2KOKA

Solution structure of an arsenate reductase (arsc) related protein from brucella melitensis. seattle structural genomics center for infectious disease target braba.00007.a.
Total Genus 25
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
25
sequence length
120
structure length
120
Chain Sequence
b'GPGSMSVTIYGIKNCDTMKKARIWLEDHGIDYTFHDYKKEGLDAETLDRFLKTVPWEQLLNRAGTTFRKLPEDVRSNVDAASARELMLAQPSMVKRPVLERDGKLMVGFKPAQYEAYFKL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution structure of an arsenate reductase-related protein, YffB, from Brucella melitensis, the etiological agent responsible for brucellosis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords arsenate reductase
source organism Brucella abortus
molecule tags Oxidoreductase
total genus 25
structure length 120
sequence length 120
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03960 ArsC ArsC family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2kokA00
5J9CA 1NW2A 2YWOA 3U6VA 3PGTA 2XC2A 4N0VA 2GSSA 4ZL9A 1B4PA 2H6ZA 3QCPA 2TIRA 1U88A 5EY6A 4GLTA 1XFLA 4NMUA 3LYKA 2HRFA 4POMA 5DVBA 1QGVA 1GULA 4LA1A 4EXJA 2V6KA 2NDOA 3J7Yk 3GURA 2O89A 2V2GA 2M46A 2WZ9A 4KW6A 2VM2A 1VGLA 2F9SA 1SD9A 2GT5A 4QL9A 4ISDA 1K3OA 2OA7A 2HT9A 4MF7A 1ERVA 3HXSA 2E0QA 3L9SA 2DC5A 2NPBA 4IBPA 4K0NA 5JWOB 3F9UA 2VD1A 1WE0A 2CT6A 1ZGNA 2IFQA 4L0UA 3P8WA 5ECKB 2IMEA 4KCEA 1BG5A 4PQHA 2P5RA 1E6BA 3ZFLA 2HZEB 1AQWA 2RM5A 1A2LA 3UBKA 5COHA 3WT1A 5AN1A 3M9JA 1XVWA 3VWWA 1HYUA 1GTAA 3W6GA 2B7KA 3CRUA 5A5KA 3KZQA 3A2VA 3H93A 1WIKA 5IPHA 3VWXA 2I9HA 2A2RA 2OADA 1PL2A 1Z6NA 1VF1A 2OACA 3CYNA 1YF1A 3LORA 3GRXA 2MZCA 2L5OA 1ML6A 4HEA2 5CYYA 4TR1A 2F8FA 4G10A 4XRAA 3UVHA 1FG4A 2X99A 1JZRA 2P31A 3BBYA 