2KUCA

Solution structure of a putative disulphide-isomerase from bacteroides thetaiotaomicron
Total Genus 34
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
34
sequence length
121
structure length
121
Chain Sequence
AQADGIAFRELSFPEALKRAEVEDKLLFVDCFTTWCGPCKRLSKVVFKDSLVADYFNRHFVNLKMDMEKGEGVELRKKYGVHAYPTLLFINSSGEVVYRLVGAEDAPELLKKVKLGVESEG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution Structure of a putative disulphide-isomerase from Bacteroides thetaiotaomicron
rcsb
molecule keywords Putative disulphide-isomerase
molecule tags Isomerase
source organism Bacteroides thetaiotaomicron
total genus 34
structure length 121
sequence length 121
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-02-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2kucA00
2FWFA 3QOUA 3RDWA 1ZZYA 5H5RA 1JLVA 1S3DA 3EE2A 3C7MA 4OFTA 4WF4A 5LCZA 3MNGA 4GF0A 1TKDB 5D8IA 4OWYA 3GL5A 4WR4A 1M7TA 4J2FA 1F3AA 2PUKC 3IC4A 4XS4A 3UAPA 3TRXA 4TW5A 5IOWA 2OBKA 3QDNA 1F9MA 4ZXGA 3RAZA 4OO4A 2C3TA 5DALB 5HFGA 1JLWA 3L9UA 3GSTA 3WD6A 14GSA 1QGVA 3ZVJD 1O6JA 1G6WA 1F6MC 2X99A 2YWOA 1FB0A 1OC9A 2PBJA 5AIXA 2H1DA 2P5QA 3ERFA 2P31A 2IFQA 2YCDA 3GTUB 4JZQA 4POMA 5EPFA 4KNDA 1O85A 3W6GA 3LGCA 1N8JA 4J57E 4KSMA 1G7EA 3HYPA 2YWIA 3QFAC 3F6FA 2RUEA 2CT6A 4XS4B 5FWGA 4HS1A 2XPDA 1GLQA 1SL0B 2IMFA 1S3AA 3KEBA 2JU5A 3ISOA 1ERTA 4EE0A 2HI7A 1EOGA 2H66A 1BQ7A 1PMTA 3FZAA 4ZILA 1OC9B 3LEFA 3RHBA 4KGIA 2XC2A 3RPNA 2B5EA 1O7UA 2DBCA 2OADA 2HNLA 2N5FA 4G19A 4KCEA 2IFQB 2DJ2A 4ZL7A 2R37A 4XS6A 3CSJA 4TRXA 1ERWA 1GWCA 4CDOA 1U88A 4XRAA 2YV7A 1UVZA 5IMCA 2QGVA 2HT9A 1OC8A 5ABRA 2ZNMA 2E2GA 4FYBA 3ZZXA 1SYXA 4MJCA 3DD3A 3WGXA 1MDIA 3GA4A 2AV4A 5J9BA 1GSUA 1AXDA 2DIZA 1MEKA 9GSSA 3TCOA 1M9BA 5ID2A 4OCEA 4KX4A 1BG5A 3PH9A 1DE2A 4PXOA 1PL2A 3A5WA 4AJ7A 1T7PB 2IMEA 1VGLA 2GSQA 1AW9A 4RI7A 2FA8A 5G5FA 2IJYA 4ECIA 3KMOA 3WYWA 4IQ1A 1HQOA 2IMDA 5DAKA 5DDLA 3QAGA 1FO5A 4K0NA 3H8QA 1V57A 4BA7A 3CYNA 4ZBAA 1EEJA 1M99A 3GH6A 2H75A 4XHMA 2KOKA 2WRTA 4BL7A 5ELGA 1A8LA 4MH3A 2WCIA 3WT1A 6GSYA 5F0GA 2OKAA 3APSA 1OE7A 1G6YA 2WJUA 2LNTA 3ERWA 3TJFA 5B6NA 2DSAA 2YZHA 2C8UA 1OYJA 1SENA 1TP9A 1SJIA 5IQYA 4FYUA 4DSSA 1JZOA 2YNXA 2WULA 4ZL9A 3VI5A 4ML6A 4TVEA 4GLTA 3GL3A 3HKRA 3SWLA 2FGXA 5DAKB 5AN1A 1GH2A 2KHPA 1TU7A 5ECOB 2C0FA 5ENUA 1SU9A 2HXKA 4XTSA 3Q19A 5INYA 2H0HA 2GQKA 3ZYWA 3GIXA 3BD2A 3HA9A 1EEMA 2XBIA 4DSRA 20GSA 3FW2A 3TDGA 2BTOT 1HNCA 2HRFA 5ECLB 3C8EA 3CSIA 4KDXA 2H74A 3TKSA 6GSUA 5KN1A 4DSSB 2FHEA 3L9SA 2L6DA 3TUEA 4NV5A 5FHIA 2MMAA 5G31A 5HFIA 3KMNA 1ZYEA 4GCIA 19GSA 3APQA 1SL2B 5GZZB 4QL9A 1XOBA 5J9CA 1Z6NA 2M72A 4IVFA 5EL8A 2VO4A 2VD0A 1SJ6A 1JZDA 2YP6A 2ZUPA 4HZ2A 1M2DA 1BYEA 1B4QA 5JCUA 3J7Yb 3D0ZA 3IK9A 2JSZA 2C80A 3EU4A 5EVOA 5F06A 16GSA 5HQPA 3M8NA 4FYCA 3QCPA 2LQQA 4MZBA 1OAZA 1AUCA 3DXBA 3LWAA 3F4SA 5F8BA 1GSFA 4BVYA 2PGTA 1W4VA 1O8XA 1PL1A 3CRTA 4PUFC 4JRRA 6GSTA 1MDKA 4MF5A 2VOCA 2GSTA 1EV4A 2OBIA 5ELAA 4IP1A 5D9WA 17GSA 4OO5A 3LQ7A 5DCGA 3QR6A 1O8WA 2LJRA 1TK0B 1JZRA 4K0GA 1URMA 2C0DA 4TN8A 4ISDA 2VCZA 4XRDA 4Q5QA 4KH7A 3QFBC 2HSYA 2YJ7A 2WS2A 4HI7A 1E2YA 2VL2A 2H1GA 1WPIA 2O85A 1WP0A 1T8EB 2A2RA 1SK2A 2PMTA 2VLTA 2IMIA 1SK1A 1GSQA 4JE1A 1XIYA 3ZVJA 2AYTA 4HDEA 1AQXA 1ML6A 2F8FA 4FO5A 2CX4A 4XCSA 1K0OA 3P8WA 4MZWA 3BBYA 1R26A 3HJOA 4EDZA 3EURA 2VM1A 3HXSA 3TB2A 1EWXA 3CTFA 3GHAA 5D93A 4NAXA 4PURA 2H0IA 4JR4A 1PD21 2AHEA 4KA0A 1EZKA 2LRTA 4EL1A 1G7OA 3UBLA 4MABA 4NMUA 4ZL8A 3I43A 1SKRB 