The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
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sequence length |
63
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structure length |
63
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Chain Sequence |
CSTVSPGVLAGIVVGDLVLTVLIALAVYFLGRLGTAEVLGIISIVLVATVLKTIVLIPFLEQN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The structural basis for intramembrane assembly of an activating immunoreceptor complex.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule keywords |
DAP12-NKG2C_TM
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| total genus |
19
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| structure length |
63
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| sequence length |
63
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-09-06 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | YojJ-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3S3W A; 4FZ0 A; 1WP7 A; 1WP8 A; 3N27 A; 4NTY A; 2QTS A; 4NTX A; 4NYK A; 3S3X A; 4NTW A; 4FZ1 A; 3IJ4 A; 2FB5 A; 2L35 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3W7T A; 4I5S A; 3VQY A; 1UJW B; 4HBN A; 1OCC B; 3AK1 A; 2R9A A; 3CME V; 4FPP A; 1A32 A; 3E2E A; 3OW2 U; 2QM7 A; 2RCV A; 5CA3 A; 4PD4 F; 4FM0 A; 2ZKO A; 3FB6 C; 2D3O W; 1QBZ A; 4J7K A; 3THO A; 3CCE V; 2IJK A; 5JCO A; 4ZI7 A; 2HVJ C; 2QKA A; 3U0Z A; 1GM7 A; 4DR6 O; 1QVG U; 2P22 C; 3B4S A; 3EXA A; 2YXY A; 4J11 A; 3HKC B; 3RW0 A; 4AI8 A; 3K57 A; 1OZ0 A; 1BSM A; 5FPR A; 1W0J G; 3AG1 B; 2H94 A; 2HEP A; 4I0X A; 1RPR A; 2VQF O; 1IBK B; 4UUJ C; 2ZNI A; 1KB9 F; 1QNM A; 4G28 B; 4CS2 A; 4DV1 B; 3OTO B; 3B09 A; 2PUS A; 2KQX A; 1YHQ V; 2X0L A; 4I4T A; 4X1I B; 1YZB A; 1VF6 A; 2JVD A; 2ZR3 A; 2Q67 A; 1AP5 A; 4GX0 A; 4JGS A; 3ZN1 A; 2VRZ A; 3E22 A; 2CTP A; 1GTO A; 4GKJ O; 4LF4 B; 1YXB A; 4GCZ A; 1HP8 A; 4B7K A; 2Q0O C; 4Q6G A; 4LP8 A; 1TUE B; 4BW9 A; 2GBO A; 1KP3 A; 1K9M W; 5JQG B; 4DR2 O; 1J5E O; 1KBH A; 2YI8 A; 1B06 A; 1N0J A; 4LNU A; 4ZKI A; 4LFC O; 2Y0I A; 4OPH A; 2KG7 A; 