1UVZA 5IMCA 2PBJA 3J7Yb 1ABAA 2YN1A 2YWNA 2KUCA 1LBKA 5AGYA 5C00A 1OVNA 3DKSA 1BEDA 1BQ7A 1SYRA 4XHMA 5DALB 5CRDA 5ECQB 1K0OA 2GGTA 5IMFA 1TRSA 3IOSA 4HS1A 4IN0A 3ED3A 3TJKA 5ECOB 5DQSA 1SYXA 2EIRA 2OE0A 1R7HA 1Z7RA 5D9TA 1U87A 5E59A 3AY8A 3HHVA 3DWVA 4PQ1A 3EC3A 4WF5A 1GTIA 4MABA 2P5QA 2V6OA 2KP1A 2CZ2A 2LQOA 4WBRD 1XWKA 5IIZA 2HFDA 4RQXA 4ILFA 5HR1A 1A8YA 5CAXA 3O76A 2DBCA 4TXOB 5B6NA 2AV4A 2ZCTA 5DDLA 5IPGA 4ZL7A 1URMA 5CRGA 1XOBA 1OAZA 4I6XA 4FYCA 2YNXA 1HD2A 1YDKA 1YF0A 4F2IA 4K7OA 3FZ4A 1E2YA 1DBYA 3APOA 1TK0B 2IMKA 1EOHA 1YKCA 2YZHA 1CQGA 1T4YA 4GSNA 3IAS2 1IYHA 1XPVA 1JLVA 4KSOA 1GLPA 2R5GA 5CP1A 1OE8A 2R37A 4EE0A 2HNLA 5ECLB 2H8LA 1SK1A 1OKTA 3P7XA 4JU5A 4CDOA 1EGOA 3DEXA 4GXZA 4PNGA 2HYXA 1GNWA 1Q4JA 3DXBA 3TRXA 2PN8A 2H1GA 1S3CA 1O8WA 2YZUA 2FCHA 4HI7A 1SL2B 1OC9B 2BJXA 1K3YA 1YKAA 3HVVA 2WFCA 2CV4A 4MZBA 3GKXA 1MDIA 3DVWA 1YEPA 2IL3A 4GCIA 5ECRB 5FT3A 2RIIA 3VPQA 4YQUA 4RUVA 1GLQA 1EGRA 1R5PA 1WRYA 2I4AA 5GSSA 4HJ2A 1ERUA 2R6KA 1AQVA 1RQMA 1O7UA 2VAFA 2FGXA 2REMA 3GUSA 2ON7A 3DGQA 2LRNA 4MPFA 2AHEA 2C8UA 1FVKA 2DLXA 4IP1A 2ES7A 1SL0B 4LL4B 5G30A 2B7JA 1T1VA 3FHKA 4GF0A 1JZOA 2I3YA 5HQPA 1GNEA 5IOXA 4XRDA 1JHBA 4V2LA 2FNOA 4YAPA 1X9SB 1YZXA 4OFMA 3HJPA 2BTOT 1HQOA 3ZREA 3ZVJA 5KN3A 4Q5RA 3IV4A 2GLRA 2PVOC 2MMNA 1MEKA 1GRXA 3DVXA 4E8HA 3P90A 1UA5A 2V1MA 3IR4A 1U3AA 3LSZA 3VWUA 1NSWA 5HFGA 1EEMA 4V2MA 5IM9A 1GWCA 5LNKe 2VLVA 4MCUA 3RBTA 4MZWA 4ULXA 1BX9A 2DJ1A 1BAYA 4V2NA 5ELAA 4HOJA 3LEFA 3F6DA 3UOMA 2HXKA 3L0HA 7GSSA 1TU8A 3I43A 3GV1A 2CX3A 1Z7PA 3EWLA 3ZITA 1X5CA 3IE3A 3ZMKA 1OYJA 4G19A 3F0IA 1F9MA 1T7PB 4I8BA 4ACSA 2KLXA 2VIMA 1ZL9A 1PSQA 4L0WA 2OE3A 3D5JA 3Q19A 2ALBA 3C7MA 5G5FA 5ECMB 1GUKA 3ERFA 2C0FA 5IMAA 2VCTA 3Q18A 4GTUA 