2L4QA

Solution structures of oxidized and reduced thioredoxin c from m. tb
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
MTDSEKSATIKVTDASFATDVLSSNKPVLVDFWATWCGPCKMVAPVLEEIATERATDLTVAKLDVDTNPETARNFQVVSIPTLILFKDGQPVKRIVGAKGKAALLRELSDVVPNLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution structures of Mycobacterium tuberculosis thioredoxin C and models of intact thioredoxin system suggest new approaches to inhibitor and drug design.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin
molecule tags Oxidoreductase
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 32
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-10-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2l4qA00
3TDGA 4V2LA 4TR1A 3HXSA 4MPGA 1ZCPA 2HXKA 4PQ1A 3Q6OA 1TTZA 4MK3A 5KN2A 3F4RA 5B6NA 4TN8A 3TOTA 19GSA 2I9HA 2L57A 1K0MA 4ZB6A 5ECQB 1YKAA 4MMMA 4KB3A 2JSYA 3HVSA 5F07A 4L0UA 5D8IA 3BCIA 3IXRA 3IV4A 4K7IA 3KCMA 4Q5FA 3A2WA 1ILOA 1XWGA 3IOSA 2X8CA 2WGRA 3HYPA 4IQAA 2H66A 3M9KA 4K8MA 1X5DA 1RW1A 1A24A 2L4QA 3L9VA 1XZOA 1Z3EA 1WMJA 2YZUA 5ID2A 2AB6A 4NWYA 1PN9A 2IFQA 1GTIA 4ML6A 4HJMA 4YH2A 2KUCA 3EYTA 3TRPA 1CQGA 1A8LA 3FHKA 4PURA 3IDVA 1U3IA 2MMOA 1I9DA 4OCEA 4KW6A 3TJBA 4P3YB 2FNOA 2VLTA 3GNJA 4N30A 5J4UA 1XVWA 1EOHA 4ZBAA 3UBLA 2MMZA 5A4UA 4PUFC 4NHWA 4PUAA 1H4OA 3H1NA 4PGTA 3UAPA 1A8YA 4D73A 1MDIA 2L6CA 4BWSA 1XWAA 4OWYA 3MAKA 1SD9A 3BJ5A 2LJKA 2CAQA 3V1WA 1T3BA 2N5BA 1F6MC 2X8GA 1ABAA 2TRCP 1GWCA 2TRXA 3HCZA 3IHQA 2B6MA 1UA5A 4ZBDA 5B8BA 3F4TA 2LNSA 1ERWA 5AGYA 3UBKA 4TXOB 1YF0A 3UMAA 3M1GA 4RI6A 4LMVA 1FOVA 5IMCA 3QMXA 1URMA 3TRQA 3DXBA 2LRTA 5CO3A 4ECBA 3WGXA 3HY2A 4F03A 3P7XA 4H86A 1EEJA 16GSA 1Z6MA 4HOJA 2FA4A 2VIMA 3FEUA 2B1LA 2DJKA 4OMVA 5F0GA 5FT3A 2YJ7A 4EDYA 4RUVA 4ACSA 1TU8A 2WFCA 1TK0B 3I69A 3IK7A 4Z7XA 1R26A 1NHYA 1UVZA 2PBJA 3MNGA 3FR6A 5DJMA 1QUWA 5L71A 1PL1A 2HE3A 1QMVA 2FD3A 2KHPA 1GUHA 2JZSA 3C7MA 4L8EA 4KH7A 2VL2C 2H76A 4WF5A 2YV7A 1I5GA 4WEYA 5B8AA 2B7JA 4MH2A 3KTLA 3IR4A 1GSYA 1HNAA 1S3CA 1J9BA 1QGVA 3ZITA 1B9XC 4PNFA 5JCUA 1SK0A 2C0FA 3Q19A 2OE0A 3APOA 4CDOA 3ZL5A 3WGEA 3S9FA 1ZOFA 1ZYEA 4MLYA 2M46A 4FYCA 3M0FA 3AY8A 2XHFA 2PVQA 1B4QA 3KMNA 4MA9A 3SWLA 6GSYA 2H1DA 1IYHA 1TU7A 4QL7A 2G2QA 4NXIA 1QXHA 4I2TA 2YV9A 2P0GA 1DUGA 3IE3A 3GH6A 4GQCA 5JCGA 2C80A 4DSSA 1WOUA 3VWWA 1TKDB 1X5CA 6GSTA 4DEJA 1HD2A 5JWQB 4F2IA 5ECRB 5G1LA 5ECSA 3US3A 14GSA 3GL3A 5G5EA 3QOUA 1SJ6A 4NPBA 2L5LA 1TDIA 1YQ1A 4TOPA 2H70A 3HZ4A 1AC1A 4KNDA 1AUCA 3CRUA 4LA1A 3ERGA 5LD0A 2E7PA 3A5WA 3L9SA 2MMAA 3M9JA 4JR6A 3FZ9A 3R2QA 2HRNA 3F63A 1GSFA 1FB0A 2C0GA 3DWVA 3FR9A 2OA7A 2YWMA 4KDYA 1NW2A 4DVCA 4ZL7A 3L9UA 3L4NA 1HQOA 3G9BA 3TJKA 3PH9A 1F37A 1XWKA 1AIUA 2D2ZA 2K8SA 3UVHA 1U87A 5E4WA 2VCXA 5HR3A 1EGOA 2VL3A 4MJAA 4KAEA 2CZ2A 2H8LA 5ELGA 5COHA 3ZFBA 3IC4A 3H93A 4ISDA 1EWXA 3EINA 2GZZA 3L78A 4ECJA 1K0CA 2DMMA 5AIXA 3P2AA 2A2RA 1EOGA 3ZRDA 2MZCA 3M3MA 1JLWA 1LBKA 1Z5YE 4JEDA 3FW2A 4XRAA 2FCHA 4G10A 3C1RA 6GSUA 2PGTA 1G6WA 1V40A 5C00A 1GRXA 2B1KA 4HEA2 2PPTA 4PQIA 2ALBA 1GSEA 4WBJA 3UEMA 2XPDA 4GRFA 2IWTA 3JCML 2N5FA 1MEKA 2GT5A 3VWXA 3F3RA 4TR1B 4XS4A 1ON4A 3HJMA 3ZZXA 4MF6A 1ERVA 5CRWA 1YZXA 3BOAA 3IPZA 5IPHA 1RQMA 3FRCA 2K18A 2VCVA 5ECPB 3CTGA 1XWBA 1BAYA 4HUAA 2ON7A 3ED3A 2L6DA 1Z9HA 1K3LA 4JBBA 4BWQA 3HVVA 1YDKA 2YJHA 4ZB9A 5J9BA 4NAXA 3FZ5A 4IJIA 1O73A 4PNGA 2H6YA 1NM3A 4F0CA 2O85A 2GDRA 5ID2B 1K0NA 1OAZA 3TKPA 3IBHA 2IFQB 2F3MA 4XIHA 3IRAA 2REMA 3ERWA 2PMTA 4ZL9A 2J23A 4POBA 1WP0A 4KUNA 5IOXA 1A0FA 2GTUA 5DVBA 22GSA 2C3QA 5G31A 2GZPA 2HYXA 3ZMLA 1N8JA 4K2DA 1JLVA 1XXUA 2HZEA 3QFAC 2O89A 4X0XA 2CA8A 2IJYA 18GSA 3GA4A 2HFDA 1GTUA 4OFMA 1XIYA 3FY7A 2H71A 2GZYA 2P31A 3MDKA 2PN8A 4KGIA 4D73B 4YQUA 4GTUA 3N5OA 1TOFA 5GAND 1XFLA 3GSSA 1NSWA 2V2GA 1XW9A 3QR6A 5DDLA 1M2AA 1X0RA 3CTFA 1Z6NA 5ECMB 1SKRB 2YPMA 1ERUA 1XW6A 2CV4A 3O6TA 2VCTA 1KTEA 2J9HA 2HRFA 5J5NA 1GUMA 1DSBA 3HJPA 3CXGA 3W6GA 4EDZA 2DJ3A 1M2BA 4HI7A 1WWJA 3ZVJA 3C1SA 3G7JA 4FYBA 4OFNA 5H5RA 3E9JB 2VCWA 2LV3A 1T8EB 3OR5A 1OC9B 2FY6A 3MSZA 4X43A 4F0BA 1FVKA 4L0WA 4ZB8A 1M9BA 4J2FA 2YCDA 5IMFA 1LJRA 4XTSA 1HYUA 2PWJA 2GQLA 2C3NA 3DIEA 4K6XA 6GSXA 2WRTA 1B8XA 2GSTA 3FK8A 2ZCTA 1J0FA 4N11A 2E2MA 2IIYA 2IMIA 1GNEA 3E0UA 2JADA 2CVBA 2P5RA 1GLQA 1THOA 4IW9A 1NHOA 2OJLA 2R4VA 5LNKe 4ZILA 2WS2A 1AQXA 4YAVA 1JZDA 5D96A 1FHEA 2CT6A 3D0ZA 6GSVA 2H73A 5EVOA 1WIKA 4RI7A 4NV5A 5H5SA 4OCFA 5ECHB 4MZWA 3UJ1A 3ZIJA 3GMFA 4K7NA 2AAWA 2LUSA 4LMWA 2GSSA 3QDNA 4GQFA 1YKCA 2VAFA 1TI1A 4HZ2A 2AHEA 2DLXA 2F8AA 1B4PA 4Q5QA 1K3OA 4EC0A 2OACA 1A2LA 3RPNA 4K7OA 1PKWA 3QFBC 1K0AA 2Z9SA 1JZRA 4JZQA 1GSQA 1YJ6A 4IP1A 2LS5A 1VF4A 2X8HA 4WR4A 2BMXA 4ULXA 12GSA 3GTUA 3QD9A 2E2GA 3UOMA 3HJOA 5HFGA 4GSNA 1F2EA 3LWAA 1S3AA 3A3TA 4ILFA 1PKZA 4JRRA 2H19A 5IMAA 4OD7A 4IJ3A 3GKKA 1FO5A 1ST9A 1OC9A 1AXDA 4BVXA 4HZ4A 4Q5RA 2DJJA 1E2YA 2QGVA 4AJ8A 3BD2A 3GL5A 2H0GA 3DEXA 1J08A 4N0VA 3GH9A 3F9UA 3Q74A 5DAKA 1OE8A 1AQWA 1YF1A 1EP7A 4Q5NA 2PU9C 1THXA 5IPGA 1F9MA 2H0IA 5G2ZA 4DSSB 4N0ZA 3DD3A 1GTBA 2M80A 4WF4A 1M99A 5IMZA 4O5RA 2ZUPA 3LYPA 3UARA 3NOFA 2NTOA 1M2DA 4XHMA 4ZIJA 4O7HA 1TRWA 3TKSE 3DYRA 3TRXA 4RQRA 2C8UA 4EXJA 3F8UA 4EO3A 1SKWB 2KP2A 2IMFA 5GSTA 4XCSA 3TCOA 5EL8A 1XW5A 4V1Ap 1A23A 1TK8B 1OE7A 1T00A 1GP1A 4ZL8A 4AF2A 4EVMA 2B7KA 4X1UA 4DSRA 4G9HA 2LSTA 2A4VA 1PGTA 1E6BA 2LQQA 5IQYA 4K0GA 2WJUA 3M8NA 2OBKA 1GSDA 3EMPA 2VLUA 2KP1A 1DBYA 4QQ7A 4I97A 3G7YA 2GSQA 2IMKA 3KXOA 1TXXA 1ZGNA 4KCAA 2CVDA 2HNLA 10GSA 1ERTA 2FUG2 2VD0A 2HI7A 2O8VB 1T1VA 2HSYA 3HZ8A 3FR3A 5ECIB 2H0HA 4HQSA 1T4ZA 2R6KA 1MDKA 4WXTA 1Q98A 4MCUA 4BL7A 2OADA 2V1MA 2BJXA 1SK1A 4ML1A 3LXTA 3WD6A 2EIOA 1HNBA 2OBIA 1PX6A 2F51A 5KEJA 2H01A 1FG4A 3RHCA 2IMEA 4E8HA 2ON5A 3ZVJD 2R3XA 2GVPA 4LLRA 3WT1A 11GSA 4GLTA 2EIQA 2HSHA 4IGJA 4ZXGA 1TW9A 5ENUA 2HLSA 2LNTA 4IS0A 1TRUA 1JFUA 1AAZA 5F8BA 1A2JA 1SL1B 2YANA 1OKDA 1GL8A 1T7PB 3TJFA 3CSIA 2LJRA 1MTCA 2FLSA 4I6XA 4K1FA 1JZWA 3PGTA 3DGQA 4XRDA 4GF0A 2VOCA 1MD4A 2B5EA 4KCEA 4XS4B 2IMDA 4HS1A 3QAWA 1U6TA 2DJ1A 5HQPA 3KGKA 13GSA 2V32A 4OFTA 1TJDA 5IO0A 3KZQA 2LRNA 4MJBA 4EF0A 4IVFA 2H30A 1O85A 3O76A 1XOAA 3FKFA 4IBPA 2B5YA 3LXZA 2M72A 2JZRA 3QAVA 1U88A 5IO2A 2VCZA 4KE3A 2RLIA 2L59A 2RM5A 5GAPD 1R5PA 3N9JA 1MD3A 2HZFA 2B3SA 5IOWA 1YEPA 1QK8A 4O92A 3F0IA 2V41A 3F6FA 3DKSA 3LGCA 1F3BA 2R2JA 1SL0B 3ME8A 4WETA 1USBA 5ECKB 2HZEB 5IMVA 2X99A 5CRHA 2CVKA 3EWLA 4ZBBA 4XS1A 3EU4A 1SKSB 2ES7A 5FWGA 2H75A 2LRCA 5ECNB 1O81A 2CX4A 2PVOC 3VWVA 5INYA 5DALA 2CAIA 1PRXA 2I1UA 4MZCA 4V2MA 4WR5A 1S3DA 4IN0A 3I6AA 4FYUA 3DMLA 1VF2A 5HR2A 2JSZA 4CHSA 4TKYA 3W8JA 3J7Yb 2CZ3A 2MBTA 1V2AA 3EE2A 2LKUA 5CAXA 2P5QA 5AISA 5A4VA 1K0DA 5GZZB 6GSWA 2A2SA 2CQ9A 5F05A 3I43A 4JE1A 1SJZA 1QFNA 2R37A 4NV2A 3VI5A 1K0OA 5HFIA 4LL1B 4KSOA 2ZNMA 2KLXA 3H8QA 4JU5A 1SK2A 2V6KA 1W89A 1M0UA 1GLPA 2IL3A 3EC3A 3ZYWA 2GGTA 5B6MA 3KP9A 4DSQA 4POMA 3L0HA 2C1YA 8GSSA 4BPYA 3P8WA 3HD5A 5IM9A 5HR0A 1V9WA 1G7EA 2NVLA 1EV4A 3E3EA 3ERFA 7GSSA 2DJ2A 1XWCA 2VL9A 5DQSA 2VUPA 3BCKA 3KH9A 3LORA 4F9ZA 3MWHA 2DIYA 2I81A 1SYXA 4OO5A 1EP8A 2EC4A 5CYYA 3ZTLA 3TKSC 3GN3A 1KNGA 1UN2A 3PR8A 4RQXA 3TKQA 5EPFA 4TRXA 1BQ7A 4HU7A 2E0QA 2JZTA 2FWEA 2C0DA 2AUVA 4GWRA 3GTUB 1KBNA 1YY7A 2WULA 1XPVA 1ZYQB 2RM6A 2FGXA 3F6DA 5EY6A 2WCIA 3GURA 2O87A 3KD0A 2QKEA 2FHEA 2VL2A 2VD1A 3KEBA 3KJYA 3HHVA 2XBIA 4L5OA 4I8BA 3EVIA 1ZL9A 1OYJA 1PD21 3KIJA 1GSSA 3SBCA 5D9TA 5DAKB 3LYKA 2DMLA 1TI3A 4AJ6A 1O8XA 5KN0A 5D9WA 2NDOA 4WKWA 1UC7A 2YWOA 5DQYA 2X64A 1JZOA 3VWUA 1XBSA 3VK9A 4ECIA 4TVEA 1OKTA 4OO4A 2I4AA 1WE0A 2KOKA 2F8FA 1G0TA 3GSTA 2OKAA 4MH3A 1PSQA 5D9VA 2NBSA 3HVXA 3GFKA 4TR0A 5JCWA 1WJKA 3DVXA 4MDCA 4GSSA 3CSHA 1GSUA 3I9V2 4GCIA 1V58A 3D22A 1R4WA 1GNWA 2DBCA 3KH7A 3C71A 2AV4A 1EV9A 9GSSA 3KMOA 2H74A 3PINA 5D9XA 4YAPA 3UL3A 4EUYA 1YEXA 3D5JA 3A2VA 1AQVA 2FWFA 2I3YA 3CMIA 3LSZA 4J57E 3D21A 3ZFLA 1TK5B 1H75A 3GX8A 1TP9A 1K3YA 3EMXA 2YZHA 5AN1A 3RPPA 1CQHA 1X5EA 3FYGA 5JWRB 4LL4B 3APSA 20GSA 5H5QA 5C04A 3VI7A 3KTBA 4HU9A 1IYIA 2VCQA 1O8WA 2V6OA 2GS3A 4IKHA 4K0NA 1RK4A 2H1AA 4TXVA 2MMNA 1K0BA 1N2AA 3LEFA 4CW9A 2JU5A 2G0FA 2YOIA 3KP8A 1BJXA 3QPMA 2O7KA 2PUKC 3CYNA 2DIZA 3U5RE 5CNWA 3C73A 4WBRD 3HA9A 3QAGA 2K9FA 3IK9A 2WDUA 5CRDA 2NPBA 4KDUA 4POLA 1MDJA 1EEMA 3UVTA 4PQHA 5B7CA 3H79A 4K9ZA 4O32A 2AJQB 1Y6EA 3NZNA 3EU3A 4L5LA 2LEGA 2DSAA 3ZIVA 4HJ2A 3QCPA 1WRYA 5J9CA 1F3AA 5J41A 1EZKA 4I5QA 3TOUA 2JACA 1ZMAA 1VRSD 2L4CA 3LFLA 1SD8A 4MF7A 2YWIA 4ID0A 3G7IA 5IIZA 3RDWA 1DE1A 2FA8A 1KEBA 4TXOA 5F06A 3RHBA 5DCHA 3K8NA 3VURA 4JR4A 2VM1A 1V57A 4TW5A 2RIIA 5GSSA 1M9AA 4MJCA 2IPAA 1SU9A 2YP6A 1AW9A 3P90A 1FVJA 2K8VA 5ECLB 3GRXA 5FHIA 2RUFA 1SYRA 3ZMKA 5JWOB 3D4TA 2H72A 2GQKA 2RUEA 1XCCA 2XPEA 1OC8A 3GV1A 1TRSA 4HDEA 4IP6A 4KA0A 1XOBA 2WB9A 5DCGA 3BBYA 3RBTA 1FW1A 1TRVA 5HFKA 5G5FA 1G6YA 1OVNA 1R5AA 4IELA 1SENA 4GXZA 4YQVA 3CRTA 2OE1A 4MJEA 1A2MA 3LQ7A 2MBSA 1PA3A 2F9SA 5DALB 3HKRA 1M7TA 3GX0A 5DBQA 5A4WA 4TR3A 1PL2A 1PQNA 4AGSA 3Q18A 4I2UA 1X9WB 2VM2A 4PX1A 4TR4A 4POKA 3RAZA 3TJJA 2YNXA 3GUSA 4GSTA 2IN3A 1T4YA 1OC3A 3TKSA 3A2XA 3F3QA 4V2NA 3VPQA 3TUEA 4MABA 2YN1A 2GT6A 1Y25A 1Z7RA 2GLRA 5G1KA 3IA1A 3APQA 4G19A 2PERA 5CRGA 1G7OA 1VF3A 3WYWA 2H6XA 5D73A 3VLNA 4XS6A 4IHUA 5AIVA 1PX7A 1SJIA 2AYTA 4BA7A 3EURA 4EKZA 2DC5A 1B9YC 3GKNA 4J56E 17GSA 2BTOT 2JL4A 5ECOB 1BYEA 3GIXA 3ISOA 3VFIA 1W4VA 1O6JA 3D6IA 5HR1A 2N5AA 3KM6A 2LJAA 6GSSA 4EL1A 1O7UA 1Q4JA 2R5GA 3O3TA 3FZAA 5ABRA 3IAS2 2MYGA 1SL2B 1XVQA 2LTKA 2QSIA 1GTAA 1R7HA 4NHZA 5CP1A 4E8EA 3CBUA 4MPFA 1ZZYA 3GYKA 1WPIA 2OE3A 4KSMA 1X9SB 1LU4A 5LCZA 2VO4A 4FH8A 4MZBA 2C3TA 5J3RA 4HQZA 3ZREA 3H4KA 2EIRA 3TJGA 3ME7A 5E59A 4F82A 4IQ1A 2C4JA 3LG6A 3DRNA 3W8SA 5KN1A 2LQOA 4AJ7A 4YQMA 5DJLA 2VLVA 3HDCA 2H1GA 1C72A 2XBQA 2H1BA 4G2EA 5CREA 2YWNA 4NMUA 3DVWA 4MF5A 3GKMA 1Z7PA 3F4SA 1ACVA 3U6VA 2TIRA 4MP4A 3LJRA 1VGLA 3ZLPA 1VF1A 3C8EA 1HNCA 1X9MB 3NIVA 5KN3A 4BVYA 2B5XA 4PXOA 2XC2A 1V98A 1ML6A 5ELAA 1JHBA 4ECCA 2CX3A 1A0RP 4FIWA 1U3AA 3D4MA 1QQ2A 2QC7A 3J7Yk 2GQMA 4N10A 4KX4A 5D93A 3CSJA 4KDXA 2HT9A 1FB6A 1B48A 3FZ4A 2GSRA 1BG5A 1BX9A 5IMDA 1PMTA 3TB2A 2DJ0A 4V1Ag 4EE0A 3GKXA 3TKRA 1FAAA 3TGZA 2WZ9A 3WT2A 1GH2A 2FWHA 3IAM2 4FO5A 3UIWA 3WGDA 1GUKA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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