2L6CA

Solution structure of desulfothioredoxin from desulfovibrio vulgaris hildenborough in its oxidized form
Total Genus 27
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
27
sequence length
104
structure length
104
Chain Sequence
MSAIRDITTEAGMAHFEGLSDAIVFFHKNLCPHCKNMEKVLDKFGARAPQVAISSVDSEARPELMKELGFERVPTLVFIRDGKVAKVFSGIMNPRELQALYASI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural and mechanistic insights into unusual thiol disulfide oxidoreductase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin
molecule tags Oxidoreductase
source organism Desulfovibrio vulgaris
total genus 27
structure length 104
sequence length 104
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-11-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2l6cA00
1F3AA 1TRVA 4IVFA 2ES7A 3TB2A 3DXBA 2GSSA 3CMIA 2V2GA 4EE0A 1TOFA 4I8BA 2FLSA 2DJ0A 2J23A 2YNXA 1WJKA 1MDJA 3GHAA 4ZB9A 5H5QA 4DEJA 2YJHA 1T4YA 4K7OA 1FG4A 4KH7A 3LORA 4V2MA 5DAKA 2KP2A 4EC0A 4MF5A 5F0GA 4RUVA 4K0NA 5B6NA 9GSSA 2R6KA 2CX4A 2VLUA 3EYTA 4TN8A 4OMVA 3GRXA 4O5RA 5EY6A 1KNGA 4I6XA 3QCPA 1ZCPA 5J41A 1SKRB 1MD3A 2DLXA 3HJPA 3ZYWA 2HT9A 3ZLPA 3M9JA 2PPTA 4PNFA 3F4RA 1ZMAA 2WGRA 1RW1A 2IFQB 1UA5A 2GZPA 3ERFA 5IPGA 2K8SA 3A2XA 1BJXA 3H79A 2R4VA 1N8JA 2VCZA 4HU9A 3F6DA 4MH2A 3IR4A 4ACSA 1OE8A 4X43A 2LNSA 2F8FA 1ML6A 1GNWA 2HSHA 1TRUA 1V9WA 4MF6A 4GQCA 5JCGA 3EINA 2VCXA 3L9SA 4NPBA 3ERWA 3HVXA 1A24A 2VCWA 1CQHA 4QL7A 1VF1A 2GDRA 2B1KA 1A2LA 5G5FA 2LNTA 2F51A 2DMLA 4ECBA 1TW9A 2HYXA 1R7HA 4GLTA 3UJ1A 5D96A 3N9JA 3TKSE 3ZITA 3QAWA 2H30A 14GSA 1HNAA 3UBKA 1YF1A 3P8WA 4YQMA 5IOXA 2RM6A 2NVLA 2DJJA 1SD9A 1XOBA 2C3TA 2DMMA 5F05A 4O7HA 3H8QA 4GWRA 4PUAA 2TIRA 3ZFBA 2WDUA 4MJCA 1SK2A 4GSTA 5ECLB 3EMXA 1PX6A 4O32A 3GN3A 2RUEA 2H6YA 5DALA 1YEPA 5B6MA 3VWVA 1AQVA 1OKTA 2IMFA 4WKWA 4N0VA 4TOPA 1TK5B 1FAAA 2X8GA 1ERUA 4MP4A 1JLVA 4DVCA 1BEDA 4OFNA 1TK0B 5DAKB 3G7IA 1GTAA 4MDCA 5DQYA 3F9UA 4K1FA 1EGRA 3IE3A 1SU9A 2C8UA 1BAYA 4ULXA 1MD4A 3TRPA 1URMA 2BMXA 1T8EB 3FYGA 2QKEA 3FZ4A 4IGJA 2LJAA 5F8BA 1IYHA 3K8NA 4EF0A 4WF5A 5AIVA 4ID0A 2OJLA 2KOKA 1G7EA 2LJKA 1U87A 2HLSA 3E9JB 5ECRB 4BPYA 4AJ6A 3F4TA 3DWVA 1TTZA 5J4UA 2RUFA 4HJMA 3SWLA 2NBSA 2LSTA 3D5JA 1B4PA 3BOAA 3C8EA 2AJQB 1XW9A 2YANA 2PMTA 5IM9A 5IMFA 5D9VA 2K8VA 3TJBA 3J7Yb 1U3IA 1FW1A 2H1AA 3M3MA 4YQUA 3WD6A 4ECIA 2LRCA 2H66A 4TVEA 3HZ8A 1FHEA 3FZ5A 5D8IA 3RPPA 3PINA 1K0AA 1XVWA 4ZIJA 1VRSD 3FHKA 3KMOA 2IN3A 2PU9C 3FY7A 5HFGA 2PVQA 2H6ZA 4DSQA 3TJFA 2H76A 5A4WA 3M1GA 5EL8A 1EZKA 1PA3A 1S3DA 4NV5A 1XWAA 3LWAA 5IIZA 5CNWA 4K7NA 5ECOB 5ECKB 4V2NA 2REMA 2PVOC 2YZUA 4ZXGA 3Q74A 1X9SB 3TKPA 4HDEA 2L4QA 2AHEA 2L5LA 1K0CA 3EVIA 5KN3A 2B7KA 3VPQA 1AUCA 2AV4A 3IK7A 3IAM2 1T3BA 3GKXA 3GSSA 1M2AA 1TU8A 3BBYA 1WOUA 3KTBA 1OYJA 2H0GA 3FZAA 2E2MA 1JZDA 5CRHA 11GSA 1UC7A 1GULA 4NHWA 1E2YA 4NWYA 4YQVA 1WRYA 5IPHA 4D73B 2O87A 2C0EA 3EU4A 3CSIA 4IJ3A 2VUPA 4ZB8A 1JZWA 2MMZA 1XFLA 1EOGA 3A3TA 3HJOA 4ML6A 4I2UA 3RAZA 4KDYA 2TRXA 3CYNA 1Z7PA 3WT2A 5B8BA 5FT3A 3TJGA 1EEMA 4N10A 2PERA 4TXVA 1XBSA 3FRCA 3EC3A 2GGTA 4XS1A 1GSQA 3UL3A 6GSSA 1QMVA 3TRXA 3HCZA 5KN1A 1OC9A 3M0FA 5CAXA 1X5CA 2LKUA 1HNBA 5J9BA 1PN9A 4AJ8A 4NV2A 2M72A 1I9DA 1G6WA 1R4WA 2F9SA 2GSRA 2LQOA 4IQ1A 3IPZA 2XPEA 4X1UA 1PX7A 2WS2A 2IJYA 3QAVA 2D2ZA 4MK3A 1EV4A 1O8WA 3GURA 1T4ZA 3KIJA 3TKQA 1DBYA 5ECSA 4OCFA 1PL1A 4ZL7A 2WB9A 3L78A 2YCDA 4KW6A 3UARA 2YWMA 2MYGA 4TR1A 1PKZA 1T1VA 3G7JA 3HYPA 2KLXA 2YP6A 3IOSA 1GLPA 1T00A 2ALBA 2YWNA 2H6XA 3KP8A 3LSZA 4KX4A 5L71A 3BCKA 5CRDA 3VLNA 2FNOA 4WR4A 2YZHA 3WT1A 2R2JA 3H93A 4EDYA 1Z3EA 2EC4A 3O76A 4NHZA 3F8UA 4JR6A 1TP9A 5J3RA 2HSYA 2WFCA 2K18A 3EE2A 1O73A 2DIYA 1GRXA 3KP9A 2B7JA 2BTOT 2X64A 4H86A 2X8CA 3GX8A 2EIQA 2M80A 2CAQA 1FB0A 3IK9A 1Q4JA 3BCIA 3KJYA 2DSAA 5JWOB 4WR5A 2V6KA 4TW5A 3A2VA 1AXDA 1B9XC 1S3CA 4KGIA 3WGEA 1LU4A 2H75A 3KM6A 3GKMA 4F9ZA 3NOFA 2B5YA 4K2DA 3Q18A 5G1LA 1OVNA 3TGZA 3KGKA 4MCUA 2EIRA 3GL3A 4E8EA 1UVZA 2PN8A 4KSOA 2CA8A 4V2LA 1WMJA 3ZVJD 3GUSA 5C04A 2MZCA 4XTSA 2HE3A 3D21A 5DDLA 4G2EA 1AC1A 1SYRA 5LD0A 2DJ1A 2H1BA 2GS3A 2QGVA 3W8SA 1XVQA 4Z7XA 3UVTA 3ME7A 4KCAA 