2L4QA

Solution structures of oxidized and reduced thioredoxin c from m. tb
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
b'MTDSEKSATIKVTDASFATDVLSSNKPVLVDFWATWCGPCKMVAPVLEEIATERATDLTVAKLDVDTNPETARNFQVVSIPTLILFKDGQPVKRIVGAKGKAALLRELSDVVPNLN'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution structures of Mycobacterium tuberculosis thioredoxin C and models of intact thioredoxin system suggest new approaches to inhibitor and drug design.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin
source organism Mycobacterium tuberculosis
molecule tags Oxidoreductase
total genus 32
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-10-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2l4qA00
5EL8A 2WB9A 3KZQA 4K7OA 2VM2A 1EV4A 5KN2A 2K8SA 1EEJA 3KTBA 20GSA 4O5RA 1XWCA 1GTIA 1FB6A 3VWVA 2C0FA 2HLSA 2VL9A 3EMXA 1MDJA 2VLTA 3KMOA 4Q5RA 2H76A 1Z5YE 3FR9A 4MH2A 3IE3A 4YAVA 2N5FA 1GTBA 4ZXGA 1U3AA 4RQRA 3Q6OA 1ABAA 1SKRB 1GSYA 3VFIA 5GAND 2PMTA 9GSSA 2GZPA 1O8XA 2QC7A 2DC5A 3RAZA 2IMKA 2NBSA 3VPQA 1SK0A 3QAVA 3WT2A 5CRWA 5HQPA 5IIZA 1HQOA 4LA1A 3QPMA 4PQHA 4TXOA 2WDUA 4HUAA 1G6WA 3US3A 4I5QA 4LL4B 4WR5A 1OC9B 2VOCA 3HJPA 4WBJA 3H8QA 3VURA 2HT9A 1F3AA 2C1YA 2GT6A 1M7TA 3DXBA 5H5RA 1OC9A 1WP0A 1M2BA 2GVPA 4DEJA 3N9JA 3RDWA 2RUFA 3IA1A 5B8BA 2NDOA 3M0FA 3FZ5A 1BX9A 2DLXA 5A4UA 4OMVA 1A2LA 3IPZA 4IVFA 5J9BA 4XIHA 2HFDA 3H1NA 1K0BA 1T00A 5AIVA 1O81A 4WXTA 1V58A 4PQIA 4XRAA 2WRTA 3NZNA 3RBTA 4ZBAA 3G7JA 2L4CA 2RLIA 4MJEA 3ISOA 4ACSA 2X8GA 4WR4A 5D8IA 3HA9A 3C1SA 2LJKA 4AGSA 1F37A 2IPAA 2R2JA 3HZ8A 1GSUA 5IMAA 1ERWA 3ZIJA 3F0IA 3UOMA 2FA8A 4WBRD 3LQ7A 4GQCA 4J2FA 2YANA 3GHAA 5H5SA 3OR5A 4EDZA 3Q19A 4NMUA 1W4VA 3CBUA 4KDYA 4OFMA 4IHUA 1PMTA 1XFLA 5F0GA 3SWLA 1XWGA 4ZB6A 1TTZA 1TU8A 3MAKA 4ZL9A 4TVEA 3KTLA 5GZZB 3KP8A 2N5BA 3F8UA 2DMMA 4IN0A 4FYBA 3GL3A 3GKNA 4TXVA 2PBJA 2H1GA 1SENA 2YZUA 5H5QA 2G2QA 4MDCA 2GSSA 1OC3A 4PXOA 5IMVA 3TB2A 2E2MA 1MD3A 4NV2A 1SL0B 1H75A 1V2AA 3PH9A 3CSIA 4EXJA 1XW5A 5ECRB 1HYUA 1SU9A 2L5OA 1K0OA 3TJGA 4WEYA 1PN9A 5J9CA 2WS2A 4V1Ap 4OCFA 3M3MA 2GQKA 1T4ZA 4KDXA 1DBYA 2J9HA 1R5AA 1VF2A 3HDCA 5DQSA 3APSA 1N2AA 4NHWA 1U6TA 2YN1A 4HI7A 3MWHA 4ULXA 4NWYA 5J41A 2GQMA 3DWVA 5ECIB 3QDNA 4YQUA 2MBTA 4XHMA 2LQQA 1GSSA 4I97A 1ST9A 4HJ2A 3F6FA 4MZBA 5D9WA 1I5GA 3KXOA 3CTFA 4XTSA 2DJ2A 3LYKA 1F3BA 5ECKB 4H86A 4MZCA 2A2SA 4G10A 3HD5A 3KEBA 2ZNMA 2PGTA 3IC4A 5EY6A 3LG6A 3DIEA 1Z7RA 2MMOA 3GTUB 14GSA 1XZOA 3PINA 2YWNA 3G7IA 1OE7A 4HJMA 4TW5A 5IQYA 2N5AA 3A5WA 1J9BA 2MZCA 3GTUA 3F4TA 2KUCA 5IMFA 3FY7A 5C04A 1R4WA 4IQAA 2I9HA 4DSRA 4KE3A 4K0NA 3TRXA 3HVXA 3ZRDA 4ZBBA 1Z6MA 3TRQA 1PSQA 5ECQB 2ALBA 3KCMA 5GSTA 2HYXA 4RUVA 3LGCA 4WETA 1RW1A 4K9ZA 4GCIA 5D96A 2P31A 3VK9A 3CSJA 2E2GA 2C3NA 1WPIA 3GSTA 4MH3A 1FG4A 2VLVA 3UAPA 2X99A 3GL5A 4K1FA 1EWXA 2P5RA 1XVQA 2V1MA 2RM5A 5KN1A 1SL2B 1K0NA 4X43A 3EU3A 1YDKA 1UA5A 3UIWA 3IOSA 3L0HA 2ON5A 1HNBA 4I8BA 1GNWA 3ZYWA 2R37A 2OBKA 2GZZA 2DIZA 2VL3A 4GF0A 3DVWA 5G31A 2CVDA 3WD6A 2L6CA 4I6XA 1QUWA 3CMIA 4EKZA 4F2IA 1AQWA 3LXZA 1GTUA 3ME8A 1WOUA 4ZILA 1K0MA 1SD9A 2O7KA 4GWRA 1PGTA 2YZHA 4POBA 5A4WA 1Y25A 3W6GA 4N30A 2H6XA 1JHBA 5EVOA 3O3TA 2LNSA 3ZZXA 4EVMA 4ZL8A 5ECMB 3IXRA 3I9V2 4DVCA 2WCIA 4G2EA 4KB3A 2B5EA 3GX8A 2MMZA 2XBIA 1JZDA 1PA3A 2H1AA 4TR3A 3DEXA 5C00A 3RPNA 4BVXA 1Q98A 3MDKA 4HZ4A 2C8UA 2MMAA 2F8AA 5ID2B 4MPFA 2JL4A 1YKCA 4CDOA 4L0UA 2JSZA 2QSIA 4JU5A 1YJ6A 3BJ5A 5F07A 2C0EA 4LMWA 2GQLA 17GSA 2PUKC 2H8LA 3A2WA 3IK7A 2HNLA 4ID0A 2VM1A 1T8EB 1DSBA 4JZQA 1K3YA 4PX1A 1BJXA 1B4QA 2LTKA 3ED3A 2JZTA 3GH6A 1LBKA 3GIXA 3C73A 3VPTA 11GSA 2LJRA 2KHPA 3GURA 1TU7A 2I3YA 2LJAA 3TCOA 4MPGA 2FGXA 1TJDA 4KX4A 1TRSA 1X9MB 1GUHA 5IO2A 4DSSB 5D93A 1VRSD 5ECNB 3QFAC 2GS3A 2C0GA 1NM3A 3EURA 3TKSA 3W8JA 3F6DA 3HZ4A 4HDEA 2YPMA 2IMIA 1OKTA 1FVKA 3GFKA 1PKZA 2FHEA 5IMCA 3QAWA 4Q5NA 3MNGA 1BYEA 1MEKA 3IDVA 2C3TA 3D4TA 1GWCA 2VD1A 4KCEA 5JCGA 5IMZA 3BOAA 2E7PA 1XPVA 2HRNA 1PL2A 5ECOB 4BWQA 3ERFA 1N8JA 1MTCA 1EOGA 1M99A 3IAM2 4ILFA 3V1WA 1U3IA 1EV9A 3I6AA 3KM6A 3ZLPA 1X9SB 2YV9A 16GSA 2AB6A 4XCSA 2OE1A 3H79A 1B9YC 