The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
78
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structure length |
78
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Chain Sequence |
GPYAQPSINTPLPNLQNGPFYARVIQKRVPNAYDKTALALEVGELVKVTKINMSGQWEGECNGKRGHFPFTHVRLLDQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural basis for regulation of the Crk signaling protein by a proline switch.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Cis isomer of Crk protein
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| molecule tags |
Structural protein
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| source organism |
Gallus gallus
|
| total genus |
9
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| structure length |
78
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| sequence length |
78
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-09-21 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07653 | SH3_2 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1QKX A; 2VKN A; 1T3S A; 2G6F X; 2MIO A; 2OJ2 A; 1G2B A; 2XMF A; 4J9H A; 2ENM A; 2OI3 A; 2LNH B; 2J6O A; 2EPD A; 1ZBJ A; 2CH4 W; 2O31 A; 1UFF A; 1YWP A; 1S1N A; 2BZY A; 2H8H A; 2K3B A; 4AFZ C; 1NYG A; 2ABL A; 1I07 A; 2HEQ A; 2J7I A; 1UDL A; 2RQU A; 2DRM A; 4J9C A; 3VS1 A; 2JT4 A; 2PTK A; 2GBQ A; 2NWM A; 2GTO A; 1GBQ A; 2HDA A; 2KRN A; 2EQI A; 5ECA A; 4HVW A; 1B3Q A; 2DL8 A; 1AD5 A; 4IIM A; 1UGV A; 2LJ1 A; 2JS0 A; 1E7O A; 2CSQ A; 5IHK A; 2F2W A; 4AFU C; 3VS6 A; 1ZUK A; 2LJ3 A; 4Z89 A; 2BZ8 A; 5FWB A; 1Z9Z A; 1UHC A; 2FEI A; 5IHI A; 1X6G A; 2QDL A; 2A28 A; 4JZ3 A; 1X43 A; 2DM1 A; 3ULR B; 2DMO A; 2EYX A; 3VS3 A; 1CKA A; 5FW9 A; 1X6B A; 2D8H A; 4AG1 C; 2CUD A; 4LE9 A; 1Y0M A; 3KFV A; 2YSQ A; 3A98 A; 1K9A A; 2W0Z A; 2X3X D; 1E6H A; 3VRZ A; 3QWY A; 1BK2 A; 1K0X A; 2YUN A; 2AZV A; 1PRL C; 3VS0 A; 2EGC A; 3EHQ A; 1NEG A; 3SEM A; 4LUE A; 4A63 B; 1I1J A; 2DNU A; 2AZS A; 1SPK A; 2KGT A; 1UG1 A; 2BZX A; 5EC7 A; 1KSW A; 3TSW A; 2K9G A; 3EG2 A; 3I9Q A; 3VS5 A; 1ZX6 A; 2E5K A; 2V1R A; 3UA7 A; 4CC3 A; 2HCK A; 2KXC A; 3LH5 A; 1RI9 A; 5GJV B; 1H8K A; 1KFZ A; 2RMO A; 2MOX A; 1M3C A; 2EGA A; 1SHG A; 2YUP A; 2SRC A; 1WIE A; 3PE0 A; 2ESW A; 3RNJ A; 3NGP A; 1H92 A; 1M30 A; 2DE0 X; 2EBP A; 2DL3 A; 1OV3 A; 4HVU A; 2GQI A; 2ED1 A; 5I22 A; 1JO8 A; 2A08 A; 2RQR A; 2KRO A; 2EYW A; 1OOT A; 1QCF A; 1W70 A; 1YNZ A; 2K7A A; 2KE9 A; 5I11 A; 3RBB B; 2L3P A; 2LP5 A; 4M4Z A; 2LQW A; 1MV3 A; 1PRM C; 4J9E A; 1UUE A; 3QWX X; 2BTT A; 2KRM A; 1OPL A; 4JJC A; 1A0N B; 4RTY A; 1AOJ A; 1VYV A; 2J06 A; 4DEX A; 1VYT A; 3PVL A; 3VS7 A; 1U06 A; 2AKK A; 3EG3 A; 1U5S A; 2I0N A; 3UA6 A; 2JTE A; 1KJW A; 2RNA A; 4CC2 A; 2DL4 A; 4OMP A; 2O2O A; 1K0S A; 3I5S A; 3NHN A; 1AEY A; 2CDT A; 4RTV A; 1TG0 A; 1YP5 A; 2C0O A; 1T0H A; 3NMZ C; 1QWE A; 4JJB A; 4RUG A; 2D8J A; 2EYY A; 2FPD A; 2KYB A; 2PZ1 A; 2DJQ A; 3SHW A; 1KIK A; 2DLP A; 4LUD A; 2EVR A; 4LN2 A; 2KR3 A; 3THK A; 3VS4 A; 2YDL A; 3M0P A; 3M0R A; 2FRY A; 2KYM A; 2JMC A; 1IO6 A; 4K11 A; 2EKH A; 2JXB A; 5IXF A; 1ARK A; 2FO0 A; 2ECZ A; 2KXD A; 1I0C A; 2VVK A; 1WX6 A; 3REA B; 2ROT A; 2DL5 A; 1WLP B; 2LMJ A; 5HCK A; 2KEA A; 1WA7 A; 3M0S A; 2CT4 A; 2KBT A; 1FYN A; 4AFQ C; 3M0Q A; 2HBW A; 1SEM A; 1RUW A; 3JV3 A; 4OMO A; 1HJD A; 3CQT A; 1W6X A; 1PKS A; 4RTW A; 2JS2 A; 1AWX A; 2C0T A; 2CSI A; 1CSK A; 1G83 A; 2V1Q A; 2RQW A; 1BU1 A; 1PHT A; 1M8M A; 1ZLM A; 4ESR A; 4GLM A; 2RQV A; 2DBK A; 3H0F A; 1MV0 B; 1WXU A; 4HXJ A; 5FWC A; 3REB B; 3PVQ A; 3EGU A; 2KNB B; 1GCQ C; 4HVV A; 2L0A A; 3TVT A; 3FJ5 A; 4QT7 A; 3EG1 A; 4J9D A; 2C0I A; 2KT1 A; 4JZ4 A; 4KRT A; 1LCK A; 2F2X A; 4HCK A; 2FG0 A; 5IXB A; 2JMA A; 1YCS B; 2J6F A; 3U23 A; 2K79 A; 1UJY A; 1AZG B; 1UJ0 A; 2K6D A; 2O88 A; 1VA7 A; 2FPF A; 2W10 A; 1YWO A; 2DA9 A; 2PNI A; 4R0K A; 1YN8 A; 2D0N A; 4J9F A; 1GL5 A; 3VS2 A; 1VYU A; 2EYZ A; 2FRW A; 3NPF A; 2DBM A; 1ZUY A; 1NLP C; 4RTT A; 4F16 A; 1NYF A; 2HSP A; 2GGR A; 1WFW A; 1NLO C; 1XOV A; 2CT3 A; 5L23 A; 1M3A A; 1HSQ A; 4IIO A; 1OEB A; 1NG2 A; 1JEG A; 1GFD A; 1NEB A; 2CH4 A; 2JM9 A; 1ZSG A; 4LNP A; 1K4U S; 3O5Z A; 1MUZ A; 1CKB A; 1N5Z A; 1H3H A; 1T0J A; 5IH2 A; 2L3S A; 1JU5 C; 2RPN A; 1X69 A; 2MCN A; 4AFS C; 1UE9 A; 3R6N A; 1JXO A; 1PWT A; 3M0T A; 3UF4 A; 4CC7 A; 2RQT A; 4ORZ A; 3H0I A; 2NUZ A; 3H0H A; 4OML A; 2JW4 A; 4EIK A; 1T3L A; 1SHF A; 1ZUU A; 4JPB W; 1QWF A; 2OAW A; 2DVJ A; 1BB9 A; 1UEC A; 1RLP C; 2DF6 A; 2DYB A; 1WXT A; 4AG2 C; 2JM8 A; 2YUO A; 4Z8A A; 1SRM A; 1RLQ C; 1SSH A; 2A37 A; 2KT8 A; 2RN8 A; 1V1C A; 1GFC A; 4DEY A; 2O9V A; 1GRI A; 4Y92 A; 4FSS A; 4D8D A; 1PKT A; 1M27 C; 1SRL A; 1W1F A; 4OMQ A; 1OPK A; 2B86 A; 2VWF A; 1M3B A; 1WXB A; 4X1V A; 5GJW B; 1UHF A; 3GBQ A; 2L3Q A; 2LZ6 B; 2GTJ A; 1QLY A; 2DL7 A; 2J05 A; 1Z9Q A; 2D1X A; 2EW3 A; 1BBZ A; 2O9S A; 3EG0 A; 5IHN A; 1JXM A; 4J9G A; 1K76 A; 1X2K A; 4JJD A; 1AVZ C; 1QKW A; 2GNC A; 1X27 A; 2DIL A; 2IIM A; 2ED0 A; 4RTX A; 4CC4 B; 1TUC A; 2LCS A; 2RF0 A; 1WI7 A; 1AWJ A; 1K1Z A; 1PNJ A; 2DRK A; 1ABO A; 2CRE A; 4WCI A; 1TUD A; 4J9I A; 1ABQ A; 2YT6 A; 2J6K A; 1U3O A; 2A36 A; 1WDX A; 1WYX A; 3IQL A; 4OMN A; 2DX1 A; 2P4R A; 1J3T A; 4D8K A; 1NM7 A; 1X2Q A; 1GCP A; 2ROL A; 3UAT A; 2AKL A; 2LQN A; 4GBQ A; 2AK5 A; 1GCQ A; 4RTZ A; 1JQQ A; 1AWO A; 1UTI A; 2L2P A; 1GBR A; 4Z88 A; 4F14 A; 3TSZ A; 4J9B A; 1B07 A; 2M0Y A; 3I5R A; 2YUQ A; 4ZNX A; 2EGE A; 2CUB A; 1AWW A; 3I35 A; 4F17 A; 2M51 A; 1E6G A; 3ZL7 C; 2SEM A; 2FPE A; 1AZE A; 1Y57 A; 2K2M A; 2X3W D; 4RTU A; 2LX7 A; 4E6R A; 2LJ0 A; 1HD3 A; 3C0C A; 1EFN A; 4OMM A; 3EHR A; 1FMK A; 2KRS A; 3H41 A; 3M0U A; 3VRY A; 2F2V A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1RAI B; 1VQ4 A; 3CCU A; 3P8D A; 4D6W A; 1G2B A; 4JS4 A; 4BE2 A; 2LNH B; 2KI7 A; 2FHD A; 2MWO A; 3LX7 A; 2XG8 D; 1ZBJ A; 1Y96 A; 1YJN A; 1WHJ A; 4C5I A; 1KQ1 A; 1UDL A; 3V8K A; 1YCY A; 4J9C A; 3CME Q; 2GBQ A; 3G71 T; 2DXC A; 4FU6 A; 1QVP A; 2H3J A; 2M9U A; 3JB9 H; 5IN1 A; 2Y90 A; 2DL8 A; 3J81 E; 1UGV A; 2EQK A; 2H3E B; 2LJ1 A; 4XU3 A; 4X34 A; 1VQP Q; 1R0C B; 5IHK A; 2F2W A; 1YJW A; 3ER0 A; 2LJ3 A; 5FWB A; 3E19 A; 1UHC A; 3CPF A; 5IHI A; 5GAM j; 3JCM P; 1X43 A; 1ZQ1 A; 4C8Q F; 5L8R E; 5CKH A; 3JCM c; 2XHC A; 1X6B A; 4F7U F; 1OUL A; 2OTJ T; 5M9O A; 2CP5 A; 3G1J A; 2CUD A; 2YSQ A; 1D1B A; 2JTM A; 3JAM E; 1W2B A; 5CQX A; 2A0F B; 1NEG A; 1LJO A; 1SF9 A; 2YLC A; 2AZS A; 1SPK A; 1YI2 T; 4LXC A; 4DBF A; 2JJ9 A; 4HCC A; 3E1S A; 1KSW A; 3TSW A; 3M54 A; 3L2Z A; 2RD1 A; 1AHJ B; 1KQS A; 2ZAE A; 3I9Q A; 3TU4 K; 1ZX6 A; 3JSC A; 1EX4 A; 2KXC A; 1TSF A; 3JCM g; 2EFI A; 2PUK B; 4M7A B; 2RMO A; 1M3C A; 1I5O B; 1SHG A; 4MMK A; 4RG8 A; 1VQM A; 3ASK A; 5A2Q E; 3VYH B; 3MP1 A; 3RNJ A; 2NUP A; 1M30 A; 3EFS A; 1P92 A; 1OV3 A; 4HVU A; 5GAO p; 4EMK B; 1D09 B; 4C0Z A; 3X25 B; 5GMK l; 1OZ2 A; 1VQ8 Q; 3OS5 A; 2RQR A; 2KRO A; 1G3W A; 4KGZ B; 4QVD A; 1G3Y A; 1OOT A; 4OP0 A; 2KE9 A; 2DIQ A; 3RBB B; 2L3P A; 1VQ4 T; 3CCU T; 3CCL Q; 1PRM C; 2X4X A; 2BTT A; 4PJM A; 1OPL A; 1A0N B; 4XTU A; 1B34 A; 3LGF A; 2BUD A; 1VYV A; 5GAM e; 4DEX A; 4C0F A; 1WQW A; 2CKK A; 2AKK A; 1G5V A; 1U5S A; 2XI9 A; 1YJN T; 1VQ5 Q; 1I4K 1; 2ZGW A; 2K57 A; 1JJ2 S; 2DL4 A; 2QK0 A; 4FT4 A; 3RDV A; 1JJ2 P; 1VIF A; 1FMW A; 2C0O A; 5GAM d; 1ACM B; 2KYB A; 3SHW A; 5HK0 A; 4PJO D; 2KR3 A; 1R8O B; 2DTO A; 5J26 A; 1YIJ Q; 4PK4 A; 2DEQ A; 2QQS A; 4IKF A; 4MDW A; 4M78 G; 3RMS A; 2EKH A; 4A54 A; 1VQL A; 2JNG A; 2KXD A; 1I0C A; 3REA B; 2ROT A; 4DQ2 A; 1NPP A; 3G6E Q; 1WHM A; 1Y7X A; 2HBW A; 2MMP A; 3JV3 A; 2QQA A; 3CBO A; 4OB3 B; 3CQT A; 2HQH A; 1RAB B; 3CCV A; 3EGX B; 2LDM A; 3D7S B; 5DLQ E; 4V2S A; 1B7T A; 1BU1 A; 1PHT A; 4OB1 B; 4BUG A; 4JRK A; 5HK3 A; 2CZ7 B; 4ESR A; 4GLM A; 5LJ3 h; 2R58 A; 3OYI A; 5D7U A; 3H0F A; 3GOX A; 3M56 A; 3CCE A; 1VQO A; 3QBY A; 2RHZ A; 2PQW A; 3HL8 A; 1NE8 A; 2KNB B; 4KH0 B; 3OW2 A; 1BI3 A; 1VQM T; 4DBQ A; 4HCK A; 3X20 B; 2C06 A; 2A7Y A; 2JMA A; 2PUO B; 4C92 D; 2ZPI B; 4MZT A; 3FLG A; 2LT1 A; 2J6F A; 4FSX A; 2K79 A; 1UJ0 A; 3TRE A; 3L2Q A; 2O88 A; 4C0G A; 2JZ2 A; 2D0Q B; 1YWO A; 2RHI A; 3C4S A; 3AHU A; 2DIG A; 3VS2 A; 2NUT A; 3OYF A; 1VQK Q; 3M58 A; 5C6S A; 4OB0 B; 4M7D E; 2CGH A; 1QP3 A; 4F16 A; 2PU9 B; 2A3L A; 3CCQ A; 2K3X A; 4DOW A; 1XNI A; 5L23 A; 1M3A A; 2QTX A; 2CZ1 B; 2BIV A; 5FLX E; 3OYH A; 1JEG A; 4YTL A; 1GFD A; 1RAG B; 3WVD B; 3FEO A; 3QUI A; 1Y96 B; 3MO8 A; 1ZSG A; 2YRD A; 3MJX A; 1K4U S; 1CKB A; 4C5E A; 2IPO B; 1H3H A; 4QKU A; 2L3S A; 3VUZ A; 2RPN A; 1VQ7 A; 1YHQ Q; 1JXO A; 1VQL T; 3LWH A; 1U1S A; 2DFU A; 3H0I A; 4P5N A; 3ZEH A; 3H0H A; 1KQS S; 4M75 G; 1KQS P; 2JW4 A; 4EIK A; 4JRI A; 1BB9 A; 1UEC A; 1DJ7 B; 1ZHI A; 3NTI A; 1KC8 U; 4M78 E; 4M7D A; 2VUB A; 2JM8 A; 2YUO A; 3CCR Q; 1N6A A; 1RLQ C; 1SSH A; 3CCV T; 2A37 A; 1BIB A; 5KCH A; 4M7A F; 1V1C A; 1KC8 R; 2RHY A; 3OYN A; 3CC2 A; 2Y4X A; 4Y92 A; 1SRL A; 1I81 A; 4HT9 A; 2M0O A; 1VQO T; 3CCE T; 4OMQ A; 2QYZ A; 2VWF A; 1M3B A; 2BKD N; 3EFR A; 2GTJ A; 1QLY A; 2DL7 A; 1BBZ A; 2O9S A; 5CVI A; 5C0M A; 2R5M A; 4N0A A; 1K76 A; 1X2K A; 3VU3 C; 4PJO E; 2P84 A; 2HQE A; 2FZC B; 3BE3 A; 5KYW A; 3I56 Q; 1D1A A; 1X27 A; 2DIL A; 4DBH A; 3KXT A; 1TUC A; 2LCS A; 1KC8 C; 3CCS Q; 4M78 A; 2MPX C; 1K1Z A; 1PNJ A; 2CRE A; 2YT6 A; 2CP0 A; 3IQL A; 1WDX A; 4JDS A; 2NUP B; 1IXD A; 4PJO C; 4D8K A; 1NM7 A; 1X2Q A; 1GCP A; 3UAT A; 1QP2 A; 4GBQ A; 2LQN A; 1JQQ A; 1IGQ A; 2DZ9 A; 3CCQ T; 3OBY A; 4Z88 A; 4M77 C; 3HFO A; 3TSZ A; 4J9B A; 4A4E A; 1Q81 U; 1B34 B; 3GIB A; 2XID A; 3AT1 B; 3NTK A; 2VXE A; 1TH7 A; 1AWW A; 2E5Q A; 2LT4 A; 3ZL7 C; 4IUU A; 2SEM A; 2FPE A; 4MDX A; 7AT1 B; 3DB3 A; 4E6R A; 3HTR A; 4LDX A; 1VQ7 T; 3OA6 A; 5FU6 B; 3UWN A; 1MMD A; 4FM4 B; 2OX7 A; 3DLM A; 1KHC A; 2KRS A; 3H41 A; 5J3B A; 2FZG B; 3JCM e; 2DYI A; 2VKN A; 2VYT A; 4O6J A; 2E3I A; 2G6F X; 3RR6 A; 4XTY A; 4FYV B; 2ENM A; 3QO3 A; 2OI3 A; 2QGF B; 1WJQ A; 4M75 E; 1Q81 C; 2EPD A; 1YIT A; 2CH4 W; 5GAN f; 2EJG A; 2O31 A; 5KYX A; 3CC2 T; 3PMT A; 2H8H A; 3A8G B; 4AFZ C; 3UT1 A; 1TXQ A; 4FIB A; 4C92 C; 5DM7 R; 2E4H A; 3JCM d; 1M5Q 1; 3G7Z A; 2COW A; 1S72 Q; 1JB0 E; 2JT4 A; 1KG1 A; 2MI6 A; 3MEU A; 2GTO A; 5ECA A; 2HDA A; 2EQI A; 3CD6 Q; 4HVW A; 3JB9 I; 4IIM A; 1M90 U; 3OYB A; 5LJ5 j; 4ZGD B; 1M90 R; 1Z9Z A; 3L2R A; 4BB7 A; 4C8Q D; 1O75 A; 5CIU A; 4FT2 A; 3X26 B; 3CME A; 3LW5 E; 3INZ A; 3T9N A; 3VS3 A; 4E2F B; 4XAX B; 4ELZ C; 5FW9 A; 3NFC A; 1LPL A; 5CKE A; 1VQP A; 4LE9 A; 1JJ2 A; 1Y0M A; 4M75 A; 3KFV A; 2W0Z A; 2X3X D; 2IG0 A; 5AYF A; 1BK2 A; 1K0X A; 2XDD A; 1Q86 U; 2ZPH B; 1PRL C; 5CR2 A; 4A63 B; 3SEM A; 1KQ2 A; 3JB9 D; 1XJW B; 1JBM A; 2RB6 A; 1QVG S; 1Q86 R; 1QVG P; 5EC7 A; 3CC7 Q; 1M90 C; 1UB4 A; 2NUT B; 3MEV A; 2K9G A; 2RI2 A; 1TUG B; 4HT8 A; 2E5K A; 3MP8 A; 1LNX A; 4JLG A; 4CC3 A; 1ZBX A; 5GMK h; 2LQ8 A; 2FZK B; 4JS5 A; 4A4K A; 4FL6 A; 3G4S Q; 4BE1 A; 4RKU E; 2GF7 A; 3OMC A; 2DE0 X; 4L5G A; 2GQI A; 3OYA A; 4KBM B; 1JO8 A; 2A08 A; 1X01 A; 1VQN Q; 2D6F A; 3URG A; 3A5Z B; 5I11 A; 1Q86 C; 3CPW S; 2HKN A; 3SWN C; 1KK7 A; 5LJ5 e; 4M4Z A; 2LQW A; 3CPW P; 1V76 A; 1MNE A; 4J9E A; 4ZGJ B; 3QWX X; 4NL2 A; 1RAD B; 1AOJ A; 1VYT A; 3C94 A; 3PVL A; 2QG9 B; 1YIT T; 4KT0 E; 1U06 A; 4BDY A; 3FB9 A; 2RJD A; 1VQ8 A; 4XTZ A; 5IAY A; 4N4I A; 3P8H A; 2O2O A; 1ZA1 B; 1K0S A; 3I5S A; 5LJ5 d; 4M7D B; 4XU0 A; 4KGX B; 3CCL A; 3ZFJ A; 1QQJ A; 1TG0 A; 1YP5 A; 3SFM A; 2IVW A; 4JJB A; 1HXD A; 2HAX A; 2EYY A; 2KY9 A; 2PZ1 A; 2XU8 A; 2RHX A; 3QZ5 B; 4LUD A; 5D6W A; 1OQK A; 3LWI A; 1VQ5 A; 5HY6 A; 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