The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
8
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sequence length |
67
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structure length |
67
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Chain Sequence |
MAIVNQRAVALYDFEPENDNELRLAEGDIVFISYKHGQGWLVAENESGSKTGLVPEEFVSYIQPELE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Distinct Peptide Binding Specificities of Src Homology 3 (SH3) Protein Domains Can Be Determined by Modulation of Local Energetics across the Binding Interface.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
NAP1-binding protein 2
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| molecule tags |
Transferase, signaling protein
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| total genus |
8
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| structure length |
67
|
| sequence length |
67
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-05-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1NM7 A; 1JO8 A; 1NLO C; 2J7I A; 2W10 A; 2ESW A; 4ZNX A; 4J9F A; 2M0Y A; 1FMK A; 1OOT A; 2YSQ A; 2GQI A; 1CKA A; 3GBQ A; 2DA9 A; 2DM1 A; 4RUG A; 3TVT A; 2L3P A; 3NPF A; 1AWO A; 2FO0 A; 2LJ1 A; 4OMQ A; 5FWC A; 1WA7 A; 1W1F A; 1H92 A; 1LCK A; 2E5K A; 3SEM A; 5I22 A; 2KGT A; 2AKK A; 3VS1 A; 1I0C A; 4R0K A; 1SRL A; 1M3C A; 2JTE A; 3UF4 A; 4AFU C; 1RI9 A; 2DYB A; 2LNH B; 2K9G A; 1S1N A; 1ABO A; 2EBP A; 1X43 A; 2OJ2 A; 2KT1 A; 3VRY A; 3EGU A; 3PVL A; 4IIO A; 2ECZ A; 1Y0M A; 2KEA A; 2AZS A; 1V1C A; 2FRY A; 3LH5 A; 2BZ8 A; 2LMJ A; 2QDL A; 4M4Z A; 5L23 A; 2EGE A; 2PNI A; 1K1Z A; 2O9S A; 2K2M A; 4HCK A; 1E6G A; 3I9Q A; 1ZSG A; 3M0T A; 2CSQ A; 3REB B; 1WX6 A; 5IH2 A; 3UA6 A; 1X2Q A; 2LJ0 A; 1VYU A; 4X1V A; 2GTO A; 2KNB B; 2DRK A; 1QCF A; 1GFD A; 1NLP C; 1K9A A; 1SEM A; 4AG1 C; 2YT6 A; 2LZ6 B; 1BBZ A; 5HCK A; 2L0A A; 