The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
22
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sequence length |
107
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structure length |
107
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Chain Sequence |
GAHMGGSMKIRVELINGNEHRTSSTPQQPQQNPSVSHIFDGETAVKDHIKVLLTHFKIPVDKVSSYALQNPFTLAYVEDSFLTPERLVEAEKSYFILRMKPHAIADR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure, dynamics, lipid binding, and physiological relevance of the putative GTPase-binding domain of Dictyostelium formin C.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Actin binding protein
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| source organism |
Dictyostelium discoideum
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| molecule keywords |
Formin-C
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| total genus |
22
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| structure length |
107
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| sequence length |
107
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-07-27 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2L1A A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2RPV A; 3TJP A; 2WNM A; 3DBL I; 2IDY A; 1GC6 A; 1VZ6 A; 2BBC A; 3RI7 C; 1NYQ A; 4S17 A; 3U2S C; 2BB6 A; 5CTR C; 1IBX A; 3B0A A; 2N0S B; 1PYW D; 5FKA C; 2G3Q B; 2N9L A; 1V5O A; 3W1S C; 2L52 A; 4FJV B; 2ZZP B; 1J7A A; 3Q3J A; 1N61 A; 3QAR A; 5DPW A; 1SE9 A; 1FNU A; 2FUH B; 3P4P B; 2RSU A; 1SJH D; 3AV8 A; 1L6U A; 3KLS X; 3DBL B; 2FCS A; 2KZR A; 2WU5 B; 2RD0 A; 2SEB D; 4TKN A; 4KSL C; 4BKT A; 2A5U A; 1GJZ A; 3ZVV A; 2MSE D; 3KVF B; 1WZ3 A; 2DX5 B; 2JX5 A; 4LNF A; 4K7W A; 2HDE A; 1UWX A; 4WIP A; 1X1M A; 3QCA A; 4JLC A; 1Y8R C; 3MP9 A; 1KH0 A; 2HTH A; 4M02 A; 3UQB A; 2CHW A; 1Q5W B; 1GG3 A; 1OQQ A; 2VH2 A; 2LVO A; 5BMH A; 2C7N B; 3IG3 A; 3SU8 X; 2INC C; 1JWU D; 5D2M B; 1WIA A; 2D2Q A; 3LXF A; 2GI9 A; 3AE7 B; 3X23 A; 2N7D A; 2MRP A; 3AEF B; 2WQY B; 3L10 B; 1WZ0 A; 1AWD A; 1WSP A; 1F77 A; 2ZNV C; 2BGF A; 2O2V A; 4RGM A; 1GB1 A; 5AUK A; 2WHI A; 1PDX A; 2XN9 C; 3ONS A; 3J9C A; 2INN E; 2EKE C; 1F2R I; 3P63 A; 1WGY A; 1SF0 A; 3PRM B; 1WJ6 A; 4RM9 A; 3WAN A; 1EUV B; 4EZL A; 3PTF C; 3PV1 A; 4P1C C; 1V6E A; 3KQ4 A; 3ZW3 A; 1EM7 A; 4IM3 A; 3VR8 B; 3N3K B; 4RF1 A; 3NVY A; 3LYY A; 5JHB A; 3NG0 A; 5AEK B; 1HZ5 A; 3Q8F A; 3C0R B; 3QQ8 B; 5H92 C; 2JYT A; 2M19 A; 1Z2M A; 4KX6 B; 1JAL A; 3WAP A; 2WWZ A; 3R66 C; 4DQO C; 5KHQ A; 1I4P A; 3AE9 B; 4PK1 A; 4KKJ A; 2L0F A; 4FXC A; 4KZC A; 1V5T A; 3PT2 B; 3JSV A; 2MHJ A; 3SFD B; 2IZV B; 3AEB B; 3EUB 2; 1WJ4 A; 1WGH A; 3ZO5 B; 1ZE3 D; 1ZOY B; 2MP2 A; 4M8M A; 2PMV A; 2GB1 A; 3RFZ B; 1V9J A; 3NS1 A; 1WGD A; 4W9J A; 1L7Y A; 3VRB B; 4KVG B; 4HRO A; 1T3Q A; 5DCN A; 3ML9 A; 3TEX A; 1BXT A; 2LGY A; 4WWO A; 1E6E B; 2BF8 B; 3N20 C; 2DZM A; 4FUL A; 2KK8 A; 2K6D B; 3Q3M C; 3APF A; 2JRI B; 2N1W A; 1WXM A; 4K3B A; 3ZNI D; 3ZDT A; 3V6C B; 5DPS A; 3U4E G; 1N63 A; 2DAF A; 3VTU A; 2XBB C; 3TEW A; 2DYB A; 1HA5 A; 2LVQ A; 1D4B A; 2J0J A; 2WXO A; 2C7H A; 2LEK A; 2BWE S; 4MEL A; 3IVF A; 4P16 A; 5HFY A; 4M0W A; 3BII D; 3Q8E A; 1OEY A; 2MWS B; 5IO9 A; 4IW0 A; 5IKC M; 2QDF A; 4DXG A; 5JHA A; 3IXS A; 2KJ6 A; 1Y56 A; 2QJL A; 1C76 A; 4AJW A; 1QKZ A; 2WXM A; 3S2A A; 2ZVO A; 3GS2 A; 3WAL A; 3BVM A; 3VR9 B; 2K8H A; 2N7J A; 3VTW A; 2L00 B; 4NQK E; 2BS4 B; 4LNK A; 5T8I A; 3DPD A; 3HVZ A; 2N9X A; 2K8C A; 4US9 A; 1VDV A; 3HVD A; 3LJ3 A; 1UEL A; 2CR5 A; 1B1Z A; 2WXL A; 1C4A A; 4BAX A; 4F1S A; 4NJ6 A; 1N60 A; 4ASW C; 4URK A; 3AEC B; 1U4A A; 4GU2 A; 1F9J A; 2K22 A; 2D10 A; 4KZ0 A; 1L0X B; 2JU6 X; 4US8 A; 4RGO S; 3KUZ A; 2QEJ C; 5BYS A; 2YEP B; 4MEM A; 4OZA A; 1ET6 A; 1LFD A; 2RDG A; 4ZRK A; 3GB1 A; 1ZUD 2; 4LLG M; 4IDI A; 4WJP A; 4W9H A; 1C78 A; 1FIQ A; 2KHW B; 4CYE A; 2QMT A; 3T3O A; 5J17 A; 3ZIM A; 1YMH E; 2W3S A; 2NMQ A; 3QC8 B; 4ZOH C; 1WFY A; 1NDD A; 2IBI B; 3Q6B A; 4ICV A; 2MH7 A; 2WU2 B; 2SAK A; 1BT0 A; 4KDL B; 3P1M A; 3V6E B; 2KFJ A; 4P6V F; 4WQO B; 4RGN A; 5H8Y E; 1IYF A; 1FXA A; 2L83 A; 1NI2 A; 4F7Z A; 4LNN A; 2HJ1 A; 3DBR I; 3TIX A; 3R2T A; 5AZG A; 2LXA A; 4TSS A; 1JWB D; 2WLB A; 3M63 B; 4WJQ A; 1JRU A; 1D6E C; 5E6O A; 1H4R A; 3VH4 B; 4P1B C; 3ZNZ B; 5GMV A; 4E74 A; 1V1P A; 1BUI C; 4WH4 A; 5JH5 C; 1P1A A; 1ZP0 B; 1RRB A; 4IC7 B; 5LXH A; 1XO3 A; 4EE2 A; 4MDK E; 3ZRC A; 4JQW C; 3DBR B; 2L05 A; 1WJN A; 3NVZ A; 3EFC A; 4W9E A; 3X0W A; 3RZW C; 3IFW B; 3CMM B; 4BKS A; 4EZK A; 1G6J A; 3RT3 B; 4HDO A; 2KVR A; 3DWM A; 2QSD A; 3RUL A; 1EF5 A; 3CIR B; 1N6Z A; 1OGW A; 5G55 A; 3MHZ A; 2VZK B; 4WWN A; 1QQR A; 3ZNG C; 2KAC A; 5FK9 C; 3PLU A; 4J6I A; 1YIW A; 4NAW B; 1I4H A; 5C1Z A; 4ICU A; 2H89 B; 1SBB B; 2L3Z A; 5CHV C; 2RPQ A; 2ACZ B; 1S1Q B; 2M8S A; 2UWQ A; 3B1L X; 1GAQ B; 2JRH A; 1WWT A; 3UIO B; 3R8B A; 2JWZ A; 4NAW A; 3BIN A; 3U7D A; 3RUI B; 5IN7 A; 1SE2 A; 1FCC C; 4W9G A; 4CO7 A; 3RNA C; 4IWO A; 2JWU A; 3P4Q B; 1ESF A; 4KIK B; 3AE8 B; 3UGB B; 1RM6 C; 2L8J A; 1AN8 A; 4R3D A; 2MBE A; 1NBF C; 3MC9 A; 4M8N A; 2G9H D; 2I38 A; 4KIK A; 2UU7 A; 3AEG B; 4RGT A; 3UIN B; 1VZ7 A; 1NVI D; 2BYF A; 1YN5 A; 3IBE A; 3V61 A; 3QJZ A; 1P7F A; 1F2R C; 3SD5 A; 2JXT A; 2KAJ A; 3BY4 B; 3A1Q A; 2LGD A; 3ZRF A; 1C1Y B; 4MGZ E; 2IGG A; 2KFK A; 2PW9 A; 3NJT A; 2D3C A; 3APD A; 4G11 A; 2PJH A; 3DVG X; 4TMA B; 3VHT C; 2C5L C; 4QAY A; 2L32 A; 1WM3 A; 1KLG D; 1LQB A; 2G1E A; 3VAW A; 2KDE B; 4BOS C; 1WH3 A; 1DYQ A; 3DVG Y; 4DHZ E; 3JYU A; 2CU1 A; 3IT6 B; 2BKF A; 3JW0 X; 1I4X A; 1TS5 A; 1E5W A; 2V3N A; 1I7H A; 2JSV X; 4DBG A; 5E6J A; 2AQ1 B; 2DZK A; 2M4N A; 5AZH A; 4P7I A; 4EOY A; 2DNF A; 1WF9 A; 4MGY E; 1ZDX A; 1PFD A; 4XZ4 A; 3RZF A; 4JGH B; 1A70 A; 2D07 B; 1N62 A; 2JQR B; 4WJN A; 1UZX B; 3B2G A; 1ZPS A; 4GSW A; 1I4G A; 4C4V B; 4HWI B; 1GC7 A; 2WXN A; 5IAA C; 4JWS C; 2WYQ A; 2WXK A; 1DGJ A; 4XE0 A; 2BVC A; 3R3M A; 2DZJ A; 1K8R B; 4OZB A; 1WR6 E; 3EHV A; 4PYU A; 4HJG E; 4ZRI A; 2DBY A; 2PVO D; 3H9D A; 4REZ A; 4GDL B; 1K50 A; 4EUT A; 1XLO A; 1HE8 A; 1SE3 A; 3L54 A; 2M0X A; 4W9F A; 3UI3 A; 4MGI E; 5CX3 A; 2AEH A; 2NBW B; 1KTK A; 2LXC A; 4XDC A; 2LAS A; 3PPA A; 2DHZ A; 3K9P B; 4ZYS A; 4YSY B; 1EF1 A; 1L0Y B; 3AE4 B; 3EGR A; 4PT5 A; 3ZQ4 A; 1CZP A; 3PRZ A; 3NUH B; 3AH7 A; 3W5V B; 1V49 A; 2IO1 B; 4G3X B; 3EEC A; 2BKR B; 1VRA B; 2K5P A; 1P98 A; 4OVZ A; 1RFK A; 3BK1 A; 2JZZ A; 4S0R A; 3PHX B; 1XQQ A; 1ZXI A; 3BYT B; 2HTM E; 3H7P B; 2NBU A; 3BZD B; 2KDF B; 2NPT B; 4DDG D; 2X8X X; 2RDH A; 2MBO A; 3SDL C; 3PLV A; 4KDI C; 3TEZ A; 4IOI E; 4ZRP A; 4DXF A; 1AW7 A; 3RCZ A; 3B08 A; 1YQ3 B; 2K6Q A; 1KLU D; 3QAQ A; 2KNB A; 1E7V A; 1WXS A; 3W1Y A; 4N59 A; 3TSS A; 1UUP A; 2GMI C; 4YT0 B; 5GXG B; 4M01 A; 1J8C A; 2MCN B; 4GMV A; 1PGB A; 1L6V A; 2L7R A; 1E9M A; 1QOF A; 3PGE A; 4PS8 A; 4XYC A; 4YXD B; 2Z0E B; 3I9V 1; 3NZU A; 3ECI A; 1MI0 A; 1TBE A; 1TKE A; 2N9K A; 1PGX A; 3RN9 C; 1L4D B; 2KQ4 X; 1UH6 A; 4MGK E; 5EDS A; 2MW5 A; 2ZW1 A; 4WAF A; 3E56 A; 2D3G A; 2X38 A; 1MG8 A; 3HIZ A; 4AJY B; 1GNU A; 3SFE B; 2JT4 B; 1SJE D; 1JWS D; 2FIF A; 4HPM B; 2V9H A; 2EEL A; 1RAX A; 2NCN A; 3WIM A; 1DOX A; 2KQS A; 2NS5 A; 2V1Y A; 4HPP A; 2FNJ B; 2KO3 A; 4OHJ A; 3MJW A; 1P9D U; 5G5G A; 2YLM A; 2NTT A; 3PO0 A; 1JWA D; 3PS6 A; 1OEY J; 4IM2 A; 3TMP B; 3V3X A; 1AYF A; 4O1N A; 1TS2 A; 2IND C; 4ARC A; 4ACF A; 3APC A; 4MH8 A; 1C3T A; 4XC2 A; 4LDT B; 2W82 A; 4BKG A; 1MHX A; 4FN2 A; 4LJP B; 2PEA A; 3AED B; 4W9I A; 3SHQ A; 4A90 A; 4JE3 B; 1ACC A; 5HKH A; 1WYG A; 2EMT A; 5AUI A; 4MSQ B; 4IWQ A; 1R7S A; 3LDZ E; 2BT6 A; 2IO0 B; 2DLB A; 2QIL A; 5J18 A; 3BVG A; 2PPH A; 1ENF A; 2LVP A; 2LRW A; 3A4R A; 2XEW A; 1T0S C; 1C9F A; 3ZTD A; 3RMK C; 3NHE B; 2PTL A; 4MAC A; 3WA0 A; 2KJH B; 3TBL D; 4NJC A; 2DAJ A; 2ZPN A; 1YQB A; 4ITK A; 1Z5S B; 3TL5 A; 4XWT A; 2KLC A; 3N1X C; 2ICI A; 2LRU A; 3M95 A; 4TV3 A; 4EKU A; 2ZVN A; 4YTM B; 1K53 A; 4C56 C; 4CQN A; 4AS1 A; 3DBH I; 4GIV A; 1P0R A; 4LDT D; 2KX3 A; 4MJS B; 1WGK A; 2JUO A; 3AI5 A; 4K1R B; 2KOX A; 3OJ4 B; 2LFI A; 3RYT A; 3A33 B; 2BYT A; 2NR2 A; 1OQY A; 2OOB B; 2BPS A; 3PZ7 A; 2CS4 A; 2MX2 A; 2ZJD A; 4MM3 B; 1VD2 A; 4BZA A; 1KM7 A; 2Y5B B; 3DBS A; 5G2N A; 4TQ0 A; 4W9C A; 3NZS A; 3WAO A; 2KWC A; 2NBV B; 2CJO A; 4NZL B; 4HXD A; 1KRH A; 2W55 A; 3DBH B; 3AU4 A; 1YJI A; 1QIL A; 1FMA D; 2LGS A; 2KT7 A; 3ZKJ C; 3ZJT A; 3IAS 1; 4BOZ B; 2IY0 B; 4A3P A; 1MPE A; 2C7M B; 3FIL B; 4MH0 E; 1NEN B; 3P2B A; 2BB5 A; 3UIP B; 3OJ3 A; 1T0Q C; 3W9C B; 4FA6 A; 2MJE A; 4K3C A; 4ZRJ A; 1E7U A; 2KC2 A; 3L0W B; 4RM8 A; 3BK2 A; 3D32 A; 4IUM B; 5LNK 1; 1ET9 A; 3NOB A; 1IP9 A; 2KWD A; 2XK5 B; 4YSZ B; 1YJ1 A; 3KW5 B; 1FFU A; 3OAW A; 2PE6 B; 5L83 A; 2BWF A; 3UF8 A; 2PVG C; 2LJI A; 2KMA A; 1VZ8 A; 4HJK A; 1EWC A; 2PE9 A; 3WCQ A; 2WX1 A; 1EWY C; 4TQ1 A; 1J19 A; 1WMH B; 4WUR A; 1V8C A; 2KTR B; 1WX9 A; 5CHW A; 1L5P A; 3DOW A; 3QA8 A; 1CQV A; 2C9W B; 3ZGZ A; 2XNA C; 3DWG C; 3R7Q A; 1SGH A; 4N9F 4; 1Q10 A; 3IT4 B; 1CMX B; 2WXP A; 2G4D B; 3RD2 A; 1WMH A; 2KTR A; 3K9O B; 1YN3 A; 2WGS A; 3U52 E; 3GZN I; 2MQJ A; 3KUC B; 3GOE A; 2FAZ A; 1J0G A; 3Q3F A; 3VDZ A; 4ZHP A; 2ZNV B; 2V4I B; 1JRP A; 2GRI A; 1TKY A; 2BYE A; 3KWV A; 1UWM A; 1T0Y A; 1J7B A; 2KJR A; 4FAD A; 3ZDM C; 4ZYN A; 1XLP A; 4UDU C; 3T9L A; 1TY2 A; 3HK0 A; 3HM3 A; 3AEA B; 3GZN B; 1TY0 A; 1XCQ L; 3R2I A; 4FJY A; 4ANX A; 4RMA A; 4A8X C; 1FRR A; 1WM2 A; 1IGC A; 1FCL A; 1LXD A; 3AUL A; 5HHD G; 4G50 A; 1YQ4 B; 3HHM A; 4GDK B; 4PYZ A; 1IPG A; 4N6E B; 3KUD B; 4DWF A; 1OQR A; 3KYC D; 1ZGU B; 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4HEA 1; 2AL6 A; 1IUE A; 1QZE A; 2DWQ A; 1ZXH A; 2KMC A; 2ZEQ A; 3PHW B; 1QOA A; 4DHJ D; 3Q8B A; 1TT5 B; 2GBK A; 3NRZ A; 2LMC A; 2BS2 B; 3ETR A; 3I63 C; 3AE6 B; 3O65 B; 2CJN A; 3RNC C; 2AQ2 B; 3KWL A; 4J3O D; 1FO4 A; 1V81 A; 3AE1 B; 4IM0 A; 4HCN B; 2CHX A; 1UD7 A; 5E6P A; 3U8Z A; 2KTF A; 2KWV B; 2HJ8 A; 3ZJU A; 3B2F A; 4C4V A; 1WRD B; 1QF6 A; 2D5G A; 4I6L B; 1FD6 A; 3I3T B; 4A3O A; 5DPT A; 1L2N A; 1SIJ A; 2D3B A; 1D5Z C; 1XD3 B; 2AL3 A; 4B0E A; 2N7E A; 1HEZ E; 3CF6 E; 3Q8A A; 4GDL A; 2KVZ A; 2EMS A; 4K7S A; 2LUE A; 5I4D A; 3DVN V; 3T3N A; 2K25 A; 2D3A A; 1T6B X; 2INP E; 1YN4 A; 4WAA A; 3BWU D; 3FC4 A; 5MPO A; 4I6P A; 3Q8C A; 1GUA B; 2WXH A; 4HK2 A; 4B95 A; 1DOI A; 3N32 A; 1FRD A; 4YTP B; 2JXX A; 1B9R A; 3AMZ A; 2VH1 A; 2WDQ B; 4G0N B; 1TZ1 A; 2IPK D; 1WXQ A; 3OG5 A; 3AEE B; 5EE3 A; 2M1M A; 3V05 A; 1MFW A; 3HRD D; 4LK0 M; 1UBQ A; 4B9K A; 2YEP F; 3ALB A; 3H7P A; 3N30 A; 2R2Q A; 2RGF A; 4E3C A; 2LZ6 A; 4FHJ A; 2NPT A; 1WYW B; 1OFF A; 2LI5 A; 3PRE A; 2FCM A; 2BTE A; 4BVU C; 5E6N A; 2KKC A; 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