2L84A

Solution nmr structures of cbp bromodomain with small molecule j28
Total Genus 27
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
27
sequence length
121
structure length
121
Chain Sequence
GSHMRKKIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQSLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords CREB-binding protein
publication title A Small Molecule Binding to the Coactivator CREB-Binding Protein Blocks Apoptosis in Cardiomyocytes.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 27
structure length 121
sequence length 121
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2011-01-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 2l84A00
4QSTA 2KTBB 3HMHA 4QEWA 1F68A 5AD2A 4IOQA 3G0LA 4TTEA 4OGIA 4Y03A 5HLSA 4QSVA 5HQ5A 5HQ7A 5E74A 1JM4B 4NUEA 5C89A 5A5PA 5F62A 5AMFA 5F2PA 5HRVA 4BJXA 5EK9A 4QSXA 4YY6A 3U5OA 4BW3A 4BW1A 4O77A 3U5NA 4AKNA 5H1VA 4HBVA 5A81A 5FE4A 4HBXA 4Q0OA 4O78A 5FE8A 2OUOA 4N4FA 3JVJA 4PCEA 4XUAA 2DWWA 4YBTA 4C66A 4RVRA 5D26A 4J0SA 5FB1A 5CUGA 3U5PA 3RCWA 5IG6A 4YYJA 5C85A 4BHWA 4Z6IA 1ZS5A 4KV1A 5EISA 5HENA 5DYCA 5II2A 4A9HA 5ENHA 2R0SA 5A82A 3QZTA 4O75A 5CUDA 5EWHA 5CTLA 3U5MA 4HXLA 4PS5A 5E0RA 5E9MA 5CQ3A 5TB6A 2DATA 5BT4A 5IGKA 3LQIA 5DKCA 5KHMA 5I40A 4UYEA 4CLBA 5DBMA 5I29A 5II1A 5FG5A 5D24A 4O71A 3HMFA 4C67A 2YW5A 1X0JA 3IU5A 4A9NA 5E9KA 4QSWA 4HXRA 4OGJA 5E7DA 5BT5A 2R0YA 3Q2FA 5ETBA 3DAIA 2DVSA 4YK0A 4A9LA 5DKDA 2OO1A 4MR6A 5I86A 4O7BA 4NUDA 5HFQA 5HRWA 5FDZA 5L99A 4HXMA 4O7CA 5L8TA 5D3PA 4CL9A 5FFVA 4YY4A 4QR3A 5E9VA 3UVYA 5DW1A 4UYDA 3UV4A 5HRXA 4LZRA 4LZSA 4QC1A 5AMEA 5E9IA 3P1FA 5LJ2A 4LZ2A 4OUFA 4QSSA 4X2IA 5JWMA 4HXKA 5HM0A 4UYHA 5E3DA 4YH4A 5CQ4A 4Z6HA 3IU6A 5CS8A 5EQ1A 2RI7A 5EV9A 4HXNA 4HXOA 4HBWA 5DFBA 4YC9A 3P1EA 4ALGA 4QNSA 4NYWA 5A5SA 3UVDA 5JI8A 5D3LA 5CQTA 5EGUA 2YEKA 4ALHA 4UITA 4YYDA 4PKLA 4N4GA 5KTUA 4QB3A 5DW2A 3MQMA 3ZYUA 3LJWA 4N3WA 4YAXA 5E73A 5ETDA 5G4SA 2MJVB 5A5NA 5IGLA 5EWCA 4QYLA 4QBMA 4TYLA 5CU8A 4NS5A 4CFKA 5L98A 5F63A 4O7AA 5KTWA 5LKUA 4MEQA 5EICA 5F3AA 2F6JA 4UYGA 5ENJA 5I1QA 4CUQA 2RNXA 3HMEA 2L85A 4YYGA 3NXBA 5FH7A 5E3GA 1WUMA 5ENCA 2OSSA 1EQFA 2RNWA 5I7YA 1N72A 4QR5A 4NR7A 4NQNA 4O74A 5FE9A 4Z1SA 3JVKA 4CUPA 5C4QA 5D3SA 1WUGA 4NRBA 5EWWA 5IBNA 3LQHA 3UW9A 5CRZA 2DVRA 3U5LA 2N9GA 4QSQA 4HBYA 5CUBA 5FE2A 4QUTA 4LRGA 5I80A 3Q2EA 4IR4A 5FE3A 5BT3A 5C87A 5F1LA 4QSRA 5KTXA 5LVRA 4BW2A 4MR4A 2E3KA 3O36A 5DY7A 4NQMA 4UIXA 2LSPB 4F3IA 5A5OA 3MXFA 4QSPA 2L5EA 3O34A 4XUBA 2F6NA 3SVHA 4UIUA 3ONIA 5A7CA 4NYXA 5FFYA 3UVXA 4PTBA 5EI4A 3DWYA 5CFWA 4NRCA 2RNYA 5CUAA 5LJ0A 5EWVA 2I8NA 5CZGA 4Z1QA 3UVWA 5DLZA 5FE5A 5EP7A 2E7NA 5H85A 5FH6A 3O33A 4YYIA 4PCIA 5FE1A 3P5OA 5I83A 4BW4A 4A9KA 4NUCA 5HQ6A 3QZSA 3QZVA 4NR5A 4KCXA 5CQAA 5DYUA 5ENEA 4J0RA 4QZSA 2DKWA 4YYMA 2YQDA 5KU3A 3S92A 2L84A 4KV4A 4WIVA 3P1DA 5HJCA 4TS8A 5HEMA 3MUKA 4MR5A 2YEMA 4YADA 5FFWA 5G4RA 5EPBA 4UIWA 4YH3A 5LVQA 3JVLA 5KO4A 5DFDA 3AQAA 5F5ZA 3UV5A 4XYAA 4YBMA 5DX4A 4IR5A 4CUUA 4Z93A 3P1CA 4TT2A 4N4HA 2NXBA 3S91A 5CPEA 2I7KA 4CUSA 3FKMX 4HXPA 5DFCA 2E7OA 5C7NA 4YYHA 3LXJA 4LDFA 1E6IA 4QSUA 3K2JA 4CUTA 4DONA 4MEPA 5A83A 4UIZA 5CRMA 5D3NA 4A9FA 4TZ2A 4NRAA 2G4AA 5CY9A 4IOOA 5E9LA 4LYIA 4QEUA 5ACYA 5FBXA 4YBSA 4TU4A 4O72A 5F60A 4MENA 4TQNA 4UYFB 5CQ5A 4IR3A 5I89A 5D25A 5F25A 3TLPA 5CQ6A 4QYDA 2YDWA 4XY8A 4YYNA 4XY9A 5HCLA 4A9MA 5H1TA 5FE6A 5LKXA 4NXJA 5I88A 2WP1A 3GG3A 5LJ1A 4QC3A 4MR3A 4N4IA 5A85A 4A9JA 4Q0NA 2FSAA 4HXSA 4TT6A 4IR6A 2RS9B 4CURA 4ZQLA 5F36A 5ENIA 5ENBA 5CGPA 5F61A 4YATA 3AADA 5DLXA 4ZC9A 4O70A 5FG6A 5D3RA 5HFRA 5C8GA 2YELA 3SVGA 5DYXA 4YABA 2R10A 5D0CA 3O37A 4QR4A 2D82A 5H1UA 5EWDA 3JVMA 3U5KA 5LKTA 3MB4A 4QY4A 3D7CA 5D3HA 3O35A 5EA1A 5D3TA 4A9OA 5EPSA 4E96A 4J3IA 2R0VA 5CUEA 5A5RA 4FLPA 4NR4A 4QEVA 2GRCA 3U5JA 5F1HA 5E9YA 4LC2A 3SVFA 5COIA 3I3JA 5ENFA 5CQ8A 4NR9A 4UIYA 3MB3A 4NYVA 2DVQA 5CP5A 5HELA 5LKZA 2RFJA 5EU1A 5FE0A 4LYSA 2RO1A 5IIDA 4TU6A 5IGMA 2WP2A 3G0JA 5LUUA 3LQJA 5DYAA 4O7FA 4TZ8A 5D3JA 5D7XA 5CQ7A 5IGNA 4UYFA 1JSPB 4A9EA 4O76A 5FE7A 5L8UA 4J1PA 5DKHA 5ENGA 4NR6A 4YYKA 4LYWA 4WHUA 3MULA 2D9EA 2H60A 4UIVA 3UV2A 5CUCA 5A5QA 5FG4A 5K29A 4GPJA 5AD3A 2DVVA 2YYNA 4QUUA 4MEOA 4TT4A 5L96A 4CFLA 4LR6A 4A9IA 4O7EA 5EVAA 5J0DA 5EPRA 4PY6A 5L97A 5EM3A 4IORA 5TCMA 4WHWA 4NR8A 5FH8A 5I7XA 5FB0A 4ZW1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4QSTA 2KTBB 3HMHA 4QEWA 1F68A 5AD2A 4IOQA 3G0LA 3VKGA 4TTEA 4OGIA 4Y03A 5HLSA 4QSVA 5HQ5A 5HQ7A 5E74A 1JM4B 4NUEA 5C89A 5A5PA 5F62A 5AMFA 5F2PA 5HRVA 4BJXA 5EK9A 4QSXA 4YY6A 3U5OA 4BW3A 4BW1A 4O77A 3U5NA 1ZKRA 4AKNA 5H1VA 4HBVA 5A81A 5FE4A 4HBXA 4Q0OA 4O78A 5FE8A 2OUOA 4N4FA 3JVJA 4PCEA 4XUAA 2DWWA 4YBTA 4C66A 4RVRA 5D26A 4J0SA 5FB1A 5CUGA 3U5PA 3RCWA 5IG6A 4YYJA 5C85A 4BHWA 4Z6IA 1ZS5A 4KV1A 5EISA 5HENA 5DYCA 5II2A 4A9HA 5ENHA 2R0SA 5A82A 3QZTA 4O75A 5CUDA 5EWHA 5CTLA 3U5MA 4HXLA 4PS5A 5E0RA 5E9MA 3D1BA 5CQ3A 5TB6A 2DATA 5BT4A 5IGKA 3LQIA 5DKCA 5KHMA 5I40A 4UYEA 4CLBA 5DBMA 5I29A 4AKIA 5II1A 5FG5A 5D24A 4O71A 3HMFA 4C67A 2YW5A 1X0JA 3IU5A 4A9NA 5E9KA 4QSWA 4HXRA 3VKHA 4OGJA 5E7DA 5BT5A 2R0YA 3Q2FA 5ETBA 3DAIA 4AI6A 2DVSA 4YK0A 4A9LA 5DKDA 2OO1A 4MR6A 4AKHA 5I86A 4O7BA 4NUDA 5HFQA 5HRWA 5FDZA 5L99A 4HXMA 4O7CA 5L8TA 5D3PA 4CL9A 5FFVA 4YY4A 4QR3A 5E9VA 3UVYA 5DW1A 4UYDA 3UV4A 5HRXA 4LZRA 4LZSA 4QC1A 5AMEA 5E9IA 3P1FA 5LJ2A 4LZ2A 4OUFA 4QSSA 4X2IA 5JWMA 4HXKA 5HM0A 4UYHA 5E3DA 4YH4A 5CQ4A 4Z6HA 3IU6A 5CS8A 5EQ1A 2RI7A 5EV9A 4HXNA 4HXOA 4HBWA 5DFBA 4YC9A 3P1EA 4ALGA 4QNSA 4NYWA 5A5SA 3UVDA 5JI8A 5D3LA 5CQTA 5EGUA 2YEKA 4ALHA 4UITA 4YYDA 4PKLA 4N4GA 5KTUA 4QB3A 5DW2A 3MQMA 3ZYUA 3LJWA 4N3WA 4YAXA 5E73A 5ETDA 5G4SA 2MJVB 5A5NA 5IGLA 5EWCA 4QYLA 4QBMA 4TYLA 5CU8A 4NS5A 4CFKA 5L98A 5F63A 4O7AA 5KTWA 5LKUA 4MEQA 5EICA 5F3AA 2F6JA 4UYGA 5ENJA 5I1QA 4CUQA 2RNXA 3HMEA 2L85A 4YYGA 3NXBA 5FH7A 5E3GA 1WUMA 5ENCA 2OSSA 1EQFA 2RNWA 5I7YA 1N72A 4QR5A 4NR7A 4NQNA 4O74A 5FE9A 4Z1SA 3JVKA 4CUPA 5C4QA 5D3SA 1WUGA 4NRBA 5EWWA 5IBNA 3LQHA 3UW9A 5CRZA 2DVRA 3U5LA 2N9GA 4QSQA 4HBYA 5CUBA 5FE2A 4QUTA 4LRGA 5I80A 3Q2EA 4IR4A 5FE3A 5BT3A 5C87A 5F1LA 4QSRA 5KTXA 5LVRA 4BW2A 4MR4A 2E3KA 3O36A 5DY7A 4NQMA 4UIXA 2LSPB 4F3IA 5A5OA 3MXFA 4QSPA 2L5EA 3O34A 4XUBA 2F6NA 3SVHA 4UIUA 3ONIA 5A7CA 4NYXA 5FFYA 3UVXA 4PTBA 5EI4A 3DWYA 5CFWA 4NRCA 2RNYA 5CUAA 5LJ0A 5EWVA 2I8NA 5CZGA 4Z1QA 3UVWA 5DLZA 5FE5A 5EP7A 2E7NA 5H85A 5FH6A 3O33A 4YYIA 4PCIA 5FE1A 3P5OA 5I83A 4BW4A 4A9KA 4NUCA 5HQ6A 3QZSA 3QZVA 4NR5A 4KCXA 5CQAA 5DYUA 5ENEA 4J0RA 4QZSA 2DKWA 4YYMA 2YQDA 5KU3A 3S92A 2L84A 4KV4A 4WIVA 3P1DA 5HJCA 4TS8A 5HEMA 3MUKA 4MR5A 2YEMA 4YADA 5FFWA 5G4RA 5EPBA 4UIWA 4YH3A 5LVQA 3JVLA 3ERRA 5KO4A 5DFDA 3AQAA 5F5ZA 3UV5A 4XYAA 4YBMA 5DX4A 4IR5A 4CUUA 4Z93A 3P1CA 4TT2A 4N4HA 2NXBA 3S91A 5CPEA 2I7KA 4CUSA 3FKMX 4HXPA 5DFCA 2E7OA 5C7NA 4YYHA 3LXJA 4LDFA 1E6IA 4QSUA 3K2JA 4CUTA 4DONA 4MEPA 5A83A 4UIZA 5CRMA 5D3NA 4A9FA 4TZ2A 4NRAA 2G4AA 5CY9A 4IOOA 5E9LA 4LYIA 4QEUA 5ACYA 5FBXA 4YBSA 4TU4A 4O72A 5F60A 4MENA 4TQNA 4UYFB 5CQ5A 4IR3A 5I89A 5D25A 5F25A 3TLPA 5CQ6A 4QYDA 2YDWA 4XY8A 4YYNA 4XY9A 5HCLA 4A9MA 5H1TA 5FE6A 5LKXA 4NXJA 5I88A 2WP1A 3GG3A 3D1DA 5LJ1A 4QC3A 4MR3A 2EJNA 4N4IA 5A85A 4A9JA 4Q0NA 2FSAA 4HXSA 4TT6A 4IR6A 2RS9B 4CURA 4ZQLA 5F36A 5ENIA 5ENBA 5CGPA 5F61A 4YATA 3AADA 1PUOA 5DLXA 4O70A 4ZC9A 5FG6A 5D3RA 5HFRA 5C8GA 2YELA 3SVGA 5DYXA 4YABA 2R10A 5D0CA 3O37A 4QR4A 2D82A 5H1UA 5EWDA 3JVMA 3U5KA 5LKTA 3MB4A 4QY4A 3D7CA 5D3HA 3O35A 5EA1A 5D3TA 4A9OA 5EPSA 4E96A 4J3IA 2R0VA 5CUEA 5A5RA 4FLPA 4NR4A 4QEVA 2GRCA 3U5JA 5F1HA 5E9YA 4LC2A 3SVFA 5COIA 3I3JA 5ENFA 5CQ8A 4NR9A 4UIYA 3MB3A 4NYVA 2DVQA 5CP5A 5HELA 5LKZA 2RFJA 5EU1A 5FE0A 4LYSA 2RO1A 5IIDA 4TU6A 5IGMA 2WP2A 3G0JA 5LUUA 3LQJA 5DYAA 4O7FA 4TZ8A 5D3JA 5D7XA 5CQ7A 5IGNA 4UYFA 1JSPB 4A9EA 4O76A 5FE7A 5L8UA 4J1PA 5DKHA 5ENGA 4NR6A 4YYKA 4LYWA 4WHUA 3MULA 2D9EA 2H60A 4UIVA 3UV2A 5CUCA 5A5QA 5FG4A 5K29A 4GPJA 5AD3A 2DVVA 2YYNA 4QUUA 4MEOA 4TT4A 5L96A 4CFLA 4LR6A 4A9IA 4O7EA 5EVAA 5J0DA 5EPRA 4PY6A 5L97A 5EM3A 4IORA 5TCMA 4WHWA 4NR8A 5FH8A 5I7XA 5FB0A 4ZW1A 4AKGA
chains in the Genus database with same CATH topology
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