The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
2
|
sequence length |
60
|
structure length |
60
|
Chain Sequence |
MKTGIVNVSSSLNVRSSASTSSKVIGSLSGNTKVTIVGEEGAFYKIEYKGSHGYVAKEYI
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution Structure of CpR82G
rcsb |
| molecule keywords |
Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase doma
|
| molecule tags |
Toxin
|
| source organism |
Clostridium perfringens
|
| total genus |
2
|
| structure length |
60
|
| sequence length |
60
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-05-21 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2YUN A; 4K11 A; 2AK5 A; 2EQI A; 4FSS A; 4QT7 A; 4AG2 C; 3EHR A; 3PVL A; 5I11 A; 2M0Y A; 5GJW B; 1NM7 A; 1YCS B; 2J06 A; 2LCS A; 4F17 A; 2ED0 A; 2EYY A; 2BZY A; 2X3W D; 1GFD A; 2KYM A; 1AZG B; 1PKS A; 3QWY A; 1SSH A; 2YUP A; 2GGR A; 3KFV A; 3TVT A; 1TUD A; 1K9A A; 3I5S A; 2RQR A; 3EG2 A; 1AWO A; 1JU5 C; 1I0C A; 2VKN A; 5FWC A; 2PTK A; 1T0J A; 1FYN A; 1QCF A; 4JJB A; 2KT8 A; 2B86 A; 2OAW A; 2C0I A; 2D8J A; 2SRC A; 3M0Q A; 2KRN A; 1K76 A; 2AKK A; 2K79 A; 1AEY A; 3NMZ C; 1UTI A; 3I9Q A; 1JQQ A; 2DVJ A; 1X27 A; 1SHG A; 1PHT A; 2L3S A; 2K2M A; 4OMM A; 4AFS C; 2NUZ A; 2RPN A; 2KRO A; 1H92 A; 1UHC A; 1PRL C; 2BZ8 A; 3QWX X; 4AFQ C; 2V1R A; 2JXB A; 1RUW A; 3NGP A; 1ZUK A; 2ECZ A; 2JTE A; 2ABL A; 4OML A; 1PKT A; 2FRW A; 2O9V A; 2K7A A; 1X43 A; 1M30 A; 1HJD A; 5EC7 A; 2KGT A; 1NYG A; 2CSQ A; 2LJ3 A; 3PVQ A; 2ROT A; 1JO8 A; 4JJC A; 1SRM A; 1NLO C; 3VS4 A; 4Z88 A; 1YWO A; 3TSW A; 1T3S A; 5ECA A; 2DYB A; 1ARK A; 2DX1 A; 2YUO A; 1N5Z A; 2A37 A; 2LNH B; 5L23 A; 2HDA A; 2E5K A; 1NLP C; 2KXC A; 2SEM A; 2DL7 A; 2K9G A; 2AZS A; 1GBR A; 1H8K A; 3GBQ A; 3EG0 A; 2BZX A; 2KE9 A; 1HSQ A; 2KNB B; 1E6H A; 3VS6 A; 1ZX6 A; 2L3P A; 2ROL A; 2EYX A; 1NEG A; 5I22 A; 1M27 