2NDOA 18GSA 6GSYA 2E2GA 2K9FA 3VURA 4NXIA 4OFMA 1GUMA 1M2DA 4HU7A 5CRWA 4POKA 4GQFA 1NHOA 1F37A 3UMAA 1OC9B 5DCHA 2VCVA 1ON4A 1ZOFA 4L0WA 3HD5A 3PGTA 1GSYA 1XWKA 1GL8A 2G2QA 2VL9A 2OACA 5J9CA 2O8VB 4TR4A 3QD9A 2FUG2 2PGTA 3F6FA 1M99A 4HOJA 3W8JA 3ZMKA 5E59A 4MPGA 4F0CA 1Z6NA 2JSZA 1KBNA 4PXOA 1T7PB 2VL2C 3ISOA 3NZNA 3D4TA 2M46A 4MABA 4HEA2 4KDUA 4GRFA 1LBKA 3F3QA 2GTUA 3QOUA 1JHBA 3E3EA 4N11A 1M9AA 5HR1A 5ECQB 2A4VA 2GQKA 2FY6A 3WYWA 4HQZA 2OA7A 1NHYA 2ON7A 3G9BA 2H72A 5ENUA 1CQGA 3LQ7A 1V58A 2RIIA 1OKDA 5B8AA 3LYKA 1ZYEA 1O81A 5HFKA 1S3AA 1SENA 3J7Yk 4EO3A 3QAGA 1THOA 4MMMA 5G2ZA 3ZL5A 4FYUA 3FW2A 3ERGA 3CSHA 4LA1A 2FWGA 3FR6A 4IELA 1BQ7A 5G1KA 2ZNMA 3VWWA 2N5BA 4KSMA 3ZVJA 3IXRA 1M0UA 2ZUPA 2ON5A 3AY8A 3LXTA 3LJRA 5IMZA 5HR0A 2LUSA 5AGYA 2XC2A 1K0BA 3WGDA 2R37A 4IP6A 4ZBDA 4HZ4A 2LV3A 1YJ6A 3I6AA 4MF7A 2GSTA 1EP8A 1ACVA 5KN2A 3H1NA 2F8AA 4ZBBA 6GSTA 3MNGA 5D9WA 3O6TA 3QDNA 3MSZA 1YF0A 4XRAA 2A2SA 1MDIA 3G7YA 4ECCA 5IMVA 2C3QA 5G5EA 1ILOA 1J9BA 2VLVA 4I5QA 4KUNA 3KD0A 3HDCA 4ZB6A 3LYPA 4Q5NA 2YOIA 3LFLA 3DMLA 3GV1A 3L0HA 1HD2A 5HQPA 3GH9A 1F2EA 1O6JA 2QSIA 2WZ9A 2B5XA 2WRTA 1GLQA 4KB3A 3ZIJA 1SJZA 1NW2A 4PGTA 2O7KA 1SJIA 4Q5QA 5ECPB 2JACA 3BJ5A 2YWOA 2MMNA 1TXXA 2YV9A 3CRTA 1X5DA 1OE7A 2H1GA 4YAVA 1SL1B 3GKKA 5IMCA 4XS4A 3APQA 4BWSA 1ERTA 1XPVA 3APSA 2IIYA 5A4VA 1AW9A 4MJEA 2IPAA 2I4AA 5INYA 3LG6A 4F03A 1Q98A 3P7XA 4L5LA 3ZREA 2Z9SA 4MZBA 1XXUA 4O92A 5B7CA 1M7TA 3P90A 1GNEA 3QR6A 2E0QA 3DVWA 2YJ7A 2NPBA 3V1WA 1SK0A 2PUKC 2XPDA 1QGVA 4TR0A 1IYIA 2N5AA 3OR5A 4YH2A 4PNGA 1WPIA 5DCGA 1V57A 4MA9A 3D6IA 2C80A 2OE1A 2RM5A 3D0ZA 2LRTA 1DE1A 4PX1A 1QFNA 2YWIA 4Q5FA 1YZXA 4EUYA 4Q5RA 1SL0B 2VM1A 5LCZA 4AF2A 4L0UA 5D93A 5ID2A 4GXZA 3CRUA 2C3NA 1RQMA 4HJ2A 2AUVA 1QK8A 2VM2A 1X0RA 2FA4A 2CAIA 5FWGA 3EWLA 2YN1A 4QL9A 3GNJA 1XW6A 3ZZXA 4FIWA 4DSSA 4POMA 5AIXA 4CHSA 1FVKA 2JU5A 3PH9A 3VPTA 1QQ2A 3GTUA 3MWHA 1V40A 2I1UA 1EEJA 3U6VA 3VFIA 1GTIA 5ELGA 4IS0A 5ABRA 1NSWA 5DALB 3M8NA 3HKRA 4HQSA 4MJBA 4KE3A 4WETA 2VL3A 4XCSA 2MMAA 2JL4A 3E0UA 2WJUA 1HQOA 