The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
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sequence length |
63
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structure length |
63
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Chain Sequence |
b'CSTVSPGVLAGIVVGDLVLTVLIALAVYFLGRLGTAEVLGIISIVLVATVLKTIVLIPFLEQN'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The structural basis for intramembrane assembly of an activating immunoreceptor complex.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
DAP12-NKG2C_TM
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| source organism |
Homo sapiens
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| molecule tags |
Protein binding
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| total genus |
19
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| structure length |
63
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| sequence length |
63
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-09-06 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | YojJ-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1WP7 A; 2L35 A; 3S3W A; 4NYK A; 1WP8 A; 4FZ1 A; 3S3X A; 4NTX A; 2FB5 A; 4FZ0 A; 3N27 A; 4NTY A; 2QTS A; 3IJ4 A; 4NTW A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3RYI A; 3AG3 B; 4LR3 A; 3Q4H B; 4WFA V; 1ZL8 B; 3ZMZ A; 1DTO A; 3ABK C; 5LL6 Y; 2PZS A; 5KHJ A; 5KMG A; 2YID A; 2ZD9 A; 3SPC A; 3BAA A; 1EM1 A; 1VQ5 V; 1WP7 A; 1XOU A; 2L35 A; 4HNA A; 4TQD A; 3W7T A; 4LWS B; 2P7T C; 2Q68 A; 5CBH A; 1JFF A; 2KSD A; 1BHB A; 2YIA A; 5A9G A; 2LW7 A; 4PHZ A; 4ABM A; 1ROP A; 3HPL C; 4J7J A; 5H6R A; 1PD3 A; 1HNZ B; 1LNQ A; 3OT7 A; 2DJV A; 1BZK A; 1JMK C; 2YXH A; 3JAS A; 1PKX A; 4U3F H; 1JR9 A; 1IUR A; 5LGU A; 4X1K B; 2FML A; 5L3F A; 4JYC A; 1K9M W; 4WBN B; 3VQW A; 1Z5W A; 1ZUQ A; 2F23 A; 4BR6 A; 5DN6 G; 4CS2 A; 4UV9 A; 5EBW C; 2D3O W; 2X6C A; 2ZNJ A; 3IGA C; 3SPI A; 1FJG O; 2EIK B; 1PNK A; 4X65 B; 3ZRS A; 1PL4 A; 3DSQ A; 4WFB V; 4UCV A; 2LFR A; 2HKO A; 1UFI A; 3D36 A; 3K59 A; 3OMA B; 2NLJ C; 1TUB A; 1FXK B; 1ZAU A; 1QNM A; 1BHA A; 3EXA A; 4DV2 B; 1Y6X A; 2UXB B; 1RM1 B; 1YXB A; 1ZX3 A; 3VQV A; 4FVM A; 3ZS8 C; 5B1O A; 3OEE G; 1B06 A; 4GCZ A; 3K0G A; 4GX1 A; 4YXW G; 2BOB C; 1M57 B; 3JD3 A; 3L9D A; 4KHP O; 4DR4 B; 1I7F A; 2X6B A; 1QQC A; 2QKA A; 5EC2 C; 2W0F C; 1SQP H; 4QIW F; 1M56 B; 1R1B A; 4X66 O; 1OCR B; 4DUY B; 4JAU A; 5FPO A; 3ASN C; 3RVZ A; 3WB1 A; 1AI5 A; 4J7Z A; 1YIJ V; 2HFE C; 2GDS A; 1H2S B; 1COW G; 4X1I A; 1AI6 A; 1GM9 A; 1SF9 A; 4ZBM A; 1VQ7 V; 1XQ8 A; 3WU2 Z; 3GWO A; 4MVZ A; 4KP4 A; 4MVM A; 3P30 A; 3H1I H; 5LP6 C; 2ADQ B; 2JRI A; 1QCE A; 3FAV A; 4IT5 A; 3H1K H; 5EK0 A; 3KG2 A; 3I5D A; 1FXH A; 1YTF B; 4X62 O; 1XMO O; 3IFX A; 2QJ1 A; 3E35 A; 1VF6 C; 3OUS A; 1P7G A; 2OTJ V; 2VQF B; 1NZ6 A; 3WFV A; 1DLB A; 4TOI A; 4JI5 O; 2GSM B; 4OPH A; 4B3T O; 3AK2 A; 4MVR A; 3CS5 A; 3HKD A; 4LF4 B; 2OIG A; 1P4R A; 1H2N A; 3A8T A; 4B3M O; 1N4C A; 4FM2 A; 2G38 A; 2JK5 C; 5C8Y B; 2N04 A; 1ARO P; 2A9H A; 1XHZ A; 1EZJ A; 1S3J A; 2HHH B; 5IT9 N; 4N21 A; 2UXD O; 4KUM A; 1JOY A; 1FXV A; 3BRC A; 3TCU A; 3N2G B; 1KB9 F; 1K73 W; 3ZHU A; 5KX5 A; 4NTX A; 5BMV A; 1XMQ B; 5K1P A; 3ZHQ A; 1H2G A; 2UXB O; 2QM7 A; 1YDX A; 1XEQ A; 1QLN A; 5JJE B; 4GUN A; 4JI4 O; 1KKD A; 1BT8 A; 4TV9 B; 4CZZ A; 2DOS A; 3M8A A; 2IJH A; 5CA1 B; 2XT9 A; 3JSL A; 4MVS A; 2CK3 G; 3S3W A; 3TK1 A; 4R6Z A; 3ABL B; 3AG4 B; 3T1C A; 5JQG A; 1JJ2 U; 3T4Z A; 4DUY O; 1KEC A; 1WPX A; 1SQX H; 1N0N A; 4X1Y B; 4DYL A; 1V55 B; 5B1B B; 5BZB A; 1Y67 A; 4JTC B; 3K9A A; 2JEU A; 1H8E G; 1H38 A; 5CA0 B; 5BR8 O; 2N74 A; 4TUY B; 4JI8 B; 2Q6A A; 2ZE7 A; 1OCO B; 4JAA A; 3CC7 V; 2XAG A; 3ZBH A; 2P90 A; 5FLX N; 3IC7 A; 1R3L C; 1SQF A; 1FFT B; 1VQM V; 2EUL A; 3APO A; 3ABU A; 2HP8 A; 4LF7 B; 3CWB H; 3D36 C; 4YJ2 A; 3ZMS A; 4O4H A; 1XHX A; 1QU7 A; 2K1E A; 3ZCC A; 3JD1 A; 3LSU A; 2YI9 A; 4I0X B; 2BTO A; 5KHG A; 4D6T H; 4J7K A; 1K5Q A; 1GN3 A; 4FFB A; 4I9W A; 4P30 A; 3UKM A; 3K04 A; 5LYJ A; 3ETG A; 2ZIO A; 5LHH A; 1YIT V; 1FKA O; 3G4S V; 4MW3 A; 4MTF A; 4CC6 A; 1GO3 F; 4QJF B; 3SYP A; 1Q7Y W; 1F4N A; 2P22 C; 4O2A A; 3DXR B; 3ZIA G; 4PJ0 Z; 3JAW A; 4WCE V; 4NB5 A; 4J9Z B; 4E4E A; 3JYC A; 2E75 B; 2HHH O; 2UXC B; 3E8G A; 2E5L O; 1Y74 B; 2VQE B; 3OGC C; 1OZ0 A; 4BIZ A; 3CCQ V; 5IJ9 B; 4J42 A; 2V7Q G; 2GHY A; 2WLJ A; 4O4I B; 2Q8V A; 2A06 H; 3VQY A; 2AHZ A; 3ZHV A; 1AP5 A; 4UCU A; 4FPP A; 1JCH A; 4ZI7 A; 3W7W A; 3ZRW A; 4O2B A; 1XNQ B; 5LXT B; 3UT5 A; 3FB7 C; 2A79 B; 4JI6 B; 4X20 B; 1GN6 A; 3O9O A; 5IYD O; 1YSC A; 2P5O A; 5ITZ B; 2CAZ C; 4GX5 A; 4BWA A; 1WN7 A; 3C3T A; 3EVK A; 4K8Z A; 1N33 O; 3H1J H; 3S3X A; 4FM0 A; 4ZHQ B; 1D2D A; 4PA9 A; 1VAR A; 3CJH B; 4RWU A; 4GKK B; 2A7W A; 3RGB A; 2HG5 C; 2K9P A; 1S0V A; 2XAS A; 4JZ2 A; 4F6E A; 4I55 B; 5EYP A; 4JYY A; 2ZQM A; 1RSO B; 4I4T B; 3JAR A; 4XBF A; 1VQ9 V; 1K97 A; 1MOF A; 4LF7 O; 1VQ8 V; 2VS0 A; 2DYS B; 2XHB A; 1V54 B; 3F5T A; 3OTF A; 1BCC H; 5J2U A; 4H13 B; 4OXS A; 5KAF Z; 2BTQ A; 3AG1 B; 5LHG A; 3SPH A; 3SJC C; 4NKG B; 1NTZ H; 3N2K A; 2GUZ B; 1AR5 A; 4P2Z A; 4OX9 B; 2BCC H; 4PV1 B; 3ZED A; 5JH7 B; 4E2L A; 2UU9 O; 2BE3 A; 3CCE V; 4ASU G; 2F66 C; 1O9H A; 3QTC A; 4PI2 A; 2QKS A; 3RYC B; 2NR5 A; 2AZ2 A; 3STL C; 3P32 A; 2ZIN A; 4DV6 B; 4EB6 B; 1HWY A; 4FLU A; 2NNU A; 2WPD G; 1W59 A; 3UCS C; 1OCR C; 3HKB B; 5GON B; 4O4J B; 4AQY B; 4HYO A; 3DC6 A; 2P06 A; 3K79 A; 3RVY A; 1SET A; 4JI0 B; 2LGW A; 2PUS A; 1RP3 B; 4QPJ A; 4DRX A; 5JVD B; 1ENV A; 1XDC A; 1H8H G; 1XNR O; 2JGD B; 2EIJ B; 1OCC B; 4HAM A; 4MTO A; 3K57 A; 4HNA B; 3P3P A; 4B3R O; 3CEI A; 4DR5 B; 5L3C A; 4ZOL B; 1N32 B; 2ZKO A; 2CH7 B; 3MD0 A; 5CA3 A; 1ZTE A; 3ABT A; 4LF6 O; 3OE7 G; 4IHJ B; 4W4K A; 3CXH F; 3I55 V; 2QKC A; 3A0R A; 1QBZ A; 5LP6 A; 1MZF A; 4AHC A; 2F93 B; 5FNV B; 2QM8 A; 4TSF G; 1PM9 A; 4EFB A; 1FFX A; 1VQN V; 4I7Z B; 2Q7E A; 1DK1 A; 1MNG A; 3M99 B; 4JI3 O; 2P67 A; 2GTS A; 2ZCE A; 4FLY A; 5H6Q A; 2JIZ G; 4FM1 A; 4K3A A; 3W7U A; 5K1X A; 1XRE A; 3MHS C; 2Q0O C; 2IU0 A; 2PI4 A; 4U3J B; 2PYJ A; 2UUC O; 1NTM H; 1QR9 A; 4UFZ A; 1R6N A; 1QLE B; 4LCU C; 5LMU B; 5IY5 C; 4DXW A; 3SDL A; 2QGN A; 4Z2W A; 3OTO B; 5L3G A; 2RN9 A; 3QO5 A; 3G71 V; 4C7U A; 4PEL A; 4U7O A; 3T1H B; 5H2F Z; 3JSN A; 2EIL B; 5LA6 B; 2CTQ A; 3K06 A; 2F43 G; 3VBB A; 1KD1 W; 4YHH B; 4JZG A; 5JCO C; 3RYF B; 4K8X A; 2YI8 A; 1R3J C; 4LF5 B; 5B3S C; 4W4L A; 3CCL V; 4N23 A; 5EZY B; 4GYC B; 1SES A; 4JPR A; 4LNU B; 5EIB D; 1N34 B; 2EX3 A; 1KBH A; 1Q6I A; 1IZ3 A; 4DUZ O; 5KA5 A; 3CCR V; 4MVQ A; 1M1K W; 4DW0 A; 3CD6 V; 4BAY A; 1V55 C; 2DQ0 A; 5B1B C; 4AQY O; 1Q86 W; 3KZI Z; 4IGG A; 1TAE A; 2ZXW C; 4DR1 B; 2YEV A; 4KL1 A; 3K58 A; 4QGP A; 3L73 H; 1J5E B; 4LP8 A; 2Q5Z A; 4YIP A; 3CX5 F; 1HP8 A; 2AXT Z; 1DF5 A; 3ICX A; 5H9C A; 4YY3 O; 1Y4M A; 4PDR A; 2OCC B; 1N8R W; 4DR5 O; 1BL8 A; 1X4T A; 1JPX A; 4R50 A; 1N32 O; 1G6U A; 2H94 A; 3E8F A; 4F4L A; 1JQ0 A; 3OGI B; 2ZT9 B; 4CS3 A; 4QE9 A; 2EIM B; 2EJ7 A; 3AG7 A; 3PN1 A; 4MSW C; 5LGT A; 5KLV H; 4P9O A; 3WB2 A; 2CE4 A; 3FD9 A; 1DF4 A; 3JAT A; 4DV1 O; 3HKD B; 4X89 A; 2VRZ A; 5CBG A; 3E86 A; 4YJ3 A; 1WNS A; 1EZV H; 1Q82 W; 3GVM A; 1AJQ A; 2UUA O; 4WF9 V; 1UPG A; 3C3S A; 1XUQ A; 3HR0 A; 1D5A A; 4OGQ B; 4TWK A; 4D7T A; 1Q3E A; 3LSQ A; 5IJ0 B; 2W0X A; 1I94 B; 4IIJ B; 2IH3 C; 1HNW B; 3ZHS A; 3OTO O; 4YIO A; 2F4V O; 3CE2 A; 3HKC B; 3HKE B; 2ZDI C; 1VF5 B; 3CRQ A; 4G28 B; 4DR3 B; 1S76 D; 4TQF A; 3ZJZ A; 5JWP A; 3OD4 A; 5KHK A; 3M7M X; 1VF7 A; 2PTM A; 1OHH G; 4F6R A; 3DC5 A; 2WLI A; 2R9I A; 4JAV A; 1R73 A; 4GLX A; 3Q4H A; 3CYO A; 5LOV B; 4LFA B; 1N36 B; 1ZL8 A; 4JV5 B; 2XAJ A; 3CPW U; 4O4L B; 1JX9 A; 3KCY A; 2FYU H; 1AI4 A; 2PGG A; 5F2V O; 1WJZ A; 4MS2 A; 3CCM V; 1TUE B; 3OR6 C; 4LWS A; 4RQF A; 5CMU A; 4J9Y B; 4X88 A; 2UUB B; 2Q7G A; 1MG1 A; 1OCZ C; 1NQT A; 2X6A A; 4LF8 B; 2YIB A; 5KUK A; 1HNZ O; 4MVO A; 2ARH A; 3AEI A; 5B5E Z; 1W0J G; 4ZIB A; 2X0L A; 4R7C A; 2IBZ H; 3SPJ A; 3RFR A; 5IWA B; 1YF2 A; 1P7B A; 4X1K A; 2UXX A; 1Y76 B; 2DYS C; 4WBN A; 1NI8 A; 1ZWI C; 3ASO B; 4YJ2 B; 3C90 A; 2L6L A; 2QWR B; 5L3E A; 1GMG A; 2O57 A; 3G6B A; 2QR4 A; 3ZRX A; 4X65 O; 1IXM A; 1S72 V; 4DV3 B; 4NXM B; 3BCC H; 3PJS K; 2A3Q A; 2Z5U A; 4MTG A; 3OMN B; 4OPA A; 1MZE A; 1FXK A; 4AI8 A; 2ZE8 A; 1KMI Z; 1TVK B; 3OFN G; 2WAM A; 4DV2 O; 5IYB O; 2EZP A; 4LFB B; 4DV5 B; 3BHP A; 5GTI Z; 1YJ9 V; 1NU1 H; 3JD2 A; 2E76 B; 2OYQ A; 1M93 A; 2WWW A; 2QWO B; 2BSK B; 4IL6 Z; 3LDC A; 3CXC U; 4EFE A; 2DE0 X; 1MMM A; 3ABM C; 4DR4 O; 2YS8 A; 2KG7 B; 1EFR G; 4UV8 A; 2PI5 A; 3ETE A; 1NR1 A; 1O9G A; 3UO2 A; 2AW9 A; 3AG2 C; 4PI0 A; 3K5L A; 4FLW A; 1GAX A; 3QG5 A; 5GW7 A; 2DYR B; 2DWE C; 3ZRW B; 2V1D A; 1BGY H; 5IYZ B; 1AI7 A; 1QVF U; 3CME V; 1PNL A; 4LF9 B; 3JD0 A; 4CH5 A; 4K0K B; 1IBL B; 4FFK A; 3O65 A; 3JAK A; 1NH2 D; 3ABK B; 3KKY A; 3X2Q B; 4B08 A; 4EKW A; 4G2K A; 2MK3 A; 1SA0 B; 3IC9 A; 2ZE5 A; 3FB8 C; 3AK3 A; 2Y0I A; 4J10 A; 4JYA B; 3TET A; 1QVG U; 3ML0 A; 4FLT A; 4G27 B; 3J80 N; 2VQF O; 2ZM6 B; 4WFG A; 3K0D A; 2HVJ C; 4JGS A; 5J2T B; 1Q6U A; 4NXN B; 2PY5 A; 1SZT A; 2QA4 V; 4UXN A; 3WG7 C; 4DR2 B; 4A5U B; 2JGU A; 2WSS G; 3B2E E; 3WB0 A; 4GX0 A; 2CGO A; 4LF4 O; 3W7S A; 1MA1 A; 1NVP D; 3E8B A; 1Q43 A; 1CXZ B; 1K8A W; 3T2M A; 1KP2 A; 2BOC C; 4I50 A; 2WLL B; 5C8Y A; 1MAB G; 1EN5 A; 1VQO V; 3ZMU A; 2YSU B; 3F7Y C; 2WLN A; 1IBM B; 4LFC B; 3TXQ A; 3LNN A; 4DV4 B; 1FAF A; 1HNX B; 3CRM A; 2YDE A; 1Q5O A; 1XL6 A; 3APQ A; 3AG3 C; 1WLE A; 3JAL A; 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1N0J A; 4FIP C; 3DXR A; 5L3D A; 5IE9 A; 1IBM O; 4LFC O; 1M56 C; 4X64 B; 3K5N A; 1HNX O; 4PD4 F; 1SC5 B; 2B1I A; 1M9N A; 2UXC O; 1Y74 A; 2LQT A; 2VQE O; 1ORQ C; 2Y69 B; 3RYI B; 5IJ9 A; 1YJW V; 1F23 A; 2ZDI A; 5D5Q A; 3OMI B; 3D3Q A; 2W6J G; 3L72 H; 3L71 H; 5FL7 G; 4O4I A; 3E83 A; 5KMG B; 2XAF A; 1GKF A; 2RMK B; 1XNQ O; 5LXT A; 2JEX A; 4K35 A; 4FLZ A; 5CB4 A; 2DQ3 A; 4X20 A; 4JI6 O; 2QWQ B; 5AG2 A; 1JFF B; 1I5Y A; 1FD9 A; 2ZIM A; 5ITZ A; 2UXN A; 2PF4 E; 4UB8 Z; 4CH3 A; 4AIL C; 1VQ6 V; 1NBM G; 2YXL A; 1BMF G; 1VQP V; 4J41 A; 4ZHQ A; 3CB2 A; 3B40 A; 2CUG A; 3JAS B; 3E22 A; 2QM4 A; 4Q6G A; 2IJJ A; 3CJH A; 4GKK O; 1PNM A; 1NJI W; 2ZR3 A; 4DR6 B; 2AZ0 A; 1SZX A; 1IXB A; 4DV0 O; 2P4V A; 5A2Q N; 4NVP A; 3LSS A; 4I4T A; 3B77 A; 2DMX A; 1H2M A; 1FJG B; 2ITD C; 4UCT A; 1THZ A; 4YJ3 B; 4JI7 B; 2OT5 A; 1WAZ A; 1CPY A; 2QWP B; 4ZKI A; 1TUB B; 4PA7 A; 2CGN A; 1X59 A; 3R65 A; 5DED A; 2QTS A; 1NS1 A; 2GUZ A; 3GB7 C; 3BEH A; 4OX9 O; 5JH7 A; 5LMN O; 3BVO A; 3SYO A; 1K92 A; 1NR7 A; 2AHY A; 1QHT A; 4KFM A; 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