2KHPA

Solution structure of glutaredoxin from brucella melitensis
Total Genus 19
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
19
sequence length
92
structure length
92
Chain Sequence
GPGSMVDVIIYTRPGCPYCARAKALLARKGAEFNEIDASATPELRAEMQERSGRNTFPQIFIGSVHVGGCDDLYALEDEGKLDSLLKTGKLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Comparative analysis of glutaredoxin domains from bacterial opportunistic pathogens.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAREDOXIN
molecule tags Electron transport
source organism Brucella melitensis
total genus 19
structure length 92
sequence length 92
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2khpA00
3D22A 1TRVA 3HDCA 2R4VA 4XS6A 4IGJA 3P8WA 4X0XA 4PX1A 3VPQA 1JLWA 3W8JA 4F0BA 2DJKA 4X1UA 3TRPA 2B1LA 3EE2A 2GQMA 2XBQA 2VIMA 1TRSA 3H1NA 2HSYA 3LG6A 1IYHA 4N10A 1YQ1A 2H6XA 4POBA 6GSXA 3IXRA 4BPYA 1AW9A 4EE0A 3GSTA 1EEJA 1GNEA 5DJMA 4I5QA 2LSTA 4IJ3A 4V2LA 1B9YC 3BOAA 1AQXA 2VLTA 5DALA 1UA5A 1GUMA 3IA1A 3ZZXA 3VLNA 3L9SA 3QMXA 5IOXA 2HLSA 1M2BA 2PVQA 2AYTA 3VK9A 1YEPA 5CAXA 5CRHA 5ID2B 3LSZA 3ERFA 4YAPA 3U6VA 1PSQA 2H70A 4WR5A 2DC5A 3ERGA 3PR8A 3O6TA 4KW6A 1TI3A 3O76A 5J5NA 4L0WA 1U87A 2PGTA 5IPGA 2ZCTA 1BAYA 5B8BA 1S3DA 3G7IA 3NOFA 5D9XA 4YAVA 1OVNA 2GQLA 1VF2A 2H30A 1GLPA 3F4TA 5FT3A 3I69A 1ILOA 5IOWA 4IHUA 2Z9SA 4L8EA 4GSTA 1RK4A 2FUG2 3GTUA 2OE1A 4D73B 2H8LA 3I43A 1A2MA 2GZYA 1TRWA 3KM6A 4V1Ag 2L4QA 5ECNB 1WMJA 3GL3A 3M1GA 5AIVA 1W89A 3ZMKA 3GX8A 1PGTA 4POMA 5IMFA 4DSSB 4NHZA 4TR0A 4LA1A 17GSA 3WT1A 3VPTA 2WRTA 4G9HA 5GAND 1ZMAA 2I81A 3BBYA 1PMTA 2PUKC 2C3QA 3EINA 2K18A 2VOCA 2FCHA 2DIZA 1QQ2A 5JWQB 1T1VA 2VLVA 4HZ4A 2I4AA 1XVWA 3J7Yk 2LQOA 1N8JA 4MPFA 2JSZA 2VUPA 4I97A 6GSTA 1TDIA 3GH6A 3A3TA 4HEA2 3IBHA 3TKRA 5CRGA 4J56E 2OE0A 1EWXA 4V2NA 5J41A 5HR1A 5F05A 3GNJA 4JU5A 4DVCA 4O32A 1SJIA 2VCVA 2YWOA 5ECOB 2RIIA 4DEJA 1FHEA 2GSTA 4GRFA 4OCFA 3PH9A 2CVDA 1PD21 2H0HA 1CQGA 4FH8A 1X9WB 3FR6A 4E8EA 2B7JA 3CYNA 5CP1A 1WPIA 3US3A 4MABA 1BYEA 1EV4A 2BTOT 1I9DA 