3CXGA 1WRYA 3E9JB 4O32A 3D4MA 4KUNA 3LORA 2NTOA 2LQOA 5HR1A 2FD3A 1T00A 2WB9A 2I3YA 2LUSA 2DJKA 4MDCA 4KW6A 4L5LA 2J9HA 3GKMA 3KJYA 1X9SB 2B5XA 2TRCP 1HD2A 3W8JA 3QD9A 1KTEA 1JHBA 3A2WA 1WMJA 3QMXA 3KTLA 1K0AA 4BVXA 5CAXA 3S9FA 4NWYA 2CZ3A 1MDJA 3D22A 2GLRA 1EGRA 1J0FA 1I9DA 3BCKA 5G2ZA 3EMXA 3HZ8A 5F05A 4HJMA 1H4OA 2V1MA 3KCMA 3LSZA 4V2NA 3BJ5A 5IOXA 4G2EA 5DQSA 3G7JA 3K8NA 3KZQA 2L57A 3QAWA 2GZZA 2JZRA 2RM6A 3CTGA 5JCGA 3M3MA 2X8GA 3VWUA 1FOVA 1SJZA 6GSSA 3IDVA 1OVNA 2HE3A 3TJBA 1PGTA 3ZMLA 2RUFA 1U3IA 5G1LA 5ECIB 2I1UA 1KEBA 4LL4B 2JZTA 3AY8A 1EP7A 1LJRA 1T4ZA 1FHEA 2MMOA 3TKSE 1G0TA 2GVPA 2O8VB 4I8BA 1U3AA 3GMFA 3MSZA 2CQ9A 2DMLA 2R3XA 2R5GA 1USBA 1THOA 2P0GA 3HVVA 4V1Ap 1QXHA 2X8CA 4JBBA 2CA8A 1R5PA 1V58A 3P90A 1MTCA 2H73A 3F4RA 4XS1A 3GSSA 2OJLA 1WJKA 4WF5A 2VD1A 3LXTA 1X0RA 4H86A 3GH9A 3GFKA 3PGTA 1S3CA 2H6XA 2H76A 2ON7A 3Q74A 5JWQB 2MBSA 4AJ8A 5KN0A 1SD8A 1GSYA 4KB3A 2MZCA 1ZCPA 2VLVA 3WT2A 3VWVA 3FYGA 1Q4JA 4EVMA 4O92A 4MF7A 2OA7A 1IYIA 1NSWA 1Y6EA 2BJXA 5GSTA 4IBPA 1A23A 1PX6A 1XBSA 5ECNB 1U87A 1NHOA 4ZBDA 3US3A 3TJKA 2GZPA 1UC7A 2HYXA 4GSSA 5KN2A 2JACA 4F0BA 2VUPA 4MJBA 4N0ZA 4HOJA 3ZREA 4LL1B 3IXRA 4KAEA 2MYGA 4WEYA 2GQMA 2N5BA 3DVWA 5DJLA 1IYHA 3EVIA 2QSIA 4K8MA 1NM3A 3IRAA 2V2GA 5JWOB 2I9HA 5CP1A 5IMAA 1VRSD 4L5OA 3IR4A 2C0EA 2NPBA 1AQWA 3ED3A 1OKTA 4TXVA 3EWLA 3GYKA 5GAPD 1GSEA 1GLPA 3GURA 4X43A 4IGJA 3IE3A 3UJ1A 1K3YA 1RQMA 2L59A 4MJAA 4KDYA 5CRDA 1XWKA 2G2QA 5A4VA 3KH9A 3DIEA 3NOFA 3VK9A 1Y25A 2IWTA 1YJ6A 3HCZA 1XVWA 1WE0A 2F51A 2IL3A 4EDYA 4GSTA 4PGTA 4MPFA 3D5JA 2DMMA 3TRQA 4EO3A 3WGDA 2QC7A 1Z6MA 2VIMA 4RUVA 4IHUA 1DBYA 1GTIA 2VL9A 1ERUA 2VCXA 3L78A 4MK3A 5LD0A 4RI6A 4TR3A 5ID2B 3J7Yk 1VF2A 4F82A 1LU4A 