3UMAA 4EF0A 5J41A 1WMJA 1R26A 4IW9A 2WRTA 3KMOA 4Q5NA 4WXTA 3GSSA 2WS2A 2B1LA 1O73A 3E0UA 3ZVJD 2GTUA 2H76A 4HJMA 4FO5A 2MMOA 3F63A 3WD6A 2DJ3A 4PGTA 5C04A 1A2JA 4KE3A 4BVYA 4YQMA 3QOUA 4GQCA 2H75A 3ME7A 1TK5B 2OKAA 4O92A 5DAKA 2PU9C 2HZFA 5JCGA 2FWFA 2VL3A 4TR0A 3DIEA 3IPZA 5GZZB 1RK4A 4MP4A 3TKPA 1K0AA 2V32A 4N10A 1FHEA 2VL2C 5DCGA 3FR3A 3C8EA 3GKNA 3QFAC 4OO4A 2VM1A 3RPNA 4HZ2A 1U6TA 4Z7XA 3W8JA 4RQRA 3KM6A 1EP8A 2H6XA 2NTOA 2O85A 3C1RA 3U5RE 3IK9A 5DQYA 2L57A 2IWTA 2LV3A 2X8CA 1DUGA 1SL1B 1THOA 1F37A 4O5RA 1U3IA 3UL3A 3D6IA 2A2SA 3CXGA 3UIWA 1F3AA 1QQ2A 1PN9A 3RDWA 4PURA 2P0GA 5ECNB 4DSSA 2EIOA 1QK8A 4GWRA 3EMPA 2EC4A 1F3BA 3KGKA 2PWJA 3VLNA 3KEBA 1V58A 4N11A 2AB6A 1UC7A 1B8XA 5IQYA 2F3MA 1G7OA 2I81A 2KP2A 2FY6A 3WGXA 4ZIJA 4CHSA 2L4CA 2DIZA 3GTUA 2JACA 2DJJA 2C3QA 4X1UA 5LCZA 2GZZA 3C71A 6GSWA 4GSSA 3QAGA 5B6MA 1B48A 1QUWA 2RLIA 3FY7A 1ILOA 2GT6A 4TR3A 3KJYA 5KN2A 1KTEA 4BL7A 4YH2A 1PKWA 4PUAA 4BPYA 4IGJA 2XBIA 1J08A 1MD3A 1EEJA 3IC4A 3KIJA 3M3MA 3CTGA 1PQNA 2YOIA 3IK7A 22GSA 3TJFA 4FYUA 2D2ZA 2FA8A 1OE7A 6GSYA 14GSA 4XS4A 3TCOA 4J2FA 4ECIA 3UAPA 1GUHA 1PRXA 1ZMAA 3LFLA 3VI7A 5DCHA 4MJCA 2VCZA 2IPAA 5INYA 5G1KA 4RI7A 2H66A 3GHAA 4TOPA 4BA7A 4ZB9A 2XBQA 1VF2A 3L4NA 1TTZA 2K18A 3D21A 3FK8A 1C72A 3I6AA 3QD9A 4G2EA 3TOTA 3TJJA 3IRAA 4P3YB 4LMVA 3KTLA 1M0UA 5A4VA 2LNTA 4KUNA 4V1Ap 2YV9A 4EDYA 5H5SA 3WGEA 2B5YA 3PH9A 2AYTA 3HVXA 1XOAA 2AJQB 2CVDA 3GKMA 1B9XC 2MMZA 1FB0A 1A23A 4EKZA 4TR1B 2XPEA 5CRWA 3A2WA 3F4TA 2N5AA 1K0MA 2H0IA 3A3TA 1XCCA 3EU3A 3KP9A 2RM6A 4HU7A 3LXZA 4NV2A 4MA9A 2XHFA 3VWVA 2B5XA 3TJBA 2DMMA 3E3EA 2HSHA 2AAWA 2LJAA 3IAM2 1HNAA 1A0FA 4KCAA 4K1FA 2JSZA 5JWQB 4KA0A 4F0BA 4MF5A 3TKSC 3US3A 2FWHA 3NIVA 1PMTA 6GSVA 1ON4A 1SENA 2JU5A 3HCZA 3TJGA 4WR5A 2VOCA 3N5OA 1EP7A 4G9HA 1XW5A 2EIQA 4K0GA 1VF3A 3H8QA 5F8BA 1XXUA 1NHOA 2CVKA 2F51A 3NZNA 5IO0A 4MPGA 4NAXA 3E9JB 3BOAA 2GQLA 3LWAA 4BVXA 4TVEA 2H19A 2KHPA 1K0BA 1A2MA 5JCWA 2YANA 2L6DA 5J5NA 3I69A 1T3BA 1WP0A 4WR4A 2QSIA 3HZ8A 1TW9A 4ZB8A 2RUEA 3P2AA 4GRFA 1WPIA 3SWLA 1AXDA 2FHEA 2H30A 3QFBC 3MWHA 1IYIA 4KDUA 4WKWA 3TGZA 2WB9A 2G0FA 3M0FA 4K8MA 1Q98A 5D9VA 2H1AA 4K7IA 4V1Ag 4X43A 3HY2A 4WF4A 1SK2A 2FA4A 3GMFA 17GSA 1W89A 3H1NA 3WGDA 4ZILA 3ME8A 4EDZA 2E2MA 2YWIA 1I9DA 4LL1B 2KOKA 1Z3EA 2C3TA 3GL5A 3GSTA 2GSQA 5ECPB 4GQFA 2WDUA 2C0EA 2I1UA 3D22A 3Q74A 3G7JA 3IDVA 1TDIA 1PKZA 4MZCA 6GSXA 2DJ2A 3WT2A 2AUVA 2JZRA 3L9VA 1GSQA 4L5OA 3TUEA 4EO3A 2JZSA 1S3AA 3KXOA 3CRTA 4MH2A 1EV9A 1GSYA 1KBNA 1VRSD 18GSA 2V41A 4NV5A 2H0HA 2VL9A 1T8EB 4K6XA 1B9YC 1AC1A 1PGTA 2LSTA 4EC0A 3TKRA 2CAQA 2B1KA 1Y25A 3ZMLA 4DSQA 1AAZA 4E8EA 3LYPA 4AJ7A 1PX7A 2GZPA 1HNBA 3FEUA 1Y6EA 3HJOA 3KMNA 4EL1A 2C4JA 4TKYA 1JZWA 3KTBA 4WETA 3ZL5A 8GSSA 1PX6A 1G7EA 2OBIA 2VCVA 1LU4A 1XWBA 1ZZYA 4F03A 5IMVA 1F6MC 2O7KA 2QGVA 1THXA 3HA9A 2FUG2 5ECSA 3JCML 2LNSA 1TRWA 1W4VA 2NBSA 3RPPA 4KH7A 4AF2A 4D73A 3DD3A 2K6VA 4POKA 4TW5A 4IP6A 1R4WA 2GVPA 2XPDA 3KCMA 1GSFA 3FR6A 3IXRA 1QFNA 4OFNA 3GKKA 2IMDA 1ZOFA 1GSUA 4OO5A 1PD21 3LQ7A 3GNJA 1FOVA 2LS5A 3EU4A 12GSA 1XW6A 4L5LA 3TKSE 4ZBBA 4XCSA 3APQA 2L4QA 1XWCA 20GSA 2GZYA 2VUPA 4XS6A 4KDXA 5JWRB 4KB3A 2HSYA 1MDJA 1TI1A 1MD4A 3GH9A 4FYBA 3ERGA 1V40A 3TKSA 3TRPA 4NHZA 3VK9A 2GSRA 2H73A 2YJ7A 2YJHA 3FZ5A 2FWGA 5D73A 2H0GA 1TJDA 1X5EA 4ZBDA 4YAVA 3KH9A 1V2AA 2C3NA 3RAZA 2GQKA 5EPFA 5IMZA 4J57E 3LG6A 1ACVA 2VLTA 3OR5A 4K7NA 4TR4A 2M80A 4OCFA 3H4KA 3CTFA 1ZYQB 3GN3A 1JLWA 5LD0A 3O6TA 5ID2B 1K0CA 4X0XA 2ZUPA 2LRCA 4Q5QA 3GA4A 2GS3A 2X8HA 4F0CA 3D4MA 2HE3A 2DIYA 5DBQA 1ZCPA 2MBTA 1V9WA 2TRCP 2VD0A 3ZYWA 3EURA 2X64A 2R2JA 4AJ8A 3ZTLA 5F05A 2FLSA 1G6WA 1UN2A 3UJ1A 4OCEA 1SJIA 4ECBA 5DAKB 1XWGA 3HD5A 1ST9A 1X9WB 1M9AA 4HUAA 4JR4A 4KX4A 3F4RA 3VPTA 3IHQA 4TRXA 2K8VA 1TP9A 3TB2A 3GIXA 4MJEA 4O32A 2JZTA 2JSYA 4L8EA 5AISA 1OKDA 1GTBA 5GAPD 3HKRA 1CQHA 1GSEA 4POLA 2HZEA 1HNCA 4MLYA 1G6YA 1TOFA 1S3DA 2B5EA 1EV4A 4FH8A 4AJ6A 5HFKA 2RUFA 4OMVA 1QXHA 1M2DA 5F07A 4IQ1A 1XVQA 1O8XA 3H79A 3TOUA 4JZQA 3MDKA 1XBSA 3DMLA 5HFIA 2PVQA 1AIUA 1J9BA 2CVBA 2TRXA 1X9MB 2VLUA 3C1SA 4ML1A 2LJRA 2R4VA 11GSA 2ZNMA 2LQQA 2H1BA 1O85A 4IKHA 2CA8A 13GSA 4PXOA 1EOGA 1YY7A 2J23A 4MMMA 5IO2A 4DSSB 4KDYA 2G2QA 3FRCA 3ZLPA 5CRHA 2E2GA 2H1DA 2PGTA 4TN8A 3HYPA 1GH2A 1J0FA 3UARA 4DVCA 2WJUA 4LLRA 3CBUA 4WBJA 1JZDA 5FHIA 1BJXA 1DSBA 2H01A 1XIYA 4NHWA 3F4SA 4DEJA 5ENUA 2LRTA 4IQAA 2H72A 2L5LA 2IFQB 4RI6A 3G7YA 3GTUB 1GUMA 4MK3A 2H6YA 4WEYA 3GL3A 4O7HA 5G1LA 3QAVA 4MH3A 5DALA 1FB6A 3HDCA 2K8SA 1X5DA 1Z9HA 3M8NA 4KNDA 4KSMA 2X8GA 3ISOA 2LKUA 2H71A 1TU7A 3F6FA 1YQ1A 3O3TA 4IJIA 3FYGA 3IA1A 3LGCA 1QMVA 4POBA 3CSIA 3KD0A 2O87A 3UVTA 5G5EA 1SKSB 3ZZXA 2DSAA 3PR8A 3QAWA 2M72A 4PNFA 3QDNA 4OWYA 4XS1A 1AQXA 2MMAA 4JE1A 4XS4B 3F8UA 5B8AA 4XTSA 4TXOA 2C0DA 3G9BA 4JEDA 4H86A 5J9BA 1H4OA 1NHYA 2F8AA 2YV7A 3CMIA 4K9ZA 3LJRA 5A4UA 4I97A 4HDEA 4PQIA 5F06A 5H5QA 6GSTA 10GSA 5J4UA 4YQVA 3BCKA 3W8SA 1WWJA 3L9UA 3A2XA 1WOUA 1FO5A 4DSRA 2DMLA 2NVLA 1PL1A 3UBLA 1USBA 2VO4A 3WYWA 1TI3A 4ID0A 4MJBA 1V98A 3F3QA 2IMFA 4IS0A 1JFUA 1K0NA 2VCWA 4JBBA 5GSTA 1WJKA 2HRNA 2OE1A 2JADA 4MJAA 4OD7A 1OC9A 3VURA 2J9HA 1XW9A 5KN1A 4AGSA 2LUSA 3ERWA 4HQZA 2IMIA 2VL2A 2YP6A 1SJ6A 5DJLA 3FZAA 4EVMA 4ZB6A 2WULA 1MTCA 2VCQA 3QMXA 4IELA 1SKWB 1X0RA 3V1WA 