The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
3
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sequence length |
72
|
structure length |
72
|
Chain Sequence |
MVSRDQAHLGPKYVGLWDFKSRTDEELSFRAGDVFHVARKEEQWWWATLLDEAGGAVAQGYVPHNYLAERET
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The solution structure of SH3 domain of PTK6
rcsb |
| molecule keywords |
Tyrosine-protein kinase 6
|
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
3
|
| structure length |
72
|
| sequence length |
72
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2009-03-18 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1JQQ A; 1B07 A; 1PHT A; 1H8K A; 1NEB A; 4RTU A; 3H0H A; 4QT7 A; 1VYU A; 3NPF A; 4A63 B; 2O88 A; 1PWT A; 4RUG A; 2OI3 A; 4HVV A; 1GBR A; 1UDL A; 2J6K A; 2LX7 A; 1AVZ C; 1AEY A; 1AZE A; 3I35 A; 2F2V A; 1BK2 A; 1W1F A; 2FPE A; 2A28 A; 3NMZ C; 1X6G A; 1ABO A; 2KE9 A; 1WXU A; 1FMK A; 2SRC A; 1HSQ A; 1NM7 A; 1MV0 B; 1M3A A; 2EVR A; 2EQI A; 2KR3 A; 2XMF A; 4WCI A; 4RTV A; 2DX1 A; 1B3Q A; 5EC7 A; 2PTK A; 1J3T A; 2F2X A; 2RF0 A; 4E6R A; 3VRZ A; 2AK5 A; 2KNB B; 1X6B A; 2BZ8 A; 2YUQ A; 4JJD A; 1E6G A; 4J9H A; 3EHR A; 1NYF A; 4J9E A; 2JT4 A; 4Y92 A; 2EYW A; 3H0F A; 2LQN A; 1I0C A; 1BB9 A; 1T0H A; 2DL8 A; 3UAT A; 2I0N A; 5FWB A; 1M3C A; 2RQV A; 3TSZ A; 1K4U S; 5IXF A; 2RQT A; 3VRY A; 1YNZ A; 1K76 A; 2KRM A; 3I5R A; 4JZ4 A; 1BU1 A; 4LUD A; 3M0U A; 1GFD A; 1HJD A; 2E5K A; 1U5S A; 2NWM A; 3UA6 A; 2O9V A; 4AFU C; 2FPF A; 3CQT A; 5FWC A; 1PKT A; 3H0I A; 4HXJ A; 5HCK A; 1YWO A; 2DL4 A; 2LMJ A; 2EYX A; 4HCK A; 2M51 A; 4RTT A; 5I11 A; 4OMQ A; 1W70 A; 2KYM A; 3KFV A; 3VS5 A; 5L23 A; 2CT3 A; 2FRY A; 2CSI A; 2LP5 A; 2OJ2 A; 3VS7 A; 1UHC A; 2LZ6 B; 3VS3 A; 3UA7 A; 2FG0 A; 2YDL A; 1ZLM A; 2B86 A; 1Y57 A; 3I5S A; 1UE9 A; 4LN2 A; 3GBQ A; 3M0Q A; 1SRL A; 1K1Z A; 4Z88 A; 1T0J A; 4X1V A; 1LCK A; 2DL5 A; 2KEA A; 2CSQ A; 5IHI A; 1JU5 C; 2BTT A; 1GFC A; 1NEG A; 1PRM C; 1E7O A; 1ZUK A; 5GJW B; 2J6O A; 4RTX A; 4F16 A; 3RNJ A; 2L3Q A; 2X3W D; 1QKW A; 4CC2 A; 2KXC A; 2ECZ A; 2EGC A; 3EG0 A; 5IHK A; 2M0Y A; 2AZV A; 1I1J A; 2ED1 A; 1TG0 A; 1T3S A; 2CH4 W; 2D8H A; 4JJB A; 3EG2 A; 2C0T A; 2P4R A; 4ZNX A; 2FPD A; 1ZX6 A; 1X69 A; 1KJW A; 2RQW A; 1QLY A; 2K6D A; 3VS6 A; 1FYN A; 2YSQ A; 2D0N A; 1K0S A; 2RN8 A; 1OOT A; 2DL7 A; 2LQW A; 3SHW A; 2PNI A; 1UGV A; 2CRE A; 1WLP B; 2HSP A; 2K3B A; 2KBT A; 2DRK A; 2KT1 A; 4LE9 A; 2KRN A; 3JV3 A; 2L0A A; 4OMP A; 2BZY A; 1CSK A; 2DE0 X; 2LJ1 A; 1X27 A; 2EGE A; 2LJ3 A; 1GCQ A; 2C0I A; 1JXM A; 4AFZ C; 2YUN A; 2RNA A; 2AZS A; 2JMC A; 2KRO A; 1YN8 A; 2JS0 A; 1QKX A; 1AOJ A; 2IIM A; 1JEG A; 2LJ0 A; 3VS4 A; 2EW3 A; 2ABL A; 1GBQ A; 1UEC A; 3I9Q A; 2L2P A; 3REB B; 3R6N A; 2EYZ A; 2DBK A; 2O2O A; 4GLM A; 2ROL A; 1Y0M A; 1NLP C; 1GCQ C; 2EPD A; 2X3X D; 1RLP C; 2EGA A; 1VA7 A; 2J05 A; 1WI7 A; 2A36 A; 2CUB A; 2YT6 A; 3QWX X; 2K79 A; 3VS1 A; 1OPK A; 4JPB W; 3ULR B; 1VYV A; 2AKK A; 1M3B A; 1WXB A; 1X43 A; 4ORZ A; 2O31 A; 2ROT A; 2DMO A; 1UFF A; 1I07 A; 1AD5 A; 1K0X A; 3O5Z A; 1UHF A; 1G2B A; 1NG2 A; 1WFW A; 2ED0 A; 2CDT A; 4J9B A; 3PVL A; 2DIL A; 3H41 A; 1W6X A; 1UJY A; 3ZL7 C; 1V1C A; 1WX6 A; 1YWP A; 1NYG A; 3REA B; 2O9S A; 3A98 A; 1ZBJ A; 3VS2 A; 2HDA A; 3VS0 A; 1YP5 A; 2CT4 A; 3M0T A; 2OAW A; 1MV3 A; 2FO0 A; 2KGT A; 4J9I A; 1XOV A; 2EKH A; 2H8H A; 1WA7 A; 1UUE A; 4IIM A; 2A37 A; 2VVK A; 1GL5 A; 2HEQ A; 1YCS B; 1JXO A; 2FEI A; 2ENM A; 1KSW A; 4R0K A; 4HVW A; 1ZUY A; 4OMN A; 4AFQ C; 3UF4 A; 2GQI A; 2LCS A; 1M27 C; 2JMA A; 2KT8 A; 1UJ0 A; 4JJC A; 1AWW A; 4OML A; 4D8D A; 4CC3 A; 4RTY A; 1GCP A; 2MOX A; 1OV3 A; 4DEY A; 3EG3 A; 2HBW A; 4CC4 B; 2DRM A; 4D8K A; 1JO8 A; 2JM9 A; 3TSW A; 4Z89 A; 2RQR A; 2DYB A; 3M0R A; 4JZ3 A; 1EFN A; 2JS2 A; 2DLP A; 2YUO A; 1OPL A; 2QDL A; 1QWE A; 3SEM A; 1ARK A; 2JXB A; 2K9G A; 3EHQ A; 1X2Q A; 2NUZ A; 4F17 A; 3QWY A; 4ESR A; 2DM1 A; 4EIK A; 1U3O A; 3FJ5 A; 1CKB A; 5IXB A; 1SSH A; 2KRS A; 5GJV B; 2KXD A; 2J7I A; 4F14 A; 4Z8A A; 4LNP A; 1H92 A; 1H3H A; 1KIK A; 2D8J A; 2GBQ A; 3RBB B; 1UG1 A; 2DNU A; 4RTW A; 4OMM A; 4OMO A; 1VYT A; 2ESW A; 2L3S A; 1NLO C; 1X2K A; 2GNC A; 4J9C A; 1N5Z A; 2J06 A; 1S1N A; 2VKN A; 2YUP A; 1RUW A; 2JTE A; 1TUD A; 1WDX A; 5I22 A; 1K9A A; 2RMO A; 1AWX A; 1RLQ C; 4FSS A; 1U06 A; 1GRI A; 4HVU A; 2C0O A; 1PKS A; 1KFZ A; 2CH4 A; 3PVQ A; 2PZ1 A; 1SEM A; 4J9F A; 2RPN A; 3C0C A; 5IH2 A; 2AKL A; 1RI9 A; 1IO6 A; 4AG2 C; 1M30 A; 2JW4 A; 3U23 A; 1WXT A; 2GTJ A; 1WYX A; 1QWF A; 4AFS C; 2W10 A; 2LNH B; 2W0Z A; 1BBZ A; 3THK A; 2HCK A; 2BZX A; 2RQU A; 4KRT A; 2DA9 A; 2SEM A; 2DL3 A; 2MCN A; 1SHG A; 5FW9 A; 3NGP A; 3M0S A; 3EGU A; 2J6F A; 4J9D A; 4LUE A; 2EBP A; 2EYY A; 1OEB A; 4RTZ A; 1ZSG A; 5ECA A; 2V1R A; 1QCF A; 1AWJ A; 1T3L A; 2V1Q A; 4DEX A; 3TVT A; 4CC7 A; 1TUC A; 2A08 A; 1ABQ A; 3LH5 A; 4J9G A; 3M0P A; 1SHF A; 2GTO A; 4K11 A; 3EG1 A; 1SPK A; 1AWO A; 3NHN A; 2JM8 A; 2MIO A; 2DBM A; 4AG1 C; 1AZG B; 5IHN A; 2DF6 A; 1PNJ A; 1A0N B; 2FRW A; 2K7A A; 1CKA A; 2GGR A; 1PRL C; 1G83 A; 1UTI A; 1WIE A; 1ZUU A; 1SRM A; 1Z9Q A; 2L3P A; 3PE0 A; 1M8M A; 4IIO A; 4M4Z A; 2CUD A; 2DVJ A; 2VWF A; 4GBQ A; 2G6F X; 2D1X A; 3IQL A; 2KYB A; 1E6H A; 2F2W A; 2DJQ A; 1HD3 A; 2K2M A; 1Z9Z A; 1MUZ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2GCX A; 1IXD A; 2K57 A; 2VXF A; 4RTU A; 1QVG P; 1TS9 A; 3C4S A; 3NPF A; 3MO8 A; 2O88 A; 4RUG A; 1GBR A; 4HVV A; 2J6K A; 1AVZ C; 3CCQ Q; 1AEY A; 2F2V A; 1FMW A; 2FB7 A; 1BK2 A; 1W1F A; 3CEY A; 4M7A F; 2G3R A; 4J8O A; 4RG8 A; 1I5L A; 4JS5 A; 4A53 A; 3L2W A; 5GAM h; 1HSQ A; 4EMK B; 3M5A A; 4F7U A; 4NL3 A; 2EVR A; 5GAO m; 1KG1 A; 2DTI A; 2XMF A; 3ASK A; 3QJY A; 5EC7 A; 2PTK A; 4ZGE B; 2E65 A; 2E4H A; 3D7S B; 3JCM g; 4PFO A; 2KNB B; 5LJ5 h; 2PQW A; 2BZ8 A; 2M9U A; 1NYF A; 3JRZ A; 4J9E A; 2JT4 A; 3ZEH A; 2EYW A; 1VQK A; 2NYS A; 3G4S Q; 1M1K R; 1I0C A; 3M56 A; 2LVM A; 3OQ5 A; 1T0H A; 2K3Y A; 1QQJ A; 1DJ7 B; 2I0N A; 4OVA A; 3CCM T; 3RDV A; 4IUR A; 4C8Q A; 3KXT A; 4FSX A; 5IXF A; 2VV5 A; 1YNZ A; 3URG A; 5A2Q E; 5CQY A; 2F1L A; 3OW2 S; 1VQO Q; 3E1S A; 2O9V A; 4OGE A; 2Y90 A; 3H0I A; 2E41 A; 4ZGD B; 2FHD A; 2DL4 A; 4Y91 A; 2LMJ A; 2EYX A; 2HQH A; 5GAN d; 2EFI A; 1D3B A; 1W70 A; 3JCM e; 3JCM d; 1YHQ A; 3KFV A; 4WF2 A; 2ZGW A; 3VU3 C; 1W2B A; 2FG0 A; 3EFR A; 2B86 A; 2F5K A; 2E70 A; 3CXC A; 2D6F A; 3I5S A; 3GBQ A; 4Z88 A; 1T0J A; 2CZ1 B; 2MF2 A; 1Q95 G; 2X4W A; 4N4I A; 1VQ5 A; 2KEA A; 3CC2 A; 2CSQ A; 5GJW B; 1GFC A; 1E7O A; 4KUD K; 2L3Q A; 1QKW A; 3L2U A; 1W2B P; 1D0Y A; 2QA4 Q; 4CI0 C; 2LRQ A; 2EGC A; 2RK1 A; 3CXC P; 1OX9 A; 1NJI U; 4V2S A; 1N8R R; 2M0Y A; 2CGH A; 2AZV A; 2ED1 A; 2QTX A; 1TG0 A; 4M77 G; 1RI0 A; 1T3S A; 2C0T A; 4EPC A; 2P4R A; 4ZNX A; 3SDZ A; 1NPR A; 2HNI A; 5GMK i; 3CC7 T; 3I56 T; 1QMC A; 2DZC A; 3CBP A; 4E47 A; 1Q82 R; 3QZ5 B; 1VIE A; 2D0N A; 3PT9 A; 1WJS A; 1OOT A; 5A0L A; 3CMA T; 4II1 A; 1TXQ A; 3NFC A; 1UGV A; 2CRE A; 4XTU A; 1KD1 U; 4KBM B; 5CKB A; 1RAA B; 2KT1 A; 2IVW A; 4OMP A; 3EGX B; 3RMS A; 2EJF A; 3UT1 A; 2KY9 A; 5GAN 8; 1N8R U; 2C0I A; 4XTW A; 4ZTF A; 1BIA A; 4EMG A; 2JMC A; 3J81 E; 4ATO A; 2K5I A; 1JEG A; 1IHV A; 3FJP A; 4C8Q E; 3LLR A; 3CCJ Q; 4GLK A; 3VS4 A; 3CBO A; 4KGX B; 1JBM A; 1BI0 A; 1M90 R; 2GQV A; 1UEC A; 1VQN A; 2O2O A; 1OYX A; 2O01 E; 4M75 D; 1Q82 U; 4IUU A; 2EGA A; 2J05 A; 3FDR A; 3QWX X; 2DO3 A; 2K79 A; 3VS1 A; 1B34 A; 4M7D D; 4F7U B; 4JPB W; 3VKI A; 5KYX B; 2CP5 A; 