4I2UA 4G10A 2YJ7A 1MDJA 3F3QA 4PNGA 1MTCA 1PRXA 1F3BA 2MMZA 2N5FA 22GSA 4MJAA 2IL3A 4JZQA 4GXZA 4JRRA 1GUHA 2YV9A 4AGSA 1MDKA 1V58A 1WWJA 2NPBA 3KXOA 2LEGA 1A0FA 2MZCA 4WF5A 5ECMB 5JWOB 3HA9A 2CVBA 2H6ZA 1YF0A 1FB0A 1QMVA 4LMVA 3CSIA 3KD0A 3M0FA 5G5FA 4F0CA 3UJ1A 4DSRA 1GSYA 4BL7A 4O7HA 1K3LA 5HR3A 1PX6A 1UC7A 5DAKB 3H93A 3BCIA 2LJAA 2DJ3A 2AB6A 3E0UA 3DGQA 3E3EA 4GCIA 2C3TA 3LEFA 1SL2B 3OR5A 3HVXA 4MZWA 5D93A 1AIUA 1GTAA 3GFKA 2R3XA 5CRWA 1GTIA 5L71A 2IMKA 4NPBA 5COHA 3TB2A 2CX4A 4MF7A 1PL2A 2CAQA 4Z7XA 2LJRA 1B9XC 6GSUA 2L4CA 19GSA 4GWRA 3GX0A 3BJ5A 1U3IA 1M2AA 4KB3A 1U3AA 2H76A 1FVKA 3A2WA 3ERWA 1NHYA 4RQRA 4QL7A 3F8UA 4WBJA 4D73A 3VFIA 4OFMA 1C72A 4HUAA 2B6MA 2REMA 1GULA 2CV4A 5H5RA 1SYXA 2TRCP 4HJ2A 1F2EA 2LNTA 1PKWA 3MSZA 4PGTA 1HD2A 2H1BA 5ECKB 3KTBA 2IPAA 4OFTA 4KCEA 2N5BA 1PN9A 1WIKA 5KN1A 3IHQA 2LRCA 3F0IA 2WJUA 4MZCA 5EPFA 2B5YA 4KCAA 3TJGA 5ELAA 1UVZA 2NDOA 5IMAA 5E59A 1A2LA 1X9MB 4KGIA 4CHSA 2XPDA 2ZNMA 1J08A 2IJYA 1FAAA 2K6VA 1XOAA 1K0NA 1G0TA 1R7HA 4WKWA 4GTUA 1ON4A 2C0DA 1YKCA 2FWEA 3FZ9A 4N0VA 5CNWA 13GSA 5JWRB 1KBNA 1ZZYA 2HZFA 3KZQA 2EIOA 3QFAC 1R4WA 2C3NA 4ZB8A 3UARA 12GSA 4KDYA 5J3RA 3W6GA 3HVSA 3C1SA 1J9BA 2KHPA 4G2EA 1SD8A 2F3MA 3P7XA 5G1LA 4JE1A 2JL4A 1SKSB 4L5OA 2OADA 2V32A 3TDGA 4K0GA 1USBA 4TR1B 3ZFBA 5DVBA 3FR9A 1SJZA 2H66A 4KDUA 1V40A 1IYIA 1EGRA 2E2MA 5D9WA 1OKDA 3HZ8A 3N5OA 4DSQA 1OC8A 3F3RA 2PU9C 2K9FA 1FVJA 5EVOA 2L6DA 1B4PA 1PKZA 2FWFA 3IDVA 3TJJA 1ERWA 3M9JA 1GSUA 3HVVA 3UBLA 3ZITA 4JEDA 4N11A 5B8AA 4ACSA 3FHKA 1G6WA 4PQHA 5ECRB 4XRAA 2H01A 1O7UA 4MPGA 2GSRA 2IMIA 6GSWA 5IMZA 3KIJA 3ZMLA 2CVKA 4LL1B 3VURA 2AHEA 4BVYA 1TRUA 4QQ7A 4TKYA 1EZKA 2V1MA 4OCEA 2GDRA 4GF0A 4XS4B 5C04A 2AJQB 3A2XA 4XCSA 1A2JA 2FD3A 4K8MA 5GZZB 3G7YA 3VI7A 4MK3A 1DBYA 3DKSA 1MD4A 5G2ZA 2DJ2A 3MWHA 1GTUA 5F8BA 3ZFLA 1F37A 4EUYA 3LORA 3GMFA 5F06A 2HXKA 1O73A 1F6MC 1GSDA 3DRNA 5AN1A 3IR4A 4K2DA 2QC7A 2HNLA 3VI5A 1GSQA 1Z6NA 2V6KA 2YV7A 1ZL9A 4V2MA 3DIEA 4QL9A 3L0HA 2VLUA 3QCPA 2VCWA 2KOKA 1EGOA 5DCGA 3PGTA 4HU9A 2CZ2A 4MJBA 2CA8A 3FZ5A 4MA9A 4OFNA 1JZDA 1NSWA 3FRCA 3I6AA 2YCDA 2G2QA 3KH7A 5GSTA 2MMOA 1R5PA 2WGRA 3L9UA 1TK0B 1XZOA 2L57A 4AF2A 2GTUA 4O5RA 1M9BA 2R2JA 1V57A 4KDXA 3ZL5A 2LRNA 4X43A 2H73A 3GH9A 3BCKA 2MMNA 2GGTA 3CMIA 2IFQB 1ML6A 1EP8A 3LWAA 4ILFA 2BJXA 1XFLA 2PPTA 2GSSA 2F8FA 3L9VA 4AJ7A 1EOGA 5ECQB 2ON5A 3P2AA 1K3OA 2P5QA 1VF3A 4TVEA 3A5WA 5ECSA 2IIYA 3CTFA 1JLVA 4L5LA 3APQA 2V6OA 4MF6A 3FKFA 4ZB6A 4NWYA 1R26A 2QKEA 1TI1A 4J57E 4HDEA 2V41A 2HT9A 1TKDB 1OC9B 3HKRA 1X5EA 3EVIA 2GQKA 3IOSA 2AUVA 4ZIJA 4ECCA 2F9SA 2OE3A 3WGDA 1K0DA 2H1AA 5CREA 2N5AA 5EL8A 2LQQA 5IM9A 2F51A 2KUCA 5FHIA 2RUFA 4XRDA 1A8LA 1H75A 2I1UA 4KA0A 1X9SB 2BMXA 1G7OA 3HY2A 4YH2A 2GT6A 2LTKA 3VWUA 3RHCA 3D0ZA 4NXIA 3WGXA 4MP4A 1NW2A 3EU3A 3HJPA 3IE3A 4PUFC 2DIYA 3LXTA 5AIXA 2QSIA 2FA8A 2L5OA 1HQOA 5ELGA 4ZBBA 3PINA 3M3MA 1HNAA 1WOUA 3AY8A 5HFKA 1XWCA 2B3SA 1DE1A 3G9BA 5IQYA 5AISA 1BX9A 1CQHA 3LJRA 4GSSA 1K0BA 4KNDA 4IP1A 2YPMA 4CW9A 4N0ZA 4CDOA 3C8EA 4ZL7A 4TR3A 2VAFA 1PQNA 4F03A 3ED3A 3HXSA 4IKHA 2FA4A 2XC2A 3KH9A 2X8GA 5ABRA 4LL4B 3O3TA 1WRYA 3UEMA 1EP7A 4TXOB 4NAXA 3RPPA 2M46A 2VM2A 1AXDA 2K8VA 1JZOA 4MCUA 2LS5A 2GZZA 2ON7A 2FY6A 5ECIB 3ISOA 5A4WA 2JU5A 3APOA 3HZ4A 4RUVA 4ZBAA 3CRTA 1N2AA 1GSEA 5ID2A 3TGZA 5FWGA 2HZEB 2E2GA 1XBSA 4ZL8A 1Q4JA 3VWXA 3UVHA 2GT5A 3GUSA 3SWLA 4TRXA 10GSA 1HNBA 4POLA 3IK7A 4EO3A 4IQ1A 1XIYA 2TIRA 3FY7A 4F82A 4LLRA 5B6NA 1KNGA 2O85A 4IELA 3CTGA 2DBCA 4BWSA 3TRQA 3IRAA 1MEKA 14GSA 2C0FA 1OE7A 3J7Yb 1B4QA 1DE2A 1FG4A 3I9V2 1BEDA 2H1GA 3KCMA 1YF1A 2C1YA 1JZRA 3K8NA 3ZIVA 2DJ1A 4DSSA 1URMA 1U88A 4FYCA 3CSJA 3GIXA 4POKA 4H86A 5J9BA 1Q98A 5F07A 2R6KA 3EYTA 1WP0A 1FOVA 4KUNA 3H8QA 1ST9A 4ZB9A 1G6YA 1Z7RA 4ML6A 2YNXA 3ME8A 4HJMA 4Q5NA 5CRDA 3IV4A 2P5RA 1Z6MA 5F0GA 3IC4A 4EDZA 4XTSA 3LXZA 1FW1A 3DXBA 4ZILA 3C7MA 1WJKA 2OA7A 4IVFA 1MD3A 3UL3A 3TJKA 1O8WA 1HYUA 1X5CA 1TW9A 1OKTA 2O8VB 3ZVJD 3TKSE 1F9MA 2NVLA 3C1RA 3TKSC 4BVXA 2VD0A 3EMPA 4ZXGA 2IMEA 1YZXA 1U6TA 4GQFA 2ZUPA 4MF5A 4GQCA 1AUCA 4I2TA 1G7EA 1HNCA 2H1DA 3SBCA 