3E0UA 1X5CA 1G0TA 2IIYA 2YJ7A 3HYPA 3KGKA 5HFIA 4Q5QA 1TDIA 6GSYA 4L8EA 2OE0A 4ML6A 3TJFA 3NOFA 1THXA 3CYNA 2VUPA 4IBPA 3IHQA 2R6KA 5HFGA 2M80A 1GRXA 1I9DA 2H0HA 1USBA 1M9BA 4MJAA 2HXKA 3FYGA 1GUMA 1MD4A 3FRCA 5JWRB 4KGIA 1XVWA 4QL7A 3EC3A 3D22A 2DSAA 3VI5A 2H19A 1GTAA 3KH9A 2ON7A 5AISA 1EEMA 3RHBA 2DIYA 3HCZA 1G7EA 3D0ZA 4KAEA 2FLSA 2GDRA 2OKAA 3FR6A 1V57A 2CZ3A 2GGTA 5DJLA 1K3OA 3QFBC 4N10A 3GUSA 3P90A 5HFKA 3ZMKA 4RQXA 1A2MA 3W8SA 4YH2A 1GSEA 1WE0A 1YKAA 4K6XA 3U6VA 1FOVA 5IMDA 1TRUA 1O8WA 4GRFA 3M1GA 3ZIVA 3KD0A 6GSXA 1X5EA 2VCWA 4IP1A 2I4AA 3GV1A 2DJJA 4F9ZA 1Z7PA 4KCAA 2OACA 2CX3A 1YQ1A 5DAKB 2B3SA 1A2JA 3HKRA 2D2ZA 2R4VA 2TRXA 1QXHA 3WYWA 3TOTA 4L5OA 22GSA 3L9VA 4ML1A 3HJMA 1G6YA 4X0XA 1MDIA 4Z7XA 3KJYA 2CAQA 4FH8A 4BA7A 1XW9A 4POKA 2B7JA 5CRGA 1TRWA 3ERGA 4TRXA 4EC0A 1V98A 4YAPA 3FK8A 1XXUA 5DJMA 1XOAA 2EIRA 6GSUA 1YF1A 3DGQA 1EP8A 2H66A 4BWSA 2FWHA 2F3MA 2C3QA 2ES7A 2M72A 4F03A 2VD0A 2CT6A 4IQ1A 1A8YA 1TK8B 1UC7A 2B5YA 19GSA 3CTGA 1ML6A 2VIMA 4EO3A 2NTOA 2H0IA 4GSSA 3WGXA 5HR3A 4JRRA 3LORA 3GKMA 1K3LA 2H75A 3DVXA 5ECPB 2BJXA 2JADA 5G5FA 4GSNA 2H74A 4D73B 4MF6A 2WGRA 3TJKA 4AF2A 5B7CA 1TP9A 1E6BA 4XS6A 1SYRA 3D21A 1UN2A 2JSYA 4QQ7A 1EP7A 3DRNA 2FWFA 1F9MA 1WJKA 3KP9A 4RI7A 1FAAA 4KNDA 2R5GA 2GSTA 3MSZA 1XWAA 3TUEA 3VLNA 5CO3A 4MP4A 1CQHA 4OCEA 3D6IA 3AY8A 2YJHA 3HXSA 3QCPA 1GH2A 1QK8A 2DJ1A 1IYHA 1ILOA 1X5DA 3GKKA 2JACA 3F4SA 1OKDA 5CP1A 2H70A 2FD3A 3CRTA 3GA4A 3IAS2 3O76A 1OE8A 2REMA 4FIWA 3TJJA 3RPPA 5J4UA 4XS4B 3IRAA 5AGYA 1TK0B 2VLUA 2YWMA 2LKUA 5B8AA 1S3AA 1TK5B 2LRNA 4V2NA 3S9FA 3P7XA 5LCZA 2RIIA 2FA4A 6GSWA 1NW2A 3FKFA 1SYXA 3A2XA 4KUNA 4XS4A 5FT3A 4J56E 1A24A 1AC1A 1JZOA 1WWJA 5DCHA 4ZB9A 2BTOT 1ERUA 1RK4A 2JZSA 2G0FA 3IBHA 3QMXA 4IKHA 3F4RA 4FYCA 3A3TA 5D9XA 2RM6A 1DE1A 1T4YA 10GSA 4LMVA 3TKPA 1THOA 3DYRA 1A0RP 3TDGA 5F05A 4X1UA 3UARA 5ECHB 1XWKA 4NPBA 2CZ2A 1AAZA 1SKSB 1ON4A 2FY6A 2ZUPA 5A4VA 3QD9A 2VCVA 1ZL9A 3Q18A 3PR8A 2C4JA 4ZB8A 4YQMA 3APQA 3VWWA 5E4WA 1PX7A 4BVYA 1VGLA 5D9TA 3HHVA 3QR6A 2KLXA 3ZVJA 2A2RA 2X8HA 3H93A 2L4QA 2CA8A 4V1Ag 1QFNA 2CAIA 6GSVA 2X64A 3TKRA 1AXDA 5DVBA 2OBIA 1Q4JA 3L9UA 4LLRA 1BAYA 3UBKA 4N0VA 2E0QA 4O32A 3FZ4A 4GTUA 4MZWA 1GLPA 4PNGA 2LS5A 2H1DA 2H73A 2WFCA 2B5XA 3F3RA 2K8VA 3TKQA 1OC8A 2WULA 4AJ8A 2P5QA 1O7UA 4ZL7A 2C0DA 4N11A 1M0UA 4K8MA 5FHIA 1B9XC 1GL8A 6GSSA 5COHA 2P0GA 4J57E 4MJCA 7GSSA 4E8HA 3E3EA 2CQ9A 5DALB 3C8EA 3EVIA 1ZOFA 2VCXA 3J7Yb 1XIYA 4HU9A 2YP6A 1A0FA 1RQMA 4V2MA 5DALA 2I1UA 2RUEA 1J0FA 1AQXA 4ISDA 4PUAA 2PVOC 2H0GA 5ID2A 3BBYA 4K7NA 3DMLA 2HI7A 4PUFC 3NIVA 2HRFA 5DCGA 2LEGA 2B6MA 1K0DA 4HZ2A 2HSHA 4OD7A 2CVBA 2IWTA 2L5LA 1SJZA 1BQ7A 2YCDA 2NVLA 2AYTA 3WGEA 3IV4A 3EU4A 4GLTA 3CSHA 2TRCP 5LD0A 1FB0A 2HZEB 2VL2A 3EE2A 4JEDA 4OFNA 4MJBA 4K2DA 5LNKe 3FW2A 3LYPA 2K9FA 4IGJA 2FWGA 5IM9A 3ZFBA 2HZEA 5D73A 3GMFA 3ZITA 4QL9A 2ZCTA 1TXXA 4MMMA 2KOKA 3GYKA 4NAXA 3ME7A 2B1LA 4DSSA 5G1KA 4HOJA 1M2AA 2FCHA 5JWOB 1H4OA 2FWEA 4PQ1A 5INYA 4GSTA 5EPFA 2I81A 2Z9SA 3LXTA 5F06A 4JE1A 1OYJA 2A4VA 3RHCA 3P2AA 5DDLA 4O7HA 1K0CA 3F3QA 3R2QA 5ECSA 4EF0A 1DE2A 1J08A 4CHSA 3D4MA 4ZBDA 5D9VA 1U88A 4XS1A 1UVZA 3APOA 5G2ZA 5CNWA 1M9AA 4O92A 4MK3A 2XBQA 5AN1A 4POMA 1S3DA 3A2VA 4ECIA 4JR6A 2O85A 4IS0A 5B6MA 3I43A 3UVHA 3ZREA 2FUG2 4YQVA 2NPBA 4V2LA 2CV4A 1JFUA 2L57A 3ZVJD 5B6NA 4TXOB 1VF1A 4HQZA 2JU5A 4F82A 3FZ9A 4K0GA 1PX6A 1BEDA 2PWJA 4GXZA 4POLA 13GSA 1AIUA 1EOHA 1URMA 3TKSE 4EUYA 2XC2A 5GAPD 1G7OA 1AUCA 2GLRA 3IR4A 2H1BA 1SL1B 1NHOA 1QMVA 18GSA 3GNJA 5DBQA 1QGVA 1Y6EA 4WF5A 4ECBA 3TGZA 3CRUA 2IJYA 1GULA 1E2YA 4E8EA 2H6ZA 2OJLA 1KBNA 3ERWA 2C80A 2GSRA 2MYGA 4TN8A 1F6MC 4NHZA 1VF3A 2L6DA 5FWGA 4G9HA 4P3YB 3ZFLA 3N5OA 3EWLA 2V41A 1NSWA 4XRDA 2GSQA 2YNXA 3P8WA 4TKYA 2DJ3A 2FNOA 1X0RA 4IW9A 1TI1A 1AW9A 1WMJA 3ZL5A 1XBSA 1HNAA 4FYUA 5DAKA 1TKDB 4BPYA 1A8LA 2VO4A 3D5JA 2H72A 1A23A 4MA9A 5CYYA 3U5RE 4IJ3A 3K8NA 4L0WA 3TJBA 2AUVA 1XW6A 4L5LA 3JCML 5IOXA 1FVJA 3DD3A 2GZYA 3LEFA 3F9UA 1LU4A 1YY7A 1GSQA 2V6OA 1SK1A 2LRTA 1PD21 5CREA 1SD8A 3LJRA 2IMFA 4ZIJA 5L71A 4MF5A 1ZCPA 2YWOA 4N0ZA 3CXGA 1YF0A 2IFQB 3L9SA 1HNCA 4I2UA 5ELGA 5KN3A 1T3BA 1EGOA 2GTUA 1XCCA 1ACVA 2PU9C 3IK9A 2R3XA 4HU7A 2VCZA 2JZRA 2F51A 2IFQA 4OO4A 1B4PA 2M46A 2O89A 4D73A 3UEMA 1FW1A 5ABRA 1GNEA 1ZGNA 5JCWA 1GUKA 4PGTA 2IN3A 2YV7A 2H71A 2GT5A 1B48A 5HR1A 1SK2A 2DJ0A 1U87A 2IMEA 5IPHA 3UBLA 1IYIA 4I2TA 3KH7A 5AIXA 3UMAA 1X9WB 1TI3A 1DUGA 5IO0A 3WT1A 3G7YA 2H01A 3M9JA 1MDKA 4BL7A 4TR1B 1M2DA 1O73A 1O85A 4KSMA 1ZZYA 1TW9A 4MLYA 4PNFA 3EYTA 4TR1A 1B8XA 1V40A 2V32A 1YZXA 3GH9A 2XHFA 1R7HA 4KSOA 3GN3A 4OO5A 2K6VA 3DKSA 2AJQB 4MCUA 4KA0A 3GRXA 3WGDA 2OE3A 2H30A 2LV3A 2DMLA 2O87A 2OA7A 2F8FA 1KTEA 2K18A 4NXIA 2WJUA 2MMNA 5G30A 5A5KA 1C72A 2CX4A 3UVTA 4ECCA 3VWUA 1SKWB 5HR0A 4GQFA 1ZMAA 1ZYEA 1Z6NA 2LQOA 2LNTA 3BCKA 3UL3A 3HVVA 4EE0A 3J7Yk 3KIJA 4WKWA 5CAXA 1PRXA 1F2EA 2X8CA 2AHEA 2DBCA 6GSTA 4JR4A 4RI6A 5DQYA 5J3RA 1T1VA 1K0AA 3GKXA 3L4NA 2PPTA 4LL1B 2OADA 4G19A 1GP1A 3C71A 1QQ2A 2QGVA 3EMPA 1NHYA 1TRVA 2VL2C 1GSFA 4AJ6A 1AQVA 3HY2A 5HR2A 1S3CA 1XWBA 2DJKA 2PERA 2BMXA 1FHEA 3ZTLA 4TR0A 4NV5A 2O8VB 2VCTA 3TKSC 1CQGA 2LRCA 3F63A 2HE3A 3BD2A 1VF4A 4KW6A 1GLQA 1O6JA 2PN8A 2L59A 12GSA 2EIQA 1BG5A 2V2GA 5IOWA 1YEXA 1KNGA 3H4KA 2TIRA 3L78A 5CRDA 3FZAA 4IJIA 1PKWA 3O6TA 1JZRA 5E59A 2J23A 1JLWA 2YWIA 1JZWA 3FHKA 3UJ1A 3HVSA 2LSTA 1ZYQB 2KP2A 1HD2A 1WIKA 3C1RA 2QKEA 3EINA 4KH7A 4EDYA 3G9BA 2V6KA 3TRPA 1T7PB 1Z9HA 2IMDA 3GX0A 4CW9A 4HQSA 4HEA2 5JWQB 5J5NA 5CRHA 2LUSA 4EL1A 1ERVA 2AV4A 4MABA 1Z3EA 2PVQA 3LFLA 1SJIA 2WZ9A 2VAFA 2MBSA 1FO5A 4FO5A 4F0CA 4OWYA 3I69A 1R26A 3M9KA 4TR4A 1JLVA 4JBBA 2EC4A 4IELA 5F8BA 5GSSA 1TOFA 3QAGA 1XOBA 3HJOA 5JCUA 1PL1A 3FEUA 2HSYA 3QOUA 5G5EA 4F0BA 1R5PA 3C7MA 4ECJA 2VCQA 5G1LA 4HS1A 2XPDA 2B7KA 4Q5FA 1EGRA 3FR3A 2AAWA 2H6YA 1SJ6A 4TOPA 5ENUA 4PURA 2B1KA 2F9SA 5KN0A 4KDUA 4DSQA 5IPGA 1WRYA 3SBCA 2YOIA 5ECLB 8GSSA 3LSZA 1LJRA 4AJ7A 3ZMLA 3LWAA 3GSSA 3BCIA 2IL3A 1YEPA 3VI7A 5ELAA 3KMNA 1PQNA 4MF7A 2HZFA 1OAZA 3M8NA 3TOUA 1ERTA 1W89A 1OVNA 3E9JB 4WF4A 1V9WA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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