3VWXA 5HFIA 2IL3A 4ML1A 4F2IA 1KEBA 1QUWA 2XHFA 5JCUA 4ISDA 4KAEA 4EVMA 3CTFA 5AISA 4RI6A 5COHA 2L59A 4IBPA 4L5OA 1ZGNA 4PURA 1UN2A 4JRRA 5GSSA 1ZZYA 1XWGA 4EKZA 3TKSA 4XS4B 3VI7A 5J5NA 3GX0A 5D73A 1B4QA 4IHUA 3FKFA 5AN1A 5GAND 3TCOA 3I69A 1ERWA 2XBQA 2H73A 1ZYQB 1TK8B 3MDKA 3F3RA 1JZOA 3FEUA 2B1LA 3NIVA 3EURA 3QFBC 3LEFA 13GSA 3RBTA 3LGCA 4IJIA 1B48A 3DVXA 1FVJA 3LXZA 2I9HA 4GTUA 3C1RA 2C0GA 4POBA 1YKCA 3VWUA 2HNLA 2IWTA 5E4WA 2E7PA 6GSWA 3TKRA 3CSJA 2IFQA 4BVXA 3CXGA 2CZ3A 4F82A 1OAZA 3R2QA 1AQXA 5JWQB 3W6GA 2H70A 1YKAA 3CBUA 3D4MA 3TJJA 2KHPA 1K3YA 4LMVA 5ID2B 1M9BA 3UEMA 4N30A 1BX9A 3DYRA 4PQIA 1GSDA 1K0OA 7GSSA 1WWJA 1TJDA 3DKSA 5DVBA 4K6XA 3HVSA 1PGTA 1F6MC 1G6YA 4J2FA 4DSSB 4MLYA 2JADA 3GTUB 1PRXA 5CO3A 2CVBA 2H01A 4PQHA 3GSTA 1K0DA 2LTKA 1VF2A 3Q6OA 4EXJA 3IC4A 3IHQA 1WIKA 4I97A 3BD2A 1J0FA 2GZYA 2OE0A 1K3LA 2XBIA 2LEGA 4OO5A 3QMXA 5F06A 2B3SA 2H19A 3EU3A 3FR9A 2HZEA 2PBJA 4K0GA 4BVYA 5KN0A 3HHVA 3GIXA 4GSNA 2V1MA 5KEJA 1H75A 1O7UA 4FH8A 4ECJA 4MJAA 2K6VA 3IAS2 2VLTA 3ZTLA 2GZZA 2CX3A 2JZSA 1DSBA 2MMOA 4ZL8A 1A0FA 4HUAA 5C00A 4TR3A 6GSVA 2L5OA 4JBBA 4LMWA 5HR3A 1Z6MA 5LNKe 1GSEA 4J57E 2B5EA 3DEXA 4AGSA 3JCML 2WCIA 3C73A 2V41A 2C1YA 1SKWB 3U5RE 3TJKA 1TI3A 1SJ6A 4HI7A 2VOCA 1GSFA 1E6BA 2JSYA 1SKSB 2AYTA 1VF4A 1TRWA 2H0IA 3TOUA 4OFTA 4IKHA 1EGOA 4OWYA 4K8MA 1XWBA 2P31A 3ED3A 4LL1B 3DRNA 2O89A 4F0BA 3H4KA 2GQMA 1GWCA 1PL2A 3C1SA 17GSA 2FWEA 1XW5A 2HZFA 1U6TA 1AIUA 2HFDA 2H0HA 2DJ3A 3WGXA 3C7MA 4CDOA 4TR1B 3IDVA 1XWCA 3FR3A 2LS5A 3F4SA 5DJMA 1AQWA 2QC7A 3GKNA 1EWXA 4TKYA 4JZQA 1HNCA 1PD21 3DIEA 2JZRA 4MPFA 5EPFA 4FO5A 3ZRDA 1A2JA 4POLA 4P3YB 3Q19A 19GSA 1R5AA 1YEXA 2CQ9A 1Y25A 2O85A 3UBLA 2H74A 3TOTA 4JR4A 2IMEA 2HRNA 1N2AA 4ZL9A 3HZ4A 6GSXA 4WBJA 2GSQA 4EDZA 5IOWA 1F3BA 4G9HA 2VD1A 1V98A 5ECMB 1GH2A 1XCCA 3A5WA 4X0XA 4JU5A 4WBRD 3ME8A 1V2AA 2YV7A 2DIZA 1Z9HA 1F9MA 4GF0A 4BWQA 1XIYA 4KNDA 2HXKA 22GSA 5CYYA 3P2AA 2HZEB 2B6MA 1H4OA 2N5FA 2MBSA 1SK1A 2JZTA 1ABAA 1I5GA 4MH3A 5D9XA 1K0MA 3HY2A 2CT6A 5CRGA 5A5KA 1MTCA 5DBQA 2GQLA 2I81A 