3ABK C; 3PJS K; 5KMG A; 4WFG A; 4TQF A; 2UXC O; 1OCO C; 3SPI A; 1MAB G; 1Z5W A; 5EIB C; 5IYB O; 3A0H Z; 2QWP B; 2ZIO A; 4QIW F; 3K59 A; 3STL C; 3UCS C; 2Y4U A; 1VQ6 V; 4HNA B; 3HR0 A; 2Z3Y A; 1X59 A; 1MZE A; 1NJI W; 3F5T A; 2P90 A; 4LWS B; 1S72 V; 3T4Z A; 4JV5 O; 1PNM A; 1MNG A; 4YJ2 B; 1NKD A; 1Q5O A; 4K35 A; 1L8D A; 1N33 B; 4LF6 O; 4X64 B; 4OGQ B; 3SPG A; 4BIO A; 1VMG A; 3G80 A; 1EN5 A; 4O4J A; 3ABL C; 1PNL A; 2DYS B; 2CTW A; 2P7T C; 4D7S A; 1TUB B; 3RT3 C; 1Y76 A; 1VF7 A; 2W0F C; 1IXB A; 1DGS A; 4F6R A; 3SR2 C; 4I7Z B; 2BTO A; 4GLX A; 1SS3 A; 5CB4 A; 3DXR A; 2DYR B; 1WB7 A; 1VQO V; 2HJD A; 2ZR2 A; 4RUF A; 1N34 O; 1LUW A; 3ZMV A; 3HKD B; 1YTF B; 2LQT A; 4O4L B; 4DV5 O; 2LW7 A; 2ZE8 A; 2Y69 C; 5IE9 A; 3SPH A; 3BPZ A; 2WAM A; 2A06 H; 1M93 A; 2UXD O; 2NLJ C; 4FLY A; 2Q7H A; 3CCM V; 1YIT V; 2Q7E A; 3HB3 B; 2ZDI A; 1XNQ B; 3QO7 A; 3BRC A; 3GWK C; 1VQK V; 2QWO B; 4B3R O; 2JIZ G; 1G6U A; 2OTJ V; 4PA9 A; 1JMK C; 1GO3 F; 5ITZ B; 5AG2 A; 2L35 A; 4H0L B; 4UV9 A; 1B04 A; 3B77 A; 5LBQ A; 4B3S O; 4FIP C; 4DV2 O; 4ASU G; 3ZHT A; 5JCO C; 2QGN A; 3CC4 V; 2Y4T A; 3F7V C; 4YJ3 B; 4QPJ A; 3ABT A; 2ADQ B; 3OGI B; 3RYC B; 1Q8I A; 1V55 B; 4UV8 A; 4DR1 O; 3ZX6 A; 4DR6 B; 4WBN B; 4PI2 A; 2V4D A; 4TWK A; 4H33 A; 1H2K A; 3WU2 Z; 1K97 A; 4I55 B; 3OMA B; 2FL4 A; 5KUK A; 2M6Y A; 2B9Z A; 5L3F A; 1KMI Z; 4D6T H; 4FLZ A; 1URF A; 2FML A; 2VQF B; 3O9O A; 2DOS A; 4R8C A; 4CC5 A; 2MW2 B; 4FJC C; 5EBM C; 5K1X A; 1VF6 C; 2DW4 A; 4WFH A; 1K34 A; 3OEH G; 2NN4 A; 4IT5 A; 5CN0 A; 1KQS U; 4BW5 A; 2F4V O; 1DTO A; 5LMU O; 2XTA A; 1UFI A; 1SQF A; 5EBW C; 1VAR A; 3G67 A; 3ZS8 C; 4MVQ A; 3CRM A; 1NR1 A; 2G38 A; 3N2K B; 1H8H G; 3IFX A; 5FNV B; 3PN1 A; 5DED A; 1O9H A; 4GKJ B; 4JZ2 A; 5LOV B; 3ABM C; 2PGG A; 4TOI A; 1V54 C; 5IYD O; 5B1N A; 5KA6 A; 4DRX B; 4R7C A; 1H2M A; 2XAH A; 3G71 V; 1JQ0 A; 3OGC C; 1J5E B; 3MAQ A; 4CH3 A; 4UCS A; 2Q6A A; 4LR3 A; 3ZED A; 1NU1 H; 1R73 A; 1D5A A; 5GTH Z; 4CBC A; 3CRQ A; 4NKG B; 1M56 B; 1WPB A; 2QDO A; 4QPK A; 3SJA C; 3FAV B; 4LFC B; 2YS8 A; 3ZMS A; 1IZ3 A; 1YJN V; 2N04 A; 2EZP A; 1XIL A; 2HP8 A; 1AP6 A; 1U96 A; 2UXC B; 5J2U B; 4UCR A; 4PDR A; 1XUQ A; 3AK3 A; 2DWE C; 2X6A A; 3D36 A; 3K9A A; 5CA0 A; 2M7W A; 1Y74 A; 5EZY B; 1KU9 A; 1K5Q A; 5LHH A; 3WFV A; 4FLV A; 1JCH A; 1M9N A; 3JD1 A; 4FVM A; 2AZ2 A; 2W6J G; 1Y6X A; 4N21 A; 4MT8 A; 4JV5 B; 1SQV H; 3P30 A; 4P9P A; 2XAQ A; 3ZRV A; 3FYI B; 4NR1 A; 1JX9 A; 1US6 A; 5KAI Z; 1FXH A; 3MHS C; 5B3S B; 3CWB H; 3T1Y O; 3GWO A; 1XRE A; 2F23 A; 2OCC B; 1RM1 B; 4ZHQ B; 2BE3 A; 1MOF A; 1PKX A; 1S76 D; 4MVU A; 1SQG A; 5LP6 A; 3OEE G; 3K9S A; 3ZJZ A; 1YIJ V; 4JAU A; 2KKW A; 3F7Y C; 3KKY A; 2WPD G; 3R66 A; 1IBL O; 3CE2 A; 2CH7 A; 3CHX A; 1JPX A; 1PPJ H; 4J7J A; 2WLM A; 1N34 B; 4LFA O; 1W2B U; 1F4M A; 5IT9 N; 1AJN A; 3H1H H; 1JJO A; 2BSK B; 1K92 A; 4X20 B; 4DV5 B; 3FB7 C; 5JH7 A; 3G4S V; 1HNW O; 2ILM A; 1PV0 A; 2UXD B; 3CCJ V; 4IIJ A; 2ZDI C; 1QLE C; 2K9P A; 1QHT A; 2D2C B; 4X1K B; 3OFN G; 1XHX A; 5TIS Z; 2Y48 A; 3A0R A; 3RYI B; 1WPX A; 1FAF A; 4MTG A; 2QE7 G; 5B1B C; 3K03 A; 4HZ3 A; 3EHB B; 4F6E A; 4B3R B; 5LGT A; 4FFB A; 1GK9 A; 4NVP A; 4ICG A; 5DEC A; 1KEC A; 1J95 A; 1BQ0 A; 3ZBH A; 5CBH A; 4FK5 C; 5K1P A; 2JEX A; 4DV2 B; 5B1A C; 4B3S B; 4JI2 O; 2VWJ A; 1VQ8 V; 2JGD B; 5KHJ A; 1XHZ A; 1B3Q A; 4EKW A; 4KP4 A; 4ZOL A; 4I50 B; 1IBM O; 2WLN A; 3ZMT A; 1FD9 A; 1SF9 A; 1THZ A; 2RDC A; 4HNA A; 3RYH A; 4DR1 B; 1XNR O; 1GRJ A; 1M57 C; 2ITC C; 3JAR B; 3RYF B; 3X2Q B; 4X9Q A; 1NI8 A; 1S5H C; 3HKE A; 2F93 B; 3E8B A; 3N2G A; 2YDE A; 3E8H A; 3ZHS A; 1TVK B; 3AG4 C; 5KHG A; 1SQX H; 4NTW A; 4CH5 A; 5JJJ B; 4DW1 A; 5D5P A; 1BGY H; 3CB2 A; 1JJ2 U; 3UT5 B; 3OTF A; 1RP3 B; 2BTQ A; 1P49 A; 2F4V B; 2CGN A; 3E8F A; 3HKB B; 3CS5 A; 5LMU B; 4O2B B; 2C2A A; 4JTC B; 2R70 A; 2P4K A; 1KP2 A; 1OCZ B; 2V1D A; 3ZHU A; 4EB6 A; 4UFZ A; 5C8Y B; 2ZXW C; 3QO5 A; 4KUM A; 4NTX A; 5GON B; 1SES A; 5EBL C; 3CEI A; 3CRR A; 2QTO A; 3ASN C; 4XDJ A; 5EC1 C; 3LSU A; 1AI6 A; 2KSD A; 1GN4 A; 1WLE A; 1Y4M A; 4DK0 A; 1R3J C; 3NR7 A; 2ZE7 A; 3BA9 A; 1XQ8 A; 3RN4 A; 2LJ2 A; 1YDX A; 3BFR A; 1HR0 O; 3QTC A; 4CC6 A; 2P5O A; 4NTY A; 1AR5 A; 3AEI A; 3MHH C; 4X62 B; 3JAW B; 4DV4 O; 3D36 C; 3E86 A; 2GTS A; 4TV8 A; 2XT9 A; 1I08 A; 5L3E A; 3SGI A; 3OUF A; 1Q6U A; 1SER A; 1I94 B; 3JAM N; 3CSX A; 2Y0P A; 3MD0 A; 2ZT9 B; 3L70 H; 3QO8 A; 4DR7 O; 2EIN C; 3M7M X; 2EIK C; 3H1K H; 3TGU H; 2PTM A; 3AK2 A; 4U3J B; 4QE9 A; 3P3N A; 4UCT A; 1W0K G; 2ZE6 A; 2ZIM A; 3T1Y B; 4OPA A; 5LP6 C; 2RN9 A; 2DE0 X; 1WA8 B; 3I5D A; 4L87 A; 5A2Q N; 4IYI A; 4O4I A; 1I7F A; 1BS3 A; 2AHZ A; 2QEX V; 4FZ0 A; 1IBL B; 3APQ A; 4LFA B; 4IHJ B; 5LA6 B; 5LXT B; 2R72 A; 1NZ6 A; 4LCU C; 2VS0 A; 4WFE A; 1VQ9 V; 1K3E A; 1R6K A; 3BA8 A; 2ZNJ A; 4ZIB A; 4BWA A; 3T4D A; 4KHP B; 1HNW B; 4TUY B; 1NS1 A; 5JVD B; 5LOV A; 2JDI G; 3E83 A; 3H1J H; 3S3W A; 3VQV A; 5DM6 V; 3I56 V; 4FMT A; 4PDL A; 1AJQ A; 3OE7 G; 3UO3 A; 3ABK B; 4A5U B; 3TET A; 4GUN A; 4WFF A; 1OCO B; 2NR5 A; 2KB1 A; 2UXX A; 2YXL A; 4TV9 A; 3CCS V; 1H2S B; 4DR5 O; 2EJR A; 4G2K A; 4FFK A; 4DV0 B; 4QE7 A; 5LYJ B; 5IWA O; 4LF8 O; 5CA1 A; 4GZR B; 4CZZ A; 3FAV A; 5BMV B; 2A79 B; 4WFA V; 1KKD A; 4JI2 B; 3JD0 A; 1K8A W; 2L6L A; 5IJ0 B; 4MW8 A; 2Q9L A; 1U97 A; 4JTA B; 2RMK B; 3K58 A; 1S77 D; 1IBM B; 5IJ9 A; 3C3T A; 1X4T A; 2P67 A; 1H38 A; 2WLJ A; 2VQE O; 4TQD A; 1F23 A; 2UXB O; 4HAM A; 5EK0 A; 4AIL C; 1H8E G; 5EC2 C; 4F4L A; 4X65 O; 3ABL B; 3CC2 V; 1WN7 A; 1XNR B; 2YUA A; 4H44 B; 2EX3 A; 4O2A A; 1EZJ A; 4E2L A; 1SET A; 4PA3 A; 1JFF B; 4RUE A; 1EN4 A; 2BOB C; 2QA4 V; 5IYZ B; 4ZBM A; 2Q73 A; 4MVZ A; 3FD9 A; 2DN9 A; 1YSC A; 1I0H A; 1Q6H A; 2EIM C; 1NVP B; 3CCQ V; 5E1A C; 2A0L A; 2OYQ A; 2ETN A; 4DV6 O; 1PL4 A; 3SYA A; 1AI4 A; 4QJF B; 1SA0 B; 2DYR C; 2EZO A; 2Y69 B; 3RWR D; 4MVR A; 1RSO B; 5J2T A; 3CRA A; 1R3I C; 4JI8 O; 5LHG A; 2X7R B; 1B6Q A; 2IBZ H; 2GUZ B; 2OWO A; 2A7W A; 1BHB A; 1SZT A; 3H1I H; 1XBL A; 1L1F A; 1S0V A; 4I9W A; 5B5E Z; 4MVS A; 2O57 A; 3Q4H B; 3BCC H; 4GT1 A; 2JJ2 G; 5B1O A; 3R65 A; 1MSD A; 2LO1 A; 4X1Y A; 5H6R A; 1EBO A; 1MSW D; 2WLL A; 4JI7 O; 2BOC C; 1R3L C; 2UUA O; 4JI4 O; 4Q20 A; 1F4N A; 1HWY A; 2HJF C; 2BCC H; 4JPR A; 1HR0 B; 4E4E A; 4RWU A; 1K33 A; 3K08 A; 1I5X A; 4MVO A; 4OX9 O; 4ZI7 B; 4JI5 O; 1IXM A; 3CJH A; 4DR4 O; 1BQZ A; 1SC5 B; 4DV4 B; 3JAT A; 1VQM V; 1ORQ C; 5BZB A; 1FFT B; 4EFB A; 2Q4P A; 2JS3 A; 2IJI A; 1YCI A; 2QWN B; 3KCX A; 4CH4 A; 4X89 A; 2ARH A; 4PI0 A; 4I0X B; 2YC0 A; 1OV9 A; 1H2L A; 3IGA C; 3A2F A; 2Q69 A; 2EIL C; 4I4T B; 2IJH A; 2ZCE A; 5KLV H; 3A0B Z; 1XEQ A; 3W7S A; 3GVM A; 1VIB A; 4JF3 A; 1ZWI C; 1I5Y A; 3FKS G; 4PEL A; 1OCR C; 5H6Q A; 3W7X A; 2XOK G; 1SQQ H; 1AB3 A; 4X8A A; 2Q8V A; 5CBF A; 3CPW U; 2PYL A; 3E22 B; 5B66 Z; 1XMO O; 2E75 B; 3JD2 A; 3M99 B; 2AZ0 A; 3CCU V; 5CMU A; 5L3C A; 3LNN A; 1PD3 A; 1FXK B; 2FTK A; 3OR6 C; 5KUM A; 1ZL8 A; 1V54 B; 1XMQ O; 1FFX A; 1QU7 A; 4UVA A; 2B1G A; 1K4D C; 4YIP A; 5H2F Z; 3S3X A; 2ZIN A; 4J9Z B; 3K0G A; 5GW7 A; 3T1H O; 4DO2 A; 5KX5 A; 4DR2 B; 4KXR A; 2WLI A; 4LNU B; 5FL7 G; 4MS2 A; 2QSA A; 2ZM6 O; 2KG7 B; 5KMG B; 4JI6 O; 2JK5 C; 1IDS A; 3FB8 C; 5GON A; 4FM1 A; 4AQY O; 4WCE V; 3AG3 C; 3WG7 C; 2PF4 E; 4JYY A; 4W4L A; 2AHY A; 2CUG A; 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2GHY A; 3AG2 C; 3DTU B; 2YI9 A; 4YIO A; 4D7T A; 1VP7 A; 5B1A B; 4QGP A; 2CGO A; 3BEH A; 4YY3 O; 4OX9 B; 1NR7 A; 3SJB C; 4JI5 B; 3LSQ A; 1Z2G A; 5FPO A; 2QR4 A; 2X6C A; 2UU9 O; 4DR4 B; 4OXS A; 1S3J A; 1YJW V; 2HFE C; 3JAK B; 1WJZ A; 2DJV A; 3ETQ A; 2WA3 A; 5D5Q A; 1MMM A; 1FJG O; 3QG5 A; 3MDS A; 2IU3 A; 1M57 B; 4B08 A; 4LWS A; 5IY5 C; 1R3K C; 4PJ0 Z; 1N36 O; 1LR1 A; 2B5U A; 3OMN B; 1QCE A; 4YJ2 A; 4X64 O; 3STZ C; 2ADP A; 1P84 F; 3ASO C; 2HR3 A; 4CH6 A; 2AXT Z; 1VQ7 V; 2OCH A; 1FPO A; 4I9Q A; 1WB8 A; 3AG4 B; 3OD4 A; 2MK3 A; 3HPL C; 1P7G A; 2WLH A; 3OAA G; 1TUB A; 4G27 B; 1Z5V A; 3IC9 A; 3J7A U; 3OR7 C; 3ETG A; 1BHA A; 1XMO B; 1KUQ A; 1JFF A; 1S5J A; 1GMG A; 3B8N A; 2UUC O; 4JAA A; 5GTI Z; 4FLT A; 3RVY A; 4DYL A; 4YXW G; 4PHZ A; 2ZXW B; 1NH2 D; 4LH6 A; 1XMQ B; 4PA4 A; 4DUZ O; 3HKD A; 3L73 H; 4O4L A; 3VOU A; 3CCL V; 1SKV A; 1SRY A; 3ASN B; 2ITD C; 4MTO A; 4MTF A; 2EIJ C; 1WP8 A; 2OTL V; 3TK1 A; 1YEW A; 1P7B A; 2LGQ A; 5C93 A; 4JI6 B; 2ZQM A; 2E5L O; 3U10 A; 4AQY B; 3Q4H A; 3EVK A; 3ZCC A; 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