2EIRA 4E8EA 2GDRA 1ZOFA 3UARA 4HQZA 3KP8A 4ZB9A 1B8XA 3FHKA 2VCQA 1B4PA 4XIHA 3H93A 4K6XA 4JU5A 3CRUA 4MJEA 2V41A 4NXIA 2X8HA 5ECPB 1TK5B 4DSQA 3D4TA 4KDUA 5CREA 1R4WA 3LG6A 1A2MA 4F03A 3CMIA 4IKHA 4JEDA 3H79A 5H5QA 3V1WA 1WIKA 2LSTA 1YY7A 4GTUA 4PX1A 4YAVA 3UBKA 4I5QA 4J56E 1ILOA 2N5AA 1A8YA 1X5CA 1YF1A 1Z5YE 1GUMA 5CNWA 2K18A 2FCHA 4NHWA 5L71A 4F2IA 4IW9A 5EY6A 2YN1A 2LJKA 4LLRA 4HUAA 2H70A 2TRXA 2IPAA 1TU8A 3LXZA 3DMLA 13GSA 3UEMA 1TOFA 3R2QA 1XVQA 4AF2A 4AJ6A 1J08A 3ZTLA 1K0NA 4KCAA 4YQVA 1BAYA 5J4UA 2OE3A 3TKRA 2AB6A 3F9UA 4MLYA 2VAFA 1A2JA 4TOPA 2C3NA 3PR8A 3VLNA 4V2LA 1YKAA 5JCWA 3TGZA 3CBUA 2ZCTA 2FA4A 4QQ7A 5ECSA 4YQUA 4V1Ag 2CVKA 2LTKA 5JWRB 2MMZA 2K8SA 4G10A 3GV1A 1GTAA 2CVDA 4OFNA 5D73A 5B6MA 2L4CA 5DCHA 5LNKe 4MP4A 5IMZA 1R5AA 4ECBA 1FVKA 2H1AA 1SD9A 4N11A 2MMNA 4I2UA 1JFUA 1T4YA 1PN9A 1Z7PA 4MPGA 2KP1A 2YJHA 3RBTA 4E8HA 4P3YB 2R4VA 2TIRA 2M46A 2I4AA 3MAKA 5AGYA 1Z3EA 4ILFA 4CW9A 4PNGA 5F07A 2GS3A 1M0UA 1UA5A 2K6VA 5CO3A 2V6OA 1ZGNA 2VM2A 4WBJA 4ZBBA 4G9HA 5D9XA 1XOAA 3IOSA 4F0CA 4GXZA 4D73A 3G7YA 2GT5A 2XHFA 5ECRB 2YWNA 4V2MA 2DJJA 3ZITA 4PNFA 3DGQA 4KSOA 1RK4A 1HNAA 1ZL9A 4OFMA 2WZ9A 3ZIVA 4NPBA 2EIQA 1YKCA 4WBRD 4BWSA 2IMKA 3A2VA 2AUVA 5IO0A 3LYKA 5AISA 3ME8A 1A2LA 2GQLA 3M0FA 5HR2A 2PVQA 2CX3A 4D73B 3DKSA 3FR3A 1QQ2A 3FZ4A 4O7HA 3VURA 2HZEA 1YF0A 2B1LA 3M1GA 3C71A 5CYYA 1DUGA 1TI1A 4N30A 4YQMA 4Q5RA 3EMPA 1X9WB 2HLSA 1V40A 3C1SA 4K7IA 5FT3A 3TKSC 1FW1A 3Q18A 4WXTA 4K7NA 1I5GA 1YQ1A 2C0GA 3KIJA 3WGEA 1TTZA 2REMA 3ZLPA 1GUKA 1EOHA 1F3BA 4EXJA 4KE3A 2RLIA 1THXA 4X0XA 2ES7A 4Q5NA 3C1RA 3FY7A 2R6KA 3GKKA 2C4JA 1F2EA 1PX7A 5ECHB 2HZEB 1CQGA 2DLXA 3IA1A 2PERA 4OMVA 1GL8A 3L0HA 2ON5A 2VCTA 5CRWA 2BMXA 2CAQA 5G1KA 3IV4A 4QL7A 2C1YA 3IK7A 4LMVA 3MDKA 1ST9A 1O73A 3M9KA 4N0VA 2HZFA 1XFLA 3H1NA 4HU7A 4BPYA 3U6VA 3FRCA 1PSQA 1H75A 2IIYA 5DVBA 1A0FA 5B7CA 1GSDA 1M2AA 1XW5A 2R2JA 2KLXA 1GUHA 4MCUA 3HJPA 1FB6A 2L6CA 3IAS2 3TOUA 3EC3A 2GZYA 2K8VA 3DYRA 2GT6A 3O76A 2HSHA 2DJ0A 3I69A 3KD0A 3TKQA 3UVTA 1M2BA 5D9VA 3GTUA 5CRHA 1K0MA 2B1KA 3TKPA 2XPEA 2LV3A 1Z9HA 2VL2C 3KXOA 4I2TA 4ACSA 4EUYA 4EKZA 5G30A 4HJ2A 3D21A 1TXXA 2FY6A 3M9JA 4RQRA 2EIOA 4O5RA 2FWGA 4K1FA 2H6YA 4IS0A 4FIWA 3P7XA 3GN3A 4BWQA 18GSA 3LJRA 2DC5A 4PQHA 2LJAA 3PINA 1XWAA 3QPMA 1YEPA 1A24A 5IMDA 2VCWA 5C00A 1XWCA 2F9SA 1A0RP 4ZB6A 4FH8A 3TJJA 4ZIJA 1KNGA 2H8LA 1PRXA 2B7JA 1M9AA 3FKFA 4K9ZA 11GSA 2K9FA 3IAM2 1PA3A 3F3QA 4ECJA 3HDCA 1AIUA 1KBNA 1PKZA 2YOIA 2F3MA 7GSSA 1ON4A 4TR1A 3N9JA 1VF1A 3IPZA 2P5RA 1XWBA 3A2XA 4X1UA 1DE1A 2OACA 1GP1A 2NDOA 3C73A 3UMAA 2NVLA 4YAPA 1GULA 2B7KA 4Q5FA 3L4NA 1EP8A 1HYUA 2E0QA 3SBCA 4MA9A 3NIVA 5ECQB 4DVCA 4WR5A 1X9MB 2B6MA 3ZRDA 2B5YA 1K0CA 1XW9A 2JL4A 4DEJA 3HZ4A 1VF4A 3GX8A 1GTUA 3FR9A 4TR1B 3OR5A 3HY2A 1RW1A 1W89A 5ECMB 3F0IA 3MWHA 3HVXA 4K2DA 5IPGA 2G0FA 2H30A 3DWVA 4I97A 2PU9C 1TJDA 22GSA 4RQXA 4EC0A 1PQNA 2XBQA 1X5EA 1FVJA 1HNBA 1SKWB 5D9TA 4WETA 2GTUA 3APOA 1NW2A 1TI3A 3E3EA 2YPMA 4IP6A 2DJ3A 3RHCA 2H01A 3H4KA 1ACVA 2WGRA 2MBTA 3FZ5A 3TOTA 3O3TA 2FNOA 4TKYA 2C3QA 2H1BA 3O6TA 1XWGA 2DJ1A 2X64A 1F37A 1B9YC 1WOUA 5A4WA 3I6AA 2JZSA 3LFLA 2YZUA 2H72A 1GRXA 1ZMAA 2FUG2 4GWRA 2IN3A 5J5NA 4GQCA 4OD7A 4HQSA 1O81A 1FAAA 3HHVA 4GRFA 2CAIA 3TJGA 2OE0A 1AC1A 4IELA 5KN3A 4I6XA 3U5RE 2D2ZA 3FZ9A 2KUCA 3IHQA 3KP9A 3ME7A 3JCML 4GQFA 1CQHA 1SL1B 2A2SA 4POKA 3ZIJA 1E6BA 3F4TA 1V98A 4HZ4A 2A4VA 4TR0A 5B8AA 1AAZA 3D6IA 3ZFLA 1GNEA 5IM9A 3ERGA 2FLSA 3G9BA 3N5OA 1BJXA 2YANA 