3NGP A; 4RTT A; 1K76 A; 1UGV A; 3M0R A; 1UG1 A; 3EG1 A; 2RQU A; 1YWP A; 4HVU A; 1OV3 A; 2CT3 A; 2DL7 A; 1ARK A; 3NMZ C; 1M3A A; 1WXU A; 2CSI A; 2GTJ A; 1WDX A; 2JMA A; 3KFV A; 1AD5 A; 4JJB A; 4JPB W; 2RF0 A; 3VS6 A; 1PHT A; 1PKT A; 1K0X A; 2D0N A; 1QWF A; 4Z88 A; 1GFC A; 1AVZ C; 2J06 A; 4LE9 A; 3C0C A; 2K3B A; 1VYT A; 1GCQ A; 1OPL A; 1WXB A; 1ZUU A; 2C0O A; 1AZG B; 1I1J A; 4OMM A; 2A08 A; 1SHG A; 2KT8 A; 3VS4 A; 1WFW A; 1GBR A; 2RN8 A; 4CC4 B; 5IXB A; 1M3B A; 2OAW A; 2CRE A; 1IO6 A; 2P4R A; 1OPK A; 2DBM A; 5I11 A; 4ESR A; 1SSH A; 3VS3 A; 2D1X A; 2D8J A; 2CH4 A; 2X3X D; 1UJY A; 4LN2 A; 4GLM A; 1K0S A; 4HVV A; 3PVQ A; 2EQI A; 1PRL C; 2RQR A; 1U5S A; 1BK2 A; 2B86 A; 2DF6 A; 1AEY A; 1RLQ C; 1X6G A; 2DE0 X; 3ZL7 C; 1K4U S; 2C0T A; 1VYV A; 1WI7 A; 4Z89 A; 2EGC A; 1KJW A; 1GRI A; 1HJD A; 3EG2 A; 1EFN A; 3VS0 A; 1ZUY A; 4J9E A; 1FYN A; 3EG3 A; 1TUC A; 1SHF A; 1NYF A; 2DIL A; 4Z8A A; 3RNJ A; 3H0I A; 2DJQ A; 2AZV A; 1X6B A; 2HEQ A; 2VVK A; 1BB9 A; 2O9V A; 1AOJ A; 4LUE A; 3EHR A; 2RQT A; 4AFZ C; 2DBK A; 1PWT A; 2GNC A; 1CSK A; 4RTU A; 3O5Z A; 2DLP A; 3A98 A; 2YUQ A; 2MOX A; 2AK5 A; 2RQV A; 2FG0 A; 2XMF A; 4CC2 A; 2RPN A; 4RTX A; 2JS0 A; 2DNU A; 4OML A; 1X27 A; 4IIM A; 2EPD A; 1BU1 A; 5EC7 A; 2HDA A; 3I5R A; 1KSW A; 2DL5 A; 3VS5 A; 2RQW A; 2A36 A; 4LUD A; 2F2V A; 4J9H A; 2MCN A; 4FSS A; 1MUZ A; 3M0Q A; 3UAT A; 3QWY A; 2JT4 A; 2EGA A; 2ABL A; 2C0I A; 3VRZ A; 5GJV B; 2D8H A; 4ORZ A; 1MV3 A; 2EYW A; 2YUO A; 4CC7 A; 1KFZ A; 4JJD A; 2YUP A; 3ULR B; 1M30 A; 2DL4 A; 3R6N A; 4F17 A; 5IXF A; 1PNJ A; 3IQL A; 2K7A A; 3H0H A; 1JXO A; 2PZ1 A; 1QKW A; 1YCS B; 1X2K A; 2MIO A; 2DVJ A; 1GCP A; 1W70 A; 1WXT A; 2CDT A; 3EG0 A; 1A0N B; 5FWB A; 2KYM A; 1UFF A; 1NYG A; 2IIM A; 2HCK A; 3H41 A; 2AKL A; 1UUE A; 1T0H A; 1M8M A; 1TUD A; 1GL5 A; 4OMP A; 3NHN A; 1MV0 B; 2CT4 A; 2EYZ A; 2JM8 A; 3EHQ A; 4D8D A; 4KRT A; 3UA7 A; 4QT7 A; 1SRM A; 1YWO A; 1B3Q A; 2EW3 A; 1YNZ A; 2X3W D; 2JMC A; 3CQT A; 1N5Z A; 1VA7 A; 3TSW A; 2CUD A; 2CUB A; 2DRM A; 3SHW A; 1AZE A; 1U06 A; 1YP5 A; 3M0U A; 5FW9 A; 3M0P A; 2VKN A; 1SPK A; 1ABQ A; 2KRO A; 2EVR A; 1H3H A; 4J9I A; 1Y57 A; 2EYY A; 2KXC A; 4RTZ A; 1AWX A; 1QKX A; 2JM9 A; 2M51 A; 3PE0 A; 1X69 A; 2LQN A; 2DL3 A; 4Y92 A; 3JV3 A; 2OI3 A; 2FPF A; 5IHI A; 3RBB B; 1NEB A; 2A28 A; 1U3O A; 2LX7 A; 2LJ3 A; 1WYX A; 1PRM C; 2O31 A; 1GBQ A; 1W6X A; 4WCI A; 1QLY A; 2FPE A; 2O2O A; 3TSZ A; 2F2X A; 5ECA A; 4HVW A; 1UTI A; 2ROL A; 3VS7 A; 4LNP A; 4D8K A; 2KE9 A; 2NUZ A; 1HSQ A; 2ROT A; 2DX1 A; 1UDL A; 4E6R A; 4EIK A; 2KBT A; 2A37 A; 4J9B A; 4F16 A; 2GBQ A; 2J05 A; 1JXM A; 4RTY A; 1QWE A; 4OMN A; 4OMO A; 4CC3 A; 4RTW A; 4A63 B; 1XOV A; 2KYB A; 2SEM A; 2J6K A; 1E6H A; 2BTT A; 1G83 A; 2J6O A; 1JQQ A; 2ED0 A; 1T3S A; 3I35 A; 1HD3 A; 3H0F A; 1AWJ A; 2EKH A; 2V1R A; 4DEX A; 1RLP C; 1I07 A; 1B07 A; 2SRC A; 1WLP B; 4AFQ C; 1UE9 A; 2RNA A; 4J9G A; 2YUN A; 2KR3 A; 1UEC A; 4K11 A; 2O88 A; 1E7O A; 1G2B A; 2HBW A; 4AFS C; 4DEY A; 1J3T A; 1UJ0 A; 1Z9Q A; 4F14 A; 1ZLM A; 2LP5 A; 4JZ4 A; 2PTK A; 2VWF A; 1UHF A; 1H8K A; 3REA B; 1GCQ C; 2V1Q A; 2CH4 W; 2F2W A; 3THK A; 1NEG A; 2FRW A; 2RMO A; 3FJ5 A; 2K6D A; 5IHK A; 1PKS A; 4GBQ A; 3VS2 A; 1Z9Z A; 2JS2 A; 1NG2 A; 1TG0 A; 4AG2 C; 2BZX A; 1KIK A; 1YN8 A; 1ZUK A; 2W0Z A; 2JW4 A; 2L3Q A; 2NWM A; 1T0J A; 2LQW A; 1ZX6 A; 2EYX A; 2YDL A; 2KRS A; 3QWX X; 1JU5 C; 4HXJ A; 5IHN A; 1JEG A; 2I0N A; 2GGR A; 2KRN A; 3I5S A; 2DL8 A; 1WIE A; 4JJC A; 5GJW B; 2KXD A; 3M0S A; 2J6F A; 3U23 A; 2LCS A; 2L3S A; 1RUW A; 2ENM A; 4JZ3 A; 2ED1 A; 2FPD A; 1CKB A; 2K79 A; 1M27 C; 2KRM A; 4J9D A; 1AWW A; 1ZBJ A; 2FEI A; 1OEB A; 4RTV A; 2H8H A; 1T3L A; 2DMO A; 1UHC A; 2JXB A; 2HSP A; 2L2P A; 2G6F X; 4J9C A; 2BZY A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1NM7 A; 3JCM Q; 2J7I A; 1AT1 B; 1K73 R; 5CO7 A; 4J9F A; 1FMK A; 1W4S A; 3P8D A; 1Q86 C; 1VQ4 T; 2AIR B; 2GF7 A; 2M16 A; 2DA9 A; 1XNI A; 1V29 B; 3NPF A; 2FO0 A; 2FVU A; 2LJ1 A; 4OMQ A; 1W1F A; 3C94 A; 2OX7 A; 1LCK A; 3I56 A; 3CCM A; 3G6E A; 2AKK A; 1VQ5 T; 3VS1 A; 3G7Z A; 3LYI A; 1M3C A; 3UF4 A; 2FYK A; 1QVF P; 4M7A F; 4FYW B; 4OVA A; 3CC7 A; 3EGU A; 3CXC P; 1K73 U; 4BY6 C; 3EFO A; 2F69 A; 3I56 T; 3A1P A; 3CCM T; 3GIB A; 2FRY A; 1M9S A; 3INZ A; 2XI9 A; 1VQ6 A; 4PJM A; 1HXD A; 3EH2 A; 5L23 A; 2F5K A; 1NBE B; 1B34 A; 1K1Z A; 1VQO A; 1E6G A; 1ZBX A; 2R58 A; 3CC7 T; 1VUB A; 4NL3 A; 2AT1 B; 3UA6 A; 2LJ0 A; 1VYU A; 2VYT A; 3PFS A; 1NE8 A; 1QCF A; 2EQK A; 1K9A A; 2L3R A; 1SEM A; 3X26 B; 1BI0 A; 2CZ7 B; 5HCK A; 1BBZ A; 1HYO A; 1NZ9 A; 1K76 A; 5J26 A; 2DKG A; 4DA4 A; 2LC4 A; 3M0R A; 1UG1 A; 3EG1 A; 1YWP A; 3JB9 J; 4ELZ C; 1ARK A; 1OU9 A; 2QTX A; 1JBM A; 1WXU A; 4MML A; 2GFA A; 1YHQ Q; 2EQJ A; 4N0A A; 1M1G A; 2NUT B; 1OX8 A; 1PG5 B; 4WF2 A; 4OF1 A; 1PHT A; 2D0N A; 4BB7 A; 1GFC A; 4N4I A; 1X75 C; 1UEB A; 2O4X B; 2H3J A; 4V2S A; 3OS2 A; 4JRP A; 2Y4Y A; 1X01 A; 2H3E B; 3EGD B; 1TWB A; 1VQ8 T; 5KH6 A; 3QDR B; 2C0O A; 5GAN 7; 5GMK i; 2EJF A; 4HCC A; 3A8M B; 3L1A A; 2KT8 A; 3VS4 A; 1PD0 A; 5GAM f; 4CC4 B; 5IXB A; 1M3B A; 2OAW A; 4DBQ A; 4PFP A; 5GAN 2; 3D7S B; 5I11 A; 1W2B S; 1PM3 A; 4FYV B; 2X3X D; 1UJY A; 4GLM A; 1OUL A; 3CBP A; 2OTJ T; 2LQK A; 2GFU A; 1PRL C; 4XU3 A; 1G3S A; 1BK2 A; 2DF6 A; 3RER A; 3ZL7 C; 4M7D G; 3RKW A; 4Z89 A; 1KJW A; 3QUI A; 3MET A; 4HCB A; 3VS0 A; 5GAN d; 2CGH A; 5I2M A; 2DIL A; 4Z8A A; 3CD6 A; 3RNJ A; 3H0I A; 4RMO A; 4PJO F; 3JCM d; 3MHX A; 3LGF A; 1X6B A; 2RK1 A; 2RHX A; 3CCR A; 2O9V A; 4XTW A; 3KXT A; 4AFZ C; 1VQK Q; 2GNC A; 4FT4 A; 2RJC A; 3FJP A; 4JJN K; 4C92 B; 4PJN A; 2DLP A; 3CC2 T; 2MOX A; 4BUG A; 2AK5 A; 3CD6 T; 3JB9 H; 1MMN A; 2JS0 A; 2GQV A; 3A8G B; 4OML A; 4PLI A; 4LDX A; 2P0P A; 2EPD A; 1QVF S; 3CCL A; 2CZ6 B; 1YJW T; 3RR6 A; 2ZPH B; 2KDS A; 3NTH A; 2EWN A; 3V8J A; 2YLB A; 2A7Y A; 3CXC S; 4Y91 A; 3CC4 Q; 3M0Q A; 2RK2 A; 4XTV A; 2EGA A; 2ABL A; 1C1A A; 2E3H A; 3CCL T; 2JOY A; 5FU7 C; 5GJV B; 4ORZ A; 1MND A; 4N0A C; 1BCO A; 3FB9 A; 1KC8 R; 1O9S A; 4B9X A; 3R6N A; 2DTO A; 3UT1 A; 2IG0 A; 1XJW B; 2CZ1 B; 1FMW A; 3X20 B; 2E1H A; 1QKW A; 2MIO A; 1KHC A; 2NYS A; 1W70 A; 3M5A A; 3EG0 A; 3CCJ A; 2K5L A; 3BE3 A; 4FCY A; 1YCY A; 1NYG A; 4M7A E; 4XTY A; 2AKL A; 2R57 A; 1I8F A; 2OTL T; 4OMP A; 4JLG A; 1MV0 B; 1KC8 U; 3EHQ A; 1WHG A; 5LJ5 f; 2LT1 A; 3CCJ T; 3G71 A; 5CKB A; 1YWO A; 1B3Q A; 3TCJ A; 4RG8 A; 5FU6 B; 1YNZ A; 1O75 A; 2X3W D; 1FX7 A; 5GAM h; 3TSW A; 2CUD A; 2EJ9 A; 2K5F A; 2DRM A; 3G1J A; 4PKC C; 1YP5 A; 4M78 C; 4UC4 A; 2QQ9 A; 3M0P A; 3HP9 A; 1ABQ A; 1MMA A; 2KRO A; 2EVR A; 5I2S A; 2DXT A; 5IT9 E; 4OB1 B; 1G8X A; 1KQS P; 4IUR A; 2EYY A; 4M77 A; 4Z02 A; 4C8Q G; 3I56 Q; 5GAN g; 3CCM Q; 3G6E Q; 1QKX A; 2COY A; 5HK0 A; 3JCM g; 4M7D E; 1KC8 C; 1Q7Y U; 5CQY A; 5IHI A; 3ZFJ A; 3JCM V; 2EFI A; 4DBR A; 1BYM A; 1NEB A; 2FL7 A; 2LX7 A; 3CC7 Q; 4M78 D; 1Q95 G; 1WYX A; 3CMA T; 2NLU A; 4OMF B; 4WCI A; 3HHT B; 3TSZ A; 5ECA A; 4HVW A; 1VQ6 Q; 4DQ2 A; 5KYW A; 2KE9 A; 2P0Q A; 2HKQ B; 1HSQ A; 1VQO Q; 1UDL A; 3LWI A; 1SKU B; 4EMK A; 2GBQ A; 2J05 A; 1JXM A; 4RTY A; 2DYI A; 4AMC A; 4A4E A; 3C4S A; 2KYB A; 4R56 A; 4ZN1 A; 1UGS B; 1Y07 A; 3PMI A; 1E6H A; 1Q7Y C; 1T3S A; 3I35 A; 1HD3 A; 2K3X A; 2V1R A; 4Y28 E; 4M7A C; 3BY7 A; 1NPR A; 5D6Y A; 1I07 A; 1B07 A; 1Y71 A; 1AHJ B; 2SRC A; 2LDM A; 1I81 A; 1WLP B; 1WHJ A; 1Q81 R; 2QDY B; 1D3B B; 1UE9 A; 2RNA A; 4A53 A; 2VXE A; 4DBF A; 3OA6 A; 1UEC A; 2HQE A; 1VQ8 Q; 3OW2 P; 1D1B A; 1LNX A; 4GY5 A; 2V8J A; 1PCX A; 2PTK A; 2V8I A; 1D0X A; 3LWH A; 3PIO A; 2RHY A; 3OS1 A; 4M7D B; 1H8K A; 3PIP A; 1GCQ C; 2V1Q A; 2F2W A; 3CCS T; 4PJO E; 4M7A D; 2RMO A; 3RDV A; 1PKS A; 4GBQ A; 1Z9Z A; 3CCQ T; 1VQ9 T; 1Q81 U; 2BZX A; 1K8A C; 8ATC B; 1SG5 A; 2W0Z A; 2JW4 A; 2L3Q A; 1JJ2 P; 1IRX A; 1T0J A; 2LQW A; 4IKF A; 3X24 B; 1Y96 A; 4HXJ A; 1ZSZ B; 1XTD A; 2I0N A; 3VKI A; 1WPY A; 4A4H A; 1WIE A; 4JJC A; 5GJW B; 2L3S A; 3OY9 A; 4KGV B; 3MCA B; 4X9C A; 3L2W A; 1WHM A; 5CIU A; 4IUQ A; 1M27 C; 4J9D A; 1AWW A; 4EMH A; 2R5M A; 5D7U A; 1ZBJ A; 2FEI A; 1OEB A; 4RTV A; 2H8H A; 3CD6 Q; 3R6O A; 4AT1 B; 5GAN 3; 2DMO A; 1UHC A; 3CCR Q; 1Q81 C; 3QHS A; 2HSP A; 2G6F X; 1IZ6 A; 4J9C A; 4HT9 A; 1JO8 A; 1NLO C; 2COW A; 2YRC A; 4ZNX A; 1TOV A; 2E65 A; 4F7U A; 4M75 A; 3KUF A; 2YSQ A; 1KQS S; 2GQI A; 2V26 A; 3M4G A; 5CVI A; 3QZ5 B; 3BDL A; 3GBQ A; 3TVT A; 4RUG A; 4J6X A; 4XAX B; 1MGQ A; 1RAF B; 1H92 A; 3CCL Q; 3HPW A; 3TQ7 P; 3SEM A; 1MMG A; 4WTO B; 4R0K A; 3QKJ A; 4AFU C; 1RI9 A; 2HD0 A; 2BUD A; 4IUP A; 3PVL A; 3JSC A; 4IIO A; 4PJO C; 2KEA A; 4C5G A; 5GAO q; 3JAM E; 4E7Z A; 3CPW P; 2CP2 A; 4QW2 A; 2LX9 A; 4A54 A; 2E6Z A; 1QMC A; 2A3L A; 4M4Z A; 1QP2 A; 4PNO A; 2WSF E; 2O9S A; 3OBY A; 3OMC A; 2DIQ A; 2RHI A; 3I9Q A; 1FMV A; 2CSQ A; 3REB B; 1WX6 A; 4F04 B; 4DOV A; 4XK8 E; 2QGG A; 4J8O A; 3CCU A; 3X28 B; 1H64 1; 2AHJ B; 1VQM A; 3CCJ Q; 4PJO D; 1NLP C; 2HZY A; 1EZZ B; 1TTH B; 3CC4 A; 1MHN A; 2JNG A; 2LZ6 B; 2QQR A; 3I55 T; 3LX7 A; 2RH2 A; 2RQU A; 5FRO A; 3SWN B; 2DL7 A; 2XD0 A; 3OW2 S; 1M3A A; 1QVP A; 1AD5 A; 3QBY A; 1D1A A; 3G71 Q; 4JPB W; 2DIG A; 3VJP A; 3VS6 A; 1BCM A; 3L2Z A; 1W2B P; 4BE0 A; 1HK9 A; 2KVQ G; 1WXB A; 1ZUU A; 2QQB A; 5LJ3 g; 3DLM A; 4OMM A; 1LJO A; 1JJ2 S; 2RN8 A; 2DZC A; 2P4R A; 1VQ4 A; 2DBM A; 4ESR A; 2M9U A; 4E7J A; 1WQ7 A; 5C6S A; 2D1X A; 2M1H A; 4EPC A; 3QZ9 B; 2VGM A; 2E5Q A; 2CP0 A; 3PVQ A; 1VQN T; 3JB9 I; 2RQR A; 1U5S A; 3UDC A; 4E7S A; 5GAM d; 2B86 A; 3EGX B; 1VQ5 A; 1RLQ C; 4FM4 B; 2DE0 X; 3V8L A; 3HFN A; 4BY6 B; 1M2V B; 1KD1 R; 3A8O B; 1BI3 A; 2EGC A; 2PUO B; 1HJD A; 3EG2 A; 4E47 A; 2D0Q B; 1N8R R; 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