4G19A 2L6CA 5HR2A 3HVVA 2DJ2A 3UVHA 5EVOA 3SBCA 4KDXA 5GAPD 2VIMA 3CTGA 1QXHA 2OBIA 3KXOA 2NTOA 1BG5A 2F3MA 3EMPA 4D73A 1XOAA 2OE3A 3N5OA 1PMTA 2FWFA 2L6DA 4ZILA 1XZOA 4E8HA 3A2WA 1ERVA 2X8HA 1R5PA 4L8EA 2CVDA 4TRXA 1JFUA 1G7OA 3KEBA 1X9MB 1DUGA 1GSSA 1TDIA 3TUEA 3UIWA 2J9HA 2MBTA 2LJRA 3KCMA 3VK9A 2H1DA 1MEKA 3QPMA 2C0DA 2C4JA 3US3A 4KCEA 4QQ7A 4YAPA 3DD3A 1R26A 3UAPA 2L4CA 1FB6A 2IMKA 2H8LA 4NMUA 2VCTA 3QFAC 2BJXA 2P5RA 3O3TA 3D22A 3L9VA 1TI1A 1K3OA 1U88A 2X99A 4NAXA 1OC3A 2V32A 3APOA 1B9YC 2HRFA 1JLWA 1O8XA 4DSRA 4ILFA 1A8YA 1B8XA 3F63A 3C71A 1THXA 1O85A 1KTEA 5ELAA 1FO5A 1PQNA 4K9ZA 4OO4A 4N0ZA 5CP1A 3IBHA 2FA8A 3KTLA 2VO4A 16GSA 4V1Ag 2AAWA 2HI7A 1VGLA 4ZBAA 1HYUA 1GTBA 1J08A 2RLIA 3I9V2 2ZCTA 8GSSA 4IW9A 2DC5A 5H5SA 1GSUA 1W89A 4BL7A 2CZ2A 4IQAA 1W4VA 3S9FA 2EIOA 5IMAA 1A2MA 1BYEA 3KMNA 1A23A 1DE2A 1A0RP 10GSA 1PSQA 4HS1A 1X5EA 3GL5A 2FGXA 1OC8A 4JE1A 4XRDA 3GYKA 2TRCP 2GT5A 1M2BA 3GFKA 1A8LA 2A2RA 2R5GA 4K7IA 4XS6A 1X9WB 4TXOA 5JWRB 2GT6A 3KH7A 1GUKA 2KUCA 2IMDA 5CREA 4GSSA 3KH9A 2WULA 3TDGA 5IO2A 3RDWA 1YQ1A 12GSA 2CVKA 1U3AA 4WEYA 2L57A 1EOHA 2KP1A 3PR8A 4LLRA 1USBA 4GCIA 1WE0A 1ZL9A 1C72A 2H71A 4FYCA 3ZFLA 5ECNB 1NM3A 4IP1A 1GUHA 3IRAA 4IN0A 4PUFC 1TRSA 2P5QA 5ECHB 2FD3A 4CW9A 1Y6EA 1EP7A 3L4NA 3TRQA 3UOMA 3VI5A 1RK4A 5FHIA 4MZCA 3RHBA 4AJ7A 3HXSA 3GA4A 4PQ1A 2V6OA 4OCEA 3L9UA 1EV9A 2DBCA 1YY7A 2P0GA 2DJKA 2OADA 2LQQA 3M9KA 1K0NA 3HJMA 5GSTA 2GLRA 1SL2B 2FCHA 5D9TA 4LL4B 1AAZA 4EL1A 4XIHA 2CV4A 1VF3A 3FK8A 4OD7A 20GSA 1MDKA 3F0IA 3ZIVA 1YDKA 2G0FA 1FOVA 2FHEA 3DGQA 1PKWA 3IV4A 1GP1A 5G30A 5GZZB 4WF4A 3RHCA 2OBKA 1JZRA 4HZ2A 2GVPA 3GH6A 1SYXA 5IQYA 5JCWA 3FZ9A 2I3YA 2VD0A 4FYBA 4BA7A 3HA9A 2IMIA 1SD8A 1G0TA 5ECIB 1GTUA 5F07A 5IO0A 4MZWA 4KA0A 3ZMLA 2YPMA 2VCQA 2VL2A 1WP0A 2C0FA 4V1Ap 1LJRA 4XHMA 2FWHA 1Z5YE 5DJLA 1TKDB 4G10A 5IMDA 3MAKA 4I2TA 2R3XA 2VAFA 4J56E 5DQSA 4JEDA 3KZQA 4TXOB 1Z7RA 2AB6A 1ST9A 4RI7A 4WXTA 1TU7A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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