The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
64
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structure length |
64
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Chain Sequence |
GAMGAKEYCRTLFPYTGTNEDELTFREGEIIHLISKETGEAGWWKGELNGKEGVFPDNFAVQIS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution Structure, Dynamics and Thermodynamics of the three SH3 domains of CD2AP
rcsb |
| molecule keywords |
CD2-associated protein
|
| source organism |
Mus musculus
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| total genus |
7
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| structure length |
64
|
| sequence length |
64
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-12-21 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1PRL C; 4ESR A; 5IHK A; 3REB B; 2GQI A; 4LNP A; 2KT8 A; 4JJB A; 4RTU A; 1K4U S; 2X3W D; 2EBP A; 2CT4 A; 1JU5 C; 2ENM A; 4GLM A; 2DNU A; 2EGA A; 2RMO A; 1QWF A; 3PVQ A; 1UE9 A; 3VS1 A; 5GJV B; 1UJ0 A; 2AZV A; 2DL8 A; 4CC7 A; 2HDA A; 4CC3 A; 4JJD A; 2F2V A; 2LQW A; 2DLP A; 1PKS A; 2KXC A; 1BB9 A; 2KT1 A; 3M0P A; 3PE0 A; 5ECA A; 1WI7 A; 3SHW A; 1AWJ A; 2L2P A; 2MCN A; 4F14 A; 1SPK A; 2CDT A; 1QKW A; 2NWM A; 3RBB B; 1SHF A; 2RF0 A; 4ZNX A; 3EG2 A; 2J6F A; 2HSP A; 4WCI A; 2CRE A; 4OML A; 5FWC A; 3UA6 A; 4F16 A; 3H0I A; 1CKB A; 2BTT A; 2RQW A; 1AZE A; 2AZS A; 1GCP A; 1KFZ A; 1K0S A; 2KXD A; 1ZUU A; 3VS6 A; 1SEM A; 2EKH A; 2O31 A; 2K79 A; 1AVZ C; 2A36 A; 1GCQ C; 2DL5 A; 2JS2 A; 1WX6 A; 2AK5 A; 3SEM A; 2K6D A; 2DF6 A; 3EHQ A; 5L23 A; 4CC4 B; 2F2X A; 4JJC A; 4GBQ A; 2ABL A; 3UAT A; 1UJY A; 2GTJ A; 2G6F X; 1CSK A; 4RTT A; 1M3A A; 4Z89 A; 1TG0 A; 3EHR A; 1AEY A; 2C0O A; 2L3Q A; 2FG0 A; 4AFS C; 1M3B A; 1SHG A; 2EW3 A; 2BZY A; 2VWF A; 2JS0 A; 1E6H A; 2DL4 A; 1AWO A; 2GGR A; 1XOV A; 1Y57 A; 1PNJ A; 1SRM A; 2CSQ A; 4R0K A; 4RTX A; 4LN2 A; 1Z9Z A; 2D0N A; 4J9I A; 2EQI A; 2KRO A; 1WFW A; 2K9G A; 2C0I A; 2FPE A; 1ARK A; 1UEC A; 3ULR B; 4JZ3 A; 2DYB A; 1V1C A; 4HVV A; 1OV3 A; 2A08 A; 3EG0 A; 4D8D A; 1WDX A; 2QDL A; 3O5Z A; 1ABO A; 1W70 A; 2KGT A; 1NYG A; 2CH4 W; 1UHC A; 2H8H A; 4HVW A; 2F2W A; 1KIK A; 2KNB B; 4F17 A; 2LQN A; 2BZ8 A; 1ZUK A; 2RNA A; 4J9E A; 5IXF A; 2P4R A; 1X69 A; 2GBQ A; 1KJW A; 2C0T A; 3H0F A; 2KR3 A; 4QT7 A; 4X1V A; 1I07 A; 1PRM C; 2CT3 A; 1WIE A; 3CQT A; 2EYY A; 1UGV A; 1QLY A; 4JZ4 A; 3EG1 A; 1X43 A; 2HEQ A; 2ECZ A; 4Y92 A; 1VA7 A; 1T0H A; 2J6O A; 2O88 A; 2FPD A; 1AWX A; 1BBZ A; 2DJQ A; 1T3S A; 1SSH A; 1T0J A; 4J9F A; 2W10 A; 2LNH B; 2JMA A; 1X2K A; 1J3T A; 1E6G A; 1MUZ A; 2J6K A; 3VS4 A; 1AZG B; 2D8H A; 1M3C A; 2DM1 A; 4RUG A; 1W1F A; 1YWO A; 1X2Q A; 2EGE A; 3H0H A; 4Z8A A; 2PZ1 A; 1OPL A; 1JQQ A; 4A63 B; 1UG1 A; 3I5S A; 1GBQ A; 4OMQ A; 2CSI A; 1QCF A; 3NMZ C; 2KRN A; 2LJ0 A; 3VS3 A; 1X6B A; 1OPK A; 2A28 A; 3RNJ A; 1PHT A; 1ZLM A; 2JM8 A; 4DEY A; 2YUP A; 2D1X A; 1M30 A; 2K7A A; 2RQR A; 2BZX A; 4J9G A; 2ROL A; 2LP5 A; 2RPN A; 4RTW A; 1PKT A; 1U06 A; 4KRT A; 4Z88 A; 3VS0 A; 4AFU C; 4AG2 C; 1G83 A; 1CKA A; 2IIM A; 4RTY A; 1G2B A; 2RN8 A; 1UHF A; 2KRM A; 2NUZ A; 2YUO A; 4J9D A; 1VYV A; 3QWX X; 1OOT A; 1A0N B; 3M0S A; 4LUE A; 1UTI A; 2VVK A; 2JMC A; 1QWE A; 4HXJ A; 2JW4 A; 2GTO A; 5IHI A; 1NLP C; 2ED0 A; 1GCQ A; 3UF4 A; 3JV3 A; 1M27 C; 3TSZ A; 4IIO A; 1MV3 A; 1WYX A; 2KYB A; 1WA7 A; 1ZX6 A; 1AWW A; 1BK2 A; 2YT6 A; 4EIK A; 1VYT A; 2FPF A; 2PTK A; 2HBW A; 4LUD A; 2KYM A; 1X6G A; 3FJ5 A; 2E5K A; 2PNI A; 2DMO A; 1NM7 A; 2RQU A; 1GRI A; 1KSW A; 2J7I A; 4J9H A; 1U5S A; 2DRM A; 1W6X A; 1GFC A; 2DA9 A; 2O2O A; 1HSQ A; 2HCK A; 2JXB A; 4RTZ A; 3M0T A; 2YUQ A; 1E7O A; 2YDL A; 4E6R A; 2M51 A; 3GBQ A; 2SRC A; 2V1R A; 2DRK A; 1H8K A; 2J05 A; 3C0C A; 1K76 A; 1BU1 A; 2JM9 A; 5I22 A; 