C; 2MCN A; 1AWW A; 2D1X A; 2CT3 A; 1KIK A; 4A63 B; 3PE0 A; 3REA B; 2YUQ A; 1W1F A; 2MIO A; 2KYB A; 5IHK A; 2DLP A; 2CH4 W; 1WIE A; 2V1Q A; 2EW3 A; 1YP5 A; 2F2X A; 2IIM A; 3EGU A; 3VS7 A; 1FMK A; 1RI9 A; 1B3Q A; 2HEQ A; 4RTU A; 4RTZ A; 2EVR A; 2F2W A; 2JT4 A; 1WLP B; 2ENM A; 2DJQ A; 4R0K A; 2J05 A; 3U23 A; 2A36 A; 1GCQ A; 1T3L A; 1WXB A; 2ESW A; 2VWF A; 2W0Z A; 3EG1 A; 1KFZ A; 2CSI A; 1YN8 A; 1M3B A; 1ZSG A; 1B07 A; 2JMA A; 3NHN A; 2DL4 A; 1GBQ A; 2HBW A; 3H0I A; 2CUD A; 4HVW A; 3RNJ A; 2QDL A; 2DMO A; 1I07 A; 2OJ2 A; 4F14 A; 4LNP A; 2X3X D; 4OMN A; 1S1N A; 1UFF A; 1VYU A; 2CT4 A; 2DF6 A; 3VS5 A; 4J9C A; 4ZNX A; 1K1Z A; 1J3T A; 2DA9 A; 4RTW A; 2O31 A; 1NEB A; 2A08 A; 4EIK A; 4LE9 A; 3VS1 A; 1U3O A; 4OMQ A; 3CQT A; 2EKH A; 1LCK A; 3SEM A; 5IXF A; 1ABO A; 5GJV B; 3M0S A; 2JS2 A; 2KT1 A; 1Z9Z A; 1OPL A; 1YNZ A; 2BTT A; 2H8H A; 4HXJ A; 4JZ3 A; 4CC2 A; 1UJ0 A; 3UA7 A; 2VVK A; 1WDX A; 2RMO A; 3THK A; 1ZBJ A; 2ED1 A; 1AOJ A; 2L3Q A; 1WA7 A; 1BK2 A; 2LQW A; 2GBQ A; 1AWJ A; 1ABQ A; 1NG2 A; 4DEX A; 2DM1 A; 1U06 A; 2NWM A; 4Z89 A; 3VRY A; 1OOT A; 2DBK A; 2O88 A; 4J9E A; 1RLQ C; 1BB9 A; 2J6K A; 1H3H A; 2I0N A; 3H41 A; 2DRK A; 2JM8 A; 4J9G A; 1UDL A; 2DL3 A; 4LN2 A; 4OMP A; 2RQW A; 4J9D A; 2JM9 A; 2HCK A; 3RBB B; 1TUC A; 4KRT A; 1OPK A; 1W70 A; 2YT6 A; 4HCK A; 3FJ5 A; 4JZ4 A; 4J9I A; 2KRM A; 2FPF A; 2FRY A; 4LUE A; 4RTV A; 2FPD A; 1M3A A; 1JEG A; 1X6G A; 1M8M A; 1ZUU A; 1XOV A; 1QWF A; 3JV3 A; 4AFU C; 1UUE A; 4Y92 A; 2EGA A; 1WXT A; 2CH4 A; 2K3B A; 1GCP A; 4J9H A; 2PNI A; 5IHI A; 2GTJ A; 1VYT A; 1W6X A; 1MUZ A; 2RF0 A; 5IHN A; 1M3C A; 2DBM A; 1YWP A; 3H0H A; 1UG1 A; 4RTT A; 2YSQ A; 1U5S A; 4ESR A; 1CSK A; 1SPK A; 1K0S A; 2P4R A; 1AVZ C; 2RN8 A; 1Y57 A; 1QLY A; 1UE9 A; 2LP5 A; 3M0R A; 2LQN A; 1G2B A; 3REB B; 2HSP A; 1SEM A; 4JPB W; 1OEB A; 2KBT A; 5HCK A; 2J6O A; 2EGC A; 1MV3 A; 2RQV A; 2LMJ A; 2W10 A; 3SHW A; 4AFZ C; 1G83 A; 2D0N A; 2J6F A; 2A28 A; 2DRM A; 2GNC A; 3EG3 A; 1Z9Q A; 2YDL A; 2EPD A; 1PRM C; 1JXO A; 4D8K A; 1UEC A; 1OV3 A; 1E7O A; 1QKW A; 4RTX A; 1SHF A; 2JMC A; 4IIO A; 2L2P A; 3I35 A; 1GL5 A; 1AZE A; 4WCI A; 1RLP C; 3M0P A; 1QWE A; 2JW4 A; 4HVV A; 2F2V A; 2K6D A; 1SRL A; 2GTO A; 1K4U S; 2EBP A; 1T0H A; 1UHF A; 4M4Z A; 2KR3 A; 1HD3 A; 2RQU A; 3M0T A; 3O5Z A; 4J9B A; 1E6G A; 2EGE A; 1X69 A; 2KEA A; 3ZL7 C; 1AWX A; 1KSW A; 1X6B A; 2O9S A; 3M0U A; 2EYW A; 2DL8 A; 3VS3 A; 3I5R A; 1MV0 B; 2DIL A; 3LH5 A; 3UAT A; 1AD5 A; 1JXM A; 1CKA A; 2DL5 A; 4D8D A; 2L0A A; 1WX6 A; 2DNU A; 1V1C A; 1K0X A; 4E6R A; 1X2Q A; 3VS2 A; 2OI3 A; 2O2O A; 3TSZ A; 1BBZ A; 1PWT A; 3H0F A; 2AZV A; 2G6F X; 1GFC A; 2LX7 A; 4F16 A; 1TG0 A; 1UJY A; 1EFN A; 2MOX A; 2XMF A; 2KRS A; 2C0T A; 4IIM A; 1IO6 A; 2RQT A; 2FO0 A; 4Z8A A; 2FPE A; 4JJD A; 1WI7 A; 4OMO A; 1PNJ A; 1WXU A; 1Y0M A; 3VRZ A; 1VYV A; 1A0N B; 3IQL A; 3EHQ A; 5IH2 A; 4RUG A; 2D8H A; 1KJW A; 2J7I A; 1WFW A; 2CDT A; 4LUD A; 2JS0 A; 1ZUY A; 3R6N A; 1I1J A; 1X2K A; 1WYX A; 2DE0 X; 2EYZ A; 2M51 A; 5FWB A; 2GQI A; 2PZ1 A; 4RTY A; 2LJ0 A; 1ZLM A; 2FEI A; 1BU1 A; 4J9F A; 3NPF A; 3UF4 A; 3C0C A; 3UA6 A; 3VS0 A; 4CC3 A; 5FW9 A; 1VA7 A; 4CC4 B; 4GBQ A; 4GLM A; 2AKL A; 4AG1 C; 1GRI A; 2C0O A; 2KXD A; 2RNA A; 4CC7 A; 1NYF A; 2LZ6 B; 4DEY A; 3A98 A; 5IXB A; 4HVU A; 2LJ1 A; 2CUB A; 1UGV A; 1CKB A; 3ULR B; 1GCQ C; 1QKX A; 2CRE A; 2FG0 A; 4X1V A; 4ORZ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2YUN A; 2AK5 A; 3LGL A; 1PSF A; 1OX9 A; 3VYH B; 4FSS A; 3OYC A; 5I11 A; 1RAA B; 4LDU A; 3FEO A; 4E47 A; 2EYY A; 4M78 E; 1G5V A; 2KYM A; 3L2W A; 1YI2 T; 2DFU A; 2ZPH B; 3QSU A; 3DB4 A; 4BDZ A; 1PKS A; 2GGR A; 2HAX A; 3TVT A; 1K9A A; 4DBR A; 2QEX Q; 3I5S A; 2DD4 A; 1AHJ B; 2OTL A; 1AWO A; 1JU5 C; 1G3Y A; 2PTK A; 3G4S Q; 3CCV A; 1FMW A; 2KT8 A; 5GMK h; 4PFO A; 3CCM T; 2B86 A; 2C0I A; 3CXC A; 3NMZ C; 2DVJ A; 1YIT T; 2NUZ A; 2EWN A; 2RPN A; 4RKU E; 2RHX A; 2WSC E; 4Z02 A; 1UHC A; 5LJ3 h; 1PRL C; 3GLX A; 3H9N A; 5HK3 A; 4C92 D; 1O9S A; 5KYN A; 2DYI A; 1RUW A; 3TRE A; 3M54 A; 4C92 B; 1UB4 A; 5GAO r; 5DM7 R; 2FRW A; 2QXF A; 2X9H A; 3CD6 Q; 2O9V A; 2K7A A; 1X43 A; 2K3Y A; 1K8A C; 1M30 A; 1ZHI A; 3OB9 A; 2QGF B; 3CME T; 4M7A F; 5GAM g; 3HRU A; 2RJC A; 3M55 A; 4MZP A; 4JS5 A; 4FCY A; 8ATC B; 2CSQ A; 5KE3 A; 2ROT A; 2Y90 A; 4KH0 B; 4EMK A; 3EFR A; 5HK0 A; 1WQ7 A; 1KD1 U; 1OZ3 A; 3NTK A; 1W2B S; 1NLO C; 2ZPI B; 3VS4 A; 1M90 U; 1Q7Y C; 3G4S A; 2F5K A; 4PJO E; 2A37 A; 3LH0 A; 4NL2 A; 2KXC A; 2SEM A; 2K9G A; 1YCY A; 3OYD A; 1KQS P; 1GXI E; 4M77 G; 1B7T A; 3GBQ A; 2K5L A; 3EG0 A; 2LQ8 A; 3OYE A; 2BZX A; 2KE9 A; 3VS6 A; 1ZX6 A; 5GMK l; 3P8B B; 2D1X A; 2CT3 A; 3CCQ T; 3REA B; 3INZ A; 3FC3 A; 1QVG S; 4C8Q G; 2V1Q A; 4M7D G; 3GF5 A; 2F2X A; 2X4X A; 3QBY A; 3EGU A; 3VS7 A; 3CD6 A; 1B3Q A; 3E2U A; 1RAF B; 4ZN1 A; 1VQ4 Q; 4RTU A; 3CPW P; 2EVR A; 3MKD A; 4PFP A; 3JCM V; 3JRZ A; 1WLP B; 3QG1 A; 1D0Z A; 4OMF B; 1FX7 A; 2J05 A; 1ZBX A; 2A36 A; 1GCQ A; 2HD0 A; 2CSI A; 1KD1 R; 1QP2 A; 3A5Z B; 3A1P A; 3OSV A; 1YN8 A; 1IHW A; 1WJS A; 1B07 A; 2DZ9 A; 3NHN A; 4XU1 A; 3CC7 A; 3JB9 H; 4GY5 A; 5LJ5 h; 3QZ5 B; 2HBW A; 1C1A A; 5HY6 A; 4DOV A; 1Y07 A; 1D1C A; 2ZPE B; 1I07 A; 2OJ2 A; 4M7A B; 4C0D C; 4F14 A; 4BDY A; 2X3X D; 1VQ6 T; 1UFF A; 4J9C A; 2MAM A; 3CCJ A; 4JRQ A; 3CCL Q; 2G3R A; 1WJQ A; 1B34 B; 5GAO q; 3CCM Q; 3SEM A; 5IXF A; 5GAN d; 4VUB A; 2OX7 A; 2D6F A; 1TS9 A; 1UGQ B; 1NJI U; 2Y4Y A; 5CK9 A; 5IAY A; 4M78 F; 2KSS A; 1YIT Q; 1YNZ A; 2BTT A; 4HXJ A; 4P5N A; 5GMK j; 2BIV A; 2RB6 A; 3MP6 A; 3QYG B; 3UA7 A; 1VQ4 A; 2RMO A; 2CP6 A; 1Y71 A; 3PMT A; 3OYY A; 3CC2 A; 2QYZ A; 3OW2 S; 1VQN Q; 1IRX A; 4Z89 A; 1OOT A; 4QW2 A; 2IPO B; 3CBM A; 5LJ3 j; 3EFO A; 1YJW T; 2J6K A; 2I0N A; 3H41 A; 1VQO Q; 3C95 A; 2DL3 A; 4E7Z A; 2LC4 A; 5DLO A; 3PTA A; 1TOV A; 1BCO A; 1TUC A; 4KRT A; 1YI2 A; 1M90 C; 4HCK A; 8AT1 B; 1KQ2 A; 4ZTJ A; 1F1B B; 1JEG A; 1X6G A; 3X20 B; 1U8R A; 4J83 A; 4C5G A; 4M75 E; 3UT1 A; 3CCM A; 1LVK A; 1QWF A; 3JAM E; 1H64 1; 2VGN A; 5GAN e; 2K5I A; 4J9H A; 1NJI R; 5CIU A; 1YIT A; 2PNI A; 3NTI A; 1Q86 U; 1KC8 U; 2GTJ A; 3LYI A; 1IHV A; 2RF0 A; 2R57 A; 1M3C A; 1UG1 A; 4ZN3 A; 1YFN A; 1U5S A; 3CCQ Q; 4ESR A; 1CSK A; 1AVZ C; 4PJO F; 2E12 A; 3RES A; 1QLY A; 2LP5 A; 3REB B; 2NUP A; 2HSP A; 4M78 B; 3O8V A; 4EMH A; 2NYS A; 4UC4 A; 3CME A; 1JJ2 A; 3FLG A; 1O75 A; 1Q95 G; 2V8K A; 4F7U A; 2EQJ A; 2GNC A; 1SKU B; 3EG3 A; 5KYU B; 1Z9Q A; 3JCM f; 4C0F A; 1RAG B; 2EPD A; 1PRM C; 1HYO A; 1JXO A; 2D0Q B; 2V8J A; 3VU3 C; 4IUU A; 1I8F A; 2DTH A; 4PK4 A; 2L2P A; 2EQM A; 2GCX A; 3OYA A; 3OQ5 A; 2PUK B; 4OGE A; 4BY6 C; 1VQ7 Q; 1XNI A; 2LNV A; 4E7L A; 1KK7 A; 1SRL A; 1K4U S; 4LDX A; 1UHF A; 1VQ6 Q; 2CP2 A; 2R5A A; 1HD3 A; 3P8D A; 2EGE A; 1NZ9 A; 1Q86 R; 3ZL7 C; 2O9S A; 1X6B A; 4C92 E; 2RK1 A; 2DIL A; 3CCQ A; 3HP9 A; 5CVI A; 4FT2 A; 2DNU A; 2DZC A; 3OS5 A; 2E3I A; 4E6R A; 2ZPG B; 3VS2 A; 2O2O A; 4J7I A; 2HL5 C; 1YIJ T; 1M2V A; 3H0F A; 2AZV A; 5GAM d; 4D6W A; 2A3L A; 2LX7 A; 4LDW A; 2C0T A; 4IIM A; 2FO0 A; 2FPE A; 4OMO A; 1PNJ A; 1WXU A; 1Y0M A; 1RAI B; 4PJO B; 1YJW Q; 2AHJ B; 2XG8 D; 2DO3 A; 1WFW A; 1PSE A; 2YRC A; 2ZCF B; 3T9N A; 4JLG A; 3R6N A; 2DET A; 1X2K A; 2DE0 X; 2M51 A; 4LDV A; 5FWB A; 2GQI A; 4DBH A; 1M9S A; 1BU1 A; 3OMG A; 1VQ6 A; 4J9F A; 1BYM A; 2RM4 A; 4M77 C; 5CO7 A; 4EPC A; 4JJN K; 1GRI A; 3G7Z A; 1LPL A; 2RNA A; 4J7F A; 3LW5 E; 2GQV A; 1KC8 C; 1P92 A; 2DPP B; 5IN1 A; 3EGD B; 2E1H A; 4PNO A; 2FL7 A; 4X34 A; 3JCM b; 4LDY A; 1WQW A; 4MDW A; 2IG0 A; 2MWP A; 3VKI A; 4C8Q C; 2FG0 A; 4X1V A; 4R56 A; 4M7D C; 4A4H A; 2QEX T; 4K11 A; 1VQ8 T; 2EQI A; 3Q1J A; 4QT7 A; 3PVL A; 5GAM e; 5GJW B; 2RO0 A; 1NM7 A; 2HMA A; 2KVQ G; 4A54 A; 3I56 Q; 3WXM B; 5GAO n; 4M75 F; 1BCM A; 2KMT A; 1VQP T; 1AZG B; 1SSH A; 2YUP A; 2R58 A; 1BI1 A; 1YJW A; 3KFV A; 2PQW A; 4PFZ A; 1OQK A; 2EIF A; 5FU6 C; 1MND A; 3M4G A; 4J8O A; 3CBP A; 3S6W A; 5FWC A; 2RI5 A; 1T0J A; 2WSE E; 5CR2 A; 4E7I A; 3ZFJ A; 2OAW A; 4X9D A; 2BUD A; 3EFS A; 3M0Q A; 2KRN A; 3WVE B; 4V2S A; 1Y96 A; 2K79 A; 3I9Q A; 3QUI A; 1PHT A; 2L3S A; 2K2M A; 2PU9 B; 4AFS C; 2FB7 A; 2DKG A; 1PCX A; 1OUL A; 5I2M A; 2KRO A; 1MMA A; 3M9Q A; 3GNG A; 4KBM B; 3QPH A; 1I5L A; 4WF2 A; 2O01 E; 4L6V 5; 1QMC A; 2CZ0 B; 1JB0 E; 2V8I A; 4C92 G; 1RAH B; 1HJD A; 2Y4X A; 2CZ7 B; 5M9O A; 3J80 E; 3BE3 A; 3GPL A; 3CCE T; 2E5Q A; 1NYG A; 3OBW A; 3PVQ A; 4KUL A; 4QKU A; 1SRM A; 2LT1 A; 1QVF P; 2HSE B; 1T3S A; 2DYB A; 4QVC A; 3JB9 G; 3FRN A; 2LNH B; 5L23 A; 5GAN h; 2E5K A; 1NLP C; 2P0K A; 4M75 B; 2BE7 D; 1OU8 A; 2X35 A; 1H8K A; 4RCB A; 4BAC A; 2FZC B; 3NFC A; 2KNB B; 2HNI A; 1AT1 B; 2L3P A; 2ROL A; 1AWW A; 4L59 A; 1IGU A; 3URG A; 2KYB A; 4J6X A; 2DLP A; 2EW3 A; 3EG9 A; 1TUG B; 4M77 A; 3CCR Q; 1NPP A; 1VQM T; 3C4S A; 3V8K A; 2DJQ A; 4FW2 A; 4R55 A; 4C0D B; 1YIJ A; 2ESW A; 4C8Q A; 1KFZ A; 2W0Z A; 1QW1 A; 2QTX A; 9ATC B; 2YRD A; 4M7D A; 3CEY A; 1WNL A; 1H3Z A; 1VQ8 Q; 1Q81 C; 1ZSG A; 2DXT A; 2DL4 A; 3M4Y A; 3CCL T; 2AT1 B; 4OB2 B; 1JJ2 S; 2QDL A; 2P4T A; 3G6E Q; 1VQP Q; 4BE1 A; 1S1N A; 3MO8 A; 4PLL A; 1Q7Y R; 4PLI A; 3L2Q A; 4RTW A; 4M7A G; 1WGS A; 2A08 A; 2VUB A; 2EYQ A; 3VS1 A; 1U3O A; 4LD6 A; 1M2V B; 3CQT A; 4HT8 A; 3RIR A; 2FHD A; 2DXC A; 4ANJ A; 4IUQ A; 2HQE A; 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