2H6ZA 3HJMA 4L0UA 4PUAA 1ABAA 2JSYA 3DEXA 4TR4A 5C04A 2CZ2A 2GSSA 3HVSA 4MH2A 1YEXA 3EINA 3W8SA 1V2AA 1T3BA 4POLA 3KM6A 12GSA 3KTBA 2HFDA 5H5SA 4EF0A 1TRUA 4ECCA 4LA1A 1SK0A 3KGKA 2AJQB 3ZL5A 2V32A 5G5EA 3FK8A 1QUWA 1XXUA 3CSHA 4ZB8A 1NHYA 1B48A 4ID0A 1OE8A 2V6KA 5DJMA 2CV4A 2VCVA 2PN8A 2LRCA 1SKSB 1ZYQB 5HR3A 5KEJA 3UL3A 1AQVA 3P2AA 3F8UA 4MMMA 5DQYA 5A4UA 5HFKA 1XW6A 2GSRA 5IMFA 4IJ3A 3VI7A 4TXOA 3GNJA 4IQAA 1Q98A 2B3SA 1SYRA 3G7IA 3NZNA 1TRSA 2ALBA 3UIWA 4PQIA 4L0WA 2AAWA 1UN2A 2VL3A 3FR6A 5GAND 4ULXA 4NV2A 3VWXA 5IPHA 5GSSA 1DSBA 3FEUA 2L4QA 3TRPA 1U6TA 6GSWA 1BX9A 1FG4A 4YH2A 1QFNA 1XZOA 2O7KA 4IJIA 3QAVA 2F8AA 5A5KA 2I81A 1Z7RA 1MD3A 3ZMKA 5COHA 1GTBA 3GUSA 4AGSA 2L5OA 2H0GA 1GNWA 2O87A 2WFCA 4IN0A 1GSSA 4TXOB 1BEDA 3F3RA 1V9WA 10GSA 4ML1A 2JADA 1MD4A 2PPTA 1XPVA 3BOAA 4POBA 1TDIA 5ECKB 4PQ1A 1VF3A 2LNSA 3BCIA 4CHSA 1T1VA 2EC4A 3DRNA 4JR6A 2CVBA 2OE1A 2KP2A 3EU3A 1X5DA 3LYPA 1YDKA 2M80A 5B8BA 3UVHA 1K0DA 4HEA2 1C72A 1LBKA 4N10A 4GSNA 1OC3A 2QKEA 2HRNA 1R7HA 1J9BA 2GGTA 2RM5A 4MZCA 3GRXA 4L8EA 1QMVA 4MF6A 4Z7XA 5IIZA 2LKUA 6GSVA 2L5LA 2NBSA 3UOMA 6GSXA 2H71A 3I9V2 5HR0A 2Z9SA 1JZWA 2PWJA 2RIIA 5D96A 2FWHA 3VPTA 1B9XC 3GKNA 2LRNA 2H19A 3ZFBA 2DIYA 1OKDA 2J23A 3VFIA 5J3RA 3A3TA 1K3OA 3VWWA 4K7OA 3F63A 4WKWA 2E7PA 1QK8A 1TRVA 3VPQA 1ERVA 2LEGA 1EV9A 1K3LA 2PVOC 2WDUA 5J41A 3GKXA 2O89A 3GX0A 3IBHA 5IO2A 3L9VA 1WWJA 3F6DA 4F9ZA 4LMWA 4NHZA 1PKWA 3HD5A 1TW9A 1K0BA 2YV9A 5E59A 2FWEA 4HU9A 1YZXA 3RPPA 4OCFA 1XCCA 1N2AA 5DBQA 1TRWA 3E0UA 3KH7A 8GSSA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#similar chains, but unknotted
...loading similar chains, please wait...
#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite