2KP1A

Solution structure of the a' domain of thermophilic fungal protein disulfide isomerase
Total Genus 29
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
29
sequence length
121
structure length
121
Chain Sequence
GPLGSEGPVTVVVAKNYNEIVLDDTKDVLIEFYAPWCGHCKALAPKYEELGALYAKSEFKDRVVIAKVDATANDVPDEIQGFPTIKLYPAGAKGQPVTYSGSRTVEDLIKFIAENGKYKAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Redox-Dependent Domain Rearrangement of Protein Disulfide Isomerase Coupled with Exposure of Its Substrate-Binding Hydrophobic Surface
pubmed doi rcsb
molecule tags Isomerase
source organism Humicola insolens
molecule keywords Protein disulfide-isomerase
total genus 29
structure length 121
sequence length 121
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2009-10-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2kp1A00
1GSFA 3N5OA 1AQXA 4LLRA 4O92A 2WFCA 2EIQA 2P0GA 4WETA 4DSSA 5ECHB 1OC8A 1GSEA 1F6MC 3F4SA 1WOUA 5GAND 4KE3A 3GMFA 1YEXA 1UN2A 2I9HA 1OKDA 5ELGA 4J57E 1PX7A 1T3BA 3ED3A 1FVKA 4MF6A 5AN1A 1AQWA 5ECRB 3E9JB 2OA7A 3HVXA 1EGRA 1TRWA 2ALBA 4MZCA 3EE2A 4KSMA 3HYPA 3HHVA 2WS2A 3FYGA 5LCZA 3QR6A 4OFNA 3P90A 4L0UA 1IYHA 5F8BA 1JZRA 1LU4A 1BG5A 4HU9A 1TTZA 1X5DA 5IOXA 4JEDA 3LJRA 3ZFBA 4NAXA 3A5WA 3GFKA 2P31A 1GSUA 3ME7A 4F82A 3RBTA 2B5XA 4I97A 3QPMA 2GT6A 5IPGA 4NV2A 1KBNA 3TJGA 1E6BA 1WPIA 4EKZA 3KD0A 3IHQA 1U88A 2DJ2A 4AJ7A 3S9FA 2YOIA 3ZIJA 1OE8A 3VFIA 3F0IA 4CHSA 4EO3A 5DALA 13GSA 3DRNA 5IMAA 2CAQA 4TR1B 5F06A 3L4NA 4KDUA 2JSYA 1XIYA 2C0GA 4MJEA 3O6TA 2IFQA 3NZNA 2IPAA 3FW2A 1G0TA 3UBLA 1V57A 1T4ZA 1U3AA 4FH8A 2YP6A 2H66A 5E59A 1HD2A 4MMMA 1UA5A 3TRXA 2IMFA 3G7JA 1I9DA 3EMXA 5B6MA 22GSA 2C0DA 4F2IA 3VWUA 3L9VA 1MEKA 5D96A 1XVQA 4ZBAA 1GNWA 4KH7A 1XOAA 2X8CA 4OFMA 3ZL5A 2NDOA 4IN0A 4IP1A 1JZDA 4EL1A 4GWRA 3FHKA 1ZCPA 3VWWA 5ECSA 3Q18A 4ZB8A 3WGDA 2EIOA 1YY7A 1QK8A 3Q19A 2C1YA 1WIKA 2C80A 5G2ZA 3KTLA 1WRYA 1XBSA 2WZ9A 2H1BA 5ECLB 5G30A 2FUG2 2H6ZA 2KUCA 3TUEA 2I4AA 5GZZB 4N0ZA 4EDZA 4QL7A 2A2RA 4YH2A 1GTBA 2VD1A 4F0BA 4LL4B 2C0FA 4I6XA 1M99A 2L59A 3TJJA 4Q5NA 4ACSA 3HVSA 3GL3A 3MWHA 4TOPA 1K0CA 3EURA 3FRCA 3CMIA 3FY7A 2C3TA 5KN1A 1T4YA 1EOGA 1DBYA 4HJ2A 1TJDA 3APOA 1JZWA 2PVQA 6GSTA 3FZ9A 3KXOA 2VM1A 1ERVA 1PN9A 2GZZA 3WYWA 7GSSA 5FHIA 4GF0A 5EVOA 4QQ7A 5HR1A 5DDLA 3ZMLA 2HXKA 5CO3A 2H74A 3L9UA 1AQVA 1TK8B 1T1VA 1JZOA 1A2LA 3PINA 3PH9A 4DEJA 2OBKA 1TU7A 3DGQA 1OC9A 5GSTA 1H75A 2CX3A 2CX4A 3W8JA 4GSSA 1YF1A 1QUWA 3CTGA 1VF1A 2F9SA 4YQUA 1EV9A 3QFAC 4YQVA 3D6IA 3F4RA 2VCVA 2CVDA 3TGZA 2H0IA 4ML1A 6GSVA 5HFIA 2YN1A 2XPDA 4MA9A 1BQ7A 3GKXA 2MMAA 5HFKA 3VI5A 2E2GA 4YAVA 4TR0A 2GSQA 9GSSA 3EU4A 4IJ3A 3IR4A 4MH3A 4G2EA 2OACA 2H72A 1ABAA 4IELA 2V2GA 1R4WA 1WP0A 1GSSA 2G0FA 2VL2A 3DMLA 1GUKA 1RK4A 2GQMA 4ZL8A 1Z6NA 5B7CA 4P3YB 1WMJA 3F3RA 4IJIA 2C0EA 3BOAA 4JR6A 3H8QA 1KEBA 4LA1A 2K8VA 1SK1A 1GLPA 3HJOA 2H1AA 3GH9A 2OE3A 4FYCA 3CRTA 4E8EA 1EWXA 3GUSA 3WGEA 20GSA 2R5GA 4ISDA 2IMDA 3QDNA 1WJKA 1SJZA 2B1LA 1HNBA 2CV4A 3CXGA 4GRFA 2FCHA 4DSQA 4NMUA 4MJCA 2WCIA 3D4TA 2LS5A 2WJUA 3GX8A 1XXUA 2LTKA 4V2NA 2HRNA 2DJJA 2E2MA 4X0XA 1JLWA 2VLTA 2MMOA 3KCMA 2V6KA 4EUYA 4MZWA 2L6DA 3HD5A 1MDIA 4WBJA 3UMAA 4POMA 2GQLA 1GSDA 1NHYA 5IM9A 5H5QA 4ECCA 1SENA 2HZEB 5DQSA 4HDEA 1O85A 2YPMA 4ZB9A 4G10A 4KCAA 4OWYA 4N0VA 1GTAA 3KZQA 1TOFA 1DE2A 4IGJA 2RM5A 4WXTA 2PU9C 3IBHA 1ERWA 1OYJA 5A4WA 2IL3A 3ZYWA 3LORA 2NPBA 3LXTA 1GUMA 2AHEA 2PBJA 1Z7PA 1YKAA 3NOFA 4K7IA 3HA9A 4XCSA 4KA0A 2Z9SA 2BMXA 5CRWA 5DQYA 5JCWA 4TXOA 2MBSA 3VPTA 3WT2A 2GTUA 2AJQB 1KNGA 1ILOA 3DEXA 3O3TA 4X43A 2F8AA 3TKRA 1N2AA 5IPHA 2OADA 3P8WA 3UOMA 3M8NA 5KN2A 5ID2B 2GGTA 4NWYA 4N10A 2IJYA 2YJHA 1I5GA 2JL4A 2FY6A 4JU5A 4L8EA 3F63A 1G6WA 4ML6A 1R26A 1PL1A 2LUSA 2B5YA 4XRDA 1O8WA 3E0UA 2R4VA 1A8LA 1XWBA 3HJPA 2AV4A 2PERA 3EVIA 1VGLA 4LL1B 2HFDA 2HE3A 4GSNA 1J08A 3I6AA 1OE7A 4HQSA 3APQA 1GL8A 4KSOA 4MJAA 3GTUB 5HR0A 2VM2A 4OCEA 2FA4A 1K0NA 3QOUA 2X64A 4HU7A 2PVOC 4ZBDA 2R3XA 3ZTLA 1PRXA 2O87A 4OD7A 4PX1A 2LQQA 2IWTA 1XCCA 1SL2B 2LSTA 3IAS2 3W8SA 1K3OA 2VL2C 1GNEA 3VURA 4L5LA 3D21A 1TP9A 2LJKA 1FB0A 1XWGA 3CSJA 4JZQA 1HQOA 4I5QA 4KW6A 1XWKA 3VPQA 2GSTA 2C3QA 4EC0A 3ZVJA 5JCGA 2A4VA 3WGXA 3HZ4A 4TR3A 2PPTA 4XHMA 3H79A 5GSSA 2JSZA 1TW9A 2DJKA 2N5FA 3MDKA 5IQYA 2I1UA 2WGRA 1XWCA 2XHFA 1OAZA 1U87A 3BD2A 1NM3A 3GSSA 5KN3A 2FGXA 1M2AA 3BJ5A 3EINA 1ZMAA 4V1Ap 3KH9A 2ON7A 3FR6A 5LNKe 2GSSA 2LEGA 1FHEA 2DJ1A 3DVXA 2GT5A 1FO5A 1PA3A 3FR9A 2C3NA 3HJMA 2H70A 3UBKA 2F51A 3A2WA 1Y25A 1KTEA 1GULA 5IMVA 1VF4A 4BWQA 4RUVA 2JU5A 2YZUA 2L4CA 4HI7A 5D8IA 4N11A 4IW9A 1X5EA 3QD9A 3U6VA 4WF4A 4K8MA 2VCZA 1X0RA 4K1FA 2LNTA 3RAZA 5IMDA 4KX4A 1XW9A 1R5PA 1TDIA 2LNSA 3EC3A 1FOVA 2YCDA 4XIHA 4D73B 2VD0A 4Z7XA 5D9WA 3UEMA 2L4QA 1F2EA 3RDWA 3LQ7A 1YZXA 1DSBA 1ZGNA 1Y6EA 2M72A 4EE0A 3LG6A 1ST9A 1SU9A 3OR5A 4IP6A 2PMTA 5DCGA 3WD6A 5J5NA 2HRFA 3FZ5A 4ZL9A 3HVVA 3W6GA 5EL8A 1TK5B 2YANA 3MAKA 3KMNA 3VK9A 4QL9A 1AC1A 5AIVA 2H75A 5CP1A 5C04A 2TIRA 2LQOA 1SJIA 3BCKA 5FT3A 3O76A 5D93A 5CRDA 3FZ4A 4LMWA 2G2QA 2F3MA 3ERFA 2H71A 1GSQA 3EMPA 3RHCA 2N5BA 4POLA 2VL3A 1THOA 2V32A 2OE1A 4XRAA 1Z9HA 3ERGA 1R5AA 5ECOB 2X8HA 3QAGA 4WKWA 19GSA 3IDVA 3DYRA 1TRUA 4AJ8A 4KCEA 3AY8A 1MD4A 3LFLA 3LXZA 1BYEA 4TR1A 2HSYA 2HT9A 2YWOA 2F8FA 3F3QA 4TVEA 4EDYA 4ZILA 4BVXA 1OC3A 1VRSD 4PUFC 2V41A 5IO0A 5CNWA 1UC7A 2H1GA 2K9FA 3LYPA 3M9JA 1X9WB 1CQGA 4NV5A 3VLNA 5A5KA 2FD3A 1YEPA 2I3YA 5DJLA 3CRUA 3KEBA 4HQZA 2OJLA 4BPYA 3H93A 2D2ZA 5IMFA 1HNAA 1V58A 2YZHA 1F3BA 1W4VA 5H5SA 2PGTA 1K3YA 2VLVA 4GQCA 2I81A 2BTOT 3A2VA 4KDXA 1GRXA 1DUGA 1QMVA 2OBIA 3EYTA 3HY2A 1GSYA 3HXSA 2KP1A 3CBUA 1V40A 1C72A 1QGVA 2JADA 2N5AA 5JWOB 2CZ3A 1XW6A 3F6DA 4CW9A 5G1KA 3E3EA 4MK3A 4OFTA 3GURA 4Q5QA 1O81A 5L71A 2AUVA 1K0MA 1O73A 3TKSC 1A24A 4ILFA 1SD8A 5DVBA 5GAPD 3D5JA 12GSA 2ES7A 1SK2A 2OE0A 2R6KA 1B4PA 4F03A 2LRTA 2TRXA 4MP4A 1ML6A 1B9XC 1THXA 3DXBA 1A8YA 5LD0A 1XOBA 4MPGA 2K8SA 5CRGA 1R7HA 3HZ8A 2C4JA 5DAKB 1JFUA 2JACA 5ELAA 5EY6A 4RI7A 1GH2A 3ISOA 5IMZA 4O5RA 1B8XA 1QFNA 4G19A 1FW1A 3ERWA 1AUCA 2O8VB 4ULXA 3VWVA 3GSTA 1A2MA 4XS4B 2IMEA 5DJMA 1S3AA 3C1SA 4BWSA 2DJ0A 1GLQA 3KJYA 2IMIA 4ID0A 5AIXA 1K0AA 1O8XA 4IQAA 3KMOA 1DE1A 4AF2A 5A4VA 3KM6A 4Q5FA 2R2JA 3L78A 4BVYA 2YWNA 3QCPA 5D9TA 3GKKA 1SJ6A 1TKDB 4HZ2A 3IAM2 1GUHA 1YDKA 3PR8A 4GSTA 2LKUA 2MBTA 4GLTA 4XS6A 3M3MA 3P7XA 2AYTA 2DIZA 4PQ1A 2FWHA 2H8LA 1NHOA 1A23A 4L0WA 2JZRA 1ERUA 3GHAA 3ZITA 2HSHA 2C8UA 4K9ZA 2P5RA 3RPPA 1J9BA 2H19A 1QXHA 2YV7A 4GTUA 1EP8A 2XBIA 1PD21 3BCIA 2VO4A 3TRQA 5CAXA 3GYKA 1V9WA 1VF2A 1RW1A 2L5LA 4AJ6A 2GVPA 4BL7A 3TRPA 3IA1A 4AGSA 1S3DA 5J4UA 1GWCA 5E4WA 1M9BA 2TRCP 4F0CA 1S3CA 3IOSA 5ENUA 1T7PB 2V1MA 2KOKA 2MMZA 2HI7A 5ECQB 2R37A 3UARA 2IMKA 3L9SA 1FB6A 4K2DA 2FNOA 5AGYA 2RIIA 2GLRA 4WR5A 3M1GA 2J9HA 5ABRA 1ZL9A 3H4KA 1Z6MA 2HYXA 4ZXGA 1YF0A 3D4MA 1X5CA 2GSRA 3GRXA 2QC7A 4DSSB 2DC5A 1TRSA 2A2SA 4MPFA 1XZOA 3LYKA 5HR2A 3V1WA 2GZYA 3IK7A 3APSA 1W89A 4I8BA 1EP7A 4TR4A 4NXIA 2DJ3A 1B48A 4OCFA 5H5RA 4GXZA 4PURA 3UIWA 4I2TA 1T00A 6GSSA 1TRVA 3FZAA 4MF5A 1V98A 2HZFA 1GTIA 3QAVA 3US3A 4NHZA 3EWLA 1PKWA 2B7KA 4H86A 1M9AA 1AAZA 2H6XA 2LJRA 2VIMA 4KB3A 2H30A 2VOCA 2KLXA 2HZEA 5G5FA 2YWIA 1H4OA 4MABA 1TXXA 3CTFA 1MDKA 3KIJA 2H0GA 3TJKA 1F3AA 1BAYA 4TW5A 4JBBA 3C71A 3KP9A 4WBRD 2NVLA 3GA4A 4JE1A 5ECNB 3Q6OA 2B3SA 4IBPA 2VAFA 3DD3A 2LRCA 2IIYA 2RUEA 1HYUA 5IMCA 4V2MA 3TCOA 1PMTA 5DALB 2ON5A 1SYXA 4YAPA 1F9MA 3IV4A 1U3IA 1EZKA 2E0QA 1PKZA 3I43A 3R2QA 3MNGA 1G7OA 2IFQB 5JWQB 3U5RE 3ZFLA 1MDJA 5CYYA 3NIVA 2CQ9A 2XPEA 3GKMA 3KP8A 3IPZA 5B8BA 3TOUA 4JR4A 3GV1A 4IHUA 4PUAA 4K7NA 5B6NA 2WULA 2GDRA 5JWRB 5G5EA 5ID2A 4RQRA 2HNLA 3TKSA 4RI6A 2EIRA 3N9JA 3TOTA 4OMVA 3RHBA 2RLIA 2RUFA 2GS3A 4FYUA 4PNGA 1EV4A 4E8HA 2L57A 5ECPB 2M80A 2LJAA 2V6OA 4O32A 3CSIA 4CDOA 3J7Yb 5HR3A 4WEYA 6GSXA 3QAWA 2ZUPA 3GKNA 3GTUA 5ECIB 4HOJA 4XTSA 1OKTA 3FK8A 3HKRA 5J3RA 1USBA 3G7YA 3J7Yk 4BA7A 1JLVA 3ZIVA 1TI1A 1ACVA 1PL2A 2DLXA 1J0FA 4XS1A 1M0UA 1EEJA 1ZOFA 3TB2A 3IC4A 4KUNA 2VL9A 1SL1B 4O7HA 1QQ2A 4WF5A 4ZIJA 1URMA 2L5OA 3ZREA 2DIYA 1TU8A 5AISA 4EXJA 4OO5A 3D0ZA 4MDCA 2CZ2A 2H76A 3LWAA 1SK0A 2O7KA 2REMA 4L5OA 1BEDA 4GQFA 3D22A 2QGVA 2JZTA 1GTUA 2X99A 3ZVJD 6GSWA 1SKWB 3SBCA 3M9KA 2PN8A 1WWJA 2VCQA 2DMMA 1YJ6A 1OC9B 1B4QA 4J56E 2P5QA 3GX0A 1IYIA 1Q4JA 2KP2A 3UVTA 4ECIA 2ZNMA 2J23A 4PQHA 1T8EB 4ECJA 1AXDA 2DBCA 5D73A 1O6JA 1PSQA 4HJMA 3UL3A 1ZYQB 5F0GA 5FWGA 4MZBA 4EVMA 1XPVA 4PQIA 2CVKA 4FIWA 2MMNA 1N8JA 1VF3A 4MF7A 3ZRDA 1M2DA 2DMLA 5F05A 2YJ7A 5CREA 2VLUA 5J9BA 1LJRA 1A0RP 3GL5A 2QSIA 2OKAA 2IN3A 1FG4A 4D73A 3A2XA 3F6FA 2E7PA 2GZPA 1EGOA 4FO5A 2VCXA 3F9UA 2YV9A 1G6YA 3CYNA 2MZCA 5EPFA 1XW5A 1SYRA 5ECMB 3TDGA 2NTOA 1K3LA 3QMXA 5D9VA 5F07A 3P2AA 3HCZA 2JZSA 4TXVA 2CA8A 3M0FA 1V2AA 4EF0A 5G31A 5IIZA 5JCUA 2B7JA 2ZCTA 1SL0B 1PQNA 3MSZA 2H0HA 3SWLA 4TN8A 2NBSA 3IK9A 5KN0A 3JCML 2H6YA 4OO4A 1XFLA 3UVHA 4IVFA 14GSA 2FWGA 5DBQA 1K0BA 2M46A 2VCTA 5INYA 5C00A 3KTBA 4TKYA 1Z7RA 3CSHA 3K8NA 3PGTA 4FYBA 3ZLPA 1AW9A 1M7TA 4K6XA 3ZMKA 2EC4A 1E2YA 1ERTA 4N30A 18GSA 4MH2A 4Q5RA 4POKA 3I69A 3C8EA 4X1UA 2H01A 2QKEA 3GH6A 1A0FA 2CT6A 2DSAA 2CAIA 1SKSB 4ZB6A 3KGKA 2AAWA 4GCIA 2PUKC 1FAAA 1LBKA 4HUAA 3LEFA 4TRXA 3RPNA 3BBYA 1CQHA 2VCWA 2FWEA 1M2BA 2X8GA 2H1DA 4ZBBA 4KGIA 5DCHA 3F8UA 10GSA 5IOWA 1B9YC 1A2JA 3LGCA 4TXOB 4HZ4A 6GSYA 1X9MB 4WR4A 1ON4A 1PGTA 3DVWA 4PNFA 3DWVA 1FVJA 2WB9A 2GQKA 1Q98A 1XWAA 2KHPA 1Z5YE 1G7EA 1AIUA 5G1LA 1TI3A 4KNDA 1WE0A 3L0HA 2AB6A 2K18A 3WT1A 3GIXA 2FA8A 4RQXA 11GSA 2XBQA 5ECKB 4KDYA 5HFGA 1BJXA 4K0GA 4K0NA 4MLYA 2K6VA 4KAEA 5D9XA 1SD9A 4JRRA 1YKCA 4NPBA 1PX6A 3FKFA 3LSZA 4PGTA 2L6CA 3DKSA 3IXRA 3G7IA 3C1RA 5A4UA 5DAKA 4HS1A 4F9ZA 1SKRB 2XC2A 1ZYEA 4ZL7A 4MJBA 1OVNA 1TK0B 2H73A 5B8AA 4XS4A 4IQ1A 5J9CA 1BX9A 3VWXA 4LMVA 3C7MA 4NHWA 4MCUA 3I9V2 2CVBA 2YNXA 17GSA 3KH7A 2B6MA 5J41A 1EEMA 4DSRA 2LV3A 2WDUA 3A3TA 1X9SB 1K0OA 3TJFA 1HNCA 3ZZXA 1NSWA 5HQPA 1RQMA 3GNJA 3HDCA 2YWMA 5COHA 4IKHA 2VUPA 6GSUA 2HLSA 3UAPA 2RM6A 4J2FA 2FWFA 1MD3A 2O89A 3UJ1A 3ME8A 3IRAA 3Q74A 1EOHA 4POBA 1MTCA 5IO2A 3VI7A 16GSA 3TKPA 2B5EA 1GP1A 2O85A 3GN3A 3TJBA 4ECBA 4V1Ag 4IS0A 4V2LA 2MYGA 2BJXA 3EU3A 3FR3A 5CRHA 2LRNA 4G9HA 3FEUA 1JHBA 3DIEA 1ZZYA 4K7OA 4DVCA 2FHEA 8GSSA 3C73A 1XVWA 1YQ1A 3TKSE 4I2UA 1NW2A 2B1KA 2PWJA 4HEA2 2WRTA 1O7UA 5KEJA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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