2RQV A; 2L3S A; 1YP5 A; 2EYW A; 4M4Z A; 2CUB A; 3U23 A; 1VYU A; 2DBK A; 3M0Q A; 3NPF A; 3NHN A; 1JXM A; 2ROT A; 2DL3 A; 4RTV A; 2L0A A; 1ABQ A; 1GFD A; 2FRW A; 2J06 A; 2CH4 A; 3REA B; 1HJD A; 3ZL7 C; 1K9A A; 1B07 A; 2DL7 A; 1YNZ A; 2I0N A; 4J9B A; 3I35 A; 4D8K A; 2L3P A; 1EFN A; 1T3L A; 1NEG A; 2B86 A; 4ORZ A; 2VKN A; 2DVJ A; 2OI3 A; 3TVT A; 2YUN A; 2LMJ A; 1YCS B; 3IQL A; 4AG1 C; 1YN8 A; 4K11 A; 3UA7 A; 3VS7 A; 3NGP A; 2JTE A; 3TSW A; 1H3H A; 1RI9 A; 2X3X D; 2EYZ A; 3VS5 A; 1GL5 A; 2XMF A; 1WXT A; 2OAW A; 3VRY A; 4DEX A; 2DIL A; 1LCK A; 1JXO A; 2OJ2 A; 1GBR A; 1RLP C; 4HCK A; 5EC7 A; 1FMK A; 5IHN A; 2DE0 X; 2LCS A; 1K1Z A; 1N5Z A; 4CC2 A; 1NYF A; 1TUC A; 2RQT A; 1RLQ C; 1AOJ A; 2M0Y A; 1ZBJ A; 2AKK A; 2GNC A; 2JT4 A; 3VS2 A; 2KEA A; 1I1J A; 1NEB A; 1TUD A; 3EGU A; 4OMN A; 5FWB A; 2MIO A; 2A37 A; 2DX1 A; 2KE9 A; 4AFQ C; 1UUE A; 2MOX A; 4HVU A; 3EG3 A; 2YSQ A; 1ZSG A; 4J9C A; 2LJ1 A; 1SRL A; 1JO8 A; 3H41 A; 3M0R A; 2FRY A; 1OEB A; 5I11 A; 3R6N A; 2LX7 A; 1WXU A; 4LE9 A; 1K0X A; 2O9V A; 3KFV A; 5GJW B; 1JEG A; 1H92 A; 3A98 A; 4AFZ C; 2LZ6 B; 1IO6 A; 3THK A; 4OMM A; 1I0C A; 2K2M A; 1X27 A; 2O9S A; 1NG2 A; 5HCK A; 1Y0M A; 2LJ3 A; 2ESW A; 1S1N A; 1ZUY A; 1UFF A; 3PVL A; 1Z9Q A; 2AKL A; 1HD3 A; 1RUW A; 3I5R A; 1FYN A; 1YWP A; 1QKX A; 2KBT A; 4OMO A; 1PWT A; 5FW9 A; 1UDL A; 2K3B A; 2CUD A; 1U3O A; 3M0U A; 2FEI A; 1M8M A; 2SEM A; 2DBM A; 5IXB A; 2EVR A; 1MV0 B; 3I9Q A; 4FSS A; 1WXB A; 2EPD A; 4OMP A; 5IH2 A; 3QWY A; 2EGC A; 2KRS A; 2V1Q A; 1WLP B; 1AD5 A; 4IIM A; 3LH5 A; 1NLO C; 3VRZ A; 2EYX A; 2FO0 A; 1B3Q A; 2ED1 A; 4JPB W; 2W0Z A; 2D8J A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5IHK A; 4FT2 A; 3JB9 I; 1JJ2 P; 2KT8 A; 3F70 A; 4RTU A; 2X3W D; 4FT4 A; 2WAC A; 3CCU A; 1QWF A; 3ER0 A; 3VS1 A; 2X4J A; 4KT0 E; 1UJ0 A; 1VQ9 A; 2D9T A; 1KC8 R; 4C8Q B; 3FDR A; 2F2V A; 4ELY C; 3DLL A; 1QCN A; 3C4S A; 3M0P A; 2MWP A; 3MKD A; 1AWJ A; 2L2P A; 3C12 A; 4OB0 B; 2QEX A; 3RUX A; 2CDT A; 1VQ7 A; 1RAH B; 2NWM A; 2ZPH B; 5LL6 S; 2HMA A; 4ZNX A; 4A4G A; 2EJF A; 2DXC A; 4M75 A; 2CRE A; 1K8A U; 1DJ7 B; 1D0X A; 3UA6 A; 3PMT A; 4J7F A; 1GCP A; 4C0D C; 4DOW A; 1KFZ A; 1K0S A; 3EFR A; 4FU6 A; 3VS6 A; 3BE3 A; 1SEM A; 2R5A A; 4J8O A; 5A2Q E; 1WQ7 A; 3MHX A; 4PJJ A; 5FU6 C; 1VQ6 T; 5I21 A; 3EAE A; 2E41 A; 3EHQ A; 3CCS T; 3EGX B; 4GBQ A; 5IAY A; 2DEU A; 2GTJ A; 4LDW A; 2G6F X; 4RTT A; 3GF5 A; 3E2U A; 1TU0 B; 1EZZ B; 2RB6 A; 3HP9 A; 1P92 A; 3OBW A; 1WHM A; 1Q81 R; 2EW3 A; 5GAN 8; 2HD0 A; 4XU0 A; 2ZPG B; 4AMC A; 1VQ6 A; 4E7Z A; 1XOV A; 4BI4 A; 2K2V A; 3RIR A; 1YI2 Q; 5D7U A; 2AT1 B; 2EQI A; 2KRO A; 2P0K A; 2E3H A; 3VYG A; 1X6O A; 2CKK A; 1PC0 A; 2F5T X; 2QQ9 A; 1V1C A; 3CME T; 3X24 B; 3A8L B; 2YRD A; 3LX7 A; 3CEY A; 3CMA A; 3O5Z A; 1NYG A; 2H8H A; 1RAI B; 8AT1 B; 4F17 A; 1VQ4 A; 3FJP A; 1Q82 R; 4M77 F; 1H64 1; 3RDV A; 5I2M A; 3H0F A; 2KR3 A; 3JCM V; 5LJ3 d; 4BY6 C; 2EYY A; 4JZ4 A; 5D6Y A; 3EG1 A; 1X43 A; 2EQM A; 2VXE A; 3EH1 A; 2H3J A; 1IXD A; 2O88 A; 1Q82 U; 4JUV A; 4E7J A; 1B7T A; 4DA4 A; 1BBZ A; 3OYG A; 2DJQ A; 1T3S A; 1T0J A; 1SSH A; 2W10 A; 2Y4X A; 3L2W A; 2JMA A; 3HFN A; 4KBM B; 1E6G A; 2QG9 B; 4RUG A; 1Q82 C; 1IGU A; 1X2Q A; 2PZ1 A; 1JQQ A; 3G71 T; 3NMZ C; 1OYX A; 4KGX B; 1X6B A; 4M7A F; 4E7S A; 4M78 F; 3WVD B; 1WNL A; 5KYX B; 1ZLM A; 2JM8 A; 4DEY A; 2YUP A; 4D6W A; 2RQR A; 1OI1 A; 5KCH A; 1YJN T; 2NLU A; 2RPN A; 4ELZ C; 1D1B A; 1GXI E; 2QI2 A; 3VUZ A; 4LD6 A; 1PG5 B; 1OU8 A; 1D09 B; 1W4S A; 4FW2 A; 3CCM T; 1QVP A; 5GAN g; 3CC4 A; 4AG2 C; 2K5I A; 4PFO A; 4ZGE B; 2RN8 A; 2KRM A; 4OB3 B; 1D1C A; 3G71 A; 2NUZ A; 5A0G A; 2NUT B; 2QA4 A; 1TOV A; 1RAA B; 2YUO A; 1O75 A; 4PNO A; 3EGX A; 4C92 D; 2RH2 A; 1VYV A; 3EG9 B; 1A0N B; 3M0S A; 4LUE A; 2XG8 D; 2EAY A; 3HFO A; 3OSV A; 1V76 A; 2JMC A; 4HXJ A; 1TH7 A; 1NLP C; 4X34 A; 1WPY A; 3QO3 A; 5HK0 A; 4N4H A; 1VOM A; 2M0O A; 3V7R A; 4BDY A; 1Q7Y U; 4M77 C; 4JRI A; 1VQM T; 1D0Y A; 2FZG B; 4XTU A; 4QVC A; 1WJQ A; 2FPF A; 2M16 A; 4PJO E; 1HYO A; 2KYM A; 3FJ5 A; 4GLK A; 1FX7 A; 4MZT A; 1VQN Q; 1VQ8 T; 2VB6 A; 4KGV B; 1B34 B; 4J9H A; 2J7I A; 1QVF S; 1U5S A; 2DA9 A; 2QQR A; 2O2O A; 1Q7Y C; 3X25 B; 4FYX B; 4HCB A; 2O4X B; 2M1H A; 4ZGD B; 3M4G A; 4EMH A; 4LXC A; 3OBY A; 3OYB A; 4E6R A; 5LJ5 d; 2M51 A; 4X9C A; 2QK0 A; 2V1R A; 1VQM A; 2PVO B; 4J6Y A; 4BD3 A; 3TU4 K; 3OW2 P; 4BE0 A; 4L6V 5; 5GMK l; 2JN0 A; 4WTO B; 1VYU A; 1MND A; 2DBK A; 3M0Q A; 4PJO G; 2DL3 A; 2L0A A; 1BYM A; 5GAO p; 1JB0 E; 2JVV A; 2J06 A; 1YJW T; 1XQH A; 1HJD A; 3AHU A; 2L89 A; 2DTI A; 1YNZ A; 3CC7 Q; 2L3P A; 4M7A C; 2CP6 A; 8ATC B; 1KQS P; 3VUB A; 4M78 C; 3OW2 S; 3G6E Q; 4A4K A; 2OI3 A; 2DZ9 A; 1S72 T; 3CCQ T; 3CCE Q; 1SF9 A; 1VQK Q; 3MPU B; 4Y28 E; 4O6J A; 1H3H A; 3CCR T; 2X3X D; 4M75 F; 3OQ5 A; 3VS5 A; 3NTH A; 4ZGJ B; 2DKG A; 2PVD B; 1FWZ A; 2LVM A; 2DIL A; 3J81 E; 3LLR A; 1M4Z A; 1YJW A; 2F5K A; 3SFM A; 1KQS S; 3CCV A; 1KG1 A; 4PJO B; 2XK0 A; 4J6W A; 1GBR A; 5EC7 A; 4BB7 A; 5LJ5 j; 1TUC A; 2RQT A; 1PSE A; 4XTZ A; 3CCQ A; 3VS2 A; 3L2R A; 4XTX A; 1NEB A; 1LVK A; 3GLX A; 1TUD A; 3TEE A; 3OYL A; 3AT1 B; 2A37 A; 2YXY A; 5CQY A; 2E1H A; 2MOX A; 5CKH A; 5DM7 R; 3L1A A; 2H3E B; 3L2V A; 2DTO A; 1NBE B; 4J9C A; 1VQP Q; 1EIF A; 3H41 A; 1OEB A; 3EGD A; 1WXU A; 4DBH A; 3DLM A; 5GJW B; 2DER A; 1JEG A; 4MMK A; 3SWN C; 1RAE B; 1YIJ A; 2NUT A; 1I8F A; 5HCK A; 1Y0M A; 1S1N A; 4RMO A; 3PVL A; 2PUO B; 2YRV A; 5GAN 7; 3I55 Q; 1QKX A; 3MO8 A; 2OTJ Q; 3M56 A; 1YJ9 T; 4B9W A; 2FEI A; 4HCZ A; 4KGZ B; 1JRI A; 3J7A F; 1Y71 A; 4OVA A; 2EVR A; 2K57 A; 3CD6 T; 1AT1 B; 4FSS A; 5GAN 4; 5GMK i; 3H9N A; 2DZC A; 1WHH A; 3QWY A; 4FL6 A; 3OYC A; 2KRS A; 5GAM d; 4ZTJ A; 2V1Q A; 1W2B P; 1B34 A; 1AD5 A; 1QCO A; 4FYY B; 3O8V A; 1IRX A; 3UPU A; 5CKF A; 2D8J A; 3CCU Q; 2RO0 A; 4M75 C; 1K9M U; 1K4U S; 2JZ2 A; 1VQ9 Q; 2CT4 A; 2ZPI B; 4FW1 A; 3CXC A; 2ENM A; 3MP8 A; 4GLM A; 4PK4 A; 3NTI A; 5HK3 A; 1Y07 A; 2IPO B; 3PVQ A; 5HY6 A; 1W2B S; 3RKY A; 3CD6 A; 2AZV A; 3ZEH A; 2EQK A; 2HDA A; 2RM4 A; 3MCA B; 2O01 E; 4EDU A; 4IUT A; 2QEX Q; 1VQ7 Q; 3HHT B; 3H8Z A; 2CS7 A; 4M7D E; 3PE0 A; 5ECA A; 1WI7 A; 1YHQ T; 1V29 B; 2KY9 A; 3M57 A; 2P4T A; 5L8R E; 1Q95 G; 4EMK C; 1QKW A; 3RBB B; 1SHF A; 3JCM X; 2DD4 A; 3QXE B; 4V2S A; 2RJF A; 4OML A; 2EQJ A; 4PFP A; 3G4S T; 2QQS A; 4M77 D; 2AZS A; 2OX7 A; 1LJO A; 1OZ2 A; 3WXM B; 2QYZ A; 5C0M A; 2K79 A; 2COW A; 1AVZ C; 2A36 A; 3X28 B; 2AK5 A; 4PJO A; 3S3M A; 2HL3 A; 1TUG B; 2RHU A; 3QBY A; 4IUQ A; 2ABL A; 1QVG P; 2MPX C; 3UAT A; 3OS2 A; 1UJY A; 4HT8 A; 2K5F A; 2YWW A; 1QP3 A; 2RJD A; 1TG0 A; 3CPW S; 4IUP A; 5DLO A; 3G4S A; 2DPP B; 3VYH B; 4NL3 A; 4BI3 A; 3PT9 A; 1U1S A; 5GAO l; 1VQ6 Q; 3PFS A; 5D6W A; 3GP8 A; 1SHG A; 3VKI A; 2G3R A; 4OF1 A; 3QYG B; 3EH2 A; 3PIP A; 1M1G A; 3OYK A; 3JB9 F; 4IUV A; 3PMI A; 1SRM A; 4R0K A; 4J5Y A; 1Z9Z A; 4XTY A; 2K9G A; 4OGE A; 2FPE A; 2K5L A; 4M7A D; 1ZSZ B; 3M9Q A; 4JZ3 A; 4M78 D; 3CMA Q; 2DYB A; 3OMC A; 4PLL A; 1OV3 A; 3HTR A; 3EG0 A; 3JCM g; 1VQ4 Q; 2LRQ A; 1WDX A; 2WSF E; 2YLB A; 2RHZ A; 1W70 A; 5KYY B; 1BI2 A; 2CH4 W; 3SWN A; 4A54 A; 2MI6 A; 3L2Q A; 1ZUK A; 4C8Q C; 4J9E A; 1X69 A; 4DOV A; 4QT7 A; 1WIE A; 2DD5 A; 2ZPE B; 1UGV A; 3SB2 A; 1K8A R; 1M5Q 1; 3GIB A; 3CC2 A; 4C5H A; 3PIO A; 1WJR A; 1T0H A; 2OTL A; 3CCL A; 1OZ3 A; 2COZ A; 1JJ2 S; 2DVE A; 2FZK B; 2QTV A; 2EJ9 A; 4J9F A; 1BI3 A; 4Y91 A; 2R5M A; 4C92 B; 4KUL A; 4QQ6 A; 2MF2 A; 2J6K A; 2QXF A; 4BUG A; 2CZ6 B; 4E7K A; 4KH1 B; 2LTO A; 1VIF A; 2A7Y A; 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