2KEA A; 1O75 A; 1Y57 A; 3HFN A; 2QQ9 A; 2ZPF B; 3EFS A; 5FWC A; 1QP2 A; 1VQ9 T; 3CCQ T; 4ELY C; 2EWN A; 1KHI A; 3SEM A; 1ZUK A; 3UWN A; 2DX1 A; 3OYJ A; 1BCO A; 4Y28 E; 3LWH A; 3OS5 A; 4M77 D; 1M2V B; 5GMK i; 2KRM A; 4PFZ A; 4XAX B; 1GL5 A; 1QQJ A; 4EPC A; 3MHX A; 3CCS T; 1W2B S; 1JQQ A; 2QA4 A; 1X69 A; 5GAN 7; 5AYF A; 2HNI A; 1ZUU A; 3VU3 C; 4OF1 A; 4M75 G; 1G3T A; 1E6H A; 4EDU A; 2XU8 A; 1U8R A; 2RHI A; 3M58 A; 2PU9 B; 3V7C A; 4QQG A; 3M0U A; 1IHW A; 1MV0 B; 2COZ A; 2JMC A; 2HQH A; 1K76 A; 1PKS A; 4JRQ A; 2YUN A; 1GFC A; 1D0Y A; 3CCE T; 2DIL A; 2E5K A; 2KXD A; 4IUT A; 2G3R A; 5CQX A; 1A0N B; 2ZPG B; 4C92 C; 4E7Z A; 4E6R A; 3C94 A; 4B9W A; 2RHU A; 3OSS C; 4BE0 A; 2X3W D; 3MEW A; 1NJI R; 3WVD B; 4C5I A; 4AG1 C; 1WXU A; 1LNX A; 3G4S A; 4RUG A; 1S1N A; 3GP8 A; 3CXC S; 4N4H A; 3H0H A; 4M7A G; 1AVZ C; 1NLP C; 1PKT A; 2PTK A; 4LXC A; 2XI9 A; 4EIK A; 1MNE A; 3CCM Q; 1YN8 A; 3I56 Q; 3KFV A; 2ZPB B; 4JLI A; 1PSF A; 4LN2 A; 5HCK A; 1QVF P; 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