The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
78
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structure length |
78
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Chain Sequence |
GPYAQPSINTPLPNLQNGPFYARVIQKRVPNAYDKTALALEVGELVKVTKINMSGQWEGECNGKRGHFPFTHVRLLDQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural protein
|
| source organism |
Gallus gallus
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| publication title |
Structural basis for regulation of the Crk signaling protein by a proline switch.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Trans isomer of Crk protein
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| total genus |
7
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| structure length |
78
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| sequence length |
78
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-09-21 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07653 | SH3_2 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2J6F A; 1J3T A; 2ESW A; 3EG2 A; 4RTY A; 2FPF A; 4X1V A; 2LP5 A; 1JXO A; 2V1R A; 4AFQ C; 1JU5 C; 2K79 A; 2YUO A; 4J9D A; 1IO6 A; 1SRM A; 4RTT A; 5IXF A; 2KEA A; 1M3A A; 1NM7 A; 2DIL A; 1BBZ A; 1CKB A; 2RQU A; 4CC3 A; 4JZ4 A; 2C0O A; 4RUG A; 5GJW B; 1OV3 A; 2L3P A; 2KT8 A; 3ULR B; 4HXJ A; 3SHW A; 2ROL A; 1WXT A; 1RLQ C; 1CKA A; 1V1C A; 2HCK A; 1WXB A; 2B86 A; 2DRK A; 1T0H A; 1H8K A; 3GBQ A; 2CSQ A; 1AWX A; 2YUQ A; 1M27 C; 2EKH A; 4RTZ A; 2YUP A; 2LX7 A; 1ABO A; 1RI9 A; 2J05 A; 4GLM A; 1MV0 B; 1Z9Q A; 2M51 A; 1OOT A; 5IH2 A; 2KRN A; 3VRY A; 1ZUU A; 1K76 A; 2SRC A; 1VYV A; 1JO8 A; 4D8K A; 2DM1 A; 2PZ1 A; 5IHN A; 3QWY A; 2I0N A; 4F17 A; 1B3Q A; 2RQT A; 1TUC A; 3NPF A; 1H3H A; 1M8M A; 3VS5 A; 3PE0 A; 2JXB A; 2EPD A; 2DBM A; 2V1Q A; 1QCF A; 1BB9 A; 2G6F X; 1UFF A; 2KXC A; 3ZL7 C; 1K9A A; 1YWO A; 2LJ1 A; 1ABQ A; 4EIK A; 2E5K A; 1I1J A; 4J9C A; 2YT6 A; 2DL3 A; 4GBQ A; 1SHG A; 1NEB A; 2J7I A; 4OML A; 2O9S A; 2AK5 A; 1M3B A; 3TSZ A; 1UJ0 A; 2KRO A; 4J9F A; 1TUD A; 1GCQ C; 1I07 A; 2JW4 A; 4KRT A; 1PHT A; 2LMJ A; 2CT3 A; 2EYW A; 1ZUK A; 2AKL A; 3RBB B; 2DF6 A; 1KSW A; 3QWX X; 1UE9 A; 3C0C A; 3TVT A; 2LQN A; 1AEY A; 2LZ6 B; 2K6D A; 2BZ8 A; 1HSQ A; 3UA6 A; 2O9V A; 1E6H A; 4JJC A; 4D8D A; 2LQW A; 5HCK A; 4IIM A; 2HSP A; 2KYM A; 2W0Z A; 2MCN A; 1TG0 A; 1K4U S; 3JV3 A; 2SEM A; 3A98 A; 1X6G A; 2AZS A; 2DLP A; 2DBK A; 4LUE A; 1NEG A; 1PKS A; 3H41 A; 4OMN A; 1UGV A; 2DJQ A; 2M0Y A; 1X6B A; 2EYZ A; 4J9G A; 1U5S A; 1W70 A; 3PVQ A; 4RTX A; 4J9B A; 1W6X A; 2D1X A; 3H0I A; 2CT4 A; 4OMQ A; 1ZX6 A; 4JJD A; 2OJ2 A; 2YUN A; 2VVK A; 1BU1 A; 2DA9 A; 1T3S A; 1JQQ A; 1K0S A; 2JM9 A; 2RNA A; 2X3W D; 5FWC A; 4AFZ C; 2OI3 A; 3NHN A; 2GGR A; 2F2V A; 3I5S A; 3LH5 A; 1LCK A; 1VYT A; 1AD5 A; 3UF4 A; 2KBT A; 3IQL A; 4JJB A; 5FW9 A; 1M30 A; 2FRW A; 1GBQ A; 2EW3 A; 4OMO A; 1ZLM A; 4WCI A; 5FWB A; 1WIE A; 1K0X A; 4JZ3 A; 5IHI A; 1UJY A; 2JTE A; 2VWF A; 2DNU A; 3VRZ A; 4JPB W; 3NGP A; 1T0J A; 2A36 A; 1AWW A; 1FYN A; 1SEM A; 2NWM A; 3TSW A; 1E7O A; 1GFD A; 2ED0 A; 4E6R A; 1JXM A; 3REA B; 1NYG A; 2CUD A; 2EGA A; 2RQW A; 1GCP A; 2JS2 A; 1Y57 A; 1MUZ A; 2DMO A; 1WX6 A; 1X2Q A; 3O5Z A; 1OPL A; 2EVR A; 4LUD A; 2D8J A; 1NLP C; 4ORZ A; 1NLO C; 2F2X A; 3VS7 A; 4J9E A; 4J9I A; 2F2W A; 5L23 A; 4RTW A; 2JS0 A; 1ZBJ A; 1HJD A; 1YNZ A; 4ZNX A; 3EHR A; 2KRS A; 2ECZ A; 2J6O A; 4CC2 A; 4IIO A; 5I22 A; 4Z89 A; 3NMZ C; 2C0T A; 2GBQ A; 1PWT A; 1KIK A; 1QKW A; 2KR3 A; 3H0H A; 1VYU A; 2CDT A; 1OPK A; 1AZE A; 4DEY A; 2KGT A; 2RPN A; 2DX1 A; 3SEM A; 2A28 A; 2P4R A; 1YCS B; 2J6K A; 4M4Z A; 3VS2 A; 3UAT A; 1G83 A; 1U06 A; 1ZSG A; 1OEB A; 1AWO A; 2AKK A; 2YDL A; 1SHF A; 1UUE A; 3CQT A; 1B07 A; 1WA7 A; 1YN8 A; 3VS1 A; 2DL8 A; 2LJ0 A; 2K9G A; 2JM8 A; 3R6N A; 4OMP A; 3EHQ A; 2EGC A; 2A08 A; 2BTT A; 1W1F A; 4HCK A; 1GRI A; 1AVZ C; 2NUZ A; 2FG0 A; 4HVV A; 3VS3 A; 5ECA A; 2L2P A; 2EGE A; 2DE0 X; 2D0N A; 2GTJ A; 4HVW A; 3VS6 A; 1ZUY A; 1HD3 A; 2ENM A; 1UTI A; 4R0K A; 2O88 A; 1XOV A; 4F14 A; 2LCS A; 4Z8A A; 2HBW A; 3M0T A; 1S1N A; 2EYX A; 1U3O A; 1WYX A; 1NG2 A; 2GNC A; 2KYB A; 2O2O A; 2HDA A; 1VA7 A; 2K7A A; 2JT4 A; 1T3L A; 3I5R A; 2RQR A; 4HVU A; 2JMC A; 2PTK A; 4K11 A; 1QWE A; 2EBP A; 1QLY A; 1WI7 A; 1Z9Z A; 2YSQ A; 1JEG A; 1X2K A; 2A37 A; 1X69 A; 1BK2 A; 2KXD A; 2ROT A; 1PKT A; 2KT1 A; 4AFS C; 2DVJ A; 3REB B; 1GL5 A; 2DL5 A; 1PRM C; 4FSS A; 1KJW A; 3M0P A; 1AWJ A; 2BZX A; 2FRY A; 3M0U A; 2LNH B; 2MOX A; 4Z88 A; 2O31 A; 2RF0 A; 3EG0 A; 3THK A; 3M0Q A; 3VS4 A; 3I35 A; 1EFN A; 1WXU A; 1H92 A; 2IIM A; 2DL4 A; 1UEC A; 3VS0 A; 1SPK A; 1YP5 A; 2DL7 A; 1M3C A; 1WLP B; 4ESR A; 3M0R A; 2AZV A; 1SSH A; 1UHC A; 3EGU A; 2CH4 A; 1KFZ A; 2OAW A; 1A0N B; 2L0A A; 2KE9 A; 1UG1 A; 2PNI A; 1N5Z A; 2CUB A; 1WFW A; 2BZY A; 2ABL A; 2RQV A; 1YWP A; 3EG3 A; 2VKN A; 4AG2 C; 2CRE A; 3M0S A; 4A63 B; 2X3X D; 2GTO A; 2C0I A; 1NYF A; 3EG1 A; 1I0C A; 2FPE A; 3PVL A; 2XMF A; 2CH4 W; 1UDL A; 1K1Z A; 5EC7 A; 4LE9 A; 1MV3 A; 5IXB A; 2FPD A; 5GJV B; 1SRL A; 1ARK A; 2L3Q A; 3FJ5 A; 5IHK A; 2CSI A; 2DRM A; 2K2M A; 2MIO A; 4OMM A; 1G2B A; 2KRM A; 4LNP A; 4LN2 A; 2DYB A; 3KFV A; 1FMK A; 3U23 A; 1PRL C; 2GQI A; 2JMA A; 1X43 A; 4RTU A; 2H8H A; 4QT7 A; 4F16 A; 3RNJ A; 2L3S A; 2ED1 A; 2RN8 A; 1GBR A; 1PNJ A; 5I11 A; 2J06 A; 2W10 A; 4Y92 A; 3UA7 A; 2FO0 A; 1GCQ A; 1WDX A; 1Y0M A; 2RMO A; 2D8H A; 4J9H A; 1GFC A; 1RUW A; 2EYY A; 4CC7 A; 1AZG B; 4CC4 B; 1UHF A; 4AG1 C; 4AFU C; 1X27 A; 2HEQ A; 2KNB B; 4DEX A; 3H0F A; 4RTV A; 2EQI A; 1RLP C; 1QWF A; 1QKX A; 2LJ3 A; 2QDL A; 3I9Q A; 1E6G A; 1AOJ A; 2FEI A; 2K3B A; 1CSK A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4FU6 A; 1M2V A; 4OB3 B; 4KUD K; 4PJO F; 4M77 D; 1JB0 E; 1KQS S; 1NPR A; 1X01 A; 3SWN C; 2V1R A; 4AFQ C; 1R0C B; 3CME Q; 4DOW A; 2KY9 A; 1IO6 A; 1U1S A; 4M78 G; 2KEA A; 3CCS A; 2E6N A; 1M3A A; 3QYH B; 2DIL A; 2PU9 B; 2P0P A; 5GMK e; 5GAM j; 2R5M A; 2K2V A; 1VQO Q; 1MGQ A; 1OV3 A; 2KT8 A; 4F7U B; 1G3W A; 1WXB A; 3AT1 B; 2B86 A; 1M1K C; 3CME T; 1H8K A; 2E70 A; 2CGH A; 2CSQ A; 4BI4 A; 4FT2 A; 1M1K U; 4C5G A; 2YUP A; 1NJI U; 1ABO A; 1YHQ Q; 3N5B B; 4GLM A; 1VQO T; 2K57 A; 4E2F B; 1OOT A; 1TOV A; 2HL5 C; 2LCC A; 4C92 C; 1FXX A; 5IH2 A; 3RKX A; 1EIF A; 1KC8 C; 5J3B A; 1VYV A; 1JO8 A; 2DM1 A; 1NPP A; 4M7A F; 2EJG A; 3CCR Q; 5IHN A; 2I0N A; 5CK9 A; 1B3Q A; 1KC8 U; 1D0Z A; 2QXF A; 3CCJ Q; 3PE0 A; 4IUP A; 2KK4 A; 2EPD A; 1YHQ T; 5AT1 B; 1WQW A; 2XD0 A; 2LJ1 A; 1M1K R; 2E5K A; 2LT4 A; 4J9C A; 1JRI A; 2DL3 A; 4BDY A; 2HNI A; 1M8V A; 2J7I A; 3CME A; 3MP1 A; 3JB9 H; 2ZPE B; 2OX7 A; 1M3B A; 4E7I A; 4HT9 A; 4AMC A; 3CCL Q; 1Y7X A; 4BD3 A; 3CCR T; 3CD6 Q; 1OX9 A; 1Y07 A; 2HBP A; 3J7A F; 1IHW A; 5KH6 A; 1PHT A; 2VB6 A; 3MET A; 5IN1 A; 3CCJ T; 1ZUK A; 2KDS A; 3QWX X; 1KC8 R; 2RJF A; 3DLM A; 2LZ6 B; 2K6D A; 1R77 A; 4M75 C; 1Q86 U; 2HZY A; 3EFO B; 1ACM B; 3CCL T; 5DLO A; 2JNG A; 3CD6 T; 1H3Z A; 3RDV A; 4XTU A; 5IAY A; 3OS2 A; 4OMN A; 1ZHI A; 1UGV A; 2AT1 B; 1KQS P; 2E5Q A; 3E1S A; 1IZ6 A; 2QYZ A; 1Q81 C; 1I5O B; 4M77 G; 3CCR A; 2QI2 A; 4J6X A; 3J81 E; 2CT4 A; 3TEE A; 1Q81 U; 3EG9 B; 2OJ2 A; 5CQY A; 1LVK A; 2P0Q A; 4IUR A; 2RNA A; 3WVD B; 5GAN 5; 4LDY A; 3NHN A; 4C8Q E; 1VYT A; 2R58 A; 1KD1 U; 1M90 C; 3CCL A; 4LDU A; 3CPF A; 3EGD B; 4JJB A; 4C92 E; 3CD6 A; 1M30 A; 1U1T A; 2VXF A; 3FLG A; 1OZ2 A; 1JBM A; 2XDB A; 3EGD A; 1Q95 G; 4OMO A; 2YWW A; 1ZLM A; 4WCI A; 1MHN A; 3MEU A; 1WQ7 A; 4LXC A; 3DLL A; 4XQ3 A; 1KQ1 A; 3QBY A; 2A36 A; 1SEM A; 2NWM A; 3NTH A; 5C6S A; 2A7Y A; 1GFD A; 4QKU A; 3HRT A; 3FDR A; 2ED0 A; 1JXM A; 1NYG A; 1IGQ A; 3QPH A; 2DXU A; 2JS2 A; 4N0A A; 3VUB A; 2QTX A; 1RAA B; 3RES A; 2EVR A; 5HK0 A; 2G3R A; 4M7D E; 1M90 R; 3TU4 K; 4PJN A; 4J9I A; 4XTY A; 4RTW A; 2JS0 A; 3I56 A; 2CS7 A; 1HJD A; 1RAB B; 3EHR A; 4M75 E; 1SKU B; 4CC2 A; 2LQ8 A; 3AHU A; 4IIO A; 4Z89 A; 2EWN A; 2QQB A; 3RKW A; 1QKW A; 2CP5 A; 2DER A; 2PVG B; 2DX1 A; 2P4R A; 3TQ7 P; 2J6K A; 4E7S A; 1TS9 A; 1VUB A; 4X34 A; 3JCM X; 2IVW A; 2AKK A; 2YDL A; 2ZGW A; 2FYK A; 1SHF A; 5LJ5 e; 1YN8 A; 4QQ6 A; 4E7J A; 4M77 B; 3L2V A; 2RA2 A; 2MWO A; 5FLX E; 2OTJ Q; 3GLX A; 3VU3 C; 2XK0 A; 4OMP A; 1WHH A; 4J5Y A; 4PFO A; 4XU1 A; 2A08 A; 2PUK B; 4HCK A; 4C5E A; 1GRI A; 1VQL Q; 2RH2 A; 2NUZ A; 2FG0 A; 4F7U F; 1UEB A; 1VQP A; 3HKS A; 3VS3 A; 2DO3 A; 3S3N A; 3JCM d; 1YI2 A; 1ZUY A; 3VYG A; 1UTI A; 4BY6 B; 1JJ2 S; 2GQV A; 2O88 A; 2OTJ T; 3M5A A; 1KQ2 A; 1OYX A; 3JCM W; 2ZZD A; 1D1C A; 3V7C A; 1WYX A; 1NG2 A; 2KAF A; 1VQL T; 3S6W A; 2HDA A; 2YRC A; 1VA7 A; 2K7A A; 1T3L A; 2RJE A; 3X24 B; 2KMT A; 4HVU A; 1QWE A; 3RR6 A; 3GNG A; 4V2S A; 1YJ9 A; 2PQW A; 5HK3 A; 4B9W A; 1PKT A; 4FT4 A; 4FYW B; 5CKF A; 3REB B; 1GL5 A; 2L89 A; 3TCJ A; 1KJW A; 1MMG A; 3M0P A; 2DXT A; 1RAF B; 2BZX A; 2JOY A; 5GMK h; 1DJ7 B; 3THK A; 2QAZ A; 2QEX A; 3M0Q A; 2B8A A; 1H92 A; 2OTJ A; 3VS0 A; 3E19 A; 4R55 A; 4N4G A; 4ZN1 A; 1VQL A; 2HSE B; 4PJO A; 2VXE A; 5DY9 A; 1QVF S; 1UG1 A; 4ZTF A; 1I5L A; 1N5Z A; 2CUB A; 5LJ3 d; 2YRD A; 1WFW A; 4JS5 A; 1OQK A; 5CIU A; 1D1B A; 4N4I A; 3CCM A; 4JRI A; 2E65 A; 2C0I A; 1NYF A; 3JCM c; 3A1P A; 5GAO l; 4DBF A; 2RJD A; 1IRX A; 4E7K A; 2K5L A; 3M59 A; 5EC7 A; 5KE3 A; 1UGR B; 4FYX B; 1FMV A; 2FPD A; 3CMA A; 2CZ6 B; 1ARK A; 3JB9 I; 1K8A C; 1VQ8 A; 3OW2 A; 2MIO A; 4JDS A; 1K8A U; 1B7T A; 1K9M C; 2BKD N; 2VUB A; 2DJZ A; 1IB8 A; 3SB2 A; 3SD4 A; 3QDF A; 5C0M A; 1HK9 A; 2RHY A; 2VC8 A; 3VJP A; 2KI7 A; 1N9S A; 1K9M U; 2RN8 A; 1GBR A; 2JJ9 A; 5I11 A; 4AT1 B; 2RK2 A; 4BY6 C; 4M7A A; 1JJ2 P; 2D8H A; 5LJ5 j; 4KUL A; 1VQ9 A; 1GFC A; 1RUW A; 3QJY A; 1AZG B; 3LGL A; 1VQN Q; 4AG1 C; 1X27 A; 4CI0 C; 1QVG S; 1UGP B; 4RTV A; 3SDZ A; 3LX7 A; 1RAE B; 4JJN K; 4WF2 A; 4GLK A; 1B34 B; 3I9Q A; 1NE8 A; 2V26 A; 3CC4 Q; 3FC3 A; 2EIF A; 3RKY A; 1JJ2 A; 2K3B A; 1B34 A; 2F1L A; 1YFN A; 4QVZ A; 2BUD A; 3EAE A; 4X1V A; 2RJC A; 1VQN T; 1XNI A; 1JXO A; 2H3J A; 5GAN 4; 1JU5 C; 2K79 A; 1X6O A; 4J9D A; 1XTD A; 2PVO B; 1Q82 C; 2QQA A; 4RTT A; 5IXF A; 3CC4 T; 1NM7 A; 1WNL A; 3FJP A; 1CKB A; 3SWN A; 1TSF A; 4IUQ A; 3EGX B; 1Q82 U; 1MMA A; 1VQM Q; 2C0O A; 2LVM A; 3LGF A; 4HCZ A; 2L3P A; 3ULR B; 1UB4 A; 4IUU A; 2ROL A; 4PJO C; 3C4S A; 3CC7 Q; 3JSC A; 1CKA A; 2HCK A; 2R57 A; 2RHZ A; 2DRK A; 2MPX C; 3X20 B; 1AWX A; 2YUQ A; 3OQ5 A; 1QVF P; 3QZ5 B; 5LJ5 f; 4RTZ A; 2X4Y A; 3JCM Q; 2PVD B; 2LX7 A; 2RI5 A; 1RI9 A; 3E9F A; 4XU3 A; 1VQM T; 3OBY A; 1VQN A; 3VRY A; 5EG2 A; 4C0D B; 4EMK B; 1ZUU A; 2K3X A; 1PD0 A; 3CC7 T; 2I2L A; 4DA4 A; 1QP2 A; 3CC4 A; 9ATC B; 2K3Y A; 3NPF A; 2DKG A; 1H3H A; 1M8M A; 4NL3 A; 3VS5 A; 2LDM A; 1YBY A; 2FL7 A; 2DXB A; 3L2W A; 2JN0 A; 4OF1 A; 2DBM A; 3CCS Q; 1YIJ A; 1BB9 A; 1Y96 B; 1UFF A; 2KXC A; 2DEQ A; 1I1J A; 4KUI A; 1R0B G; 1PD1 A; 4OML A; 2K5F A; 3V8L A; 2KRO A; 3QDR B; 4J9F A; 4L6V 5; 4ZGJ B; 4KGX B; 2DZ9 A; 2LTO A; 4KRT A; 4M7A C; 2LMJ A; 2CT3 A; 1OU9 A; 4A4E A; 3V7R A; 1VQM A; 2DF6 A; 1QW1 A; 3CCS T; 3OS1 A; 4OGE A; 3TVT A; 1WJQ A; 4A4F A; 3X28 B; 8AT1 B; 1VQK A; 2BZ8 A; 4JRP A; 4BAC A; 3CC7 A; 5LJ5 h; 1HSQ A; 5J39 A; 1IXD A; 4QQD A; 2NUP A; 3UA6 A; 1QVG P; 1X75 C; 2XDD A; 4FIB A; 2LQW A; 5HCK A; 3ZBD A; 2X4X A; 2HSP A; 3V7S A; 2FVU A; 1K4U S; 5I21 A; 2SEM A; 1QMC A; 2Z0W A; 2DLP A; 4LUE A; 3PT9 A; 4BE1 A; 3CCV A; 1X6B A; 1D3B B; 2JZ2 A; 5CAI A; 1W70 A; 1WHK A; 3PVQ A; 3GIB A; 4RTX A; 1D1A A; 1Y71 A; 4J9B A; 1W6X A; 4A53 A; 2RHI A; 1LOJ A; 3OYJ A; 4PJO E; 2E10 A; 2DYI A; 3QYG B; 1VIF A; 4OGC A; 2VVK A; 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