1YDKA 3GKNA 5IO2A 4MH2A 4K7IA 1NM3A 1QFNA 2CT6A 5LNKe 4PQ1A 3GURA 1XW5A 16GSA 1ABAA 3FK8A 4RQXA 4PQIA 2EIQA 3U5RE 2I9HA 3FR3A 1XVQA 2GLRA 5A4UA 2YZHA 4ZL9A 3GTUB 2JZRA 5GAPD 2OACA 4OWYA 3DMLA 3IAM2 1GSSA 5DAKA 2F8AA 2XBIA 2WS2A 1JFUA 3GA4A 7GSSA 4EC0A 3HJOA 3IAS2 3UBKA 1VGLA 1GRXA 2M72A 5IO0A 2C4JA 3F6FA 4TW5A 2LJKA 2E0QA 3D4MA 3GKKA 1M9AA 1VF1A 2DJJA 4TXOA 2WFCA 3GSSA 4WXTA 1ERVA 3WT2A 4RI6A 2JADA 1QUWA 4NV2A 2AAWA 4K1FA 2HFDA 2PN8A 3Q74A 3D21A 3DVXA 3Q6OA 2CX3A 3FZAA 2WZ9A 2OBKA 2JZTA 2LUSA 2FLSA 1AAZA 3WGEA 2WCIA 2H6YA 2IWTA 2RM5A 2VL2A 2A2SA 3FYGA 3HCZA 4HI7A 1PA3A 4ECJA 1R5AA 5G31A 4TN8A 2EC4A 1O6JA 2VO4A 3ZRDA 4ID0A 1SJ6A 5ECPB 2CQ9A 5EY6A 2MBTA 2C0EA 2O7KA 2RUEA 4XS1A 3ME7A 2XHFA 1YEXA 4MZBA 2YOIA 3TJBA 2HSHA 3F4RA 2WULA 2VL2C 1W4VA 4P3YB 1T3BA 1TU7A 5D9TA 3V1WA 1T8EB 2ES7A 2KLXA 4MLYA 2C8UA 4NMUA 4YQUA 6GSYA 2EIRA 3CXGA 3C71A 3E9JB 5LD0A 4E8HA 1SL0B 1UN2A 3KMNA 3C73A 4OD7A 1QXHA 1GSFA 4F9ZA 2OKAA 2HE3A 2A4VA 3FEUA 4LMWA 1LU4A 1SENA 5ECLB 2MYGA 5JCGA 3ZVJA 1GH2A 4KE3A 4EXJA 4EF0A 3RBTA 2IMFA 3IPZA 4FYBA 5JCWA 5HFGA 3GL5A 1O85A 1TK8B 4GLTA 3P90A 2YN1A 4JR6A 4OO4A 2A2RA 2VCQA 5KEJA 5JCUA 3LYKA 5CYYA 1ZYEA 1K0AA 3D5JA 2G0FA 1DUGA 2H19A 3N9JA 2MMAA 1BQ7A 4NHWA 4IN0A 5D73A 2JACA 1XOBA 5DJLA 2C80A 1NHOA 1PL1A 2VCXA 2K8SA 2P0GA 3QOUA 1T00A 2HRNA 3M8NA 1SL1B 2L6CA 1WE0A 2KP2A 3F63A 1FO5A 1QGVA 1SD9A 2GVPA 20GSA 5H5SA 4NV5A 3GKXA 2C0GA 3GYKA 1THXA 1TTZA 1TJDA 4KAEA 4PUAA 3WYWA 3KP9A 2M80A 4WBRD 2OBIA 2H75A 4HU7A 3JCML 3DD3A 3TJFA 3F6DA 3H79A 5H5QA 5A4VA 6GSVA 3DEXA 4J2FA 3HJMA 4TR1A 4BA7A 1S3AA 1M99A 4WEYA 1B48A 2DLXA 2YP6A 4L0UA 5INYA 1GLQA 3KJYA 2VCZA 4Q5FA 4HOJA 2VL3A 1QK8A 3TKPA 2MBSA 3RHBA 4IJIA 3QPMA 5A5KA 1YJ6A 3EMXA 1XXUA 4AJ6A 3NZNA 1SK0A 3F4SA 3ZIJA 2I3YA 1K3YA 2FWGA 4PXOA 5J4UA 1O81A 3W8SA 1K0MA 3CBUA 4K7OA 1S3CA 3R2QA 1K0CA 3LFLA 1SK2A 4GSNA 2X8CA 3L78A 1ERUA 4WR4A 2PBJA 2R5GA 4V1Ap 2L59A 2WB9A 2J23A 2IN3A 1RW1A 2DSAA 2YANA 1LJRA 4ISDA 4RI7A 4HZ2A 1ZCPA 1X5DA 1AQVA 4XIHA 1A8YA 1GNWA 1M0UA 1XWGA 4FIWA 1GWCA 1OC3A 3TOUA 2YWIA 3ZYWA 2YJHA 3KEBA 3CSHA 1V2AA 1KTEA 1Z5YE 4IS0A 1TXXA 4XS4A 5IMDA 4PNFA 1KEBA 4I8BA 5DCHA 5AGYA 4K0NA 3QFBC 3G7JA 4ZBDA 3GRXA 3KP8A 2X99A 4EKZA 2YWMA 1EV9A 3QD9A 3HD5A 3VWWA 5ENUA 2GS3A 4EDYA 5D9VA 4EL1A 1THOA 4O92A 3UMAA 2HI7A 3APSA 5B6MA 1O8XA 1OAZA 1EEMA 3KTLA 3TCOA 2VD1A 2B5EA 3QAGA 4YQMA 3TOTA 2LRTA 2B1KA 2H74A 2YZUA 2PVOC 2GSQA 1Z9HA 4K9ZA 1ZYQB 3EU4A 5B7CA 2PERA 2JSYA 2DMMA 1XW9A 1RQMA 4HQZA 3GHAA 1VRSD 1Y6EA 1XWBA 1V98A 4PURA 2PMTA 4TXVA 1X0RA 5HFIA 3TRXA 3LQ7A 3LGCA 4I6XA 3GV1A 4ML1A 1SU9A 2FNOA 3S9FA 2RM6A 4ECBA 2R37A 3RAZA 4K6XA 1TOFA 2PWJA 4WETA 1GL8A 5IMCA 1EOHA 4MH3A 2FGXA 1E6BA 5C00A 1ZOFA 2XPEA 1K0OA 3UAPA 4IBPA 3UIWA 3ZREA 2O87A 3TKQA 4Q5QA 3LYPA 4F2IA 1XWKA 4TOPA 1AC1A 2X64A 1H4OA 5J9CA 3F9UA 1XPVA 4WF4A 3EWLA 2IFQA 4MMMA 4KX4A 1M2DA 1SKWB 4YQVA 1B8XA 4FYUA 3WD6A 5CO3A 3IK9A 2J9HA 3GN3A 2V2GA 9GSSA 2WDUA 2JZSA 1A24A 1A0RP 3GKMA 2NBSA 2DJ0A 6GSSA 2IMDA 1TP9A 5IPHA 3DVWA 2DMLA 2B5XA 1PX7A 4K7NA 5G30A 1YKAA 2TRXA 1T4ZA 1GTBA 1F3AA 4KH7A 2E7PA 1OC9A 3TKSA 3EC3A 1BJXA 1SK1A 5IMVA 2RLIA 4HQSA 1M7TA 3MNGA 4ECIA 5D8IA 2LKUA 1XCCA 3CRUA 4MDCA 5DALB 1SYRA 5DBQA 4FO5A 3L4NA 1Z3EA 5IIZA 3HYPA 5HR0A 4G19A 2GZPA 2LNSA 2D2ZA 3QDNA 4XHMA 5DDLA 4IQAA 5G1KA 2H0IA 2B7KA 1MDIA 11GSA 2KP1A 1ZGNA 4HS1A 2YWNA 3MAKA 1GUKA 5KN2A 2O89A 2VCTA 4TR4A 1LBKA 2AV4A 5GSSA 3FW2A 4MJEA 2LV3A 2ALBA 3QR6A 2X8HA 3MDKA 5D96A 2H0GA 4OMVA 3ZTLA 3KGKA 1I5GA 3FZ4A 3DWVA 5DQSA 2FWHA 1TU8A 1OE8A 3ZLPA 2H71A 4EVMA 4JR4A 4ULXA 5ECHB 1J0FA 2VM1A 1Y25A 5E4WA 4MJCA 2FHEA 3RDWA 1VF4A 3UVTA 1BG5A 3M9KA 5HR2A 3VWVA 3QAVA 1JZWA 4JBBA 1AQWA 3UOMA 3QAWA 1E2YA 2HRFA 1OYJA 1V9WA 2HZEA 1FB6A 1ERTA 3BD2A 4KSOA 1Z7PA 3Q18A 8GSSA 4N30A 2L5LA 4KSMA 3Q19A 3D4TA 18GSA 3RPNA 2HYXA 1XWAA 3NIVA 3TUEA 1YY7A 5KN0A 3KMOA 2NTOA 2CZ3A 3D6IA 1ACVA 1T7PB 1XW6A 1DSBA 4OO5A 2OJLA 4AJ8A 3A2VA 2VL9A 4IW9A 5HQPA 2H72A 5DQYA 1GP1A 3HHVA 4BWQA 3H4KA 1JHBA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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