2X4X A; 2DEU A; 1RAD B; 1WXB A; 1X43 A; 2JUF A; 4ORZ A; 4L5G A; 1YJ9 A; 4C0D B; 2DMO A; 1UFF A; 1I07 A; 4PKC C; 3TEE A; 2K5L A; 1VQ8 A; 4A4F A; 1G3W A; 1WFW A; 3HRS A; 2ED0 A; 2BKD N; 4MML A; 1D1A A; 2COW A; 5FU6 B; 2LT4 A; 3M59 A; 2RA2 A; 1OX8 A; 1WX6 A; 1W4S A; 2CT4 A; 2KQW A; 2OAW A; 2FO0 A; 2GFA A; 4M75 C; 4C8Q B; 2EKH A; 4BI3 A; 1UUE A; 4N4H A; 2EJG A; 1WHG A; 4JLG A; 2V26 A; 1YFN A; 4PJO A; 3JCM c; 1X6O A; 1GL5 A; 1YCS B; 3T9N A; 4XU0 A; 4WTO B; 2DTH A; 3OB9 A; 2DVE A; 4HVW A; 1YIJ T; 3CCM Q; 2VGM A; 3V7C A; 4AFQ C; 2GQI A; 2JMA A; 2KT8 A; 1TTH B; 3LGL A; 5KE3 A; 1K9M C; 3JCM W; 1D0X A; 4D8D A; 4CC3 A; 1GCP A; 2MOX A; 1YIT A; 5D7U A; 1OV3 A; 4C5G A; 5LJ3 d; 3CD6 A; 4D8K A; 4J7F A; 3TSW A; 4Z89 A; 2RQR A; 2RJF A; 2NUT A; 1QP2 A; 4B9X A; 4JZ3 A; 1YHQ T; 1JJ2 S; 4QQG A; 1SSF A; 3QKJ A; 3SEM A; 2DAQ A; 1ARK A; 2JXB A; 1FXX A; 3BW1 A; 3EHQ A; 1X2Q A; 3N5B B; 2NUZ A; 3WXM B; 1D0Z A; 1QP3 A; 3L2R A; 2DM1 A; 1VQM A; 1Q7Y U; 3TU4 K; 1K73 R; 1PD0 A; 1KC8 C; 5IXB A; 4EMK C; 3OA6 A; 4M78 A; 5GAN f; 1VQ5 T; 1U1S A; 2DPP B; 3R6O A; 3A1P A; 3CC2 T; 2KXD A; 3JCM f; 3M58 A; 2DET A; 3LYI A; 1KIK A; 3M9Q A; 4FW2 A; 4KGV B; 1BI3 A; 2FL7 A; 4N0A A; 4FYX B; 2DNU A; 2JTF A; 5GAO p; 4OMO A; 2L3S A; 4OB3 B; 1YJW A; 1KHC A; 3JAM E; 1N5Z A; 1S72 Q; 4VUB A; 4KH0 B; 2HQE A; 2ZAE A; 2K5F A; 1QVF A; 4FSS A; 4HVU A; 4PJM A; 2MWP A; 3X24 B; 4J9F A; 4R56 A; 3GIB A; 3CCU T; 1JRI A; 1IO6 A; 3E2U A; 2KAF A; 2HKN A; 4KH1 B; 3G6E A; 1M9S A; 4AFS C; 2W10 A; 4FT4 A; 3THK A; 1WPY A; 1AT1 B; 4KRT A; 1IRE B; 4PJO E; 3CPW P; 2R57 A; 5HK0 A; 2P0Q A; 3HFN A; 4OB2 B; 1SHG A; 5FW9 A; 4XAX B; 3M0S A; 2OTJ Q; 2A7Y A; 2EYY A; 2LX9 A; 5I21 A; 2QEX A; 4DA4 A; 5ECA A; 5DLQ E; 1WZO A; 1VQ6 A; 2V1Q A; 1VQN T; 1TUC A; 3I55 A; 5GAN 7; 1ABQ A; 3LH5 A; 1SHF A; 2JVV A; 3JB9 I; 1I81 A; 2X4Y A; 4DOV A; 1SPK A; 1KQS A; 3NHN A; 5CQX A; 1NE8 A; 1K8A U; 3PTA A; 1AZG B; 5GAN 6; 1YJ9 T; 2V8I A; 2K7A A; 2GGR A; 4J6W A; 3VYH B; 1Z9Q A; 3PE0 A; 1VQ8 T; 4M75 F; 3V8J A; 3CCE A; 4JRQ A; 1MMA A; 2M1H A; 4BI8 B; 2RD1 A; 1M8M A; 4QQ6 A; 3HL8 A; 1Y71 A; 2CUD A; 3OYA A; 2IG0 A; 3BY7 A; 4XU2 A; 4GBQ A; 4PJO B; 7AT1 B; 2QQR A; 2D1X A; 1VQP A; 2K4Y A; 1KQS P; 4RMO A; 3RMQ A; 1R0C B; 1FMV A; 2DJQ A; 2E3H A; 1HD3 A; 5FRO A; 2RQT A; 1H3Z A; 1H8K A; 2XID A; 4A63 B; 1VQK Q; 1AZE A; 2VYT A; 3V8K A; 2DIQ A; 1X6G A; 1ABO A; 4XU3 A; 1VQ9 A; 1WXU A; 2NUT B; 2SRC A; 1M3A A; 1TH7 A; 3FRN A; 2EQI A; 1Q81 U; 4RCB A; 4XTZ A; 3A5Z B; 1YIT T; 4C8Q D; 2B8A A; 3VRZ A; 3OYY A; 4JJD A; 3DB3 A; 3P8H A; 2ATC B; 3INZ A; 3M4Y A; 3C95 A; 3E9G A; 3FLG A; 1YHQ Q; 4P5N A; 1OU9 A; 5EG2 A; 1WJQ A; 2ZZD A; 4C0D C; 4JRK A; 3UAT A; 2CP6 A; 2DTO A; 4CRI A; 2AT1 B; 4JRI A; 1M3C A; 1VIF A; 3EH2 A; 5LJ3 f; 2QA4 T; 3VRY A; 1VQM T; 4JZ4 A; 5FU6 C; 4BY6 B; 4PNO A; 4LUD A; 1U5S A; 2NWM A; 1VQ5 Q; 3EGD A; 2FPF A; 3CQT A; 3CC2 Q; 3JCM P; 4HXJ A; 2QK0 A; 2E6N A; 1OI1 A; 4C8Q C; 2HQX A; 1WGS A; 3S3O A; 2M51 A; 4OMQ A; 2HMA A; 3VS5 A; 1SKU B; 3OYI A; 5CR2 A; 4M77 E; 4XTX A; 3WVD B; 1UHC A; 5HY6 A; 5CKD A; 2EAY A; 1ZLM A; 4QVC A; 2AHJ B; 4LN2 A; 3CCL A; 4DBQ A; 5KYU A; 1G8X A; 4KGZ B; 2DL5 A; 2BIV A; 5KH6 A; 2EJ9 A; 4O6J A; 1RAI B; 4M7A A; 2CYZ B; 4RTX A; 3CCJ T; 1LVK A; 3RNJ A; 2ECZ A; 4DBH A; 3OSS C; 4ELY C; 3PNW C; 2KMT A; 3GLX A; 1M8V A; 1R0B G; 3HFO A; 3SWN A; 1UGQ B; 4OP0 A; 2QEX T; 2FPD A; 1ZX6 A; 5CIU A; 1KJW A; 1QLY A; 2YXY A; 1KHI A; 4EDU A; 4M77 B; 3VS6 A; 1FYN A; 1VQN Q; 4LDV A; 2QI2 A; 2DFU A; 4C0F A; 2DL7 A; 3JB9 G; 2KVQ G; 3LGF A; 3E19 A; 2PNI A; 2RHU A; 1YI2 A; 3QYG B; 1XTD A; 1N9R A; 1WLP B; 2KBT A; 1O75 A; 4LE9 A; 3JV3 A; 2L0A A; 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