2FD3A 6GSSA 4HQSA 1A24A 3UEMA 3QPMA 3PINA 1SJZA 3BCIA 2QC7A 4XIHA 3GFKA 4PX1A 2L6CA 1PA3A 2VCXA 5AIXA 1SU9A 1N8JA 1K3LA 1N2AA 3GYKA 2HI7A 4F9ZA 2GDRA 5D93A 2B6MA 1RW1A 5F0GA 2ON5A 2LJKA 3LXTA 1Z6MA 1BYEA 5CO3A 2LTKA 4BWSA 4IVFA 2MBSA 4I5QA 5H5RA 2QKEA 2IIYA 1AW9A 3HJMA 4Q5FA 1ERWA 2N5BA 5IMDA 3VI5A 1R5AA 3MAKA 5L71A 5E4WA 3ZFBA 1M9BA 6GSUA 3CSJA 3RHBA 4BWQA 2OJLA 4ZL8A 5GAND 2O8VB 2JL4A 4HU9A 3RHCA 4ML6A 3EMXA 9GSSA 3BD2A 3GH6A 19GSA 4OFTA 3FKFA 1EZKA 3S9FA 2H70A 3MNGA 3KH7A 2Z9SA 3HZ4A 1M99A 5G2ZA 5G31A 3DYRA 3I9V2 4PUFC 1LJRA 3F3RA 3QR6A 2IN3A 1TKDB 1M2BA 2FWEA 2PERA 5CNWA 4GSTA 1GL8A 1NM3A 2MYGA 5J3RA 1G0TA 3NOFA 3CSHA 2IJYA 5B8BA 2A4VA 3FR9A 5ECIB 1DE2A 1VF4A 1OC8A 2YCDA 1K0DA 4J56E 3TRQA 2N5FA 1H75A 2C1YA 3DRNA 1AUCA 1T00A 2LEGA 3EYTA 1TXXA 5HR2A 2WCIA 3GX8A 3ZIVA 4NPBA 5D8IA 1A0RP 5B7CA 5A4WA 3VFIA 3N9JA 3L78A 3R2QA 1EWXA 3MSZA 3FW2A 5CREA 2DJKA 2C0GA 4JR6A 3EINA 1O81A 4IHUA 4HZ4A 2GQMA 1GTUA 2B3SA 2K9FA 4I2TA 4I2UA 2CX4A 5D96A 1I5GA 4JRRA 5FWGA 3HVSA 5KN0A 1GP1A 4QL7A 2PPTA 4FIWA 1ERTA 1SK0A 2PUKC 4N30A 3D0ZA 2GSTA 4NXIA 3M9KA 1FVJA 5IOWA 3TDGA 4LMWA 2YWMA 1F2EA 3M1GA 1TK8B 2WGRA 5AIVA 4CW9A 4KAEA 5EL8A 2CQ9A 1M2AA 3ZRDA 3IBHA 1O6JA 4ECCA 1M7TA 1FAAA 2PMTA 4D73B 3GX0A 2H74A 4NWYA 4MF6A 2C80A 1TRUA 3SBCA 5D9WA 2R3XA 3KP8A 5EVOA 5ELGA 4ZBAA 5ID2A 5ECHB 1GSDA 5JCUA 4ECJA 3ZIJA 5DJMA 2L59A 5KEJA 4IJ3A 4F82A 4EUYA 3EE2A 2E7PA 1SD8A 2YPMA 3K8NA 4QQ7A 1V57A 3Q6OA 3APSA 3G7IA 3TKQA 2CZ3A 16GSA 1ZYEA 1GSSA 1SKRB 4ZXGA 4K2DA 2CAIA 2HLSA 2OBKA 3C73A 5D9XA 1YJ6A 1DE1A 1FW1A 4N0ZA 1OC3A 3BJ5A 5HR0A 5ABRA 5HR3A 3D4TA 1MDKA 1B4QA 3EVIA 4TXVA 2BMXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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