2L57A

Solution structure of an uncharacterized thioredoin-like protein from clostridium perfringens
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
126
structure length
126
Chain Sequence
MSLEGIKQINFQSINVVENLEEAKEGIPTIIMFKTDTCPYCVEMQKELSYVSKEREGKFNIYYARLEEEKNIDLAYKYDANIVPTTVFLDKEGNKFYVHQGLMRKNNIETILNSLGVKEGHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution Structure of an Uncharacterized Thioredoin-like Protein from Clostridium perfringens
rcsb
molecule keywords Uncharacterized protein
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Clostridium perfringens
total genus 41
structure length 126
sequence length 126
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-10-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2l57A00
5IO2A 4GCIA 4HQZA 3DXBA 2HI7A 1SYRA 2VLVA 4RI7A 5ECMB 4G19A 2JU5A 1QMVA 4TOPA 2YZHA 1XFLA 3HXSA 10GSA 3I9V2 4HUAA 2LKUA 1KBNA 1T00A 2H19A 5JWQB 3ZTLA 1XOAA 3MDKA 4KH7A 1SL1B 2O87A 1AQWA 3E0UA 5J9CA 3WGDA 1TK0B 2VL2C 1B8XA 1E6BA 4LL1B 3GN3A 2H76A 1YZXA 4IHUA 4IJ3A 2ZUPA 3GTUA 2GQMA 3BCKA 2VCXA 1DUGA 1XBSA 2GS3A 5JCUA 4K7OA 3ZITA 4KUNA 4NXIA 3KEBA 2XHFA 1S3CA 1BQ7A 4WBRD 5DJMA 2L6DA 3LORA 5ECPB 2JACA 2AJQB 3HVSA 4F82A 3P8WA 3F3QA 5HFGA 1QK8A 2OKAA 2AB6A 2C8UA 2X8GA 1GLPA 5D93A 3EINA 4DSSB 2MMZA 2H1GA 2H1AA 3VK9A 1YJ6A 4NAXA 3FK8A 1K3LA 1XWCA 4NV5A 2LJRA 2QGVA 1EEJA 2CVBA 1A0RP 4KCEA 4K6XA 4OCEA 4ML6A 5INYA 4IN0A 3L4NA 1HYUA 2GVPA 4E8EA 3D22A 4KDUA 1T4ZA 4HU7A 2H01A 4KB3A 2XPDA 3BJ5A 4DVCA 1K3YA 4F0BA 1MDKA 2ZCTA 4PXOA 3VWVA 2R3XA 2K9FA 2I1UA 3F8UA 3C1RA 2VLUA 4GQCA 2H75A 1JFUA 1OC3A 2RUFA 3BD2A 1O81A 1QFNA 1GSFA 3ZZXA 1Z7RA 3ZVJA 2FWHA 1Z3EA 4IELA 1XWGA 5ID2B 1FVJA 1K0DA 3PH9A 4PUFC 4MF6A 1H75A 1KTEA 1AQVA 3APQA 2TRXA 5DQYA 3GIXA 1F3BA 5C00A 2GZPA 2MMOA 1SL0B 2OBIA 2V32A 4DSRA 4IW9A 2VM2A 5EY6A 3M0FA 2H74A 1MD3A 2L59A 4MDCA 3TKSA 3O3TA 4KNDA 2HZEA 2V1MA 1AC1A 4EC0A 3GX0A 4HJMA 18GSA 1GTBA 4MZWA 5J4UA 2WFCA 3A2XA 2DJKA 2CT6A 3CTFA 1GH2A 1SL2B 1T8EB 4TR3A 5JWOB 1HNAA 2L57A 4K1FA 3GUSA 4ZL8A 2BMXA 4KSMA 1ZOFA 4YQVA 5CAXA 3FY7A 3IK9A 4ZL9A 2J23A 4BWSA 2B3SA 3IAM2 3EURA 4ZBBA 1GSQA 2HFDA 4AJ7A 1EOHA 1U3AA 1TDIA 1G6WA 3ZRDA 2LEGA 3G7JA 2KUCA 4QL7A 3HYPA 3CRUA 1SD8A 3LFLA 5ELAA 4TR0A 3KH7A 2GSTA 2VCVA 4Q5FA 1BYEA 5ABRA 1Y6EA 3LXZA 1EV4A 1ML6A 1WPIA 2H1DA 4IGJA 1WIKA 4ILFA 3KH9A 2BJXA 2FWEA 4K7NA 2IMEA 2R6KA 3U6VA 2ON7A 1UVZA 2VAFA 3I69A 2YANA 4KDXA 1SJ6A 3TJGA 1YF1A 3UJ1A 2LSTA 3QAWA 1FVKA 3FZ4A 3ZFBA 5HFKA 5IOWA 2PERA 3HDCA 1SJIA 1FW1A 2H73A 3F4TA 4P3YB 4POMA 4MJBA 1ZZYA 1TW9A 5DJLA 4GQFA 1TI3A 5GAND 1JZRA 1R5AA 2M46A 1GTAA 2CA8A 3RPNA 1GP1A 3FYGA 3UAPA 3LSZA 4FH8A 1B9XC 1XPVA 1BJXA 2CZ2A 4J56E 3TKRA 2IFQB 1OC9B 3GKNA 1TRSA 5CO3A 1FHEA 1WE0A 1HQOA 4V1Ag 3ISOA 1I9DA 1K0MA 1DBYA 1EOGA 4CDOA 2HLSA 3VWWA 5IMZA 3M8NA 3SWLA 3KIJA 3D4MA 3VWUA 1WP0A 4MA9A 1XOBA 4GLTA 4IP6A 4GSNA 3GMFA 3IE3A 4RQRA 2KOKA 1ABAA 3HY2A 4ISDA 3CXGA 4TVEA 2PBJA 5G5FA 5HR3A 3KJYA 1SKRB 2HZFA 1SK1A 3F6DA 5ECKB 2DSAA 4JE1A 1URMA 3UEMA 3GKXA 4OFMA 1F6MC 4IQ1A 4MH2A 3ZMKA 2WCIA 3M9JA 1XWKA 4WEYA 1JZWA 3J7Yk 2GSQA 3ZIVA 3HZ8A 4HJ2A 2H1BA 5JCGA 3QFBC 1OAZA 19GSA 6GSYA 4ZBDA 1T4YA 4FO5A 2CV4A 5DALA 1IYIA 3MAKA 4EF0A 2EIOA 3VPQA 3QCPA 2H0HA 4EVMA 1ERVA 3FEUA 1ILOA 1EP7A 4V2MA 5F0GA 2JL4A 3TRQA 4TKYA 4F9ZA 1GSYA 5B6MA 3OR5A 4MABA 1QQ2A 1GTIA 1YKCA 1FB6A 3KD0A 4N11A 2DMMA 3IR4A 3W8SA 5GZZB 3FRCA 4MJEA 5IMDA 3FW2A 3UARA 5G30A 2LJAA 1ON4A 2GZYA 2MBTA 1AUCA 3AY8A 3IDVA 2HRFA 3QDNA 1GRXA 3P90A 2YZUA 1RQMA 2RM5A 4KW6A 4GXZA 2R2JA 2REMA 5ENUA 3FZ5A 3TJJA 3LG6A 3O6TA 2I3YA 2NBSA 5EVOA 2H8LA 4IVFA 2CAQA 3QFAC 4XHMA 5LD0A 1PSQA 4TXOA 2F3MA 4ZILA 1GTUA 4YAVA 4IJIA 5KN0A 2BTOT 2LTKA 2DJ2A 3VURA 2YOIA 3TJKA 2C3QA 1PL1A 1TI1A 3DEXA 3HZ4A 4O32A 4I5QA 4EDYA 2RM6A 3RDWA 1PA3A 1PQNA 1GUMA 3LQ7A 3R2QA 2H72A 2LRTA 3UVHA 1GNEA 1AQXA 2EIQA 4JBBA 4D73B 4PUAA 2JSZA 2B6MA 1OYJA 1VF3A 11GSA 5CRGA 2KP1A 4PNFA 4ZB9A 1UC7A 4JU5A 3LWAA 3TJBA 2R5GA 2K8VA 2IMDA 3GRXA 5J3RA 3CSHA 2KP2A 3KCMA 3TOTA 4BWQA 1M9AA 3F63A 2VCTA 3W8JA 2PMTA 4CHSA 1BEDA 3L9VA 4H86A 2VO4A 1EP8A 2N5FA 4Z7XA 3TB2A 1AW9A 3ZREA 4TW5A 2O89A 4K2DA 3D4TA 1K0CA 3IA1A 5DBQA 4XS1A 1GULA 2WULA 2CVDA 3C1SA 5ECIB 3KXOA 3P7XA 1THOA 3IC4A 1B4QA 3HVXA 1PKZA 3HCZA 2DIZA 4POKA 3MWHA 1FAAA 4LA1A 4TR1B 3ZFLA 2MBSA 3KZQA 5A4VA 5HFIA 4BL7A 14GSA 5ID2A 1GUHA 4MLYA 3F0IA 1ZL9A 3NZNA 2DC5A 4ECBA 3GH9A 1SD9A 3IV4A 1XVWA 2DIYA 3DMLA 2LNTA 2V6OA 4XRDA 5HR1A 1R5PA 1XWAA 3TGZA 5CP1A 2C3NA 5CREA 1M99A 1F9MA 2JZTA 1M2BA 1X9SB 2G2QA 2GQLA 2JADA 6GSXA 1S3AA 3DRNA 4L5OA 5B6NA 3UVTA 3A2VA 3KMNA 1F3AA 3LJRA 5IQYA 1SYXA 5FT3A 12GSA 5DDLA 2C0EA 1LJRA 3GTUB 3IBHA 4N30A 4MH3A 5ECHB 5G31A 3Q74A 2H6ZA 4V2NA 1GNWA 5J9BA 3ZL5A 2CZ3A 2V41A 4MF5A 5G1KA 2O7KA 2JZRA 2FGXA 4GRFA 2PVQA 1A2LA 3G7IA 3IRAA 3KM6A 2VLTA 3Q19A 3TCOA 5IOXA 5D9TA 2AHEA 2H70A 2VL9A 1GL8A 4XS4A 3M3MA 2H6YA 4DSQA 1VRSD 1FOVA 4WR5A 5F07A 2AAWA 2K8SA 2E2GA 3FKFA 5HQPA 2IN3A 2C3TA 2LV3A 2PGTA 5CRWA 1BAYA 1K0NA 5IM9A 22GSA 3UIWA 1EGOA 1U6TA 1Y25A 3F4SA 2MZCA 3E3EA 3IHQA 9GSSA 1GLQA 3G7YA 3EU3A 1NHYA 3ERFA 5G1LA 2FY6A 1R7HA 5G2ZA 3SBCA 1SKSB 2HXKA 2E2MA 4OD7A 1K0OA 4L0WA 3KGKA 4ECJA 4XRAA 3FZ9A 1Z9HA 1XIYA 5JCWA 3P2AA 3QR6A 5DAKB 1KNGA 3J7Yb 1ACVA 2DJ3A 3APSA 2LRNA 3H93A 1W89A 1PL2A 1V2AA 3QD9A 1PD21 3PR8A 4FIWA 2O85A 3CSIA 4O5RA 1OC9A 3S9FA 2RLIA 1FG4A 4OO5A 1V9WA 1TU7A 4RI6A 2B7KA 6GSTA 4WF5A 3GKMA 5EPFA 4PURA 5FWGA 5ELGA 2LS5A 2C1YA 2E0QA 2HZEB 4KAEA 4KE3A 1TKDB 1F37A 1YDKA 4OCFA 2C4JA 4O7HA 4ULXA 3QMXA 2G0FA 2H71A 2C0DA 3EWLA 1JLVA 3CBUA 2X8CA 3CMIA 3TKSE 4HS1A 2VCWA 1X9WB 1NSWA 2CX3A 2H6XA 1A23A 1QGVA 3FR6A 4ZIJA 4EUYA 1B48A 3GKKA 2CVKA 3KMOA 1HNBA 1OKTA 3KTBA 5CYYA 4HZ2A 5GAPD 3QPMA 1U3IA 3H1NA 5IMAA 2YJHA 1G7EA 5D9VA 2YCDA 1WMJA 3MSZA 1ERTA 3ME8A 1TJDA 1X9MB 5CRDA 5GSTA 1AXDA 1W4VA 1M0UA 1USBA 3C7MA 4N10A 2GLRA 3G9BA 2EIRA 3E9JB 4XTSA 4X1UA 5DVBA 4ML1A 3F4RA 2XPEA 3A2WA 2DLXA 2PVOC 3NIVA 3CSJA 5AIVA 4TXVA 3WYWA 4F2IA 1PRXA 1LU4A 2L5LA 2WGRA 8GSSA 1LBKA 3M1GA 4EXJA 2B5XA 4K8MA 3PINA 2M80A 5A5KA 1AAZA 1T3BA 1PKWA 2LJKA 4FYCA 2PUKC 3FZAA 3UBKA 3K8NA 4LLRA 4I97A 4HEA2 2VOCA 2N5AA 1K0AA 2L6CA 4ZB8A 1TOFA 3WT1A 3KP9A 2OACA 3ERWA 4FYBA 2ALBA 1ZMAA 5L71A 2FCHA 3C8EA 2KHPA 1PN9A 1JZOA 2R37A 2YV9A 3QOUA 3TJFA 1O7UA 3RBTA 1X5DA 4L5LA 1A8YA 4MK3A 1HNCA 3UBLA 3CRTA 3JCML 3F3RA 3ZVJD 3EMPA 3ZLPA 4MZBA 1KEBA 1VF4A 3GFKA 4TRXA 2NDOA 1YEXA 1SJZA 2C0FA 4KSOA 5ECSA 3UL3A 4KDYA 2V2GA 3Q18A 4N0VA 4DEJA 1SK2A 1J9BA 2YNXA 2B1LA 2Z9SA 5ECRB 4OWYA 1B4PA 2DJ0A 3V1WA 5E4WA 2IIYA 3NOFA 2F8AA 4I6XA 1PX6A 4ECIA 3L9SA 1DE2A 3F6FA 1ZYEA 2HE3A 2YP6A 4YQMA 2YWOA 3KTLA 1GSUA 4KA0A 2D2ZA 5DALB 4JR6A 3VPTA 4YH2A 4MMMA 4QL9A 2VCZA 2IWTA 2X99A 17GSA 4KX4A 4WR4A 1QUWA 3KP8A 1G0TA 5KEJA 5CRHA 1ERUA 2YWNA 1R26A 4IKHA 1GUKA 1RW1A 3ZIJA 4K0GA 1C72A 1XWBA 3L78A 5AGYA 4I2TA 2IMKA 2NPBA 1U87A 2NTOA 4LMVA 3FHKA 1PX7A 2HSHA 3ZYWA 4X43A 2DMLA 5IPGA 1MDIA 1MTCA 3LYKA 1R4WA 2E7PA 1U88A 4GF0A 4Q5QA 4TR1A 2J9HA 5D73A 4MCUA 1GSSA 4DSSA 2VL3A 4LL4B 3O76A 5H5QA 2X64A 2R4VA 1JLWA 4V2LA 1SKWB 13GSA 2F9SA 1EEMA 5DCGA 4WXTA 3GA4A 1OC8A 5ECLB 4HDEA 1FO5A 1OKDA 4WETA 4MJAA 2WJUA 2P5RA 4MP4A 3GL3A 1NM3A 16GSA 3EU4A 1M2AA 1XCCA 2AV4A 5ECNB 2GT5A 4IP1A 1X5EA 1WOUA 3PGTA 4AJ6A 2DJ1A 2B7JA 4XIHA 2A2RA 2F8FA 1H4OA 5B8BA 2YJ7A 2PN8A 4KGIA 2HYXA 1MDJA 3DVXA 4PGTA 5IPHA 2IMFA 2JZSA 5B7CA 3ZMLA 5C04A 4ID0A 4MJCA 4RUVA 2VCQA 2WRTA 2RUEA 1Z5YE 1YEPA 4NWYA 3RHBA 1RK4A 3QAVA 1O8WA 3DWVA 3I43A 2YWIA 1M2DA 1N2AA 1UN2A 4G9HA 1SENA 1YKAA 1X0RA 2IJYA 2ON5A 1V58A 4IS0A 4ZB6A 1I5GA 2PPTA 3TRPA 3GL5A 2OE0A 5CNWA 1ZCPA 4OFTA 4F03A 4MF7A 2F51A 4HZ4A 4MPGA 1EZKA 3US3A 4JR4A 5ECOB 4HI7A 3GURA 6GSVA 1JZDA 1WWJA 3ME7A 2OBKA 3DGQA 5GSSA 3F9UA 1V57A 3DVWA 3N5OA 4BA7A 3FR3A 1GWCA 3TDGA 4AGSA 2IL3A 5DCHA 1E2YA 1B9YC 1N8JA 2JSYA 3A3TA 2NVLA 7GSSA 1ZGNA 1XXUA 5DAKA 2FA8A 3TOUA 1X5CA 2L4CA 2P0GA 1Z6NA 3FR9A 1K3OA 1A0FA 2OE3A 1MD4A 3LGCA 2TRCP 1ZYQB 3TKPA 1TRWA 2A2SA 1PGTA 1Z6MA 4HOJA 4K7IA 3ED3A 2XBIA 2QC7A 3CYNA 4EL1A 4PQ1A 5ECQB 3EC3A 4LMWA 4BVXA 2HNLA 1JHBA 4I8BA 2RIIA 2ZNMA 2IMIA 3RHCA 2GT6A 1QXHA 4HU9A 2ES7A 2WZ9A 3VWXA 1VF1A 3EMXA 2KLXA 1GSEA 5KN1A 4OFNA 5H5RA 4ZBAA 4TN8A 4YAPA 1MEKA 3TUEA 1OE7A 5A4WA 1V98A 4G10A 5EL8A 3WGXA 4NPBA 4AF2A 2CQ9A 4L8EA 3U5RE 2WDUA 3L9UA 1A2MA 4Q5RA 2AYTA 2IFQA 4PNGA 5AN1A 1VF2A 4ECCA 3GHAA 4L0UA 1PMTA 1YF0A 4JRRA 5D9WA 3QAGA 1Z7PA 1TTZA 2FNOA 3LXTA 1TU8A 3WGEA 2GZZA 2GQKA 4XS4B 3GSTA 2GTUA 2VUPA 4NMUA 1EWXA 1UA5A 5E59A 3IOSA 4TR4A 1CQHA 2GSSA 1M9BA 3LEFA 2EC4A 3IPZA 1GSDA 3UOMA 4WF4A 4K9ZA 4YQUA 5J5NA 5AIXA 2I81A 2YPMA 5HR0A 2LUSA 2FA4A 2GSRA 4NHWA 5AISA 1XW5A 4GTUA 2H30A 2DJJA 3BOAA 2L4QA 3UMAA 4EE0A 1THXA 4PX1A 1TK8B 1OVNA 2PU9C 4E8HA 1XW9A 6GSUA 4FYUA 3IXRA 1XVQA 1TRVA 4PQHA 2LNSA 4NV2A 3GV1A 4G2EA 5D9XA 4RQXA 2FWFA 2VM1A 4O92A 3VLNA 1SK0A 1ST9A 3APOA 5HR2A 4EO3A 2YV7A 2VD0A 3HJPA 1G7OA 3H4KA 2TIRA 5COHA 4AJ8A 5DQSA 2MMAA 4KCAA 2L5OA 1EGRA 4GSTA 2C0GA 3DKSA 2FD3A 3C71A 4I2UA 2OADA 2N5BA 3HJMA 3HJOA 1F2EA 2AUVA 2MYGA 1ERWA 1AIUA 2HT9A 4WKWA 3D6IA 4N0ZA 4EDZA 2P31A 2K6VA 2CX4A 2VL2A 3D21A 2FUG2 1BX9A 3H8QA 5G5EA 3LYPA 2YWMA 2H66A 2GDRA 3WT2A 1NW2A 4WBJA 1EV9A 2PWJA 5LCZA 3W6GA 2LRCA 3WD6A 2QSIA 5JWRB 2QKEA 4J57E 1O85A 3RAZA 4GSSA 1G6YA 3EYTA 3HHVA 4PQIA 1DSBA 1DE1A 1YY7A 3VI7A 3VFIA 1HD2A 3EVIA 3TKQA 2MMNA 20GSA 4OMVA 5LNKe 2OJLA 1O73A 5A4UA 3GX8A 2HSYA 2I4AA 3DD3A 6GSWA 4X0XA 5F8BA 2A4VA 3Q6OA 2VIMA 2WS2A 4EKZA 3HKRA 1VGLA 3CTGA 1T1VA 2HRNA 2FWGA 4ACSA 5IMVA 3TKSC 5KN3A 4ZL7A 5IMFA 1SU9A 2M72A 4GWRA 1XZOA 2YN1A 4XCSA 3GSSA 2B5YA 3VI5A 1YQ1A 2OE1A 3RPPA 3L0HA 2FLSA 4Q5NA 2LQQA 4D73A 1O6JA 3C73A 5J41A 3HA9A 3I6AA 2C80A 3DIEA 5D96A 1J0FA 3A5WA 2OA7A 4POBA 2IPAA 1TXXA 3HVVA 1V40A 3GH6A 4NHZA 4MPFA 1XW6A 4K0NA 3GYKA 3MNGA 4V1Ap 5IO0A 2B1KA 1NHOA 1WRYA 3HD5A 1TP9A 2CAIA 1TRUA 4BVYA 3D5JA 1A24A 4JEDA 4J2FA 1IYHA 1BG5A 4MZCA 4QQ7A 2B5EA 3DYRA 2LQOA 2V6KA 3GNJA 2K18A 2H0GA 5F06A 1OE8A 2XBQA 1Q4JA 2X8HA 1CQGA 5FHIA 1S3DA 4BPYA 4POLA 5B8AA 2XC2A 4JZQA 4XS6A 3D0ZA 3ERGA 1J08A 1K0BA 5IMCA 1O8XA 3BBYA 4CW9A 4HQSA 2VD1A 2DBCA 1Q98A 3IAS2 4IQAA 3EE2A 1M7TA 2WB9A 1FB0A 3H79A 4F0CA 3TRXA 5H5SA 5KN2A 3M9KA 2I9HA 1T7PB 2GGTA 5D8IA 4OO4A 5IIZA 3IK7A 4ZXGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite