The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
60
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structure length |
60
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Chain Sequence |
GSMGRQCKVLFDYSPQNEDELELIVGDVIDVIEEVEEGWWSGTLNNKLGLFPSNFVKELE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Mus musculus
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| publication title |
Solution Structure, Dynamics and Thermodynamics of the three SH3 domains of CD2AP
rcsb |
| molecule keywords |
CD2-associated protein
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| total genus |
9
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| structure length |
60
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| sequence length |
60
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-12-21 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2AKK A; 2X3W D; 2LCS A; 3VS3 A; 3VS7 A; 3O5Z A; 2KXD A; 1VYU A; 4EIK A; 1AWW A; 1SHG A; 2KBT A; 4OMM A; 2EKH A; 2CUB A; 3NPF A; 1SPK A; 2LJ3 A; 1K0S A; 1WIE A; 4CC4 B; 1PKT A; 3NMZ C; 2ROL A; 1UGV A; 2CUD A; 2D8J A; 3EG1 A; 2JM9 A; 1M27 C; 2BZ8 A; 2KEA A; 4AG1 C; 2KRS A; 1NLO C; 4IIM A; 2L2P A; 2X3X D; 3THK A; 3M0R A; 3I9Q A; 5FWB A; 1YP5 A; 4HCK A; 2JT4 A; 5EC7 A; 2ED0 A; 2JMA A; 3TSW A; 2DVJ A; 1WFW A; 2LQN A; 1B07 A; 2D0N A; 2FEI A; 2FO0 A; 2PZ1 A; 2DMO A; 2KRO A; 2DRM A; 2MCN A; 3C0C A; 2CSQ A; 1PNJ A; 2D8H A; 2C0O A; 4M4Z A; 2FRW A; 2FPF A; 2RF0 A; 2A36 A; 2KYB A; 1V1C A; 3NHN A; 3UF4 A; 4F16 A; 2O88 A; 1PRM C; 2GTJ A; 1WI7 A; 1I1J A; 2VVK A; 1QKX A; 5IXB A; 2ED1 A; 1FMK A; 2W0Z A; 4Y92 A; 1RLP C; 3VS0 A; 2L3Q A; 5IXF A; 3H0I A; 2EPD A; 1PRL C; 4R0K A; 4CC3 A; 4AFZ C; 2DL8 A; 1K9A A; 1SHF A; 2DX1 A; 1TUD A; 1K1Z A; 1AOJ A; 2BTT A; 4F17 A; 3SHW A; 4JPB W; 3I5R A; 1MV0 B; 2EBP A; 3LH5 A; 2OAW A; 1G2B A; 2KE9 A; 1BK2 A; 4LNP A; 1UUE A; 3VS1 A; 1ZUY A; 1QWF A; 1ZUU A; 3VS6 A; 2RMO A; 2DF6 A; 1VYV A; 1K0X A; 1KJW A; 2RQR A; 1WLP B; 2DBM A; 1NEG A; 2L3S A; 2FPE A; 3PVL A; 1GFD A; 4JJD A; 2RQT A; 1OPL A; 2DJQ A; 2GBQ A; 2F2V A; 1IO6 A; 2DYB A; 4J9H A; 1WXU A; 3VS5 A; 5FWC A; 1UHC A; 1I0C A; 2ABL A; 1W70 A; 3JV3 A; 2DA9 A; 1JU5 C; 2LJ1 A; 1YNZ A; 2EVR A; 2CSI A; 1VA7 A; 4E6R A; 5L23 A; 1UFF A; 2K79 A; 2J6O A; 3PVQ A; 1H92 A; 2NUZ A; 3H0F A; 1ZBJ A; 4JZ3 A; 2J6F A; 1UE9 A; 4HVV A; 2FRY A; 3R6N A; 1AWJ A; 2KT8 A; 1I07 A; 2YUN A; 1GBQ A; 3UAT A; 2JW4 A; 2VWF A; 1X6G A; 4J9F A; 2NWM A; 4ESR A; 1X6B A; 1OOT A; 3EHR A; 3GBQ A; 4KRT A; 1AD5 A; 2EYW A; 2OI3 A; 2CH4 W; 1K4U S; 4QT7 A; 1AZE A; 3VS2 A; 4J9B A; 4ORZ A; 2EQI A; 1BBZ A; 4DEY A; 1OV3 A; 3PE0 A; 1AWX A; 2MIO A; 1GL5 A; 5GJV B; 2V1R A; 4A63 B; 1LCK A; 1U3O A; 2LP5 A; 2DE0 X; 1OEB A; 4J9C A; 1A0N B; 4HXJ A; 2JXB A; 1U06 A; 2O31 A; 2EGA A; 3EHQ A; 2FPD A; 4D8K A; 2A08 A; 2L3P A; 1WDX A; 3ZL7 C; 1UEC A; 3M0Q A; 1NG2 A; 2K9G A; 4JJB A; 2LMJ A; 4LE9 A; 1AZG B; 1E6G A; 2W10 A; 3H41 A; 2IIM A; 2JMC A; 1UTI A; 1YCS B; 2RQU A; 1AWO A; 1G83 A; 1Z9Q A; 1XOV A; 1X27 A; 2HCK A; 1UJY A; 2KGT A; 4RTZ A; 4IIO A; 1M3A A; 5IHI A; 1M3C A; 1YWP A; 2K7A A; 3SEM A; 3M0T A; 1ZX6 A; 1QCF A; 2DL4 A; 2ENM A; 4RTV A; 1KFZ A; 4Z8A A; 4J9D A; 1EFN A; 1RLQ C; 2RQV A; 3IQL A; 5HCK A; 3M0S A; 3UA7 A; 3VRZ A; 4Z89 A; 2L0A A; 2O2O A; 3UA6 A; 2ROT A; 4DEX A; 2VKN A; 4J9E A; 1H8K A; 1NYF A; 2GTO A; 2JS0 A; 4ZNX A; 1RI9 A; 1U5S A; 4OMO A; 2HDA A; 2RPN A; 4OML A; 4HVU A; 2HBW A; 2PTK A; 3M0U A; 1WYX A; 4JJC A; 1J3T A; 2M0Y A; 4AFU C; 2HSP A; 3NGP A; 1B3Q A; 1AVZ C; 1MUZ A; 1GBR A; 1KSW A; 1T0H A; 4RTY A; 4D8D A; 1S1N A; 1M30 A; 4Z88 A; 1NLP C; 3EG0 A; 1HD3 A; 1YWO A; 2AZS A; 1FYN A; 1GCP A; 2GQI A; 3TVT A; 2HEQ A; 3U23 A; 5IHK A; 5IHN A; 2P4R A; 2DL5 A; 2EGC A; 2SEM A; 2DNU A; 1RUW A; 1GCQ A; 3QWX X; 5I11 A; 1JXM A; 2V1Q A; 3REA B; 1JO8 A; 1X43 A; 1ABQ A; 2RQW A; 2F2W A; 4OMP A; 4LUE A; 4AG2 C; 1KIK A; 4RTW A; 1ARK A; 4J9G A; 2QDL A; 1Y0M A; 2EW3 A; 2LJ0 A; 1ZLM A; 2CT4 A; 2RNA A; 3QWY A; 1JEG A; 5GJW B; 3TSZ A; 2AK5 A; 4X1V A; 4CC7 A; 2DL3 A; 2J6K A; 2YDL A; 1QKW A; 4LUD A; 4CC2 A; 1JQQ A; 2O9V A; 4LN2 A; 1N5Z A; 2PNI A; 4RTX A; 1AEY A; 2LQW A; 2DLP A; 2E5K A; 1X2Q A; 2JTE A; 1M8M A; 3CQT A; 1NYG A; 3M0P A; 1ZUK A; 2A28 A; 2GNC A; 2D1X A; 1UG1 A; 2KT1 A; 2JM8 A; 2J7I A; 2FG0 A; 2YUQ A; 1T3S A; 1TG0 A; 1PWT A; 2YSQ A; 1MV3 A; 2O9S A; 1HSQ A; 2EYZ A; 1Y57 A; 1YN8 A; 4JZ4 A; 1JXO A; 1X2K A; 1SRM A; 4K11 A; 1M3B A; 2YUP A; 3RNJ A; 4FSS A; 4F14 A; 1NM7 A; 1T0J A; 3EG3 A; 1WA7 A; 3FJ5 A; 3VRY A; 1PKS A; 2F2X A; 2XMF A; 1VYT A; 4GBQ A; 2DL7 A; 1CKA A; 5IH2 A; 1K76 A; 2K3B A; 1UHF A; 3I35 A; 2J06 A; 4AFQ C; 5I22 A; 2ESW A; 1SSH A; 2GGR A; 2K2M A; 1ABO A; 2AKL A; 3KFV A; 3RBB B; 4OMN A; 1QLY A; 2B86 A; 3EGU A; 1CKB A; 4HVW A; 2EYY A; 1BU1 A; 5FW9 A; 2DM1 A; 1SEM A; 2C0T A; 2BZX A; 1BB9 A; 1CSK A; 2DIL A; 2MOX A; 1GRI A; 2CDT A; 2DRK A; 2J05 A; 2EGE A; 4RTT A; 2CT3 A; 2K6D A; 1HJD A; 2LNH B; 3A98 A; 2KNB B; 2KRN A; 1E7O A; 1Z9Z A; 2CRE A; 1PHT A; 1TUC A; 2SRC A; 4J9I A; 2A37 A; 4OMQ A; 2H8H A; 1W6X A; 3EG2 A; 2DBK A; 2LZ6 B; 1T3L A; 1UJ0 A; 2LX7 A; 2ECZ A; 4GLM A; 2I0N A; 1H3H A; 2AZV A; 2G6F X; 2KYM A; 2CH4 A; 3REB B; 3ULR B; 1QWE A; 4RTU A; 2JS2 A; 3VS4 A; 4AFS C; 3I5S A; 1GCQ C; 2RN8 A; 2EYX A; 1NEB A; 2M51 A; 2C0I A; 4RUG A; 3H0H A; 2KRM A; 2YT6 A; 2BZY A; 2KXC A; 1WXT A; 4WCI A; 1GFC A; 1E6H A; 1WX6 A; 1WXB A; 1UDL A; 1SRL A; 5ECA A; 1ZSG A; 2OJ2 A; 1W1F A; 2KR3 A; 2YUO A; 1X69 A; 1OPK A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5HK3 A; 2X3W D; 1YJN T; 4LD6 A; 3C94 A; 3VS7 A; 4EIK A; 1AWW A; 2MYS A; 1VQP T; 1IGU A; 2CUB A; 2DXU A; 2QAZ A; 3MJX A; 4M77 E; 4M75 B; 1UGV A; 4DBQ A; 4F7U F; 2BZ8 A; 2KEA A; 3SWN C; 2X3X D; 3G71 T; 2DAQ A; 1I4K 1; 4HCK A; 5EC7 A; 2NUT B; 1BCO A; 5FU7 B; 3OYI A; 4ANJ A; 1JJ2 A; 3PIO A; 2QTX A; 4A4K A; 2LQN A; 1YHQ A; 4M75 C; 2FZG B; 4ZGE B; 1YI2 T; 5FU6 B; 2MCN A; 3CCJ A; 3D7S B; 3C0C A; 4PJN A; 2LVM A; 2OX7 A; 1PNJ A; 1TWB A; 4XTX A; 2FPF A; 2KYB A; 1V1C A; 5IAY A; 1PRM C; 5FU7 C; 1QKX A; 5IXB A; 1FMK A; 4Y92 A; 2V8K A; 2XID A; 1PCX A; 1PRL C; 2KVQ G; 4JRK A; 1K9A A; 2M0O A; 1MMN A; 5FU6 C; 4F17 A; 5KCO A; 3LH5 A; 1G3S A; 5AT1 B; 1ZUU A; 3VS6 A; 1QCO A; 1QVF S; 1K0X A; 3BY7 A; 3QJY A; 4OGE A; 2DBM A; 2L3S A; 2E41 A; 3X24 B; 2E12 A; 2JJ9 A; 1GFD A; 5CKB A; 2XG8 D; 3JCM f; 2RQT A; 1OPL A; 4C8Q D; 7AT1 B; 1M1K R; 4DBR A; 5FWC A; 4OMF B; 3DLM A; 2M02 A; 2RHZ A; 2HD0 A; 2CSI A; 4JS5 A; 3OYY A; 1VA7 A; 4AMC A; 2HKQ B; 2FZC B; 4OVA A; 3CCJ T; 3PVQ A; 2NUZ A; 3OYH A; 2J6F A; 3AHU A; 4HVV A; 1EX4 A; 5L8R E; 2X9H A; 3TRE A; 3UAT A; 2JW4 A; 2KK4 A; 4C5E A; 3V8L A; 3CPW A; 4KUI A; 1JJ2 S; 3LH0 A; 5CCA A; 4FSX A; 5C6S A; 4ESR A; 1X6B A; 1VQO Q; 3EHR A; 4C8Q E; 1QP2 A; 3MEV A; 4A4H A; 2OI3 A; 1AZE A; 3CCU A; 2XI9 A; 4FYV B; 2KAF A; 3HSB A; 2R5A A; 2EWN A; 4TVR A; 1Q82 C; 3OS5 A; 1LCK A; 2QA4 Q; 3JCM P; 4L6V 5; 1FXX A; 1OEB A; 4EDU A; 3FJP A; 3CC7 A; 1KC8 U; 3CCM A; 2ZCF B; 1U06 A; 4B6M A; 1X75 C; 4D8K A; 3E9F A; 3C12 A; 3M0Q A; 3DLL A; 4C92 D; 4JJB A; 1UTI A; 2RQU A; 1AWO A; 2EYQ A; 4RG8 A; 1OQK A; 3CME A; 3C4S A; 2P0K A; 1XOV A; 3M54 A; 1NPP A; 1UJY A; 2KGT A; 1VQO A; 1M3C A; 3J81 E; 3SEM A; 4N4I A; 1QW1 A; 4Z8A A; 3NFC A; 3IQL A; 1N9R A; 1WHH A; 3M0S A; 1Y07 A; 3VRZ A; 1RAA B; 4Z89 A; 2O2O A; 8ATC B; 4J9E A; 4X9D A; 5GAN f; 3E9G A; 5CQY A; 4C92 E; 1KQS P; 4A54 A; 3OYJ A; 3ASK A; 4ZNX A; 2RPN A; 2K3Y A; 3ME9 A; 4OML A; 4HVU A; 1BI3 A; 1XQH A; 2PTK A; 3UPU A; 3M0U A; 3CPW S; 1J3T A; 2M0Y A; 3AT1 B; 3CMA A; 1KSW A; 2NLU A; 1JB0 E; 1HD3 A; 2AZS A; 4XTW A; 4FIB A; 1K73 R; 3QBY A; 2VGN A; 2HEQ A; 3RDV A; 1N8R R; 5IHN A; 3CC2 T; 3OYD A; 5GMK h; 3M4Y A; 4M7A G; 1VOM A; 2V1Q A; 3REA B; 1JO8 A; 1IZ6 A; 3PMT A; 4PJO B; 2XK0 A; 2RQW A; 1RL2 A; 4OMP A; 4HKE A; 3OS0 A; 2KDS A; 2QDL A; 4M7A A; 2KSS A; 3MP6 A; 4XU2 A; 3CC4 A; 1MMD A; 1ZLM A; 1AHJ B; 2RNA A; 4F7U G; 1D0X A; 5EG2 A; 2X4W A; 3M55 A; 2RK2 A; 3TSZ A; 2MWP A; 3V8K A; 1PD0 A; 2LTO A; 4J6Y A; 4PJO C; 2DL3 A; 4E7L A; 4M7D F; 1QKW A; 3NTK A; 4HA8 A; 2QYZ A; 2QA4 T; 1RAC B; 4LUD A; 1M90 C; 1O9S A; 5LJ3 e; 2X35 A; 2K5L A; 4F7U A; 2BUD A; 5AYF A; 3RER A; 1M2V B; 2H3E B; 2PNI A; 3OQ5 A; 2MWO A; 3EAE A; 2VXF A; 3PFS A; 1UGQ B; 2JTE A; 4QVC A; 2Y4X A; 1M8M A; 1TTH B; 4PK4 A; 3JCM g; 1Y96 B; 3FB9 A; 2A28 A; 1TS9 A; 3OS1 A; 2JM8 A; 1TU0 B; 2J7I A; 3QYH B; 3V7R A; 2HKN A; 1VQ8 Q; 2YUQ A; 3J80 E; 1PWT A; 3OA6 A; 2E10 A; 1HSQ A; 2EYZ A; 4BD3 A; 1ZBX A; 3JSC A; 2O4X A; 3CXC P; 1F1B B; 1NM7 A; 2ZPB B; 5GAN 4; 2E5Q A; 4BE2 A; 2LCL A; 2E4H A; 3FC3 A; 1VYT A; 1NPR A; 4GBQ A; 1WHG A; 4M75 D; 1CKA A; 3S3O A; 5IH2 A; 2OTL T; 1K76 A; 1UHF A; 4BI8 B; 2P0P A; 2DEU A; 1U1S A; 3I35 A; 1VQ4 Q; 3GOX A; 3UT1 A; 2QDY B; 1D0Y A; 1SSH A; 4MML A; 2K2M A; 1ZSZ B; 2YLC A; 3OW2 P; 4E47 A; 3RBB B; 5GAM h; 4OMN A; 2ZPH B; 2B86 A; 2EYY A; 2EIF A; 3QII A; 2DEQ A; 2LRQ A; 2DIL A; 2MMP A; 2MOX A; 4MDW A; 4QQG A; 2A7Y A; 4LDW A; 5KYY B; 3OBW A; 1KQ2 A; 2KNB B; 2SRC A; 4M75 E; 3E2U A; 2RJC A; 1YJ9 Q; 1S72 A; 3HRU A; 2H8H A; 4BE1 A; 3EG2 A; 1UJ0 A; 3CCE Q; 3JRZ A; 1VIE A; 3QZ5 B; 1RAE B; 2VYT A; 2LX7 A; 2X4Y A; 2KQW A; 3EGX A; 2OTJ Q; 3GPL A; 1QVG A; 3TU4 K; 4GLM A; 4IKF A; 4QQD A; 1H3H A; 4M77 F; 1KC8 R; 3CD6 Q; 2CH4 A; 3EG9 B; 4M78 B; 3L2V A; 3V7S A; 4RTU A; 2HSE B; 1VQ4 A; 4N4G A; 2YRD A; 1G3W A; 3A5Z B; 2NUP A; 4RUG A; 4KH1 B; 1OU9 A; 4J7I A; 1M1K U; 2BZY A; 1YIT A; 5GAN g; 1GFC A; 3OYA A; 5KYN A; 5DLO A; 1WXB A; 4QKU A; 3JB9 F; 1I5L A; 1IRX A; 1Q7Y C; 2DO3 A; 1OPK A; 4ZGD B; 1WQW A; 1YJ9 A; 2VB6 A; 1SHG A; 2QQB A; 3NPF A; 2LJ3 A; 4CC4 B; 1TOV A; 3NMZ C; 2ROL A; 1UGP B; 1VQP Q; 1VQ8 T; 1C6V X; 3EG1 A; 2JM9 A; 2DIG A; 5A0D A; 3SDZ A; 3M5A A; 4AG1 C; 2KRS A; 3MET A; 2E1H A; 2L2P A; 3THK A; 2OTJ A; 3I9Q A; 3SB2 A; 3H6Z A; 2JT4 A; 3CD6 A; 1BI2 A; 1LNX A; 3G71 Q; 3TSW A; 4BDY A; 3GIB A; 1NJI C; 1G8X A; 2DMO A; 1V76 A; 2KMT A; 2DIQ A; 3EH1 A; 5GMK i; 2CSQ A; 2D8H A; 2FRW A; 2A36 A; 4F16 A; 2O88 A; 8AT1 B; 1WI7 A; 4XTZ A; 2W0Z A; 3VUB A; 2MAM A; 1YIJ Q; 2L3Q A; 5IXF A; 2EPD A; 3ZBD A; 1UB4 A; 3JCM Q; 4CC3 A; 4LDU A; 4JRP A; 1QVG S; 1KHI A; 5GAN j; 2K5F A; 3S3M A; 1YJN A; 4IUQ A; 3SHW A; 3HP9 A; 4JPB W; 4EMK A; 2EBP A; 2OAW A; 1G2B A; 1BIB A; 1BK2 A; 2KE9 A; 4LNP A; 1VQP A; 1YCY A; 2P84 A; 2RMO A; 1VYV A; 1KJW A; 1YJ9 T; 2RQR A; 1RAH B; 1WLP B; 3JCM h; 2QGF B; 1NEG A; 2JZ2 A; 3V8J A; 3CCE T; 3PT9 A; 2EJG A; 1Y71 A; 5GAN d; 3G71 A; 4C8Q F; 3EH2 A; 2EKO A; 3EFO B; 4Q5W A; 2GBQ A; 2DYB A; 3G6E Q; 4RKU E; 4M7D G; 3PGG A; 3ZFJ A; 4L59 A; 4Y28 E; 3CD6 T; 4DOW A; 1I0C A; 2ABL A; 1W70 A; 3RIR A; 5FRN A; 3PTA A; 1FWZ A; 2E65 A; 1YI2 A; 2EVR A; 4E6R A; 2K79 A; 2RJE A; 4M7D A; 5KH6 A; 1ZBJ A; 4JZ3 A; 4C0Z A; 3WVD B; 1UE9 A; 3R6N A; 1D1B A; 2KT8 A; 2YUN A; 3JCM X; 3HL8 A; 4JDS A; 3CBM A; 1HYO A; 2VWF A; 2QTV A; 1YBY A; 1WHJ A; 2R57 A; 3CBO A; 1N8R U; 3QSU A; 3H9N A; 5HKC A; 3JB9 D; 1OOT A; 4KRT A; 1IXD A; 3SWN B; 2QEX Q; 3SD4 A; 3VS2 A; 3OYF A; 4C0F A; 3LWH A; 1W2B A; 2AT1 B; 2MIO A; 3VV0 A; 5GJV B; 4A63 B; 1U3O A; 3PIP A; 2XHC A; 4HCB A; 1EZZ B; 4DQ2 A; 4J9C A; 4M78 F; 2JXB A; 3OYL A; 5HK0 A; 1WZO A; 2ZAE A; 4BE0 A; 4QVD A; 4C92 F; 3R6O A; 3ZL7 C; 3MEW A; 4A4E A; 3J7A F; 1NG2 A; 4FU6 A; 2RA2 A; 5CVI A; 2LMJ A; 3DB3 A; 4LE9 A; 1AZG B; 2W10 A; 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